Cp4.1LG15g03140 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGATTTTGATGACATGAGTATGGGTCAGTGTTAGATAGCGACTTTCCCTTACGCTCCCCATTTTTCTTTTATAAACATTTTTCTCTCTTCATTCTCTTTCACATTTCACTTTTTGCTCATCACCCAAATGGCTCAGGTTTCTCCTCTTCCTTTTTTTCTCTCTCACTCCTCTTTCTTTCTTCTATTACATTTCTGTTTTCTCTTCCATCTTCTGCAGAAAGTTGTGCTGAAGGTGATGACCATGACTGACGACAAGACGAAGCAGAAGGCAATCGAAGCTGCTGCCGACATCTACGGTTCGTCTCCGATNTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCCAAATCTTTCTTCCGAGTTTTCGATCTCTAAGTGTGGAAAATCGATCGACTCTGTTTGTTTGTTTGCTTGTTTGTTTGTTCTGTTGTCTGAAAAGAATCGGAAACTGAAAAACTATATGAAATCATCTGGAATCGGAAATTGAAAAACGATATGTGGAATCGTAAACTGAAAAACGATATGGAATCATTTGGAAACGGAAATTGAAAAACGATTTGAAATCATTTGGAATCGTAAACTGAAAAACGATATGAAATCATTTGGAATCGGAAATTGAAGAACGATATGAAATCATTTGGAAACGGAAATTGAAAAACGATTTGAAATCATTTGGAATCGTAAACTGAAAAACGATATGAAATCATTTGGAATCGGAAATTGAAGAACGATATGAAATCATTTGGAAACGGAAATTGAAAAACGATTTGAAATCATTTGGAATCGTAAACTGAAAAACGATATGAAATCATTTGGAATCGGAAATTGAAGAACGATATGAAATCATTCGGAAACGGAAATTGAAAAACGATTTGAAATCATTTGGAATCGTAAACTGAAAAACGATATGAAATCATTTGGAATCGGAAATTGAGGAACGATATGAAATCATTCGGAATCGGAAATTGAAAAACGATTTGAAATCATTTGGAATCGTAAACTGAAAAACGATATGAAATGATTTGGATGATTAGGTGTTGATTCGATCGCGGCGGATCTGAAGGATCAGAAACTGACGGTGATAGGATCGATGGACGCGGTGGCGATTGTGAAGAAATTGAAGAAAGTAGGTAAAGTGGACTTGATATCAGTCGGACCTGCAAAGGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGGAGAAAAAAGAGGAGAAAAAAGAGGAGAAAAAGGAAGAGAAAAAGGAAGAAAAAAAGTGAAAAAGTACAATTCCTTTCCCCCCCCTTCTTTCAATTTTGATTTTCCATACATTTAACGAATTTTAATTCAAATAAGTTCTTCTCAATTCATATCAAAATTACATGAAGAACAAACCTCTGTACCTACTTAATTTTTGTTTTCACAATCCCTTTCAAATTCATGCTCTGATTCACTCATAATGCAGCCATTTGTATTTCCAACATACGAACACAACAGACAATTTTCCCTAATTGGTATCCAAAATTTATGTAACAGATCGACATATTTTGTATTTTCATGTTTAGTGGGACCTACAAAGTTTGTTCCGTGGTTCCGTTGTTCCGTTGTTTCTTGATTTTTGCAATTTAAACATAATTTAATGACTAGATAAGAATTTGAAATGGGATATAATTTTGGTGGTGGTGGTTGAGCGGGGCATGGGAAAATGTTCAGAGCTATATGGCCAACAATGGTGGCGTACATAATTTTTTCATAATTCTTATTTTGAAGTTTTTGGCTCTTGATTTGTACTCATTCATTCCGGTGTGTTTCACTTTATTTCTCTCTTAAAGTCTTATTTTACGGCGAGGAATGAAGTTGTTCAAGTTGAAATTGATATCCTCATCTATAATAATAAATTCATAAATTTTATTTCCTTAATATGAGATTAATAGTATATGGATTATTGTGGTAAAACTATCCGGATGATTTGATCTAAATTATTCATGTGTAGACATGTGAGTGTGGTATCATATACAATAGGTTGGCATAATATGTTCTGTGAAATATTTATTTATTTATTATTATTATTATTTTTTTTGTAAATTAGTTGATTAAGAAGATTAATATTTGACTGTTAAAGATATTTAGTAATAAATTATAATTTACCATATATATTATATTTGATATTTTATTAAAAGGCAAATATTGTCTTCTTGCCATAGTTATTTTTCCATTTATTGTTATTTCCGTTCATTACTCTTTTCATATCCTTATAATTTATTTCATTATAAATAGATGGATTAAGCAAAAATTCTCATGGTATCAGAGTCTTTTTCGGTTTAACAACTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGGCTTCTGAATCCTCTACTATTTTTCTCCACCACCATTGTTTGCTTTAATATCGCAGGGGCAGTTGTCATGGCTGCCGTAAGCGGAGCCGATTGATTACTCCTTGACTCCACCCTATTGACCTCCAAAATCACCTTTCGCCATACTCTATACTTACTACCTCACATTTTCCAACCCAATCGGTTTTCCCTTAACCAACATAGCCTCTCTCATTTTCTTCCCAATCAACCCTTCATCCTTCACAAAAACCCTAATCTCATGATCGTCATCGGTGTTCTCTTCGAAAATATACAGAATCTCAATAAGCCCATCGACCTTCTGCAGAGATTTACCTTTGGAATCTGGGCGCCGCACTGACCTCTTCGCCAACCAAGTCGCCGACGCCCTTCTAGCCAAAATTGGCTCCTTCGCCCACTGTGGTGACTCTTTCGGCTTCAACATTGTCTTTGTCCCTTGCTCTAGGTTTCCCCTCCTACTTCTTGGGTTGACATATTCTCACCAGAGCCAAGGCAGCATCGTTGGTAGGCGACGATCCCTCTTCATGGGTTAGACATATTATCGTCGAAGCCAAGACAGCATCGTCGCTGGGCGACGATCCCTCTGCAGTTTTCGATGGCCAAGAAAGTGTATCTCTACGCCTCCTCTGAACCAGGTTGTTGACATCTTCATGAAGAGTGTTTCTCAACCTCTCTTTGAATTTTTCAGATCCAAGCTTCACGTTCGTTCAAATCCGACGCTTAACTTGCGGTGGGGTGTTAAGGATATTTAGTAATAAATTATAATTTACCATATATATCATATTTGATATTCTATTACAAGGCAAATATTTGCCTTCTTGCCATAGTTATCTTTCCATATTCTTATAATTTATTTGATTATAAATAGAGAACTTTCACACACCATTTGTGGTGGATTAAGCAAACATTCTCATTCACAAATAATCATATTTGACTTTATCTTTATTTTTTAGTTATAAAATCCTCCATGGGTGGAAGTGACGGTTGAAGTCAATTCAATAAATCTATCATTTTGGAACCTTTACTAAGGATTTGAAAATATAATCTCAAAATATAGAATTCACTTCTTCTTCCAATATAGAGTAAATAGATTAGTTACTTTCTCTAACTACAAATTTCGGGACTTGAATAATGAGAACTCATTTTCTGACTGGCTTGAGAATGACTTAGTTGATCATAAACATCTTGTGCATTAAAGGATCAATTACTTGGGGTATCAAATGTACTTACGAGGTTAAACGAATTTTTGACCTAAGTGTATTGATGAACAACTCGTGAATGGTCAACTTATATGTAATGATTATGTCTCTAGACACAATTTATCTTACCATACACAAAATTGCAACTCTAGGACTATTAACTAGAGTTAATGAATTAAAATGGATTTATTAAAAGGTTTAGTTAATGGAAGTAAAGATGTAGAAGGAAGTTTGGTAAATTCCATTAGTATAGGCATATAGGCATGTTATTGAAAATCTAAGATACTTTACTCATACTCATACTCATTTTACTCATACTCATTTAGATCTTTCATACCTTGTTAGAATGGTGAGTAGGAACATGGAGAAGTCTACTCTGATGCATTATCAATTGGTCAAACACATTCTCCATTGTGTGAAAGAAACCACAAGCTATGAGTTGAAGAATCAAAGAGGGCGAGAGACGAAAGAACAAGTCAGTTTTATCGATAGTGATTTAGTTAGAGACATTGACGATAGAAAAGTACTGCATGAATGATATTTTATATCAATGAAAACTTTAGCACTTAGCAATCTCTGAAGCAGCGAACCGTGACACTATCTTTTTGTGAACCCAAGTTTATGTCAGCAACTGTAACATCATGTCAAGTATTGCAATTGAGAAACTTGTGCGAAATAACCAAAAGTAAGCTAAAGGTAGTAACTCAATATATTAACAAAAATTTTGTGATTGCATCCATGGAGAACCTGGTATTTTGACGCATAAATTTTTTTATCAAAACTCGCTTCCAATTTCCCTGTTGGTGTGTCGAGAAGTAATAGATCGTTGTGTTGAGAAGTAATAGATCGTTGTGGAGTTTATGCCCTAGAGAGAAATGTGCAAATCACCTTGGCCTTAGCAAGAGTTAAATTTGCAAAGATGCAAGGGAGATTGTGAGTCAATAAGCTTGACCTCATACTTGATTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTCGATTCTTTAACTTGTGGAGCAAGTTTATGAAAATTATTAGTGCTTCTTCCCCTATAAATAATCTTCGGATGTATGCTTTATTCTCAACAAAAGAAATTAAGAAGCATAGTGCTTAAAGTTTTTTCTAGTACAAAGAAAGTTTCCCATCCCTTTCAAGTTAGTTTCTTTGTGTTTCAGTTATTTACTTCGGTGTGATTCAATCGAGGGTCAAAATCAATATCTGATGGAGTCCCACATTCGAAAATTATCTTAAAATTGCTCTAAGTTAATAATTTTATTCACTAAGTCAAGCTTATTAACTCACATCCTCCTCCATAAGCTTGACTTTGCTCGAGATTCTTCACTTCAAGCAACTCACGTATGTCTGCAAATTTAACCCTTGCTAGGGTCTTGGTGAGGATGTCCGCACACTGCTCTCTAGTTTCAACTTTGCTTGG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BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TrEMBL
Match: A0A0B0PEJ7_GOSAR (Putative late blight resistance R1B-12 OS=Gossypium arboreum GN=F383_27355 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 7.7e-17 Identity = 50/54 (92.59%), Postives = 53/54 (98.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2Q3H9_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_006G049200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 7.7e-17 Identity = 50/54 (92.59%), Postives = 53/54 (98.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TrEMBL
Match: A0A103YDM2_CYNCS (Heavy metal-associated domain, HMA OS=Cynara cardunculus var. scolymus GN=Ccrd_014477 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 1.0e-16 Identity = 49/54 (90.74%), Postives = 52/54 (96.30%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TrEMBL
Match: W9QN89_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_001022 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 1.3e-16 Identity = 49/54 (90.74%), Postives = 52/54 (96.30%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TAIR10
Match: AT5G23760.1 (AT5G23760.1 Copper transport protein family) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 1.1e-19 Identity = 49/54 (90.74%), Postives = 53/54 (98.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TAIR10
Match: AT1G01490.1 (AT1G01490.1 Heavy metal transport/detoxification superfamily protein ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 4.9e-07 Identity = 27/59 (45.76%), Postives = 43/59 (72.88%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. TAIR10
Match: AT1G28290.1 (AT1G28290.1 arabinogalactan protein 31) HSP 1 Score: 48.1 bits (113), Expect = 5.5e-06 Identity = 28/53 (52.83%), Postives = 31/53 (58.49%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. NCBI nr
Match: gi|449461247|ref|XP_004148353.1| (PREDICTED: FK506-binding nuclear protein [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 1.3e-17 Identity = 53/54 (98.15%), Postives = 54/54 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. NCBI nr
Match: gi|659131817|ref|XP_008465871.1| (PREDICTED: synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 1.7e-17 Identity = 52/54 (96.30%), Postives = 54/54 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. NCBI nr
Match: gi|763766919|gb|KJB34134.1| (hypothetical protein B456_006G049200 [Gossypium raimondii]) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 1.1e-16 Identity = 50/54 (92.59%), Postives = 53/54 (98.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. NCBI nr
Match: gi|728842363|gb|KHG21806.1| (Putative late blight resistance R1B-12 [Gossypium arboreum]) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 1.1e-16 Identity = 50/54 (92.59%), Postives = 53/54 (98.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g03140 vs. NCBI nr
Match: gi|1009122613|ref|XP_015878095.1| (PREDICTED: nucleolar protein 58 isoform X1 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 1.1e-16 Identity = 50/54 (92.59%), Postives = 53/54 (98.15%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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