CSPI05G12610 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTCCAGGCATCATAATGCACCAGCAATCCTCTTCTGCAGTTTCTCCACACCATATCAATCCTCCGCCTTCCTCTCTTAGGTCACCTTCATCCACACCTCCCGCTGCCCACTCTCCACTGCCTCTCACCACTCACGTCTCCAATTCCCACCGGGAGCCATGCGACCATGTTGCCGGACCAGTGCTGCAATCCGCCGGTGATTCTGCTGTAGCTATGGCTTGCCCACTCGCCCGGGTCCGCTTGTCTGATATTGCCCCCTACGACGGTGCGCCTGCGGGGTCCTACGTGAGGGCGGTTGAGGCTTTGTCCGGATCCTTGACGAGATATAATGCGGCTGTGATTGAATTGGAGAATGAAGCTGCTGCTCTCACTCGTTGCGGTCTTGAAGCGGCTAGGTTGTTTTTCAAAAGTAGAGCGCAGAGTGGAGGAAAGGGGCGAAGTGTTTATATGTATAGAGCTGGAAGGTGGTTAGCTTATACTCTCTGTTTACTATACTACTTGTTTAGTTCTCATTTTTAAGCCAGTTATTTTCTGATACTTCCTGAGTTCTTCCTTCAAGGATCTGTTTCTGGAACCAGGAAAATATTCATGTTGATTTATGCCGCTTTACATGAGCTCAAGTAGAATTACTAGTCAACCAATTTACTGTAATTAAACGGAAAATCATAACAAAGTGGCTTCCTGGTTTTGGCTTCCATCACCTAGATTGGAGCTTGAGATTAATTTGAACAAAGACAAATCAATTTTTTACCTCTCCCTTAAGTTGCACCCTTTTCATACAGTGAAATTGGCAAATTGTCTAACCGAATATTAGTGATCGGGTTCAAATGAGACGCCTGTTCCTCACATTATCTCCTTTGCCTACAATGACTAGTCCATCTTTTTAAAAGTATCCTATGCACACATGAGGGGCATGGACATAAGTTTTGTTTTCTGAGGATATGGTTTGAGAGGAACAATTGTAACATCAAGATTGAGAGGAGGTAAGATTATTTGCATGAAGGATAATGAGAAAATAAAGAAAACCTCTTTCTGGAAAAAAAGAATTAAATGGGAAAGGAAAACTCTAACTTGATTGTCTTGGGCAAAAATTATTCAACAAACTTCCAGCTGAGGTATGATCAATCTTCCTCCTAAATGTCAGATTGCAGGTTGAAGTCTGTCGTACCTTCCAGACTCTGTCACTTGATGATATTGGGCATCCATCTTTGTCCTTTGAAAGAGAACTTCCTGTTGCCATTTGAGTTTGGCTCCATTGAGTTTTAATTAATGGTTCCACTTCTTGCTCTATGTTAGCTCCAATTCCATTTGGTATGATACTTAGAGAAAATGTTTATTGAATCATTCAGCTTTTCATAAGCTTAAATAGATTTATCAACCAACTTGCAATTGTAAATCAAGGAGAAAAACTTAACAAGTTGGTTAAGTTGATTTGTGACTTCCTGTCATTGGGTTCTAGCTTGATAAATTCAATTAATTTAAAGATTGCATTGGGTTCTAGGAGATCTCTTTGTGAGGTTCTCAGTCAAGGACGGTTTGTCTATTTATTTACAGGACTATAGGAGGATAGCCTTCTTTGCCATCTTTATCCCCATCTCTATTTATTGTGCAATTTTGGTTTAGAGAATTGCCTCTATCCTTGCCTTTTCTGATAATTACATTTTGGTCATTTTGTTTTAGTTGCCCTTTGTTTTATTTTTGTTACAGAGCAGTGGAAGATTGGGACTCTTGTCCTCCGTGTATGGCTGATATTTTTAGATGTATGGGTAAAGCAGCTCGAGCTGCCTTGTGTGCAATAGCTAGGCATCTTCGTTTGAGAAGCGAGTAAGAATGCTGTTGAAATTCATTTCTACTTTTGGTTAGTGTTTGACTTGTGTACCTATCTATACAAACAAATCAATACTTTGCAGTGTTTTCAATAATTTGCTCGATGACACTCCACTTCCTGCTACTGATGTGTCCTCATCAGTGCTTGTTGCAATGCACTTGCATAATAGCTCTTTGCACAATTGCAAGGGTTCTATTGGAGGAGGAAAGTCAGCAATGAATGTTGAGGTTGAGAAGGGGTTATTGACATTGTTTTCCTCAGACAATCCTGGTTTACAGGTGGGACTTCAATGACCTTGATAACTGATCTTTTTTAGATATTAGCATTTAAATTTAATGTCTAGCACCATAAATTCAGTGCATTAAAGCTTTACGATACTTTTAGGAGCCTCAAAGACATGGACGTTATCTTTTCCTCATTGGCAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGCTGGTACCTAGCAGACACTGTCTTGGCACCTGGAGATCTGTTACTGATTACTGGAAAGGCACTTAGCCATGCTACAGCTGGCCTTCGGCCTGCTGCATCATATAGAGTTGCTTCTGATCATTCCTTGGGCTCAAATTGTGTTGGGAGGTATATAATTCTTATAAATCCACATATTTAAAATTTTCCATTTTATTGTATAATCTATACTGTATGAGCAAACCCTTTTAATTGTTTCTTGGATTGAATTACTTTGTTCAGTGTTGTGGTTGTAGGACTTCCCTTGCATTTAGACTCATGCCCCAGACAAATGCCATACTAGACTGTTCTCCCATTGCAGCAGCTGGTCATGTCATTCCCCAAAGATATGGTCCAGTCTCTGTTAGCCAATTCATGGATGATCTTTCTGCTGAGGAAGATGTATTATGCACTCATCTGGATAAGGATAACAATTGTGTAAGTCTTGTACTCTTTTTTGGTAGGAATACTGTTAAAACTTGGATTTCTTGCCACAACAAGCCATGGCGAAGATGCATAGTATGAAAAGCTTGTGCAGATCTTAACACTGTTCTTCATAATATTCAATTCACTCAATCAATTATTTCCTCTATGTGGTATTTCTTTTTGGAAGCTTGTGTTTTTTTTGAAACGGAGAAAAGCAACTTTGTTAATAATATAAGAAACTAATGCTCAAAGTACAAGAGTACTATACTAAGAGCAAAATAAGAAAAAGACACTATCATCCAGACAATATAAAGAAAGATGAACTCGGGCAATACAAATATGAAAGTGACCTACAAACGATCACAAAGGAAAAACAATGAAAGAACCAAAGCAATAGAGAATTGAAACATTAGCAAAGAGCTTCATACAAAGAGAATTTAAACACTTCGTCGAAAACCACCCACTTCCAACTAAAATTTTGTATTCCACATGCTTCAATTTGAAAGGAGAAGGGGAACACGAAGAAGAAAGAATCAGCTGCTTCAAAACTATCCAACCTAAATAATTCTTTGCCCAACGCTTGTGTTTTACCTCTGCTTCATTTTGTTTTTCTCTCTACAAGTTATTATGAATTGATAATCTAAAATAGATTTGCATTATACACTTGCTCCCTCCACTTTTGTTGTAAGTCGGTTAAAAACGCAAGTGGGTGGGTTGTGTTATGTTGGTTGGGTGACACTTTTAGAGGGGGTGTTTGGGACAAGGAGTGGAATAGTGAGCTCTAGTTTAGGGAGTCGTGCACTCCTAAGACTTATAGTGTAAAGAGTTGATAAGATATAGCTTCCACGTACTATTCTATGGGTACTATTTAATATAGTTGAAGTCCCTTTCCAATAACCCTAATTTATATAATATTACAAAATAATAATTATATAATTTAAACCGTATTAAAAATATTAACAGTAGTTTATTGTTGACTAAATATTAGTGGGTAAGTACAACTAATTTTATATAGTATCAAACACATTTTAAACAATTGTTAGATTAGAAGTTAATTTTTGATCTGCTACCAAACACATATAAAAACATGAAATACACTCCGTTTTCATAAATTCTTTGTTTTCAAATTGTTGATTCCAAATTCTCTACCAAACAGATCCTAAGAGTTTTAGAAGATATACTCATAAGACCTCTTAATTGTCTTTGAATACACAACATTTTTCCTGAAAGGAAGCGGTGAATTCTTAATAAAAATCTTTACCTCATAGCTTCTAACGAATTTTGGCAATGAACGAAATTTTGTGGGCCATTCTTCTATTTTTATGTGCAACTTGCCTAATAATTTCCATTTGCCTGTGTGGATGAGGGGATCAAAATTCCTTGACAACTTAGAAATAGAAGACTGATAACTTTTCTCTCAAAATGTGAGTTTTGTTATGAGATGGGAAAGTTCGTGCTTGATAGAAGGGAATTTAAACTAGGAGCGGTTGAGTCTGATAGGAAGATCTTTATTGAGGACATAATGAAAGGAAACACGGTAGGTTGGAGCTGGATTTAGTTACTTCTACGTGGGTAAGGGATTGTTTAAAGGTAGCGGCGGAAGTGAGTTTCTTCATGGGTTTTTGGCGTAGAAGAAAGTTGGAGTTTGCCATTATCTTTTCTTTGATTCTTTTTTCGAATGGAGACAAGAACTTCTTTATTGATAAAGAACTCAAAGTACAAGAGAGTTATACAAAGAAAGCTATAAAGACGTAGTAATCAAGGGAGTCCTCTATCAGGAGGTGCATCTGGACATTTCAACAAGGTTGACACCCCCTTGGCGCCAAACATTATATCCCGAGCACAAGCAAAACAAAACAATAAAGAAGCAATGATAAAAGCATCCATCTTAGTACAAATGTCCAGAAAACAGTACGGGACCGGAAGAAAACAATAAGAATCTCGGGGGATGGGGGGGTGTGCAAAAAACAAAACTAAAACAGGGGGCAATCCTACAAGGCTTCAAAAACAGTAGAGGGCTTCGTCTTTAATCTGCAAACATTGAAACTGAGGCAGCATAGGATTAGGCAGGTTGAGAAAGAAAAGCAGCCTAGCTAAGGTAAATGTCTTGTATGGAATAATTAACGAACTCCTTTTTAAGGGAACGCCAAGTTGCAGCTTTAAGTTCTGCTGCATGCATAATTTCTGCCCTTGGTCTTGCTTTATCATGGAAGATACGTTGATTTCGTTAGAACCATACGTTGATTTCGTTTGAAAGTAAAGCTTTTGACAAATTGT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ATGGTTCCAGGCATCATAATGCACCAGCAATCCTCTTCTGCAGTTTCTCCACACCATATCAATCCTCCGCCTTCCTCTCTTAGGTCACCTTCATCCACACCTCCCGCTGCCCACTCTCCACTGCCTCTCACCACTCACGTCTCCAATTCCCACCGGGAGCCATGCGACCATGTTGCCGGACCAGTGCTGCAATCCGCCGGTGATTCTGCTGTAGCTATGGCTTGCCCACTCGCCCGGGTCCGCTTGTCTGATATTGCCCCCTACGACGGTGCGCCTGCGGGGTCCTACGTGAGGGCGGTTGAGGCTTTGTCCGGATCCTTGACGAGATATAATGCGGCTGTGATTGAATTGGAGAATGAAGCTGCTGCTCTCACTCGTTGCGGTCTTGAAGCGGCTAGGTTGTTTTTCAAAAGTAGAGCGCAGAGTGGAGGAAAGGGGCGAAGTGTTTATATGTATAGAGCTGGAAGAGCAGTGGAAGATTGGGACTCTTGTCCTCCGTGTATGGCTGATATTTTTAGATGTATGGGTAAAGCAGCTCGAGCTGCCTTGTGTGCAATAGCTAGGCATCTTCGTTTGAGAAGCGATGTTTTCAATAATTTGCTCGATGACACTCCACTTCCTGCTACTGATGTGTCCTCATCAGTGCTTGTTGCAATGCACTTGCATAATAGCTCTTTGCACAATTGCAAGGGTTCTATTGGAGGAGGAAAGTCAGCAATGAATGTTGAGGTTGAGAAGGGGTTATTGACATTGTTTTCCTCAGACAATCCTGGTTTACAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGCTGGTACCTAGCAGACACTGTCTTGGCACCTGGAGATCTGTTACTGATTACTGGAAAGGCACTTAGCCATGCTACAGCTGGCCTTCGGCCTGCTGCATCATATAGAGTTGCTTCTGATCATTCCTTGGGCTCAAATTGTGTTGGGAGGACTTCCCTTGCATTTAGACTCATGCCCCAGACAAATGCCATACTAGACTGTTCTCCCATTGCAGCAGCTGGTCATGTCATTCCCCAAAGATATGGTCCAGTCTCTGTTAGCCAATTCATGGATGATCTTTCTGCTGAGGAAGATGTATTATGCACTCATCTGGATAAGGATAACAATTGTATAGCTCGAAATGATCAAAACAAGGAAGCCTCGCTAAGAAGTGTTCTCTCAGATCCACTATCAGGTGCATTCCTTGAGGATGCGACGTTTGTTTCATGTGGACATTCATTTGGTGGTCTCATGCTGAGGAGAGTCATTGAGACGTCAAGGTGCACCATTTGCAACTCAGAAATTGATGCTGGGTCTTTGATTCCTAATCTAGCACTTAGAGCCGCAGCCTCAGCTGTGAAGCATGAAGATGATAGGAGGCTATTCCACAATGCTGCATTGAGGAAGCGTAGGAAAGAAATGGGCGACCATATGGATCCAATGAGAAGATTAAACAGGGTGAAGAACTTCATGTTTTATCAATATGAAGTAGGATCTTGTGACCTCACGTTTGTTAGAAGAAAGAGATTGAAGGAGGCCTCAAAACAAAAGGCTTTAAAAGCAAGGTTATTGTTAGATCATAATCTGGATTTGTTAGAGGCCAAGTATCCTTCTTCAAGCCCCAGTTCTCCCAAACAGGCCAGTGCCTTAGAACTCTATCTAGAAAGAAGCATGCTTCAGTTTTTGGATCTCCCTTGTGAGGAAGATGACCTCTTGTCGAAGACAGCTAAGAGGAGGATCCATCACTAA MVPGIIMHQQSSSAVSPHHINPPPSSLRSPSSTPPAAHSPLPLTTHVSNSHREPCDHVAGPVLQSAGDSAVAMACPLARVRLSDIAPYDGAPAGSYVRAVEALSGSLTRYNAAVIELENEAAALTRCGLEAARLFFKSRAQSGGKGRSVYMYRAGRAVEDWDSCPPCMADIFRCMGKAARAALCAIARHLRLRSDVFNNLLDDTPLPATDVSSSVLVAMHLHNSSLHNCKGSIGGGKSAMNVEVEKGLLTLFSSDNPGLQVCDPNGRWYLADTVLAPGDLLLITGKALSHATAGLRPAASYRVASDHSLGSNCVGRTSLAFRLMPQTNAILDCSPIAAAGHVIPQRYGPVSVSQFMDDLSAEEDVLCTHLDKDNNCIARNDQNKEASLRSVLSDPLSGAFLEDATFVSCGHSFGGLMLRRVIETSRCTICNSEIDAGSLIPNLALRAAASAVKHEDDRRLFHNAALRKRRKEMGDHMDPMRRLNRVKNFMFYQYEVGSCDLTFVRRKRLKEASKQKALKARLLLDHNLDLLEAKYPSSSPSSPKQASALELYLERSMLQFLDLPCEEDDLLSKTAKRRIHH* Homology
