
CSPI04G08900 (gene) Cucumber (PI 183967) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTCGTTGTTATTACAGATGTGGTTCGATCAACGCTTCCTACCTGCATACCACCATCTTACAAGGGTGCCACTATTCGTTATATGTATTATGTTAAAAGCACGTTACTAGGACGATGGCTATCACAGGAAAATGGTCGATCTCATAAAGAGTCGCCGAAGGATCAAATAGAAATGGTTTGTGTACTTGTTTCAAAGATGAGCGCATTCATTGTTTGATTTGAATTGAATAAACATTAGGTGAACTGCATTAGGGAAAAAAAACATTAGGTGAACTGCAGCTGGAATTTGTTTCTGACTTCAATTTTTCTTTTAGAAGAACAATTCTTTTTCAGTCCTACTTACTATTACTACATTTACTAATCTTCTCACATACCTTTCATGCTTGAATCCCTGTAACCAACTAAGTGTTTCATCCAAGTATGTGCTCATTGAATGGGTACTTCTTATCAATAACAATAAACATAGGTTCTTAAATTTTATTTTTTACACTGCATTGCTTTACACTGATAATGGATGTTTTTTCTGTTTCTTCACCATAAGATTATTTATATTCTTTTCTTTTCGTGGATTGTATTTTCAAATCTTATGTGTATAAATATAGTTTTTTTCTTTTGATATCCGTGAGTGTCTGGGCCAGCTTACGCGCACCTCGACTAATCTCACGGGACAACCCATCTGACCCTACAACTTTTGGGTGTCAAGGAAACTCATAGGAAATTAATTCCTAGCTAGGTGACCAACATGGATTGAACCAATGACTTCTTAGTTAGTTATTGAGACTATCTCCCTTTTTACCACTAGGCGAACCCATGATGATTTTCATAAACATAGTTGTTAAAATTAACTTTTCAATTACAGACAAGAAATCATTGAATGGATTTATGATTGGACTAGAGAATTGGAGGATAGTACCTGACCTTTTCCTCCCTATGCATGTTTTCTGTATTTCTGGTTAAGATATTATCTAACTTCATTTATTATTTATTTAGGAAGCTCGGCTTCCATTACAAGTGTGGGTCACTCAGAAAACTAATGGCATGCTAATGGAAGAAGGTCAAAATGATGGTGATCTTTCCTCTCTCTGTTTGTTATAGTTGTGCAAGTTGCATATTTATTTGCATCTGAAGTTCATTTGTGGTTTGTGGAATTACACACACACCTATGCACACATTAGCAGCTACGCATTTTGCTTACATCTACATGGTTACTATTCCATATTTGTTTATATCAATTGGAGTTTTTTCTTAAATCTCCTTCAGTGTAGGCCATCTTTTCTTCACTCTCATTGTGAATTTGCTCTTCATTGAAGCTTCACATCCAAAATAAAAGAAAGTATCAATTTACTCTTCTTTTAGATCTATAATTCAATATGGCTAACTGAACTTTCTTTTGAAGATCATTGCTTGGTATTTGGTATTTAGTATTTGGTATTTGGTATTTGGTATTTTATGACTAAAAAGGGGTGACCTTTTAGTGGTAAGAAATTGGGATGGCTGGAGATAGGGCTTGTGGTCTCCTGGAGTTGGCCTTGGTTGGGCAAGACCTCCCCAAGAATTAGAGTGATGAGTCATGACTATGTATAGTTGGTTTTCTATAGGAAAAAAAGTCACGACTATGAGCATAAGGTACGGAGTGGAGCCCTCTTATACTTTTAACTTTAAATAACTCAAGTTTTACATTTCCTTGTACATGCCTTTCTGTTTACACGTGCCTATATCATCATAAATGAGGGAGTTTCATTAATCGCTTGTTAAGATTTCTATCCTGAAAATCAGTAAAATCCCAACAAGGGTAAATAGAGACAGTACTCTGTTACAATATATTGATAATAATAGCCAAAATGTATCACAATATGTCAAGCACAGATAAAAGTAAGGAAATACAAGAAGACAATAAACCAGCTCCTTCGAGAAGGATGGAAACCTCTCCTAATGAAGCCTACAATAGCCTTCACGAAAAACAAAACCTAAAACATTAATCCATAACATTCCATATAAATACCCATCATTTAGTGGGCCCTCAGATAGTGTTTCTTCTCTCTTCAGCTCCTGAAATTGCCATATTCCATGTCAACTCCCTTTTTTGCCCCATCTCTTGTATGTGTGTAATATCGGGGGTCTAACATTACTGGTTGGCTCGAAACCTTGTCCTCAAGTTGGAGTGCGGGGAATTGTTGATTCATTAAGTGCACCGTTTCCAACGTAGCTTCACTGTCTGCAGCCCCTTCCTCTTGACCAGCCAATCATTTGCTGCCATTTCTCTTATTAATATAATTAGATTATTCTTAGGAGATATTATTTTGGAGATATTATTTGATATTATTTCCTTAAGTGTATTTCTCTATGGTTATATATAGGCTTGTATCTCTACTAAATAATTAATGAAATATAGATTAATTCCATAAAATCAACATGGTATCAGAGCTCTAGGGTTTTCCCCTTATTGAATTCTAGCCTCCACATCCCGTTTGATCTCTGCCTCCGTTGATGAATGATCAACGGAGGCAGAGATCAAACGGGATGTGGAGGCTAGAATTCAATAAGGCGAAAACCCTAGAGCTCTGATACCATGTTGATTTTATGGAATTAATCTATATTTCATTAATTATTTAGTAGAGATACAAGCCTATATATAACCATAGAGAAATACACTTAAGGAAATAATATCAAATAATATCTCCAAAATAATATCTCCTAAGAATAATCTAATTATATTAATAAGAGAAATGGCAGCAAATGATTGGCTTTTCAAGATGAAGGCGCCGCAGACAGTGAAGCTACAGCAGCCGATTGAACCTCTGCCAGTTGAAGCCGAACGCCCAGCCGAAGAGTTTCGGTTTTGTTCGTCGTCCAAGAAGCTCTGCTCGCCGCAACATAGAGTTGCCGTTGCTCCATCTCCTTGCGCTGTCCCAACAAAACCATGAAACCCCATGTCCTCAGATCCTCGCGTCTGCCTCCAATCTGTTCCAGATCTGTCTAATTTCGTTCAGACCCATCCTTCATGTCTGCCTTCAAAGTTTAGATCGAAGCCCAGATCCAACGACGCCTCGTTTCTGTTTTTGTTCAGATCCGCTAAGCCTCTCTGCTCCATTCAGTTCAGTTTCCGTTCTGTTCGCCCCAGATTTCCCGTTTAATCTGATTCTGACTTGCTCTAGTTTAGTTCGTTCGGTTCCATTTCGTGGGTTTGTTCTAACCTAGAAGTTCTTTGTGTGTTTGTTCTTCGGGTTTTTTATTCTATTCTAGATATATTGTTTCTTTTCTTAGTTCTTAGCAAACTCAAGTTTGTGATTTCAACCTTGAGTTTGAGGGAGGGTATTAATATAATTAGATTATTCTTAGGAGATATTATTTTGGAGATATTATTTGATATTATTTCCTTAAGTGTATTTCTCTATGGTCATATATAGGCTTGTATCTCTACTAAATAATTAATGAAATATAGATTAATTCCATAAAATCAACATCTCTATTCCATCTGATTCCCTAAACGGCCTCCGACCTCAGTTGCAATACAAACTCTTCGGTTAGCATGGAGGGAAGTTTTAGGACCCTTTGCGTTTGACCCAACTTTCTTTAGCTGGGATACAGGAAAGACATCATGGATACATGTTCTTGAAGGTAATTCTAAGCGATATGCCACTTTTCCAATTCTTTCCATGACTCGATAGGGTCCATAGAGTTTAGGTGAAAGTTTCTCACTTCTTTTTTTTGCTCGAGACATCTGTCGATACAACCATAATTTCAAGTATACCTCATCACCTACTTGGAATCTCAGTTCCCTCCAATGTAAGTTCGCTTGCTTTTTCATCCTATTATGGGCTACTACCAAGTTTTCTTTCAATGAATTGATTATTAAGTCTCTCTCCATAAAATACTACCCATTCTCTTTCATCAGCTTTTTCTAGCAGCTCCAAGCTGTTTGTAAAGGCTAATTCTGATTTACTGGAAGTTAGTTGCACCCAAATTCAAGCTCTAGCCCATTCTTCTAAGTCTTTTTCTCATCATTCTAACTCTACCCAGTTTAAGTATTCTGAGTTCTCTTTGCCTAACTTCAAGGTAAAATTGATAGAGAGATGGTAGCTAGGTTTTATTTTGTCATCTTTATGATGGGTAGGCTGCTCTAGCCGTATGAGGTATCCTTCTTGTAAAAGGTGCTGGTATGTTCTTTCGTTATTTCCTTTTCCTTGTTATCCTTCTATATTGTTGATTGTAAACATCTTGGCTTAGACATAAATAAAGAATATCAGAGTACTACCTTTGTTTAGCCATTGTTGGGTATTTTATTTGATACTTTGGTTGGGAGCCTGACAGTCTTCTGATTCCCCAGTTTCCTTTTTTTAGGCTTCTTCTTTATTACTCTCATTGTATAACTCTCTCGTACTTCGAGTTTTATTATTAATAAAGAAGTTTGTCTCTGTTTCAAAAACAAGAAAACATGATGGATAGATTTAAAGAAGAAAAAGAATTATGAACTTTAAGGATTGGACACTGGAAACCGCAGGAACATTTGAAGTGGGCTGTATGGGGTGCTGCTGCTCAATTTTGTGAAGTGCACGAGAGGGGAGCATATTCAATTTAAATTTTAGGTTTTGTGATTTTTTATATTCTTTAAGAAGAAAGTTAATGGGCTTCAAAATTTGGGCCCATTCTTCTCTATTTTTCTTTTCCAGCGTGTCTGTATTAAAAAGATAATAAAAAAACAGGACACGCAAAATGTTGTGTCAGACATGTGTCTGGACCAGTCTAGACCAATCCTTGTCCGCCAAGTGTTCGACACCGATACCACCTCTTGTATGAAGTGTCCGTGCTTCTTAGCAAACACACAATTTTCTTTGTAGTATTAATTATCTTGTAAATATTTCTGTTGGTTGGGTGTACTGCAAGTCGTTAGCTGTGTACTTGCATCTGGATCGTTCTTTATCATATCTATGCAGGATATCTTATAAGCAGATCTCCTGCATTATACGTTATATTGTGGTTGGTGTAATACCG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CCATTGGACCAGTAGTCATCTTATCTATTGTCATCTTCCTGAATTTGATGGTTGTTAACTTATTATTTTGATGATTTTTATTAAACCACCCATTCATCCAAAAGCTTAAGCTGGTGGTTGTAGGCAAATTTAAATATATATCACCAACACTCCCCTTCACTTGTGGACTTGAAATATTTGAAAAGCCCAACAACAAGTGGAAATCAATTTTAACGGGGGAGGAAACGACTATGCAGAGGTTTGAACACAGGACCTTCCTGGACCACCTGCTCTGATACCCAAACCACCAATTCACCCAAAAGCTTAATCTGGTGGTTGAAGGCAAATTTAAATATATATCACCAACAATTTTAAATGGAATATTTCACATGTTTATACGCACAACATATATTGAAAATTGGTGTGTCACCACATTGGTATCGTCGTATCGTGTGTTAGTGCCCATGCTTCCTAGCTAGTATGTTCAGTTATATACTTTGCAAGGTTATTTTTCTAATATTTATTGAACTGTGTTTGTAGGTTCAAAGTGATCACTATGAGGTTGTTGCTGATTTGATTCAGACAAGCTTTCTTTTCTCCATTCCCATGGATGGGCCGATGTCTTTTTCCACTCCACATGTATCTTTGCAGTGGGCACTTCGCTTTGAATTTTTTACCACTCCCAAGAATGTGGATTGGACCAGGTACTGACCCAAAATTTTGTAGTACTACTGAAATATCTTGTTAGATATAATATTAAATTTACCTCCACCCTTCATTTTTAGTTTTTTGGTTAATTGGTGATATAATATGGTAATAAAGAAAGGGTCCCATTTTCAATCTATTTAATGTTATTTCCTTCCGAAAAATAATTAGTTTTGTATATAATAATATTCAATCTGTTTCTTTTAAAAAAAAATTAACTTCATCCATAAGTTTGTTTTTGGGTCAGTTTGTGATTTAACATATCTATATATGTCCATTGCTGTTAATAAAATGGTAGGTTTTAGACTAATGTAGCTGAACGGTGTAGTACTGGTACCTACTAGTGATATTTTCTCAATGCCTTCAGAAGGTTCTTTCTTATCACTAACCTAATCCTAATAATTGTTAGCAATTTCGTATATATTTTAATTCTATCTTCACTATTTCAGATATGAGCATCCTCTCTTGATAGAAGGAAGAGAGAAAAGTGAATGGGTTCTTCCAATCACCGTGCATGCACCTCCCTCTAGCGCTGCAACTGCTCAGAACCGAAATGATAGGCCTTTCTCTTTGGAGCCCTTGTGGATGCACAGCTGATGGTAATTCACCATGTTTGTTATTTACTCCAAAGTAGTAGAACTTCACGTTTTCCATGGTTTGTATCTCGCCCAGTTACGAGAAAAGAACAGTCAAGAATTGATTCCTACTAGATCTTGTTCGGCTGTCCTCCAAAATACCTCCATTTGTGCCATCTTTATTTTTCTTCAATCTTATCATGGATTTTCTTTTGGCAGTTGCAAATATAACTGTTGAAGGTTGGGGTTTGACTTCGCACCATAAAAAGAAAAAGATGAGTGTATTGAAACCATAGATACACAAATACTTCTAATGACTAGGCTTCAGTTTCCTCATAATAAGGTTGACAGAACAATAGTATTTGTCTAGTTAAAGTAGGACTCCTGATTCATTAGTGATTAGTGAAGTGATGAATATTGCTACAAGGGCTTCAAAATGGATGTGTTAAACGCACTCTAACTCCCTTAATTCAAGTGCATCTCAAGCTTCATATCAAGTCACACATCAATAGACTCTTTTGTAGCTACTTTCTGGGCTTCCTCACACCCTTGTTTATGTTTTTTGACGGGCTGTACTTTCAGATGAGTGAGACTGTAATTTGAACTCTTAATGTGCATCATGCAGGGGTCCAATCGATGGCTTGCTGCCAGGAATTTTTTTCAAGAAACTGATGTCCAGCAAATGCAAATGTTGAACAGAAGCACATGAAGAAGATGGCGACAGTGAGTGTAGACCATTGACGCTGCAGGTTGGCTGCTACATGTTGCAATTAAAAATGTGAATCTGGTTCTGGTTGTGCTAAAATGGTGTTCTTGGGTTCTCTCCAATTCAAAATGTGAATCTGGTTCTTTTTTTTTTTACTTTTAAAATGCAATAGAAACTCCCAACATTCTTTTGAAACACTTGAATGTGATTAAATTCTTTATATATATGCATATACAGCC 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ATGTTCGTTGTTATTACAGATGTGGTTCGATCAACGCTTCCTACCTGCATACCACCATCTTACAAGGGTGCCACTATTCGTTATATGTATTATGTTAAAAGCACGTTACTAGGACGATGGCTATCACAGGAAAATGGTCGATCTCATAAAGAGTCGCCGAAGGATCAAATAGAAATGGAAGCTCGGCTTCCATTACAAGTGTGGGTCACTCAGAAAACTAATGGCATGCTAATGGAAGAAGGTCAAAATGATGCCTTTCAAATGGATGTATTTTGGAAAGAGATGGAAAGTGATACTGATTGGATCAGAGCAAATGATATATATGATGGCACTGATGAAGGATATGATAGCTCAAGGGATGAGATCTCTTCTGTCTCGTCATACAATCCAATGAGAGAACCTTTTCATAGAACATTTGGAAGTTCACTGTCATTGCAGTCATCTGCTGGAAGATCTTCAATAAAGATTGCTCCTTTTATTGAGGGAGAGCGATTAAGTTTATCTTCTAATGTTGCACGTCCTAGGGTCTCTGTTGCTGAGGTCCTATATGAATCTGCGGATGTTGCATCACCTCAGAAGTCATTTGCAGCTGTCTCTCCCAGCCAGGTGTTGAACTTTGAGAAGAATCAGTCAACAGATGATGATGCTGGGGCAGCAACATCACCTAGGCCTAAAACTATTGAACCTGTAGCATCGGAAGGCTTTATTCGGGGAAGATCTTACAATATCAGGGTAGATGACCAAGTATTGCTTAGGTTTTGTCCAAAAAACTCTGATTCAACCTATTATTTTAGTGACATGATAGGTGGAACTCTAACCTTTTTCCATGAAGAAGGAACGAGGAGATGCCTTGAGCTGTCAATAACTTTGGAAACTTCAGAGACTGTATCTCGCCGTTTCATCCACCCTTCTCGGAGGAATTCTCCAACAATTGTGAAGGTTCAAAGTGATCACTATGAGGTTGTTGCTGATTTGATTCAGACAAGCTTTCTTTTCTCCATTCCCATGGATGGGCCGATGTCTTTTTCCACTCCACATGTATCTTTGCAGTGGGCACTTCGCTTTGAATTTTTTACCACTCCCAAGAATGTGGATTGGACCAGATATGAGCATCCTCTCTTGATAGAAGGAAGAGAGAAAAGTGAATGGGTTCTTCCAATCACCGTGCATGCACCTCCCTCTAGCGCTGCAACTGCTCAGAACCGAAATGATAGGCCTTTCTCTTTGGAGCCCTTGTGGATGCACAGCTGA MFVVITDVVRSTLPTCIPPSYKGATIRYMYYVKSTLLGRWLSQENGRSHKESPKDQIEMEARLPLQVWVTQKTNGMLMEEGQNDAFQMDVFWKEMESDTDWIRANDIYDGTDEGYDSSRDEISSVSSYNPMREPFHRTFGSSLSLQSSAGRSSIKIAPFIEGERLSLSSNVARPRVSVAEVLYESADVASPQKSFAAVSPSQVLNFEKNQSTDDDAGAATSPRPKTIEPVASEGFIRGRSYNIRVDDQVLLRFCPKNSDSTYYFSDMIGGTLTFFHEEGTRRCLELSITLETSETVSRRFIHPSRRNSPTIVKVQSDHYEVVADLIQTSFLFSIPMDGPMSFSTPHVSLQWALRFEFFTTPKNVDWTRYEHPLLIEGREKSEWVLPITVHAPPSSAATAQNRNDRPFSLEPLWMHS* Homology
BLAST of CSPI04G08900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L0L6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G099740 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 837.8 bits (2163), Expect = 2.0e-239 Identity = 416/416 (100.00%), Postives = 416/416 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0M0 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 5.4e-229 Identity = 399/409 (97.56%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0N5 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 5.4e-229 Identity = 399/409 (97.56%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1A1 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 5.4e-229 Identity = 399/409 (97.56%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L132 (uncharacterized protein LOC111499409 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 746.9 bits (1927), Expect = 4.6e-212 Identity = 368/404 (91.09%), Postives = 385/404 (95.30%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. NCBI nr
Match: XP_011653362.1 (uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >XP_031739927.1 uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >KGN53681.2 hypothetical protein Csa_014549 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 825.5 bits (2131), Expect = 2.1e-235 Identity = 409/409 (100.00%), Postives = 409/409 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. NCBI nr
Match: XP_008455604.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016901787.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 1.1e-228 Identity = 399/409 (97.56%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. NCBI nr
Match: XP_008455606.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 1.1e-228 Identity = 399/409 (97.56%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. NCBI nr
Match: XP_016901788.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X5 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 1.1e-228 Identity = 399/409 (97.56%), Postives = 401/409 (98.04%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. NCBI nr
Match: XP_038904900.1 (uncharacterized protein LOC120091119 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 779.2 bits (2011), Expect = 1.7e-221 Identity = 387/415 (93.25%), Postives = 398/415 (95.90%), Query Frame = 0
BLAST of CSPI04G08900 vs. TAIR 10
Match: AT1G50120.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rgp1 (InterPro:IPR014848), Immunoglobulin E-set (InterPro:IPR014756); Has 144 Blast hits to 140 proteins in 61 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 86; Fungi - 10; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 516.9 bits (1330), Expect = 1.5e-146 Identity = 266/419 (63.48%), Postives = 321/419 (76.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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