CsGy2G007770 (gene) Cucumber (Gy14) v2

Overview
NameCsGy2G007770
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Gy14) v2)
Descriptionprotein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2
LocationChr2 : 6370801 .. 6432349 (-)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexonthree_prime_UTR
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mRNA sequence

ATGGAGGAGAAGCACGAGGACGTGGATGATGTTGGAAGCGCGTCCGGTGATTCTTTTATTGATGATTCTGAAGACGATGGGCCATCGACTTCTGGGAAGGACGATCAGTTACATCTCGAGGCAAGCGACATTAGCCTTTTCATTTGTATTTACCAAGTCTTGGCTTTACTTGTTGCTTCATGTCTTGCTAGAACCATTGACTGAGCAAGAGATTGAGGATTTGGTGGCTGAGTTCTTAGAAGTTGAGAGTAAGGCTGCAGAGGCTCAAGAAGCACTTGAAAAGGAGTCTCTTGCCAAAGTGGAGAAAGAAGTTCGAGAAGAACTGGCATTGACTCTTAATGGTGATGATTTGGAAACAGCCATTGCAAATGAAATGGCTGCTTTCGTAGAGGAGTGGGAGGTTGTGCTCGATGAGCTTGAGATTGAGAGTGCTCATTTGTTGGAGCAACTTGATGGTGCTGGTATTGAGCTGCCAAGTCTCTACAAGCTAATTGAAAGTCAAGCTTCTAATGGTTGCTTTACTGAAGCTTGGAAAAAGAGGATACACTGGGTAGGGTCTCAGGTAACTGGTGATCTTCTTGCATCTGTATCTGACGCAGAGAAAACCCTCCAAATTGAAAGGCCTGTAATGAGACGACATGGTAAGCTGTTGGAGGAGGGAGCAAGTGGATATCTGCAGAAGAAATTTTCCACTCACGAGATTGAGGGAATCGGTACAGAAAAATTGGAAGTTGATTGGGGCTCTCTTAATAAGGTTTTTTCAGAAGGCTCAAAGGACAGTGACACGTTGTTTGGCAGCAAGAACTGGGCTTCTGTTTACTTGGCTAGCACTCCGCAACAAGCTGCAGAAATGGGACTCAAATTTCCTGGAGTTGATGAGGTAGAGGAGATAGATGATGTTGATGGAAGTTCTTGTGATCCATTTGTTGCAGCTGCCATTGAAAATGAAAAAGAGTTGGATCTTTCTGAAGAACAAAAGAAAAATTTCAGAAAGGTCAAAGAAGAAGATGATGCCATTTTTGACCGAAAACTCCAAATACATTTGAAACAAAAGCGAAATCAGAAAAGATGTAAACAGGTCTCCCAAAAAGATGTTTCCCCAAGAGATGAAGAGCAGCCCGTATCTTTGGTTGACTGTTTGAACCCTGTTTCAGATGATAAAGTTGACAAATGTCGGATGGGGTTATCTGATGATGAGAATGGAGATGTTAAAATCAAGGTTGACATACCCAACGGTTCTGATGCTTCAAGTGATATTGACATGGAAAGGTCTATGGAGCATACAGCTTCTGTGCTTCCTTCGGCTTCATCTAATTTTGTGGAACCTTTAGGTTCCAAGCGTTTAAATGATATGGAAGAAGTTATCACTCAAACTAAAAAGAGTCGAACTAATGGTGTACATAATGATGAAAATTCCCCAATGAAGGAGCATTCTGCTTTGTTGAACACCATATGCAACACGGAACAAAATGACTATGATGCTGATTCTCTTCCATCGACGTGTCCAAACGAGAAGATCCATTGTACTGCTTGTGATCAAGTGGTTATTAAAGTGTATGCACATCCTTTCCTGAGAGTAATTGTTTGTGCAGATTGCAAAAGCATGATGGATGACAAGAAGAATGTAAAGGAACCTGATTGCTCTGAATGCTATTGCGGATGGTGTGGCCACAATGCTGATTTAGTAAGTTGTAAATCATGTAAAACACTCTTTTGTACTGGTTGCATAAGGCGGAACCTTGGTGTTGAGTGCTTGCTCAAGGCCCAGGCTTCTGGGTGGCATTGTTGTTGTTGTCGCCCAAGTCTTTTGCAATCCTTGACCACTCAGTTGGAGGAAGCCTTAGGATCTGAAGAGTTGACAGGTTCTAGCTCTGATAGCGATTCAGACAACCCAAATGCAGATATAAATGTAACCATCAGCTCAAAGAGAAAGCGTAAGAAAAAAATACGGCGGATACTCGATGACGCTGAATTAGGAGAAGATACTAAAAAGAAAATTGCCATAGAGAAGGAACGCCAAGAACGTCTAAAATCATTACAAGTTCAGTTTTCGTCCAATTCTAAAATGATGAGCTCTGCTGGCTTTTGCGGAAATCTATCTGAAGGTGCCAGTGTCGAAGTCCTTGGTGATGCCTCAACGGGATATATAGTGAATGTTGTGCGGGAGAAAGGAGAAGAGGCCATTAGAATTCCGCCAAGCATTTCATCAAAGTTGAAAACCCATCAGATTTCTGGAATAAGATTTATGTGGGAAAATATCATTCAATCAATACGGAAAGTGAAGTCTGGGGATAAAGGACTTGGATGCATTCTTGCTCATACAATGGGCCTTGGTAAAACTTTTCAGGTTATAGCATTCTTATACACTGCAATGAGAAGTGCGGACTTGGGTTTACGAACAGCACTTATTGTTACCCCTGTTAATGTGTTGCATAATTGGCGGCAAGAATTCTTCAAGTGGAAGCCTTCAGAATTAAAGCCTCTTCGCATTTTCATGCTAGAAGATGTACCAAGGGAGAAAAGGGCCGTGTTGCTTGCCAAGTGGAGAGCCAAGGGTGGTGTCTTTTTAATTGGTTATAGTGCTTTCCGAAACTTATCACTTGGTAAACATGTCAAGGACAGACAGATGGCTAAAGAAATATGCCATATCCTTCAGGATGGACCAGATATTCTTGTATGTGATGAGGCCCACATGATTAAGAATACCAAGGCTGATATAACACAGGCATTGAAACAAGTGAAATGCCAGAGGAGGATTGCGTTGACTGGATCACCACTACAGAACAATCTCATGGAGTACTATTGTATGGTTGATTTTGTGAGAGAAGGTTTCCTGGGAAGTAGCCATGAATTTAGGAATCGCTTCCAGAACCCCATAGAGAATGGGCAGCATACTAATTCAACTCTGGATGATGTTAAAATAATGAACCAGAGGTCTCATATTCTATATGAACAGTTGAAAGGGTTTGTTCAAAGAATGGACATGACCGTGGTGAAGAAGGACTTGCCACCTAAAACTGTCTTTGTGATATCCGTAAAACTCTCTCCCTTACAGAGGAAGTTATACAAAAGATTTCTTGACGTGCATGGATTTAATAATGGCAAGGATTCTAGTGAACAGTTAAGGAAACGGAGCTTTTTTGCTGGGTACCAAGCACTGGCCCAGATCTGGAATCATCCTGGAATCCTGCAATTGACCAAAGAAGACAAATATTATGTGAAGCGTGAAGATGCTATTGAAAATTTTCTTGCAGGCGATTCCTCCAGTGATGAAAACATAGATTCTAATATTGGAACTGGAGATAAACCAGTGAATGCCAATGGGAATCATCAGGATAAATTTGTTAGTGGTTTTTTTGTTAAGGATTGGTCAAATGGTCTGCTTCATGCAAATAGTTACAAGGAGGTAGATTACGGGGGAAAAATGGTTTTGCTGCTAGAGATCTTAACCATGTGCTCTGAATTGGGCGATAAGGCATTGGTGTTCAGCCAGAGCATTCCTACGCTTGATCTAATTGAATTCTATCTTTCAAGATTGCCCAGACGAGGAAAGAGAGGAAAATTTTGGAAAAAGGGTAAAGATTGGTATAGGCTAGATGGAAGAACTGAGAGTTCCGAAAGACAGAAGATTGTCGAAAGGTTTAATGAGCCTCTAAATAAGAGGGTGAAATGTACCTTGATATCAACTAGAGCTGGATCATTGGGCATCAATCTTCATTCTGCTAATCGTGTCATTATAGTGGATGGCTCTTGGAATCCAACTTATGATCTTCAGGCTATTTATCGAGCTTGGAGATATGGCCAAACAAAACCTGTGTTTGCTTACCGATTTTTGGCGCATGGAACAATGGAAGAAAAAATTTATAAGCGTCAGGTAACAAAGGAGGGACTGGCTGCTAGAGTTGTTGATCGCCAACAGGTATATCGAACTATTTCTCGGGAAGAAATGTTGCATCTTTTTGAATTTGGTGATGAAGAAAATCTTGAGGCTTCCACTGAGTTGGACCAAGGAAATGGGCATACATCCCACCAGATTATGACTGGGCATCAAGGAAACGTGCTGAAGCAGAAAGGGCCTCTTTCCCATGGCAGTTGCTCATCCGACAAGTTAATGGAAACTTTACTTGGGAAACACCATCCAAGGTGGGTTGCCAATTACCACGAGCACGAAACGCTACTCCAAGAGAATGAAGAGGAGAAACTATCCAAGGAGGAGCAAGATATGGCATGGGAAGTGTACAGAAAATCATTAGAATGGGAGGAAGTGCAGAAAGTTTCACCAGGGGATTTTATATCTGAGCAGAAGTTAACCACGTCGAATAATGCCCATCCTGCACCTGAGACAATTGATCTGGCACAATCAAGGGCCAGGAACCGATTCGTTTCCCGTAAATGCACAAATCTTTCTCATTTGCTAACACTTAGAAGTCAGGGGACAAAGGTTGGCTGTAGTACAGTTTGTGGGGAATGTGCACAAGAGATAAGCTGGGAAGATCTCAACAGAGATGCCAAGTTAGGGAAGTGAACCATTTTGTCTATCTATACTTACATTTTGTAAGTCAAGTTCTAACACAACAGAGCCATTACTTTTTGTAACATGAAGCCCCACCCTCATCCTCATTTATAATTGGCATGTCTGCATCCTGCATGCCTTTTCTTTTTCCTTTCTTTTGGCAACAATATGAAAGGGTCTTTTTTGTCTTTCTATTTTTTTGTGGGGTTAATATTTAGAATGGTTAGTTGAAACTAGGTCTGTATAGATTTTGTTATTTGTGATCATTTAATATATAAGTTGTAATGAAATAACAGCTAGTTCTGATTACAGCTCTCAATTTCTGATTTTTAGGGCAACTTTTTCTGTATGCCCAATTTTTAGGGAGCAATGCTTGGGTGTCTATGCATCTCACCTTCCTACAACTTCCTTTAAAGTCTAAAAAAAACTGATAAATCACGATTGGATAATTT