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q58FY4 (U-box domain-containing protein 63 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB63 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.5e-11 Identity = 38/89 (42.70%), Postives = 51/89 (57.30%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DBN5 (U-box domain-containing protein 62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB62 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.4e-09 Identity = 35/107 (32.71%), Postives = 57/107 (53.27%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3S2 (uncharacterized protein LOC103496673 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496673 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 4.7e-271 Identity = 477/485 (98.35%), Postives = 479/485 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FWI9 (uncharacterized protein LOC111447566 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447566 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 863.2 bits (2229), Expect = 6.1e-247 Identity = 445/493 (90.26%), Postives = 456/493 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JTN9 (uncharacterized protein LOC111487410 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487410 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 851.7 bits (2199), Expect = 1.8e-243 Identity = 443/499 (88.78%), Postives = 454/499 (90.98%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DMB0 (uncharacterized protein LOC111022323 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022323 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 713.4 bits (1840), Expect = 7.8e-202 Identity = 354/377 (93.90%), Postives = 363/377 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5S2Y2 (uncharacterized protein LOC110754572 OS=Prunus avium OX=42229 GN=LOC110754572 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 665.6 bits (1716), Expect = 1.9e-187 Identity = 355/487 (72.90%), Postives = 403/487 (82.75%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. NCBI nr
Match: XP_004140426.1 (uncharacterized protein LOC101206682 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648109.1 hypothetical protein Csa_004712 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 961.4 bits (2484), Expect = 3.4e-276 Identity = 485/485 (100.00%), Postives = 485/485 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. NCBI nr
Match: XP_031741482.1 (uncharacterized protein LOC101206682 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 961.4 bits (2484), Expect = 3.4e-276 Identity = 485/485 (100.00%), Postives = 485/485 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. NCBI nr
Match: XP_008456842.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496673 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 9.6e-271 Identity = 477/485 (98.35%), Postives = 479/485 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. NCBI nr
Match: XP_038891861.1 (uncharacterized protein LOC120081226 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891862.1 uncharacterized protein LOC120081226 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891863.1 uncharacterized protein LOC120081226 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 906.4 bits (2341), Expect = 1.3e-259 Identity = 464/493 (94.12%), Postives = 468/493 (94.93%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. NCBI nr
Match: XP_022942565.1 (uncharacterized protein LOC111447566 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 863.2 bits (2229), Expect = 1.3e-246 Identity = 445/493 (90.26%), Postives = 456/493 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. TAIR 10
Match: AT3G19895.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 540.8 bits (1392), Expect = 1.3e-153 Identity = 299/475 (62.95%), Postives = 358/475 (75.37%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. TAIR 10
Match: AT3G12940.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 150.6 bits (379), Expect = 3.9e-36 Identity = 110/324 (33.95%), Postives = 159/324 (49.07%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. TAIR 10
Match: AT2G40640.3 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 4.6e-13 Identity = 38/105 (36.19%), Postives = 57/105 (54.29%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. TAIR 10
Match: AT2G40640.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.8e-12 Identity = 38/89 (42.70%), Postives = 51/89 (57.30%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI05G12610 vs. TAIR 10
Match: AT2G40640.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.8e-12 Identity = 38/89 (42.70%), Postives = 51/89 (57.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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