CmaCh14G011820 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTGATGGATTTTACAGCGAACGCGGAGAGCAAAAATTGGGGACAGAATCCATCTCGCTTTCTGATAAAAATTAGCCGGACACCATTTCGTTTCTTTCCCCTGTTCTGATTCTCACTCCGACTGGTTCTGCTGTTGATTGACCGTAAAATGTTGATTTCGCTGGCTTCTCGATTCCCAATCCTTGTAATGCAGCAGACCCGCTCCGACTCCAACCCTCGGCGCGGGTTTGGAAACAAGGAAGACAATAAAGTACGTATGCATGTTTATGGTGTTTTTTTTTTGAGTTGCTACGGCTTTTGTATCTTGAAAATGTACTGCGGATTGGATATATATGATTGCGCACATTTTCCCTGGTTACTTGCGAGGTTTCTGAATTATCGTATCCGGCTATGGTTGTTTCGTTATTTTGAGCTCCGATTTGACCTCTGTTTTTTATACGCATAAGTTCTGGGCCGATATGAATCTCGACTACTGAACACACATAATCACGCATGGTTTAGTGGAAAAATAAATTGAATTGTTTCTATTTGAGTACATGGTGGATTGGTTATTGTAATTTAGTATAGTTTAAGATTTTATTTTGAATCTGTAATTGTTTTGAACATAAATTTTCTTTCGAAAGGAAGTTTTTAATTTTGATCATGACTACGGTTGGAGTGGAATCTGATTATTACACTGACTAATGAAATTGTTGATTTAAAAAAGATTTGTTTTCATGAGAGTAAAACAGCATAAAGTTTCATTAGATTTCCTGCTTCCTCAATGTTATCATAAATTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAATCTTGCTCAAAACATCTTTCCGTGACTGTCTTGAGCTATAATTTTAATGGGATTCGTTCAAAGCACACAAGCTTTCTTCGATCAAAGTGCTCAACTTAGAATAATAGAAATACCTCAAGTCTCCCATGTACAACCCCACACTTTGGAAGCAAAAAGCAGAACTACAGCAGTCTGTTAAGATTCTTTGCATTACAATAGTCCATGATACGCCAATTCAAACAGAGAACGAAAGTTGTGGTTCCGTGCATAAAGTCTCAAGTGTCAGTCCTTTCTATAGCTTTGTTTAATATTTCTTTGTTTCTGCTATTGATTTGTTCTTTTTCGTTACTTGTTACTGATTTGAATGCAAGCTCGTAGGATCATTGTTAGGCTGATTCTATAGGCATTGCGAGCAAATTTTGTGATTTTGCCTTGTGGATGTTCTGCTATTTTCTGCTATTCTCTCTTTTACATCAATAGACGGAGGTAATAAGCTGTATTTTTCGATGATCCATCTCTACCCCACCCAAGTCCCCGTGTGCAACAATTCTATAGTTGCGTTCGAATTCCTCTCCCGTGTTTTCAAATTGTTAGCTGAGCTATAGCCATCATCTGCTATCTTATAGCAGTATGGTTGGGTTCTTTTTCCTCCCTCTGTTAATAGATATTATTAATATGCTATACAATCATTTTATAATCATCTATTTTTTTCGGGCATCATTAACTCCGCTTTGTTATTATACACTCAGGCCAACAAAGCTGGCAACTCGAGCAACCAGAAGGGTAGGGTGTCACAACCAAGGTATTCCAAAATAGTTTAGTTTTTTGAAAATTTGAATTTATTTTTTATTGTGTTTGAAACTTTGTGCTTTACTGCTTGTTGGGCGTTTTCAGTTATTGCACAATGTTGATGCTTTCTAGCATTCTCATTCATTTCACATACAGACACATTCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGCATATCTGCATTGCTNNNNNACATTCTTTTGACATCTTTAAGAATCAACAAATTTTTGCTACTGTTCTGGAACAACTTTTGCTCTGCCATTGATGTCTAATCCTACACTATTTTTTCTTCTACTTCTACACTTACTGAAATTATTTTCTTTCTTAAACCATCATCCTTAAAGTTGCTGACACACTACAAGAACTTTAAAAACTTGAAGAGCATAACCACAAAATCAGTAAAAGAGAGAATAGCAAACACTGAAATGTCAAACACTGAAAGACAAATATTGTCTTTGATTTTTTTTCCTTTCTTCCAACCAACTCCTCTAGTTTTATTTTTTTTCCTCTCCCTTCACACTTAAAACTTTCTTTCCAAATATTTACAATAAAGAACACTTATTTCTTATCTTTGATTCATTGAAAGCCATCCACCATTGACCTATTGAATGATAAGGAGTAGCACCAACTAAATGCGTGAAGACGGAAGATCACCAACTTGAAGACACAAGATCCCTAAAATTGAACTCCTCTATATGGGTAAACATCGACTACAAATGAAGTGAAAGCCCTTTACAAGAGGATATTCAATAACATATTGAATATCTAAATATATAAAAAAGAAGAAGCATCCTTCTCCTATTACAAAAAATTGTGTGCAATGAGAAGTAGTAAAAGGGGTTGTTTCTCTAAGTCGATGTCAGTTGAATCTGGAAGAACAGGTAATCCCATTGAGCTGCTCTTGTACGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANGAGAAAAAGAATGAAGAAAAAGAGAGAAAGAATAGCAAGTTAGTGACCTTGTCCCCCTTTAGAATTAAAAGTAACTGACTAATTGAAATAATACACTAGTAGAAGGGGTGACTGGATTAATAACTGTACAAGGCTGGACATGCTATCTATATGGTGTTTAATTTTACACTGTCATCAGCAACTGTTCTCTAATCTAATGAAAAATTGGGGATAAGAGCTGATCAGTTTTTATGTTTTTGCAATCTCCAAATTATCTTCTCAATTTATGTGAGTTTCACTTTTTGGTGACTTTGCTAATTTTGTGTTTTCCTTTGCTTTGCACTCACTGCTGATGTAGGAAACCAATTCCAAAACAATCCAGTACAGTACCCACACGTAAGTGTAACTAATTTTCCTGTAAGTTTCTTCATCATTTTCTTCTTTTTTCTTTTTTTGATCTTTTAATTGAAAGGCTTATGTAATTTTACATTTTTGCGGTACGTGCATTAGTTCTGAGTTGGCGGGCTTGGATAGCAAGGGAGCTTCCATGCTTTCCTTCGTGAGGTGAGTAAGTGACTGAGGGAGAGTTGGAGCTTTTATTGATACTGATGTCTAAATGCTGAAAGCTAGGTGTTATAGAAATTTAGATTCAAAAGACAACAACCCACCAAGACTAATGTATCTTTAACATTATCCTTGAACGACCATCAAACAGATGTGTGAATGTGTTAGACCCCCAATTGTGAATACTTCCTCTTGGAGGGACAATAAAGGGAAAACACCTAAGGAAGTTTGTTAGAATGCATGTGGGTGTTAGTGGAACGTGGAGTATAGGTAGCCCAGTGTAGGTGTATGTCTGGCTATTGCATTTGGGAAGGTTTATGTACGCTTTGTTTGTAGGGTTTTGGGTAGGAAGTATTTTGTGATAGAACAATGTTCGAAGGGAGAGATTACCAACCCTCTCGAAATGGACTGGGTGTTCTGGCTCTTTTACAATCATTTTTCCTACTTGTAATATCAATATATCTTGTAAGGAAGTTGAACCCTGGCAAGTGGTATTAGAGAACGTTCAATCTTGGGGAAGATTGGGAAAATGGCACAATAGAAGATCAATGAAAGGCTGGATTCAACAGAGAAGAGTTAGGTGGAATCCATGAGACTGCGATAGAGAAAACAATGGATGCCTTGGTAGTAGAGATGAAGGAGAATCGAAGGACCAGCGAGGAGACGAAGAAAGCTTTAGTTGAATCGCAACATTTGTTGAATAAGCTTGCCATGAAATAGCTATCTGTAGGGAAATCTCGATGTCATTTGTCACAGAGACATCTAGTGGAAAGAGAAAAGTTCATGAAGAAGAAATATAATTGTTCATTTGGCACAAAATAAAGGAAGATGAAACCTCCTTGAAGAAAAATATGGGTATACAACAAGATCAAATCAAGTTTAAGAAGGTGGTAATGCTTGTGTTCTCAGCTGAGAATCTGGACAAATGGATGTTCATGGCTTTGCGTTACTATCAGATTCACTAGTTATCGAATGAAGAAAAGCTCATTGTGTCTGTTATGATTTTTTTAGGGAAGAGTGCTTAATTAGTTCCGATTGATTATGAATGAGGGGATGAGTGACTGGAGTGACCTAAAGAGAAAAATGTTTAAGCGTTTTTGGCCACTGCAGGAAGGAGCATTATGCACACATTTTTTGGCCGTAAAACAAGAAGATAAGGTGGCGGATTACTGAAATCAATTCAAAGAACAGACAGCACCTTTACAACACTTGACAGATGAATTGTTGGAAAAATCCCTTCACTAACGAATTGGACTCAGTGGTAAGGACTGAAGTTCTTTTTTTCAAAGGCCTGCTGGGCTAGATGATATCATGGATACAACCCAGTTGGTCAAGGGTCGTATAAAAAATACAACAAAAAAAGCCGAGGACCCAGCTGCATACAAGGTTAGTAAATTCTCACCTACTTAATACCCAAGTGCCCAAAAGAATACGACCAAATCATTCCAATCGCGAGGAACCTCCATTCAAAAGATAAACAGACTATAAATTCCAATGGCTGGGGAGTGGAGGCAAATGACCAGAAAATTGGAGCTATGGTGTAATGTCTAGTTGCAACGATGTGGAAGGAATTCTGTGGGTTCCTGGGCTTGATAGGATACTAAGGACGATTTATGGTCAATTATGGAGAAATCACAGCCCCCTGCATTAGTTAGCGAATATGAATACCTGGGTTTGATCGGATACTAAGGACGATTTATGGTCAACTATGGAGAAATCATGGCCCCCTGCATTAGTTAGCGAGTACGAATACGTTTGTGTGGAATGAAGAAGCAAGCATTGCTCAAGCCCAAGAATGCTATGAAGACACTACCAATGCTAGCTTTGCCCAATTTCTCCATTTCGCTTATGATGGATACTGATGTGTCTAGCACAGGGATCGGGGCCGTTTTGT