CSPI02G10820 (gene) Cucumber (PI 183967) v1

Overview
NameCSPI02G10820
Typegene
OrganismCucumis sativus var. hardwickii cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr2: 11072638 .. 11077980 (+)
RNA-Seq ExpressionCSPI02G10820
SyntenyCSPI02G10820
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGGGTAGAAGCGAATTCCATCTTGTACCCTATGTCCCTAGCTATCCACCCGATCTTACCCCTAAAATGGGAGGTTTATTGGGTCAGCGTCATTAAGCTGCCCTCACATATGCAGATCTAAGGATAATTCCATATGAACAGAAGTTCATAATTAGCTTAGGATTAAGATTAAGTTACATTGGTTGTCTATAAACAAAATAGTTGGTTTTATTAAAGTCAACGGTGTTATAACCTAAAAGCGATTATTTCTATAGTTCCAGTCTTATGTAAACTCTTTATATAAGATGCTTCCACTTTCATATCTCTACATGAACGATTTAGTATGATATCGTTTGTACTGACTACAAAGTGGGTCGCATCTATAGTGTTTCCAGTATAACGTGTCCAACCGTATTCGTATATTATAGACTATTTAGGCTATATACTCAAACTTGATCCACGTTTATGTCTCTACATAAAGTTCAAGTTTTACTCAATAATAGCCTTAAGACCTTTGTTTATTAGCTTTAAGATTATAGTATCAATAACGATTTTATTGAATAGAATATGATTACAAACTATGAGTTTTAGGACATAAATTCCAACACAACTAACTTTTCATACGATCGTTTAACTTCCTACACGATCATTTAACTAAATAGTCCTTCAAAATTTAATAAAAACAGAATGATAATGATTTTGAACAAATCATTCAAATATTATAACAAAATTAAAGCCGTTAATCTACATATTGGCAAGAAACAATAGTACCCCACCTCCCCAAACATCCTCCACAAGCAAACAAGATCAAAACAAGAAGTCAACGGTGATAAGCTTTTGTTTCTCTCTCTAAACTATGAATCAACTAAATGAGAGAGAAGTAAAGAGAGAATCAAACCAATGTGACGCTTACAGTGACGACGGACTAGAGAACAAGAAGCCATAGAAAGGAATTAATTATAGGTTAAATAAGGAATGATTCAACCATTGAGAGAAGAAGAAAAAATGTAAAAATAAAATTAAAAAAGAAAAAAAGAAGAAGAAGAGAAAAAAAAGATATGGTTGATTGATGAAGGAAGAACATAGATGTTATGGGAAGGAATCACAAACCCTTGATTCTTAGCGATTGTAAATCCTCCTCTTGAGTTGAATAATAAACCCCGAGAAATATATTTTTCAGGATAAAAAAATATACCCATCAACCAAACGTGGGTTTTATAAGTCTATATTCATTCCCACTCTCTTTACCCACAAACCAAACGACCCCTTATAGAACATACATGTATTAATGTCTATCATCGATAGAATCTGAAATTTTGGTACATTTTGTAAATATTTTATTAAATTTGTCATATTTCAAAATGAAAAATTGCATCTGATGATAAATTTTTTTAGAAAAAGATAGTTCATAACACATTCTTTTTGTATATTGTAAAGATACAGGCTATCTACGTTTAAAGTTGCAATTTTTACAAATTTTAAAAAATAGAACGATATGGGTCGGACTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTATTTTTTCAAACTATCCATTCACAGTTACCCTTTCCATTTCATTTTCTAAGTTTAACGAAGGCAAAAAAGAAAAAATCAGCAGCACCCATCTAGGTTTATCCCTTGCGCGCGTCGTCACACTCACTTTCGCGCCGCAGATCGCGTCTGCCCAGTCGTCGTCCGCCCGTCGCCGCAGGCAAGCTTTTGTATTTTCTTCTCCCTTTATTTCCTTCACCCTCACGGTTTTCTTCAACTACACAGCACCCCTGTCGTCCTCAGCTGTTGCCTCCCTGGCCGCCGCCGCCGGATTCGTGGTTGAGGGTAATGTTTATTTTTATATCGTGGGTTTTCTTAAAATTTCTTAAATACCCATTTAGTTTTTGTCTAAGTTTTAATATTCTCATAATTGTTTTGGATAATTAGGTTGATTTGAAGATTTTCAAGGTGTTGTCCAAGGTGATTAAGGTTGTTTTAGCAACTTTTTGGTAAGTATTAAGCTCCAAAATTCTTTTTAGATGTTTGGATTCACTTATGTTTCTGTCTATCTTCTTTTTTGAGGATGCGAGGGTCTCTAAAATCTCAATTTAAAGAAGACTTCTACACTTTTTGACTGTAATCTTTACTCGTATTGCCAATTGAACTAAATATGACCACCAAATTTGGAGATTTTTTTGTACTAAAGTTCCTATAATTGGTAGAGTATTGCTCAACTTGAACTTTAAAGAAGGCTTTTACTATGTTTTTATACTTAAATAGATTGGAGATGTTTTTGTACTTTATTTAAGCCTGTGAGATAATATTATAACATATACATTTATTCATGCTTGTGTTGCTGAAACTTTGAAAGAGAGTGGACAAAATGGACACTTATAAGAGTTTGATGGGTCTTCTTAACTTTACAAGTGTTCATTCAAAAATAGATTTTGAGTTGAAGTCTTTTTAATTATAATTACTATGAGATACTACTACCTTCAAGTGATGAAAGAAATGAGGGAGACATTAATGAAGAATATGGAGGTTCAGTTTGTAAAATGGAGATGGATGAAGAATGTGATCGAGTTCCGTTTGTGAAATGGAGATAATTATTTTAGTTTAAATTGTGAGTCAAATTTTAGCAGCAACATTGTTCAAAGTAGGAATGGAAAGTCGATGTTGCTTTGCTAAAGGACACACGTAACATGTATCATGACTATGAACAAAATCAGAGAAGGAAAAAAATACTTGATAGATCCTTCATACTTGTCCCAAACGCTGACGCCAAACAGAATTGGACTTTACATACCAGAGCATGTCTTTCAATACATTTTGTAGAACCTTCATCTTTGTTCATGTGTGAAAACTGGAATGGAAAGGAAATAAAGGCGGTTGACAAGTTCAAACTTCCTCATTGTTCTCAATTTTAACGTGTTCTGAATGAGGCAATGATCATTAGAGAAGATAATGGAGTAATGTGGAAGGATCCTTAAGCAACGCACTAATGAATAACATATTATAGGCAAATTCTGTAATGAAAAATATATCACGCAAGCAAACATCTGTCTGGAAGATGATATCACCCATGAATTCAACTATAAACCAAGTCTGAAGAGGGAGAACTAACTAATTTATTTTGAGTAGGTCTAAGGTTAACAAATAAGGAATGATTGTAGTTTACATGATTGGACGCACCAGAGTCGAGAACCCATACAACATAATGATTATGCTTAGACATAAGAGTAGGGAGACATGTACCTACTACATGAGTGGTTTCGTTCTTGATGTTACTTGCAGATGAGATTGTAACATTTCAGAAGTTGTTAGTACTGATTACCGTTGAGGGGCACCGGAAAAGTTGATTGATTCGTCTTTGGACCATCATGATCCTTATCGAATCTAGTTTAGAAAGATGTTGTAGAGACAATTGCTTTATGATGAACAGATGAATTATTGTTGTTGAATTTGTATCCTGGTGGATAACCATGGAGTTCGTAACACTTACCAACAATATGACCCGTTATACCACAATTCAACGTCCTCCACTTTTCTTCTTGGATTTATCAGAGTTGCTGTGTTTTGTAATATCAGATCTTGCTGTGTTTTGTAATATCAGATGTTGCGATTAAAGTGATCACCTCAATTGACGAAGAGGAATATCCAATAGAAGGTTGTCTCTTCTCTTGAATTATCAACAAGAATACCTTGTTGATAGCTAGCAAAGGATCGGTCAAGAGAATTTGAGCACAAATTGAGCATGTGATTCATTCAGTCCCATGATAAAAATCATAACAAACTTAGAATCGAGAAACTCCAATAATTTCTTTAATCTGCCACATGTGCATTCATCAGGAGGCTGGTATTCCATAAGATTTTGCCAAATGGTGGTAGTTTTAGCATAGTAAGCTTCAACAAGAAGTACTTTGCAAAGTCATAACATTTCCTTTGATATACATTGTGCAATTGACATACATGAGGACCATTGGACCGATGATATCACTCCTTCAAACCTGCATCCATCTCTTTCGAAATTGAATTAATAATCAATGATGTGATGATAATGTTGGAAGACTCTCCTTTGATAGTCGGTTTTGAAATAGCTCCAGTGGTTAAACCTAATTAGTTCTTACCAGAAAGAGCCAGACATCGCCTTACTCCATGAGGAGTAATTACTGATCCAACAAGTGGTTGAGTAACAAGATTAGTAATCGGAGTAACTGAATAATGTAGAAGGTACAGATTTAATTGAACTTTAAGATTAGTTGCGAGTGATGAAATTGCAGAGGTTGCATTAGTGGTATTTTCTGCAGTAATCATGCTGAAGATCATGTCAAAGGTGAAGACGATCGATATGAAGAACAACAAAAGAACGGAGATGAAGATTTAAAAAAGAAATTAACTGGTCGAAGATTCAGCAGATATAATGTGGAAATGCTTTGATATCATGATGCCGTTGAATAAATTAGAAAATTAATTAACTGAGTAACCAAATACTAACAAAAATATATTAGCTGAACAGTCAGTTTGCAATCCCCTAATAATTCGGCCTTTTCTTTTCTGCTTCATTTTTTGTTGCACCACCGCTCATCTCTTTCTCTGGGCTTCTTTTCCCCTTTTGCAAGGGCATTCTAGGGTTCACGATTTCTGCAGACAAAATGTCCTCAATTGGAACATCCAAGGGAATTCTGGAGATCGCCAAGTTTGGGATTTATGTTACTATACCTATCGTTCTCATGTACACCTTTGCCAACAACAGCAAAAACCTGCAGAGATTCATGGGCAAAGTAACTTTCTACCTCCCACTCTCATACAATTATGTTTGTGGATCTGCTCTTAGTTTTATATGGACAGATTATTAACTATTATTTTCTTCTTATTTTTGGGTGGAGGTATCTTGTAATTAAGAGCATCTTTGGCTGTTCAATTCCCTTTCTTTTAGAATTTATAGGTAGCTGTGGGACTTTGCATAAATGACACAATAGGAAATAAATACACGCAGGCCATGTTACAATATTTTCTGGATATAATTAGCTCTAATTTTATTTATTTAATGCTTGTATCTCTAATGGAATAATGCACCTGAGTTGAGGGTTCAATGCAATACTGAACCCTAGAAGTTACTTGAAATGCACGTTGTTCGTGAAGTCAAGATTTATTTGAATTGATCTTCCTTTATCAGGATTCGTTGATGTTCCTTTATCAAGATTTATTTTAATTATCTAAGTTTTCTTATTAATAGATTCTCTTCTGATAGTCTTACATAGTGTATCCTCCCGAGGGACCAAGGCCTCCATCTCCGGAAGAAGTAAGAGAAATGGCACGCGAATTGGCTCGAAAGAACAACATTCGTTGATGATTTGTGGTCTTATATCTACTGCAATCCAG

mRNA sequence

ATGGGTAGAAGCGAATTCCATCTTGTACCCTATGTCCCTAGCTATCCACCCGATCTTACCCCTAAAATGGGAGGTTTATTGGTTACCCTTTCCATTTCATTTTCTAAGTTTAACGAAGGCAAAAAAGAAAAAATCAGCAGCACCCATCTAGGTTTATCCCTTGCGCGCGTCGTCACACTCACTTTCGCGCCGCAGATCGCGTCTGCCCAGTCGTCGTCCGCCCGTCGCCGCAGGCAAGCTTTTGTATTTTCTTCTCCCTTTATTTCCTTCACCCTCACGGTTTTCTTCAACTACACAGCACCCCTGTCGTCCTCAGCTGTTGCCTCCCTGGCCGCCGCCGCCGGATTCGTGGTTGAGGGTAATGTTGATTTGAAGATTTTCAAGGTGTTGTCCAAGGTGATTAAGGTTGTTTTAGCAACTTTTTGGGTTCACGATTTCTGCAGACAAAATGTCCTCAATTGGAACATCCAAGGGAATTCTGGAGATCGCCAAGTTTGGGATTTATGTTACTATACCTATCGTTCTCATGTACACCTTTGCCAACAACAGCAAAAACCTGCAGAGATTCATGGGCAAATCTTACATAGTGTATCCTCCCGAGGGACCAAGGCCTCCATCTCCGGAAGAAGTAAGAGAAATGGCACGCGAATTGGCTCGAAAGAACAACATTCGTTGATGATTTGTGGTCTTATATCTACTGCAATCCAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTAGAAGCGAATTCCATCTTGTACCCTATGTCCCTAGCTATCCACCCGATCTTACCCCTAAAATGGGAGGTTTATTGGTTACCCTTTCCATTTCATTTTCTAAGTTTAACGAAGGCAAAAAAGAAAAAATCAGCAGCACCCATCTAGGTTTATCCCTTGCGCGCGTCGTCACACTCACTTTCGCGCCGCAGATCGCGTCTGCCCAGTCGTCGTCCGCCCGTCGCCGCAGGCAAGCTTTTGTATTTTCTTCTCCCTTTATTTCCTTCACCCTCACGGTTTTCTTCAACTACACAGCACCCCTGTCGTCCTCAGCTGTTGCCTCCCTGGCCGCCGCCGCCGGATTCGTGGTTGAGGGTAATGTTGATTTGAAGATTTTCAAGGTGTTGTCCAAGGTGATTAAGGTTGTTTTAGCAACTTTTTGGGTTCACGATTTCTGCAGACAAAATGTCCTCAATTGGAACATCCAAGGGAATTCTGGAGATCGCCAAGTTTGGGATTTATGTTACTATACCTATCGTTCTCATGTACACCTTTGCCAACAACAGCAAAAACCTGCAGAGATTCATGGGCAAATCTTACATAGTGTATCCTCCCGAGGGACCAAGGCCTCCATCTCCGGAAGAAGTAAGAGAAATGGCACGCGAATTGGCTCGAAAGAACAACATTCGTTGATGATTTGTGGTCTTATATCTACTGCAATCCAG

Protein sequence

MGRSEFHLVPYVPSYPPDLTPKMGGLLVTLSISFSKFNEGKKEKISSTHLGLSLARVVTLTFAPQIASAQSSSARRRRQAFVFSSPFISFTLTVFFNYTAPLSSSAVASLAAAAGFVVEGNVDLKIFKVLSKVIKVVLATFWVHDFCRQNVLNWNIQGNSGDRQVWDLCYYTYRSHVHLCQQQQKPAEIHGQILHSVSSRGTKASISGRSKRNGTRIGSKEQHSLMICGLISTAIQ
Homology
[Close]
BLAST of CSPI02G10820 vs. NCBI nr
Match: KAE8651832.1 (hypothetical protein Csa_023611, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 2.1e-22
Identity = 49/51 (96.08%), Postives = 51/51 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 143 VHDFCRQNVLNWNIQGNSGDRQVWDLCYYTYRSHVHLCQQQQKPAEIHGQI 194
           VHDFCRQNVLNWNI+GNSGDRQVWDLCYYTYRSHVHLCQQQQKPAEIHGQ+
Sbjct: 4   VHDFCRQNVLNWNIEGNSGDRQVWDLCYYTYRSHVHLCQQQQKPAEIHGQM 54

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CSPI02G10820 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CSPI02G10820 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CSPI02G10820 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8651832.12.1e-2296.08hypothetical protein Csa_023611, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of CSPI02G10820 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CSPI02G10820.1CSPI02G10820.1mRNA