Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron)
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTAAAACCTTCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTAAGTTCTTTACTTTCTTTGTTTTACTTCGTGATATTTGGTTTATAATATTGGCTGTTCGAAATAAGTTTTGTGAGTCATGTTGTTAAGTGGGTTTTTACTTCTTGAGGGGCATATCAAGGATCCCATGTTGGAAAGGTCAATGGAGCTTACACTTCTTTTAACATAGAGGATTTACTTCTTATTCTCAATTGGTTTTGAGATGGAACCTCACGTTAGGTTTTTTGGCTGTATTGGTGTAACCAAGTACTCCTTTCAGAATGTTGCTACATTATGTCAATATACCTAGTGTATTTTGTCTAACTTTTGTTTAATCTTTGCAGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGGTATGTATGTGATTGAGTTGCTTTCCTAGTAATGTATGTGTGTGTTTATATAGAAGCTCTCTTAACTCATTCCACTATGCATTAGTACCTGCATGGATTGGTTATTATTCAATGGTTTATATTCATCATTTGCTTTATTCTTCATTTATGCAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGGTATTTCTTTTTTCATGATCGGAGATTTGCACAGTTCATTTGAGTTGCCTTTTTTCAGACAATTACCAATGTTTTTGTTCCAAAATTTATTATTGGGTTTAGAAAAGGAATCAACATGTGCCTCACTAACAAAAATCTAATCTCCTCCGCTCATATAAGTTTGGTGGATGCCCCTTCAAAAAAAGGAAAAAAAGATGGTATGGGAGGCTTTATAAGAGTCTTTTACTAGAATTTATGGCAAGAAAGAAATAGAAGATTTTTCCAAGATAAAGAAATTCCTTTCTTTAGATTTTCTGATGCAATGGTTAATATGATTGACTTGGTGTAAATGTTCCCCCTTGTTTCACCTAGCTTGACCATGCTTCTTTCCCTACTTTTATAATTCCATACCATTGATGAAGTGTTGTTTTTTTCTTTCTAATTCTACTTTTAAAATGTGCCTCATTACTAGGGACAATTAATGTTCCAGAATTAGTAATGCAGAAAATAAATTGATGACTTAATTACACATCTAGTATTGAAAATGTCATAGAAAACTTTTGGTGTCATTGATTCATCCAATAAAGTATTTTTCTTTCAGCTTAAGTTGACTTCAATTAATAATTTCAAAATATTCTTGCAAATTGTCTTTGTGTTCATTGTTCATGGAATCATCATAAACATCCCTCCAACGTTGTTTAGTCTTTTTTTTTTATTCTTTTTTGGTAATTAAATTGTTTGAAATGTATGCTTCTTGCTTTTTTCTTCATTTTCTTTATAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGGTGTTATGCCACTTAATATCAAAAATTTTAAATCTTCAATGAGATATGAAATTTAATTTGCTATTATGTCTGTTCTAACAAAATATGTGCAAATGATTATAAGAAAGGATAATTCTAGTTAATGAATTTTTGGACCATCTGATTCTTGTACTATTCACCTGTATCTTTCATTGGATCCTAATTTACACGAGATGAACTCTGAGCATATTTGTTAGGAAATCTTTAATTTAAGTGTTCACATCCCTTTATTTTTTCTTCCCTGCGTGTTTTGGACAGTGCTCAGTTCAATTTTACCTTAATGTTTTGTCTCCCAACTGATTATAATTTTTGTTATTTCAACGGTCATTTAAAGAATTGAAAAGCTGCAACAGAGAAACTAACCAAAGGGGCTAATGGAAAGTAGGCTTACTCAGCAGAAATGAGGAAAGGGAAATAATTACGAGTCTTTTTTCACAGGAACGACCACCCTGAAAGTAACCTAAACTACTAGATAAAAAGAATGTCACACTCACCATCTCTCTTTTTGATTTCCTTTTATCTATTTATTTATTTATATTTATATTTTTCTTGGAACTACTTTTTTTAGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTAAAAAAACAAAAAGAATATTTTTCGAAATCTTCAATGTGAAAGGAGGCATCAAAGTACACACTGGATCTTGAGTGGCATATTTTGTTTTATTTGTTGGAATTTGTGTTGCATATTGGTGCTTTGGTTTGTTTTCCTACTAGTCCTCTTTACTTGATGAACTAGTGAGAATTCTTCATTAGGATGGCCTTCAAAGGGATTTTCTTTTTGATTATTTTTGCTGTTGTGTTTTTCTAATCTTCAGGCTGCAGTCTTTTACTGAGTTCTTAATTGGTTGTATTTGTATTTGTTTTGTTTTTGTTTCATTGTACTTTGAGCATTAGTCTCTTTTTATTTTATTGATGAAAAGTGTTGTTTTCTTTTTGGGAAAAAAGTACAGACTGGACTCATTTTATCTTAATGATTCACTTAATTTTTTTCTTTATATCTTCATTGATCAAATGGGTTATCTTGAACTATTATTATGTATTTATTTTTATTTAAAAGTTGTCTCTTTTCTTCTTAGTGAGACATTTATTGATAAGGTGAAATATTCGGAAGAATGTTGAAACCCATTCTGGAAAGAGGGTTCTCTCTATCTAAATGTCAAAAAGGAATAATGAGAAAGATAGATTGCTCTAATGCATTTATTTTGAATTTAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTATTCACCTGCGGCCTTGTTTGTCTTTTCCCTTCAATATTTGCTTTTAGGTAGACACTTTACCTATGGTCTTGTGTTCTTAAAGTAGGATCTTTGGAGGGGTAGAAAGATATTGGAAGGAACTTTGGAAGTTCATTAGATTCAAATTTTAATCCAAAAATCGTTAGTGGGGGTGGTGGGTCATTTTAGTAAGAATTCTTTTTGAGGATTTGGGAGAGAATAGCTCTCTTGAATGCCTGATGTATTGTAACTTATTTTGATATTGCAATATGCATTTCTATTTTTTAATGTGTTTTGTGTTGTTCTTGAGTGTTCATGTTTGGTGGTAACATAACACTTTATTCCTCATGCCTTTGCATCCTTGAAGGAACAGTTATTAACCAAATCAATCACCTTGCAGATCATTAGACAAATTCACGGTTTAGGGACTAAAGATACTGAAGTTCAAGCATTGCACTGTCATAATTCAATACCACAGGAGTATAGTGTCTACCTTGTTATACTAAACTTTAGAGACTAAATTACAACTTCCTTGGAAGTCCAATGACCAAATGTGAGTTCTAACCTAGAATAGCTGAAGTGAGCATAGATAGCTGTAGAAAGGCGAGTGCTAGAGGTTCTTATGACCTCATGTCTCAACTCAAATATTGGGAAAGTAGCACCTACCGTTGACTTTTCTTATTTTTCGGTTTTGTTTTATTAACAAAGCGTGCTTTAAGATGGCAAGTTTGCTTAATTGGAAGTGAGTTCACAACTTGAGAATTATTGAGAAATTTTTAATTGCACATATTCTCATGTATGTTTAATAAACCCATTGAATTTGTCTATATTCAATTATCAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTGAGTGGTAGATTTTACTTTAATTGCATGTTGTAGGGTACAATCTTTTATATTTAAGATATTCTTTTTTGTTTTATCTTTATGTTTTTTGTAACAAGAAACTGATGGAAGCCAATTTGGTATGAATTCACTACTATTTTATTGATGATAGAATAGGAATAATTCCTGATTACAATATAGAAACCCTCTTCTGCTCCTCTCTCTCAAGGAAGAACAGAAAACCAATTCTCAAAATAAACCTAACTCCCTTTCCCACCAACAACTCCTTTTATTTATACTAACAACAAATTTACTAACTCTTACCTTTACTAACCCTCACGTGCTATTCATGTGCACGTTATATTTCTTTTTACTCCTCCTGCTGTACTGATGCAATATTGGAGATCTATCAGAAACTTATCATTGAGAAAGTAAAAAGAGACTAATGCTTGAAAACTACAAACTATACATGAGGAGTTTATTAAATGTGACTGTTGTTTGGATCTGAAAAGTTGGTACTCAATTCATAAATTGATAAGATCTTGCTAGCGATGATGGTTTAACACTAGTCTTTGGAACTTGGTGCTGGGCACGCAGATTTGTTTGTTTTTTTTTAGTCTATTTGGCTAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGTGAAATGTATCTATTTGAATTTAGATGGAGGAACACTGTGAGGAAAATAAGATGACATTTTTTCGTGAAGGGGAATGTTTTTACATAGAACACCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTCTATTTGGCTAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGCGAAATGTATCTGTTTGAATTTAGATGGAGGAACACTATGAGGAAAATAAGATGACGTTTTTCGTGAAGGGGAATGTTTTTACATAGAAGCAATAGTTTTAAGCAATTTTCAACTTATTGGATAATGCTTTGAGCTTCCTCATAGTTAAACTTAACTGAGTAACAGAAACTCAAATGGAGGGATGATAATAGAACACCTTTCTAATAGGTCTACAAAATAGTAGATCTTCACCTTTCTGATAGAACCCACTTCTTTTGGATATTCTTAGAAAAGTGTAGTAATAAAAGGACGACGCCTTTAAACTTCTAGTGGGTCCTCCCTTGAAGCCTTTCTCCCAAATTTTATGGTCCAATGCAGTTAAAGCTATTCTTTCTCTCCGAAATTTAGTTTGAAAAGAACCAACACGTTTTTTCAAGGCAAGTCTCTAGCATGGTCCGATTGTTGTGATCTTGCATCTATACACTTTGGGGGGATTAACTAAAGGTGTATACACTGAAAGTAGAAGATCAATTGGGCTGTAAATCCTACAAATCTTTCACCTGGGGAACTCAATAATTTTTTAAAAAATTTTTATGGCTGAATTAGAAAGTAGATTAATTTTCCGTCGTTGTACCAAAGGTTCAATTTTCTCTCTTGTTTTCAATCTAATGACGTTGCAGGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGTAAAGGAAAACAGTCAAATATATTTGCCTTGGATTTTCCTCTACGTGGTAATAGATAAATCATACATCTACTTATTTATTTTTATCTAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGTTAGTGCTGCTTGTATACATAGCTTATCCATTTGTAAAACCTCTTTAAACCATGACCGTAGTAAAATAGATTTCTAAGCATAAAAATATTTCATTATTCTCTATGTTATTAGACCTTCATCAGACTGCAATTCTCCGACTGAAATCTTTAAATTCATTTCTGAGATACAAAAGTATTTTTTGGTTTATCTTAGGACTGTGGAATCAATGATTAGAAGAACCATAATAAGTTCTCATAAATTGTCGAGCAATTTTTTATACACTTATTGGCATTATCAACTATCAACGGATGTGTATGATTAATTTATGATGTATGTGATAAAGCAATGTTTTAAAAGGCTACACCTGGAGACTTGCCTCGAGGCAAGGCTCCAACTTTTGGCTCCAAGACTTACACATCCTTTGAACCACAAGAGAAGAGGCTTACAATTTTGTGAAAATACATTGAGGCTAAAAAATGTTTATGGCTGATGTAATGATTAGAAGTAGTAATTTGTCTCATTCTTCAAAAATGTAAAAGTTTAAGTTGTGACAATATAAAAATTGATATTCTTACAAGCCAAGAGAATGAGCAAGTAATTTTCCGATGATCTACAAGACATGGTTGAAGGAGAACAGCTTTTGTATGGTTTAGCTTTTGATTGATCTTTTGTGGAATTCTTTAATAATTCAGGAAACCATTTAAGTGGATGGTTCTTAGTTTTATTTTTTGAGATACATAGGAAATTTATGATAGAGCTCGGTCATATCTCTCTGAAAACAGACCTAGCATAGCTTACCATGAAAAAATGCCTTTAAATCATAATTTTTTTTGTTCTCATTACTGCATTGAGCTCTAACATTAAGCTTTGTCAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAAATTTTAAACTGGTTTTAGTTTTAGTTGTTGTGAAACTGCTGTTGGAATTAGTGTATAGAGGCCTTAACTCACATTTGTGGTTTATTTCTAGTATCCTTCTTTCAATTGGCTGAACTGGAAATCTTTTTGCCCAAAAGGATGTATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATACAGGGAGGGCAATCAAATTTTCGACCTTTTAGATGTGGGAGAGATATACTTTGATCGATAAACTAGGGTCAAACCTGAATTTGGTGCATAATACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCATTTTCAAGAACCCTACCC
mRNA sequence
CTAAAACCTTCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAAATTTTAAACTGGTTTTAGTTTTAGTTGTTGTGAAACTGCTGTTGGAATTAGTGTATAGAGGCCTTAACTCACATTTGTGGTTTATTTCTAGTATCCTTCTTTCAATTGGCTGAACTGGAAATCTTTTTGCCCAAAAGGATGTATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATACAGGGAGGGCAATCAAATTTTCGACCTTTTAGATGTGGGAGAGATATACTTTGATCGATAAACTAGGGTCAAACCTGAATTTGGTGCATAATACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCATTTTCAAGAACCCTACCC
Coding sequence (CDS)
ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAA
Protein sequence
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS*
Homology
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 1.2e-109
Identity = 417/809 (51.55%), Postives = 524/809 (64.77%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
MSGF FG S +S GFSFGS S + SSS+SS+++P S S N
Sbjct: 1 MSGFPFGQS--------NSVGGFSFGS---------SSATNSSSASSTTSPLSFSF---N 60
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS----SAATSASSLFGVS 120
+SNPSS+ FGFGSS ST SS + S G +SS PS S+A+S++ FG
Sbjct: 61 QSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASS------TTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFG 120
Query: 121 SS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 180
SS ++ SFGFG ++SS+ + SLFG S T++ S GS P FG SS
Sbjct: 121 SSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFG----SSTTNASSAAPGSSP---FGFVTSS 180
Query: 181 GSSLA-PS---FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLF 240
SS A PS FGA +SSA T S+ FGAAP++G++ S+PSLF SSA+ S++ LF
Sbjct: 181 ASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLF 240
Query: 241 GTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST 300
G S+SAA+S S LFGA +++A GS S+FG +S SGS+
Sbjct: 241 GASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSS 300
Query: 301 GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSSLSSSSSQNLT-- 360
S G GSSPF SSS S+ ST +LFASS S SPF S+ +SSS+ N +
Sbjct: 301 PSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNA 360
Query: 361 SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 420
S+SPF AS +GFSF + S TTS T S+ + ++SSSSFSFGT A+S
Sbjct: 361 SASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT-----ASSSSSFSFGTSANS------ 420
Query: 421 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVP 480
GF++ STG S+AP++ S S +V + +T TTTS+STPAA T+ P+ S P
Sbjct: 421 GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAP 480
Query: 481 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTA 540
A + + + S A ++ P ASS A S TGFG+ SS ++ + S + KTST
Sbjct: 481 ASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTP 540
Query: 541 ASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST 600
ASSSQ + P+ + + ++T+T+ + SS + T + LVV SSS TST A V+ +
Sbjct: 541 ASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGS 600
Query: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAK 660
PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAK
Sbjct: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAK 660
Query: 661 VVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQA 720
VVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAMYEQ+
Sbjct: 661 VVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQS 720
Query: 721 EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 758
E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAE
Sbjct: 721 ELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 739
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
G0SBQ3 (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) OX=759272 GN=NSP1 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 2.6e-08
Identity = 206/688 (29.94%), Postives = 339/688 (49.27%), Query Frame = 0
Query: 86 SFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAAS 145
SF+ ST +S + +S A ++ LFG S+TG ++ F ++S S SLFG A+
Sbjct: 2 SFTFGQPSTSGASGQSNTSTAPASGGLFG---STTGSSTPAFSFGNTSGTQSGSLFGGAT 61
Query: 146 SSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPS-SGSSLAPSFG-ALSSSAGTSSAPLFG-----AAP 205
+ TSLFG S P+ A S G S + S G +L +A S LFG AA
Sbjct: 62 TG--QKTSLFGNTSSTTPAGTPATSLFGQSTSSSSGPSLFGNASKPSGNLFGNTSTSAAG 121
Query: 206 SAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSS 265
S+ + PSLF G+ +ATTS+ T A+ A SGS LFG++ A T SS
Sbjct: 122 SSTPAGTPSLF-GSKTATTSAGASSTTPAATAGSGS-LFGSTTA----------TTQGSS 181
Query: 266 GSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVAS 325
T +GLFG S +S S +T S T+P + S S + P A+
Sbjct: 182 TPTSTGLFGGS--STASKSLFGSTTTPATGTSGSQTTPAKPLFGSFGSTTPAGAPPTDAT 241
Query: 326 PSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAA 385
+ F S TT + + S+S T SS+ PA +S+ ++ + A
Sbjct: 242 KTAGLFGNLSKPATTGTSTPTLFGSTSATTQGQSSTPLFGAKPAETSTTTA-----ASGA 301
Query: 386 STGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS 445
+T +SAP STT T +L++S ++ +T +ASTPAA T+P F A +S+
Sbjct: 302 ATPATSAPASTTPTLFGGATLTSSAPAASTSTSTATASTPAA---TKPLFGATATTSAPG 361
Query: 446 AATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFTGFG----VTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAA 505
++TT + + + A +AA+ + ++ T FG T++A++SS + S P+ +
Sbjct: 362 SSTTTATPGLFSTTPATTAAAGSSTATSTLFGTKPATTTAAAASSTPAATSTPSLFGSKP 421
Query: 506 SSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSA-TV 565
+S+ APAS G P+ +A ++A TT+ S S T+S + TT+ + A TV
Sbjct: 422 ASTTAPAS-GTPTTTTAPASTSAPATTTAAPTSGASATASTTTAGQDAKTTTAGLGASTV 481
Query: 566 SSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE 625
+LP + KT++EII W +L + +F++QA + EWDR +++N + + +L
Sbjct: 482 GPQSQLP-RLKNKTMDEIITRWATDLAKYQKEFKEQAAKVMEWDRLLVENGEKIQKLYTS 541
Query: 626 VAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRD 685
+ E+E++L +E+ Q+E+ L E + + +Y + G ++AA R+
Sbjct: 542 TYEAERASNEIERQLSNVESQQEELTAWLDRYERELDELYAKQMGSAAGEQAAGPDQERE 601
Query: 686 AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQL 743
Y+ AE + +L++M + + +I+ +N ++G + D PL +VR+LN L
Sbjct: 602 RTYKLAEKLTDQLDEMGKDLAKMIKEINDMSNTLSKGSKPD-----DPLTQIVRVLNGHL 655
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 1109.7 bits (2869), Expect = 0.0e+00
Identity = 729/762 (95.67%), Postives = 738/762 (96.85%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ--SSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 60
MSGFGFGSSTSQ SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSL SSSSSSSNPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPF 60
Query: 61 PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
PNPTSNP SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 360
FQSSLSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360
Query: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
Query: 421 TPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
TPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
Query: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
Query: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
Query: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 660
RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660
Query: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Sbjct: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
Query: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0KA27 (Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 1072.4 bits (2772), Expect = 8.5e-310
Identity = 737/917 (80.37%), Postives = 739/917 (80.59%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
Query: 121 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFG 180
GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSS+APSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180
Query: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
Query: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSS 300
AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQS+
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300
Query: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV---------------------- 360
LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 360
Query: 361 ------------------------------------------------------------ 420
Sbjct: 361 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 420
Query: 421 ------------------------------------------------------------ 480
Sbjct: 421 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 480
Query: 481 ------------------SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 540
SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST
Sbjct: 481 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 540
Query: 541 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 600
GGSSAPSTTATKPTSL SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT
Sbjct: 541 GGSSAPSTTATKPTSL----------------SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 600
Query: 601 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 660
TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF
Sbjct: 601 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 660
Query: 661 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 720
PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV
Sbjct: 661 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 720
Query: 721 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 758
EEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL
Sbjct: 721 EEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 780
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 852.8 bits (2202), Expect = 1.1e-243
Identity = 619/797 (77.67%), Postives = 654/797 (82.06%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 61 PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
F N TSN PSS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAAS+SGTS LFG +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSAGASS 240
GS P PSFGAAP SGSS+AP FG+ S SAG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240
Query: 241 APSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 300
APSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA AS GS +FGAS AASGS S
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGS---------------SS 300
Query: 301 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 360
LFGS+PF +S SS STSNLF +SS ST+PFQ+S SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 SLFGSNPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360
Query: 361 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 420
GFSF T SLSKTTSIT ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSIT--AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420
Query: 421 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 480
GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480
Query: 481 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 540
TLSIAASS PS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540
Query: 541 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 600
SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600
Query: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 660
EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 660
Query: 661 ELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720
ELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE
Sbjct: 661 ELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720
Query: 721 QIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 758
QIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT
Sbjct: 721 QIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 763
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 852.0 bits (2200), Expect = 1.8e-243
Identity = 620/811 (76.45%), Postives = 659/811 (81.26%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 61 PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
F N TSN PSS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S+LF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASS-------GISGSALFAA 120
Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAAS+SGTS LFG +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSS 240
GS P PSFGAAP+SGSS+AP FG+ +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240
Query: 241 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 300
+P FGAAPS G +SAPSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA AS GS +FGASAAASGS
Sbjct: 241 SPFFGAAPSVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS--- 300
Query: 301 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSS 360
S LFGS+ F +SSSGTLSS STSNLF +SS ST+PFQ+S SSSSS
Sbjct: 301 ------------SSSLFGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSS 360
Query: 361 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 420
QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT +SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+S
Sbjct: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT--VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSAS 420
Query: 421 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 480
QSSFGF+I+NAAS GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPS
Sbjct: 421 QSSFGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS 480
Query: 481 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 540
FS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TS+A+SSSAI SLSLPTK+
Sbjct: 481 FSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKSL 540
Query: 541 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS 600
TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Sbjct: 541 TAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS 600
Query: 601 STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEV 660
+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEV
Sbjct: 601 ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEV 660
Query: 661 AKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720
AKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE
Sbjct: 661 AKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720
Query: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 758
QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK
Sbjct: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 780
BLAST of CSPI06G08680 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1DSI7 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023501 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 8.1e-207
Identity = 503/625 (80.48%), Postives = 541/625 (86.56%), Query Frame = 0
Query: 141 FGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSA 200
FGAA ++G+SS S+FGA APS G+ +SSAG+SS LFGAAPSA
Sbjct: 1 FGAALAAGSSSGSVFGA------------------APS-GSSASSAGSSSFSLFGAAPSA 60
Query: 201 GASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGS 260
GA SAPSLFGG SSAT+SS PLFG+SA A+ GS L GAS AASG SLFGT A+SSGS
Sbjct: 61 GA-SAPSLFGGVSSATSSSTPLFGSSAPTATPGSALPGASVAASG---SLFGT-ASSSGS 120
Query: 261 TGSGLFG----SSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSL---STSPFQSSLSSSSSQNLTSSS 320
GS LFG ++ FG+++ GT S+S LFASS+ STS FQ+S SSSSSQ+L+SSS
Sbjct: 121 AGSALFGAPLSTNSFGSNTFGT----SSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSS 180
Query: 321 PFVA-SPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF 380
PF A S SGFSFPT SLSKTT+ + +SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF
Sbjct: 181 PFAASSSSGFSFPTTSLSKTTN-SVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF 240
Query: 381 SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAF 440
S +NAAST S+AP TTATKPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAF
Sbjct: 241 SFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAF 300
Query: 441 SSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSS 500
S SSSAATT+S AASS PSAASSGA SSFTGFGVT++ASSSS I SLSLPTKT TAASSS
Sbjct: 301 SLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSS 360
Query: 501 QAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLP 560
Q PASFGFPSL SASTAATT+SGFSA SQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSA VS+TPKLP
Sbjct: 361 QPPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLP 420
Query: 561 SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVET 620
SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVET
Sbjct: 421 SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVET 480
Query: 621 QAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIE 680
QAELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIE
Sbjct: 481 QAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIE 540
Query: 681 RELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS 740
RELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS
Sbjct: 541 RELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSS 596
Query: 741 RIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
RIQK+AAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 601 RIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS 596
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
XP_031743587.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical protein Csa_005518 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 1174.8 bits (3038), Expect = 0.0e+00
Identity = 754/757 (99.60%), Postives = 756/757 (99.87%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
Query: 121 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFG 180
GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSS+APSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180
Query: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
Query: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSS 300
AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQS+
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300
Query: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 360
LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 360
Query: 361 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN 420
PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN
Sbjct: 361 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAAN 420
Query: 421 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 480
STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS
Sbjct: 421 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 480
Query: 481 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 540
LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST
Sbjct: 481 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 540
Query: 541 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 600
VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL
Sbjct: 541 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 600
Query: 601 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 660
RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 601 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 660
Query: 661 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 720
RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL
Sbjct: 661 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 720
Query: 721 MWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
MWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Sbjct: 721 MWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 757
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
XP_008459731.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo])
HSP 1 Score: 1109.7 bits (2869), Expect = 0.0e+00
Identity = 729/762 (95.67%), Postives = 738/762 (96.85%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ--SSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 60
MSGFGFGSSTSQ SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSL SSSSSSSNPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPF 60
Query: 61 PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
PNPTSNP SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 360
FQSSLSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360
Query: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
Query: 421 TPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
TPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
Query: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
Query: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
Query: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 660
RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660
Query: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Sbjct: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
Query: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 882.1 bits (2278), Expect = 3.4e-252
Identity = 631/770 (81.95%), Postives = 653/770 (84.81%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
MSG G GSS+SQ SSSPFSS+TGFSFGST+ FSFGSS +PLSL SSSSSSNPTSSSS
Sbjct: 1 MSGSGSGSSSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGSSSTPLSL--SSSSSSNPTSSSS 60
Query: 61 PFPNPTSNP-SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
PF N T NP SSSS GFGSSSF +S SSPFSFSL
Sbjct: 61 PFSNQTPNPASSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFSLPL------------------------ 120
Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSL 180
FG++ SS SSA LFG+ASSSG+S PAPSFG A SSGSSL
Sbjct: 121 -----------FGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSS----------PAPSFGPASSSGSSL 180
Query: 181 APSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFG-TSASAASSGS 240
PSFGAL SS G+SSAPLFGA PSAGA SAPSLFGG SSATTSSAPLFG TSAS AS GS
Sbjct: 181 VPSFGALPSS-GSSSAPLFGATPSAGA-SAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTTSASTASPGS 240
Query: 241 GLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFA---SS 300
LFGAS AASGS SLFGT +T+SGS+GS LFGSSPFGAS SS STSNLFA SS
Sbjct: 241 ALFGASVAASGSSSSLFGT-STTSGSSGSALFGSSPFGAS-----SSLSTSNLFASSSSS 300
Query: 301 LSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVA----SPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLT 360
STSPFQ+S SSSSSQNL SSS F A S SGFSF T SLSKTTSIT ++SSSSSLT
Sbjct: 301 TSTSPFQNSFSSSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSIT--TASSSSSLT 360
Query: 361 LASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFS 420
ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLS+SVAPLFS
Sbjct: 361 TASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSSSVAPLFS 420
Query: 421 TVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVT 480
TVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSGAVSSFTGFGVT
Sbjct: 421 TVTTTSGSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSSFTGFGVT 480
Query: 481 SSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSA 540
S ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSL SA T ATTTSGFSASSQSQTSS
Sbjct: 481 SMASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLTSAPTPATTTSGFSASSQSQTSST 540
Query: 541 LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE 600
LVVASSSSGTTSTV+ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE
Sbjct: 541 LVVASSSSGTTSTVNATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE 600
Query: 601 WDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKD 660
WDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKD
Sbjct: 601 WDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVESQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKD 660
Query: 661 ERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD 720
ERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD
Sbjct: 661 ERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD 713
Query: 721 AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 713
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
XP_022959228.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata])
HSP 1 Score: 852.8 bits (2202), Expect = 2.2e-243
Identity = 619/797 (77.67%), Postives = 654/797 (82.06%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 61 PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
F N TSN PSS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTGASS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAAS+SGTS LFG +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSAGASS 240
GS P PSFGAAP SGSS+AP FG+ S SAG+SS+P FGAAPSAG +S
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TS 240
Query: 241 APSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS 300
APSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA AS GS +FGAS AASGS S
Sbjct: 241 APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGS---------------SS 300
Query: 301 GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPS 360
LFGS+PF +S SS STSNLF +SS ST+PFQ+S SSSSSQNL+SSSPF AS S
Sbjct: 301 SLFGSNPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSS 360
Query: 361 GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAAST 420
GFSF T SLSKTTSIT ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAAST
Sbjct: 361 GFSFSTTSLSKTTSIT--AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST 420
Query: 421 GGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAAT 480
GGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAAT
Sbjct: 421 GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAAT 480
Query: 481 TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGF 540
TLSIAASS PS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF
Sbjct: 481 TLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGF 540
Query: 541 PSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV 600
SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Sbjct: 541 SSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTV 600
Query: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKL 660
EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKL
Sbjct: 601 EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKL 660
Query: 661 ELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720
ELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE
Sbjct: 661 ELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE 720
Query: 721 QIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 758
QIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT
Sbjct: 721 QIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT 763
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])
HSP 1 Score: 852.4 bits (2201), Expect = 2.9e-243
Identity = 623/811 (76.82%), Postives = 657/811 (81.01%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60
MSGF FGSS+SQ SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
Query: 61 PFPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120
F N TSN PSS+ FGF SS F +S SSPFSFSL +ASTG SS S S SSLF
Sbjct: 61 AFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS-------SGSSLFAA 120
Query: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------SLFGAASSSGTSSTSLFG----A 180
SSSS G +SFGFG SSSS SSA FGAAS+SGTS LFG +
Sbjct: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
Query: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSS 240
GS P PSFGAAP+SGSS+AP FG+ +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240
Query: 241 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 300
+P FGAAPSAGA SAPSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA AS GS +FGASAAASGS
Sbjct: 241 SPFFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS--- 300
Query: 301 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSSLSSSSS 360
S LFGSSPF +S SS STSNLF +SS STSPFQ+S SSSSS
Sbjct: 301 ------------SSSLFGSSPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSS 360
Query: 361 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 420
QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+S
Sbjct: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT--AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSAS 420
Query: 421 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 480
QSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPS
Sbjct: 421 QSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS 480
Query: 481 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 540
FS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+
Sbjct: 481 FSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSL 540
Query: 541 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS 600
TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Sbjct: 541 TAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVS 600
Query: 601 STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEV 660
+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEV
Sbjct: 601 ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEV 660
Query: 661 AKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720
AKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE
Sbjct: 661 AKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYE 720
Query: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 758
QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK
Sbjct: 721 QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEK 777
BLAST of CSPI06G08680 vs. TAIR 10
Match:
AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )
HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 8.2e-111
Identity = 417/809 (51.55%), Postives = 524/809 (64.77%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
MSGF FG S +S GFSFGS S + SSS+SS+++P S S N
Sbjct: 1 MSGFPFGQS--------NSVGGFSFGS---------SSATNSSSASSTTSPLSFSF---N 60
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS----SAATSASSLFGVS 120
+SNPSS+ FGFGSS ST SS + S G +SS PS S+A+S++ FG
Sbjct: 61 QSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASS------TTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFG 120
Query: 121 SS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 180
SS ++ SFGFG ++SS+ + SLFG S T++ S GS P FG SS
Sbjct: 121 SSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFG----SSTTNASSAAPGSSP---FGFVTSS 180
Query: 181 GSSLA-PS---FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLF 240
SS A PS FGA +SSA T S+ FGAAP++G++ S+PSLF SSA+ S++ LF
Sbjct: 181 ASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLF 240
Query: 241 GTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST 300
G S+SAA+S S LFGA +++A GS S+FG +S SGS+
Sbjct: 241 GASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSS 300
Query: 301 GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSSLSSSSSQNLT-- 360
S G GSSPF SSS S+ ST +LFASS S SPF S+ +SSS+ N +
Sbjct: 301 PSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNA 360
Query: 361 SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 420
S+SPF AS +GFSF + S TTS T S+ + ++SSSSFSFGT A+S
Sbjct: 361 SASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT-----ASSSSSFSFGTSANS------ 420
Query: 421 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVP 480
GF++ STG S+AP++ S S +V + +T TTTS+STPAA T+ P+ S P
Sbjct: 421 GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAP 480
Query: 481 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTA 540
A + + + S A ++ P ASS A S TGFG+ SS ++ + S + KTST
Sbjct: 481 ASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTP 540
Query: 541 ASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST 600
ASSSQ + P+ + + ++T+T+ + SS + T + LVV SSS TST A V+ +
Sbjct: 541 ASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGS 600
Query: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAK 660
PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAK
Sbjct: 601 PKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAK 660
Query: 661 VVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQA 720
VVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAMYEQ+
Sbjct: 661 VVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQS 720
Query: 721 EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 758
E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAE
Sbjct: 721 ELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAE 739
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q8L7F7 | 1.2e-109 | 51.55 | Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... | [more] |
G0SBQ3 | 2.6e-08 | 29.94 | Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A1S3CAD4 | 0.0e+00 | 95.67 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... | [more] |
A0A0A0KA27 | 8.5e-310 | 80.37 | Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3... | [more] |
A0A6J1H5C8 | 1.1e-243 | 77.67 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... | [more] |
A0A6J1L2D4 | 1.8e-243 | 76.45 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... | [more] |
A0A6J1DSI7 | 8.1e-207 | 80.48 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC11102350... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
XP_031743587.1 | 0.0e+00 | 99.60 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical pr... | [more] |
XP_008459731.1 | 0.0e+00 | 95.67 | PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo] | [more] |
XP_038874708.1 | 3.4e-252 | 81.95 | nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida] | [more] |
XP_022959228.1 | 2.2e-243 | 77.67 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata] | [more] |
XP_023548092.1 | 2.9e-243 | 76.82 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
AT2G45000.1 | 8.2e-111 | 51.55 | structural constituent of nuclear pore | [more] |