ClCG06G004950 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTTTCTTAGAGAAAGAGAAATTAGGGCTCCTCGTGCTGATCTGGCGAAAATTGGGAGAGAAGGATTTGAACTAATTGACGAATACTTTGGTCGAGCGCCGGCGGCGAGAAGGGTGGCGGCCAAGGCAAGGCCGATTCTGCCCCAGCCACCACGTAAGGCGGAGCAACCTCCGAGGAAGAGGACGGAAAAACCGGCGGCGGCCGTGAAGACCTCCGATCAGGTGGCGAAAACCGGTGGTGGAATCGTGATAACAACTTGGCGTGCGTATGCAAAATGAATATAGCTTTGTTCCTCTCTAGAAGTAGAACTAGTTGGTGCTCATAATATATAAATATACATAAGTATGGGTACTTAACTGCAAAATATATATATATGTATGTATGTATGTAAGTGTAGCTCTGCTAGTTTGCCTTTTGCTTTGCTATGTAGAATCAATATAATATAAAGTAATGTATTTGATCTAAGCTTATGAAATCTCTCCCTCTCTCCCTGCAAAGGAAAAAAAAAAAAAAATTTGATTTAACTTCTCAAGTTTTTATCATTAAAAAATAACCATTTAAAAAAAAAGTTGAAATGTTTGGCAACGATTTTAAATAACTTTTTAAAGAATTGAATTCATAAAACAGGTTGGTTTGAGAGAAACACTTGAAATAAAATTATCAAAATACCCTCACTAATCCTCGATCTCATTTCCACCAATGACCAATTTAGTGGCCATCTCGCTCCTACTAGCTACCACCACACCAACGACCATCTCTAACTACCACCTTCAACAACAAATTACAACCTTTGACTCTAACAACGATCATCTTTGATGACCAAGTACATATATTATCTCTAACGACCAACTCTAACAAGTAACTCTAATGACCAATTAGACAGACGATATGCTAACAAAACAAAAAAGCTCAGCCAATGAAGATGTTTTTAAATACAAAAATTTGAAATGATAAGTTTAACCATCGTTCTTTTCTAGTAATTTGTCATTGCTAGAAACACTTTGAGTATGTAGCAACACAAACAAGCCTGTAAAAACACTTTTGAGAAGAGATGCAACTAAATACATGAGTGTTTTTATTTTAAACAATGTTTATAAAAAAAAGTTTAAATGAAAATGACTTTTTGAAAAATATTTTTTCCAAACAATCTAAACAAATCCTTAATATTTAGGTCAAATTACAAGTTTAGTTCCTAAATTTTGAAGTTTGTGTGTTTATTATACAATACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGACAAAGGAAACATCAAGTGAGGTTCATCAATATAAATGTGAAAACAAATGAGAGGTTAGAGGAAAACCTTCCAATTAAGAGATATGGTCGAAGCATCATAATTACAGAATAACTTAGATGCGGACACCAATTAGCAACTAAAGTGATGATGTTCTCCCCAAGATTAGCTTGACCCTTGGCATAATCCTTGAATATTCTATTGTTATGCTCAAGTCAAATAGATCACAAAATAGCCCCTGTGATGTTAGTTCTAAGAGCGTGACTAACTCTTTTATCTTTAAAAAAGATAATATTATTAGAGACAATTGTAGCTAGGTATGTGCGGCTAAAGTTAAAAAGATGCCTATAGAGACTTGGTGAAGTTACAATGTAAGAAAATATGATCATCAATCTCACACTACTCGATTTACAAAGCACACACCAATTTAAGTTTAAGCAACAACAAGTGAATCAGGTTTGAGATTTTTCAGCCATGTTCAATCTCCTGTAAAAAAGAGTCCATATGAAAAACTTGCGTTTCTTAAGAAGGAAAGAGGTCCACAAATTCTCTAACATTTGGATAAAAAAAAGATAAAATAGACGTAAACTTCAACGTTGAAGAACCAAACCATATTAAAGCATACTGCATTTATACACTTTCGAAAGTACACAATCAAATAATTGACATAAACCTCAAGTTCATGAACCAACATATCAAATTAAGATAATTATTTCGAAATATAATTTAAAATGTTCGACCATAATTACTAAAGGTTTAAATTTAAATATTACAACATAGTCTAAAACCATTTAACGTTGGAACTTATAAAAAAAAGAGTCAGAAACCAATAAAAACATTAAATTTAAATATTACAAAAAGTTTCAAATAGTTCCAACCGTATATATTAAAGGAATTTTTTTTTCCTAGATTTTGAGACAAAAGTTTTCATTTTTGTCCTAATTAATTAAAATATGTCATATATTTAGTCTTTAAGTTTTGAGTTTAATTTTAATTTAGTTTCTATATTTTAAAATGTTACAAATTTACTATGATAGATATAATTTGTGTTACAATTTGGTCCTTAAGTTTCAATATTTACACTTTTAACCTTGATTTTTAACTAAATAATGACTTTCATTCTTTTACATTCATGACTACTATATAATTTAAAATAATTATGAATTTAGGTTTTAAAGTTAATCTTAATAATGATGAAAAATAGTTATACTTAATTAATTATTATTCTTTTAAATTAATTAATAGACATTAACACTAAAGGTGGAAAGTGATTATTTAGTGAAAAACCAAGGTTAAAAATGTAAATCTTGAAACCTAGGAACCAAATTGAAACAAAATTCAATTCTCAAAAGAAAATTGTTACATTTTGTAACTTAGGGACTAACTTGAAATTAAACTCAAAACTTAAAAGACCAAACGTATAAGATTTTGAAATCTACAAACCAAATAGAAATTAGACCAAAAATATAGAGACCATAAATGTATTCTTTTTTTCAAATAACAATAATAATAATTGTCATCGAGACGAGAACGAAGAAAAAGAGATGTGAAAAGAACTTCTTCGGCCCTATTTGGTTCCACATGAAAAAGAAATAATTATCCTTATTCCCTCCCTTCTTTCATATGAAGATTCTCTGCTTTATTACGAACACAGAGATAAGTCATGCACAAGGAATGTATTAGATAACATGAAGTTCCATCTCAAAACTAATTGGCAATGAGAGGAATAGCTCATTTTCAAATATGGAATCTTCAACGGAATGAAAGTCTATACATTTGAAGTTTTTGTAATATTAATCCATCAACTTAAGCTGTTTTTGGGTTTGATGTTGCTGATAAACCAGCAGGAATAATAGAATTTTGTTCCTCAACAAAGAATATAATTTTCCAAACTCTTGACCTTGAAGCTTAGTGAGAATTTGAAGCTTTTAGACTTAGAAACTCTCTTTAGATTAGCTTTTGTGGTCTTGATTAAATGGTTCAGGATTCAATATACTAACACCTTGGGGAAGGTTTTCTTGATCAAAACTTTTTAGTTGGAATTCAACATATCCATCCATGCATGGACCATATTATAAATCACAAACATATTACAATAATCTTTCTTTTGATGCTGTTAAGGAAAAAATAAATAAATAATAGTTTTTGATAAGCAAGAAAAGAGTGGAAAAACCAACAAACCTTCTCTATTCTTTAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAAAAAGGCCATCTTATTCATGCAATACAACCCAATTATTTCTATTAAAATTACCAATAATTTTCCAATTTTCTTATTAAAAAAATGTTATAATCCTTGTGGGTGATTCTGTTGTTGACCTAATCAAAGAAACAAACCTAACAAAAATAAAGTCTAAATTTATCTAAACTAGCAAAACAAAAAGAAGAGACAAGTCTAAAAGGCATTAGGGCATTTGTGAAAAGCACTACATCGTCAGTAGTACGTAAAGGTGATGTTAATGTTAAATGAGTTTTCTTGACTGAAATTTGTCATCAACAATAATAATATATTTGAAACTATGAATGTTAAGTCTATTTTTGACAATATCTGGTGTAGTGAGACTGAAAGCTAGATTTTGAAGTTGATAGTACGAGTTCATGGTAGTTGAGTTCCGCTTGGGTTAATTTTAAGCCTAATACCTCAGAAAAATATCTTTAAATTGTTCTGAACTTTGGAATTAAATACAATTCAATCTTAATAATAGGTTTATATATATATATAAAATTAAAATAAAAAAACTTTGGCTTGATACGTATTTCTTTGGAACTTTTAGCGTTGTCTAACATCCCTTGGATAAATACGAATAAAGCAACTTTTCTTTTAAAATTACAATCAAGCAATTCCCATAATTAAAATATTTATATATTTATATTTATACTCTTTTGCGCTACCATTCCTCGCCATCTGCCTTTTCCACGTGTGTATATATATATATATATATATATATTTCTAAATATCCTACGTGCCTATTAGATATAATAACTAGTGAGATTTAAATCTTACCTAGCATCTAAAAATATATAATGATTAGTTGATTAGATTACCAATTTAATGTGTTAGTTATACGTTAATTGACATTGACATTTAATCTTTCACTGAAGTCAGATGTTAAAATCTATATCCACTATATTTGTTGTATTCATGGAAAGGGAAAAAAACTCCAAATTTAAGTCTCATTATGAAGTCATTTCGTCTTAGGATTTTTTAGAGGTGTTCATGAGTTGGGTTAGATTGAGTTGAAACACTTTTTAGAACCAACTTAATTTTCGGGTTGTAAGATTTTTTAACCTAAATAACTCTTATTAAATAATAAACCCAATCCAACCATGAAATGTTTGGGTTGATTTGTATTACTCTGGTTATAATTTATTTAAAATTTTGTTCTAAAAATAAGTAAAATGTTAATATGTAAAAAAATTATTTAATTATTTTAATATATTGAATTAAGATAAACAACGCGATTTCAACTTATATTGTGATTTTTTTTTCCAGATTGCTAAAAATGTGTTGTTGGAGAATAAATTATCCAAAAAAATTATGAAATTAACTTGAATATATGTATATATAATTGTATCATAAGTACACAAAACACTGTTTAAATTTAATAGTAAATTCAAGTTGGTTTGAGTTATTTTAAGTGAACCCATAAACCAACCAAATCCATAAAATTTTCATTTATTTGAATCCAACCCTAAAACTACATTTATTTTTAGTTTTCAAAATTTAGTTTTGTATTTGAAGATATTGGTAAAAAGTTAGATAACAAACCAAGAAGCCTAGAAGTAGAACGAGTGTTTATAAGCTTAACTTTCAAAAATTAAAAACTAAAAACCAAATAGTTACCAAATGGACCTTAACAATCTATGTAGTTTAGACTTTATTATTTGAGTGGTTTGTGTGCTTTTTAAAATTTCCAACATCACAAATTGTCTTATGTTACAAGTTTTTTTTTTCTTAAATTCAACTCGTAGGATTATAAAACGAGCATATCTCAACTGACATATATATAATATGTGTTAACTACCAACAAGTTTATAGTTTGAAAGTTCTATTTGAAGTTGGAGGACTCAACTTTTAAAATTGAAAGTTTAAGGGTATAATTACGATTATCACCGTAATTCGAAAATTGTCCAAACTTTTATAACATAACATATAGATTGATATGAAACTAAGCTAGAATAGATAATTCAAAAAATTATTTCAAAGTATGGTGGAAAAATTACAAATACTACGAAGATAGAGTCCCTAGGTGCAAATTTACTCTTGTCGTCACCTCAATGACGTCTTAAACCCCTCAAAGAATCATTTTCAAAATAAGAAAAAGGAAAAAGGAAAAAAGAACCTTTGCCGACCCATTAACCCAATTTGAACGTTGAATATAACTTATTTTATTTTATCTTTTATTTTTAACTATCTCTAGAGAATAATTCAACCTTCATAATTTGGCTCTTTAGAAAAATAAATATATATACTTCTTAGATATAATAATTTTTATAAACACCTTAAAAAAATTAATAATAATTTTTAAAACCTAGTTTAGTAGTTATTTCATTTTTTATTATCATTATTTTTTTTAATTTAAGTCTATAGAAACTATTTTCACCTCTAAATTTCTTCTCCTCTTATCTACTTTTTACTAATGGTTTAAAAAAACTAAACCAAATTTTGAAAACTAAAAAAATTGCATTTAAAAATTTATTTTTGTTTTTGAAATTTGGATAAGAGTTCAACCCTTGTACTTAAGAAAAATGCAAATCATTACAAAAAAAAAAAAATTAAAAGAAAATAGGTTTAATTTTTTAATTACCAAAATAATTATCAAACGAGGTCTCAAGCATTTTCTAAAATAGATTATATATAAAATTCTTTTGTAAATATTTTTTTAAAAAAACTGAAATGTATATTTCGAACACATTTGGTCATAAAAACAATAAAAAAATCATTTTCAAACTTTTTTGTGATACTTAGCCATATGATTCAAAGTATTTTAAAAAATTTATATGATGCACTCATCTTTATGCATCACACTATCATCATATATATAAAAATAAATTTAAATATTTCAAAAAAGTAATAAGAAAAATTTTCAATGTGACAAACTATGATTGGATAATTTGGTGAGATACACAAATATAAGTGTATTTCAGAATACACCTAAGTATTTTCCTTTTCTCATTACTATTTATATAGAACATATTTAATCCATCTCAAACAATTAGTAAGTGTACTATATTCCAAAACTATATAAAATGGTTAAAATTTCATTTTTGTACTTATATTTTGAAGTTTGTTCAATTTTAATTTGGTCCATGTACTTTCAATAAATATTACATTGAGTCCCATGATTAGTTTATTATTGTTGATATTTTTTTATAAAGAAAATTGTTATGTATTTACATTTCTACTATAAATTTTGAAAATATATTCACATATAATATTTCCTTACATGAAAATTTTATTATTGTTTAACAAATTTCAGTAAACATTAACTTGACAGACTAAATTTAAAATTTATTAAAAGTATGGAAATTAAAATTGAAAAAGCCTCCTGTATTTTAACCTAATTTAAATTTTTTCTTAAAAAAATAAAAAATAAAAAATAAAACAAAATGTCATGCTAAAATATAGCAACCACCATCCTAAAAAGTTACCCCCCAAATATTCCCAATCCCTTTAACTAAATCAAAATCCATTATTTTACTCTCTAACAAATCAAATATCTTCATAATCTTAAATCTTATATATTTCTTTTAAAAATTTTCTCAATAATTAAAAGTATCTTTCGTTTCTTTAGAACACTTGAAAAATTCCTTTTGAACATACTTTTTCTTATAAGTGTTTAATTATATATAAAACACATTTAATTCATCTCAAACATAGTTTAACGGTTTAAGTGTTGTTCTAGTTCTAATTGAGAACCATAACCTATTAAAAAGGTAAAATAAAAGGCTATGTTACAATAAATTAATCACTAATTCTTCTAAAAGAATTTAATAAATAATTTAATTGATCATTCAAAAAAAAGTTAGGAGTCTCCCCAAATATTCCCAATCCCTTTCACTATATATATTAGTTTTAAACCACACTCCTAATTATTTTGAATTAAAAAGATGGAAAATATAAATTTATACCAATAAACTTATTTGAGATTATATCCAAATTACATACTACTTGAAAAAACATGATATAAAACTTATAATTTTATCAATAAATCAAACTCCTAACTTTTATAATGAATCAAATTATACTTTCAATTAGGATTTTTTTTGAAAATCGTTCTTATATTAATTATAATTGTCCATTTTGTTCATCGGCCATCTGAAAAAGCCTACACATGTAAGAAATTGATGTATTAATGATTTTCAAAGATAATATTAATAAAATGTCTCGATTGATTAATTTATGATAATTTTAGGAGTTAGTTTAATTGAAACATGTATATGTTTCACACAAGATTCTTTTAAACAAAATTTGAATGAGGGAGAAAATTCAAAGGTTTGATTGATTAAACCCTAAGCTTTATAGGTATGATTTTATTATTTTTGAAATAAAAAGATATATTATTCTACTTTGTAACTTGAATGCACGTTGTTAAACTGAGTACAACTCAATTGGTATAAAGATTTTATTGATTGTCGCATTAATTCTTTTTTAAATTAAAAAAGAAAAAAAAAACAACTGTGGGGCCCAGCAATTGGCCAAAATTAAGCTTCTTCCCAGCTCTATATAAAGGACCAAAACCAAATGAAACTTCACAAACCAACAAAGCCATTCAAAATCAAAGATAAGGGGAGGAAGAAAAAAAAACTTTCCTTTTTCCTTTATTTTTTCTTCTTTTTAAGAAAAAACATTTTTCTGAAATTATGGGTTGGAGAGAAAGAGAAATTAGGAATACTCGTGCTGACCTGGCGACGATTGGGAGAGAAGGATTTAAACTAATTGACGAATTCTTCGGTCGAGCGCCGGCAGCCAGAAGGGTGGCGGCAACGGAGAGGCCGGCTCAGCCGCAGCCGTCGCGTAAGGCAGAGCAACCTCCATGGAAGAAGAAAGAAAAACCGGCGGCGGCCGTGACTTCCGATCAGTTGGCCAAAACCCGCGGCGGCATCGTGATAACAACTTGGCGTGCAAAACGAAAATAG ATGGGTTTTCTTAGAGAAAGAGAAATTAGGGCTCCTCGTGCTGATCTGGCGAAAATTGGGAGAGAAGGATTTGAACTAATTGACGAATACTTTGGTCGAGCGCCGGCGGCGAGAAGGGTGGCGGCCAAGGCAAGGCCGATTCTGCCCCAGCCACCACGTAAGGCGGAGCAACCTCCGAGGAAGAGGACGGAAAAACCGGCGGCGGCCGTGAAGACCTCCGATCAGGTGGCGAAAACCGGTGGTGGAATCGTGATAACAACTTGGCGTGCGAATACTCGTGCTGACCTGGCGACGATTGGGAGAGAAGGATTTAAACTAATTGACGAATTCTTCGGTCGAGCGCCGGCAGCCAGAAGGGTGGCGGCAACGGAGAGGCCGGCTCAGCCGCAGCCGTCGCGTAAGGCAGAGCAACCTCCATGGAAGAAGAAAGAAAAACCGGCGGCGGCCGTGACTTCCGATCAGTTGGCCAAAACCCGCGGCGGCATCGTGATAACAACTTGGCGTGCAAAACGAAAATAG ATGGGTTTTCTTAGAGAAAGAGAAATTAGGGCTCCTCGTGCTGATCTGGCGAAAATTGGGAGAGAAGGATTTGAACTAATTGACGAATACTTTGGTCGAGCGCCGGCGGCGAGAAGGGTGGCGGCCAAGGCAAGGCCGATTCTGCCCCAGCCACCACGTAAGGCGGAGCAACCTCCGAGGAAGAGGACGGAAAAACCGGCGGCGGCCGTGAAGACCTCCGATCAGGTGGCGAAAACCGGTGGTGGAATCGTGATAACAACTTGGCGTGCGAATACTCGTGCTGACCTGGCGACGATTGGGAGAGAAGGATTTAAACTAATTGACGAATTCTTCGGTCGAGCGCCGGCAGCCAGAAGGGTGGCGGCAACGGAGAGGCCGGCTCAGCCGCAGCCGTCGCGTAAGGCAGAGCAACCTCCATGGAAGAAGAAAGAAAAACCGGCGGCGGCCGTGACTTCCGATCAGTTGGCCAAAACCCGCGGCGGCATCGTGATAACAACTTGGCGTGCAAAACGAAAATAG