CSPI07G15130 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGCTTCTTACTTGGGAAAGAAAATTGATGGAAAAAGAAAGAATGGAGTCTTATGAAAGAAAATCCCCACAGGGATAAATGGTAACGCTTTTTGAAAAATTCACATTTCATTTCACCATTTCTTTGGTAGACATTCAAATCAGTGATCGGAAAAGGGCGGCACACTTCAAAATTTCCCTCTAAACATCGGTTCAGGACAAGAATTTGTAGATACTTGCAGATGAGTGGCGCGAGGCTGTGCGGTTTGTTGGGCGAATTGGGGTATGAAGGCGCACAAGCATTGGACCCTGACAGTTTCGAATGGCCATTTCAGTACGACGATGCTCGCTCCATTCTCGATTGGATCTGTTCTAGCCTGCGCCCCTCCAATGTCCTCTCCCATTCCGAGCTCTCCCAGTAACTTCCTCTTCCCCATTTTCGTTTTTTTTTTTTGGTTAATTTGTGAATGCTTGTAGTGGGTTTGAATTTTACTCATCGGCGAGTGTCATTTTGGCGTGTAATATCTAGGTACGGGCAATTCCTTGAAGAGGGAAAGCTTTTGGAGGTGAAATTCTTTAGAATTTTTCAGTATGGTTTTGTTTTGATAGAAGAGTTGTTGGGTTTTAATTGTTGGGTTTGTCGAACAGGGGGAGGATTTGGATTCAGCTTATGATAGCATTTCGGCATTTTCGTCTAGACGAGACAACCAAGACGCTCTTTTTGGAGGCGAAGAAGGGTTGAAGGAGATAAGGTGGTATACTGTGTACATTCTTTAAAATAGGTTCTTGTGTTTGGTTTGTATCGCTGCCGCTTATGTCATTTACAATCTTGTTTTCAACATTGGTAGAGAAGCAACCGTCGCATATAAATCTGAAGCATTACAGTTACAAAGACAACTTAGCCATCTTCAGTCTCAATATGATATGCTTACAAGCCAAGCTTCTACTTTGACTCAAGGGAGACGGGCACGAGTTGCTGCAACTTCTAGTGTAAATGGACAATTAACGAGTATAGATGATAGCATCTCTGCCAGGAATTTAGAGGTATATAAACAATGGGGTGAACAATTTATCGTTTCTGCTTTATTTCTGTGTCTAACGTGTGGTGTTTAATCTTCTGTATAACCACTAATAAGGAGTGTTTGAAACAAAAGACCTCCAATCTATATTGGTAAGGAAACGTTGAATTACAAAAAGAAATGTGTAGGGCACTCTGAGTTGAGGACGTAAACTGTATATTTTCAAAAAAGTTTCAGAAGTTGTAAACTCATACGAGAAAGTTCTATGGTTTTTTTCCTTCCAAAGAAGCCAACAGGTGGTTTATTTCGCTCATCTTTCCAACCATCTAAACACTATCATTTTGCTCACTTCAAAGATCCCCAATGCCATTGGATTATCAAAAAGGTTTCCAATTATCAAAGAGCTTTAGCCTGTCCTCTTATGCACGAATTAGGAGTCAGCCATGCTGGACATAGGTGTTCAAGTGATGATTGAGGAGCTCCTTCTCAATCTCCCTTTTAAAGAGAAAAGGTGTTTTTTTGGGGCTTGTTGGAGTGTCTGCTATTGTTTGAGATGTTCGAGGAGACAGGGACAATCTCGGGTGTTTCACAGTAGGGTAAGGGATCTTTGTGAGATTTGGTATTTTGGTTTGATTTCACACATCCTTATGGGCTTTGATTTTTAAGACCTTTTGTAATTATTCCATCAATAACATTTTAATTAGTCGGACCCCCTTCTTGTAGTTGGGGCGTTTAGGTGGACTTGGTTTGCTCTTGTATTCTTTCATCATTTCCTCGATGAAAGTTGTTTCTACCCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGGTCTAGTCTGTCCTTGGGAAGGAGTCCTGCTCAGTAGCTGAAATAAAGCTTTTGAGGCCCTGTTGGGGAAACGCCAATTAATTTTGAAATTTCTTAACAAGTCCTTTCAGCAAGCAGCAGCAAAAGGACAATTAAAGATAAATTATTGTGCCATAATTTTTTAATTAATGTCTTGTTAGAATTAGTGGGCTTGGACCCAAGGAAGGATTTAACCTAATTTCCTTTCCTTTTTTATCATAAACATGTTGTCTATTTATTTTCCCCTTGTATCTTTTGTTAATATGAGAAATTAATAAGAAAGTCATATTGTGGTTTTTCTCCCATTACTCAGGTTTCCACGTAACTTATTGTCTATTTTCTTTACTACTTTTAATCGGGCTTCATCTTATATGGCATTTTTGTCTCCCCCCGTTGTAACTGTAAACCTTCCCTCTTTGAAAATACTTGGTGAATTATTTCATTTTAAGACATCTTAAAATGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGTGTTGTAATTTAGATGAATGCAGTTCTTGGAAGGATTGCATCCACAGCCCAAGAGTTGGCTCATTATCATTCTGGCGATGGTATTATTTTAGTTGTTCTATCACTTTTTATGACGAGTTTTTATTCTACTACTTTAAGGTTTAGTCAGTTATTTAAATTAGTTTCATTTGAAGCTTATATTTTGATTCTTCTGATTTTTCTCTATTAAATATGTCATGTGTGTACTTAAGGAGAAAGATACCGTTGAATTTTACAATTTCCCTTCTTAAAACCACATTGTCTCTCAGGAAAATGTCATCACCAATCTTTCTTGGCTGTTTTTGAAATGGGAGGGAAGGAGGAGAGAAGCAGGGAAAGAAAAATAAAAGTGTTAATGTGGATGTTGTCTGTATTAATGTCTTCTAGAGGCTCCTCTTGTTAACGTGGGTGTTGTCTGTACTGATGTCTTCTACAGACTCCTCTTAGAGTGCTTTATCTAATTGCTGTTATTATTCGTCTTCTCTATCTAGCTAGATATGGGTAGTATTGTTGCAGAAGAGGTACGTTTGGTTGTGTTATTTTATCTGACTTGCAAGTGTATCCAATCCTTGTACGTGTTGTAACAAATGATTCTAATCACTTTTTAGCTTGAGCATCATGCATGTCCATTTGCTTTGCAACATTGACAGTTCCAATCTCTTAGATAATAATTTAAGTTTTAATTCTTTTTAAACAATTTTTTTTCATTTCTTTCGTCTCTTTGATTCCTTCTGAAGTTATGAATATGAATGATTGCGCAGAGGATGGTATTTATTTGGCGTATTCCGACTTTCATCCATACTTGGTTGGGGATTCATCCTGCATAAAGGAGCTAAATCAGTGGTTTTCTAAACAACTAGACACGGTATGCAGATTTGAATCTTAGATCTTTTGAATTCAAAATTGTATGATGGGAACTTTTGGCCATCAAGATTTCACTTATGACAAAATGTGATAACACCTTTTTTTTTTAAAGGAAACATAGAACTTTCTTTGAGCAAAAATGTGACACACATAAGGGAAGGGAGATTTGATTCTCTCAATCCCAAGCCAAGAAATGACACGAGGTTTCTAATTAATTTTGATGTGGAGTATTAGTTACGAATGTTCAATAAGGTTTTTGAGGCTGATGCTTTGAGGCTTGCAGCAAGACTCAAATTTCTAGCCTTGAATGTTTTGCCCGATTTGAACACGAGGTTTATACCTTCATGAGCACACAGAAGCTTGAACCCTTCACGTTCTGAAATAACTAGGACACTAATACCAAATTACTATCTGTTTGTCTTCAAATAGAAACTTTCACTTATGCAATATTCCATTGCATGTAGTAATTCTATACTACTACTTTTATCATGAAGGTTAGCAAAATTATTAAGGATGAAAGTTAAAGAATAAGTTGGATTCTTTTTGTGAAAAAATTACATATATATTTTTAAAATGGAAAACCAAGTTTCATTGTGGAAAATGGAACACAAATGGACATACAAAAACAACCAAATAACAGGAACCAAATGATTAACTATACAAAAAGGGCTCCGATTCAAGATGAACGGGGTTAGCCAAATCCTTGGACAAAGATGCCTAAATGGAAGCAAACCTAGCAAGAGACCTAACTGTTCTTCCCACAATCTCTTAAAATCTTTAAAAATGCTATTATTTTTTCTCAAGGTCCTACAGGACAAACATATTTTTTCCTTTTTACTCTCCATTTTCTTATTGTCTTTTAATGCTAGTCTTTTTTTTCTTTTTATTTATTTTTTAAAATATTTAATTTTGTTAATATTGATGAAATTTGATTTTTTGTATGATCATATTTCTACCTTAATTTGCTTTCATTGTTTTTGTCATGCGATAATGGTTAGGGGCCTTATCGACTAGTTGCTGAGGAGGGAAAGTCAAAATGTTCATGGGTGAGTCTTGATGACATGTCAAATATCTTAGTAAGAGGTATATTTCTTGTGAACTTTATTTTATCCTTTTCACCTTTCACTGTTTTTTCTTACCCAAAAAGAGGGTTAAAAAGAATTGAAAGTATTAAATTTACCACTAACCCATTAGCTTAAACTTTTGAGTTCACAATAGTTTAACATAGTATCTGAGGTCTTGTGTTGAAGCTTTTGTGATGTCATTTTATCTCTCTTAAATCACTAACAAGTGGGGCAAATTTAAGATAATATCTAACACTGCTTCTCACTCGTGGGTTTGAAATATGAAGAAAGTCCCAACAAGTGGAAATTAACATTAATCAAGGAGGAAACAACAACATAAGGGCTTGAACACAAGACTTTTTTGGACCACCTGCTCTGATACCATCTTAAATCACCAATTCACCCAAAAGCTTAAGCTGATGGGTGGAGGAAGATTTAATATAGTATCTAACAATCTCGATTAACATTAATTTTTACTTATTGGGTCTTCTACAAAACTTTGAGGCCATAACCGGGGCATGTCAAAGTGCATTGAAATAATTGCCCATTAGTTTAAGCTACTGGGTTTATTGGTGATTTAACCAACAAAGGGAAAAAAAGTGAAGTGGAGGGTAAACATGACTGTAATTTATATTGTTTGATCATCTTGCTCTCCCTTTCTTGTTCTTATTGATATTTCCCTGGTACTTCAGGTTTCTGTAGTACTGTATGATGTTTTATAAATTTAAACCAATT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ATGAGTGGCGCGAGGCTGTGCGGTTTGTTGGGCGAATTGGGGTATGAAGGCGCACAAGCATTGGACCCTGACAGTTTCGAATGGCCATTTCAGTACGACGATGCTCGCTCCATTCTCGATTGGATCTGTTCTAGCCTGCGCCCCTCCAATGTCCTCTCCCATTCCGAGCTCTCCCAGTACGGGCAATTCCTTGAAGAGGGAAAGCTTTTGGAGGGGGAGGATTTGGATTCAGCTTATGATAGCATTTCGGCATTTTCGTCTAGACGAGACAACCAAGACGCTCTTTTTGGAGGCGAAGAAGGGTTGAAGGAGATAAGAGAAGCAACCGTCGCATATAAATCTGAAGCATTACAGTTACAAAGACAACTTAGCCATCTTCAGTCTCAATATGATATGCTTACAAGCCAAGCTTCTACTTTGACTCAAGGGAGACGGGCACGAGTTGCTGCAACTTCTAGTGTAAATGGACAATTAACGAGTATAGATGATAGCATCTCTGCCAGGAATTTAGAGATGAATGCAGTTCTTGGAAGGATTGCATCCACAGCCCAAGAGTTGGCTCATTATCATTCTGGCGATGAGGATGGTATTTATTTGGCGTATTCCGACTTTCATCCATACTTGGTTGGGGATTCATCCTGCATAAAGGAGCTAAATCAGTGGTTTTCTAAACAACTAGACACGGGGCCTTATCGACTAGTTGCTGAGGAGGGAAAGTCAAAATGTTCATGGGTGAGTCTTGATGACATGTCAAATATCTTAGTAAGAGATTTGGAGACATCCCATCATCAACGTGTATCTGAGTTGCAAAGGCTACGTTCGATTTTTGGGACAAGTGAAAGACAATGGGTCGAAGCTCAGGTTGAAAATGCAAAGCAGCAAGCTATTCTAATGGTTCTCAAGTCACAAGTTACGTCAGATGAAGCCCATATTCATCTTGATCTTCATTCTCTCAGGAGAAAGCATTCTGAACTGGTTGGGGAGCTTTCAAATCTCTATGATAAAGAGGAGAAATTGTTATCTGAGACAATTCCTGATCTGTGTTGGGAATTGGCTCAATTGCAAGACACATATATTTTACAAGGAGATTATGATTTGAAGGTCATGCGTCAGGAGTTCTACATTGATAGACAGAAAGTGTTCATCAGTCATCTGGTCAATCAGCTTGCTAGGCATCAATTCCTGAAAATAGCTTGTCAAGTGGAAAAGAAGAACATGCTTGGAGCATATTCATTGCTTAAAGTTATAGAGTCAGAACTTCAAGCATATTTGTCAGCCACCAAGGGGCGAGTGGGTCGTTGCCTGGCACTGATTCAAGCTGCTTCAGATGTACAAGAACAAGGTGCAGTTGATGATCGCGATAGTTTTCTGCATGGTGTCAGAGATCTGTTAAGCATACATTCAAATATCCAGGCTGGAGTATCAACATATGTGTCTGCTCCCGGCATTATTCAACAGATATCTCATCTTCATTCAGATTTGAGAACCCTTCAATCTGATCTTGAAAACTCCCTCCCGGGCGACAGAAACAGATGCATCAATGATCTGTGCTCTCTTATTCAAAGTTTGCAGCAATTACTCTTTGCCTCTTCTACAACTGCACAACCATTACTGACTCCACGGGCCTTAATGAAAGAGCTGGATGAGATGGAAAAGATAAATGCCAAACTATCTTCTGCAGTTGAAGAAGTTACCTTGGAGCATTGTAAAAAGAATGAGATTGTCAAACATCATTCTCAGGAAGTAGGGCTACAACGTAGAGTTTTCGTTGACTTCTTTTGCAATCCTGAACGTCTCAGGAGTCAAGTTCGTGAACTGACTGCTCGAGTTAGAGCCATGCAAGCTTAG MSGARLCGLLGELGYEGAQALDPDSFEWPFQYDDARSILDWICSSLRPSNVLSHSELSQYGQFLEEGKLLEGEDLDSAYDSISAFSSRRDNQDALFGGEEGLKEIREATVAYKSEALQLQRQLSHLQSQYDMLTSQASTLTQGRRARVAATSSVNGQLTSIDDSISARNLEMNAVLGRIASTAQELAHYHSGDEDGIYLAYSDFHPYLVGDSSCIKELNQWFSKQLDTGPYRLVAEEGKSKCSWVSLDDMSNILVRDLETSHHQRVSELQRLRSIFGTSERQWVEAQVENAKQQAILMVLKSQVTSDEAHIHLDLHSLRRKHSELVGELSNLYDKEEKLLSETIPDLCWELAQLQDTYILQGDYDLKVMRQEFYIDRQKVFISHLVNQLARHQFLKIACQVEKKNMLGAYSLLKVIESELQAYLSATKGRVGRCLALIQAASDVQEQGAVDDRDSFLHGVRDLLSIHSNIQAGVSTYVSAPGIIQQISHLHSDLRTLQSDLENSLPGDRNRCINDLCSLIQSLQQLLFASSTTAQPLLTPRALMKELDEMEKINAKLSSAVEEVTLEHCKKNEIVKHHSQEVGLQRRVFVDFFCNPERLRSQVRELTARVRAMQA* Homology
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WQE7 (AUGMIN subunit 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AUG3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 990.3 bits (2559), Expect = 9.5e-288 Identity = 504/615 (81.95%), Postives = 559/615 (90.89%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68CZ6 (HAUS augmin-like complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HAUS3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 8.1e-21 Identity = 123/614 (20.03%), Postives = 261/614 (42.51%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DCY9 (HAUS augmin-like complex subunit 3 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=haus3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 3.4e-19 Identity = 129/615 (20.98%), Postives = 262/615 (42.60%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8QZX2 (HAUS augmin-like complex subunit 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Haus3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 4.2e-17 Identity = 89/461 (19.31%), Postives = 202/461 (43.82%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K8J4 (HAUS-augmin3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G372870 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1194.9 bits (3090), Expect = 0.0e+00 Identity = 615/615 (100.00%), Postives = 615/615 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D231 (AUGMIN subunit 3 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold306G002290 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1186.8 bits (3069), Expect = 0.0e+00 Identity = 608/615 (98.86%), Postives = 614/615 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BHJ3 (AUGMIN subunit 3 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489715 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1184.5 bits (3063), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/615 (98.70%), Postives = 613/615 (99.67%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGX4 (AUGMIN subunit 3 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489715 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1177.2 bits (3044), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/623 (97.43%), Postives = 613/623 (98.39%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GNA3 (AUGMIN subunit 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455978 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1166.4 bits (3016), Expect = 0.0e+00 Identity = 598/615 (97.24%), Postives = 608/615 (98.86%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. NCBI nr
Match: XP_004150336.1 (AUGMIN subunit 3 [Cucumis sativus] >KGN44692.1 hypothetical protein Csa_015762 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1194.9 bits (3090), Expect = 0.0e+00 Identity = 615/615 (100.00%), Postives = 615/615 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. NCBI nr
Match: KAA0041997.1 (AUGMIN subunit 3 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK17932.1 AUGMIN subunit 3 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1186.8 bits (3069), Expect = 0.0e+00 Identity = 608/615 (98.86%), Postives = 614/615 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. NCBI nr
Match: XP_038899056.1 (AUGMIN subunit 3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1186.0 bits (3067), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/615 (99.02%), Postives = 614/615 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. NCBI nr
Match: XP_008447222.1 (PREDICTED: AUGMIN subunit 3 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1184.5 bits (3063), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/615 (98.70%), Postives = 613/615 (99.67%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. NCBI nr
Match: XP_008447221.1 (PREDICTED: AUGMIN subunit 3 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1177.2 bits (3044), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/623 (97.43%), Postives = 613/623 (98.39%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI07G15130 vs. TAIR 10
Match: AT5G48520.1 (unknown protein; Has 609 Blast hits to 593 proteins in 129 species: Archae - 0; Bacteria - 41; Metazoa - 390; Fungi - 40; Plants - 64; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 74 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 990.3 bits (2559), Expect = 6.8e-289 Identity = 504/615 (81.95%), Postives = 559/615 (90.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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