CSPI04G19400 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTGTGGGTCTTGATTGTAGCAATGCAATACAATGCTCAGCAAAGGTTAGTTTTCAAATATTTTTCTTGTTATTTGTGGTTGCTCCGCTTGACCAGTAAATAACTCGATATTGCTATTCCATAGAGGTGAATACTTAATACTGCTTACTTAAAAGTACTAATCTTTTGTAGGAGGGGATAGGTATAATTGAAATTTTAAATGCGATTGTTGAAAGAGTTCCTCCACCACGTAATACTGCTGATAGACCACTTCGAGCATTAATATTTGATAGGTATATAAACTAGCTTGGTTATCTCTCTTTATTTGTGTTTATGATCAAATGACTCTTTTTTACCCTAGATATTGTTAATTTGAAGACTGGTTTCTCATGTTTGTTTCTTTGTTGGATCCTTTTCAAGTAATAACGTAAAGATCTATAGCGTATGGATAAGGTTGGGTGTCTTATTCTATGGAGACTATCGATAAGACTCACTTTGTAATGGTTATAAATAGTTTGATTCAAACTATTCATGTGGAGAAATGCGAGTGGAGTATCCCTATACAAAGAGTTTGTATTAGACTGCCAAATAATTAATCTCTCTTTGTAAATTCTTTAATTAGTGAGATTAATATTTAATAGGATACTAAATCCTTCTATACGGATGTATTGTTAAATTACTATACGTCGTTTCATAGTTTATGTTCTTACATGTCTATTATTTTAATGAATTGTTGTGTTAGATGTAATATTAAATTTATCTTAATCCATCTTTTTAAACTTTTGAATCAATCGGTGATTTAAGATGGTATCAAAGTAAGTGGTCTTGGAGGTTACTTAGTAACTAACTTCTATTAAATCTTCTATAAATAAAGCCCTGCCCTCCCTTGGGAGGCAGAAAAATATTCTTCCGAAATCTCTTTGGTAGTTTACACCAAATTGGTATCAGAGCATTTATGCTCTCGGGTCCTATGGCTATCCGGCATGGAAGGCAACCTGCTCAGAATCAAGAGGCGAAAGATACCCATGTCCTCTCTCCAAAAACCTTTTCGAGATGCTTGCTGTTTGTGGAAGCTTTGGTGGAGAGAATTGAGAGAGCATTGAATGAGGTCTTGCAAAGGAATTAAAACTGAGTACAGGAGAACTAAAAGGTAAGTTCTCTCTCTTCCCTCTTTCCTCTCTCCTCTCACCCACCCTCTTCTCCCTTCACTTCGGCCATGGTTTTTCCAGTCACATCTTCTCTCATCGCACTAAGGGATCCCGTCGTCCTCCCTCACTCCGCCCAGCCCGATGAGTCACAGTTCCATTTTTTTCCTAAAATGGAAGTTAAAAGTTGTAAAATTGTAGACTCTTTCTACTGCATTAGGTTCGAAAAGAGGCGTTTCAATATTGAAGATGTACACTTCCAAAAAATTCTTTAGTTTATCCAAGACTCAATTGGATTGGTTCATTGATTTAATAGCGGTTCTAGTCAAAGAACTAGATTGGAAGTTCTTCAGCAAATTTGGGAGCAATGAAAGCGGAACAACAAGACTATCCAAATTCCAAACTCCATTTGCTTGGTTTCTAAGGTGTGTTGCTTGAAGTACCTCTAGAGCACAATCCTTCATCCACATCTACTCAGGAGAAACCCGACAAGGTTGGATATGCTTTCTAAATATGATCAGGTCCTTTTTGTTAACTACGCTTCCTCGCATTCCACTCTCCATTCAGAAGCCGGCCATTCACGACAGCCCCACTTAGGAAGCAAAGCCGAATTTTGAATTTTAATGCCCCCTAGACCGAGACCTTCATCTTTACTCGATGATTGATCTTGCCGCCGGCAAATCCTTCCCAAAAGAAGTTCCTCATGATTTTTTCCAATGAAGTTGCCACATGAGTTGGAATAAGGAATAAAGAAAGATAGTCTCGTTTCAAGACTTCAATAACTAACAACTTAGATTCGATAATCAGCAATCCTCCTGATCTGCCATTAGCTTCAATAAGGTCCCAACCAATTTCTTCTAAACTCTATAGTGCCTTTATAATATAACTATCAATCTCTTTTCTTTTGGTCTCTTGAATCATTGCTATATCTGGATTTACTTTCTTCAAATGTTTTTTAGTAGCCAATTGTTTCGATTGACCCATGATCCTGTTAGACCCCCTATCATTCACACATACAAACGTAGGGGCAGAAAAGGTATGGAAGGAATATTCCGATGTGGGACCGACAGGAAGGCATGGGAGTATATAAGGGAATGTTTTGGGATTGCTGAGGGATCATCATAGAGAAAAGAGTAGCAACAACTTTTGGATGAGAAGGCCATCATTCTCGAATTAGCTGGAGAGTTATCCTTTATCTTTGTTTTTTTCTTTTTGATATTGACTAGTGTGGTGTTTCCTTCGTTAGAGGATAGTATATGAACCTTGTCTTTCGTTAGAACTATATCAATATATAAATACAGAGTACTGTCTTTGTTTCTCTATTGCTTGTTGGGATTTTATTGAGTGGCAGGCGTTGGGTCCTTACAGATCCCTCTAGTGTTCCACGATATAATCATCATCCTAGCTATCTCTGCCTTAGATCAATTCAATTTCGCAGGCTGCTAAGAATGAAATGAACTCTTGAGAGGGGAAGATACTTGCTGGCTTGCACAAACTCTCTTTTCCTAGGGAGGAAAAGAGCTTGGAAATATCTGGATTGAGAAAATCACTATCCTCTAGTTTCTCTCTCTGTTTGGAACTCTTCTACCTCAATTTGGTTGATTTTTAGCATTGCTTACACTGGTGATTGATTCAACTTCCATTATTTCATCTTCCGGGTTCTCCACTTCTTTGAGACAAGAAGTACCTCGCACAAAATTGAAGAATGAACCAGAAAGCTTCGAGGAGTGCAGGGGCCCATCTTTCTCCAGATTATGGAATTTGCAATCATTTCAAGTGTGCCAAAGGAGGTAAATCATCTCATGTTCCAAAAATTTTCAAACATTACATCTGCAAGCAAACCTCCTTCGACAATGTTTGGACTGCCCTACTAAAATTGGAATTAAATGGGGCATGTGACCTTAAAGTTCCCCCTTTGGACTCCTTCGGATCTATCCCATCAAGCACTCCATTTCTGATAAAAACCCGAATCTTCTGGAAGTATACAACTCTAAAGTTAAGGCCCCTGAATGCTTCATTAGGTCAGTAAACGCAGGTTCTACATTTGAGCTTTTCAATTTTTCTAAATCCACCATCACTAACACAAAGGTTTCTATTTTGCAAGGCTCCCCCTGCAAAGCTGATTATTCTTTCAAGAACCAACTTGATATTTCCTCTACATTCATTGTTAGTAATGAAGAATCAGTCGGTGCTCTCAGCGCGTTTGACATTAAATTAGACTCTGAAATTGAAGGGGTGGAGGCTTCCTTCCAAATAAAGTTCCCTTGGATCTGCCAAAGGATTTATTGACAATAGTCGATGATTGTGGAATTATTTGGCTTAAATTATCAATTCAGTCCTCCCATGTTGTTTGACCTCCAATATTATTCCAATATAGTAAGAGAAAGCAGAAAGAGAAGTCGAAAGTTTGTGTAATGGCTTTGCTCGGGATGACTCGGGTGGAATGACTTTTCTCTGTTTCAAAAAAGAAAAAAAAGATTGAAGCTAAAGATCACTGCTTTAATCTTGAAGGCTTCACTAGTTTTATTGGTTTGCTTGAATCATTTCCTTCTCATGTTCCTAGTTCAGATTATCAACTATTTGAGTATTCACCTTCAGTATTGAGGTATGTGTTGAAGAAAACGTTTGCTCGTGGTTCCTATGGTAAAGTATTACTGGCTTTCCAAGGTACTCCCAAGAAGTATTTAGTTCAGAAGGCGAAAATATTAATCTTTTGTGCAACTCATCTTTAGAAGTCTTGATTGCCAGAAACTATAGTTGCTCTTCTAATATTTCCCAAGCTTATACTCTGAGATTATCTTGTTCATCATGAATCGTGTTATGGTTGAAAAAGGTGCTGGAATCTATTAAAGTGGCTTATGGGAGAAATATTTTGGTGAATATTTTTAATATTTCTACACTAATGAGGGATGAGTTTTCAATTGGAACATCAAACTTTGTCTTTGAAGATTCAACATGATGTGTTGAGGTGCTGTAATGGAAGTACAACCTTTTGCTGATGCTGATATTTTGAAAGATTGTTTTGTTCCTTTTTTGGGTTTGGACTACTTTGGCAAGATAGCTTTGAGATCACCGGTTGCATCTTTTTGCTAGTCTCTAGATCTGAATGGTTTCCTTTTGAGGGAGTTATTTTGTTGTGCTTTGTATTTAGATCTCTTTGTTTTGGTTTTGTTTTAACTTCATTTTTTCTGTTCAATTTTGCCTTTTTAGCTTGTTCTTTGCATTTGTTTATTTGCTTTGGTCGTTTTCCCTTGTATTGGCCGAGATCATCTTTGGGCAGTTTGTTTGGATGTTTTTGCCTTTTCTTGTTTTGCTCTTAGTATAATTCTTTTGTACTTTGAGCATCAGTCTCATTTTTCTTTATTAATTAACAAGCTTGTCTCCGTTTCAAAAATTAAAAAAAAAAGAGCCAAAGGGACTACATCTAATGCTGGCCTATATTCTCCACTATCTTTTCATATGAATATTTGGGAAGATCTCTTAGTTGATTTTGTTGTTGGCTTGCCTAAGACTCAAAGGGGATTTGATGCTGTCATGGTAGTAGTGCACAAATTCAGCAAGATGGTCCATTTCCTAGCCTGCAAAAAGACTAATGATGTTGTTTATGGTGCCACCTTTTTCTTTAGAGAAATTGTGAGACTTCATGAAATTTTTAAACCATTGTTTCAGACAGGGATGTTAAATTCCTTAGCCACTTTTGGAGGACTGTTTGGAAGAAATTTGATACTACACTCAAATTGAGCACCATCACACAGCCTCAAATTGCTGGTCAGACCAAAGTTACTGATAGGTCGTTAGGGAACTTAATTTGATGCTTAGTGGAGCACATCCAAAAGAATGAGACATGACTCTCGCACAAGTTGAATTTGA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IVGLDCSNAIQCSAKEGIGIIEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVLDGRIKRGDRIYFMASDKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTITHHGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKFEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLSLITTAPSVVYRVNCVNGDTVECSNPSLLPEPGKRRSIEEPFVKIEMLTPKEYIGPLMELAQERRGEFQEMKFITEVRASITYGLPLAEMVGDFFDQLKSRSKGYASMEYSFIGYRESELIKLDIQINGDRVEPLSTIVHNNKAYSVGRALTQKLKELIPRQMFKVPIQACIGSKIIASETISAIRKDVLAKCYGGDITRKKKLLRKQAEGKKRMKAIGRVDVPQEAFMAVLKLEKEVL Homology
