CSPI06G08680 (gene) Cucumber (PI 183967) v1

Overview
NameCSPI06G08680
Typegene
OrganismCucumis sativus var. hardwickii cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP62
LocationChr6: 7300311 .. 7308712 (+)
RNA-Seq ExpressionCSPI06G08680
SyntenyCSPI06G08680
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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CTAAAACCTTCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTAAGTTCTTTACTTTCTTTGTTTTACTTCGTGATATTTGGTTTATAATATTGGCTGTTCGAAATAAGTTTTGTGAGTCATGTTGTTAAGTGGGTTTTTACTTCTTGAGGGGCATATCAAGGATCCCATGTTGGAAAGGTCAATGGAGCTTACACTTCTTTTAACATAGAGGATTTACTTCTTATTCTCAATTGGTTTTGAGATGGAACCTCACGTTAGGTTTTTTGGCTGTATTGGTGTAACCAAGTACTCCTTTCAGAATGTTGCTACATTATGTCAATATACCTAGTGTATTTTGTCTAACTTTTGTTTAATCTTTGCAGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGGTATGTATGTGATTGAGTTGCTTTCCTAGTAATGTATGTGTGTGTTTATATAGAAGCTCTCTTAACTCATTCCACTATGCATTAGTACCTGCATGGATTGGTTATTATTCAATGGTTTATATTCATCATTTGCTTTATTCTTCATTTATGCAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGGTATTTCTTTTTTCATGATCGGAGATTTGCACAGTTCATTTGAGTTGCCTTTTTTCAGACAATTACCAATGTTTTTGTTCCAAAATTTATTATTGGGTTTAGAAAAGGAATCAACATGTGCCTCACTAACAAAAATCTAATCTCCTCCGCTCATATAAGTTTGGTGGATGCCCCTTCAAAAAAAGGAAAAAAAGATGGTATGGGAGGCTTTATAAGAGTCTTTTACTAGAATTTATGGCAAGAAAGAAATAGAAGATTTTTCCAAGATAAAGAAATTCCTTTCTTTAGATTTTCTGATGCAATGGTTAATATGATTGACTTGGTGTAAATGTTCCCCCTTGTTTCACCTAGCTTGACCATGCTTCTTTCCCTACTTTTATAATTCCATACCATTGATGAAGTGTTGTTTTTTTCTTTCTAATTCTACTTTTAAAATGTGCCTCATTACTAGGGACAATTAATGTTCCAGAATTAGTAATGCAGAAAATAAATTGATGACTTAATTACACATCTAGTATTGAAAATGTCATAGAAAACTTTTGGTGTCATTGATTCATCCAATAAAGTATTTTTCTTTCAGCTTAAGTTGACTTCAATTAATAATTTCAAAATATTCTTGCAAATTGTCTTTGTGTTCATTGTTCATGGAATCATCATAAACATCCCTCCAACGTTGTTTAGTCTTTTTTTTTTATTCTTTTTTGGTAATTAAATTGTTTGAAATGTATGCTTCTTGCTTTTTTCTTCATTTTCTTTATAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGGTGTTATGCCACTTAATATCAAAAATTTTAAATCTTCAATGAGATATGAAATTTAATTTGCTATTATGTCTGTTCTAACAAAATATGTGCAAATGATTATAAGAAAGGATAATTCTAGTTAATGAATTTTTGGACCATCTGATTCTTGTACTATTCACCTGTATCTTTCATTGGATCCTAATTTACACGAGATGAACTCTGAGCATATTTGTTAGGAAATCTTTAATTTAAGTGTTCACATCCCTTTATTTTTTCTTCCCTGCGTGTTTTGGACAGTGCTCAGTTCAATTTTACCTTAATGTTTTGTCTCCCAACTGATTATAATTTTTGTTATTTCAACGGTCATTTAAAGAATTGAAAAGCTGCAACAGAGAAACTAACCAAAGGGGCTAATGGAAAGTAGGCTTACTCAGCAGAAATGAGGAAAGGGAAATAATTACGAGTCTTTTTTCACAGGAACGACCACCCTGAAAGTAACCTAAACTACTAGATAAAAAGAATGTCACACTCACCATCTCTCTTTTTGATTTCCTTTTATCTATTTATTTATTTATATTTATATTTTTCTTGGAACTACTTTTTTTAGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTAAAAAAACAAAAAGAATATTTTTCGAAATCTTCAATGTGAAAGGAGGCATCAAAGTACACACTGGATCTTGAGTGGCATATTTTGTTTTATTTGTTGGAATTTGTGTTGCATATTGGTGCTTTGGTTTGTTTTCCTACTAGTCCTCTTTACTTGATGAACTAGTGAGAATTCTTCATTAGGATGGCCTTCAAAGGGATTTTCTTTTTGATTATTTTTGCTGTTGTGTTTTTCTAATCTTCAGGCTGCAGTCTTTTACTGAGTTCTTAATTGGTTGTATTTGTATTTGTTTTGTTTTTGTTTCATTGTACTTTGAGCATTAGTCTCTTTTTATTTTATTGATGAAAAGTGTTGTTTTCTTTTTGGGAAAAAAGTACAGACTGGACTCATTTTATCTTAATGATTCACTTAATTTTTTTCTTTATATCTTCATTGATCAAATGGGTTATCTTGAACTATTATTATGTATTTATTTTTATTTAAAAGTTGTCTCTTTTCTTCTTAGTGAGACATTTATTGATAAGGTGAAATATTCGGAAGAATGTTGAAACCCATTCTGGAAAGAGGGTTCTCTCTATCTAAATGTCAAAAAGGAATAATGAGAAAGATAGATTGCTCTAATGCATTTATTTTGAATTTAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTATTCACCTGCGGCCTTGTTTGTCTTTTCCCTTCAATATTTGCTTTTAGGTAGACACTTTACCTATGGTCTTGTGTTCTTAAAGTAGGATCTTTGGAGGGGTAGAAAGATATTGGAAGGAACTTTGGAAGTTCATTAGATTCAAATTTTAATCCAAAAATCGTTAGTGGGGGTGGTGGGTCATTTTAGTAAGAATTCTTTTTGAGGATTTGGGAGAGAATAGCTCTCTTGAATGCCTGATGTATTGTAACTTATTTTGATATTGCAATATGCATTTCTATTTTTTAATGTGTTTTGTGTTGTTCTTGAGTGTTCATGTTTGGTGGTAACATAACACTTTATTCCTCATGCCTTTGCATCCTTGAAGGAACAGTTATTAACCAAATCAATCACCTTGCAGATCATTAGACAAATTCACGGTTTAGGGACTAAAGATACTGAAGTTCAAGCATTGCACTGTCATAATTCAATACCACAGGAGTATAGTGTCTACCTTGTTATACTAAACTTTAGAGACTAAATTACAACTTCCTTGGAAGTCCAATGACCAAATGTGAGTTCTAACCTAGAATAGCTGAAGTGAGCATAGATAGCTGTAGAAAGGCGAGTGCTAGAGGTTCTTATGACCTCATGTCTCAACTCAAATATTGGGAAAGTAGCACCTACCGTTGACTTTTCTTATTTTTCGGTTTTGTTTTATTAACAAAGCGTGCTTTAAGATGGCAAGTTTGCTTAATTGGAAGTGAGTTCACAACTTGAGAATTATTGAGAAATTTTTAATTGCACATATTCTCATGTATGTTTAATAAACCCATTGAATTTGTCTATATTCAATTATCAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTGAGTGGTAGATTTTACTTTAATTGCATGTTGTAGGGTACAATCTTTTATATTTAAGATATTCTTTTTTGTTTTATCTTTATGTTTTTTGTAACAAGAAACTGATGGAAGCCAATTTGGTATGAATTCACTACTATTTTATTGATGATAGAATAGGAATAATTCCTGATTACAATATAGAAACCCTCTTCTGCTCCTCTCTCTCAAGGAAGAACAGAAAACCAATTCTCAAAATAAACCTAACTCCCTTTCCCACCAACAACTCCTTTTATTTATACTAACAACAAATTTACTAACTCTTACCTTTACTAACCCTCACGTGCTATTCATGTGCACGTTATATTTCTTTTTACTCCTCCTGCTGTACTGATGCAATATTGGAGATCTATCAGAAACTTATCATTGAGAAAGTAAAAAGAGACTAATGCTTGAAAACTACAAACTATACATGAGGAGTTTATTAAATGTGACTGTTGTTTGGATCTGAAAAGTTGGTACTCAATTCATAAATTGATAAGATCTTGCTAGCGATGATGGTTTAACACTAGTCTTTGGAACTTGGTGCTGGGCACGCAGATTTGTTTGTTTTTTTTTAGTCTATTTGGCTAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGTGAAATGTATCTATTTGAATTTAGATGGAGGAACACTGTGAGGAAAATAAGATGACATTTTTTCGTGAAGGGGAATGTTTTTACATAGAACACCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTCTATTTGGCTAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGCGAAATGTATCTGTTTGAATTTAGATGGAGGAACACTATGAGGAAAATAAGATGACGTTTTTCGTGAAGGGGAATGTTTTTACATAGAAGCAATAGTTTTAAGCAATTTTCAACTTATTGGATAATGCTTTGAGCTTCCTCATAGTTAAACTTAACTGAGTAACAGAAACTCAAATGGAGGGATGATAATAGAACACCTTTCTAATAGGTCTACAAAATAGTAGATCTTCACCTTTCTGATAGAACCCACTTCTTTTGGATATTCTTAGAAAAGTGTAGTAATAAAAGGACGACGCCTTTAAACTTCTAGTGGGTCCTCCCTTGAAGCCTTTCTCCCAAATTTTATGGTCCAATGCAGTTAAAGCTATTCTTTCTCTCCGAAATTTAGTTTGAAAAGAACCAACACGTTTTTTCAAGGCAAGTCTCTAGCATGGTCCGATTGTTGTGATCTTGCATCTATACACTTTGGGGGGATTAACTAAAGGTGTATACACTGAAAGTAGAAGATCAATTGGGCTGTAAATCCTACAAATCTTTCACCTGGGGAACTCAATAATTTTTTAAAAAATTTTTATGGCTGAATTAGAAAGTAGATTAATTTTCCGTCGTTGTACCAAAGGTTCAATTTTCTCTCTTGTTTTCAATCTAATGACGTTGCAGGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGTAAAGGAAAACAGTCAAATATATTTGCCTTGGATTTTCCTCTACGTGGTAATAGATAAATCATACATCTACTTATTTATTTTTATCTAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGTTAGTGCTGCTTGTATACATAGCTTATCCATTTGTAAAACCTCTTTAAACCATGACCGTAGTAAAATAGATTTCTAAGCATAAAAATATTTCATTATTCTCTATGTTATTAGACCTTCATCAGACTGCAATTCTCCGACTGAAATCTTTAAATTCATTTCTGAGATACAAAAGTATTTTTTGGTTTATCTTAGGACTGTGGAATCAATGATTAGAAGAACCATAATAAGTTCTCATAAATTGTCGAGCAATTTTTTATACACTTATTGGCATTATCAACTATCAACGGATGTGTATGATTAATTTATGATGTATGTGATAAAGCAATGTTTTAAAAGGCTACACCTGGAGACTTGCCTCGAGGCAAGGCTCCAACTTTTGGCTCCAAGACTTACACATCCTTTGAACCACAAGAGAAGAGGCTTACAATTTTGTGAAAATACATTGAGGCTAAAAAATGTTTATGGCTGATGTAATGATTAGAAGTAGTAATTTGTCTCATTCTTCAAAAATGTAAAAGTTTAAGTTGTGACAATATAAAAATTGATATTCTTACAAGCCAAGAGAATGAGCAAGTAATTTTCCGATGATCTACAAGACATGGTTGAAGGAGAACAGCTTTTGTATGGTTTAGCTTTTGATTGATCTTTTGTGGAATTCTTTAATAATTCAGGAAACCATTTAAGTGGATGGTTCTTAGTTTTATTTTTTGAGATACATAGGAAATTTATGATAGAGCTCGGTCATATCTCTCTGAAAACAGACCTAGCATAGCTTACCATGAAAAAATGCCTTTAAATCATAATTTTTTTTGTTCTCATTACTGCATTGAGCTCTAACATTAAGCTTTGTCAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAAATTTTAAACTGGTTTTAGTTTTAGTTGTTGTGAAACTGCTGTTGGAATTAGTGTATAGAGGCCTTAACTCACATTTGTGGTTTATTTCTAGTATCCTTCTTTCAATTGGCTGAACTGGAAATCTTTTTGCCCAAAAGGATGTATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATACAGGGAGGGCAATCAAATTTTCGACCTTTTAGATGTGGGAGAGATATACTTTGATCGATAAACTAGGGTCAAACCTGAATTTGGTGCATAATACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCATTTTCAAGAACCCTACCC

mRNA sequence

CTAAAACCTTCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAAATTTTAAACTGGTTTTAGTTTTAGTTGTTGTGAAACTGCTGTTGGAATTAGTGTATAGAGGCCTTAACTCACATTTGTGGTTTATTTCTAGTATCCTTCTTTCAATTGGCTGAACTGGAAATCTTTTTGCCCAAAAGGATGTATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATACAGGGAGGGCAATCAAATTTTCGACCTTTTAGATGTGGGAGAGATATACTTTGATCGATAAACTAGGGTCAAACCTGAATTTGGTGCATAATACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCATTTTCAAGAACCCTACCC

Coding sequence (CDS)

ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAA

Protein sequence

MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS*
Homology
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 1.2e-109
Identity = 417/809 (51.55%), Postives = 524/809 (64.77%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
           MSGF FG S        +S  GFSFGS         S  + SSS+SS+++P S S    N
Sbjct: 1   MSGFPFGQS--------NSVGGFSFGS---------SSATNSSSASSTTSPLSFSF---N 60

Query: 61  PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS----SAATSASSLFGVS 120
            +SNPSS+ FGFGSS  ST  SS       + S G  +SS PS    S+A+S++  FG  
Sbjct: 61  QSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASS------TTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFG 120

Query: 121 SS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 180
           SS     ++   SFGFG ++SS+  + SLFG    S T++ S    GS P   FG   SS
Sbjct: 121 SSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFG----SSTTNASSAAPGSSP---FGFVTSS 180

Query: 181 GSSLA-PS---FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLF 240
            SS A PS   FGA +SSA T S+  FGAAP++G++    S+PSLF   SSA+ S++ LF
Sbjct: 181 ASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLF 240

Query: 241 GTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST 300
           G S+SAA+S S LFGA             +++A GS  S+FG   +S         SGS+
Sbjct: 241 GASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSS 300

Query: 301 GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSSLSSSSSQNLT-- 360
            S  G  GSSPF  SSS   S+ ST +LFASS       S SPF  S+ +SSS+ N +  
Sbjct: 301 PSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNA 360

Query: 361 SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 420
           S+SPF AS +GFSF   + S TTS T  S+   +     ++SSSSFSFGT A+S      
Sbjct: 361 SASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT-----ASSSSSFSFGTSANS------ 420

Query: 421 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVP 480
           GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+ S P
Sbjct: 421 GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAP 480

Query: 481 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTA 540
           A + +  +    S A ++ P  ASS A  S TGFG+ SS  ++ +  S +     KTST 
Sbjct: 481 ASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTP 540

Query: 541 ASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST 600
           ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T + LVV SSS   TST  A V+ +
Sbjct: 541 ASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGS 600

Query: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAK 660
           PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAK
Sbjct: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAK 660

Query: 661 VVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQA 720
           VVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+
Sbjct: 661 VVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQS 720

Query: 721 EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 758
           E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAE
Sbjct: 721 ELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 739

BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G0SBQ3 (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) OX=759272 GN=NSP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 2.6e-08
Identity = 206/688 (29.94%), Postives = 339/688 (49.27%), Query Frame = 0

Query: 86  SFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAAS 145
           SF+    ST  +S  + +S A ++  LFG   S+TG ++  F   ++S   S SLFG A+
Sbjct: 2   SFTFGQPSTSGASGQSNTSTAPASGGLFG---STTGSSTPAFSFGNTSGTQSGSLFGGAT 61

Query: 146 SSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPS-SGSSLAPSFG-ALSSSAGTSSAPLFG-----AAP 205
           +     TSLFG  S   P+   A S  G S + S G +L  +A   S  LFG     AA 
Sbjct: 62  TG--QKTSLFGNTSSTTPAGTPATSLFGQSTSSSSGPSLFGNASKPSGNLFGNTSTSAAG 121

Query: 206 SAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSS 265
           S+  +  PSLF G+ +ATTS+     T A+ A SGS LFG++ A          T   SS
Sbjct: 122 SSTPAGTPSLF-GSKTATTSAGASSTTPAATAGSGS-LFGSTTA----------TTQGSS 181

Query: 266 GSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVAS 325
             T +GLFG S    +S     S +T     S   T+P +    S  S     + P  A+
Sbjct: 182 TPTSTGLFGGS--STASKSLFGSTTTPATGTSGSQTTPAKPLFGSFGSTTPAGAPPTDAT 241

Query: 326 PSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAA 385
            +   F   S   TT  +  +   S+S T    SS+      PA +S+ ++      + A
Sbjct: 242 KTAGLFGNLSKPATTGTSTPTLFGSTSATTQGQSSTPLFGAKPAETSTTTA-----ASGA 301

Query: 386 STGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS 445
           +T  +SAP STT T     +L++S     ++ +T +ASTPAA   T+P F   A +S+  
Sbjct: 302 ATPATSAPASTTPTLFGGATLTSSAPAASTSTSTATASTPAA---TKPLFGATATTSAPG 361

Query: 446 AATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFTGFG----VTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAA 505
           ++TT +     + + A +AA+  + ++ T FG     T++A++SS   + S P+   +  
Sbjct: 362 SSTTTATPGLFSTTPATTAAAGSSTATSTLFGTKPATTTAAAASSTPAATSTPSLFGSKP 421

