Cp4.1LG10g12240 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TACCCTCAGGGTGGGCGAAGATTGTAAACGAGGTTATATCCCCGAATTGGGCGGTGATCGAGGAGGCGCTTTGGTGGTTCTCATGGCCTGCCACCATCTTCACACTGCGACTGCTAGTGCGTCGCACATTTGCAGAAATTTTTTGAGATACATTTTCACCGCCAAATTTGCTTCTCCTCTTCGTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGAGGATACAGTCTCCTGGTCACCATTGTTTTCCGTCTTTCTCCGTTCTGCTATCCCCGAAGGTAACTCAGTTTCTGCTTATTGGTACTTATTGTTCTGAATTGATTCTAGCATATTTACCGAGAAGTTTAGTTGCAAAAAGTAGGAGGCTCATTAATGGTGGAGTGTTATTGTGTCGATGTGAAATGGGCGAGATATATTATGGTAGCAAGTGTAATTCGATTAATCAAAGAGCAGAATGTGGTTGATGGCTCTTATTGCAATAGTTTTTCTTGTCATCTCGACATGAGAAATGGATACTATTTTGATCTTAGTTGTGATCATGGCGTCTAATTTTAGCGTTTGGTTAAATTCAAAGCAATATACAACTTTTTGCCTCTGTTTTCTGCTGCAGTTTTGACTTCTTCTAAGGATTTTTCTCGGTTTCTCAGGGTTACTGTAGTTCATCTAGAAGTGTAAATGCTGCGATTAACGTAGATAGCAATGCAACTTATCATGGTAGTCCGGCATCTTCTAGTAGCCAGCAAATGCTGCAAGTCCAAGATTCATTATCGAATTCACCCACATGCAAAGAAGAAACTGAAATTGATAGTCCTTCAGATGCGAGGGTCATGCTCATTGATGGCACATCAATCATTTATAGAGCATACCACAAGCTTTTGGGTATGTTAGATTTGTCATCAGAATGTTTTAGTTTGACTTAGTTTGTTATCCTAACTTATATTTTCAATCCGTATTTCCACTGGAGATGGTTTATGTGCATAGAGGATAATTGATAGCAGAAAAGTGGCACACATAAACCCGTTGGTAAAGAAGTAGACTTTAAATTCTTAACATTTTTATTCTTTCATAAGAAACGCGGACAAACTTCATTAATAGAGAAAAAGATATACAAAAATGGAGACGATATATCCCCAAATGCCAAGGGGATTATAAAAAGGATTTCCAATTAGCATTAATTTATATCAAATTAGAACTACAAACATGAGGGAGCAAAGAACGCCATTTTGGTGAAAACAATCTAACTTGCTCCCTACATTCATCACGAGAGGATTCACTGTCTTGAAAAGTCCTCTTGTTCCTTTCATACTAAAGTCTCCGTAAAACCACTACCACTGAATTGAACCACAACGCTCTAGCTTTGCCCCCAAAAAGAAGTCTCATAAATGAGCTGAAAAAAAGCCCCCGAACACCCCTTGGGGAGCACCCAACTTCAGTTAAAACTTAAAAAAGACTACACCAACCAAAAGCAACATACGTTTTTGCTATATTTACTTCTTTGATTTATTTGTTTGTTTGGATTTCTGTTTTGGAGCAGCAAAGCTGCATCATGGCCATTTATCACATGCGGATGGCAATGGAGATTGGGTGCTAACAATATTTACTGCCATGTCACTTGTAAGTAACATTCTTGTTAGGTTCTTGTTTTCAAATGTTATTTTACCTGTCCTTTTTCCAACAATGATATACATTCTACTGATAGTGCCTCAAACCCTAATGCTATTCTAAATGTTCTCCTCATCTTTGTTGTTTTTTGCCATGAAGTAATTTCTGTTAAAATATTACCATAAAATATAGGAATATCAATTTTCAGCTTGTTGGGTATTGGCATAATGCATATGCCGTGTTTGACTAGCCATGGGAACAAAAGAGAAACATATGAGGGATCATCAACATGTAGGAGCTCGGGCCTATCCAAATCATCCTCAATAATTATATCATAGGGTGCCTCTATGGTATGAAAGGGTGGTGGGTCGAGCTCGGGTTTAAAAGTTTTGGGGTAGTGTCTGTGATAACTAGTGAGAAAGACGCTGTATTAGAGGGAAGAGGGGGAGGCTATTCAAAGAAGGTGGATAGGTATGGTAGTGAGTCAATTGGAGAAAGGTGATGTCGTGGGGAGCCTTCATCAAATGAGTGCAAGGGGATGATAATATGTTTTCTTAGTCTAAAAGAGGTTTATCGGTGGCTGTCGAGAACTGATAAAGATGATGAAGGAAAAAGAAGTGATGAGGTGGGTTACAATTCCCTTCCTAGGCCCGTTTGACATTGTCTTTCGGTTTCCAGTTCATTTCCTCTAACCTTACCATCTCTTCAATCTTACATTTCAACAAGACACTTGTTAGGCCTACCATCATTAGGCAATACTTTAGAAGCGGTAGAAAAGGGAATGTACCCTCATCAAGTTAGTATCTCTAAAGGCCTTTTGTTCCAACCTTTCTAAAGCTTCCTTTAGTGAGCGGAGTTTTCCCATGAATTTGAAACCTTCCCACTTTCAGGAACATTTGTTGGCCACCAAGAAACTTAAAAAGGAGTGATAGGAGATCAACATATTTTCATACCTTAGAGGACAGGGTCCCTACTTTGGCTCCCATTGATCCAGAGAAATCGGCCAATGACTCGATGTGTCCCTGGGACCTAGAGATCTTTTGGCACCAAAGAAAGAATCCATCCAAACTCTAGATAACAAGGCTCTGGACCACCCTCAAAAGACAGTTCTATTTTCTCCGAAGTGCAACTATTTCCTTCCGTAGATTTCATCCTTCCTTCACCAATTTGACTAAAGAGGGTAGCTCCATAGATGTCCTATGTTGTTTGACCCTTCGAGGAACTTGAGATTTACTCAAAAGAATTGTAGCAAGTGTCATAAGAAATCTTCCAACCCTTGCACGCAATACTTTTGGGGCACCCATCAAGGGGTTCAAAAGCAATCATACATCTGCCTCTTTGATAACTCATGTTAGACATTTGAACAAATATCTATTCGAAGAACTTCTTTGCTTTTGATCTCACGATGATGAAAGAAAAAAATAGCTTACCCACATGAATATCCCCAAATGAACATTCACATTTGAAACTTTTGATATGAACCAAGACATCTCAATCATGCAGTATATACTTCAAGGAAGATGTGAAAAAAATGATCAAATTACCACCAGATAAAATCAAGTTGCAATTCATGACATATTAAAGAAGAATCAAGTTTCAATTGTTCTTGTATGATTACAAATTTTGGGTGGATGATAATTAAGAGTTATGGTGTTTTATTAATATATTTTAAGGCACTTTATTTACTTTAAGGTTACATTTATATAGTGGCGAATTATGGTCATAAAGTATACATCAATAAGGTTGTTAGATCAAATTCTCAAGAGTTGCAATCATTTGAAATGAAATCAAATTGATTTGGGGTTTCTGCATTTGTGAAATAAAGGTTCGCATATCCACGCGCCTTATGAGAGTTCTTAGATTCAATTGACTAGAGTTTCCATATCATTTGGTATCATTTGTGTTTCATTTGTGTTTCTTATCAATTTGGTTTTTATTTATTTTTATTCTTTTAGCCCATAATCGATTTAGAGTTTAAAAACTAATCTAGAATGAGAGCTTCATTTATTATGTAAATGAGTGTAAACAGAGTGCCCTAAAATTTCTTGAGTGTATACATGTGAGAGAGTGCTGTGAGGTCTTTTGTATTTTCTGAATTTAATTTTGCAACGAAGTTTCTCAAATAGATTAGATTTGAGGACAAATCCTCTTGAAGAAGTGAACAATGATATGAACCAATGCATCTCAATCATGCAATAGCAATATGTACTTCAAGGAAGATGTTAAAAAAATGTTGTTCAAATTATCACAAGATAAAATCAAGTTGCAATTCATGACACATTAAAGAAGAATCAAGCTTTAATTATTCTTGTATGGTTACAAATTTTGGGTGGATGATAAATTAGAGTTATGATATTTTATTAATACATTTTAAGACACTTCATTTACCTTAATGTTACATTTACATAGTGGCTAATTATGGTCATAAAGTATACATGATGGCTAATTATGGTCATAAAGTATGAATGTTACAACTCTTGAAATGCCTCATGGAAGGTGAATGGTTTTATTTTGAGACTATATAACGCCATGTATCTTGTCTTTGTAAAGTAGACTTGGAAAATGTAATAAAAATAGCATTTGTGTTTCTTTTAGCCAAAAGCTAAGTTTCTTTGTAATTTTATGTAGTTTATGTTGAATATTTAGAATCATTCAAGCTTGACATGATCAATCTTTGATCTTGCTTGTGGAGTAATTCAAATCTCAAATAAGTGTTCTTGCCTTGAGATATTCGATCAACAAGGTAATTTGGATCTTACTTTCCCTTGGAGTGGTTCTTGGATATTTAGATCAAAAAGGTTTTACTCTTCAATAAGGTTGTTAGATCAAATTCCCAAGAGTTGCAATCATTTGGAATGAAATCAAATTGATTTGGGTGTTTTTGCATTTGTGAATTAAGGGTTTGGATATCCAGGCACCTTACGAGGGTTCTTAGACTCAACTAGCTAGGGTTTCCATATCATACAATATTGTTCAATTAGCACCTTCGTCAATTCATCTTAGAGGTTGAACACATCTCTTCCTTTCAATCTTCACTGAGCATGTATACACCTCACCAGCCCTAACCTCTTCCCGCTGGCTCTCATCCTTCAGTCCACTAACACATTATGAAAGAGATGAGGAGAAGAAAGAGAGAGAGTGTGTGTGCGTGTGTGCGCGCGTGTCAATCCAAAAGTGTTTTCAACCCATGGTTATATTGACAAAAGTCTTTTGTAATTATAGTGTAATTGTACATCCTTCACTTGTGCTTCTCAATGTCTTGCTGAAACATTTTCTGTTTCTAAGCAAAAAAAGACGGGTGGTTTTACAAATTTTGAAAGATGGAGATATTTCTTGTGATAATTGCTATATCTATTATATATCTTTTCTGCAAGAATTTGTGATTTTTCTGCAGGTAAA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ATGGCCTGCCACCATCTTCACACTGCGACTGCTAGTGCGTCGCACATTTGCAGAAATTTTTTGAGATACATTTTCACCGCCAAATTTGCTTCTCCTCTTCGTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGAGGATACAGTCTCCTGGTCACCATTGTTTTCCGTCTTTCTCCGTTCTGCTATCCCCGAAGGGTTACTGTAGTTCATCTAGAAGTGTAAATGCTGCGATTAACGTAGATAGCAATGCAACTTATCATGGTAGTCCGGCATCTTCTAGTAGCCAGCAAATGCTGCAAGTCCAAGATTCATTATCGAATTCACCCACATGCAAAGAAGAAACTGAAATTGATAGTCCTTCAGATGCGAGGGTCATGCTCATTGATGGCACATCAATCATTTATAGAGCATACCACAAGCTTTTGGCAAAGCTGCATCATGGCCATTTATCACATGCGGATGGCAATGGAGATTGGGTGCTAACAATATTTACTGCCATGTCACTTATTGTTGATGTTCTGGAGTTTATGCCTTCTCATGTGGCGGTTGTGTTTGATCATGATGGACATGCATATGGTCATACTTGTTATTCATCCAATGAAAATTTCATGGCAAAAGGATCCACTTTTCGTCATACACGTTACCCTGCATACAAGAGTAACAGGCCACCCACACCTGATACCATAGTCCAGGGGCTCCAATACTTAAAGGCATCCATAAAGTCCATGTCCGTAAAGGTGATTGAGGTACCTGGAGTGGAGGCTGATGATGTGATTGGCACATTGGCTTTGAGAAGTGTTGCTGCTGGGTGTAAGGTTCGTGTTGTCTCCCCTGACAAAGACTTCTTCCAGATTATATCTCCTTCATTACGTCTTTTACGAATAGCTCCACGTGGGTTTGAGATGGTTTCTTTTGGGCTGGAGGATTTTGCCGAAAAATATGGAGTTCTGGAACCTTCTCAGTTCGTTGATGTGATGTCTTTAGTTGGTGACAAATCTGATAATATTCCAGGAGTCGATGGAATTGGAAATGTCAATGCTGTGCAACTTATCACTAGATTCGGCACATTAGAAAATTTGTTGCAACATGTTGATCAAGTGGAAGATGAACGTATAAGGAAGATGTTGGTAACAAATGCTGAACAAGCTATCTTGAGCAAGGACCTGGCAATCTTGCGATCTGATCTTCCGCTCTATATGGTACCATTTACCACCAGAGATCTTTTATTCAAGAAACCGGAGGATAATGGGGAGAAATTCACAAGCCTCTTAACTGCTATTGGTGCATATGCAGAAGGATTCTCAGCTGATCCAATTATGAGGAGAGTACTAAACTTATGGAAGAAGCTTGAAAAAAGTTAG MACHHLHTATASASHICRNFLRYIFTAKFASPLRFSSSSSSSLRIQSPGHHCFPSFSVLLSPKGYCSSSRSVNAAINVDSNATYHGSPASSSSQQMLQVQDSLSNSPTCKEETEIDSPSDARVMLIDGTSIIYRAYHKLLAKLHHGHLSHADGNGDWVLTIFTAMSLIVDVLEFMPSHVAVVFDHDGHAYGHTCYSSNENFMAKGSTFRHTRYPAYKSNRPPTPDTIVQGLQYLKASIKSMSVKVIEVPGVEADDVIGTLALRSVAAGCKVRVVSPDKDFFQIISPSLRLLRIAPRGFEMVSFGLEDFAEKYGVLEPSQFVDVMSLVGDKSDNIPGVDGIGNVNAVQLITRFGTLENLLQHVDQVEDERIRKMLVTNAEQAILSKDLAILRSDLPLYMVPFTTRDLLFKKPEDNGEKFTSLLTAIGAYAEGFSADPIMRRVLNLWKKLEKS
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. Swiss-Prot
Match: DPO1_THEFI (DNA polymerase I, thermostable OS=Thermus filiformis GN=polA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 8.0e-39 Identity = 99/275 (36.00%), Postives = 155/275 (56.36%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. Swiss-Prot
Match: DPO1_GEOSE (DNA polymerase I OS=Geobacillus stearothermophilus GN=polA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 1.8e-38 Identity = 104/306 (33.99%), Postives = 165/306 (53.92%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. Swiss-Prot
Match: DPO1_BACCA (DNA polymerase I OS=Bacillus caldotenax GN=polA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 4.0e-38 Identity = 103/306 (33.66%), Postives = 167/306 (54.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. Swiss-Prot
Match: DPO1T_THET8 (DNA polymerase I, thermostable OS=Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) GN=polA PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 1.3e-36 Identity = 100/276 (36.23%), Postives = 152/276 (55.07%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. Swiss-Prot
Match: DPO1F_THETH (DNA polymerase I, thermostable OS=Thermus thermophilus GN=polA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 1.7e-36 Identity = 100/275 (36.36%), Postives = 146/275 (53.09%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TrEMBL
Match: D7T2D6_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_05s0094g00430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 567.0 bits (1460), Expect = 2.0e-158 Identity = 289/392 (73.72%), Postives = 335/392 (85.46%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TrEMBL
Match: A0A061EJA7_THECC (5\'-3\' exonuclease family protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_019883 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 557.4 bits (1435), Expect = 1.6e-155 Identity = 289/402 (71.89%), Postives = 333/402 (82.84%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TrEMBL
Match: A0A059DB23_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_A00006 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 555.8 bits (1431), Expect = 4.7e-155 Identity = 286/390 (73.33%), Postives = 323/390 (82.82%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2NBI5_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_005G123800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 548.1 bits (1411), Expect = 9.9e-153 Identity = 278/387 (71.83%), Postives = 324/387 (83.72%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2RDM6_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_005G123800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 547.0 bits (1408), Expect = 2.2e-152 Identity = 277/385 (71.95%), Postives = 323/385 (83.90%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TAIR10
Match: AT3G52050.3 (AT3G52050.3 5'-3' exonuclease family protein) HSP 1 Score: 513.8 bits (1322), Expect = 1.0e-145 Identity = 267/395 (67.59%), Postives = 319/395 (80.76%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. TAIR10
Match: AT1G34380.2 (AT1G34380.2 5'-3' exonuclease family protein) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 1.2e-11 Identity = 80/340 (23.53%), Postives = 144/340 (42.35%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. NCBI nr
Match: gi|449453197|ref|XP_004144345.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101222649 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 743.8 bits (1919), Expect = 1.8e-211 Identity = 384/451 (85.14%), Postives = 410/451 (90.91%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. NCBI nr
Match: gi|659069411|ref|XP_008449676.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491482 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 736.9 bits (1901), Expect = 2.1e-209 Identity = 383/451 (84.92%), Postives = 412/451 (91.35%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. NCBI nr
Match: gi|778694790|ref|XP_011653865.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101222649 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 2.6e-199 Identity = 370/451 (82.04%), Postives = 395/451 (87.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. NCBI nr
Match: gi|659069413|ref|XP_008449686.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491482 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 699.1 bits (1803), Expect = 5.0e-198 Identity = 371/451 (82.26%), Postives = 396/451 (87.80%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG10g12240 vs. NCBI nr
Match: gi|694384553|ref|XP_009368167.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103957700 isoform X1 [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 582.0 bits (1499), Expect = 8.8e-163 Identity = 318/453 (70.20%), Postives = 362/453 (79.91%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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