CaUC01G002850 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGCCCCAGCTACCATTATATATCAAGGCCCATGCTTCATTTTCTTTCATCTTCCATGATCTGTATCTCATCAATTCGCTCTCTTCTCCGAAGAAATTTCTTCAGCGTTCGATCATTATCTTCTTCACCTCTGGTTTCAAATACCCGATTCTTCCCCGATTCGAAGCAAACCCTTTTGCATAATCAGCAGTGTTTTTCTGTAACTCGTTTCGTTTCACCAATTAATTCAGGTTCTTCGCTTATCGGCTCGTTTTCGACTCGCTTGGAACATACTATGGCCACCCCTTCCAAGACTTCAGTCCATGACTTCACCGTCAAGGTTGGATTTCTTCTTCATTTTGCATGTAGTTTTGAGTTTGTTTTGGTTTGAGATCGGGTCGTGTCGAGTTGATACACTGATTTTGAATCCTGAGAATTTGGAATTTAGGGGAAATGGTTTTTTTTCTCTAAGGTTTTTTTTTTTAGTGTAAGGTTATTGTAATCGAATCATATGAGCGGGCACTCTTTTAAGGGAATTTTGTTGGTATGGTATCATTTAGTGTGTTAGCGTGGAGAAGTATGGGTAATCGTTCAATTGTGTTTATGATTTTCCCTTCAATTCAGCTGTTTCCACACCCTTTCAATGGCTGGTTGAATCAATGGGCTTCAATTAGCTCTGTCATTTTAGTTGGGGAATTCCTCTTTTTCTGTGAAGCTCTGATTGATTTGCTTCCTGGGAATGTTAATAATTTGTTGGCTTTTCTTTTCGAAACTATATGAACTGCTTGTCCTCTGCTTGCAGGATGCTAGAGGAAATGATGTTGACCTCAGCATTTACAAAGGAAAGGTCCTGTTGATTGTCAACGTCGCTTCACAATGGTAGTGTATAGTACACAGTTATTTCTGATGCCTTCTCTAATCTCTGTCCCAAAAACATAAGGATGTCTTACAATTTTGTCTTGAAAGTTTTTGAGTTGATTATATTGTATCTATGTAGTCAAAATGGTAGGATGATGACTTTGAGTTGCCATTCTTAATCATGTGAATGAATAGTCCTCTATGAGCCATTATAGATTTAAGAGAATTTTGGTATCACCTTCCAATATAGAAGAGAAAAATCTCTCCAACCTTGATGTATAGATATAGTTATGTCGATGATAGATTCCAAGAATGGAAATTGAGACTATATCAACTATTAGTTTTAGATTGGGCAGTACATAATTATCCATATGATGAACGTGGGCAGCCACTTTGACATTGTTTTGCTTTCTTTTTAATGTTTAGTTTTTGATGCACTGCAGTGGCTTGACCAATTCGAATTACACTGAACTGAGTCAGCTGTATGAAAAATACAAGGGTCATGGTCTGTTCTAAATATCCTTCAATCTATTTTCTCTCTTGCTTCAATTCATCCTTTCTTCTTTCCAATTCAAGTTCATAGTTACAATTTACGCTTGAATTCGACAGGATTTGAGATTCTTGCATTTCCGTGCAACCAATTTGGAGGCCAGGAGCCAGGAACCAATGAAGAGATTGTGCAATTTGCTTGCACCCGTTTTAAGGCTGAGTACCCCATTTTTGACAAGGTAAATAAGATACCCATTTGACACCTTCAAATCTTACTGGGGTTTTAGTTTTTACATGGTTGACACAAGGGAATTGTTGTTCAAAGTGGTAGATTTTATTTTAAGCTATATAACTGTCCTTTCTTGTTCATAACAGGTGGACGTGAATGGAAACAATGCGGCTCCTCTGTACAAGTTCTTGAAGTCAAGCAAAGGTGGGCTCTTCGGAGATGCCATTAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTGGACAAAGATGGAAACGTTGTCGATCGTTACGCCCCAACAACTTCCCCGCTCAGCATTGAGGTGAACGAATCCAATAGTTCTTCGCAACTAATCTTATAATCGAATTTGAGTACTCTTTTCTTTATGAATCAATCAGTCCATTATTGTAACTGTGGGGTGTTGGTTGTATTTTTACAGAAGGATGTGAAGAAGCTGCTTGGAGTTGCTTAAGAATCTGAGGGCTGTTTTTCCTTGTCTTTTTATTAGAAACAATGAATAAAGCTGCTGTGTATTTGCTCTGATGTGTATGCCTGTGGTTTTCTTAATGTTGTTCCATGTATTTACAAGACTGTAAGTTAAGAATTATGTAATAAGTTGGTTGGGCTTTGATGTATCCCAAATGTAGCTGCTGTTTTTATGCGCTGGTTTTCTTAACGTCTGTTCTTGTACGTTTTGAAGTACAAATTTACAGATTTATTTCTTCCTCTTGCAATTTTATTAGATATTATGATGTGTGGGCCGAGATTCGAGCGTGTGGTGGAAATTTTGAATATATATATAATGTTAGGAGAATTATTATAATGAAAAAAAATATCTAACTATTTATAAATATATAAATATATGAATATATAGAAAAATTCTTGGGACATAGAATTCGGTCGATCTATGTATTTTCTATATCCAATAATGTTGTGTGCAAATATCCAAAAGCAGGATGATTTAATGTTAGGGAAATTATTTTAAGGTGTAAAATTGTTGAAAACATTTTACAAATAAAAACTGTTAAAAAATATTTGCTTTGATCACAGCGTGATAGATAGCAATATCTATGTGACACATGATATAGTAAATATTTTTCTTGGTTTTTATATATCTAGAAACCACTCTTAATATTATATTATTAATTTTATATTATATCATCTAATATTATATATTATAAATTAAAATAAATAAAATTAGTAACTTTAAACATGTAATTTTTTTTTTTTTTTTAAGGTTAATCGTTTAGAGCAATTTAGAGTAAAATTGAAAAATAACAATTAATCTCAATGATTTAATCTCCGTAGTCCTTGTAGCCCTTGAATTTTGGTCTATAACAATTTAATCCTCGTACTTTTAGTTTTGTAGCAATATAGTTCTTAAATTCTATTATGTAACAATTTAGTCATTGTACTCTAAAATTTGTAATGAAAAGTTTGTAACGATTTAGTCTCTAGTGTTAAAATAAACTTTTTTGCATAAATAAACAAATAAACAAATTAGAGACTTAATATTCGTATATAATACAAATGAAAATTTTAGTCCCTAAATTTTACCATGTAACAATTAAGTCCTTATACTTCAAAATTTGTAATTAAAAAATTGTAACAATTTAGTCTCTATAGTAGAAATTAGTGTTAAGATTTAATGAGATTTTTTACACAAATAAACCAATAAATAAATTAGAGACTCAATATTCGTATATAATACAAAGTCTAAAATAATAAAAACTAACATCTAATTTTGATAAATTTTTTTACACAAGAGACTATATTGTTACAAATTTAAAAATATAAGGATCAAATTGTTATACGCTAAAGTTTAGAGACTAAAGTGTTACAAAATTAAAAATATAAGGATTAAATTGTTACAAACCAAAGTTTAAAGACTAAATTGTTAATTTTATGAAAGTTTAGGAAAAAAAATGTTTTTTAATTTTTTTTTAAAGTATGGTGTAAGTAGGAAATTCGAACAATAGATTTCAGGAAAAAAATTTGAATTTTAAGTCCATTCTAAAAATTCACAAAAATGGTAACTTAATTTTAAACTTTACAAAATGCCCAAGAAAAAGCATTTTCTCAAACGGGGTTTTAATTAATTAGAATTTTTTTCTTTTTTAATTTAATTGAATTATTAACTGAGTTAAAATTTTAAACTACACTAGTTATTCTAGTATTTAATGTAGTTTGGTTTACATCACTATTATAAGGAGGGGAGATTTGAATCTTGAATTTGTTTTATCCTCTCAAGTTTATCAATTTTGATAATGAAGTAATTCTATTATTTTTTTACCATAATTACTTTGTATTAGTAATAAATTTTCAAAATAAACAAATAGAGTTAGACTTAGTTTGGGATTGTTGTATTTTTTTGAATAAGAGATTGAATCAATTAAAATTTAGAACAAATGTTAGAAAATAAATTAAGGGAATGATAAATTTGAGATGGGTAAGAGAAAAATGTTAGGAAAGCTACAATCGAACAAATTTAAAAGTGATTTTGAGTAGATTAATAAATAAGTTGTTTTACTAGACCGCTAAAGCGGTTAGGTTTCACGTATAATCACTTTTTACGCTTGCAAAAGTAATTCCAAACAAGTCTTTAATTTTCTTCACAAACGTTTATGTTGTGGAGCATGATCATGCCGATGTTTGTGTTGCACTACCAAATTGCTTGTATTATATTGAAAATTCTAGTATTTTTATTATATATTTTCATGTGAGTTTCGATTTGTTAGTGATATTTTATATTAAAAAGAGGATACTTATTAATTAATTTAACTTTAATAAAGATTGATTAATTTTCGTCAACATTGCACATGCAGATACACATGTTACATATACATATATATTCTCCATTATTTTAACAACGTTAATTGCAATATTCATTTTATATATTTTTCGTAATAGTGATAGAGAGATCCAACTTTAAATTGTTGGTGGCTAATACTAATTGATACTATTTTTAATGATTTGAAATCAATTTTAATGGTATGAACATTTTGTTTAAAAGTGTAAAATCAAACATTAAATTCATTTTGATGATTAAAAACATGTTTCTATTTTAAGTTATTTTGGACTAAATGGCGCAATCAATATTTAAGAAGAAAGCATAATTCAAGTCGAAAGTCCCAACTTAGGACTAAAGTGGCCTAGAAAAAGGGCGCTAGCTGAGGCCAGGCTCAAGTCAGCATGCTCGACCTTGGCCAAGGTCATGCCAAGCCTCACAAACACACCCAACATGGCATGCTTTACACATGTTTCGGCTCAAGGGATCATCTTAGGCCCAAAATATGGCTAAGAGAAGGTGCTTCACCTTGGCCGAGGCTGACCCTGGGGTAATGTCCTAGGTCAACTACACCTATAATTACATCATGAAAGCTTTGAAAAGTAAGTTCATTCTAATACTCAAACTCTCTACTTGCTAGACAATTATACCTTCTTT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ATGGGCCCCAGCTACCATTATATATCAAGGCCCATGCTTCATTTTCTTTCATCTTCCATGATCTGTATCTCATCAATTCGCTCTCTTCTCCGAAGAAATTTCTTCAGCGTTCGATCATTATCTTCTTCACCTCTGGTTTCAAATACCCGATTCTTCCCCGATTCGAAGCAAACCCTTTTGCATAATCAGCAGTGTTTTTCTGTAACTCGTTTCGTTTCACCAATTAATTCAGGTTCTTCGCTTATCGGCTCGTTTTCGACTCGCTTGGAACATACTATGGCCACCCCTTCCAAGACTTCAGTCCATGACTTCACCGTCAAGGATGCTAGAGGAAATGATGTTGACCTCAGCATTTACAAAGGAAAGGTCCTGTTGATTGTCAACGTCGCTTCACAATGTGGCTTGACCAATTCGAATTACACTGAACTGAGTCAGCTGTATGAAAAATACAAGGGTCATGGATTTGAGATTCTTGCATTTCCGTGCAACCAATTTGGAGGCCAGGAGCCAGGAACCAATGAAGAGATTGTGCAATTTGCTTGCACCCGTTTTAAGGCTGAGTACCCCATTTTTGACAAGGTGGACGTGAATGGAAACAATGCGGCTCCTCTGTACAAGTTCTTGAAGTCAAGCAAAGGTGGGCTCTTCGGAGATGCCATTAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTGGACAAAGATGGAAACGTTGTCGATCGTTACGCCCCAACAACTTCCCCGCTCAGCATTGAGCTGCTGTGTATTTGCTCTGATGTGTATGCCTGTGGTTTTCTTAATGTTGTTCCATGTATTTACAAGACTTACAAATTTACAGATTTATTTCTTCCTCTTGCAATTTTATTAGATATTATGATCGTGATAGATAGCAATATCTATGTGACACATGATATAGTAAATATTTTTCTTGGACTAAAGTGGCCTAGAAAAAGGGCGCTAGCTGAGGCCAGGCTCAAGTCAGCATGCTCGACCTTGGCCAAGGCCCAAAATATGGCTAAGAGAAGGTGCTTCACCTTGGCCGAGGCTGACCCTGGGACAATTATACCTTCTTTCTTAAACATTACACCTTCTGACTTAAACATTGAAGCCTGGGATCTTTCCATCTTGAAGCTTCTTGTCACTGTCAGTTCACTATTTTGTAATTGCTATTTCCTTGCATTTCATCGAAGCTCAGGTCTGTTGATTTTACAATGGCTACCCAAGCTTCAAATCACCCGGAATCCATTTACGACATCACCGTCAAAGTTTGTTCTCAAATGGAAGGGGTTTTTGTTAAATTTCAATGCATCTTTTGAATTGAATGTTAATTTTCGTTTTGATTTGTTTCATTTCGATGCTGAGGGAAATGATATCAACCTTAGGATATACAAGGGTAAAGTCCTACTCATTGTCAACGTTGCTTCCAAATGGTACATTCTTTTTCTTTCACTTTCGATGTTTGCACCTATATGCTCTTTAATTTGCAACGTTTCTTTTGTTCTTTCGCTAGGATATTTCAACATGATTTCAAACATTACAAAACACAATTCACTGATGTTTCTGAGTGTTTTTGCTATTATTTTTATCCCTTGCAACAGTGGGATGACAAATTCAAACTATCTGGAGTTGAACCAACTATACGACAAATACAAAGAACACGGTTACCCTTTTATCACTCTCTTGTTGAAAATCATACGAATCGCTTATTTAGTATATTCTTGTTGGTTTTGTTACTTTTGTCGAAGAATTCTCTCTTTAGAATCCTATGTAAATGCATTTAGAAATTTGATGAGTTGGTTTGGATGTATTGTTATTGCAGGTTTGGAAATTCTGGCATTTCCTTGTAATCAGTTTGGCGACGAGGAACCGGGAAGTAATGATGAGATCAAAGATTTTGTCTGCAGTCGTTACAAATCAGAATTTCCAATTTTTGACAAGATTGAAGTAAATGGGAACAATTCTGCTCCACTCTACAAATTTTTAAAATTGGGCAAATGGGGGATATTTGGGGACGATATTCAGTGGAATTTTGCCAAGTTTCTCATTGATAAGGATGGGAAAGTAGTTGATCGTTATTACCCCACAACATCACCTCTCAGCATTGAGCATGATATCAAGAAGCTATTGGGGATCTTATGA MGPSYHYISRPMLHFLSSSMICISSIRSLLRRNFFSVRSLSSSPLVSNTRFFPDSKQTLLHNQQCFSVTRFVSPINSGSSLIGSFSTRLEHTMATPSKTSVHDFTVKDARGNDVDLSIYKGKVLLIVNVASQCGLTNSNYTELSQLYEKYKGHGFEILAFPCNQFGGQEPGTNEEIVQFACTRFKAEYPIFDKVDVNGNNAAPLYKFLKSSKGGLFGDAIKWNFSKFLVDKDGNVVDRYAPTTSPLSIELLCICSDVYACGFLNVVPCIYKTYKFTDLFLPLAILLDIMIVIDSNIYVTHDIVNIFLGLKWPRKRALAEARLKSACSTLAKAQNMAKRRCFTLAEADPGTIIPSFLNITPSDLNIEAWDLSILKLLVTVSSLFCNCYFLAFHRSSGLLILQWLPKLQITRNPFTTSPSKFVLKWKGFLLNFNASFELNVNFRFDLFHFDAEGNDINLRIYKGKVLLIVNVASKWYILFLSLSMFAPICSLICNVSFVLSLGYFNMISNITKHNSLMFLSVFAIIFIPCNSGMTNSNYLELNQLYDKYKEHGYPFITLLLKIIRIAYLVYSCWFCYFCRRILSLESYVNAFRNLMSWFGCIVIAGLEILAFPCNQFGDEEPGSNDEIKDFVCSRYKSEFPIFDKIEVNGNNSAPLYKFLKLGKWGIFGDDIQWNFAKFLIDKDGKVVDRYYPTTSPLSIEHDIKKLLGIL Homology
BLAST of CaUC01G002850 vs. NCBI nr
Match: KAG7036048.1 (putative phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase 6, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 4.5e-145 Identity = 326/684 (47.66%), Postives = 343/684 (50.15%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. NCBI nr
Match: KAF3448555.1 (hypothetical protein FNV43_RR09268 [Rhamnella rubrinervis]) HSP 1 Score: 471.9 bits (1213), Expect = 1.0e-128 Identity = 301/687 (43.81%), Postives = 336/687 (48.91%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. NCBI nr
Match: KAF9689346.1 (hypothetical protein SADUNF_Sadunf01G0082700 [Salix dunnii]) HSP 1 Score: 464.5 bits (1194), Expect = 1.6e-126 Identity = 305/695 (43.88%), Postives = 377/695 (54.24%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. NCBI nr
Match: KAB5573580.1 (hypothetical protein DKX38_000774 [Salix brachista]) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 4.3e-124 Identity = 283/613 (46.17%), Postives = 330/613 (53.83%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. NCBI nr
Match: QCD85030.1 (glutathione peroxidase [Vigna unguiculata]) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 7.4e-124 Identity = 275/636 (43.24%), Postives = 321/636 (50.47%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O48646 (Probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase 6, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GPX6 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 314.3 bits (804), Expect = 3.5e-84 Identity = 168/228 (73.68%), Postives = 190/228 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06652 (Probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase OS=Citrus sinensis OX=2711 GN=CSA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 290.8 bits (743), Expect = 4.1e-77 Identity = 137/157 (87.26%), Postives = 148/157 (94.27%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23814 (Probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase OS=Spinacia oleracea OX=3562 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 281.6 bits (719), Expect = 2.5e-74 Identity = 129/150 (86.00%), Postives = 143/150 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LEF0 (Probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase OS=Mesembryanthemum crystallinum OX=3544 GN=GPXMC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 276.6 bits (706), Expect = 8.1e-73 Identity = 128/158 (81.01%), Postives = 143/158 (90.51%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P30708 (Probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase OS=Nicotiana sylvestris OX=4096 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 2.0e-71 Identity = 124/150 (82.67%), Postives = 140/150 (93.33%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5P1D4 (Glutathione peroxidase OS=Salix brachista OX=2182728 GN=DKX38_000774 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 2.1e-124 Identity = 283/613 (46.17%), Postives = 330/613 (53.83%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4D6L995 (Glutathione peroxidase OS=Vigna unguiculata OX=3917 GN=DEO72_LG2g5388 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 3.6e-124 Identity = 275/636 (43.24%), Postives = 321/636 (50.47%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438JJM0 (Glutathione peroxidase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=GPX6_1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 444.9 bits (1143), Expect = 6.3e-121 Identity = 298/734 (40.60%), Postives = 356/734 (48.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A445HVZ7 (Glutathione peroxidase OS=Glycine soja OX=3848 GN=D0Y65_028762 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 3.5e-119 Identity = 270/617 (43.76%), Postives = 301/617 (48.78%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4Y1RGD0 (Glutathione peroxidase OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=Prudu_014196 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 1.5e-117 Identity = 295/702 (42.02%), Postives = 371/702 (52.85%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. TAIR 10
Match: AT4G11600.1 (glutathione peroxidase 6 ) HSP 1 Score: 314.3 bits (804), Expect = 2.5e-85 Identity = 168/228 (73.68%), Postives = 190/228 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. TAIR 10
Match: AT4G31870.1 (glutathione peroxidase 7 ) HSP 1 Score: 252.3 bits (643), Expect = 1.2e-66 Identity = 118/153 (77.12%), Postives = 130/153 (84.97%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. TAIR 10
Match: AT2G25080.1 (glutathione peroxidase 1 ) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 7.8e-63 Identity = 119/178 (66.85%), Postives = 137/178 (76.97%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. TAIR 10
Match: AT2G31570.1 (glutathione peroxidase 2 ) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 3.9e-62 Identity = 112/157 (71.34%), Postives = 125/157 (79.62%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC01G002850 vs. TAIR 10
Match: AT1G63460.1 (glutathione peroxidase 8 ) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 1.5e-61 Identity = 104/157 (66.24%), Postives = 132/157 (84.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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