MGFLREREIRAPRADLAKIGREGFELIDEYFGRAPAARRVAAKARPILPQPPRKAEQPPRKRTEKPAAAVKTSDQVAKTGGGIVITTWRANTRADLATIGREGFKLIDEFFGRAPAARRVAATERPAQPQPSRKAEQPPWKKKEKPAAAVTSDQLAKTRGGIVITTWRAKRK
BLAST of ClCG06G004950 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KG95_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G318690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.2e-29 Identity = 75/92 (81.52%), Postives = 78/92 (84.78%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004950 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KG95_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G318690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 7.6e-21 Identity = 59/84 (70.24%), Postives = 66/84 (78.57%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 103.6 bits (257), Expect = 2.4e-19 Identity = 64/89 (71.91%), Postives = 67/89 (75.28%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004950 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KI19_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G318680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 1.6e-15 Identity = 56/91 (61.54%), Postives = 64/91 (70.33%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004950 vs. NCBI nr
Match: gi|700192218|gb|KGN47422.1| (hypothetical protein Csa_6G318690 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.7e-29 Identity = 75/92 (81.52%), Postives = 78/92 (84.78%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004950 vs. NCBI nr
Match: gi|700192218|gb|KGN47422.1| (hypothetical protein Csa_6G318690 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 1.1e-20 Identity = 59/84 (70.24%), Postives = 66/84 (78.57%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.5e-19 Identity = 64/89 (71.91%), Postives = 67/89 (75.28%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004950 vs. NCBI nr
Match: gi|700192217|gb|KGN47421.1| (hypothetical protein Csa_6G318680 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 2.4e-15 Identity = 56/91 (61.54%), Postives = 64/91 (70.33%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |