CSPI05G11060 (gene) Cucumber (PI 183967) v1

Overview
NameCSPI05G11060
Typegene
OrganismCucumis sativus var. hardwickii cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr5: 9621335 .. 9622657 (+)
RNA-Seq ExpressionCSPI05G11060
SyntenyCSPI05G11060
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTATAAGTTACATGAAGTTAAGAATAAGCAACGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGAGAGAGAGAAAGAGATAAGGAAGAGAAGCTTACCGGCGGAGCGGTGGCGGGTTTGCTTCGCGAACGGAGAGAAGGGGAAGGATGGGGCGGCTGGGCTGCGGCGGAAAGAAAGACGGAAGGGAACGGCGGAAGGAAAAGAGAAAAGAGAAGGAAAGGAGAAGGAGATGGTGGATTCGTCGCGGCGTACGGGAGGAAGGAGAAGAGGCGCGGCGGTTGCGGCTGGGGAGAAGGGGAAGGACGCACGAGGAGGAAGAAGGAAATAG

mRNA sequence

ATGGCTATAAGTTACATGAAGTTAAGAATAAGCAACGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGAGAGAGAGAAAGAGATAAGGAAGAGAAGCTTACCGGCGGAGCGGTGGCGGGTTTGCTTCGCGAACGGAGAGAAGGGGAAGGATGGGGCGGCTGGGCTGCGGCGGAAAGAAAGACGGAAGGGAACGGCGGAAGGAAAAGAGAAAAGAGAAGGAAAGGAGAAGGAGATGGTGGATTCGTCGCGGCGTACGGGAGGAAGGAGAAGAGGCGCGGCGGTTGCGGCTGGGGAGAAGGGGAAGGACGCACGAGGAGGAAGAAGGAAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCTATAAGTTACATGAAGTTAAGAATAAGCAACGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGAGAGAGAGAAAGAGATAAGGAAGAGAAGCTTACCGGCGGAGCGGTGGCGGGTTTGCTTCGCGAACGGAGAGAAGGGGAAGGATGGGGCGGCTGGGCTGCGGCGGAAAGAAAGACGGAAGGGAACGGCGGAAGGAAAAGAGAAAAGAGAAGGAAAGGAGAAGGAGATGGTGGATTCGTCGCGGCGTACGGGAGGAAGGAGAAGAGGCGCGGCGGTTGCGGCTGGGGAGAAGGGGAAGGACGCACGAGGAGGAAGAAGGAAATAG

Protein sequence

MAISYMKLRISNXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXREREKEIRKRSLPAERWRVCFANGEKGKDGAAGLRRKERRKGTAEGKEKREGKEKEMVDSSRRTGGRRRGAAVAAGEKGKDARGGRRK*
Homology
[Close]
BLAST of CSPI05G11060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KE93 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G051530 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 7.6e-24
Identity = 67/73 (91.78%), Postives = 70/73 (95.89%), Query Frame = 0 

Query: 368 RWRVCFANGEKGKDGAAGLRRKERRKGTAEGKEKREGKEKEMVDSSRRTGGRRRGAAVAA 427
           RWR CFANGEKGKDGAAGLRRKERRKGTAEGKEKREGKEKE V+SS+RT GRRRGAAVAA
Sbjct: 5   RWRFCFANGEKGKDGAAGLRRKERRKGTAEGKEKREGKEKETVESSQRTRGRRRGAAVAA 64

Query: 428 GEKGKDARGGRRK 441
           GEKGK+ARGGRRK
Sbjct: 65  GEKGKEARGGRRK 77

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CSPI05G11060 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CSPI05G11060 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KE937.6e-2491.78Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G051530 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CSPI05G11060 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CSPI05G11060 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 41..78
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 37..100
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 85..100

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CSPI05G11060.1CSPI05G11060.1mRNA