CSPI07G05200 (gene) Wild cucumber (PI 183967)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAAGAAGCAAGTTAAGTTAAAGTAAGTATTGAAATCATAGATCCACCACCAAATAAAATAGAGCATAGAAACAACGAAAATGGCAAAAGGAAAAAAGAAAAGAAAGTGATGGAAAAAGATTGATTGCTTTAAAGAAATAGCCGCCAGCGGGAAGAGAGCACGAGCACGATAGAGCATAAAAGCAGACCAAAAGGAGGTTTGAATTGACTGACATTCTTCCCATTCCAATACCAATTCCCCACCTTCAAATTCAATAATGAAATCACTGACCCAATACCAACAAACTACCCCACAATAACATCAACCCAAGTCAATTGAGCTTCTCTCCCATTTCCCAATCCAATTCCTCCTCTTCCACAACCCACCGGCATCACCAGCTTCACCAGAGCAGCCAATAATGGGGAATGGCACTTCCAAGCCCGATTCCTCCTCCTATTCTTCTTCTTCTTCCGATCCCGATGCTGAAGAGTCTCGTATTTCTCGCTTTAAGAATCGTGTTCATCTTCGTCGTTTTCTTCGTAGGCGGCGTAAAGTCACCAATGGCCGAGCTTTTCGTTCTCATACCAAACTTGGCTCTGCGGAGGATTTCGCTGGAATCGCTATTCTAACTCTTATTCGTGTAATTCTCTGCCTAACTTCGCTTTCTCGTCTTTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTGATGTGTTTTGGTGTTTGTTTGTTTGTAGGCGCGAATGGATTTCAAGGACAGGTGGCTAGCTTGTGTTTCCTTTGGAGAACAGACTTTTCGAACGGGAATCTCTGACCAGTTAAGTGCCTGATTCTTTGTCTCTGTTTTTCTGACAATATTTGTGTTTGGTTAATCCTTTGGGACTGCGTACGTGATTGTTAGAAAAAGAAGTGAGTTATACACCTGCACGTATATTCCTTGATTGCTTCGCTTTTTCTCGTTTGCCTTCTGTAGCTACAATGGCTGAAATGAACTTACCGTTTTACTGTTTTAAATTAGTTGGGTACGGAATCTTGTAATTGGAAAATGTTGTTCCATCTTGGAGAAGGGAATTTTTTATGGTATAAAGGGAAAAATCAAAGGTTGTTTTACTGTGCTGGAAAGTTTCATTGTGGGGAGAATACAACCATGGGAATTGAATTACTACAGTGTCCAGATGAACCTTTGCTTTCTCCCGAAATATTAATACATGGTGGGAAGTGAAAATTGGAAACAGTATAAAAAATGTCTAACAACGTTGGAAGTACGTTTGGGTTCTCTAAATTTTGTGCTGTTTAAATGTCTTATCAACACTATATTGAATGTTGGAGCAGAAAAGTGCTTTTTATCGCTATTATTAGAGAAAAGAAGAAAATCTTTCATAGAGTTACGTAGTTTCTTCCACAGAAGAGTATTGACAATGTTGGAAATTTTCTAATTGTGATGAACAATTCACTAAGTACAGAAAACCTATCTGATAAGAATCACAAAGTTCAAAGAAATAAGCGAAATCATTATTCTGGAGGTTAGTTATTTTCATGGGATTAGTTTGAATTTGAACAGGAATTGAAGGAATTATTATTATTTTTTTAAACATCAGGTTTTGGGACTACAGGAATAAAAAGAGTTATAAATTTAACTGTACTTGTAGTTCTGTAAAATTTACCTGGGATTGTAAACTTAAATTCACAAGTTTTAACTTTAAAGTTTCTGTCCGTTTCAATTGACTTGAACCTTTTACTTTCGTGTATGGGCTGGCCAATTTGGTTTTATCATCCGAGACATTTTCAATTTTAACCGCCATTTTTAGGAGCCCTTGGTTAAATTGGACCATTATATCTGACATGGTCATAAAATTTTCTATATCATACAAATGTACCATCAAATCCTTTATCTGAATGATATCTATGACATGGTCATAAAAATTTATTTGTTTTCTTTATCTTATTGTTGAGCAATCTTGATTCTGCCACTTCAAATACCCTTCCATATACATGCGTAAATCTATAATGTTGAGTTTGTTGATTGGGTTTCATTGGTTCTGCAGCACTAAAGAACCAGCTTGGAACTCTGTGAGTACTCAGACCTCTACTATTTTGCAGAAAATTGAGTTTCTTTACTTGCGTTGTATTCAACTAAATTAATTTTTTTGTTTGCATTTGTATTAAAATGGTTTCCCTATCACTTCTTGAGCAGGAATTGATTTAAATTGTACCATCTCTGCATTTCTATTTAAGTTAGTTTTACTATCGTAAAGAAAAATGAAAGAATATTCAAGGGTACAAGAAGGAAAAGCTCAAAAAAAGGAGCCAAACTACAATAAGGAACTCCAGTGAAGAGAAATAAAACCAAGCGATTAGTTACAATAGAGCCTAAAAATAGAGGACCAAAGAAAAACAAATAATCTAACAAGGACTAAGCATTGTCAAAAGATGTCTCGTACCCTCTGAAGGTTATTTTGTCTATCTCACCTTAAAACCCCCACAAAATAGCACATACCCCGGGCTATCACAAGTTTAAAGTTTCTTGACGTTTGAAAATAGGAAGTTTTGAAAACTTTACGTTCTGAACTTTTGTGTCCTCATGGTATTCACTATTCAGTTTCTTGTGTTGTCAAAGTTTCCGTTTCTTTTTTCAGTTGGTTTGCGTTCCTCCTTCAGTTGGTTCTATTTTCACCCTATTAGCTTTTCTTTAGAATTTAAAAAAATGCAGCTCACACGGTTTTTTTTTCGTTTTCTGAAACAGATTGTTTTGTCCAGGGTTCTAGTGTATCTATGGTTTTTGTTTTCTGAACTGCGTGTTTAGAATCTTGTAATTAAGTTTTTCTGTTCTATGTTTGCTGATATTTTTATAGATTTATGTCTTGCTTTTCATCCATCAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATAAACAATCCATGAAGATTTCTGTTTCCTTAAAAGAAAATAAAAGAAAACGTACTTAAATATCATTGTTTAATCCGAAGTAAGGATTTATGGTAATGTAATTGAACATTTATGCTTATTCTTCAGTTTATAACTGTTAGGCCTCATTTAATACGTATTTAATATGTAAATCACCTGACATATGGAGCTTTGTTTAAATACAATATTTCTTCTCAGGAAAAGAAGCTTCTCTTGGAAAAAGATGGACCTCATATTGCAAGAATTTCTGTTTTTGAGGTAGTAATCATCTTTTAGGTTGAATGTTTTTAACTTTGTTTAGGGTTTGTTTGAGATTTCCCAGAAAACAAAAGGTTGCTAAGCTTAAGCTTCTGTAGCTTCAGTTTTACTTAATACTGCAATATAAACAGAAAAACGAATTAATTTTCTATTCAAAAGTAATACATGTCCTTAAAAGAACTTTTCAGTATTCAAATATTAGTTTAACGTATCATATATCTTAATTTAGTATAATTTTATGATTCTAAAAAATTTTGAATAAATTTTATAAAAAGTTCATTATGCTAATTAATTTATTGCTTACTTTAACGGGTGAAAGAAACAAAATTTGTGGAAAGAAAACCAGAGTTGAAACTGAAGTCAACTTTAGCTGAAGTACAACTTTGTAATCACTAGGGGCAGTAATGTCAAATATTAAAAAGAATGCTAATTTGCCTTAGAATATTGAAAATGAAAGTCACATTACAGAATTGCATAATTTTGTAGATTTTGAGAGGAGAAATGTATGAGAAAAATGTAGTAGCAGCTACATCACATACAACTTTGACTGCTATTTAGAATTTAGAGAATTAAATGTCTTTTTTGTTTTTATTTTTAAGTCAAGAATATACACACACGTTTGAGCATGAATTATTTGTAGGCATTCATTTAAATTCCTTCCATGGAATCATGTAATCTGAAGTCTGTAATTATCCTTTATGTTGCAGACTAATAGAATATCCCGGAACAACCTTGTAGGGTTTTGTGAAATCGATCTACTTGAGTTTCTATCACAGGTGAGTATCTATTACCACATCAGACCCATTCATGATCATTTAGTTCCATTACTTGAAATGCTTCACATGGAAACATTCATTTTTGTTAACTTTAGTATTTTGCAAGTGCCGAGTTACTCTCTATATTTTAAAATCTTTCTGTTATATAGTATTAACTATTAAATACTATTTATTCGAATAACGCAGTGTAGGCAGTTTTTTTCTTATTATAGCGAACAATATAGTTTCATTAAGAAGAAAAATGACTAAAGACGATGGTATAAGAAATCCAAAATATGAATGCATATCAAACCCTAAACATTCAGATTTTATTCACAAGGTTAAATGGTTATAAAAATGAGATCATATCAACGAGATAACTACAAGAAACTTTTCTGATTAGAGATAATGGAGGATAGTAGTATTAGGGAAGATAGTAGTTAATTACTCAATGACATAGCTAAAACCATAGTGGACTCAAAGAAATTGTTGAAATTATATTTCTTGTCAGAAAGGATCCATTTATTTCTCTTTTTTCTGAAGATTCTACATAAAACAGCTCGAGCGACATTTTGCCAAAGAGTATTCTTAGACTTCTTGAAAGGTCACCCACAATTTTGTTTGGCCTGAAGGTGGAGATATCCCCAGGCATGACAGAAAACCATCTAAAGTTAGAAAGGATACTGTTCCAAAGATGTGATGCTAAGGAGCTGGAGCTAAACGTGGATCTGAGATTCAGTTTCTTTAACACATAAGAGGCAGCAAATGGACGATAAATAAAGCCGAGGAGCTCTCTTTTGCAGCTCATCTTGTGTGTTAATGTAGACGCTACTGGGTTTTCAAATAAAGAATTTTACCCTCGTTAGCATTTCTCCTATCTAGTCTGACTGTATAAATAGTTGGCAATGATTTTAGATGATGAGGCAAGTTTAGCACTTAGTGATTCAGACAAAAAGTTCCCATCCTTTTCCAAAATCCACCTCCAGAAGTCGGTCCTCTCAATAGGTGTAAAGAAGGATATCAAAGTAATTAGGTGAGCTTATTCATCTATTTCATTTCTTTGAGCTTTTGCCTCCAAC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BLAST of CSPI07G05200 vs. Swiss-Prot
Match: PSD2_ARATH (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=PSD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 906.7 bits (2342), Expect = 1.4e-262 Identity = 452/646 (69.97%), Postives = 544/646 (84.21%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. Swiss-Prot
Match: PSD3_ARATH (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=PSD3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 893.3 bits (2307), Expect = 1.6e-258 Identity = 455/658 (69.15%), Postives = 547/658 (83.13%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. Swiss-Prot
Match: PSD2_ORYSJ (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=PSD2 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 1.7e-234 Identity = 395/533 (74.11%), Postives = 466/533 (87.43%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. Swiss-Prot
Match: PSD3_SCHPO (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=psd3 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 4.4e-70 Identity = 156/394 (39.59%), Postives = 229/394 (58.12%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. Swiss-Prot
Match: PSD2_CANAL (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Candida albicans (strain SC5314 / ATCC MYA-2876) GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 266.5 bits (680), Expect = 7.5e-70 Identity = 169/437 (38.67%), Postives = 239/437 (54.69%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TrEMBL
Match: A0A061E2K3_THECC (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Theobroma cacao GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 975.3 bits (2520), Expect = 3.7e-281 Identity = 491/658 (74.62%), Postives = 569/658 (86.47%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TrEMBL
