Lsi03G006210 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTGGTAGGTTTTCTCCAAATTTCCATCTCCAAGGCACAAAACTCCCCTCAAGACTTCGTCGATACCCACAACGTCGTCCGAGCTGCAGTGGGTGTCGGTCCAGTCTCCTGGGACGACACCCTAGCCACCTATGCTCAGAATTACGCCGATAGTAAGATTGATACCTGCGAGATGGAGCACTCCAATGGGCCCTACGGTGAAAACCTCGCTGAAGGGTACGACGAGATGACGGCGATAGAGGCAGTGAAGTTCTGGGCGACCGAGAAAAAGTTCTACAACCACCATTTGAATCGGTGCATCGGTGACGAGTGTGGCCACTATACGCAAATAGTTTGGAGGGACACTAAAAACATAGGGTGTGCTAGAATGAAGTGTGAGAACAATTGGATTTTTGTGATATGCAACTATAATCCTCCTGGTAACTATATAGGCCAACATCCCTACTAAAATCTAAGTACGAGAGACTTTATAAGAAAGAATTAATATGATGTTCCTCTTGATAATATGCATTTATTTGCATCTATGTATTAGAATATTAAATAGTTACATGAAATATATATGTATATCAGTTATTATATGTCTTCATGTTTAAATTTGAGAGAAGTTACTTTATTTTTGCTATGGAGTAAAAAAAATAAAAAAAAAACAATAAATAATTTTATCTCCATTCTTAAAAGAAATTACTCGCTCATATTTACGTAGCTAATAAGGAGAAAAAATTAATTGCAAACTCTAATACTGGTTCTCGTAATAGATTAGTTAACATTTTGGTGGATCATTTATTTATATTGTTTTATTTTCCTAAATATTTTCATACATTCAATTAATTAAATAAAATCATAAAGTTTAATATCATTATATATGTTGCTAATATTAACATATGCACTAATAATTATATCAATTTGAATCTAAATTTTGGGATGCTAATGTATACTCTTATGGTTTAGAGGTTTTATATGAATTTAACCTATGCACTAATAATTATATCAATTTGAATCTAAAATTTTCACGAATATATCAATTTACACTCTTATTCAAAGTTAATTCATCCAAAAAAAATATTGGGTAGGATTTATAATTTTTTTTCAATTAAAATCTTAAATTGTCATAAGTGAATCACTATGAACCTTTTATTTAAATTACTTTTGAAAATCGTCCGTTTATTAATTTTTTTACACGCGTTTCTTCACATATTAGATTAAGAAAATGGACAATTAGAATTGTTACATGAACGATTTTAAAAAAAAAAAAAATCTTAATTGAGTGTTAAAATTAATTTGCAAAATTTAGGATTTTAAGTTGATAAAATTATATGTCTCACATACTATTTATCTAAATGGAACGTAATAAAGAGTATAGATTAATACATTTATAAAAGCTTAAATTTTAAATCGATACAATTATTTACTTAAAAACTTTTAATTGATACCATCCTAAAATGATATTTCTTTTTCTTATTTAATTGTCACGACATGAATATAAAACGATATATTTTTTTTGGTTGGTTATTAAATACGATGCAACCGAATTTTGTCAGAAAAATTAAAAGAGATATAGATGTGGCATTAATAGTTGTGAAGTTTAGTAAGTATATATAATTGTTGTCACCATCAAGTAGAGAGAGTTAATAAAGGGTTTGAATTTTCCTTCTGTTGTATTACAAGGACGACAAATCGAAAGAGTTACAGATATAAATTAGATCAGTTCTCTTAAATTGAATTAATTGGTGTTCATTCTAGAATTTAGAACAACCAAAATTTGTTTTTGTTAGTTTAATGAGACGGCAGATATATCATATAAGAAATAGAACAAACAAAATGATTGGAGCAATGTGTAGATTTTAACTAGAAATGTTAAGAAATAGATGTGGAACCTTTGCACATCCCCATGGTTAATAGATTTGATAGTTAATTTTTTTTTTTTTATTTTAAATAAGGGTAAAAGAATATCGGGATTTAACTTTTTTGTCATCTTATAAATTGGGTAGGTTTTATTAGTTTCTAGGAGGATAAGAATTATCTCTGGTACATTCCCTACTAGAAACGAGAGTTTGTTCTTACTAATAATCGTGGAGATGGAGGAAGGAATCTCTTACTTCAAGAGAAAATTACCCCTGAGCTAAATAAGTTTACTTTGGCCACAAGGTCACATAGTTGGATCTATTTGGTGTTGACCCACTCCTTTGTCACACTCTTACCTTTCCTCCTCAAATGAAGATATACTTCTCTTATCCTAGAGGCTACAATTGGGTACAACCCTATGTAGGCTTATAAAAACTTGAGAAAGGTCAAGAATGTAGGCTTCATAAAATCTTGTGAGAACCCGACCAACCTGGACCAACCTCAACCCTAGGTTGGGTTGGGTTAGATTTGTTTTCTGTTTGGGTTGGGTTAGAATGTAGGAGAATGAAAATTTTCGAGTTAGTTCTCGAGTTATTTGTTGTGTTCACATAATTAACCTAGTTGTTAATAATGGGCTAGAAGATATGCATGACTTTATAACTAGTATTTGCAAAGTAGTATGATAGCATACTATTGATGTCAAAATTTGGACAGGGTGAATAGTGCCATTTTGACAGAGACCTTTCTGGGCATCGTTTAATTCCCGAAAAACATTCCAATCAAAAGAAATTTATAATACAGTGAATCCTATACTACTACTACGATGACGTAATAATAGTGATAAGTTTGGGTCGAACCATAGGGAGACAAGCGGTAATGATGCTTTGTCGAGTTAATTATCAAATTAGCGCGTAAAATGAAGGGGGTTTGGATTGGAAAGAGATAAAAGCGTGCAAGAAAATAAAGTGGAAGGGTAAATGTAACCTAGGATTGGGTTTATTTAGTTTCGAGAGCAAGAGGGATCCTATGCAGTTTTCAATTATCAATTTCTGTTAATTAGACATGCATTTGATTTATGCGTGCACAACAACCTACATAGCCTAACCTTAACTCAAAGACACTACAAGCAGCTGAAAAGCTCAATTAAACTAAGCAAGCGTCCTAAATATTAATTAAAGTCAGACAACCAAGCTCAATTAACCTACATGCCCTTAAGTCTATTTGGTTCGATAGCGCCCATATAGAAACTAAAAACATGCGCATTAATTTTAAGGATTTTATTGTGTTGATTAACTAATTGGATAACCTAATCAATTAATCAAGTTTTCCTTTGAGCCTAGTTGAAACATGCATTCTAAGATCTAGGATAGCTATAAACCCTAGCATGCAAGATTCAACTAATTGCTACTTAGGTGATTAAGCTAGATGAACATAAGAGAAATACGCAAGCCTAATCTATTAGCTAAGACATACATTCATGATAGGGGTGTCAATCCACATAAAAACATACATCTAAATTGAAATAGATTCAAAGAAAGGCATGAAATCAAAATATATTCAGCACAATCCACAAAAATCTCAAGAAAACTACTTAGGTCTTGCTCCCAAAACCAAATAAATATACATACCTCTACAATCAATAGACAAAATATAGAGGGAAGCTCTAATTCATGAACTACAACCCAAAATAAAACTTAAATCTAACCTAAATATAGAAGAAAAGATGAAAGAGAAGAAGAAATTTTAGTATAACTTCGGCCTCCATGAGTTCCTTCATCCCCTAACCCTAAAAGAAAAGAAAGATATTTATAGATCTGGCGAGGGCGTCGTTATGCTCATGAAGAGCATAGCGACGCTGGCTTTTCCAGCTGCAGCGTAGCTACACTGCCTCCATTTTCGCCCAGCGCCAGCTATTTCTTTGGAACGCAGCGCAGCTACGCTGCCTCTAGGGGCATTTTAGCATTTTGCATCTTTGAATCTTCGAGTGTCCGATTTCACTTCCAATAACCCAAATCAACCCCAAACGGCCCATAACACTCTAAAATGCATGTTTTGCTCAAATTCCCTATAAAATAAACATTTAATCATATAAAACATAATAAGGAAGCTAGATTAAAGATATAAAAATAGCTCTTTTCAAGAGCTATTAGTGCCCAATCCTTTTGCAGCAACAACTGTGAATTTGTAATTCAAGAACGACAGCAACCTGGAAGACAAAAAGAATCTGTACATCGGTGTGGTGCTTTCCACATAAGACTCTGATGCTTACGTTAACAGGAAAACTATGGGGCAATAATAGAAATTTGGGGGTGAGTGGACTTACTTCCCTTAGGGTCTTCCCCGTTTATTTATAGAGCTTTTCTTGACCTAATTCCTTTCTTTCTAGGATTTATGAGTTATACTGTCAGCCAAATCTCTCTCCTTTGGCTGGATTTTCCAAATAAAACCTATTTGTGGTTAACCATTTGGGTCGACCCATGCCACCCCTTTCCTTTTGGCCTTGCGCCTTTTGGCTTTATTTTTTTGGCCTGTTACGTCATTACTTCCTTCATTATTTTACTCATTTGCCCTTGGGTCTAAAATTTTCCTCAACATTAGCCCCACTCCTAAGTTTGATCTGAAGAATTGGTATGTTCATCGATACAAACTTAGAAGTATTGTTCGATCCTTCGTCGCTTCTTTAATTGCTCTATCTTCCTTATTATATGACATACCAGTCTTATGTTGGTATAACCGTATCGAATTTGGCTAATCCAAAATCATTCTCAGATCTTTAGCCATGTTGGAAATATCTAGCCAGATTTCTTTTGGAAATCCGGTTAGATTCCAGGCGCGCATTAACCATAATTGAGTCGTTAAGCACAAAATTTATGTCATGCCCGTTCTTTTCCGAGGAGCATAGACACATGAGCTTGGCTTTTCTTCTATCAAGGATCATTCTCCTCTTCTCTAGACACGCGTAGTTGGGAATATTGGTTAAGATTTCGTTGGTCTCCATCCAGTTCCCTAATTTCCATCCTCCTATACTTAAGTAGAGTCAGCCTACCTGCCTTTCATGATGGGCTTTGACATTTTTCTTTAATTTGACCCGAGCGATTAACTCAGATTTTGGATTTGTAGTCTTGTTGATTACCTTGGTTTTCAATCAT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BLAST of Lsi03G006210 vs. Swiss-Prot
Match: PR1A_TOBAC (Pathogenesis-related protein 1A OS=Nicotiana tabacum PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 5.3e-40 Identity = 78/142 (54.93%), Postives = 99/142 (69.72%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. Swiss-Prot
Match: PR1B_TOBAC (Pathogenesis-related protein 1B OS=Nicotiana tabacum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 1.3e-38 Identity = 76/142 (53.52%), Postives = 97/142 (68.31%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. Swiss-Prot
Match: PR1C_TOBAC (Pathogenesis-related protein 1C OS=Nicotiana tabacum PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 160.2 bits (404), Expect = 3.8e-38 Identity = 76/142 (53.52%), Postives = 96/142 (67.61%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TrEMBL
Match: A0A067KWY2_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_09851 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 1.1e-76 Identity = 147/313 (46.96%), Postives = 192/313 (61.34%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K7N5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070232 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 1.7e-74 Identity = 140/171 (81.87%), Postives = 146/171 (85.38%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K6A0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070235 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 9.9e-70 Identity = 117/135 (86.67%), Postives = 126/135 (93.33%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K4C1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070225 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 230.7 bits (587), Expect = 2.5e-57 Identity = 99/132 (75.00%), Postives = 113/132 (85.61%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TrEMBL
Match: A0A103XME5_CYNCS (Uncharacterized protein OS=Cynara cardunculus var. scolymus GN=Ccrd_004588 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 224.2 bits (570), Expect = 2.4e-55 Identity = 128/321 (39.88%), Postives = 174/321 (54.21%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TAIR10
Match: AT1G50060.1 (AT1G50060.1 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein) HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 3.3e-40 Identity = 74/140 (52.86%), Postives = 97/140 (69.29%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TAIR10
Match: AT4G33720.1 (AT4G33720.1 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein) HSP 1 Score: 156.8 bits (395), Expect = 2.3e-38 Identity = 65/130 (50.00%), Postives = 91/130 (70.00%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TAIR10
Match: AT2G14580.1 (AT2G14580.1 basic pathogenesis-related protein 1) HSP 1 Score: 156.0 bits (393), Expect = 4.0e-38 Identity = 68/147 (46.26%), Postives = 97/147 (65.99%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TAIR10
Match: AT2G14610.1 (AT2G14610.1 pathogenesis-related gene 1) HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 1.2e-37 Identity = 67/138 (48.55%), Postives = 91/138 (65.94%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. TAIR10
Match: AT2G19990.1 (AT2G19990.1 pathogenesis-related protein-1-like) HSP 1 Score: 151.4 bits (381), Expect = 9.9e-37 Identity = 67/126 (53.17%), Postives = 93/126 (73.81%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. NCBI nr
Match: gi|659110139|ref|XP_008455069.1| (PREDICTED: basic form of pathogenesis-related protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 299.3 bits (765), Expect = 8.3e-78 Identity = 138/165 (83.64%), Postives = 149/165 (90.30%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. NCBI nr
Match: gi|1009121091|ref|XP_015877272.1| (PREDICTED: STS14 protein-like [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.1e-77 Identity = 148/335 (44.18%), Postives = 202/335 (60.30%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. NCBI nr
Match: gi|643728186|gb|KDP36354.1| (hypothetical protein JCGZ_09851 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 1.6e-76 Identity = 147/313 (46.96%), Postives = 192/313 (61.34%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. NCBI nr
Match: gi|778724756|ref|XP_004137080.2| (PREDICTED: pathogenesis-related protein 1A-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 2.5e-74 Identity = 140/171 (81.87%), Postives = 146/171 (85.38%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006210 vs. NCBI nr
Match: gi|659110137|ref|XP_008455068.1| (PREDICTED: basic form of pathogenesis-related protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 274.2 bits (700), Expect = 2.9e-70 Identity = 119/135 (88.15%), Postives = 126/135 (93.33%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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