CsGy1G004770 (gene) Cucumber (Gy14) v2 | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CsGy1G004770
Type	gene
Organism	Cucumis sativus (Cucumber (Gy14) v2)
Description	Uncharacterized protein
Location	Chr1 : 3127560 .. 3138180 (+)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGAGATGAAAAGAGAGGAGCACCTGGTGGTTGCTGCTGGTAAAGTGGTAGTGGTGGTGACAGAGGAGGATGAGGGCTGTTTCCGCGGTGTCGCTGCTGCTAATGCTTCCCTTCTTTCTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTGGGAGCCCAGCCTGCTGTCTCGAATTGAACTCGTGGACCTAAGGCCAGTTAGATACTTTTCGAGGCATTCATTGTTTTTTTCCCCATTATTTTAAATACATCAAATATTTAAACAATATTCCCCCCTCCCCTTAGTTTTCTATTTTTTTTTTATGCTTTCATCATTTCGTTGTGCTCAACATCTCTTATTTCTCTCCCCCGTCCTCAAATATCTAAATCACTAAAATTATTAAATTAATACTTCTTCCTCCCAATCTAACGAATTTAAATTTGTTTGAAGGAATGAATTACTACAGTTCAAATTAATTAAAATAGTTTGTATTTGAGATATATAATAGATGGATTAGAATAATTTATATTTGAAGTTTATAATAGTATGTGTTTGGTATGTAGATTATTTTGGTTTTATAAGAATAAACACGATGTCAATATCAAATTGAAAGTTTTAAATAATGTGTTATTGTAGCTAATTGGAGACTTCTAGATAGTATTTAGTATAACGAAATATGATTGTTATAGTTTTAGATAATCTTGTCCCAAATGGTCATGTGAAAATAAGCCCTTCTCACGATAGTACACACCTTTAAAATCAAGATGTGTTGGACATTTAGTTCACCAATAGGTTTTCAGGTTTAATATTAAATTTAATTCCAAACCGGTTGAAATTAGTGTTAATTTAGCTTCTAAACTTTTAAATTTATAAATTTAATTTGTTAACTTTGATATATGTGAAAGTTCATGAATTTGTTAGACATAAATTTAAAAGTTTTACGATCGATTATAAACATATAATTTTATTTTGTATAATATAGTTCTAAATAGTTTTTACTATGAAGAGATTTGAAACCAAGAAAAGAGAATCCGTGAGTGGTTTTTGTTTGAAAGGGATAAATTAATCAGTAATTAATTGCCTTCTCTCACTCGTACACATATAATCTTCCACTGCACTACCAACTACTAATCCATCCTCACATGACGTTTCCCTTCTATTTACCACTTTTTTTCCTATCGTTATTCTTGAACAAATCTATATATCTAACGGCACAAATTTTTGAATAATTCATCACAATTTCATATTGAATAGATTTTGTCCCTTCCATTGGGGCCAAAAATGGTCTGTCCTTGACATTACAATTTCAAATTAAATAGAACGACTCTTTTGACATGGAAGTAATTTTGATCATTTTCGTGTGTTCTCATGTCACTTAAGACAAAATCATTTGAATTTGAATCTTGATCCAAAATACTTGTTATAGGTAGAAAGTTTGTGAATCTTTCATAATGCACTTAATACAAAAACTAATATTATTGATAAGGGAATCAACATCAACTCACTTTGCCTCTTTTAGATGTCTGAAATTGAAATATAGAAAGAACGTAAGTATGTCTGGAGATGATATTAAAATGATAATTGTTTTAATTCTTTGGTGCATTTAAAATTATATAAATGATCCAAATAAGTCAAGGAGAAAGTTTTGTTTTCTATAATTAAAACCAAAATTGACATGCTTTTGACATTTAACCATGTTGTTTCCTATCACGTTGCAGAGGGAGAGTTTGGATTGGTAGTGGTTGATCGACCTCACCAAATTGTTGTGAAAGTTGAACGTGGATACTACTTGGAATAATTCCCTCACGATGTCTTAGTTGGCTTATTTACGAGTCTTTTAGATCTTTTCTTTGTGTAAGGTTTTAAAAGGATGAATGTTCTTCAAAATATTAAGATAATGATGCTAGAGTTATTTATAAAAGCACGAGGAAATGTTGTTCTTTTGATGAATTATAAGTTTTAAGGACTCTTCTTGAATGCGTGAAATGGTCAAGTTATATTTTGAAGTTGTGATCTCACCAAAATCAATGATATTTTGGATGGAATTCGTACCTTGATGCATATATAACATGCTTTGAGTGTATTTCTCTTTTTGTTTGCATCTCGAAATTACCGTTGCACACAACCTCTCTTAGGTTCCTAGTTGGTGTGCGGTTAGCCTCTACTTTTAAAAGATGACTTCAACTTTTTGCACTTCTAATGTTTGGCCTTTTTATGTTATTTTCTTTAAGAAAAAAAAATACTTTGAGGATGAAGGTGTTTCTTAAATAAAAGGACCGCTCGATACAAGAAGAAAAAAAATGTTACAGTAAAAGATGTAAACATTTAAGTTTATGGATGAAGTTTAGTATTTGTTATATATTTTAAACATTCTATAAGTACTTGAAATTAAGGAAAATTGCTAAAAACTAATTCAAAAATAAGTTCTTTAAAAAATAAATGAAATGCCTTATTTTATCCATTTGAGGAGTCAAAATAATATTTGAGAATACAAATCCTTGTTTTGCCCAAAAATGGACTTTTAGGGAACTCGAATTTTTGTCATAACCAGAATTTTCCAACAAAATTGATCTATTTAAAAAATGATCATAAGAAAATGTGTAAATATACTCTCAAAAGATAAAATATACTCTCAAAAGATAAGTGGGTACGGAAAGTCACGTTGTTGATTTTACCCATTTGAGGAGTGAAAATTATCCTTTTTACCTATAGGCTAGAAAGATATCGAAGATCTTATGTACCAAGATTGGTCAAGTTTGAGAGTCTATAGAGATAGGAGACCCATGGGCAAACAAAGAGAGCTAAAAAAATCCTATGAAGAACTTAGAGGGAGCTCTATGAGAGCCTAGAGAGACGAAAGTTCAACGATCCATGTGATAGCTCAAAAGGAGCTCTTAGAGCCTATGAGAAAGAGGGAGAGCTTTGAGAACACTTTGAGAGAGCCTATAGAGATCTTAAAGGATCCACAAGAGACAATAGGATCATGTGGAACTTAGAGGTAGCTTAGATGACACATGGTGATAGCATAAAGAAACCATGGGTAGTCTAATGGTAGTGTAAAGGACTCATAAGAGAGCTTAGAGGTAACTCAAAGACAAATAAAAAACCTAGCGGACGCTTATAAAACCCATGAAAAGCCTAAAGGCATCTTGATAAGTACCCACAAAGGTTACAATTGTTGTGAGGACCCCTTAAGACCTATGAAGGACTTATGCGTCAGATGGAGATCCCGATGAAAGATTTTTGCAGAACCCATGAAGGACTTAAAAACCATATGGAGAACCTTGGAGAACCCAAGAAAGTCATTTACAAGACCCACAAAGGATTCAGGAGTCACATTATGCGAATTTTGGAGGATCTATGGAAAGACCTCTACATGACCCATGGAGGACTTAGAGGTCTAATAGAGAAATAAATCCTTCATACGAAGACTTCTATATGATTTTTGGAGGACTTAGCACTCCCATAAAGGACATGTGGATGACCTCCTGTAGGACCCATAAAAGACCTTAGAGGGATTAAGTTTGGAGCCGTCTAAATTCTCAATGAACGATCCATAAAGGAAACGTTAAGGAATTGGATGAACCACTCATGCATCCATTACAACCTCAAATTGTGATAGTATAACCACTCAACAAGTATTAATTTAATGGTGTGAAAATTTAAATATGGACAATTATGAACCATGCATTAGAGATACATCACTAGTGCGATACTAACTTGAGTGTTGAAGTGTGTATAGCTTGACACCACACTAGTGCTCGATTTCATTTATCTTGTAGGCACTTGAACTACTTTATCTCATAATACAAATTCACGATTGATCTATTTTTTTGGCATCAATACCCATGAAAATTTCCCCTCCTTTATCTTCTCCCTATAGCTTCTCTAAATTATTATCTCCTCCTCTCTCAGTTTAACTCTCCTTCCTAGCTTCACAACACATTTTTTTTCTCCTTCCGTGATTAGTAGTGTGTGGTTCTTAAAAAACTACACATGATATCATTAAATTTGACTACTTCAATAAGTGCTCTTGTAATGAAGATTAAAAGCATACACACAACAAGTGGTTATTTAGTTGAAACAAGTGGTATCAAGATAGAAATACAATGGACAAGTAGGCTCCTCACCAAGTAGGTAAAAGCAAAATAAAAGGAAAAATTCAATGGTTATTTTTGTTCATTTATTTTCCCCCCTATCTAGGTAATGCAACAATGTTTTGCTTTAGGATGATATTTGTTTATTTGAATGTTTTCATCTTTTCATACGGAACAATGTCTATATTCGAGTTATATGATTTTTTTTTTTTTTACATTTTGGTATTATAGTGAGGTTGGTATTTTTTTTTCTTTTTCTTTAATATTCAGTTTATCTCGTAGTCAATTTGTATGAAGGACAAAAAATGTTTTAATTGAAGTCGATGATATAGAAGAAAAAGTAGAGTTGAAAGAGCAATTTCATAAGACATTATTTTAAAAAAGGGTAACAATAATGTTGTCAGTGTGAGCAATTGTTTTTTTATTTTGTACGAAGCAATTTTAGTTAAATATGATACAAAGATTAGAATGGTTAACATTGCCATTCATACAACGTTGCTTTAGAAATGTTTGAAACTTGAATCAAAGATTCTCTGCCAATTGCAACTAATGATATTGCTGCATTAGATATGTGATATTTTACCAAGTTTTAAGTCTAAAAAGTATGCCAAGTTATTAAAAAAGAAACGGAAATAATTAATACCGTAATTAAACTGTTACCGAACTAAATTAAATAGTTAGATGAGGATTAAAAAGAAAAAGGATTGGGTAATGTGAAAGATTAAGGAAAGGGAGGGTGGAAGCGTAAAAGGAAAGAAAGGGCGAAGAAGTGCCCTTGCAAAGGCCGCTACGGCAGAGCGTAGGTGAGGCATCAAACATCTTCAAACGACAAATCTCTTTCAGTTTCATAGTGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCAAAAAAAACCCAGGCTAAGCCTTAATCGGCTAACCCAACCCCTCGACATCCGACCTTAAAACGCCCCCTTCCCCGTCATTTTTTCTAAACCCCCCCTTATTATCGCAATCCCATCCCATTCCCCTCTTCCCATTTTCCGCTCTTCTTCTCTGTCCACTCCCTTTCTCTATCTCTCTGCTTCCTTCACAATGAGAAGATTTGGGGCGGTGCCTTTCATCGCCTTACTTGTTCTCCTCTGCGGATCTGTTCCGGTGAGATCTGATGGATCCGATCATCGCTACAAAGATGGAGATCCTGTTCCTCTCTATGCTAACAAAGTTGGCCCATTTCATAATCCCAGGTAATTCTTCTACTTCACTATTGTTCATTCTTTCATAAGATCTACCATTTTATCACTGTTCTCTCTTTCCTTTAATTTCTTCTCTTCACTTCTAGCTCCTATCTTTCATTGGATTGAATTGCTTCTAGATTTGGTGATTTCAATCCAGATCTGAGCAATTTTTGCAGTCAATGCGTTGACCGCAATGTCACTTCTGATCTGCTCAATCGTTTAGCTTAATTACTGCACAGTTTTTTTCCTCCCCAAAGTTCGTCTACTGTATACATGCTGAATATTCAAGACACTCGAGATTCTGTCTTCAAGATTTTCTGTTTATTCCTAAATAAAGTGACAGCCTCACTAACTTTGTTATGTGGCGTGCCTTCTTGCGAGGATATCCGAATTTTTATCTTTAATGCTGAAGGATTGACTTCATCTTTTTGTTGGTTCTTAGAAATAAGATTTTAATTGATATCCTAACTTATGAGAAGTATACGATACAGCTGGATAGGCGTTAGATGGTCTTATAATTCGCTACCCCATATTTTATCTGACATATATTGTATTTCTTTTTTCTTTTGGTCACAGTGAAACTTACCGCTACTTCGATCTCCCATTCTGCGTACCAGGTATGCATCTATTGTGCTAATTCCCGTATTTGTTAGTTGGAATTTGGAAAACCAACTAGATGAATCTAAATTGCAGATGACGTGAAGGAGAAAAGGGAGGCTCTTGGTGAAGTATTAAATGGAGATCGTTTAGTTAGTGCCCCGTACAAACTTGACTTCTTGCAAGAGAAGGATTCTTCTAGTGTTTGCCAGAAAAAACTTTCAAAGGAAGATGTTGGTAGATTTCGTGCTGCGGTAGACAAGGACTACTACTTTCAAATGTATTATGATGATTTGCCAATTTGGGGTTTCATAGGGAAGGTTGACAAGGAAGGAAAAGATCCTAGTGATTTCAAATATTACCTATACAAGCATATCCATTTTGATATATTTTATAACAAGGATCGGGTTATTGAAATAAATGTCAGAACAGACCCCAATGCCCTTGTCGATCTCACAGAGGATAAGGAAGTTGATGTCGAATTTTTATACACTGTAAAATGGAAGGAGACAACCACCCCATTTGAGAATAGAATGGATAAGTACTCCCAGTCATCGTCACTACCTCATCATTTGGAAATTCATTGGTTCTCAATTATAAACTCATGTGTAACTGTCCTCCTCCTTACTGGATTTCTTGCCACCATTCTTATGCGAGTACTTAAAAATGACTTTGTCAAGTAAGAAGATTTAGCATTCTTTTTTTTATACGGTGCTTGTTCTGCTTTTATTTTTCCTTCTTACCCTTCTGTGTCTTATGATATAGATATGCCCACGATGAGGAATCAGCTGAGGACCAGGAAGAGACTGGGTGGAAATACATACATGGCGATGTATTTAGGTACCCGAAACATAAGTCTCTTTTTGCAGCCTGTCTTGGTTCTGGTACCCAACTGTTCACACTGTAAGTAATAGTGTATCTTGAGTTAATATTTAGAAACCTCTGGTTCCCCTCATCCCCAACATTTTTTTAGTAACTACGTTCTACATTTATCTCTACAGTACAGTGTTCATTTTCATACTTGCGCTTGTTGGAGTGTTTTATCCATACAACCGAGGGGCTTTATTTACTGCACTAGTTGTAATCTATGCTCTTACATCTGGGATTGCTGGCTATGTCGCAACTTCCTTTTACTGCCAGCTCGAGGGAACAAACTGGGTACTTTCTCTTTGAATTATTTTTCTCTCGATTTCTTCAGTATTTTGGGTTAACAAGGTTTTCAATTTCTCAACGATAGGTAAGGAATCTGCTGTTGACTGGATGCCTCTTCTGCGGGCCTCTTTTTCTGACATTTTGCTTTCTAAATACTGTCGCAATTGCCTATACAGCAACTGCGGCCCTTCCTTTTGGTACTATTGTTGTAATAGTCCTCATATGGACTCTTGTAACATCACCTTTGCTGGTGTTGGGAGGGATTGCTGGTAAAAATAGCAAGGCTGAATTTCAAGCTCCAGTTCGAACCACTAAATATCCTAGAGAGATTCCACCTTTGCCTTGGTACCGTGGGACGATTCCACAGATGGCAATGGCAGGATTTCTGCCTTTCAGTGCCATATATATTGAGTTATACTACATATTTGCCAGTGTGTGGGGCCACAGGATTTACACCATATACAGCATCTTGTTTATTGTGTTCATCATTCTCCTTATAGTTACGGCATTCATTACTGTGGCATTAACATACTTCCAACTTGCTGCCGAGGACCATGAATGGTGGTGGAGGTATATTTGTTGCACTCTTTAGTAACTATTCAGTAATTTTTCAACATTCGTCATGTGTGTTCCTTTTCCTTTTTAATCCTTGCAAATTTACAATTCTCATTAATAGCATAATAATTCAGGTGGACATTATTTTTGCTTCATCAAGTTTTTGATGATATAGAGGCAGGATGAAGCCTGTTTTTATTAATTATGAAATGGTTTCTTTGAACATGTCATTTATGCGAAATGAATTTGTTTACTAGGTAAAAGTTCTTAAAAGTTCATGATAGTCATTCAGGATAATTGACTCGTTCCATCGTTTTCCTTCTCTTTCTTAAATATTTGATAGCTTTTGTTACTTTGAAAAAATTGTTTGCTTAAGTATGCAAGAAATGTGTTTATATGAGGAAATTATCATTCAAGTCTGCTGAATATTTGCTGTCACGTTGCATGTTAGTTGAGGATTTGCTGCTAGATGTCTTATCTCACTTCATATTTAGTGAATACTAGAATAGTAGGATTGCATTTAGACACTTAAAGGAGACATCCTCAATAACTATCTAAGAAGTCATAGGTTCAATTCATGGTGACCACCTACCTATGAATTAATTTACACAAGTTTCCTTGACACCTAAATGTTATAAGGTCATCATGTGGGTTGTCCTGTGAGATTAGTTGAGGTGTGCGTAAGTTGGTCCGGACACTCACGGATATTGAAAGAATGTTGGATTGCATTTAGGCTCGAGTATTGGCAAGGTTAGATGAGATGGCAGTTTATGTAGGTATTTGAACATTTTTGGAGTGTTAGAACCCTTGAGATGTGCTTCCAATAATTTTATCTAATATGTCTATGGCCTTTCAAGCACAGGTGATGTTATAAAGCCATACGTAATTTGTTGAACTCCTTTTGTGTTCTTTATTCTGCAGATCTTTTCTTTGTGGTGGTTCAACTGGCTTATTTATCTACGCTTACTGTTTGTACTACTACTACGCTCGCTCAGATATGTCTGGGTTTATGCAAACATCATTTTTCTTCGGCTACATGGCTTGTGTCTGCTATGGCTTCTTCCTGATGCTTGGAGCTATTGGTTTTCGAGCAGCTTTGCTTTTTGTGCGCCACATATATCGGTCTATCAAGTGCGAGTAGTTCTGGGTATTCATCACTCAATACTGAGAAGTCGAGTTGTGTTTCTTTTTCAAATTCATAGGTTTCTATGTAGAAAAGTTACCTGCAGCTTTATTTGTTCTTTTTTGGTGACATGTCTTAAAAAGGGAACAGCAATTTCTTTAGGTATTATATGCTCTAAAAGCAGGGCAGCGGTATGGTGGCAGGATGGATGACTGTGCCAGGCACGAACTTGGGGAACGGAGTTTGTACCATTACATTAGTTGCAACACTTTTGTTTTAATCTGAACTTTGTTCAACACATTATTGTTCTTCCTCTCAAGTATCTGACACCCGCTTATGGTGAAATACTCGTCAGCTCCGGAATTCAATTCGTTTGCTTAGTCTGTTCCTCAATTTTTATATAAATCAGAAATAAATCCAATACATTACGACATAAAACTATATGATATAACAAGTATCTATGAAAGAGAATCAAATCAAGGGTTACACATTTTTCATTAATTTTAGAAAATTAACCAATAATTCAACAGGATTAACCATCGCCTACTTTGTTAGTTAACTCAATTGTTTTGATATGAGAAGGATGGTTATGGTTTTGATTTAAATATAACTTATAGCATACCACCCAAATGAAAAATATAGAAAAGAACAAGACAAGCCAGCTATTTGTGGAAATGTGGATGGGGTTGAAGTAAAAGACATTTGATTGGAAGGTAGGGAGACATGACCAAAGCTGGGTGGCTGGCTGGCTCATTGTTACAATTTTGATGATGTAACCGAGACAGAGTTATTGGTATTTATTGATGTTATAAAAAGAAGGAAAGAGGAAAGGGCCATGGGATATACATATACATAATACATATTATTAAAGGGCAAGGCAGGTAGTGAAGGTCAATGGATCCTAAGGTATTAGCGTTGATTGGTATTGGACTTAGAATCTTCGTCTTCATATGTCTCCTCATCGCCTTGGTCGTAATTGCCACTGACAAATTGTCCCTCATTAATGGCTTCAAAGCAACCTTCAATGATATCCATGGATACAGGTTCTTCTCTACTCTGCTCTGCCCATCAATCTCATTTATACATTCACAATCAATACAAATTCACTACAACAAATTATGATTTGCTCATACTGTTTCTTGCAATGCAGGTACGTGTTGTCTGTTGCAGTTATAGGGCTAGCCCATACAATTTTACAACTGGGTTTCTCCATATACCATGTGCTTACCCAAAACATACCCTTTTGGAATGGACTTCCACAAGTCAACTACTACGCTGACCAGGTTGGTGACTAAGACAAATTACTTTTGAGATTCGAAAAAAACTTTGGGCTTACGAGTGAATCAAATGCATTATGGATATGCAGGTCATAACTTGGATGTTGGCCACGGGGGTTGGAGCTGGCTTTGCGGTCTCCCGAGAGCTGAAAAGTTATGTGGATTCAAGAACTAAGAAGGAATTTGGGGATAACGATTATGGGTTCTTCAGTCCAGCAATCGAGGAGCAGAAATCATTGATAGATGATTTCTTCAATAAGGCCACTGTTGCCACTGCCATTCTCTTCCTTGCTTTCATCTCCATGGCCACTCTCCTCCTTCTCTCTCCCTTCAATCGGATCAAACCAACTCCTCTTCCCGCACAAGATCCCGAGGCCCAAAAGTCTGAGGCCCAATCTTCACAGGTCCAACATACGGAGGCCCAATCATCGGAGCCCCCTTCTAGTTGATTTTTGGTTCTCTATAGCCAATTCTGTTGTTCCATTCCTCACTAATCCAGGATCATTATAGTTTTTTTTAATATTAATATAATGTAGTTGTTGATTTCTTATGTTTAATTCAAGAACAAAGATATTGTTATGGTAAATATCAAATACGTGGATGAATACTTAAATTTCAACAAATATTTAAAAATGATGG

mRNA sequence

ATGGAGATGAAAAGAGAGGAGCACCTGGTGGTTGCTGCTGGTAAAGTGGTAGTGGTGGTGACAGAGGAGGATGAGGGCTGTTTCCGCGGTGTCGCTGCTGCTAATGCTTCCCTTCTTTCTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTGGGAGCCCAGCCTGCTGTCTCGAATTGAACTCGTGGACCTAAGGCCAGTTAGATACTTTTCGAGGCATTCATTGGATAAATTAATCAGTAGAAAATGTCTGAAATTGAAATATAGAAAGAACGTTCCTAGTTGGTGTGCGATTAAGGAAAGGGAGGGTGGAAGCGTAAAAGGAAAGAAAGGGCGAAGAAGTGCCCTTGCAAAGGCCGCTACGGCAGAGCGTAGGTGAGGCATCAAACATCTTCAAACGACAAATCTCTTTCAGTTTCATAGTGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCAAAAAAAACCCAGGCTAAGCCTTAATCGGCTAACCCAACCCCTCGACATCCGACCTTAAAACGCCCCCTTCCCCGTCATTTTTTCTAAACCCCCCCTTATTATCGCAATCCCATCCCATTCCCCTCTTCCCATTTTCCGCTCTTCTTCTCTGTCCACTCCCTTTCTCTATCTCTCTGCTTCCTTCACAATGAGAAGATTTGGGGCGGTGCCTTTCATCGCCTTACTTGTTCTCCTCTGCGGATCTGTTCCGGTGAGATCTGATGGATCCGATCATCGCTACAAAGATGGAGATCCTGTTCCTCTCTATGCTAACAAAGTTGGCCCATTTCATAATCCCAGTGAAACTTACCGCTACTTCGATCTCCCATTCTGCGTACCAGATGACGTGAAGGAGAAAAGGGAGGCTCTTGGTGAAGTATTAAATGGAGATCGTTTAGTTAGTGCCCCGTACAAACTTGACTTCTTGCAAGAGAAGGATTCTTCTAGTGTTTGCCAGAAAAAACTTTCAAAGGAAGATGTTGGTAGATTTCGTGCTGCGGTAGACAAGGACTACTACTTTCAAATGTATTATGATGATTTGCCAATTTGGGGTTTCATAGGGAAGGTTGACAAGGAAGGAAAAGATCCTAGTGATTTCAAATATTACCTATACAAGCATATCCATTTTGATATATTTTATAACAAGGATCGGGTTATTGAAATAAATGTCAGAACAGACCCCAATGCCCTTGTCGATCTCACAGAGGATAAGGAAGTTGATGTCGAATTTTTATACACTGTAAAATGGAAGGAGACAACCACCCCATTTGAGAATAGAATGGATAAGTACTCCCAGTCATCGTCACTACCTCATCATTTGGAAATTCATTGGTTCTCAATTATAAACTCATGTGTAACTGTCCTCCTCCTTACTGGATTTCTTGCCACCATTCTTATGCGAGTACTTAAAAATGACTTTGTCAAATATGCCCACGATGAGGAATCAGCTGAGGACCAGGAAGAGACTGGGTGGAAATACATACATGGCGATGTATTTAGGTACCCGAAACATAAGTCTCTTTTTGCAGCCTGTCTTGGTTCTGGTACCCAACTGTTCACACTTACAGTGTTCATTTTCATACTTGCGCTTGTTGGAGTGTTTTATCCATACAACCGAGGGGCTTTATTTACTGCACTAGTTGTAATCTATGCTCTTACATCTGGGATTGCTGGCTATGTCGCAACTTCCTTTTACTGCCAGCTCGAGGGAACAAACTGGGTAAGGAATCTGCTGTTGACTGGATGCCTCTTCTGCGGGCCTCTTTTTCTGACATTTTGCTTTCTAAATACTGTCGCAATTGCCTATACAGCAACTGCGGCCCTTCCTTTTGGTACTATTGTTGTAATAGTCCTCATATGGACTCTTGTAACATCACCTTTGCTGGTGTTGGGAGGGATTGCTGGTAAAAATAGCAAGGCTGAATTTCAAGCTCCAGTTCGAACCACTAAATATCCTAGAGAGATTCCACCTTTGCCTTGGTACCGTGGGACGATTCCACAGATGGCAATGGCAGGATTTCTGCCTTTCAGTGCCATATATATTGAGTTATACTACATATTTGCCAGTGTGTGGGGCCACAGGATTTACACCATATACAGCATCTTGTTTATTGTGTTCATCATTCTCCTTATAGTTACGGCATTCATTACTGTGGCATTAACATACTTCCAACTTGCTGCCGAGGACCATGAATGGTGGTGGAGATCTTTTCTTTGTGGTGGTTCAACTGGCTTATTTATCTACGCTTACTGTTTGTACTACTACTACGCTCGCTCAGATATGTCTGGGTTTATGCAAACATCATTTTTCTTCGGCTACATGGCTTGTGTCTGCTATGGCTTCTTCCTGATGCTTGGAGCTATTGGTTTTCGAGCAGCTTTGCTTTTTGTGCGCCACATATATCGGTCTATCAAGTGCGAGTAGTTCTGGGTATTCATCACTCAATACTGAGAAGTCGAGTTGTGTTTCTTTTTCAAATTCATAGGTTTCTATGTAGAAAAGTTACCTGCAGCTTTATTTGTTCTTTTTTGGTGACATGTCTTAAAAAGGGAACAGCAATTTCTTTAGGTATTATATGCTCTAAAAGCAGGGCAGCGGTATGGTGGCAGGATGGATGACTGTGCCAGGCACGAACTTGGGGAACGGAGTTTGTACCATTACATTAGTTGCAACACTTTTGTTTTAATCTGAACTTTGTTCAACACATTATTGTTCTTCCTCTCAAGTATCTGACACCCGCTTATGGTGAAATACTCGTCAGCTCCGGAATTCAATTCGTTTGCTTAGTCTGTTCCTCAATTTTTATATAAATCAGAAATAAATCCAATACATTACGACATAAAACTATATGATATAACAAGTATCTATGAAAGAGAATCAAATCAAGGGTTACACATTTTTCATTAATTTTAGAAAATTAACCAATAATTCAACAGGATTAACCATCGCCTACTTTGTTAGTTAACTCAATTGTTTTGATATGAGAAGGATGGTTATGGTTTTGATTTAAATATAACTTATAGCATACCACCCAAATGAAAAATATAGAAAAGAACAAGACAAGCCAGCTATTTGTGGAAATGTGGATGGGGTTGAAGTAAAAGACATTTGATTGGAAGGTAGGGAGACATGACCAAAGCTGGGTGGCTGGCTGGCTCATTGTTACAATTTTGATGATGTAACCGAGACAGAGTTATTGGTATTTATTGATGTTATAAAAAGAAGGAAAGAGGAAAGGGCCATGGGATATACATATACATAATACATATTATTAAAGGGCAAGGCAGGTAGTGAAGGTCAATGGATCCTAAGGTATTAGCGTTGATTGGTATTGGACTTAGAATCTTCGTCTTCATATGTCTCCTCATCGCCTTGGTCGTAATTGCCACTGACAAATTGTCCCTCATTAATGGCTTCAAAGCAACCTTCAATGATATCCATGGATACAGGTACGTGTTGTCTGTTGCAGTTATAGGGCTAGCCCATACAATTTTACAACTGGGTTTCTCCATATACCATGTGCTTACCCAAAACATACCCTTTTGGAATGGACTTCCACAAGTCAACTACTACGCTGACCAGGTCATAACTTGGATGTTGGCCACGGGGGTTGGAGCTGGCTTTGCGGTCTCCCGAGAGCTGAAAAGTTATGTGGATTCAAGAACTAAGAAGGAATTTGGGGATAACGATTATGGGTTCTTCAGTCCAGCAATCGAGGAGCAGAAATCATTGATAGATGATTTCTTCAATAAGGCCACTGTTGCCACTGCCATTCTCTTCCTTGCTTTCATCTCCATGGCCACTCTCCTCCTTCTCTCTCCCTTCAATCGGATCAAACCAACTCCTCTTCCCGCACAAGATCCCGAGGCCCAAAAGTCTGAGGCCCAATCTTCACAGGTCCAACATACGGAGGCCCAATCATCGGAGCCCCCTTCTAGTTGATTTTTGGTTCTCTATAGCCAATTCTGTTGTTCCATTCCTCACTAATCCAGGATCATTATAGTTTTTTTTAATATTAATATAATGTAGTTGTTGATTTCTTATGTTTAATTCAAGAACAAAGATATTGTTATGGTAAATATCAAATACGTGGATGAATACTTAAATTTCAACAAATATTTAAAAATGATGG

Coding sequence (CDS)

ATGGAGATGAAAAGAGAGGAGCACCTGGTGGTTGCTGCTGGTAAAGTGGTAGTGGTGGTGACAGAGGAGGATGAGGGCTGTTTCCGCGGTGTCGCTGCTGCTAATGCTTCCCTTCTTTCTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTGGGAGCCCAGCCTGCTGTCTCGAATTGAACTCGTGGACCTAAGGCCAGTTAGATACTTTTCGAGGCATTCATTGGATAAATTAATCAGTAGAAAATGTCTGAAATTGAAATATAGAAAGAACGTTCCTAGTTGGTGTGCGATTAAGGAAAGGGAGGGTGGAAGCGTAAAAGGAAAGAAAGGGCGAAGAAGTGCCCTTGCAAAGGCCGCTACGGCAGAGCGTAGGTGA

Protein sequence

MEMKREEHLVVAAGKVVVVVTEEDEGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIELVDLRPVRYFSRHSLDKLISRKCLKLKYRKNVPSWCAIKEREGGSVKGKKGRRSALAKAATAERR

Homology

[Close]

BLAST of CsGy1G004770 vs. NCBI nr
Match: KGN63932.1 (hypothetical protein Csa_1G029590 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 3.4e-20
Identity = 74/74 (100.00%), Postives = 74/74 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1  MEMKREEHLXXXXXXXXXXXXXXXXGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIEL 60
          MEMKREEHLXXXXXXXXXXXXXXXXGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIEL
Sbjct: 1  MEMKREEHLXXXXXXXXXXXXXXXXGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIEL 60

Query: 61 VDLRPVRYFSRHSL 75
          VDLRPVRYFSRHSL
Sbjct: 61 VDLRPVRYFSRHSL 74

[Close]

BLAST of CsGy1G004770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LT29|A0A0A0LT29_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G029590 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 2.3e-20
Identity = 74/74 (100.00%), Postives = 74/74 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1  MEMKREEHLXXXXXXXXXXXXXXXXGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIEL 60
          MEMKREEHLXXXXXXXXXXXXXXXXGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIEL
Sbjct: 1  MEMKREEHLXXXXXXXXXXXXXXXXGCFRGVAAANASLLSFLLLLFLFLWEPSLLSRIEL 60

Query: 61 VDLRPVRYFSRHSL 75
          VDLRPVRYFSRHSL
Sbjct: 61 VDLRPVRYFSRHSL 74

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CsGy1G004770 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KGN63932.1	3.4e-20	100.00	hypothetical protein Csa_1G029590 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of CsGy1G004770 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CsGy1G004770 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CsGy1G004770 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
tr\|A0A0A0LT29\|A0A0A0LT29_CUCSA	2.3e-20	100.00	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G029590 PE=4 SV=1	[more]

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CsGy1G004770.1	CsGy1G004770.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 102..124

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:


Gene	Orthologue	Organism	Block
CsGy1G004770	Csa1G029590	Cucumber (Chinese Long) v2	cgybcuB001
CsGy1G004770	CSPI01G04900	Wild cucumber (PI 183967)	cgybcpiB001
CsGy1G004770	CsaV3_1G004850	Cucumber (Chinese Long) v3	cgybcucB002

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
CsGy1G004770	Cucurbita maxima (Rimu)	cgybcmaB105
CsGy1G004770	Cucurbita maxima (Rimu)	cgybcmaB111
CsGy1G004770	Cucurbita moschata (Rifu)	cgybcmoB099
CsGy1G004770	Cucurbita moschata (Rifu)	cgybcmoB106
CsGy1G004770	Cucurbita pepo (Zucchini)	cgybcpeB093
CsGy1G004770	Cucurbita pepo (Zucchini)	cgybcpeB098
CsGy1G004770	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cgyblsiB033
CsGy1G004770	Melon (DHL92) v3.5.1	cgybmeB018
CsGy1G004770	Melon (DHL92) v3.6.1	cgybmedB016
CsGy1G004770	Watermelon (Charleston Gray)	cgybwcgB051
CsGy1G004770	Watermelon (97103) v1	cgybwmB062
CsGy1G004770	Silver-seed gourd	carcgybB0522
CsGy1G004770	Silver-seed gourd	carcgybB0526
CsGy1G004770	Watermelon (97103) v2	cgybwmbB051
CsGy1G004770	Wax gourd	cgybwgoB055