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5B4D2 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VITISV_013255 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 826.6 bits (2134), Expect = 1.3e-238 Identity = 405/451 (89.80%), Postives = 441/451 (97.78%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9RHQ5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Ricinus communis OX=3988 GN=RCOM_1767360 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 3.1e-235 Identity = 401/449 (89.31%), Postives = 433/449 (96.44%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9GHA6 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTRDRAFT_815670 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 812.0 bits (2096), Expect = 3.4e-234 Identity = 401/451 (88.91%), Postives = 434/451 (96.23%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FNM5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08650 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 785.8 bits (2028), Expect = 2.6e-226 Identity = 387/451 (85.81%), Postives = 426/451 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8AI54 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=OsI_05919 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 770.8 bits (1989), Expect = 8.7e-222 Identity = 384/459 (83.66%), Postives = 422/459 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMN9 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491317 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 885.6 bits (2287), Expect = 8.9e-254 Identity = 445/451 (98.67%), Postives = 450/451 (99.78%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRW4 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466184 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 866.3 bits (2237), Expect = 5.6e-248 Identity = 437/451 (96.90%), Postives = 443/451 (98.23%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EAZ6 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432406 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 866.3 bits (2237), Expect = 5.6e-248 Identity = 437/451 (96.90%), Postives = 443/451 (98.23%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVN5 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024873 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 860.1 bits (2221), Expect = 4.0e-246 Identity = 431/451 (95.57%), Postives = 444/451 (98.45%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J7DZN0 (Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic OS=Tripterygium wilfordii OX=458696 GN=HS088_TW02G00785 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 834.3 bits (2154), Expect = 2.4e-238 Identity = 409/451 (90.69%), Postives = 441/451 (97.78%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. NCBI nr
Match: XP_031740279.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X5 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 888.6 bits (2295), Expect = 2.2e-254 Identity = 449/451 (99.56%), Postives = 449/451 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. NCBI nr
Match: XP_011653860.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN54948.2 hypothetical protein Csa_012600 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 888.6 bits (2295), Expect = 2.2e-254 Identity = 449/451 (99.56%), Postives = 449/451 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. NCBI nr
Match: XP_008449438.1 (PREDICTED: translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 885.6 bits (2287), Expect = 1.8e-253 Identity = 445/451 (98.67%), Postives = 450/451 (99.78%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. NCBI nr
Match: XP_038889419.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 872.8 bits (2254), Expect = 1.2e-249 Identity = 438/451 (97.12%), Postives = 447/451 (99.11%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. NCBI nr
Match: XP_022925039.1 (translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 866.3 bits (2237), Expect = 1.2e-247 Identity = 437/451 (96.90%), Postives = 443/451 (98.23%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. TAIR 10
Match: AT5G08650.1 (Small GTP-binding protein ) HSP 1 Score: 785.8 bits (2028), Expect = 1.9e-227 Identity = 387/451 (85.81%), Postives = 426/451 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. TAIR 10
Match: AT5G39900.1 (Small GTP-binding protein ) HSP 1 Score: 432.6 bits (1111), Expect = 4.0e-121 Identity = 215/445 (48.31%), Postives = 298/445 (66.97%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. TAIR 10
Match: AT1G45332.1 (Translation elongation factor EFG/EF2 protein ) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.4e-09 Identity = 57/234 (24.36%), Postives = 97/234 (41.45%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. TAIR 10
Match: AT2G45030.1 (Translation elongation factor EFG/EF2 protein ) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.4e-09 Identity = 57/234 (24.36%), Postives = 97/234 (41.45%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G19400 vs. TAIR 10
Match: AT1G62750.1 (Translation elongation factor EFG/EF2 protein ) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 1.7e-07 Identity = 54/235 (22.98%), Postives = 94/235 (40.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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