Cp4.1LG14g05550 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)

NameCp4.1LG14g05550
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (Zucchini))
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG14 : 898320 .. 907946 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

AATTATTATATTTTTTGAAAATGGGGACGATGAAGAACTGAGCGATTTCCCGCCTTCGAGAGTTCTCTTCTTTTATATCTCGCCCGGTCGATGAAGCAAACTTCAGATATTTTTCACTTCGAAATTCTCCCACAACTCTCTGAAAATCCAGAGCTCTAGGGTTTCGACCTCCGAATCCGATTAACTAGCGTTTGAACAACCCTTCTAACAATCTCTGTTAGGGGTTCTTTCAGAATACACCGTTTTCGTTTTTCGAATTTGAGTGTAATCTGGGTTTTGAGCTTCTGTGACCTGTAGCTGTAGCCTTCCCTGTATCTGGGAACGATGCACATCAAGGAAATCTGTCTGGAGGGGTTCAAATCCTACGCGACGAGGACTGTTGTACCGGGTTTCGATCTTCACTTCAATGCAATTACTGGGCTTAACGGTTCTGGAAAGTCCAATATTCTCGATTCGATTTGCTTTGTTCTGGGAATTACCAATTTGCAGCAAGTTCGAGCTTCGAATCTTCAGGAGCTAGTGTACAAGCAGGGGCAAGCGGGTATTACCAAGGCAACTGTGTCGATTGTGTTCGATAATTCTGAGAGGAAACGGAGTCCACTTGGGTATGAGGATCACCAGGAGATTACAGTGACCAGACAGATTGTGGTTGGAGGGAGGAACAAGTATCTGATCAATGGGAAGCTTGCGCAGCCTGTTCAAGTTCAAAATCTTTTCCACTCAGTGCAGCTTAATGTTAATAATCCACACTTTCTGATTATGCAAGGCCGCATCACCAAAGTCTTAAATATGAAACCGCCGGAAATTTTATCTATGCTTGAAGAAGCTGCAGGGACAAGAATGTACGAGACAAAGAAAGAGGCTGCTTTGAAAACACTTGACAAGAAGCAAAATAAGGTAGATGAGATCAATAATCTTCTTGACAAGGAGATACTGCCTGCTCTAGAGAAGCTGAGGAAAGAACGAATGCAGTACATGCAATGGTCAAATGGCAATGCTGACTTAGATAGGCTTAAGAGGTTTTGCATAGCCTATGAATATGTGCAGGCTGAGAACGTAAGGGATAATGCAGTTAGTCAGGTAGAACAAATGAAGGCAAAGATTTCAGAGATTGATGACAGTACAGTAAGGATGCAGTCGGAAATAAAAGATTTGGAGACAAAAATCACCACATTGGTTGCAGAAAAGGAAGCCAATATGGGGGGTGAAGTAAAAACTTTAACAAATAAAGTAGATCTGCTATCTAATGATCTGATTAGGGAAACGACTGTACTGGAGCATACAGAAGACACTCTCAAGGGTGAAAAGGAAAATGCTGAAAAGATGATTAGTAATATAGAAGATTCAAAAAACTCTGTGGAAGAGAGAGCCTCTGCTGTTAGAAAGGCTGAAGAAGGAGCTTCTGATCTAAGAAAATCAGTTGAAAAGCTGACTAAGAACTTGGAAGATTATGAGAAAGAATATCAGGGAGTATCAGCTGGCAAGGGAAGTGGAGATGAGAAGAAATGTCTTGAAGATCAACTAGGCGATGCTAAAGTAGCTGTTGGGAGTGCTGAAACCGAACTAAAACAATTGAAAACAAAAATAAGCCATTGTGAAAAGGAACTTGCGGAGAAAACTAAGCAATTATTGTCGAAGCGTGAAGAAGCTATTTCTGTAGAGAATGAGTTAAGTACTAAAAGAAAAGATGTAGAGAATGTCAAGCTTTCGTTGGAGTCTCTCCCATATAAAGAGGGCCAGTTAGAAGCTTTACAAAAGGAACGTGCATTTGAAATGGAGAGAGTACAAAAGCTGAAAGATGAGATACGCAACCTTTCAGCACAATTAGCTAGCGTTGAATTCAAATACCGTGACCCTGTAAAAAATTTTGATAGGTCAAAGGTCAAAGGAGTAGTTGCAAAACTTATCAAAGTAAAAGATAGTTCTGCAATGACCGCCTTAGAGGTCACTGCCGGTGGAAAAATGTTTAATATAGTTGTAGACAATGAAAATACTGGAAAGCAGTTGCTTCAGAATGGTGATCTTCGGAGGAGAGTAACAATTATACCATTGAGTAAGATACAATCTAATCCCGTTCCCCCAAGAATTCAACATGCTGCTGTCAAATTGGTTGGGAGGGAGAATGCCGAACTTGCACTTTCTTTAGTTGGGTATGAAGAAGAATTGAAGAGTGCAATGGAGTATGTATTCGGTTCAACCTTTGTTTGCAAAAATATTGATGCTGCAAAAGAGGTTGCTTTTAATAGAGAAATTCACACCCCAAGTGTTACACTTGAAGGTGACATTTTTCAGCCGAGTGGTCTATTGACTGGAGGAAGTCGCAAGGGTGGTGGTCAATTGTTGAGGCAGCTTCATGATTTGAAGGGGATGGAAGCCGAACTTTCCATGCATCAGAAAAAATTATCTGACATTGAAGCAAAGATTTCAGAGATCCTTCCACTCCAAAAAAAGTTTGTGGACTTAAAGGCGAAGTTAGAGCTTAAGATGAATGATCTCTCGTTATTTCAGACAAGAGCAGAGCAAAATGAGCATCATAAGCTTGGTGAATTGGTGAAGAGGATTGAGCAGGAGCTTGAAGAAGCAAAAGCTACTGCCAAAGGAAAGGAACTTGAATATAAGGATTGTGTGAATGCTGTTTCGTTGCTTGAAAAATCAATCAAAGAGCATGACAATAATCGAGAAGGAAGGTTAAAAAACCTTGAGCAAATGATTAAGGCGACGAAATCTAAACTGCAGTCATGTTTAAAGGATTTAAAGGGGCATGAAAATGAAAGGGAGAAGCTTGTCATGGAAATGGAAGCTGTTGTACAAGAGAAGGCAACATTAGAGGCTCAATTAATTGCTATGAAAACACAAATTAACAATTTAACCTTGGAACTAGAAGAAAAGAGGGCCAAGGTACTTTCCATAAAAAGTAAAAATGATCTGGCTCAGTCTGAGCTCGATGCAGTCCGTTTGAAGATGAAGGAATGTGATTCCCAAATCAGTTGCATTGTCAAAGAGCAGCAAGAACTTCAACATAAACTTAGTGAAATGAGTATTGAGAAGAAGAAAATGGAAAATGATGTAAAACGATTACAGATGGAAAGGAAAGATTGTTCTGTTCGAGTGGACAAATTGGTTGAGAAACATGCATGGATTGCATCTGAGAAACAGCTATTTGGAAAAAGTGGAACTGATTATGATTTTGAATCACGTGATCCTTGTAAAGCTATAGAAGAACTCGAAAGACTGCAGGCTCAACAATCCAGCCTTGAGAAAAGGGTGAACAAGAAAGTAATGGCAATGTTTGAGAAAGCGGAGGATGAGTACAATGATTTGATGTCCAAGAAGAACATCATCGAGAACGATAAGTTTAAAATAAAGAAGGTGATCGAGGAATTAGATGAGAAAAAGAAGGAAACCTTGAAAGTGACTTGGGTAAAAGTTAACAGTGACTTCGGTTCCATTTTTTCTACATTACTACCTGGGACCACGTCTAAATTAGAGCCTCCTGAAGGTTGCAGCTTCTTAGATGGTCTTGAAGTACGAGTAGCATTTGGTGGTGTTTGGAAGCAGTCATTATCAGAATTAAGTGGAGGTCAACGATCTTTGTTGGCACTTTCTCTAATTTTAGCATTGCTTCTCTTCAAACCAGCTCCACTTTATATCCTGGACGAGGTTGATGCAGCCCTTGATTTGAGCCATACACAGAACATCGGGAGGATGATCAAGGCTCACTTCCCACATTCACAGTTCATCGTTGTTTCACTCAAAGAAGGCATGTTCAACAATGCCAATGTACTTTTCCGGACCAAATTCGTAGATGGTGTTTCCACTGTTCAGAGAACTGCTACTGCTAAGCAAAACAAGTGATCCTTATATTGTACAAGATCTTAGTCCCTTTTACTTCTTTCTTATTTCTGTGGAACAAATGATATTTTTATTGTTTTCCATCAAACCCATTACAATGATATGTAAATTATTGCCAGAAATTTCTGAACATATTAAACGAAAGTATATAGACGGCCGGCTTCATTGACTGAGTAACACAGGTTGGTGAATCTTCCTTGGAAAAATATAAAAGTTGGTGAAGACCGCTAGTGGTAAATCGCCAAACGGTCTCCGAGTCAAAAAGTGTTGTGGAGACCAAAACTTTGAAATCTGTTTCCTTGAAAGTGAAGCCCTCCCGTTAGCGTATTGGGTTAGCCAATATATATACCCACCAAAGTCACTCTAATCCCACACACAATTTTGAGCTTTGTACAATCACAAACCAATGGCTTCACCTACAGCTTTGGTTGCTTGGAAGAAGGTTGCCTTCTTGGCTTTCCTTCTTATTGCTGTCAGTGTTTCTGCAAGAGAACTTGCTGGGGCTAACGTTGTCACTCGCACAGCCCGTGAGATGGCGACGGAGCCCAATGGTGTGATAGGAGGCAGCAGATTAATAGCTCGACAATTGGATACCGCTTGGAGAGGACATTATTCTCCTCCTCCTCCTCGTCGTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCATTCCTCCTAAGGGCAAGGTCTTGAGGTCTGTTGGTGTATTTTATCTTTAGTTACCCTTCTTTGCCCTTTTGGTGGGTTTGGATAATAAGGATGTCTGATCTTCAAGTTTTATGAATTTCTTTTCCTGCAAGGTTGTGGCCTTTGAAGGCGTAGGTGTGTGTGTCGTTGGAGTTAAATTCAAGCTTAATAATCAGAGTTTAATAGCATACTACTCTTGTTGTTTACAGTGTTTCTATTTTGTAATTACTTATGTCAATGTCAAACACACAAAAATATGCAATTTTATCACTTAGAGTGAGCAGTGAATACAAAGAAAGAAAGAAATGGCCGACTTCCTTGACTTCACAGCCCAAGTCGACGGAGGTAAGTGGTAGGTAGGAAACAGTCGCACCACCTGCCAACCTTGGCACTCTTATTCTTCACCTTTTTCCTCTTCAAAATCTGAAGACGAGTAGCCTAAGGGGCATGAAATTACAACTCCTGCACTT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Coding sequence (CDS)

ATGGCTTCACCTACAGCTTTGGTTGCTTGGAAGAAGGTTGCCTTCTTGGCTTTCCTTCTTATTGCTGTCAGTGTTTCTGCAAGAGAACTTGCTGGGGCTAACGTTGTCACTCGCACAGCCCGTGAGATGGCGACGGAGCCCAATGGTGTGATAGGAGGCAGCAGATTAATAGCTCGACAATTGGATACCGCTTGGAGAGGACATTATTCTCCTCCTCCTCCTCGTCGTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCATTCCTCCTAA

Protein sequence

MASPTALVAWKKVAFLAFLLIAVSVSARELAGANVVTRTAREMATEPNGVIGGSRLIARQLDTAWRGHYSPPPPRRSPPPPPPPHSS
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG14g05550.1Cp4.1LG14g05550.1mRNA


The following gene(s) are paralogous to this gene:
GeneParalogueOrganismBlock
Cp4.1LG14g05550Cp4.1LG01g03830Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB234
The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cp4.1LG14g05550Silver-seed gourdcarcpeB0998
Cp4.1LG14g05550Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB245
Cp4.1LG14g05550Cucumber (Gy14) v1cgycpeB0673
Cp4.1LG14g05550Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB344
Cp4.1LG14g05550Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB715
Cp4.1LG14g05550Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpelsiB172
Cp4.1LG14g05550Watermelon (Charleston Gray)cpewcgB207
Cp4.1LG14g05550Watermelon (97103) v1cpewmB227
Cp4.1LG14g05550Melon (DHL92) v3.5.1cpemeB190
Cp4.1LG14g05550Cucumber (Gy14) v2cgybcpeB327
Cp4.1LG14g05550Melon (DHL92) v3.6.1cpemedB233