CsGy3G017490 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGACTATTTTACCCTTCTCCCACCGCTCACGTCGACTGGCCCATTTCCAAAGGAACCTTTCTCCTCCCGCCTTCTCTCCTTTCATCTCCGAACTCTAGAGCCCGATTTTTGTGTTTGAAAGTTTTATTCATCTTTTAAATTCTTCCATTCCTCCATGAAACTAAGTTGGATGGGTTCTTCTCATTGGTTTGCCTTCATTCTCATGAAGCAATTCTGAGGCGTTTCTGAAACTGTTGAACATCGAGTCGGAAGGAGAAGAATTCTTCTGCCGATGTTAAAATTTTAGCATTGAAGTATAAACTATGGCCGTAGATACCAATTTGAATTTCCAATCTCTGTTTGAGAGTTTGAAGATGGAAGGTCCATGGCTTCCTCCTAAAACTTGGGAGTCCTTCCCTTTACAAAGCCAACAAACTCAGCTCCCTTCCCGCTGTAGTGCTGCCATCTCCTCATCTTCAGTCTCTGTAACTTTTCTCGTCCTTTTTCTCTACCTTCATCCCTCTTTTCTTTTTGGAATTACAACCTGCTTGATCTTCTCACTTCTTTCTATCATACTTGTTGCATTTTAAAGTTTTGGCGTTGTCATTTTGTTAGTTTTGTTACTTACTGCAACTTTTGAGTATCAAATTGCTTATGCACTGATTTTTGAAGATTGAAACTACGATCGTTATGTTTCAGGAGGCGAGCTTGGTTAGATTGGCCATGAACGCACTACAAGGGCTGGAATCAGCACTTATCAGCGTGGAAAATGTATCTGCTGCCTTTTGTTCTGATCCTTCGGACAGGACATTCCATCAAATTCCATCTTTATGGAATCGTTCTTCAAGTACGCATGTTTTGGGAAAAATACTCAGGTCCTTTGGCTGTGTTGGATTTTTAGTTTTCCTGCTTCATAAATTTGTAGGCCACTTTACTGAAATGGGTATAGACGAAACATTTAATCAGATGAGTTATCAATCTAAGCTCGAACAATGCAAAAGTAACGATGACAGTAAAGTGATAGAGAGACAACGCTCCCAAAAGAGTCTTGTTAATCAGGCATTTGCAGTTGCTCTGAAAAAAATTTTAGAAGGATACACGTGTGCACTAGATTCGTTGCATGCTTCTGTAGGCTTGAGAAGAACGTCAAAAGTGCCTGATGCGCCTTTTATTGAATCATCAGTGGAAGGATGTCTTATGAGTGTGGTGCATTCTGAAGTAACATTGTTGGAGATGTACCTTCATACAAGGGAATTGAGAAATCAGATTGAAGTACTTGGAAATATATGCAACCTGCACAATATAGCCAATTGTTTCTCATTGTTACCATTTCAAGACCTAATTTGTAAAGCAACGTCTGAATTTTGTAATTTTCATAGGGGTGGAGACTTGCTTACATATTTATACACTCAACTACAGGTGAGCTAAACTAGAAAATATCCTTCTTCTGGTTTGTAATTTACTTTTCTCATTGAATTCTAAAAATTTATTATACAAGAATATTTCCTCTGGTGCCTATTAAGTCACTTGAAGGTTTAGAATAATTTTTGTATTAGGAGATACCTGAAAAAAGAGTAAGAATCAAAAGGTTATCCTGGCTTCTTGTTTGTCCTGTCCTGTCAGCAATCCCTTCCAAACAAGTGAGTTGGTACTGGAGGTGCGAGAAAAAAATGAATCCTTTAACAGTATTTGTGTGTACTATGATGAGAAAGACTGGGGTTGCAGTGGGCGGTTTTGTTGTCTGAAATTGATAGAAGGCAACCAAGATTAGATTTATCATGTGGTTAGTTGTTTCTAATAGGTTTATATGAATGACTGCAAAAGGGAGTTATTTGCTTTCTTATAGTTGTTTGTGCTTTGCAGAATATTGGTTGATGACCTTTAGAAGTTATTGACATATTACCTTTCACATGCTTTGGTTTAAGCAAGTCTGTAGTTTGAACCTTGGGCTTCTTGGCTTGGTATTTAGGCAATGTAGATGAGCTGTTGATTGGTATCTGACTTTAATGAAATGGTGAAGATGCTTGAATTTATGCCTTGAATACTTGGAATTGGATTTTAATCTCTCTTTATCTTGAGGAATCCATTGTATAAGTCATCATATTTACGGGATATTATGCCTCGTTTCTATTGATACCAACTTGGGGCATTCATAAAATTTGAGGCCGCTTTAGCTTCTTCATATGCATGTTTATGTAGTTTCAAAAAAAGAAAAAAATGCATATTTATGCTTATGCTTATTTAGTAAATGCATTTGCGTGCAACTGAATTTCTTATCCTTTCCCTTACAACTTTGCTCTTTTATACCATAAAATATTTTTTTATGGATCATATAATGAACATATTTTTGACCCATATTCTCTAGGTTGCTGATCCTGCACACTGTGCTGTACTCAAATTTCTGTTCCTCCACTCATGTGAACCATATTGTGCTTTTATTAGATCATGGATATACAAAGCTGAAGTTGTTGACCCTTATGCAGAGTTCGTAGTTGAATATGTTGACGTTAAAACACCTAATCTCAATACTGCTGGAATCTCCAGTTTCCCACTAGCATGTACAAGGGTAGTCTTATTACTATTGTTTTTTTGTAAATTTAAAAGCAGTTAGCAGTTTTATTTCGTCCTCTTGTGTGGTTTCCTTGGTTTGAGTTTGACATTCATTGTTCTGGACCATTCCCTGTAGGAGAGAGAAGGAGTTTCTATTCCTTGTTTTATGAAAGAATTATTGCTTCCTCTTCTCAGAGCTGGCCAGCAGCTTCAAGTATTAGTGAAACTACTTGAATTGGGTACTTCTGTTGCCACTGCAGACTGTACTTATGATGATTTTCTTCCTTGTTGGACTGGCTTTTCTAGCTATCATGGGAGCTATGAATCTGTAATCTCTTTCAGCAAAGAAGATGTGGAGTCCAGGGTTTCTGCAAGGAATATTTACTATGAAATGATGCAGAAAAAGCTCGATAATTTTTTGACTAAAATGGAGTTCAGATATGAGCAGGTAATCTGAATGCTACAATATGCATCTCGAATAAGAAATATGCAGATGCAAATAGCTCTCTGTTTTTCATGATACAACATTGTGCACAAATATTCTGGTTTTTATAACTTTGGATTAATGCGGTCCTTCCTCCATAATGTTGAGGAGGTGTTTCGAATGAGAGTTTGGGCTTTGGCAAGTTTGGCACAAGATGCCAAACCTACGTTAATCCCATGAGTCAGTCAAACCTGGTGTTTATTGGACAAACTCATCGGTTTCAATAGTACCCCAAATCTACTTTCTCAAAACTCACAACTCACAAATCGCTTTAGTTTTCCTAAATGTGGGCTTTTCAAACGTGCACTCCAACTATTGGTTTCTTAAATCTGGGCTTCCTTCCTAATTTTAAAATTTTGAATTCATGCTTTAAGTACCCTTTAAAGGACAGGTCGTGCCTCATGGAAAAGCTGATCATAGGTCAAAACCAGAGCCACAATTGTGAGTATCAACATAGTTTGTGTTAAAGCCAGAGCCACAATTGGCAATAGTCCTGCATCCCGTTTCTAGGTTCCTCTGTTTTAAGTAGTTGCTGGTGCTGCAATAAGGGTTCTTGGTCATGTTCTGCATTTTGTTATGAGAAATGCAAACAAAGTTTACCCTGGTAGCTTGATGGCAAGGGCTTGGGATGTTTGGAATTAACTTCATTCAAATTCTGATATTGAGAGATATTAAATCACCGATCAATCCAAAAATTTAAGTTGATGGAGTTGTGGCAAATTTAATCTTTTTTATCTTGTAGAAGGTTCATGAAGTGAATATTAAAGTTGAATGGAGAGGAAATGATGTTGGAGTTTGAACACAAGATCTAGACTTTGATACCTTGTTAAATCATCCATCAACCCTAAAAAGCGTGAACTAATTGGTTATGATTAATTTAATATTTTACAAATACTTCAACAAGTACTCAATAACTTAAATTCTTTGCTGTCTTCGACCCTTAGGTAGTCTTAGACTCTTGGGAAGGGTGAAACGTTTTGGAGGATTAATGAGGGGTGGGTAATGATGAGCATACTGATGCAAGAATTGAACTCCTGATGCCCTAATTATTGAAAACAATTGTCTAAATTTATAAATTTTGAATTGAGGGAAAATGGTTTTTGTTGGATCAGCTGTAGCCGGTAGGTAGTTCATGGTATTGTTTTTATAAGGGTATGTGTATTTATGTTTGTCTTCACCCTGCCATGTTACCCTGAGAATTATTCATAGAGCTTTTAACAACATAGGTTGTGGAACATGATGATAAAAGTAAGCTCCAAGATGTCTAACCTATGATCAATTTCTTCATTGCTCTTCCTATTAATATGTCATATATTTTGCAGTTCTACAACTTTGCTGCTGGTTGTGTTATTAATATCAGTCTTATGAATATTGTCCTTTAATAGGTGGCTCCAGATGATGCAGTATCTATGATCCTTGCTCATGTTGGAGGAAGCATAAGTGCACCTTTGTCAATTGAGTCTGGGAGTAGCATAGTTGTTCCAGAACCAGATAAAAGGAGCTCAATTATGTAATGTCTTTATTTAAAGGAGAGACAAAGTGCACACACCAATTTACGTGGAAACCCGAGTACTGGAAGAAAAACCACGATTGTTTGTTGTTATTAATTTTTAATGAATAATACAATAGGTACAAGGGAGAATAAATAGAGTATACAAGAGAATAAAAAAGGAAAAGATTCAGGAAATAAGGAAAATATTCCCACAATCTTTCCATAAATATTCTAGGATTCTAACAAGGAAAATAATTAGAAAATAAGGAAAGGATTCTAACAATCTTATATTGTTGGTTACTTCTCTAAGAGTGCTATGTGTCCATTGTATGGTAAAAGTACACAAGGCCTTGTGTGTAGACGCATATGCTCTGCTGTTCACACATGAAATATATTTTGGCACAAAATTTTAGGGCTTTGTGAGGCTGTTGCATAATCATCTCTGTTCATTGTTTCTCTCGTTTTATAAATCTTATTCAAGCTTTTGTT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BLAST of CsGy3G017490 vs. NCBI nr
Match: XP_008457080.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496848 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 469.9 bits (1208), Expect = 6.1e-129 Identity = 236/249 (94.78%), Postives = 239/249 (95.98%), Query Frame = 0
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BLAST of CsGy3G017490 vs. NCBI nr
Match: XP_022958553.1 (uncharacterized protein LOC111459753 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 9.5e-122 Identity = 222/249 (89.16%), Postives = 232/249 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017490 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy3G017490 vs. Swiss-Prot
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BLAST of CsGy3G017490 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8BKN5|GCP5_MOUSE (Gamma-tubulin complex component 5 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tubgcp5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 1.5e-06 Identity = 43/179 (24.02%), Postives = 87/179 (48.60%), Query Frame = 0
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BLAST of CsGy3G017490 vs. TrEMBL
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BLAST of CsGy3G017490 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1U8PHQ9|A0A1U8PHQ9_GOSHI (uncharacterized protein LOC107959243 isoform X2 OS=Gossypium hirsutum OX=3635 GN=LOC107959243 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 3.1e-81 Identity = 151/249 (60.64%), Postives = 191/249 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017490 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1U8PKA5|A0A1U8PKA5_GOSHI (uncharacterized protein LOC107959243 isoform X3 OS=Gossypium hirsutum OX=3635 GN=LOC107959243 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 3.1e-81 Identity = 151/249 (60.64%), Postives = 191/249 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017490 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1U8PHP3|A0A1U8PHP3_GOSHI (uncharacterized protein LOC107959243 isoform X1 OS=Gossypium hirsutum OX=3635 GN=LOC107959243 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 3.1e-81 Identity = 151/249 (60.64%), Postives = 191/249 (76.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |