CaUC01G018950 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC01G018950
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr01: 32158710 .. 32162103 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC01G018950
SyntenyCaUC01G018950
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGAAGCACTTCCATGAAATTCCTGATGTTGGCGCCAAGCGCTTTCCTGGATCACGATGGTTTGTCCTTTTCAACAAAGGCATTTGAACAATTTTGGGACAATTGCCATAAACTCGATTTTGTACTCGTTGCGCGATGTGACTGAAGATGTTGATTTTCAACATAACCGTGAGCCTAAAAATTCACAATTTTGTTTTTAACAAAAAAAATTAATAAATAAACAATAAATAATTTTGGTACATACAATTGATTTAGTCCCATTGATAAACTAGCTAAATGTCGTATTTACTTATAAATTATAAAGACAAATGGTTATACAAACCAAATTATTGACAATTAAATTTCATAAACTTTTCACCATAGCAATCAATTACAACATGTTGAAATTCAATGACTATTATCATAGAATTGTTACACATCAACTAAAATATTATTTTTATAAAAGTTCAAGAAATAACAATGATTTTTTAACTATATTAAATGATATGTTTGGGTGGAAGTAATTCTAAAATGGTTTAAATTACTTTAATCATTTTCAAAACTATTCAAAAAAAATGTTTTTAATTATTTACAATCAATTTTAATAGTATAAAATATGTATTTAAAAAGTAAACTAAACATTAAAAGAGTGATTGAATGTGTGTGATTTTAAAGATGACAAAGTAATTTTAACAATTTCAAAATGTCTTCCAAACACTTAAATAAAAATATTTTGGAGTAAATCTTAAATAGTTAAAATCAATTTTTTTTTGTCCCATTTAAAATCACTACTAAACATATTTTTAACCTTGATTCATGCCATTAAAATTGATTTTAAGAGATTAAAATTATTTTTTATTGATTTTGAAATTGATAAAATTGTCACTTACAAAAGTTTCAACCTCTAGAAAGACAAATTTTGGTTCCTAAGCTTATGCTTATCTGACTTCAAAAAATTTATTTCCTCGTTTCCTTTTTCCTTTTTTTCTAAACCCTATTTCACCTTCAGCCACCACTTCCCAACCATAACCACCAGCCACTACACCCGCCCCGCCGCACGCCGCCATTCGCCCCACGACGCTCATTTCTCAGATCCCGAAGGTATCCCTTGCAATCACACTCAGCCTCAGCTTGTCCCAATCTCTCCCTGTGGTAGCACAATCTTCAGTCGCAAGCCCCAATAATCCCTCCTCTCTGTTTCGTCTTCTCTCTCGATCGCTCCCCTCAATCTCACTCACTTGGCCTACTTCAAGGTTTGTCCTCTCTAGGTCTTTCTCAGTTATGATTGCTACAATCTCGATTGTATATATATATTGCTCAATATATATCTCCCATAGTCTCAAGATGTTATTCGATTGTCTAATATGAGTAAGTCAGTAACTACTTTTTTCCAGCAGTTTAACGGGGATTCGATTTTTACACTCGCAGTTTTTTTTATTATTGATGTATAAACGTTAGTTAATCTGCTGTTTAATGACGTTTTTCTTGCACGAGTATTGTGGTTTTGTCTAATTGAAGTAATGGCTCATTTCTTTCTTGAAATTGCGGGTATTCTATTTGCAAATCTTCTGTATGTAGAGGATTATCAGCTGTACACCTTACTTTCAGAATATTCAAATTGCTTGAGATATGAATGGTAACTTGTTACGAACAACTTCTGTTTGGATGGCTTTATTATTGTTGAAGCAGCTCCTTTACTTTGTCTGAATGTGATGTGATTTCAATTACCATAGTATTCACCTTTGCATTTTGATGATTCCCTTTTCTCTTCATTTCGATAAACTTCTATCTTTTATTGACGTCGCAAGGTAAGCTCATTACATTTGTCTTTTTCTATAAATGATCCTTTGCCAGTGTTCTCCTATATTTGCTGTACTTCTGTATATCAATGAGATTCAATTTTCTAAGCTTTGTGTTCCAATCCTTATCTTGTAGCTTCAACTACCACATCATCTTTAAAAGCGTTTTAAATTTTATATCAGAGTCTAAACACTACCTTGCTCCTGTGTTTTTTCCCACCATTGTTTTCCCTATTCTTGAGTGAGTTTCAATCTTAATCTTGAAGTTTCATCTACCACAGGGCTCTCTTAACAAAGCTCAATAAGGACAATAGGTATAATAAAAGACTTAGAGGGAATGAGTTTTATTCACTGTCACCACCTACTTAGATTTGATACTTTGGGGGTGTTTGACCTACCGACTTCATAAGTTGATGTTAAATAACTCAACTCCACCAACTTTAATGGTGTTCACTATTAAAGTTTGCACATTTATCTAAGAACTCCATCTTCTTTTCCCCTCTTTCTCTCTTTTGCATATTTATCTAGGAATTCAACAAAACAACTCTACATCCTAAACCTAGACTTCCTAACTCCAACATATTAACTCTAGATTTCAGATACCCATATAAGTTTCCTTGACACTCAAATGTTGTAGTGTAGGGCATGTTGTCCCATGAGATTAGTCAAGGTGTCCAAGTTGGCTTGGACACTAACGGATATTATAAAAGAAAATTTATTTACTTATGTTGTGGGGCGTTTGGATGGGAATTTGGCAACCATATTGATGGTTTGTGGGGAAGTGTTGATGCGCTCTATAGCAGCTAGCCTTGAGGACCTTTAGAGAGTGATAGGTGGGTCAGATGGCTCAACATTGTGGAGTATCTATCTCATCAGGTTATCATTCTCGTCTATACGGGGATCAAGATAATTGGGTGAGATGGGATGAGGAGTGACTGACGAGATGATGGATTATCTTGGTTCTGCTAGTTTATCTCTTTATACTTTAGATTCACTCTGCTAAATTTATCTCAACCTAATAATACATCTTTCAAGTCTGGTGGAGATTTGATAGGGTTTTGGAGCAGAAAATCTTTAACCAAATTCCAATCACATGGACAGTTTGAGGGTGTGTTGATGGGTTTACAGCAAACAGGTTGGTTTCTATATATACCATCGAGGCGTGTGATGAGAAATTGGCGGGTTGGGTGCTTCCAGGTTGTCGAATCTCTCTAATCAGGTCGATAGCATTTTATAGTAGAAGTTTATAAATTCAATTCCACTTGATGCTAACTAGTAACTATCATGGGGTTTTGAACCAATAATCTTGTGAGATTTCAAGTGATTGCAATTATTTCCTGCCCATTCTTGGCTCACCAAATTATAATTTTGGTGATGTATTTTGAAAGTTCATTTCCAGTTACAGTTTTAGTGCAATACATAACAAGCCTATTGACAATAAACTTTGCTGCTTGTTTAATGTTAACCATTTATATCTCTTCTGTTTCCAACATATATGAGTAGACTAAGTACTTGGCAAATTTCATCTTACTAGGTGAACAGGAACTATAATGGAGGCTAAGTTTTTCCGGTTCCTGAAGATTGTGGGAGTTGGTTACAAAGCCAGAGCTGAAG