Match: A0A067LD73_JATCU (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Jatropha curcas GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 1.2e-276 Identity = 477/658 (72.49%), Postives = 564/658 (85.71%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TrEMBL
Match: I1KUF4_SOYBN (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Glycine max GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 952.2 bits (2460), Expect = 3.3e-274 Identity = 479/624 (76.76%), Postives = 542/624 (86.86%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TrEMBL
Match: B9GWD3_POPTR (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Populus trichocarpa GN=PSD2 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 948.0 bits (2449), Expect = 6.3e-273 Identity = 482/660 (73.03%), Postives = 553/660 (83.79%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TrEMBL
Match: A0A0B2RJT0_GLYSO (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Glycine soja GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 945.7 bits (2443), Expect = 3.1e-272 Identity = 475/624 (76.12%), Postives = 538/624 (86.22%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TAIR10
Match: AT5G57190.1 (AT5G57190.1 phosphatidylserine decarboxylase 2) HSP 1 Score: 906.7 bits (2342), Expect = 8.1e-264 Identity = 452/646 (69.97%), Postives = 544/646 (84.21%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TAIR10
Match: AT4G25970.1 (AT4G25970.1 phosphatidylserine decarboxylase 3) HSP 1 Score: 893.3 bits (2307), Expect = 9.3e-260 Identity = 455/658 (69.15%), Postives = 547/658 (83.13%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. TAIR10
Match: AT4G16700.1 (AT4G16700.1 phosphatidylserine decarboxylase 1) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.6e-09 Identity = 74/296 (25.00%), Postives = 111/296 (37.50%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. NCBI nr
Match: gi|778724254|ref|XP_011658767.1| (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1295.8 bits (3352), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/660 (99.55%), Postives = 658/660 (99.70%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. NCBI nr
Match: gi|659110477|ref|XP_008455245.1| (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1267.7 bits (3279), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/661 (98.03%), Postives = 652/661 (98.64%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. NCBI nr
Match: gi|720014399|ref|XP_010260486.1| (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 977.2 bits (2525), Expect = 1.4e-281 Identity = 490/658 (74.47%), Postives = 566/658 (86.02%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. NCBI nr
Match: gi|645223856|ref|XP_008218832.1| (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3-like [Prunus mume]) HSP 1 Score: 976.5 bits (2523), Expect = 2.4e-281 Identity = 493/660 (74.70%), Postives = 578/660 (87.58%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI07G05200 vs. NCBI nr
Match: gi|694316392|ref|XP_009333651.1| (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3-like [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 975.7 bits (2521), Expect = 4.0e-281 Identity = 487/658 (74.01%), Postives = 572/658 (86.93%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (PI183967)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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