Bhi08G000339 (gene) Wax gourd (B227) v1

Overview
NameBhi08G000339
Typegene
OrganismBenincasa hispida (Wax gourd (B227) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr8: 14159456 .. 14171871 (-)
RNA-Seq ExpressionBhi08G000339
SyntenyBhi08G000339
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTTTATGAGGATATGGCCCCATTGGATTGTGAGCCAAACATCATAATTCTGGATGAATTTGAGGAAACAGATACAAAAAGAACAAACGTTGCTTCTGTACTTGAACAACAGCATCATCCAGCATCAATTGAATCACAAGGTTTTTCTTCCTTTCCTTCTTTTCAAGCATGTCTTTGAGAATTCTGTTACACTGCAAGAATCGATATATTATTCGATGTCTTCAAGTCTTTTATAACGACGAAATATGTACTTTTGTTGTTAATACTTGTGGCGAATACCAATTTCATTGAGTAGAAGTATCTCCTGGAAAAATATTATGATGATGATTGTACATTAGCAACATGTTCTACCACATGGCAGCAGAAAAAAAAGGTGAAAAGTTTTATATCATTGTTGACAAAATATCACTACAATTGAAAATATGTTTAGTAACAACCCGTTGGTTGTTGGTAATGAACTATAAAACGTTGCCATTAAATTTTATATGTTGGTAAAGCCAGTGACCATAGTTAGCTTTGTCACAAAAGCAAGTGGTGATATGAAATAATCACTTAAACGATGGATGATGTCGAGCACTTTTAAGTCTTGTGCCAAACTGGATTCTTTGCTTTAGTTAGTACATATAATCTGTCACTAAGTCGGATTTGGACGACATTGTTTTTAAAGCGATGTGAAGGTGTAGCATAAAACATTGAAAGCATGTTGTGTCACGAACTTGAGAACGATATAGTTTCTTCTATAGTTCATTTTAACTTGAGAATGATGTGGTTTTTTCTATTGTATTTTAGCATTTCTTTAGGACTTTGTTGGGGTACAGAGTTTTTTCCATGAAGTCCCTTTTATTGTTTTCATTTCCATCGAGAATTTTGAGTTTGAGCTTGTTGGAAGTGTTGTTAGCTTCAGGGCTTTTCTTCCTTGTCGGAGTTTGATTTCTTCCTCGTTGGAGGGCATCAATGACATTGCGATTCTCATACATTTTTTGGTAAAATATCTCCTCTTGCATATAGCATATTCTTTGGATTTCAAAAATTGTTGATGAAAGAGTTGTTTTGAGTATATTTTAGCATTTCTTAAGGATATTTGTTGGAACTCAGAGCTTTTTCTTTTCTTTTCTTATTTTCTTTTTGTTTCCATTGAGATTTTCTTTGGAGTTTGCGCTTGCTGAAAGTTCCTTTAGCTTTAGGGCTTTTCTTCCTTGTCAAAGTTCGTTTTCTTCCTGGTCGGAGAGGATAAAAGAGGTTGGGATTCTTACACATTTTATTAAAATATCTCCCTTTGAGTATTACTTGGATTTCAAAAATTGTTGATGAAAGTGTTTGTTTGAGTGTATTTCAGCATTTCCTTTGGATATTTGTTGGAATTCAGAGTTATTTTTTTTTTTTCATTCTTGTTTTCTTGTTTTTTTTCCATCATGCTTTATCGGAGTTTGTGCTCGTTGGGAGTTGTATTAGCTTCAAGCCTTTTTTTAATGAAAGATAGATGGAATGTAAGCTAACCCAAGCAAATGATATAATGCTCCTGACAAAGGTAGTAACAATGATAATAACAGAAAAGAAACGAGAATAGACACAAGAAAATGCAGTGTAACCACACCTATGTCTGGGAGGCTTTTAGCCTGAATGAAAGAGTTTCACTAGTGATGATAAGCGTTTACAGAGTAACAAATAGCTAATAGTTACACTATCTAGTTTTACATACAGCTAACTACTAGTGGGCAAGTTAGATTCCCCCTAACTATAATGCTTTTTGTAGATGAGTCTATAGATTCTGGCTCCCTCTAATCTGATATCGTCTTGCATAAAATTCACCACTCTTTTCACCATCTAGTTGAAACCACTCAACTAGTTCTTCATAAAAATTGAATGAATCCGAACAAGGTTACTCATGCAATGTAGCAACTTAGACAGATCAATGTCTTCAATATCGAAGCACACCACGACCACCTTTTTACCATCAAAACTTTTCTTTTAAAAGTCAAAAGTGGCTTACCCTAACCATCAACAAACAAGAGAAATATATCAAACCCAAAGGAAAAAAACCCCACATTCATAAGGAAAGAATGCAATGGCCAAAAAAAGGCAAGTAGACTCAACCAAAACTTGCAACAAATAAGGAAAAAGTATTCACCAATCATACCGGTACATGAAGCCAAAGACAAAATAAACAACAAGAGGGATAAAAGAAAATATAAATGCTAACAGTAACAATAAGCTCCCTCTTCGGCAAAAGATTTTCTTTTATCGGCAAACCAAACAACAATCAACACCAAACAAAAACCAACCAATACTTAAAAGAAGCTAACAAAATCAACCAACAACTAAACAATCAGCCAACCACCAAACCAACAACCCACAAACAGCCAATAAACACTCTATCCCTTTTGCTAGTAAGAAAATAAGTCAGAGCTCGGAGCAGGAGGCTGAGATGTAGAGGCACCGTCAATATGAGGCAACGACATGCTCAAAAAATGGACAAGGGCATCAATCTCAGACCTTCGATAAGTCAATTCCTGAATAACAATACTCAAAGTACGAGATTCAGCTGATAGAATATGAAAAATGCGCATGCCAAGCTCAGTATGAATCAACAATCCACCCTTAGGGACTTGAAGATCCTCAGGGAGAGAAATGTCAGTAGCTTTAGGATGGATATTATGAACCTTGGAAGCATGGGCACTTCATTTTGGATGAAGTATCAGTATCAGACACGTGTCCGACACCGACACACTTCCTTAGACACGTGTCAAACACGTAATTTTACGTGTCTCTCTCTCTCTTTTAATTAATCAGACATGCCAGATTTGGACACACTGAGGGACACGTTTTGATTTTTTGTTTTCACTTGGTTGAAATAAGCCCAAACCCATTTTATTATTTTAGTATGAAAAGAAATTGTAGCTACTCGAGAAACTAAAAAATTATACCCTACAGAAGTGCTACAATCAGAACAACCTGTCAGCATCCCCCATATAGTAGACCTACCTCCTGTTTTTTCTTCCACTGATAAGTCTCCTCATTGTACCTCAACTGATAGTCTTTTTCTCAGTGGAACTAGAGATGTCTACAGGGCGAGGCGAGGTCGGGGATGCCATTCCCTATCCCCATTCCCACTCCCTATTTCATTCTCCATCCCTGTGAAATTTTCCATGAGGATCGGGGTGGGGATTCCTTGCGGGGAATTTGCAGGGACCAGGTTCGAATTTTTCTCCGTTACCTTTTTTGTTTTTTGTAAAAAACCAATTAATTTAAATCACTAATGTGAGCAAATTTTAATTAAATAATTAACTTCATCACTAAATTGTTTATTATGGTTAGTTTTACATGAAAATTTGAATTTAAAGATAAATTACTCAAATTTTGGCCTAAAAAAACTAATTAATTTTTTTTAGTAGAAAGAAATAAACATAAATCAAATTATTCACATATATAATCTAAATTTAAATATTCAATTTAAACATATACATTATTTTTCCCAATAAATAATCAAATTTGAAATTTAAATGTAATATTTATATAATAATAATAATAACATAGCCTTAGATAACTATACTAAATAAATAAGTAGAAGCTAATCGAGGCGGGGACGGGGAATTGGGGTAGGGTAGGGTGGGGCGGGGACGACTGTCCCTATTTAGCTCACGAGGATTTTTTCCCCATCCTCCCCTTGTTCCCCGCCTAATAGGGGAATCCCTGCGAGGCCCCGTCCTCGTGAGAAATTGGACATCTCTAAGTGGAACCCTCTTATGCTTTGGCCTCTTGCTCTTCCATGACACCCAACCTTTTACTCACTGGTTCATCCAACCAACCTCCTCTAGAAGCTTTGACCCAGCCTCCCATTGTCACATTGACCTACCAAACCTCTCCGCAATTTCAAAATACTCACCCAAGAAGCTTATCATTAATCACAAGCAAACTAGTTTCATCTTAGGCACAAAACATTTTACAACCATAAAGTGTAAGGTTATATTTTTTTTAACCATCCACTGATGAATTTAGTATAGGCTCTGGGGGAGGGGGGAGGTCGAGCCCCCCTTCAACTTTATGCTATATATATTATATTTATATTTATATAATTGACATAATATTAATGTCATTAGCTATTCTAGTGGTAAATCTGTCTTTTAGTCCCCTTTGAACCCAAGTTCAAGTTCCACTCCTTACATTTGTTTTTTAGATTATTCTTACTAAATTATAAAACCCCCTGTCAACAAAATTTTTGGATTTGCCACTCAACTCATCCATTCAATTTTCTATAATATATGGTATCTTAAAAGTATTCTTATGTTTAATATGTATGGTTAATTTATCTTGAAGTATTATCACATATATTATTTTTTAAAAAAATAAAAAAAATATAATGTGTCCCATATGTAATGTATCATGTGCTACATTTCTAGAAATGGGCGTGTCGCCACGTTGTATCGTGTTGTGTCAGGTGTCCGTGTCCGTGCTTCTTAGTTATGAACAATGTCAGACACATAAGAATCCTAAAAGATCTTATAGTTAAGATTAAGAACCTTGGGCTAAGGATTAGGAGCATCACTTAGACCAAGATAGTAAGACATTGAGATAACAAAATACAAGGCAGTAAACGTGGAAAATAGAAAGAAAACTTGATAACAAACGAGTCAACATGGCAAAGTAGTTGATTGTACACAAACGCACCAAAATTAAAGGTAAACAGAGTCCCAATCTCATAAAGAAAGCTTGTAAGAGTAGGTGAAAGACTAGAACCATGTGTCGAGAGACACACCAATTGGCAATGCCAACCCTGAAAACAACGTACTTCACACTAAGAGCTGCAATAGATAACTGACCAAACTGAGACCAAATAGTTCTCGTGCCTCTAGTGAGTTCAGAAACAAGAACTTAAGTAGAGGGATGAGGCCTAAGAAGCACGGACACGGACATGCGACTCAACACGATAAGACACGGTGACTCACCTATTTCTAGAAATGTAGGACACGACACGTTGGGGACACACGCGCGCGCGCGCGC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CTTTAAGTTTTGTCTCGTTTTAGTCCCTAGATTTAAACTTGTTACAATTTCACTCTTGATATTTGAGATTTGTTTCAACTTGGTCTTTAGGTTTCACTGAATATTGACAGTTAATCTTTGGTGTTTATGTGTATTAATTAATTTAATTTATAATTTTTTTAAAATTAACTAATAAGCATTATCATAAAAGATGGAAAATGAGTTTTAGTGAAAGATTGAGGTTAAATGTGAAAATTTTGAAATTTAGAGACCATATTGAAACAAAACTAAAATCTTAAGGGTGAAACTATAACATTTTGAAATTGAACTCAAAATTTATGGACTAAAAGTGTAACATTTTGAAACTTAGGGACCAAATAGAAACTAAAACCAAAATCTAGTGACAAAAAAATGTTTTCCCTAGAAAATATTAGTTCTTACTTCTGCAAATTTCAATGTTTTATAAATTTGTTGTGTTGTGTAAGTAGGAAAATATGTTGATGTTAAGGAAAGTTGAAAAACATAAGACTGATGAAGAAATTATAGTTATGGTTCTTGGAAAGAGGTCATCATACATGAACGGATTCGGATATGGACCAAAACCACCACGAAGGAAAGAAGCATCGTCTTAAACACAAGAGTATGTCGAATCTCTTGAGACTTGTCTCACAAGGACCAAAGAATTATTAGCGGATCAACGTCAAGGGTATGAAAGAAAGTTTAACCAAATCAATGAAATTCTGAAGAAGTTTAGTGAAGGAAGGGATGTCAAGGACTGAAAAATTATTGCAGGATCAACACCAAGAGCAAGGGTATGAAAGAAAGTTTAGCCAAGTCAATACAATACTTAGTAAGGTAAAATTGGTCATTTTGTGATAATTATGTATGTTTGTAAATGTTGTTTATGATTCTGACTAGGGGTGGGGTGAGAGTTTTGAGATAATTATGGGTTGTGATTTTTAACTATGGTTGTAAAGACTTTGTTATGATTATAATAGGCCTCGTTTGGTAACTTTTTGATATCTGGTTTTTAAAAATTAAGCTATTTCTTTTTAATGTCTTACCATAATTTTCATCTTTCTTTGAGTAAAAAAAGTTGAATTCTTAGTCAAATTCTAAAAACAAAACAAGTTTTTAAAGTTATCTATTTTAGTTTTCAAAATTTGACTTGGTTTTTTAAAACATTGGTAAAAAGTAGATAATGTAAAGCAAGAAATTTAGAGGTGGAATGAGTATTTAGAGGCTTATTTTTAAAACTAAAAATTAAATGGTTATCAAACAAAATTTTAGTTGTCAAGATTTTGCATATGTGCGAGTTTGTGATTTTGGCTTATGTTGGGGTTGGGGGAGTGATTTGGTTGGAGTTTTTAGATAATTATGAGTTCCACAAGGATGCTAAATCTTAATAATTGTTGGATGTTAGATTTGAGTGGTTGCATGCCTCCTAATAATCATAAAGTAAAGTTATGATACTTTTGTTTGTCTCAGACCATCTAACTGTAAAAAACTGTTAGCTATATATACATTGTGACGATTAATGTCGTGCAAGCGTACACATCAAATTATAATATAGTTAAAATAATCTTGGTCGAGTATCGTTTTTAGGTATTTAATTTGATGATCTTTTAGTTATTCAGAGATCATTCTAATTTTAAGGTATCGACTATGATGTAAGTAAAGTAAATTAATCCTAAGAAAGCATTAATCATAAAAGTGATTAAGTATGAACATTTTTTTTCACAAAGAGATGCTTGAGGGTATAAATTTCATTAATGGATCTTCTAAACTCAATTGCTTTGACTCTTGAACCAATTAACACAAACACCTAGATCTAGAAGTCTTTCATCTGGATTGCCTCTCTTGAAGTAAATCTTTTCTTTTATTTAATTACTAATTACTAATATCTTGAAACTAGACAATTAAGCAAACATTAAAACCCTTAATCAACAATCTCTATCGTTTTTTTTTTATTATATCAGTATGTCCAATCAATAGTTTAGCATGCATGATCTAATATAAAACCCTCTTGTTACAGCAAGATAGTAAACCATAAAATCATTCAATTCAATTGCTGATCAACAATCAAAGCAAGAAGAATAGTCATGCCGAAAAGTGTTAATATCAATTGGAATTCAAGATCCACAAAAGTATTTAGCAATAATCTATAAAATTCATCTAGTAGATTAAGATAACATAACTTTCATAGATAGAATCATAGCTAGAATGCAAAAATACAAAGAAGAAAAAAAGACACGAAAGGGAAAGAGAGGTGTTATCCGGCATTTCGGTATTGTCTTAGAGGTTGAATCGACCCTCCAACATTCTTCGATTGACTCCAGCGCCAAAGAACCTTCGAAATATGTTCAAAACTCTCTCTCTGCCTTCAAAAGCCCAAGACTCGATGCTCAAAATGGCTAGAAACCCAAAGATTTCATAA

mRNA sequence

ATGGTTTATGAGGATATGGCCCCATTGGATTGTGAGCCAAACATCATAATTCTGGATGAATTTGAGGAAACAGATACAAAAAGAACAAACGTTGCTTCTGTACTTGAACAACAGCATCATCCAGCATCAATTGAATCACAAGGTAATCACGATGATTTTGTATACCCGAATACGACTAATGATATGACGAGAGCAGAGCGACGAGTACGTGGTGCTTCACGGGGAGTTCGCTTAAATAAGACTACTGCCACCATGGGAAGAATAAAAGTTACATGGACTCCAACACAAGGCAAACCAATTGGAGACATGGCAAGTCTGTTTAATGGAGAAATAGGAGTATTGGTGAGAAAATTCATCCCTTTAAAATATGAGAAGCAGAAAGACATTCCAAATGAACTTTATGATATTTTAACAGAACAATTGTTGAGGTTGAATCGACCCTCCAACATTCTTCGATTGACTCCAGCGCCAAAGAACCTTCGAAATATGTTCAAAACTCTCTCTCTGCCTTCAAAAGCCCAAGACTCGATGCTCAAAATGGCTAGAAACCCAAAGATTTCATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTTTATGAGGATATGGCCCCATTGGATTGTGAGCCAAACATCATAATTCTGGATGAATTTGAGGAAACAGATACAAAAAGAACAAACGTTGCTTCTGTACTTGAACAACAGCATCATCCAGCATCAATTGAATCACAAGGTAATCACGATGATTTTGTATACCCGAATACGACTAATGATATGACGAGAGCAGAGCGACGAGTACGTGGTGCTTCACGGGGAGTTCGCTTAAATAAGACTACTGCCACCATGGGAAGAATAAAAGTTACATGGACTCCAACACAAGGCAAACCAATTGGAGACATGGCAAGTCTGTTTAATGGAGAAATAGGAGTATTGGTGAGAAAATTCATCCCTTTAAAATATGAGAAGCAGAAAGACATTCCAAATGAACTTTATGATATTTTAACAGAACAATTGTTGAGGTTGAATCGACCCTCCAACATTCTTCGATTGACTCCAGCGCCAAAGAACCTTCGAAATATGTTCAAAACTCTCTCTCTGCCTTCAAAAGCCCAAGACTCGATGCTCAAAATGGCTAGAAACCCAAAGATTTCATAA

Protein sequence

MVYEDMAPLDCEPNIIILDEFEETDTKRTNVASVLEQQHHPASIESQGNHDDFVYPNTTNDMTRAERRVRGASRGVRLNKTTATMGRIKVTWTPTQGKPIGDMASLFNGEIGVLVRKFIPLKYEKQKDIPNELYDILTEQLLRLNRPSNILRLTPAPKNLRNMFKTLSLPSKAQDSMLKMARNPKIS
Homology
BLAST of Bhi08G000339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DXU5 (uncharacterized protein LOC111025525 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025525 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 7.5e-05
Identity = 29/77 (37.66%), Postives = 46/77 (59.74%), Query Frame = 0

Query: 68  RVRGASRGVRLNKTTATMGRIKVTWTPTQGKPIGDMASLFNGEIGVLVRKFIPLKYEKQK 127
           R +G +RG  L +    +G+IK+ WT  QG+P+G  ++ FN EIG L R +I  K  K+K
Sbjct: 16  RAQGETRGEFLLRVVNRVGKIKLEWTEQQGRPVGPGSASFNSEIGYLARNYIDAKRAKKK 75

Query: 128 DI----PNELYDILTEQ 141
           +I     N++  +L E+
Sbjct: 76  EITXLETNKIIQMLLEK 92

BLAST of Bhi08G000339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P6QNU2 (Putative transposase, Ptta/En/Spm, plant OS=Rosa chinensis OX=74649 GN=RchiOBHm_Chr4g0385011 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 8.3e-04
Identity = 37/125 (29.60%), Postives = 59/125 (47.20%), Query Frame = 0

Query: 24  TDTKRTNVASVLEQQHHPA------SIESQGNHDDFVYPNTTNDMTRAERRVRGASRGVR 83
           T+   T V      QH  A      ++ ++  +D+ +  +  +  T   ++VRG +RGV 
Sbjct: 72  TERTTTGVRISSRLQHQTANDQLLINVTTEEQNDNVMSASNQDPPTGPTKKVRGKTRGVN 131

Query: 84  LNKTTATM-GRIKVTWTPTQGKPIGDMASLFNGEIGVLVRKFIPLKYEKQKDIPNELYDI 142
            +K  + +  +I VT T   G+P G  A +   EIG  VR   PL  EK K IP    D 
Sbjct: 132 ADKVLSQLNAKIPVTLTEQNGRPTGPYAEMLANEIGFTVRNHAPLNVEKWKKIPKIDVDK 191

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1DXU57.5e-0537.66uncharacterized protein LOC111025525 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025... [more]
A0A2P6QNU28.3e-0429.60Putative transposase, Ptta/En/Spm, plant OS=Rosa chinensis OX=74649 GN=RchiOBHm_... [more]
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Bhi08M000339Bhi08M000339mRNA