mRNA sequence

ATGGGAAGCACTTCCATGAAATTCCTGATGTTGGCGCCAAGCGCTTTCCTGGATCACGATGCCACTACACCCGCCCCGCCGCACGCCGCCATTCGCCCCACGACGCTCATTTCTCAGATCCCGAAGGTATCCCTTGCAATCACACTCAGCCTCAGCTTGTCCCAATCTCTCCCTGTGGTAGCACAATCTTCAGTCGCAAGCCCCAATAATCCCTCCTCTCTGTTTCGTCTTCTCTCTCGATCGCTCCCCTCAATCTCACTCACTTGGCCTACTTCAAGGGTTTTGGAGCAGAAAATCTTTAACCAAATTCCAATCACATGGACAGTTTGAGGGTGTGTTGATGGGTTTACAGCAAACAGGTTGGTTTCTATATATACCATCGAGGCGTGTGATGAGAAATTGGCGGGTTGGGTGCTTCCAGGTTGTCGAATCTCTCTAATCAGGTGAACAGGAACTATAATGGAGGCTAAGTTTTTCCGGTTCCTGAAGATTGTGGGAGTTGGTTACAAAGCCAGAGCTGAAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAAGCACTTCCATGAAATTCCTGATGTTGGCGCCAAGCGCTTTCCTGGATCACGATGCCACTACACCCGCCCCGCCGCACGCCGCCATTCGCCCCACGACGCTCATTTCTCAGATCCCGAAGGTATCCCTTGCAATCACACTCAGCCTCAGCTTGTCCCAATCTCTCCCTGTGGTAGCACAATCTTCAGTCGCAAGCCCCAATAATCCCTCCTCTCTGTTTCGTCTTCTCTCTCGATCGCTCCCCTCAATCTCACTCACTTGGCCTACTTCAAGGGTTTTGGAGCAGAAAATCTTTAACCAAATTCCAATCACATGGACAGTTTGA

Protein sequence

MGSTSMKFLMLAPSAFLDHDATTPAPPHAAIRPTTLISQIPKVSLAITLSLSLSQSLPVVAQSSVASPNNPSSLFRLLSRSLPSISLTWPTSRVLEQKIFNQIPITWTV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC01G018950.1CaUC01G018950.1mRNA