CaUC01G020480 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC01G020480
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr01: 33325053 .. 33330187 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC01G020480
SyntenyCaUC01G020480
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAACAACTTGAGCTAATGGCATTCTTCTTGATCGAACTCTCGCTCGTTGAGTATGAATATGATTTTCAAATAATTTATAGTTTGAAGGTTAGGAAAAAAAAAAGGGAAAAGAAATCAAAACTAAACAGAGTAATACTTAGGTACAGCCTACTACACCTATCATCATACATCTCATTCAATTACAAAGAAAAAAAAAGTATTTTTTTAAAAGAAAAGTTTGCGTGGCAAATTGTGATTTAACATTTGGATAGATTATACAAAGATAGTTGCAACCCGAGATATACCCAAGTATATCTCTTTCTAACCTTTGGAAAGTTTAGTTGGAAATGCAACCAAAGTTCCACATTGACTAGATGAGGAGATGATCATGTGTATATAAGTAAAGACAACTGTAGACAACTATATTCAATAGTACGAGGACTTTTAAGTGAAACTAATAGTAAAGTTACTAAGATTTATATCTTAATTAAAGTGAATTGAAGATATGTGGACGTCTCTCGTCTGCAACAAAGAATATTTTGTATTAGTTGATGGGTGAGAAAAAAAAAAATTTTAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTATGTAACGGTAAAGGAAGAAAATATAGGGTGGTGTGAGTGAGAGGAGCCATTGGAGGCCTTTTAAAGAATTGCCAGGTTGTCCCCATAAAAGGGCCAACGTGCCATCGGTTTGCGTTTTCTTAATTCTATGTTGAAAAATGGCTCTTAAAAAGGGACCTTTTATTATTAAAATAATTTTCTTTTGGGGCACCAATTACACTTTAGGTTCAAAATACATCATTAAACTATATAAATATAAATATATATGCTAAATTGTAAAAACCATTTTTAAAGTATGTTGATAGTTGTAATTTTAAAACTTTGTATAAGTTCGAAAGTCCAATTTTTACATTTGAAAGTTTGAGGGTCCAATTGTATAAGTTTGAAAGTCTAATTTTAACGATTGTACAAGTTCGATGGCTCAAATTTTTACATTTGAAAGTTTGAAAGTGTAATTGCAACTATCACCATAATTTATGGTGGTTTTTATATGTATCACTTGCCTTGCAACTTTTAAAAAAAATGTGATGTTTGACGAAACTAAAAAAGTGATTTTGAAATAACCAAAATCACTCCTCTAGGTGATTGTGAGTGATTTTGTTTTGAATAGACTTTTATTTCATATTAATAAATTCTCTTCTTATTTTACTTGATTTTATCCATGATTTATAGGAAATTTGTATTTTTCTTTTTAATTCTTTTATCCATCTTAATCTCTATTTCCCTCTTATTTTTATTTTAATTTTTCCTCTCTAAAGTTTTTATAATGTTTTATCTCTAATTTTATTTTATTTTCATTTAAAAGTGTCATTTTTCTGACCTTTTCTCCCTTCAATAGTTTTTAACTATATTTTAGGGGCCTACTCAAAATTTGGCCTCACTTTAAAAAACTCAAAATTTGCCCTTTTGCTTATGTCATTTGTGTGTAAAGGTACCATTTTGACCCCAAAATGTGTGAGGTCAAACGCAATCCAAATTTCTTGCTTCTTCCTCTAGCTTCTTCCTCGTCAATTTGTAGTTTTTTCCTTTGAGTTTTTTCCTTCATTCAAATTCTCACTCTCGCTTCTTCCTCTCGTTTCTTCCTTTAGCTTCTTCCTCGTCAATTACCCCGCGGGTAAAGATGTCTACGGGGAGGGGTGGGGTCGGGGATGGCTTCCCTGCTCCCCGTCCCAACCAAATTCCCCACGGGGATTGGGGTGGGGATTCCTTGAGGGGAATTTTTCCCAGTTTGATTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATCAATTATCATAAATCACTATTATGAAAAAGTTTTAATTAAATGGTTAAAATATGATTAACTTCACATGGACGATTAAAATTTAAAGAGAAATTACTCAAAAATTTGAAATTAAAGGAAATAATTTTCTATCAAATTATTCATATTATATAATTTAAACTTATTAGAATTCTAACATATATATATATATATATTTTAACCTAATTCAAACATATTCATTGTTTTGACCATTAATCTTGAAAATTAAATATCATATTTATATTTAAATTATTATAATAAATAAATAAATAAAACCTAATGGCGCGGGGACGAGGAATCATTCCTCGTTCCCTGTCCCCGTCCCTATTTAGCTTTTGGGGAATTTTTTTCCCCACTCCCGCCCTCATTCCTCACCTAAACGGAATCCCTGCCCCATTTGAGGCGAGTCCCCATGGGCCCCTCCTCCGTGAGAAAAATGGACATCTCTACCCATGGAGAATGAGGGAGGGAGTGAGGATTTTTTTCCCTACCCGACCCTGCTCTGAGTCCCCGCCCCGCCCTAGATTTTATTTATTTGTTCTCATAAGTTGGGATTACTTTCAATCTGGCTACACTATAATTTAGTCAAACTTCACAGTAGTTTTTTTATGTGACCATGAGTTGAAGTTTTTAAATTGGTTATTGGGTTAGATTTTAAGGTGAGTCCAAATAAATAATAATGATAAAATATGTAGGCTTTTTTATCGTGTAGATAAGCAGCAATTGATGCGCCACTTTAAGTGTTAACCGCAAGTGTATGGGTCAAGTTATAATATAAGACAGTGAAGTCCGAATATCGTTCCACTAAAGATCCAATTGTGAATGTCACACCCCCTCCCAGATTACCCTCCATAACCTGAGAGGAGATGTAAGGACAGCATACATCACCCCTCTTGTGAGGTTCACTGTCCAACTGTACCTGAATAACCGGTTGAAACATGACTTACATAACTGCCCATATCACTTATTCTAATAATATAGACATTAAGATCAACCACGCCCATAAATTCAATAACATGAGAACTTATATTTACATAACCAGGTACTCCAAACTCGTTCACGAATATACTTAGATGACATATACAATAATCAGTCTCACATCCCAACTACTAGCTAACTATGTCTACATGCCACATAAGCAAAGTTATTTACACATACAGCAACCTAAATGCAAGTACTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGATAACTCGAAGCTTAAGCAGGGCGAGCTTGAGTAGGCTAAGCACAAGGAACTTCCTCGCTACTTGGGTGGGAAAGAAAACATGAAAAACGTGAGTTGAATGCCTAGTGAGTGACATAGTATTTTAAACACAACCCATGAACCAAATCATGCTCAATATTAGAGAAAACATAACTTTAGCATAAAACTCATGTTAAGCCTTGAAATAAAACATAAGCCAGGTCTTTTACAAAAATACAGTTTACAAACTCATCAAACCCTCTTTTTGCTTAAAAATTCCCTTAGTTGAGGCGAAGTAAGGCTCAACACACTCAACGTCGAAAACAAACCTTAGTTGGGGCGGAGTAATCTCGACACACCCAAAGTTGAAAACCTTAGCTGATGTGGAGTAATCTCAACACAATAGCGTCATCAAACACTATGTGCACATAGGACTATCTCAGGATACCCAAGTACCTTCTACGAGTCCTTCAGTACTGGGTCCCTAGGAAACTCAAATGCCTTCTCAACGTCCTTCAGCACCGAGCTCCTTTAAGTCACAGGTTTACAGTTTTCATGTGTTCTTCATAGGGAGCCTGCATAAACTGGCTCACAACGCTAACAGCATAGGAGATATCTGGTCTAGTGTGTGCTAGGTAGATTAGTCTCCCAACTAGACGTTGATACCTCTCTTTATTAACAAGAACTTTGGCAATAGACTCTCCTAATTTGACATTAGACTCGATAGAAGTGTCAGCAGGCCTGCATCCGGTCATACCTGTTTCTTTCAGCAAATCAAGAATGTTATAACGCATTAGTTTATTTTTAATGCCTTAACTAGACAAATTTTTATGGAGAAGCAAGAAAGAATCTAATTCATATGCCCAAAAATGATAAACAAATATCCATAAAACTCTTTTTGACAGCTTTCTCTTCTTCTACTTCTTGTTTATCAGGATCTCTCTGTTTTCTCTTCACCGGAAAGAGTGGGAGAAAAAGGTCTTGGTGAATCAAAACCCAAGAGGCTGTGAGGAAAAAGGTCTGTGTTGGAATATGTGAGGGGCTGGAGGTTGAATTTGAACATAATTTGCCTGGCTGAATGTTTTTTGTTTAAATAAATAGGTCCTTACTTTCTCGTCCCTAGTTTGTTCTTCTTTCTCGTTTCCTTGTTTTATGACAAAAATTTTATTTGACCCATTTTTTTCCAGTATTGATAATAGAAGAAAATCAGTTGATGTAATGGCTTTCACTAAGATAACTAAGCAGATAGGAAAATTACTTGTAATGGTTAAGATAGCAACTGTTAGTAGTGATACCATCATATTCAAAGGAATTTTTGATGGGCGATTGATTGCGGTACGGCTAATGAAGGATCTTGAAGATGTCGCAACACACGAAAAAGAAATTCTATTAAATTCGGATAGTCATCTGAACATTGTTAGGATGTACGGGACAAAATCAGACGAGGACTTCATATATCTTTGTCCATAACGATGCACATGCAATCTAGAAGTCTTCATTAACGAAGTCTCACCGAATAGCGGAGAAGGCGATCCACTACAAGATTTCGGAACTAAGAAGATCAAACGGTGGATAGAGAGAGACCAAGACATCTTAAGCTTCGATTGATGATGTGAGTACATAAGTTATATCTTTGGTTATTTACAAGAATATGTGAGAGTTATTCTCCTATTGTTAGACATTCCTCAATACATATTCTTTCATTAGTAACTCATTTCAATTTGGAATAAAAACAAACGGATGCTACTACAATCTTCTTATATGGAGATCTATAGGAAGAGATATGCAAGAAACAACCCCAATGCTTCATAGAAGAAGGGAAAGAACACTTGGTTTGTAAATTGAGAAAAACTGCAAACATCGATAAAAGAAGGCCAGCTATTGGTTTTTTGTTCAAACTTAATGGAAATACAATGAGTTGGAGATCATGTTAGGTCCACAACAGAATCAAAGTCAAGAAA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mRNA sequence

ATGGAACAACTTGAGCTAATGGCATTCTTCTTGATCGAACTCTCGCTCGTTGAGTATGAATATGATTTTCAAATAATTTATAGTTTGAAGAAAGAGTGGGAGAAAAAGGTCTTGGTGAATCAAAACCCAAGAGGCTGTGAGGAAAAAGTTTGTTCTTCTTTCTCGTTTCCTTGTTTTATGACAAAAATTTTATTTGACCCATTTTTTTCCAGTATTGATAATAGAATACGGCTAATGAAGGATCTTGAAGATGTCGCAACACACGAAAAAGAAATTCTATTAAATTCGGATAGTCATCTGAACATTGTTAGGATGTTAGTGTCAGATTTGATTGATGATATTCTTGTACCAACTGTTCGTTGTGATAGCTGGAGTGCCTTGGCATATTGTGAAGAAATCTTAAGTTTCGTGATCAAACAAAAATATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAACAACTTGAGCTAATGGCATTCTTCTTGATCGAACTCTCGCTCGTTGAGTATGAATATGATTTTCAAATAATTTATAGTTTGAAGAAAGAGTGGGAGAAAAAGGTCTTGGTGAATCAAAACCCAAGAGGCTGTGAGGAAAAAGTTTGTTCTTCTTTCTCGTTTCCTTGTTTTATGACAAAAATTTTATTTGACCCATTTTTTTCCAGTATTGATAATAGAATACGGCTAATGAAGGATCTTGAAGATGTCGCAACACACGAAAAAGAAATTCTATTAAATTCGGATAGTCATCTGAACATTGTTAGGATGTTAGTGTCAGATTTGATTGATGATATTCTTGTACCAACTGTTCGTTGTGATAGCTGGAGTGCCTTGGCATATTGTGAAGAAATCTTAAGTTTCGTGATCAAACAAAAATATTGA

Protein sequence

MEQLELMAFFLIELSLVEYEYDFQIIYSLKKEWEKKVLVNQNPRGCEEKVCSSFSFPCFMTKILFDPFFSSIDNRIRLMKDLEDVATHEKEILLNSDSHLNIVRMLVSDLIDDILVPTVRCDSWSALAYCEEILSFVIKQKY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC01G020480 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC01G020480 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC01G020480 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC01G020480 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC01G020480.1CaUC01G020480.1mRNA