Query: 506 SSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSA-TV 565
           +S+ APAS G P+  +A   ++A  TT+    S  S T+S       +  TT+ + A TV
Sbjct: 422 ASTTAPAS-GTPTTTTAPASTSAPATTTAAPTSGASATASTTTAGQDAKTTTAGLGASTV 481

Query: 566 SSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE 625
               +LP  +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L   
Sbjct: 482 GPQSQLP-RLKNKTMDEIITRWATDLAKYQKEFKEQAAKVMEWDRLLVENGEKIQKLYTS 541

Query: 626 VAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRD 685
             +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    ++AA     R+
Sbjct: 542 TYEAERASNEIERQLSNVESQQEELTAWLDRYERELDELYAKQMGSAAGEQAAGPDQERE 601

Query: 686 AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQL 743
             Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      PL  +VR+LN  L
Sbjct: 602 RTYKLAEKLTDQLDEMGKDLAKMIKEINDMSNTLSKGSKPD-----DPLTQIVRVLNGHL 655

BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1109.7 bits (2869), Expect = 0.0e+00
Identity = 729/762 (95.67%), Postives = 738/762 (96.85%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ--SSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 60
           MSGFGFGSSTSQ  SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSL SSSSSSSNPTSSSSPF
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPF 60

Query: 61  PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
           PNPTSNP  SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61  PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120

Query: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLA 180
           SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180

Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
           PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240

Query: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
           FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300

Query: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 360
           FQSSLSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360

Query: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
           FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420

Query: 421 TPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
           TPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480

Query: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
           IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540

Query: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
           GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600

Query: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 660
           RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660

Query: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
           EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Sbjct: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720

Query: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
           QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761

BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KA27 (Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 1072.4 bits (2772), Expect = 8.5e-310
Identity = 737/917 (80.37%), Postives = 739/917 (80.59%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
           MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60

Query: 61  PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
           PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61  PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120

Query: 121 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFG 180
           GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSS+APSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180

Query: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
           ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240

Query: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSS 300
           AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQS+
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300

Query: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV---------------------- 360
           LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV                      
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 360

Query: 361 ------------------------------------------------------------ 420
                                                                       
Sbjct: 361 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 420

Query: 421 ------------------------------------------------------------ 480
                                                                       
Sbjct: 421 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 480

Query: 481 ------------------SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 540
                             SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST
Sbjct: 481 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 540

Query: 541 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 600
           GGSSAPSTTATKPTSL                SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT
Sbjct: 541 GGSSAPSTTATKPTSL----------------SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 600

Query: 601 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 660
           TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF
Sbjct: 601 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 660

Query: 661 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 720
           PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV
Sbjct: 661 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 720

Query: 721 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 758
           EEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL
Sbjct: 721 EEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 780

BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 852.8 bits (2202), Expect = 1.1e-243
Identity = 619/797 (77.67%), Postives = 654/797 (82.06%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
           MSGF FGSS+SQ   SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60

Query: 61  PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
            F N TSN PSS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S       S SSLF  
Sbjct: 61  AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120

Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
           SSSS G +SFGFG SSSS  SSA                FGAAS+SGTS   LFG    +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180

Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSAGASS 240
           GS P PSFGAAP SGSS+AP FG+  S             SAG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240

Query: 241 APSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 300
           APSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA  AS GS +FGAS AASGS                S
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGS---------------SS 300

Query: 301 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 360
            LFGS+PF +S     SS STSNLF   +SS ST+PFQ+S SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 SLFGSNPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360

Query: 361 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 420
           GFSF T SLSKTTSIT  ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSIT--AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420

Query: 421 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 480
           GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480

Query: 481 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 540
           TLSIAASS PS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540

Query: 541 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 600
            SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600

Query: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 660
           EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 660

Query: 661 ELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720
           ELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE
Sbjct: 661 ELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720

Query: 721 QIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 758
           QIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT
Sbjct: 721 QIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 763

BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 852.0 bits (2200), Expect = 1.8e-243
Identity = 620/811 (76.45%), Postives = 659/811 (81.26%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
           MSGF FGSS+SQ   SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60

Query: 61  PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
            F N TSN PSS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS         S S+LF  
Sbjct: 61  AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASS-------GISGSALFAA 120

Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
           SSSS G +SFGFG SSSS  SSA                FGAAS+SGTS   LFG    +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180

Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSS 240
           GS P PSFGAAP+SGSS+AP FG+                            +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240

Query: 241 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 300
           +P FGAAPS G +SAPSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS   
Sbjct: 241 SPFFGAAPSVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS--- 300

Query: 301 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSS 360
                        S LFGS+ F +SSSGTLSS STSNLF   +SS ST+PFQ+S SSSSS
Sbjct: 301 ------------SSSLFGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSS 360

Query: 361 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 420
           QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT   +SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+S
Sbjct: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT--VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSAS 420

Query: 421 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 480
           QSSFGF+I+NAAS  GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPS
Sbjct: 421 QSSFGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS 480

Query: 481 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 540
           FS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TS+A+SSSAI SLSLPTK+ 
Sbjct: 481 FSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKSL 540

Query: 541 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS 600
           TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Sbjct: 541 TAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS 600

Query: 601 STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEV 660
           +TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEV
Sbjct: 601 ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEV 660

Query: 661 AKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720
           AKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE
Sbjct: 661 AKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720

Query: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 758
           QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK
Sbjct: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 780

BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DSI7 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023501 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 8.1e-207
Identity = 503/625 (80.48%), Postives = 541/625 (86.56%), Query Frame = 0

Query: 141 FGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSA 200
           FGAA ++G+SS S+FGA                  APS G+ +SSAG+SS  LFGAAPSA
Sbjct: 1   FGAALAAGSSSGSVFGA------------------APS-GSSASSAGSSSFSLFGAAPSA 60

Query: 201 GASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGS 260
           GA SAPSLFGG SSAT+SS PLFG+SA  A+ GS L GAS AASG   SLFGT A+SSGS
Sbjct: 61  GA-SAPSLFGGVSSATSSSTPLFGSSAPTATPGSALPGASVAASG---SLFGT-ASSSGS 120

Query: 261 TGSGLFG----SSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSL---STSPFQSSLSSSSSQNLTSSS 320
            GS LFG    ++ FG+++ GT    S+S LFASS+   STS FQ+S SSSSSQ+L+SSS
Sbjct: 121 AGSALFGAPLSTNSFGSNTFGT----SSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSS 180

Query: 321 PFVA-SPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF 380
           PF A S SGFSFPT SLSKTT+ +  +SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF
Sbjct: 181 PFAASSSSGFSFPTTSLSKTTN-SVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF 240

Query: 381 SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAF 440
           S +NAAST  S+AP TTATKPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAF
Sbjct: 241 SFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAF 300

Query: 441 SSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSS 500
           S SSSAATT+S AASS PSAASSGA SSFTGFGVT++ASSSS I SLSLPTKT TAASSS
Sbjct: 301 SLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSS 360

Query: 501 QAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLP 560
           Q PASFGFPSL SASTAATT+SGFSA SQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSA VS+TPKLP
Sbjct: 361 QPPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLP 420

Query: 561 SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVET 620
           SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVET
Sbjct: 421 SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVET 480

Query: 621 QAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIE 680
           QAELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIE
Sbjct: 481 QAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIE 540

Query: 681 RELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS 740
           RELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS
Sbjct: 541 RELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS 596

Query: 741 RIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
           RIQK+AAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 601 RIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS 596

BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match: XP_031743587.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical protein Csa_005518 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 1174.8 bits (3038), Expect = 0.0e+00
Identity = 754/757 (99.60%), Postives = 756/757 (99.87%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
           MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60

Query: 61  PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
           PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61  PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120

Query: 121 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFG 180
           GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSS+APSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180

Query: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
           ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240

Query: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSS 300
           AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQS+
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300

Query: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 360
           LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 360

Query: 361 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN 420
           PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN
Sbjct: 361 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN 420

Query: 421 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 480
           STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS
Sbjct: 421 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 480

Query: 481 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 540
           LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST
Sbjct: 481 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 540

Query: 541 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 600
           VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL
Sbjct: 541 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 600

Query: 601 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 660
           RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 601 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 660

Query: 661 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 720
           RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL
Sbjct: 661 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 720

Query: 721 MWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
           MWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Sbjct: 721 MWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 757

BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match: XP_008459731.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 1109.7 bits (2869), Expect = 0.0e+00
Identity = 729/762 (95.67%), Postives = 738/762 (96.85%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ--SSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 60
           MSGFGFGSSTSQ  SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSL SSSSSSSNPTSSSSPF
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPF 60

Query: 61  PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
           PNPTSNP  SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61  PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120

Query: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLA 180
           SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180

Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
           PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240

Query: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
           FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300

Query: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 360
           FQSSLSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360

Query: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
           FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420

Query: 421 TPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
           TPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480

Query: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
           IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540

Query: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
           GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600

Query: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 660
           RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660

Query: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
           EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Sbjct: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720

Query: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
           QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761

BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match: XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 882.1 bits (2278), Expect = 3.4e-252
Identity = 631/770 (81.95%), Postives = 653/770 (84.81%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
           MSG G GSS+SQ   SSSPFSS+TGFSFGST+ FSFGSS +PLSL  SSSSSSNPTSSSS
Sbjct: 1   MSGSGSGSSSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGSSSTPLSL--SSSSSSNPTSSSS 60

Query: 61  PFPNPTSNP-SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
           PF N T NP SSSS GFGSSSF +S SSPFSFSL                          
Sbjct: 61  PFSNQTPNPASSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFSLPL------------------------ 120

Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSL 180
                      FG++ SS  SSA LFG+ASSSG+S          PAPSFG A SSGSSL
Sbjct: 121 -----------FGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSS----------PAPSFGPASSSGSSL 180

Query: 181 APSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFG-TSASAASSGS 240
            PSFGAL SS G+SSAPLFGA PSAGA SAPSLFGG SSATTSSAPLFG TSAS AS GS
Sbjct: 181 VPSFGALPSS-GSSSAPLFGATPSAGA-SAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTTSASTASPGS 240

Query: 241 GLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFA---SS 300
            LFGAS AASGS  SLFGT +T+SGS+GS LFGSSPFGAS     SS STSNLFA   SS
Sbjct: 241 ALFGASVAASGSSSSLFGT-STTSGSSGSALFGSSPFGAS-----SSLSTSNLFASSSSS 300

Query: 301 LSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVA----SPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLT 360
            STSPFQ+S SSSSSQNL SSS F A    S SGFSF T SLSKTTSIT  ++SSSSSLT
Sbjct: 301 TSTSPFQNSFSSSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSIT--TASSSSSLT 360

Query: 361 LASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFS 420
            ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLS+SVAPLFS
Sbjct: 361 TASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSSSVAPLFS 420

Query: 421 TVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVT 480
           TVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSGAVSSFTGFGVT
Sbjct: 421 TVTTTSGSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSSFTGFGVT 480

Query: 481 SSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSA 540
           S ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSL SA T ATTTSGFSASSQSQTSS 
Sbjct: 481 SMASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLTSAPTPATTTSGFSASSQSQTSST 540

Query: 541 LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE 600
           LVVASSSSGTTSTV+ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE
Sbjct: 541 LVVASSSSGTTSTVNATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE 600

Query: 601 WDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKD 660
           WDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKD
Sbjct: 601 WDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVESQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKD 660

Query: 661 ERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD 720
           ERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD
Sbjct: 661 ERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD 713

Query: 721 AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
           AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 713

BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match: XP_022959228.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 852.8 bits (2202), Expect = 2.2e-243
Identity = 619/797 (77.67%), Postives = 654/797 (82.06%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
           MSGF FGSS+SQ   SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60

Query: 61  PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
            F N TSN PSS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S       S SSLF  
Sbjct: 61  AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120

Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
           SSSS G +SFGFG SSSS  SSA                FGAAS+SGTS   LFG    +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180

Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSAGASS 240
           GS P PSFGAAP SGSS+AP FG+  S             SAG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240

Query: 241 APSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 300
           APSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA  AS GS +FGAS AASGS                S
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGS---------------SS 300

Query: 301 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 360
            LFGS+PF +S     SS STSNLF   +SS ST+PFQ+S SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 SLFGSNPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360

Query: 361 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 420
           GFSF T SLSKTTSIT  ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSIT--AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420

Query: 421 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 480
           GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480

Query: 481 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 540
           TLSIAASS PS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540

Query: 541 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 600
            SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600

Query: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 660
           EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 660

Query: 661 ELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720
           ELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE
Sbjct: 661 ELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720

Query: 721 QIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 758
           QIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT
Sbjct: 721 QIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 763

BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match: XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 852.4 bits (2201), Expect = 2.9e-243
Identity = 623/811 (76.82%), Postives = 657/811 (81.01%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
           MSGF FGSS+SQ   SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60

Query: 61  PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
            F N TSN PSS+ FGF SS F +S SSPFSFSL +ASTG SS S       S SSLF  
Sbjct: 61  AFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS-------SGSSLFAA 120

Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
           SSSS G +SFGFG SSSS  SSA                FGAAS+SGTS   LFG    +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180

Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSS 240
           GS P PSFGAAP+SGSS+AP FG+                            +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240

Query: 241 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 300
           +P FGAAPSAGA SAPSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS   
Sbjct: 241 SPFFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS--- 300

Query: 301 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSS 360
                        S LFGSSPF +S     SS STSNLF   +SS STSPFQ+S SSSSS
Sbjct: 301 ------------SSSLFGSSPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSS 360

Query: 361 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 420
           QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT  ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+S
Sbjct: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT--AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSAS 420

Query: 421 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 480
           QSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPS
Sbjct: 421 QSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS 480

Query: 481 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 540
           FS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ 
Sbjct: 481 FSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSL 540

Query: 541 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS 600
           TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Sbjct: 541 TAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS 600

Query: 601 STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEV 660
           +TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEV
Sbjct: 601 ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEV 660

Query: 661 AKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720
           AKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE
Sbjct: 661 AKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720

Query: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 758
           QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK
Sbjct: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 777

BLAST of CSPI06G08680 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 8.2e-111
Identity = 417/809 (51.55%), Postives = 524/809 (64.77%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
           MSGF FG S        +S  GFSFGS         S  + SSS+SS+++P S S    N
Sbjct: 1   MSGFPFGQS--------NSVGGFSFGS---------SSATNSSSASSTTSPLSFSF---N 60

Query: 61  PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS----SAATSASSLFGVS 120
            +SNPSS+ FGFGSS  ST  SS       + S G  +SS PS    S+A+S++  FG  
Sbjct: 61  QSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASS------TTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFG 120

Query: 121 SS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 180
           SS     ++   SFGFG ++SS+  + SLFG    S T++ S    GS P   FG   SS
Sbjct: 121 SSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFG----SSTTNASSAAPGSSP---FGFVTSS 180

Query: 181 GSSLA-PS---FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLF 240
            SS A PS   FGA +SSA T S+  FGAAP++G++    S+PSLF   SSA+ S++ LF
Sbjct: 181 ASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLF 240

Query: 241 GTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST 300
           G S+SAA+S S LFGA             +++A GS  S+FG   +S         SGS+
Sbjct: 241 GASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSS 300

Query: 301 GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSSLSSSSSQNLT-- 360
            S  G  GSSPF  SSS   S+ ST +LFASS       S SPF  S+ +SSS+ N +  
Sbjct: 301 PSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNA 360

Query: 361 SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 420
           S+SPF AS +GFSF   + S TTS T  S+   +     ++SSSSFSFGT A+S      
Sbjct: 361 SASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT-----ASSSSSFSFGTSANS------ 420

Query: 421 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVP 480
           GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+ S P
Sbjct: 421 GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAP 480

Query: 481 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTA 540
           A + +  +    S A ++ P  ASS A  S TGFG+ SS  ++ +  S +     KTST 
Sbjct: 481 ASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTP 540

Query: 541 ASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST 600
           ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T + LVV SSS   TST  A V+ +
Sbjct: 541 ASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGS 600

Query: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAK 660
           PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAK
Sbjct: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAK 660

Query: 661 VVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQA 720
           VVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+
Sbjct: 661 VVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQS 720

Query: 721 EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 758
           E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAE
Sbjct: 721 ELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 739

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q8L7F71.2e-10951.55Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... [more]
G0SBQ32.6e-0829.94Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3CAD40.0e+0095.67nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... [more]
A0A0A0KA278.5e-31080.37Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3... [more]
A0A6J1H5C81.1e-24377.67nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... [more]
A0A6J1L2D41.8e-24376.45nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... [more]
A0A6J1DSI78.1e-20780.48nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC11102350... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_031743587.10.0e+0099.60nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical pr... [more]
XP_008459731.10.0e+0095.67PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo][more]
XP_038874708.13.4e-25281.95nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida][more]
XP_022959228.12.2e-24377.67nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata][more]
XP_023548092.12.9e-24376.82nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G45000.18.2e-11151.55structural constituent of nuclear pore [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 661..688
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 599..629
NoneNo IPR availableGENE3D1.20.5.170coord: 586..645
e-value: 4.4E-9
score: 38.2
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 165..217
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 130..152
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 292..314
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..20
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 166..192
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 33..106
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR12084:SF0NUCLEOPORIN 62-LIKEcoord: 22..750
IPR007758Nucleoporin, NSP1-like, C-terminalPFAMPF05064Nsp1_Ccoord: 543..647
e-value: 1.5E-21
score: 76.3
IPR026010Nucleoporin NSP1/NUP62PANTHERPTHR12084NUCLEAR PORE GLYCOPROTEIN P62-RELATEDcoord: 22..750

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CSPI06G08680.1CSPI06G08680.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006913 nucleocytoplasmic transport
biological_process GO:0015031 protein transport
cellular_component GO:0005643 nuclear pore
molecular_function GO:0017056 structural constituent of nuclear pore