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ATGTTGATTTCGCTGGCTTCTCGATTCCCAATCCTTGTAATGCAGCAGACCCGCTCCGACTCCAACCCTCGGCGCGGGTTTGGAAACAAGGAAGACAATAAAGCCAACAAAGCTGGCAACTCGAGCAACCAGAAGGGTAGGGTGTCACAACCAAGGAAACCAATTCCAAAACAATCCAGTACAGTACCCACACAGGCTCCTGCTGTGACTTCCCGTTACGATGAAAATTCTTATAACAAATCTTTGGACCCTTCATTTGAAAAACGACTAGAAGCAGTTAAAAGATCAGCACTTGAGAAGAAAAAGGCAGACAATAAAAAAGAATTTGGAGCAATTGACTATGATGCACCAGTGGAACCGGAAGAGAAAACAATTGGACTTGGTACCAAGATTGGAATAGGTGTAGCTGTTTTGGTCTTTGGCTTAGTTTTTGCTCTCGGAGACTTTCTGCCCTCTGGAAGTATCAGTCCTGTTGAGGATTCTGTGGTGGTAGATAACAAACTATCGAAAGAAGAAGAAAGTAATCTTCAGAATATGCTCAAAGAATACGAGGTTACACTTCGTAGCAACCCAAAAGATCCAACTGCTATGGAAGTGAGTGATCTTTCTGTTGCTCGGCCTTCTAATAGTTATGATTTTTGTACTACAGTTTTCTGCCACCTATCTCAAGTTTTTGGCATAGTGGGGGCGGCAGTTACCTCAGCTGAATTGGGTAAATATGCTGAAGCAGCCTCTTTGCTTGAAGATTTGATAAAGGTGAAGTCAGATGATTCTGACATTTTCCGCTTGCTTGGGGAAGTAAAATATAAACTTAAAGATTATGATGGGAGTATTGCGGCATACAAGAGTGCCACAAGGATATCTGAAGATGTCAACTTTGAGGTTCTGCGTGGTCTTACAAATGCGTTACTTGCTGCTGGGAAACCAGATGAGGCTGTTCAATTCCTTTTGGACTCCCGTGAACGTCTTAAAAGTGTACCATTAGGAAGTATGGCTGAGGGCGAGAAGATGAAAACAAAATTACCGATTGATCCTGTTCAAGTTGAGTTACTGCTTGGAAAAGCGTACTCAGATTGGGGACATGTTAGTGACGCTGTATCTGTTTATGATCAACTCATCACCAGTCACCCTAATGATTTCCGTGGTTACTTAGCTAAGGGAATTATTCTGAAGGAAAATGGCAGCGCTGGGGATGCTGAGAGGATGTTCATCCAAGCCCGATTCTTTGCTCCGGAGAATGCTAAGATGCTTGTAAACCGGTATTCTAGATGA MLISLASRFPILVMQQTRSDSNPRRGFGNKEDNKANKAGNSSNQKGRVSQPRKPIPKQSSTVPTQAPAVTSRYDENSYNKSLDPSFEKRLEAVKRSALEKKKADNKKEFGAIDYDAPVEPEEKTIGLGTKIGIGVAVLVFGLVFALGDFLPSGSISPVEDSVVVDNKLSKEEESNLQNMLKEYEVTLRSNPKDPTAMEVSDLSVARPSNSYDFCTTVFCHLSQVFGIVGAAVTSAELGKYAEAASLLEDLIKVKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSIAAYKSATRISEDVNFEVLRGLTNALLAAGKPDEAVQFLLDSRERLKSVPLGSMAEGEKMKTKLPIDPVQVELLLGKAYSDWGHVSDAVSVYDQLITSHPNDFRGYLAKGIILKENGSAGDAERMFIQARFFAPENAKMLVNRYSR
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TrEMBL
Match: A0A061G9M3_THECC (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_027744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 7.9e-128 Identity = 259/425 (60.94%), Postives = 312/425 (73.41%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TrEMBL
Match: W9SDR6_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_001367 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 458.8 bits (1179), Expect = 7.4e-126 Identity = 257/429 (59.91%), Postives = 309/429 (72.03%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TrEMBL
Match: D7SS20_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_09s0054g00720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 454.9 bits (1169), Expect = 1.1e-124 Identity = 258/412 (62.62%), Postives = 301/412 (73.06%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TrEMBL
Match: A0A067JYF7_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_22575 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 6.9e-124 Identity = 256/408 (62.75%), Postives = 296/408 (72.55%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TrEMBL
Match: A0A067DFI2_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g015907mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 446.8 bits (1148), Expect = 2.9e-122 Identity = 251/412 (60.92%), Postives = 304/412 (73.79%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TAIR10
Match: AT1G78915.3 (AT1G78915.3 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 391.0 bits (1003), Expect = 9.6e-109 Identity = 219/440 (49.77%), Postives = 292/440 (66.36%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. TAIR10
Match: AT2G37400.1 (AT2G37400.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 1.1e-06 Identity = 43/178 (24.16%), Postives = 80/178 (44.94%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. NCBI nr
Match: gi|659130317|ref|XP_008465106.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103502794 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.8e-173 Identity = 336/423 (79.43%), Postives = 364/423 (86.05%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. NCBI nr
Match: gi|449453336|ref|XP_004144414.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101220521 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 608.6 bits (1568), Expect = 8.3e-171 Identity = 330/423 (78.01%), Postives = 361/423 (85.34%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. NCBI nr
Match: gi|590616926|ref|XP_007023644.1| (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 1.1e-127 Identity = 259/425 (60.94%), Postives = 312/425 (73.41%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. NCBI nr
Match: gi|1009113967|ref|XP_015873431.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107410514 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 459.5 bits (1181), Expect = 6.2e-126 Identity = 258/424 (60.85%), Postives = 315/424 (74.29%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh14G011820 vs. NCBI nr
Match: gi|703070286|ref|XP_010088748.1| (hypothetical protein L484_001367 [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 458.8 bits (1179), Expect = 1.1e-125 Identity = 257/429 (59.91%), Postives = 309/429 (72.03%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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