CsaV3_7G026740 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGTCCCACTCCCTCTACCTCTCTTCCTCCTCCCCATCTCTCCAAAGTCATCGTGCAATTCACAAACTTTCTTCTCAGAAACCAATCTCTCCACCCCCTTCTCTCATTCCCTTCGCCAATTCAAAACCTCTCACTGTTTTCAATGGCCCCCGTTTTTCCTCCATTAACAGAACCCCATTTCCAAGCCCCACAATTCCTTCAAACCCCCCTTTCCTCTTCGCAAAAACTTCCCCATTTCTCCAATTGATGAAGCCCCATTTTCCTTTTGCTCTAACTCAGCTCCTCCTTCTCACCCCTCTCCCTAGCTTCGCCTTGGAAACCGACCTAGCTTCTTCTGATAAGATAAGCCTGGAGTCCATTTTGGTTTCAATCGATGAATTTTTCAATAGATACCCTTTTTTTGTTGCTGGGTGTACTTTCATTTGGCTTGTTGTGATACCTTCGATTGATTACTATTTTATAAGAAAGTATAAGTTCATTTCTGCCATTAATGCGTTTCGTAAAATCCGAGATGAACCAAATGCACAACTGTTGGATGTTAGAGAGGAAAAGAGCTTGGCGGTTTTGGGGTCTCCTAATTTGAGGATTTTGAATAAGGATGTGGTGCGGGTTGTGTATTCAGAAGAGGATGAAGATGGGTTTGTGAAGAAGGTGAAGAAGAGCTTTGGTGATGATGCTGATACTATAGTCTTTGTCCTGGACAAGTAAGTTGTTTCCATATACTCTGAGTGAAATTGGGCTTGTGTGTGTTGTGGAATTTGGAGAGGCTTCTGTGATCTTCATGGTGATGTGTTTTTCTCTGTTCAGCTATGGAGAATTGTGACTGAATCATTTTAAGCCTCATTTGATAGTAATGTGTAATGTGGCCTGTTTTATAATCATTTGGTTTTTAGTTTTTGAGATTATGCTTGTTTTCTTCAACTTCTTTAATATGGCTTTCATCTTTTCTAAAACTAACACTTTGAATTCTTAGCCAAATTTCAAAAACAAAATTAAGTTTTCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTTTTCAGAATTTACTGAGTTTTTTACTCTTAACATATCACCAATAAAGGAAGGTAGAAGTAGTGTTTATAAGCTTTATTATTTTCAAAAACCAAAAGGTTATCATTGAGAGCAAATAAAAATTTAAAAGAACTCATGGGTAGGAGTAGTATTAATAAGCTTAAATTTTTAAATAGGTGTTTCACTATGTCACGTTTTAATATCTTTCCAATTATAAGAGTTCAATTTCGTCACGTGCTGTGCTTTCAATGTCCAAGGTAGTTTTGATGGTAACTCCATGAAAGCGGCTGAGTTATTGGTCAAGAATGGCTTCAAGGAGGCCTATGCAATCAAGGATGGTGTTAGGGGCGAAAAAGGGTGGTTGGTATGCGTTCTTTCACTATCTACTTGATACGTATAATATTAATTAATTAATTTAAAAAAATCATATTTTGTTGAAGGCTTAATCATGATGCATTTCTATTTTCTTTTTAATTTGTTTTCTTGTTCGATAATCATGGTACTATGTCGTTTTGAAACTATCCGTTAGGTGTTATTTTCCTTGAGTAGAGGTTCTTTCTTTATCTCTTTTGTGGGGAGCCTTTCTTTTGGTGGCCTCTTTTATTTGTAGGATCTTTTATGCTCTTGTATTCTTTCATTTTCTTCCCAATGAAAGTTTGGCCATTCGTAAAACAATAATAATAAAAAGAAAAGGAGCAGGAAGAAGAAGGGAAAAAAAATAGCAGAACACCAAAACTCAAGGTCATCCTTGTCCTCATCCTCTTCTAAATCTATGTTTCATCTAAAGATTCTCCTTTGTCATTCTCTTCATGATCTTCAATGTCTATTTCCTCTTAACCAAAATCTTCATCATCATTGCTTCTCTTCTAGGTGGTAAAGTTGAGTTGGTTTTCGGACTCAAAATCTTAGAGGCTAGTGTATGTGATTTGTTCCTCTAGACATTGTAGATTTAGTTTGCTTTATGGCTTTTTTAATCTTTAGTAGCAATAGCACATGCTACATCTCCCATGTCAGATCACTATTATCAAAATCCAACTCATCATGTTTTGGTCATTTTCTCCTTCCTTCATCCCAACCAACACTTCTTTGCAGAAGTGATATTAACCAGAGAGGAAATAGTGTTACTGGAGTTCAAACACAGAACATCTCACTTTGATACCATATTAAATCACTAATCTATTCAAAAGTTTAAAAGTTGATGGTTTGCAATAAATTTCAGAGGAATTGTTTTTAATAACATAATTGTTGAAAGTATTTACAAATACGACAAAATTTTACTTTCTCTTTGTGATAGAATGCAATAGATTCAGATATGCATCTATCCATGTCTACCACTAAAGTGATAGATGTTTATTTGAGTATACCATAGATATAAAAGTAAAATTTTGCTATACTTGTAAATAAATTAGCTCATTTTGTTATATTGAAAACATACCTAAATTTAACCTATTAATTTTTAACTCTGTAAATCAAGCCTAGCAAGATTTGAATAAACCAAGTTAACCGATGGACTTCCTTTTCTTGACATCTTAATTTCTAACTGAATTTTCATTATTGTTTTGCCTTTGAGAGTTGATGGTGCTCTCCCACAAGTCATACAAGTACTTATCACTTATGATTGCTTCTTTTTAATTTCGGGCCATCTAGATTGGCTTGAAAAATATTTATTTTTCAAAGAACTCATTTTTGTTCAAACTACTTTGATAAAAATTGTTTAAAATACACTTCAAGAGTTATCTTGAGTGATTGTCAAAGGACCACAATTTTTGTCAAAATGACTTATTTTTTAATTAAACGATTGAAAATGTATTTCAAATGCCCCTTTCGTGATATTAGATCTCATTTTTCTCCTATATAAATTTTAGAGTATAATTGGGCATTCATATCTTCTCTTTTGCCTTTTTGTTGCTTCACTTACACTAGTGGACACCTAAAATACATTTTGATATACATTTTCACTTATTGTCTGAAAATTTAATTTTTTATACATATTCTTTAACACTTTTGCACATGAAAATTAGCAAAACAAACAATTATTTAGGCCATGTTAAATCACCATTACACTCAAAAGGCAGATAAGTTACTTGTAATTTTGATTTTTCTTTTTTCATATGATCGACAGTGGAAAGCCACACTAGCAAGCACTTTTATGATTTCGTCATTAGGATCTTTTGATTTACCTGTGCTGAACAAGGATGCCTTTGTACTTTTCAAATTTAGTTGATCGACATTAACTAATTGATTCTAGTTGGTATGAGTAGTTTCTTTTCATGTTCTTCATTTATGTCTAATTTCGTCTCTTCCTTCCTTTCCGAGTCTTGACTTGGCGGAATTTAGTAAGCAGATGTTAAGACTATTTTCCAAAATTTGATAAAGCTTTCAATTACTTATTTTTTCATCCTCTTTGCAGGCAATACAGGAAAGCTTATTGCCACCTTCTGTTCACATGAAAAGAAGGAAAAAGGGTAAAGCTTCGCCAAAGTTGGGGACCAATGGAGTTGTTCAACAAAATGGAGACAATGAGGCTGTTCCCTCTTTGAAATCCTCCAATCGAGAAATACAACCGTCACATGTCCATGTCAATGCATCGTCACCTGCCGAGTCACAGTTGAAAACCCAGTCAAGGCCGTCCTCTCCTTATCCAAATGTATGTTCATTCTGCCAACTAATACATCTTTTTAAGTGTAAATTGTTTTTTCAACAAGTAGAGAAATAATGGTCTAAGATCAGAATTAAAATACAAAAGCATTGTATGTTTGACTGTCTAGCTTAATATGCTTCTAAACATTTTAAAAACAACAAAAAACCCTTGGTTAAACCATTTAATTAGGCATCTTAGTTTTTAACGATTAAATATATTCCCTCCTTCGTACTATGGTTTTCGTCTTTGTTAAGTAATAGAGTGATTCTTAGCCAAATTTCAAGGTAAAAAACAATTGTTTTTTAGTTTCAAAACTAGACTTGGCTCTTGAAAACATCAGTAGAAGTTGGATGTTAAATCAAGTTATTTAGAGATAGAAGCGGCGTTTGTAGGCTTAATTTTTAAAAACAAAAAACCAAACGGCTTGTTATCCAGTGTTTCATCTAAAAATACTTGTTCCAACCAAACGGCTTGTTATCCAGTGTTTCATCTAAAAATACTTGTTCCAGAATTATCTAGAAGTCACACAGCTAATAGAGAATGCATGTTTCATTACTTGTAGGAAACAAAATTATTTCCGACTCAGTAAAAGTTGAAACTCTCTTTTATGTACAATTCTCACTGTCATGATTTAGTTTTTTTTATTTATTTATTGTGGATTTTATATGCATGTGGCTTACATACTGACTCAGTTTTCTTGAACACTGATAAATGGCAGTACCCAGATTTAAAACCACCATCATCTCCAATGCCCTCAAAGCCAGGGAAGTGAAAGACTCGCAAGTTTTTCACCTGACCATCTTTGTTCTGCATAGAGAAGTTGACTTCAATATGTCATCAGAGGCTGCGCTATTGTTTCCATGTGCTTGTTGTAAACTCCAAATTTTTGGTAACTAGCTGTATATAATATATTAATATAGTCTTCTTGCTTCTCCTATGGTTGGTGCAAGTAAAGATTTAACCAAATGAAGGCATTTCAATTTTCCACAGTGAATAGTTACAGGGAAATGGAAGGGATAGTTAGATGAAGCACAAGGCTTAATGACTTCAGAATATAGATTTAAATAATACAGATATTCTAACAAAGAATATAGATGTGTCAATTAATGGTTGGGAGCATTACAATTACTCATATCATTTGTGGCTATAGCATGAGTAGCTTCTGGTATGGCATAAGAGGCGTTATGCAGTTAAGAAAGAAAATGCTATGTTTTTCATCTCTATCAAATAGCACAAATATTCTAACAAAGAATATACACTCACAAATCC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BLAST of CsaV3_7G026740 vs. NCBI nr
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BLAST of CsaV3_7G026740 vs. NCBI nr
Match: XP_004149315.1 (PREDICTED: FRIGIDA-like protein 3 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN44673.1 hypothetical protein Csa_7G368740 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1053.1 bits (2722), Expect = 5.4e-304 Identity = 550/550 (100.00%), Postives = 550/550 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. NCBI nr
Match: XP_008458098.2 (PREDICTED: FRIGIDA-like protein 3 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1036.6 bits (2679), Expect = 5.2e-299 Identity = 542/560 (96.79%), Postives = 552/560 (98.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. NCBI nr
Match: XP_008458100.1 (PREDICTED: FRIGIDA-like protein 3 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1028.9 bits (2659), Expect = 1.1e-296 Identity = 537/550 (97.64%), Postives = 546/550 (99.27%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. NCBI nr
Match: XP_022991468.1 (FRIGIDA-like protein 3 [Cucurbita maxima] >XP_022991469.1 FRIGIDA-like protein 3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 963.4 bits (2489), Expect = 5.6e-277 Identity = 502/550 (91.27%), Postives = 522/550 (94.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TAIR10
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BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TAIR10
Match: AT3G25480.1 (Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 5.0e-62 Identity = 126/220 (57.27%), Postives = 162/220 (73.64%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TAIR10
Match: AT3G22440.1 (FRIGIDA-like protein) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 2.6e-42 Identity = 139/460 (30.22%), Postives = 244/460 (53.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TAIR10
Match: AT4G14900.1 (FRIGIDA-like protein) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 4.9e-41 Identity = 161/546 (29.49%), Postives = 266/546 (48.72%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TAIR10
Match: AT1G31814.1 (FRIGIDA like 2) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 6.4e-33 Identity = 100/370 (27.03%), Postives = 199/370 (53.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q67ZB3|FRL3_ARATH (FRIGIDA-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FRL3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 417.2 bits (1071), Expect = 4.9e-115 Identity = 257/512 (50.20%), Postives = 320/512 (62.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q56XR7|STR4A_ARATH (Rhodanese-like domain-containing protein 4A, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=STR4A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 9.0e-61 Identity = 126/220 (57.27%), Postives = 162/220 (73.64%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9LUV4|FRL4A_ARATH (FRIGIDA-like protein 4a OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FRL4A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 4.7e-41 Identity = 139/460 (30.22%), Postives = 244/460 (53.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q940H8|FRL4B_ARATH (FRIGIDA-like protein 4b OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FRL4B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 8.8e-40 Identity = 161/546 (29.49%), Postives = 266/546 (48.72%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A0SWL0|FRL2A_ARATH (FRIGIDA-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FRL2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 141.4 bits (355), Expect = 5.2e-32 Identity = 100/370 (27.03%), Postives = 199/370 (53.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0K5B2|A0A0A0K5B2_CUCSA (FRIGIDA-like protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G368740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1053.1 bits (2722), Expect = 3.5e-304 Identity = 550/550 (100.00%), Postives = 550/550 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C8B2|A0A1S3C8B2_CUCME (FRIGIDA-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497631 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1036.6 bits (2679), Expect = 3.4e-299 Identity = 542/560 (96.79%), Postives = 552/560 (98.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C770|A0A1S3C770_CUCME (FRIGIDA-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497631 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1028.9 bits (2659), Expect = 7.2e-297 Identity = 537/550 (97.64%), Postives = 546/550 (99.27%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A061DLP5|A0A061DLP5_THECC (FRIGIDA-like protein OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_002601 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 3.9e-218 Identity = 409/551 (74.23%), Postives = 472/551 (85.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G026740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2N9IH79|A0A2N9IH79_FAGSY (FRIGIDA-like protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS51547 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 761.5 bits (1965), Expect = 2.1e-216 Identity = 407/552 (73.73%), Postives = 467/552 (84.60%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene: The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |