Cp4.1LG05g05110 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	Cp4.1LG05g05110
Type	gene
Organism	Cucurbita pepo (Cucurbita pepo (Zucchini))
Description	Unknown protein
Location	Cp4.1LG05 : 2960494 .. 2966413 (-)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGATGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGACCTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAGTACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGNCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACNTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCNACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTNCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCTTATTATTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAGAACACCGCCAACAAAAGTTCACTGAGTCATGGCATTTAAATTATATTAAGTTGTATGAATAATATTAGCCAACTTTCTACATAGAAGGTGAATNGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCTTATTATTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

mRNA sequence

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGATGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGACCTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAGTACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGNCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACNTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCNACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTNCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCATCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCTTATTATTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGATGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGACCTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAGTACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGNCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACNTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCNACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTNCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCATCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCTTATTATTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

Protein sequence

MGAMKPLRHWPQLLSVVAICLIATTVVTAQLDDDLMLPIKNPDLGGDLPKHHHHSTYPPVDHHHKPPQSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPXPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYXPTSTSLLHHLPTSTSLRHHLPTSTSLLHRHPTXKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPYYYKSPPPPHKSKYPH

Homology

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN2_ARATH (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 264.6 bits (675), Expect = 8.1e-69
Identity = 457/799 (57.20%), Postives = 472/799 (59.07%), Query Frame = 1


Query: 1087 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP---PSPYVYKSPPPPPYVYKS 1146
            P  Y SPPP   +Y SP P    YK+PP P Y+  SPPP   P+P V    PPPPYVY S
Sbjct: 25   PETYASPPP---LYSSPLPE-VEYKTPPLP-YVDSSPPPTYTPAPEVEYKSPPPPYVYSS 84

Query: 1147 PPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKS 1206
            PPPP Y     P P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY S
Sbjct: 85   PPPPTY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYNS 144

Query: 1207 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 1266
            PPPP Y     P P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY S
Sbjct: 145  PPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSS 204

Query: 1267 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 1326
            PPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY S
Sbjct: 205  PPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSS 264

Query: 1327 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKS 1386
            PPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY S
Sbjct: 265  PPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSS 324

Query: 1387 PPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPP 1446
            PPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP
Sbjct: 325  PPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPP 384

Query: 1447 SPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKS 1506
              SP P   YKSPPPP       Y+Y SPPPP+ SP P   YKSPPPP       Y Y S
Sbjct: 385  YYSPSPKVDYKSPPPP-------YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP-------YVYSS 444

Query: 1507 PPPPSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1566
            PPPP   P P +    PPPPYVY SPPPP Y       PSP VY   PPPPYVY SPPPP
Sbjct: 445  PPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTY------SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP 504

Query: 1567 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 1626
             Y      P P VY   PPPPY+Y SPPPP Y      P P +Y   PPPPYVY SPPPP
Sbjct: 505  YY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP 564

Query: 1627 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1686
             Y      P P VY   PPPPY+Y SPPPP Y      P P VY   PPPPYVY SPPPP
Sbjct: 565  YY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP 624

Query: 1687 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1746
             Y      P P V+   PPPPYVY SPPPP Y      P P V+   PPPPYVY SPPPP
Sbjct: 625  YY-----SPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVHYKSPPPPYVYNSPPPP 684

Query: 1747 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSP 1806
             Y      P P VY   PPPPYVY S PPPPY   SP     SPPPPY+Y SPPPP  SP
Sbjct: 685  YY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSS-PPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 716

Query: 1807 PPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSP---SPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSP 1866
             P   YKSPPPP  SP P  YYKSPP P      PPPP Y  SP    KSPPPPY Y SP
Sbjct: 745  SPKVYYKSPPPPYYSPSPKVYYKSPPHPHVCVCPPPPPCYSPSPKVVYKSPPPPYVYNSP 716

Query: 1867 PPPSPSP-PPYYYKSPPPP 1873
            PPP  SP P  YYKSPPPP
Sbjct: 805  PPPYYSPSPKVYYKSPPPP 716

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 184.9 bits (468), Expect = 8.2e-45
Identity = 286/452 (63.27%), Postives = 296/452 (65.49%), Query Frame = 1


Query: 115 YVYKSPPPP-----PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 174
           Y Y SPPPP     PP  + SPPP   +Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y SPPP   V
Sbjct: 29  YFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPP---VYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHY-SPPP---V 88

Query: 175 YKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPP 234
           Y SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   +Y SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP
Sbjct: 89  YHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP 148

Query: 235 PPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYK 294
              VY SPPPP   Y+YKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y 
Sbjct: 149 ---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY- 208

Query: 295 SPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPP 354
           SPPP   VY SPPPP   Y+YKSPPPP    + SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP
Sbjct: 209 SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPP--VKHYSPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPP 268

Query: 355 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKS 414
              Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKS
Sbjct: 269 VKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKS 328

Query: 415 PPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--Y 474
           PPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   Y
Sbjct: 329 PPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHY 388

Query: 475 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 534
           VYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   Y+YKSPPPP   Y SPPP   +Y SPPPP
Sbjct: 389 VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPP 428

Query: 535 SP-YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 537
              YVYKSPPPPP  + SPP  PY+YKSPPPP
Sbjct: 449 KEKYVYKSPPPPPVHHYSPPHHPYLYKSPPPP 428

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. Swiss-Prot
Match: LRX3_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 1.2e-35
Identity = 231/414 (55.80%), Postives = 252/414 (60.87%), Query Frame = 1


Query: 744  PTXKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPP----PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 803
            P   +P PPP +  SPPPP  ++ +PP    PPP    SPPPP Y   SPPPPP      
Sbjct: 396  PPVVTPLPPPSL-PSPPPPAPIFSTPPTLTSPPP---PSPPPPVY---SPPPPP------ 455

Query: 804  PPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPY-- 863
            PPPP VY  PPPPP     PPPPP VY  PPPPP     PPPPP +Y  PPP PPPP   
Sbjct: 456  PPPPPVYSPPPPPP-----PPPPPPVYSPPPPPP----PPPPPPPVYSPPPPSPPPPPPP 515

Query: 864  VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP-------YVYKSPPPPPYVYK 923
            VY  PPPPP     PPPPP VY SPPPPP VY SPPPPP       Y  + PPPPP+   
Sbjct: 516  VYSPPPPPP-----PPPPPPVY-SPPPPP-VYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPPH--- 575

Query: 924  SPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 983
            SPPPP +   SPPPP PY Y SPPPP   + SPPP      SPPPP     SPPPP Y Y
Sbjct: 576  SPPPPQF---SPPPPEPYYYSSPPPP---HSSPPP-----HSPPPP----HSPPPPIYPY 635

Query: 984  KSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI-YKSPPPPPYV 1043
             SPPPPP    SPPP P +Y  PPPPP +   PPPP   Y  PPPPP + Y SPPPPP  
Sbjct: 636  LSPPPPPTPVSSPPPTP-VYSPPPPPPCIEPPPPPPCIEYSPPPPPPVVHYSSPPPPPVY 695

Query: 1044 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYV-YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV--YKSPPPP 1103
            Y SPPPPP  Y SPPPPP V Y SPPPP   Y SPPP P  Y SPPPPP     +SPPP 
Sbjct: 696  YSSPPPPPVYYSSPPPPPPVHYSSPPPPEVHYHSPPPSPVHYSSPPPPPSAPCEESPPPA 755

Query: 1104 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYV-YKSPPPPPY 1140
            P V+ SPPPP  +    PPPP +++SPPPP   Y+ P PP   V Y SPPPPP+
Sbjct: 756  PVVHHSPPPP--MVHHSPPPPVIHQSPPPPSPEYEGPLPPVIGVSYASPPPPPF 759

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 149.1 bits (375), Expect = 5.0e-34
Identity = 255/424 (60.14%), Postives = 265/424 (62.50%), Query Frame = 1


Query: 748  SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 807
            S PPPP  + SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYK
Sbjct: 24   SSPPPPVKHYSPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYK 83

