CsaV3_7G006180 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTCAAAAGAAAGGGTCATATTTGATTTGATATGAACATGAGTAAGCAGGGCTCGAGAATCAAGAATGCAGATAAGGTTGAAGAAGCAAGTTAAGTTAAAGTAAGTATTGAAATCATAGATCCACCACCAAATAAAATAGAGCATAGAAACAACGAAAATGGGAAAAGGAAAAAAGAAAAGAAAGTGATGGAAAAAGATTGATTGCTTTAAAGAAATAGCCGCCAGCGGGAAGAGAGCACGAGCACGATAGAGGATAAAAGCAGACCAAAAGGAGGTTTGAATTGACTGACATTCTTCCCATTCCAATACCAATTCCCCACCTTCAAATTCAATAATGAAATCACTGACCCAATACCAACAAACTACCCCACAATAACATCAACCCAAGTCAATTGAGCTTCTCTCCCATTTCCCAATCCAATTCCTCCTCTTCCACAACCCACCGGCATCACCAGCTTCACCAGAGCAGCCAATAATGGGGAATGGCACTTCCAAGCCCGATTCCTCCTCCTATTCTTCTTCTTCTTCCGATCCCGATGCTGAAGAGTCTCGTATTTCTCGCTTTAAGAATCGTGTTCATCTTCGTCGTTTTCTTCGTAGGCGGCGTAAAGTCACCAATGGCCGAGCTTTTCGTTCTCATACCAAACTTGGCTCTGCGGAGGATTTCGCTGGAATCGCTATTCTAACTCTTATTCGTGTAATTCTCTGCCTAACTTCGCTTTCTCGTCTTTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTGATGTGTTTTGGTGTTTGTTTGTTTGTAGGCGCGAATGGATTTCAAGGACAGGTGGCTAGCTTGTGTTTCCTTTGGAGAACAGACTTTTCGAACGGGAATCTCTGACCAGTTAAGTGCCTGATTCTTTGTCTCCGTTTTTCTGACAATATTTGTGTTTGGTTAATCCTTTGGGACTGCGTACGTGATTGTTAGAAAAAGAAGTGAGTTATACACCTGCACGTATATTCCTTGATTGCTTCGCTTTTTCTCGTTTGCCTTCTGTAGCTACAATGGCTGAAATGAACTTACCGTTTTACTGTTTTAAATTAGTTGGGTACGGGAATCTTGTAATTGGAAAATGTTGTTCCATCTCGGAGAAGGGAATTTTTTATGGTATAAAGGGAAAAATCAAAGGTTGTTTTACTGTGCTGGAAAGTTTCATTGTGGGGAGAATACAACTATGGGAATTGAATTACTACAGTGTCCAGATGAACCTTTGCTTTCTCCCGAAATATTAATACATGGTGGGAAGTGAAAATTGGAAACAGTATAAAAAATGTCTAACAACGTTGGAAGTACGTTTGGGTTCTCTAAATTTTGTGCTGTTTAAATGTCTTATCAACACTACATTGAATGTTGGAGCAGAAAAGTGCTTTTTATCGCTATTATTAGAGAAAAGAAGAAAATCTTTCATAGAGTTACGTAGTTTCTTCCACAGAAGAGTATTGACAATGTTGGAAATTTTCTAATTGTGATGAACAATTCACTAAGTACAGAAAACCTATCTGATAAGAATCACAAAGTTCAAAGAAATAAGCGAAATCATTATTCTGGAGGTTAGTTATTTTCATGGGATTAGTTTGAATTTGAACAGTAATTGAAGGAATTATTATTATTTTTTTAAACATCAGGTTTTGGGACTACAGGAATAAAAAGAGTTATAAATTTAACTGTACTAGTAGTTCTGTAAAATTTACCTGGGATTGTAAACTTAAATTCACAAGTTTTAACTTTAAAGTTTCTGTCCGTTTCAATTGACTTGAACCTTTTACTTTCGTGTATGGGCTGGCCAATTTGGTTTTATCATCCGAGACATTTTCAATTTTAACCGCCATTTTTAGGAGCCCTTGGTAAAATTGGACCATTATATCTGACATGGTCATAAAATTTTCTATATCATACAAATGTACCATCAAACCCTTTATCTGAATGATATCTATGACATGGTCATAAAAATTTATTTGTTTTCTTTATCTTATTGTTGAGCAATCTTGATTCTGCCACTTCAAATACCCCTCCATATACATGCGTAAATCTATAATGTTGAGTTTGTTGATTGGGTTTCATTGGTTCTGCAGCACTAAAGAACCAGCTTGGAACTCTGTGAGTACTCAGACCTCTACTATTTTGCAGAAAATTGAGTTTCTTTACTTGCGTTGTATTCAACTAAATTAATTTTTTTGTTTGCATTTGTATTAAAATGGTTTCCCTATCACTTCTTGAGCAGGAATTGATTTAAATTGTACCATCTCTGCATTTCTATTTAAGTTAGTTTTACTATCGTAAAGAAAAATGAAAGAATATTCCAGGGTACAAGAAGGAAAAGCTCAAAAAAAGGAGCCAAACTACAATAAGGAACTCCAGTGAAGAGAAATAAAACCAAGCGATTAGTTACAATAGAGCCTAAAAATAGAGGACCAAAGAAAAACAAATAATCTAACAAGGACTAAGCATTGTCAAAAGATGTCTCGTACCCTCTGAAGGTTATTTTGTCTATCTCACCTTAAAACCCCCACAAAATAGCACATACCCCGGGCTATCACAAGTTTAATGTTTCTTGACGTTTGAAAATAGGAAGTTTTGAAAACTTTACGTTCTGAACTTTTGTGTCCTCATGGTATTCACTATTCAGTTTCTCGTGTTGTCAAAGTTTCCGTTTCTTTTTTCAGTTGGTTTGCGTTCCTCCTTCAGTTGGTTCTATTTTCACCCTATTAGCTTTTCTTTAGAATTTAAAAAAATGCAGCTCACACGGTTTTTTTTTCGTTTTCTGAAACAGATTGTTTTGTCCAGGATTCTAGTGTATCTATGGTTTTTGTTTTCTGAACTGCGTGTTTAGAATCTTGTAATTAAGTTTTTCTGTTCTATGTTTGCTGATATTTTTATAGATTTATGTCTTGCTTTTCATCCATCAAGTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAATAAACAATCCATGAAGATTTCTGTTTCCTTAAAAGAAAATAAAAGAAAACGTACTTAAATATCATTGTTTAATCCGAAGTAAGGATTTATGGTAATGTAATTGAACATTTATGCTTATTTTTCAGTTTATAACTGTTAGGCCTCATTTAATACGTATTTAATATGTAAATCACCTGACATATGGAGCTTTGTTTAAATACAATATTTCTTCTCAGGAAAAGAAGCTTCTCTTGGAAAAAGATGGACCTCATATTGCAAGAATTTCTGTTTTTGAGGTAGTAATCATCTTTTAGGTTGAATGTTTTTAACTTTGTTTAGGGTTTGTTTGAGATTTCCCAGAAAACAAAAGGTTGCTAAGCTTAAGCTTCTGTAGCTTCAGTTTTACTTAATACTGCAATATAAACAGAAAAACGAATTAATTTTCTATTCATAAGTAATACATGTCCTTAAAAGAACTTTTCAGTATTCAAATATTAGTTTAACATATCATATATCTTAATTTAGTATAATTTTATGATTCTAAAAATTTTTGAATAAATTTTATAAAAAGTTCATTATGCTAATTAATTTATTGCTTACTTTAACGGGTGAAAGAAACAAAATTTGTGGAAAGAAAACCAGAGTTGAAACTGAAGTCAACTTTGGCTAAAGTACAACTTTGTAATCACTAGGGGCAGTAATGTCAAATATTAAAAAGAATGCTAATTTGCCTTAGAATATTGAAAATGAAAGTCACACTACAGAATTGCATAATTTTGTAGATTTTGAGAGGAGAAATGTATGAGAAAAATGTAGTAGCAGCCACATCACGTACAACTTTGACTGCTATTTAGAATTTAGAGAATTAAATGTCTTTTTTGTTTTTATTTTTAAGTCAAGAATATACACACACGTTTGAGCATGAATTATTTGTAGGCATTCATTTAAATTCCTTCCATGGAATCATGTAATCTGAAGTCTAATTATCCTTTATGTTGCAGACTAATAGAATATCCCGGAACAACCTTGTAGGGTTTTGTGAAATCGATCTACTTGAGTTTCTATCACAGGTGAGTATCTATTACCACATCAGACCCATTCATGATCATTTAGTTCCATTACTTGAAATGCTTCACATGGAAACATTCATTTTTGTTAACTTTAGTATTTTGCAAGTGCCGAGTTACTCTCTATATTTTAAAATCTTTCTGTTATATAGTATTAACTATTAAATACTATTTTTTCGAATAACGCAGTGTAGGCAGTTTTTTTCTTATTATAGCGAACAATATAGTTTCATTAAGAAGAAAAATGACTAAAGACGATGGTATAAGAAATCCAAAATATGAATGCATATCAAACCCTAAACATTCAGATTTTATTCACAAGGTTAAATGGATATAAAAATGAGATCATATCAACGAGATAACTACAAGAAACTTTTCTGATTAGAGATAATGGAGGATAGTAGTATTAGGGAAGATAGTAGTTAATTACTCAATGACATAGCTAAAACCATAGTGGACTCAAAGAAATTGTTGAAATTATATTTCTTGTCAGAAAGGATCCATTTATTTCTCTTTTTTCTGAAGATTCTACATAAAACAGCTCAAGCGACATTTTGCCAAAGAGTATTCTTAGACTTCTTGAAAGGTCACCCACAATTTTGTTTGGCCTGAAGGTGGAGATATCCCCAGGCATGACAGAAAACCATCTAAAGTTAGAAAGGATACTGTTCCAAAGATGTGATGCTAAGGAGCTGGAGCTAAACGTGGATCTGAGATTCAGTTTCTTTAACACATAAGAGGCAGCAAATGGACGATAAATAAAGCCGAGGAGCTCTCTTTTGCAGCTCATCTTGTGTGTTAATGTAGACGCTACTGGGTTTTCAAATAAAGAATTTTACCCTCGTTAGCATTTCTCCTATCTAGTCTGACTGTATAAATAGTTGGCAATGATTTTAGATGATGAGGCAAGTTTAGCACTTAGTGATTCAGACAAAAAGTTCCCATCCTTTTCCAAAATCCACCTCCGGAAGTCGGTCCTCTCAATAGG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BLAST of CsaV3_7G006180 vs. NCBI nr
Match: XP_011658767.1 (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1296.2 bits (3353), Expect = 0.0e+00 Identity = 658/660 (99.70%), Postives = 658/660 (99.70%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. NCBI nr
Match: XP_008455245.1 (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1242.3 bits (3213), Expect = 0.0e+00 Identity = 637/661 (96.37%), Postives = 640/661 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. NCBI nr
Match: XP_023553974.1 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1197.6 bits (3097), Expect = 0.0e+00 Identity = 611/659 (92.72%), Postives = 630/659 (95.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. NCBI nr
Match: XP_022963616.1 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1197.2 bits (3096), Expect = 0.0e+00 Identity = 611/659 (92.72%), Postives = 629/659 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. NCBI nr
Match: XP_022967583.1 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1191.4 bits (3081), Expect = 0.0e+00 Identity = 608/659 (92.26%), Postives = 627/659 (95.14%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TAIR10
Match: AT5G57190.1 (phosphatidylserine decarboxylase 2) HSP 1 Score: 900.2 bits (2325), Expect = 7.6e-262 Identity = 437/587 (74.45%), Postives = 519/587 (88.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TAIR10
Match: AT4G25970.1 (phosphatidylserine decarboxylase 3) HSP 1 Score: 893.6 bits (2308), Expect = 7.1e-260 Identity = 455/658 (69.15%), Postives = 548/658 (83.28%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TAIR10
Match: AT4G16700.1 (phosphatidylserine decarboxylase 1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.4e-10 Identity = 74/296 (25.00%), Postives = 110/296 (37.16%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. Swiss-Prot
Match: sp|F4KAK5|PSD2_ARATH (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PSD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 900.2 bits (2325), Expect = 1.4e-260 Identity = 437/587 (74.45%), Postives = 519/587 (88.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A4GNA8|PSD3_ARATH (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PSD3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 893.6 bits (2308), Expect = 1.3e-258 Identity = 455/658 (69.15%), Postives = 548/658 (83.28%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q5JN42|PSD2_ORYSJ (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PSD2 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 1.3e-234 Identity = 395/533 (74.11%), Postives = 466/533 (87.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q5AK66|PSD2_CANAL (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Candida albicans (strain SC5314 / ATCC MYA-2876) OX=237561 GN=PSD2 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 268.9 bits (686), Expect = 1.5e-70 Identity = 187/524 (35.69%), Postives = 276/524 (52.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. Swiss-Prot
Match: sp|O14111|PSD3_SCHPO (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=psd3 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 267.7 bits (683), Expect = 3.4e-70 Identity = 157/394 (39.85%), Postives = 230/394 (58.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C020|A0A1S3C020_CUCME (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495456 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1242.3 bits (3213), Expect = 0.0e+00 Identity = 637/661 (96.37%), Postives = 640/661 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1U8A0R6|A0A1U8A0R6_NELNU (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Nelumbo nucifera OX=4432 GN=LOC104599579 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 966.5 bits (2497), Expect = 3.1e-278 Identity = 471/602 (78.24%), Postives = 540/602 (89.70%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A251RIT9|A0A251RIT9_PRUPE (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Prunus persica OX=3760 GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 962.2 bits (2486), Expect = 5.9e-277 Identity = 472/600 (78.67%), Postives = 545/600 (90.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S2XB81|A0A1S2XB81_CICAR (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Cicer arietinum OX=3827 GN=LOC101504195 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 962.2 bits (2486), Expect = 5.9e-277 Identity = 483/632 (76.42%), Postives = 547/632 (86.55%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G006180 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067LD73|A0A067LD73_JATCU (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Jatropha curcas OX=180498 GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 960.7 bits (2482), Expect = 1.7e-276 Identity = 477/658 (72.49%), Postives = 564/658 (85.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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