Coding sequence (CDS)

ATGGAGGAGAAGCACGAGGACGTGGATGATGTTGGAAGCGCGTCCGGTGATTCTTTTATTGATGATTCTGAAGACGATGGGCCATCGACTTCTGGGAAGGACGATCAGTTACATCTCGAGGCAAGCGACATTAGCCTTTTCATTTGTATTTACCAAGTCTTGGCTTTACTTGTTGCTTCATGTCTTGCTAGAACCATTGACTGA

Protein sequence

MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVASCLARTID
Homology
[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. NCBI nr
Match: KGN61297.1 (hypothetical protein Csa_2G076530 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 6.5e-26
Identity = 67/67 (100.00%), Postives = 67/67 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVAS 60
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVAS
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVAS 60

Query: 61 CLARTID 68
          CLARTID
Sbjct: 61 CLARTID 67

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. NCBI nr
Match: XP_008441780.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008441783.1 PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.2e-11
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. NCBI nr
Match: XP_008441784.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.2e-11
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. NCBI nr
Match: XP_008441785.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X3 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.2e-11
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. NCBI nr
Match: XP_011649015.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011649016.1 PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.2e-11
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LKL8|A0A0A0LKL8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G076530 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 4.3e-26
Identity = 67/67 (100.00%), Postives = 67/67 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVAS 60
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVAS
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEASDISLFICIYQVLALLVAS 60

Query: 61 CLARTID 68
          CLARTID
Sbjct: 61 CLARTID 67

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B4Z9|A0A1S3B4Z9_CUCME (protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 7.9e-12
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B484|A0A1S3B484_CUCME (protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 7.9e-12
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B4W2|A0A1S3B4W2_CUCME (protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 7.9e-12
Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 41
          MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE
Sbjct: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLE 40

[Close]
BLAST of CsGy2G007770 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2R6PYJ7|A0A2R6PYJ7_ACTCH (Protein CHROMATIN REMODELING like OS=Actinidia chinensis var. chinensis OX=1590841 GN=CEY00_Acc25354 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 4.5e-07
Identity = 32/42 (76.19%), Postives = 38/42 (90.48%), Query Frame = 0 

Query: 1  MEEKHEDVDDVGSASGDSFIDDSEDDGPSTSGKDDQLHLEAS 43
          MEEKHE++DDV SA+ DSFIDDS+DDGPS SG++D LHLEAS
Sbjct: 1  MEEKHEELDDVESATSDSFIDDSDDDGPSISGENDGLHLEAS 42

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsGy2G007770 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN61297.16.5e-26100.00hypothetical protein Csa_2G076530 [Cucumis sativus][more]
XP_008441780.11.2e-11100.00PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_0084417... [more]
XP_008441784.11.2e-11100.00PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 [Cucumis melo][more]
XP_008441785.11.2e-11100.00PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X3 [Cucumis melo][more]
XP_011649015.11.2e-11100.00PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_0116... [more]
BLAST of CsGy2G007770 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy2G007770 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy2G007770 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
tr|A0A0A0LKL8|A0A0A0LKL8_CUCSA4.3e-26100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G076530 PE=4 SV=1[more]
tr|A0A1S3B4Z9|A0A1S3B4Z9_CUCME7.9e-12100.00protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC1034858... [more]
tr|A0A1S3B484|A0A1S3B484_CUCME7.9e-12100.00protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC1034858... [more]
tr|A0A1S3B4W2|A0A1S3B4W2_CUCME7.9e-12100.00protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC1034858... [more]
tr|A0A2R6PYJ7|A0A2R6PYJ7_ACTCH4.5e-0776.19Protein CHROMATIN REMODELING like OS=Actinidia chinensis var. chinensis OX=15908... [more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0005524 ATP binding
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsGy2G007770.1CsGy2G007770.1mRNA


InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..35