Query: 808  SPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPYVYKSPPPPPY 867
            SPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP  VYKSPPPP   Y SPPP      VYKSPPPP  
Sbjct: 84   SPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPP--VYKSPPPPVKHY-SPPP------VYKSPPPPVK 143

Query: 868  IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSP 927
             Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   +YKSPPPP  
Sbjct: 144  HY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPP-- 203

Query: 928  YAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP- 987
              Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP 
Sbjct: 204  VKYYSPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPPV 263

Query: 988  -----PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 1047
                 P +YKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP +      PPP VY SPPPP +   
Sbjct: 264  KHYSPPPVYKSPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPPVHY----SPPPVVYHSPPPPVHY-- 323

Query: 1048 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 1107
               PPP VY SPPPP +      PPP VY SPPPP +      PPP VY SPPPP +   
Sbjct: 324  --SPPPVVYHSPPPPVHY----SPPPVVYHSPPPPVHY----SPPPVVYHSPPPPVHY-- 373

Query: 1108 SPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPP----SPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPP 1160
               PPP VY SPPPP   Y YKSPPPP     P VY SPPPP + Y SPP  PY+YKSPP
Sbjct: 384  --SPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYSPPTVYHSPPPPVHHY-SPPHQPYLYKSPP 373

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 6.8e-23
Identity = 175/303 (57.76%), Postives = 189/303 (62.38%), Query Frame = 1


Query: 1419 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPP---YIYKSPPPPSPSPPP 1478
            Y Y SPPPP +   SPPPP  SPPPPY Y+SPPPP  SPPPP   Y YKSPPPP  SPPP
Sbjct: 34   YTYSSPPPPEH---SPPPPEHSPPPPYHYESPPPPKHSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPP 93

Query: 1479 PYYYKSPPPPSPSPPPP---YYYKSPPPPSPPPPP---YIYKSPPPPP--YVYKSPPPPP 1538
            PY+++SPPPP  SPPPP   Y YKSPPPP   P P   Y YKSPPPP   Y YKSPPPP 
Sbjct: 94   PYHFESPPPPKHSPPPPTPVYKYKSPPPPKHSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPK 153

Query: 1539 YIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 1598
            +   SP P   Y YKSPPPP    K  P P + YK      Y YKSPPPP  +YK     
Sbjct: 154  H---SPAPEHHYKYKSPPPP----KHFPAPEHHYK------YKYKSPPPPTPVYK----- 213

Query: 1599 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 1658
               YKSPPPP  +YK   PPP  +   P   Y YKSPPPP  VYKSPPPP +   SPPPP
Sbjct: 214  ---YKSPPPPTPVYKYKSPPPPKHSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKSPPPPEH---SPPPP 273

Query: 1659 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP-YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSP 1708
              VYK   PPP ++  PPP P Y YKSPPPP +   SPPPP Y   SPPPP   Y Y SP
Sbjct: 274  TPVYKYKSPPPPMHSPPPPTPVYKYKSPPPPMH---SPPPPVY---SPPPPKHHYSYTSP 303

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TrEMBL
Match: D8TDP8_SELML (Putative uncharacterized protein OS=Selaginella moellendorffii GN=SELMODRAFT_449207 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 9.5e-250
Identity = 695/991 (70.13%), Postives = 746/991 (75.28%), Query Frame = 1


Query: 377  YVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK---SPPPPPYVYKSPPPPP-YVYK 436
            Y Y SPPPP   Y YKSPPPP Y YKSPPPPP VYK    PPPPPY YKSPPPPP Y Y+
Sbjct: 45   YTYSSPPPPSPVYEYKSPPPPVYEYKSPPPPPPVYKYKSPPPPPPYYYKSPPPPPPYKYE 104

Query: 437  SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 496
            SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+
Sbjct: 105  SPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYE 164

Query: 497  SPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP-YI 556
            SPPPPPY Y+SPPPP PY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPP Y 
Sbjct: 165  SPPPPPYKYESPPPP-PYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPPYY 224

Query: 557  YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPXPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 616
            YKSPPPP  VYK        YKSPPPPPY Y+SPPPPP  Y YKSPPPPPY YKSPPPPP
Sbjct: 225  YKSPPPPSPVYK--------YKSPPPPPYKYESPPPPP--YYYKSPPPPPYYYKSPPPPP 284

Query: 617  YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 676
             VYK        YKSPPPPPY YKSPP        PP P Y YKSPPPP Y YKSPPPP 
Sbjct: 285  PVYK--------YKSPPPPPYYYKSPP--------PPSPVYYYKSPPPPAYYYKSPPPPV 344

Query: 677  YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-------PYVYXPTSTSLLHH 736
            Y YKSPPPP Y Y+SPPPP    K      Y Y             P+     ++S    
Sbjct: 345  YYYKSPPPPAYHYQSPPPPSGKVKITCGESYYYGYTNKHGIFRIELPHQSWEEASSCKAK 404

Query: 737  LPTSTSLRHHL---------PTSTSLLHRHPTXKS--PPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 796
            +  S+ ++             T   L  +  T K       P+IY +P P    + +   
Sbjct: 405  IIKSSYIKSSCNVITDYRSGATGAKLKFKSKTEKELVLTAGPFIYATPEPSSVCFYT--S 464

Query: 797  PPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSP 856
            PPY YKSPPPP   Y Y SPPPP Y YKSPP        PP P Y YKSPP        P
Sbjct: 465  PPYEYKSPPPPTPVYHYASPPPPVYYYKSPP--------PPSPVYYYKSPP--------P 524

Query: 857  PPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPYVYKSPPPP-PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 916
            P P Y YKSPPPPPY YKSPPP PPP Y YKSPPPP PY YKSPPPPPY YKSPPPPPY 
Sbjct: 525  PSPVYYYKSPPPPPYYYKSPPP-PPPKYYYKSPPPPSPYYYKSPPPPPYYYKSPPPPPYK 584

Query: 917  YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 976
            Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP  Y Y+SPPPP Y YKS PPPPY
Sbjct: 585  YESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPP-VYKYESPPPPVYKYKS-PPPPY 644

Query: 977  VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1036
             Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPP Y YKSPPPPPY
Sbjct: 645  KYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPVYKYKSPPPPPY 704

Query: 1037 VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1096
             YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPP Y
Sbjct: 705  YYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPVY 764

Query: 1097 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSP 1156
             YKSPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP P
Sbjct: 765  KYKSPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPP-P 824

Query: 1157 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 1216
            Y Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP Y Y+SPPPP Y YKS PPPPY YKSPPPPP
Sbjct: 825  YKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPVYKYESPPPPVYKYKS-PPPPYYYKSPPPPP 884

Query: 1217 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 1276
            Y Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPP
Sbjct: 885  YKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPP 944

Query: 1277 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 1336
            Y Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPP
Sbjct: 945  YKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPP 980

Query: 1337 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1340
            Y YKSPPPP Y       PPYVYKSPPPP Y
Sbjct: 1005 YYYKSPPPPEY-----QSPPYVYKSPPPPSY 980

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TrEMBL
Match: Q9C668_ARATH (Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.10 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 1.2e-180
Identity = 404/455 (88.79%), Postives = 416/455 (91.43%), Query Frame = 1


Query: 928  YAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 987
            Y Y  P PP YVYK   PP ++Y SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 28   YTYSPPSPPSYVYK---PPTHIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPP 87

Query: 988  YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 1047
            YIYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 88   YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPP 147

Query: 1048 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 1107
            YVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPP
Sbjct: 148  YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 207

Query: 1108 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 1167
            YVYKSPPPPPY+Y SPPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 208  YVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 267

Query: 1168 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1227
            PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 268  PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 327

Query: 1228 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1287
            PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 328  PYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 387

Query: 1288 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1347
            PYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 388  PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 447

Query: 1348 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP---YLYKSPPPPPY 1380
            PYVYKSP PPPYVYKSPPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 448  PYVYKSPSPPPYVYKSPPPPPSYSYSYSSPPPPIY 478

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L0P1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G291360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 9.1e-176
Identity = 574/825 (69.58%), Postives = 598/825 (72.48%), Query Frame = 1


Query: 1056 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS-PPPPPYIYKSPPPP-PYVYKSP 1115
            P + + S  PP Y ++  PPPP  Y    PPP  YK    PP Y+YKSPPPP PY+YKSP
Sbjct: 48   PKHQHHSKFPPKYHHRHTPPPPVKYHHHKPPPPKYKHHKSPPSYVYKSPPPPSPYIYKSP 107

Query: 1116 PPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 1175
            PPPPY+YKSPPPPSPY+YKSPPPPPYVYKSPPPP PYIYKSPPPPPYVY SPPPP     
Sbjct: 108  PPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYNSPPPP----S 167

Query: 1176 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 1235
              PPPPYVYKSPPPPPY+YKS   PP+VY SPPPP       PPPPYVYKSPPPP     
Sbjct: 168  PSPPPPYVYKSPPPPPYVYKS---PPHVYSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 227

Query: 1236 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 1295
              PPPPYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPYVYKSPPPP     
Sbjct: 228  PSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 287

Query: 1296 SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 1355
              PPPPY+YKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP     
Sbjct: 288  PSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 347

Query: 1356 SPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 1415
              PPPPYVYKSPPPP     SP          PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYK
Sbjct: 348  PSPPPPYVYKSPPPP-----SP---------SPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYK 407

Query: 1416 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPS 1475
            SPPPP       PPPPY+YKSPPPPSPSPPPPY+  SPP     PPPPY+YKSPPPPSPS
Sbjct: 408  SPPPP----SPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVSSSPP-----PPPPYVYKSPPPPSPS 467

Query: 1476 PPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSP-PPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 1535
            PPPPY YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPPSP PPPPY+YKSPPPPPYVYKSPPPP     
Sbjct: 468  PPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP----- 527

Query: 1536 SPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVY 1595
            SP PP PYVY SPPPP       PPPPY+YK+PPPP       PPPPY+YKSPPPP    
Sbjct: 528  SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYKTPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP---- 587

Query: 1596 KSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVY 1655
               PPPPY+YKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPY+YKSPPPP    
Sbjct: 588  SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP---- 647

Query: 1656 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLY 1715
               PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY SPPPP    
Sbjct: 648  SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP---- 707

Query: 1716 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP-PPPPYV 1775
               PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP       PPPPY+YKSPPPPP    SP PPPPYV
Sbjct: 708  SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYIYKSPPPPP---PSPSPPPPYV 758

Query: 1776 YKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPP 1835
            YKSPPPPSPSPPPPY+YKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPPSPSPP
Sbjct: 768  YKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPP 758

Query: 1836 PPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPSPPP-YYYKSPPPPHK 1875
            PPYYYKSPPPP  SPPPPY+YKSPPPP  SPPP YYYKSPPPP+K
Sbjct: 828  PPYYYKSPPPPSPSPPPPYFYKSPPPPLKSPPPTYYYKSPPPPYK 758

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TrEMBL
Match: Q9C669_ARATH (Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.9 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 514.2 bits (1323), Expect = 6.6e-142
Identity = 360/442 (81.45%), Postives = 371/442 (83.94%), Query Frame = 1


Query: 100 SPPPYLYKSPPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 159
           SP P  Y    P PPYVY SPPP   YVY SP PPPY+YK   PPPY+Y SPPPPPYVY 
Sbjct: 28  SPTPTPYS---PLPPYVYNSPPP---YVYNSPSPPPYVYK---PPPYIYSSPPPPPYVYS 87

Query: 160 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 219
           SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY 
Sbjct: 88  SPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYS 147

Query: 220 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 279
           SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY  PPPPPYVY+SPPPPPYVY SPPPPPYVYK
Sbjct: 148 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 207

Query: 280 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 339
           SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 208 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 267

Query: 340 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 399
           KSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPY+Y
Sbjct: 268 KSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 327

Query: 400 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK-SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 459
           KSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYV   SPPP PYVYK   PPPYVYK   PPPYV
Sbjct: 328 KSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYK---PPPYVYK---PPPYV 387

