Cucsa.149750 (gene) Cucumber (Gy14) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGAGGAGAGAAAATGGGACCGAGACTATCTTGCTTTAAGATAAAATTAGCTTGATACACCCTCCGTTTGCTTCTTTTTGTAACATTGCCTCAGAATTCCACTAGTCTGATTCTCACTCCGCCCGTTTTTACTGTTACCTGACCCCAAAATGTTCGCTACGGTGGTTCCTCGATTCTCAATTCTCCTAATGCAGAGCCGCTCCGATTCTAACCCTCGCCGTGGTTTTGGAAACAAGGAAGACAATAAAGTACGTATACCCATGTTTATGGTGCATTTTTAGTTACAACGGCTTCCTATCTTGAAAATTTACTGTAGATTGGCACATGATTGCGCTCATTTTTAGATATCATGCTATCCTTGATTTTCGATAGGAAGCCTAGTTTGACCATTGCTCGTGTGCATGGTTTTGGTTGAATTATTTATATGAGTACGTAGTGATTTGGTATAAGATAAAAATTTGTTTATATGTTTTGGATAGCAATTTTCTATTCAAAAGGAGTTTCTAATCTAGAATAGTAGAAATTTCTCAAGTATCCAATGCACAACCCCACATTGTAGAAGCAAAACGCACAACTACAATAGTTAGTTAAGATTCTTTCCATTACAGTAGTCCATGATGATACACGTACGCCAATTTAAAGAGAGGATAAAAGTTGAGGTTCTATGCATAAAGTCTTATAAGTCTGAAGTTAATTTATTGGAGTTTGGAAGTTTGTGTTTGGGTGCAAAATTGTAAGATGGAGTTTGTCGACAAATGTGAAAGGTAGAGAAAGCAGGGAAGGTGTTAACTATTGAAATTGTGTTGTTTAACACCAACTTAAGGGTCAAGAGGCTCCTAAGTGTCAATCCTTCCTATGGCTTGTTCAATATTTCTTTGTTTGTGCTATTGATTTGTCCTTCTTCATTACTTGTTCCTTCGACTGTTTCTTGTAGAATCTGTGCTAGGCTGATTCTATAAGCCATAGCGACCAAGTTTTGTGATTTTGCCTTGTGGTTGTTCTGTTATTTTCTGCTATTCTCTCTTTTACACCAATAGACAGAGGGAATGAGTATTTTTCCATGGTCCGTCTCTATCCACCTAAATCCCCATATGCAGTTATATAGTTGTATCAAAATTCCTCTCCCGTGACTTCAAATTGTTAACTGAGCTATGGGCATGATCATTATGGTTGAATTCCTTTTCCCCCCTCTTAATTGATATTATTAATATTCAATTCAATTAATTTGTTTAATCCTCCAATTAAGGCATTATTAACTCATTTTGTTATTTTACACTTAGGCTGACAAAGCCGGCAGCTCGGGCAAGGAGAAGGGTAGGGTGTATCAACCAAGGTATTCAAAATTAGTTTAGTTTTTTTGAAAACTTGAAATTATCGTTTGTGGTTTAGAAATATATTGAATATATAAATAAAGAAAATATCCTTCACTAATTACAAATGATAGTGTGTAATGAGTAAAATTAAAAGGGGCCGTTTGTTTAAGTTGGTGTCAGTTGGATCTGGTAGAACGGGTAACCTCGTTGAGCTGCTCTAATACATCAAAGAGAGAGAGAAAATAATAAAGAAGAGAATGTATCAGATACCTATTGGCACTTAGCTAGGTATTGATATTGTCACCCTTTCTAATAGAAAGAAATCGACTAATTGAAAGAATACACTCTAGTAGAAGGGTTGACTGGATTGATTACTGCACAAGAGTTGACATTATCCTTTTACTTGACATGCTCTCTATATGGTGTTTTATTTTACGCTCTGTCATCTTCTAATCTAATGAATTGGGGATAAGAGCTGATCAATTTTTATGCCTTTTCACATCCGAAGTATCTTCTCAATTTATTTTCACTTTTGATGACTGTGCTAATAATGTGTTTCCCTCTGCTTTGGACTCACTGCTGATGTAGGAAACCCATTCCAAAACAATCTAGTACAGTACCCACACGTAAGTGTAACTCATTTTCCTGTAAGTTTCTTCATTATTTTCTTCCTTTTCTTTTATGATCTCTTAATCGAATGGTTTCTTCGTTTTTCCTGTACGTACATTAGCTATGCGGGGACTTGGATAGCAGGGGAGCCTCTAGGCTTTTCTTGGTGAGGTGAGGAAGTGACTGAGGGAGAATTGGAGCTTTTGTTTTTCTTTGAAACGGAGACAAACTACTTTATTAGTAATAACAACTCAAAGTACAAGGGAGTTATACAATGAGCGTAATAAAGAAGCCTAGAGAGCAATAAGTGAGGGAGGATCAGAAGGTGCACTCGGACATCTCAACTAGGTTGACACACCCTTAGCACTAAAACAACATATCCCAACTAAAGCTAGAAAATAAAATATGCCAAAATACAATGGAGACATAGTCCAACCTAATGCAAAGAGCTGAGACAGAGAAATAAAGAAATAAAAGGGAAATTGGGTGCACACAGCAGTATAAAGGCTGAGCCTATAGACAAAAGCAAAAGTTTCTATTGTGTAAACTAGACCAAAAGAAAATGTAGGCTATGCTCCAAAGAAGGCCGGCCAGAGAGGGGAAAACAAAGCTGTCAAAATGCAAAACAAAGTAACGAAAACAGACAGGGCCTAGGGGACTGGTTGAAAGATAAAGACTGCCCAGTTGAGACAAGGAACTTGAGTGTAGTAATTCACAAACTGATTGTTTAGAGAGCACCAAGCTAGTGCATTGCGTTCTTTTCAAAGACACAAATTGCGGAACTTCCACTGAAAGAGAAATACCTAAATCTCTTCTCCTTTTATTACATTATCTCCTTACCCTTTTTTTAAAGGTTAAACTGCCAACCAAGGTATTTCCAATTGCAACAAAAGCAACCTTGCCAAAATCGGACGTTGAAATTATAGCTACTGAACGCTTGTTCTTTGTGAAGACATTGCAATACTTGCTATTGACAGCAATTGGATTAACAGTATACAGGCATCCAAGTATGTCTACAATTTGTTCAACGAAACCAGAGACTAGAAAATGAAGCGATGAAAATCTTTGCAGAATCTGGTTTTCGATGATCATTACTATTCCTCTGAACATTGTTATCCATCGTGCGATGTGCTCGAGGGTTATTGTTCTTGCTAAAGGGAGCACTGCTGGGTTGAGGAATAGACACACTAGTCGAAGAGCTTTCAATGCGAATGACACGTGTGAAAGCATCATCTAATGATGGAATCTTAGAGTCAGAGAGAATATGTGCCTTTGCCATTCCAAATTCAGGTAAGAGTCCATTAAAAAAGATCATAACAACCATCTTCTTTCGTCGAGCTTGTTGAACTTTAACATCAGGACTAAAAGGTAACAATAAGCCAAGCTCGACAGTTATTTTCTTAAGCCGCATAAAGTAGCTGGTGATAGACTCAACTTTTTGTTCAGCACGAAAAAATTGCATACAAACTTCAAACATTCTATGTACTTGCTATTTGCCTAAATATAGAAAATCTAAAAATTCCAGAAGTTCTTTAACAGTCACAATGATCAACCAATCCAATTATCTCACTCTCAATTGAGTTTTTGATATGAAGTTCTTCGGTCGCATAAAGTAGTTGGTGATTTAACAGTCAGAAGTTCTTCGGTCGTATGATCATTCATCTAAGTACTTCTCAAATAAAACAAAATTGTTCGATGTCAATCCTAATATTTAGATCCATTTAACTTATGTTCTGTGATCTTAGAGGCTAAGGGAATAATGTTGGAGACTACCAATTTTTTTATGTCGGCAATATTGAAGTCACACACTGATTGTAGTCTACACAAACAAAGAAAAAGTCAATCCAAACAACTGCAAAACTGAAGAAGACCCTAAAACAATGGCGTAATCTTCAGTTTTTGTCAAACCCCAATACTATTTGATAGACCCAACGGTATAGACTGACTGGAAACAAAGGTTCGAGACAAGCCTAGAAGATGGAGGTCAAATCGGAGTCCTCAAGCGCTCTCGCACGCCTGCACGTGGATGAAGTACAGGGAGATTTCGGCGGCGTGTGAAGATCACGCGTGGTGTTTCCCGACGATCGGCAAAGACAAACTTGGATGGACGGAGGTGGCGCTTCTTATGGTATGGGCGGTGTCGACAAACAGCCACATGAAAATGATCTAAACTTAAGCCCTAATGGATAACGAAGCCACCAACTACGATATTCCAAACCCTAATGGCTCTGATATCTTATTCATGTAGTGTCAGAGTAAAATTACATATATAGAGAGAGAGCAAATAAACCCCACTGTATGTACAATTACGATAAAGGACATATATTACTTTTCTCTGAATTATTGACTACATGGTATCAGAGCCATTAGGGTTTGGAATATCGTAGTTGGTGGCTTCCTTATCCATTAGGGCTTAAGTTTAGGTCATTTTCGAGTGGCTGTTTGTCGACACCGCCCAACTCATAAGAAGCGCCACTGCCTTCCGCCTCATTTTGTCATCGCCGATCGTCGGGAAATGTTGTGCGTGAGCTTCACCCACCGTCAAAAAATTTCTGCACAGTCTCCATGCGTTGGTGTGAGGGAGTGCATGAAGCGTCCGATTTGATCCCCGTCTTCTGGGCTTGTCTCAAATCCTATTTTCTGGTCCGTCTGTGCAGTTGGGTTCATCAATGATTATTCGAGTTTGACGAAAATTGAAGACTAAGAACTCGTTCTAGGGTTTGTGGCTGTTTTTGTTCAATTTTTTCGCTGTTTGGATTGATTTGTTTTGCTTGTATGGACTACAATCAGCGTGCCTCTAGTATGGCCTACATAAAAAAATTTGGTAGTTTCTAACGTTATTCCCTTAGCCTCTAAGATCACAGAACATAAGTTAAATGGATCTAATTATTATAATTGGCATCAGACAATTTTGTTTTATTTGAGAAGTACTGATATGGATGATCATATGACCGAAGATCCCCCAGAAGATGTAAAGAAGAAGAAAGATTGGTTTCGTGAGGATGCCCGTCTATATCTTCAGATCAAAAACTCCATTGAGAGTGAGATAATTAGATTGGTTGATCACTGTGAG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CGAGGAGAGAAAATGGGACCGAGACTATCTTGCTTTAAGATAAAATTAGCTTGATACACCCTCCGTTTGCTTCTTTTTGTAACATTGCCTCAGAATTCCACTAGTCTGATTCTCACTCCGCCCGTTTTTACTGTTACCTGACCCCAAAATGTTCGCTACGGTGGTTCCTCGATTCTCAATTCTCCTAATGCAGAGCCGCTCCGATTCTAACCCTCGCCGTGGTTTTGGAAACAAGGAAGACAATAAAGCTGACAAAGCCGGCAGCTCGGGCAAGGAGAAGGGTAGGGTGTATCAACCAAGGAAACCCATTCCAAAACAATCTAGTACAGTACCCACACAGGCACCTGCTGTGAGTTTCCGTAATGATGGAAATTCTTATAACAAATCTTTGGACCTTCAATTCGAAGAGCGACTTGAAGCAGTTAAAAGATCAGCACTTGAAAAGAAAAAGGCAGACATTAAAAAAGAATTTGGAGCAATTGACTATGATGCACCGGTGGAATCGGAAGAGAAAACAATTGGACTTGGTACCAAGGTTGGAATAGGTGTCGCTGTTTTGGTCTTTGGCTTTGTTTTTGCGCTCGGAGACTTTCTGCCCTCTGGAAGTACCGGTCCTGTTAAGGATTCTGTGGTGGAAAATATCAAACTATCGAGAGAAGAAGAAAGTAATCTTAAGAATATGCTCAAAGAATACGAGGTTACACTTCGTAGCAACCCAAAAGATCCAACTGCTTTGGAAGGTGCGGCAGTTACCTCAGCTGAATTAGGTGAATATGCACAAGCAGCCTCTTTGCTTGAAGACTTGATAAAGGAGAAGTCGGATGATTCTGACATTTTCCGCTTGCTTGGGGAAGTAAAATATAAGCTTAAAGATTATGATGGGAGTGTTGCGGCTTACAAGAGTGCCACAAAGTTATTTGAAGATGTCAATTTTGAGGTTCTACGTGGCCTTACAAATTCACTACTTGCTGCCGGGAAACCAGATGAGGCTGTTCAATTCCTTTTGGACTATCGGGACAATCTTAACAATGTAAAATTAGGAGAGGGCAAGGAAATGGAAACAAAATTATCGATTGATCCTGTACAAGTTGACTTACTACTTGGAAAATCGTACTCAGATTGGGGACATGTTAGTGATGCTGTATCTGTTTATGATCAGCTTATCTCCAGCCACCCTAATGACTTCCGTGGTTACTTAGCTAAGGGAATTATTCTAAAGGAAAATGGTAGGTCTGGAGATGCTGAGAGGATGTTCATCCAAGCCCGATTCTTTGCTCCTGAGAATGCCAAGATGCTTGTAGATCGGTATTCTAGATGACCTTAGCATCTCCTACATTACGTTTATAGTTTGTATACACAATTATCATTTATCACCATAAGTTTTGGTTCTACGATGTGAAAATCTGAAACGCAGAATGTGCGTTTTGCTGATGTACAAAAGAAATTTGTAAAAAAGTTGTATTTCATGTATATAATACATATATGTATG ATGTTCGCTACGGTGGTTCCTCGATTCTCAATTCTCCTAATGCAGAGCCGCTCCGATTCTAACCCTCGCCGTGGTTTTGGAAACAAGGAAGACAATAAAGCTGACAAAGCCGGCAGCTCGGGCAAGGAGAAGGGTAGGGTGTATCAACCAAGGAAACCCATTCCAAAACAATCTAGTACAGTACCCACACAGGCACCTGCTGTGAGTTTCCGTAATGATGGAAATTCTTATAACAAATCTTTGGACCTTCAATTCGAAGAGCGACTTGAAGCAGTTAAAAGATCAGCACTTGAAAAGAAAAAGGCAGACATTAAAAAAGAATTTGGAGCAATTGACTATGATGCACCGGTGGAATCGGAAGAGAAAACAATTGGACTTGGTACCAAGGTTGGAATAGGTGTCGCTGTTTTGGTCTTTGGCTTTGTTTTTGCGCTCGGAGACTTTCTGCCCTCTGGAAGTACCGGTCCTGTTAAGGATTCTGTGGTGGAAAATATCAAACTATCGAGAGAAGAAGAAAGTAATCTTAAGAATATGCTCAAAGAATACGAGGTTACACTTCGTAGCAACCCAAAAGATCCAACTGCTTTGGAAGGTGCGGCAGTTACCTCAGCTGAATTAGGTGAATATGCACAAGCAGCCTCTTTGCTTGAAGACTTGATAAAGGAGAAGTCGGATGATTCTGACATTTTCCGCTTGCTTGGGGAAGTAAAATATAAGCTTAAAGATTATGATGGGAGTGTTGCGGCTTACAAGAGTGCCACAAAGTTATTTGAAGATGTCAATTTTGAGGTTCTACGTGGCCTTACAAATTCACTACTTGCTGCCGGGAAACCAGATGAGGCTGTTCAATTCCTTTTGGACTATCGGGACAATCTTAACAATGTAAAATTAGGAGAGGGCAAGGAAATGGAAACAAAATTATCGATTGATCCTGTACAAGTTGACTTACTACTTGGAAAATCGTACTCAGATTGGGGACATGTTAGTGATGCTGTATCTGTTTATGATCAGCTTATCTCCAGCCACCCTAATGACTTCCGTGGTTACTTAGCTAAGGGAATTATTCTAAAGGAAAATGGTAGGTCTGGAGATGCTGAGAGGATGTTCATCCAAGCCCGATTCTTTGCTCCTGAGAATGCCAAGATGCTTGTAGATCGGTATTCTAGATGA MFATVVPRFSILLMQSRSDSNPRRGFGNKEDNKADKAGSSGKEKGRVYQPRKPIPKQSSTVPTQAPAVSFRNDGNSYNKSLDLQFEERLEAVKRSALEKKKADIKKEFGAIDYDAPVESEEKTIGLGTKVGIGVAVLVFGFVFALGDFLPSGSTGPVKDSVVENIKLSREEESNLKNMLKEYEVTLRSNPKDPTALEGAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKLGEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR*
BLAST of Cucsa.149750 vs. TrEMBL
Match: A0A061G9M3_THECC (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_027744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 490.3 bits (1261), Expect = 2.1e-135 Identity = 251/380 (66.05%), Postives = 306/380 (80.53%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TrEMBL
Match: A0A067JYF7_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_22575 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 487.3 bits (1253), Expect = 1.8e-134 Identity = 259/390 (66.41%), Postives = 301/390 (77.18%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TrEMBL
Match: D7SS20_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_09s0054g00720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 486.9 bits (1252), Expect = 2.3e-134 Identity = 254/382 (66.49%), Postives = 299/382 (78.27%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TrEMBL
Match: B9HK22_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0008s00440g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 476.9 bits (1226), Expect = 2.4e-131 Identity = 251/389 (64.52%), Postives = 303/389 (77.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TrEMBL
Match: A0A059AJJ2_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_J03184 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 475.7 bits (1223), Expect = 5.4e-131 Identity = 250/379 (65.96%), Postives = 302/379 (79.68%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TAIR10
Match: AT1G78915.3 (AT1G78915.3 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 424.5 bits (1090), Expect = 7.2e-119 Identity = 220/400 (55.00%), Postives = 287/400 (71.75%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TAIR10
Match: AT5G02590.1 (AT5G02590.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 6.7e-08 Identity = 60/236 (25.42%), Postives = 98/236 (41.53%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. TAIR10
Match: AT2G37400.1 (AT2G37400.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 4.4e-07 Identity = 52/219 (23.74%), Postives = 99/219 (45.21%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. NCBI nr
Match: gi|449453336|ref|XP_004144414.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101220521 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 760.0 bits (1961), Expect = 2.0e-216 Identity = 389/389 (100.00%), Postives = 389/389 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. NCBI nr
Match: gi|659130317|ref|XP_008465106.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103502794 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 728.8 bits (1880), Expect = 5.1e-207 Identity = 373/389 (95.89%), Postives = 380/389 (97.69%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. NCBI nr
Match: gi|1009113967|ref|XP_015873431.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107410514 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 491.1 bits (1263), Expect = 1.8e-135 Identity = 261/398 (65.58%), Postives = 313/398 (78.64%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. NCBI nr
Match: gi|590616926|ref|XP_007023644.1| (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 490.3 bits (1261), Expect = 3.0e-135 Identity = 251/380 (66.05%), Postives = 306/380 (80.53%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.149750 vs. NCBI nr
Match: gi|802742387|ref|XP_012087305.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105646135 isoform X1 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 487.3 bits (1253), Expect = 2.6e-134 Identity = 259/390 (66.41%), Postives = 301/390 (77.18%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Gy14)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |