
Bhi09G000168 (gene) Wax gourd (B227) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGGATGAGTTTACCGAAATCGGTCTTCTTCCAAGAGAATCTATAGAGCAAGCTATAGATAAATACAAATACATACACATCGGATGCGTTCAAGTTGCCACTAGTCGTAAAAATGTATCGTATTTATTTCGTGCCAAATGTATGGGATTGGATTGGACGATTCCTAAGGCTCTTGGTGATATGTGTCCTCAAACGTATGAAGACATGCAATTACTTTTTGGAATCGTGGACATTAAAATCATATCGAGGCTTGTTAAGATGTCGAGGATTACTAAAGAACAGCTGCTTTGGTGTGAGGAGAAACTGAACAAGTTAGATATATCTAATGGAAAATTGCGGAGAGACCTGTCTCCTCTTCTTTTTCCATGTTAATTACTTCTTTTTCTGCTGCTGCACTGCATCGCAAAATTGTTGTGATTGTGATTATGTTTTATGTATTTGGATTATGGCTACACATAAGTCTGGTAATGGACCCTACTACTACTACTTTTATGATGAATATGAATTTTGGGGGCTTTCGAACTCCTTGTGTTTTATTGTTCCTTATGCGGGTCCTTTCAACTATCCAATCTTTCTGTTGCAATTTGGAAACTCACATCACAGTGTAAGAGATCAATGTTTTTTTTCCCTCATTTTAAACAATGTTCATCTCTTATGGTCACAGTTCGTCTCTTCTCTTTAGACAAACTAAAGACTCTTCTATTACCAATTCTCGCCTTGCTTTTTTACTGGCTAAATTATGGAAAGTCTTTCAAAAGTTTAAAAAATATCCCTAAATTTTCTAAATCAGTTCAAAAAGTATCCTTGCAGTTAGTATTGGACGAAATCTATTAGTGTTTTGTTTAAAAATATCAGTGCGGTTAGTAGATGAACACTAATCATTAGTAGATGGAAACAAATTGGATTGGACTATCATTATATAGGCTAAGTGTTTTGTTTCAAATGTTTAAAAATACCTATGCTGTCAATAGATGAACACAAATTGTTAATATTTGATTCCAATATCTTGAAATTTTTAAATGTTTCATTAATATTTTTAGCCTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCTATAGATAATATAGTGATCAATTTGCTTGAAATTTTATTCAGATAAAAAAAAAACCAAATTAAAAATAAATTGTATAGGTATTCTCTTTCATATAGTTCTCATTTGTCTAGTTTTTACATCAATTTTGTCACAATAAAATATAAACTAAAATTTCAAGTTAAACATAAAAGTTCTCAAAATTTCAAAAATAAAAAAATCTTCCAACAATAAAATAGCCAAACACCCTAACACATAATCAACTACGATTAGCCCATGGTGCTTCCGTTATTCACCTTTTTTTGTGGTAATAATCTGGTGGGATAAACAAAATGTTTTTCTTTTTTCTTTTTGAATATAAACAAAATGGTAAATAATTAACAAGGAGGAGAGTAAGATCGGAGAAAAAAAATAGAGAAAATAGAGAAATGATAGGTCATGAATTGAAGTAAGGGAGATAACTAAAATGAAAGAGGGAGGTGATGGGATGTAGATAAATTGTAAGAATATTTTTAATTTTTTGAAGTAAGGGTATTGATGCAACTTTAGAAAGTTTTTGCAACGAGGTATTGATAGTTTGTGTTCATATATTAACATTAAAGGTATTTTTTAATATATATATATATATATATATTAAATTTCAAGGTACTTTTGGAACTTTTAAGAGTTCATTGGTAGTTTTAAAACAAAACGCTCATAGTTTTCATCTAAAACTAACAATAATGATATTTTTTGAAAATTTTGAAACTTAAAAGAGAATTTTTTACATTTTTAAAATTTTCAAAAATTAAAAGGATATTTTTGATATAAAATATAAAATTTAAGGATATTTTGTATAATTTAGTCAACCGTTTTAACCGTAGTATAAAAGGAATGATTATTTGTAATTGCATTCTAGTGTTTTTGCATTTAACACTTGTAATCAAGTGGCCATAGGTTACATGTTTATGTCTAAACCTAAACCGTTATTTCTTGCTCAAGAGAGGATATTAGATACATCTATTGCCATGCTTCAACTGCCATGCTTTTTTAATTTTTTTTTGGAACATCCCTAGGTGAGATTAATTTCAGAGAAAAACAATAAAATAATGTCAAACAGGAACTTTTCTTTTAGTACAACAATCGAGATGTAGGAGATTAAAATTCTAATTGAACTACATGACAATATCATTCAATTAAACTCAGCTTTTAAAACAAACCACACAGACCAAATAACAAACACTGAATTATGCAAAATCAAACTATGAACTGAACTAAATATGAACCGAACCAAAAGTGAACCGAACCAGTTTGTTATACTCGAACCGAACCAGACCTAGATCTAATTTTAGGTCATCGTGAAATGCAGACTTGAAATTGCCAAAAAACAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAGAAAAACGAAGGAATCCTCACAAGACGACCACCACGAACAGGCGTTGCATAAACGCGAAGAAGCGGGCGACGCCGGCGAACAGGGGAGCGATTACCGGCGAACAGACGTTACAGAAACGTGCGAAGACCGGAGGTAGATCGTGGACTGACTGCAATCACATGCTTCTGGGTTTTCTTCGTGGCTGCAGGTTACCACACCTGTTACTGGTTACCTACGTTTCATTTCACCATGTCTTCAGCATCAACTGTTTCTCAATCTGTGTCACTTCCTGCTCCGCCTACTTCAAATTCTGTTGCTAATGGTTCTTCAATTCCCAATTTGATCCCTGCCCCATCTTTCCATAGTCACCAACTACTGCCTGGAACTCCCATGGTACCTGGGCCACCGGGAATGTCACCGTCGCTGCCAGTAGTGTCGACAACTCCGGCAGCTCTGTTTCCACCAAACGATTCTGCTTCCACTATCCCGGGACCCCATATGCATGCAACTCCTAACTCAATTAATCCTTCTTTACGTCCACAAATTTGTGGTTCGTATCCTTCTCTAACTCCTGTTGTTTCTCCACCTCATGCGATCTGGTTTCAGCCTCCTCAGTTGGGAGCCATGCCCAGGCCTCCCTTTCTGCCATACTCTGCTTCTTACCACGGCCCTCTTCCTTTTCCTGCTCGTGGAATGCCCCTTCCCTCTGTCCCATTGCCTGATCCTCAACCTCCCGGTGTTACTCCTGTTCAAGTTGCATCTGCCATTGCTGTGTCATCTGGTCATGGAAATCAGCTTAGTGGCAATTCGTTGATTCAGACAGACTCAAATCATCCTCAACTTGGTATGCCGTATGCTGTTAAATTATTATCTTTATATCATGGTAAAGCTATTTATACTTCTGTGATTTTATGTGCCTAAGCTACCGTTCTTCATTCATTGTATAATCATTTAACAGATAGCCAGAAACACGCTCAAGGTGTAGGGCAATCTGAGAACATCCCTTTAACTAAACACTCGGAGGATTGGACTGCTCACAAGACCGAGGCAGGAATAATCTATTACTATAATGCATTGACGGGAGAATCTACCTATGAAAAGCCTTCCGGTTTCAAAGGGGAGGTATTTTTCCAGAAGTTTTCTATTGTTTCGAATGCAAATAAGTTTCGTTTTATCTACTTGTTGTTTACCTGTAAATCTCTCTCCCTTTCTTCCACCCTCCCTCTCCACTTTTGCATCACACCATTAGTGCGTGTGTGTGTTGTTCTGGTTTCAGCAGCTTTTTGACCAATTCTTCTTCAGCATGAAGCTTTTGTGGAATATGGGCTGAGTAACCGGCTGAAATGAACAATTGTTGTCATTGTGGTTCATTATTGAACTTTATTATCATTTATTAATATGTGTGTGTATATAAACATATAGCAATTTGATGTAATTAAATTTGTTGCAGCCTGAAAATGTCATGGCGCAGCCAACATCAGTTTCAATGTAAGTGGCCTTATTAACCATGATGGAATGCGATTGTTCCATATAAAACTGAAACATTTTTACTTATTTTATTAGTCACTATCTAGTGAATGTGCTTATATTCCATTGTCTGTAGGTCAAACTTGTCTGGTACGGACTGGGTTTTGGTTACTATGGGTGATGGTAAAAAGTACTACTACAACAACAAGACAAAGGTATGCTCAAAGTTCATGTTTGGAAGTTTTCTTGTTTGAAATAAATTTATGGATACATGTCCCCGCTGTTAACAATTTGTGTATCGTGAGAAAATGATCCCCTGCTGTTAGTTTTCACAAGCTCTTCGAAATCGTGAGTTTGGATCCTAGTGAGGTGTGGTCCCTGGTTAGATTTCATGGGTTTCGATTTCAAAGATCTTTTTTTAATTATCCTATAGGTTCTTAGACACAAGTAGATAGTGTTGATGATAATTTAGAGGTTTACTTACGGTTTTGATTCCTTATTATTATTATTTTATAAGAGACAATTTCATTGATGTATGAAATTACAAAAGAGAGGGGGAAAGAAGCCCCGCAGCCAAAGGAGTTACAAAAGACATCTCCAATTGGTTAAAGGAGAATGAAACTATAACATTTGAAATGATTAGATAATTTACACCAAGAGATAGCAATGCTAAGCACATTATCAAAAAAGAGTTCATAGTGTTGAGCTTTGTTGTTGAAGAGACTTGTTTCGTCCAAGCTAGACCGACCATAAAAAGGCTCTAACAATATGTTTCCATAGGAGACCCTTTCTACCCTTGAAAGGATGATCTTCGAGAACGAGGGAGAGGAATTGGTTGATATCCGAAGGAAAGACCACATATCAATTAAAAGCATGAAGAATGTGATTCTAAAAGGTCCTTGAAAAAAGGCAGAACATGAATAGATGACTTTGAGATTCTGTGTCCTTTTTGCAAAGAGTGCATCAATTGGGAGACATCGCCAGAGAGAGATTGCGCGTTGAAGCTTGTCATGTGAGGACAACCCTATGTGATAACTCCCAAAGAAAGAATTTAATCTTTTTGGGGTAGTGGTCAGACCAAATACCATCGATGGGGCTTATCGAAGATA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MKDEFTEIGLLPRESIEQAIDKYKYIHIGCVQVATSRKNVSYLFRAKCMGLDWTIPKALGDMCPQTYEDMQLLFGIVDIKIISRLVKMSRITKEQLLWCEEKLNKRCINAKKRATPANRGAITGEQTLQKRAKTGGYHTCYWLPTFHFTMSSASTVSQSVSLPAPPTSNSVANGSSIPNLIPAPSFHSHQLLPGTPMVPGPPGMSPSLPVVSTTPAALFPPNDSASTIPGPHMHATPNSINPSLRPQICGSYPSLTPVVSPPHAIWFQPPQLGAMPRPPFLPYSASYHGPLPFPARGMPLPSVPLPDPQPPGVTPVQVASAIAVSSGHGNQLSGNSLIQTDSNHPQLDSQKHAQGVGQSENIPLTKHSEDWTAHKTEAGIIYYYNALTGESTYEKPSGFKGEPENVMAQPTSVSMSNLSGTDWVLVTMGDGKKYYYNNKTKISSWQIPNEVSELRQQNDEKTKEHSAPLPNNNALTDLGTSSISINTPAINTGGREATPLRMVGISGSSSALDLIKKKLQDSGTPVASSPISAPTVAQPDVNLLRDADATVKALQTENNKDKPKDADGDGNVSDSSSDSEDVDNGPTNEQLIIQFKEMLKERGVAPFSKWDKELPKIVFDPRFKAIPSYSARRSLFEHYVKTRAEEERKEKRAAQKAAMEGFKQLLDRASEDIDHTTSYQTFKKKWGNDPRFEALDRKDRENLLNERVLYLKKAAIEKAQALWAASTTSFKSMLQERGDINVNSRWFRVKDSLRDDPRYRSVKHEEREMLFNEYISELKAVEEEKQRESKARKEEQEKLKEREREWRKRKEREEQEMERVRLKVRKKEAVASFQALLVESIKDPQASWTESKVKLEKDPQGRASNPDLDSSDTEKLFREHVKMLQERCANEFRTLLSEAFTAEVVAQLSEDGKTVLNSWTMAKRILKPDPRYSKVPRKEREALWRRYADDTLRKQKLANDHKGEKHNDFKSRATIDAGKFPSKPRIHE Homology
BLAST of Bhi09G000168 vs. TAIR 10
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BLAST of Bhi09G000168 vs. TAIR 10
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BLAST of Bhi09G000168 vs. TAIR 10
Match: AT1G44910.2 (pre-mRNA-processing protein 40A ) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 2.4e-22 Identity = 192/754 (25.46%), Postives = 334/754 (44.30%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. TAIR 10
Match: AT3G19670.1 (pre-mRNA-processing protein 40B ) HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 1.9e-19 Identity = 149/617 (24.15%), Postives = 247/617 (40.03%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. TAIR 10
Match: AT3G20260.1 (Protein of unknown function (DUF1666) ) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 1.1e-09 Identity = 28/49 (57.14%), Postives = 40/49 (81.63%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT25 (Pre-mRNA-processing protein 40C OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRP40C PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 715.3 bits (1845), Expect = 9.5e-205 Identity = 428/824 (51.94%), Postives = 567/824 (68.81%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O14776 (Transcription elongation regulator 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TCERG1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 1.6e-47 Identity = 237/886 (26.75%), Postives = 389/886 (43.91%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CGF7 (Transcription elongation regulator 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tcerg1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 190.7 bits (483), Expect = 8.1e-47 Identity = 227/847 (26.80%), Postives = 372/847 (43.92%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B6EUA9 (Pre-mRNA-processing protein 40A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRP40A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 3.4e-21 Identity = 192/754 (25.46%), Postives = 334/754 (44.30%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NWY9 (Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRPF40B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 100.9 bits (250), Expect = 8.5e-20 Identity = 136/570 (23.86%), Postives = 238/570 (41.75%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHX0 (pre-mRNA-processing protein 40C OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500614 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1471.4 bits (3808), Expect = 0.0e+00 Identity = 778/846 (91.96%), Postives = 800/846 (94.56%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K978 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G447710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1465.3 bits (3792), Expect = 0.0e+00 Identity = 775/846 (91.61%), Postives = 799/846 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GNF1 (pre-mRNA-processing protein 40C OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456014 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1436.4 bits (3717), Expect = 0.0e+00 Identity = 757/848 (89.27%), Postives = 797/848 (93.99%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi09G000168 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JUS6 (pre-mRNA-processing protein 40C OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488550 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1423.3 bits (3683), Expect = 0.0e+00 Identity = 751/848 (88.56%), Postives = 794/848 (93.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Wax gourd (B227) v1
Date Performed: 2021-10-22 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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