Query: 460 YK-SPPPPPYVYKSPPPPPYIYK-SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPP 519
           Y  SPPP PYVYK   PPPY+Y  SPPP PYVYK   PPPY+Y   PPP+PYVYK   PP
Sbjct: 388 YNYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PP 443

Query: 520 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPY 539
           PYVY SP PPPY Y SP PP Y
Sbjct: 448 PYVYSSPSPPPY-YSSPSPPLY 443

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TrEMBL
Match: M4D3G5_BRARP (Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 496.5 bits (1277), Expect = 1.4e-136
Identity = 318/362 (87.85%), Postives = 326/362 (90.06%), Query Frame = 1


Query: 158 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 217
           Y  P PPPY Y  P  PPYVYKSPP   Y Y SPPPPPY+Y SPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 27  YSPPSPPPYAYSYPWLPPYVYKSPP---YAYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYV 86

Query: 218 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 277
           YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYV
Sbjct: 87  YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYV 146

Query: 278 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 337
           YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY
Sbjct: 147 YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPY 206

Query: 338 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 397
           VYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY
Sbjct: 207 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPY 266

Query: 398 IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 457
           +YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY+SPPPPPYVYKSPPPPPYVY+SPPPPPY
Sbjct: 267 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYRSPPPPPYVYKSPPPPPYVYRSPPPPPY 326

Query: 458 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPS-PYVYKSPPPP 517
           VYKSPPPPPYVY S PPPPY+YKSPPPPPYVY SPP P YIY SPPPPS  Y Y SPPPP
Sbjct: 327 VYKSPPPPPYVYSSAPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPSPSYIYSSPPPPSYSYSYSSPPPP 384

Query: 518 PY 519
            Y
Sbjct: 387 IY 384

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TAIR10
Match: AT1G26240.1 (AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 6.2e-184
Identity = 404/455 (88.79%), Postives = 416/455 (91.43%), Query Frame = 1


Query: 928  YAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 987
            Y Y  P PP YVYK   PP ++Y SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 28   YTYSPPSPPSYVYK---PPTHIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPP 87

Query: 988  YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 1047
            YIYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 88   YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPP 147

Query: 1048 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 1107
            YVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPP
Sbjct: 148  YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 207

Query: 1108 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 1167
            YVYKSPPPPPY+Y SPPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 208  YVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 267

Query: 1168 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1227
            PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 268  PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 327

Query: 1228 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1287
            PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 328  PYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 387

Query: 1288 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1347
            PYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 388  PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 447

Query: 1348 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP---YLYKSPPPPPY 1380
            PYVYKSP PPPYVYKSPPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 448  PYVYKSPSPPPYVYKSPPPPPSYSYSYSSPPPPIY 478

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TAIR10
Match: AT1G26250.1 (AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 514.2 bits (1323), Expect = 3.3e-145
Identity = 360/442 (81.45%), Postives = 371/442 (83.94%), Query Frame = 1


Query: 100 SPPPYLYKSPPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 159
           SP P  Y    P PPYVY SPPP   YVY SP PPPY+YK   PPPY+Y SPPPPPYVY 
Sbjct: 28  SPTPTPYS---PLPPYVYNSPPP---YVYNSPSPPPYVYK---PPPYIYSSPPPPPYVYS 87

Query: 160 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 219
           SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY 
Sbjct: 88  SPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYS 147

Query: 220 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 279
           SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY  PPPPPYVY+SPPPPPYVY SPPPPPYVYK
Sbjct: 148 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 207

Query: 280 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 339
           SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 208 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 267

Query: 340 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 399
           KSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPY+Y
Sbjct: 268 KSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 327

Query: 400 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK-SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 459
           KSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYV   SPPP PYVYK   PPPYVYK   PPPYV
Sbjct: 328 KSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYK---PPPYVYK---PPPYV 387

Query: 460 YK-SPPPPPYVYKSPPPPPYIYK-SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPP 519
           Y  SPPP PYVYK   PPPY+Y  SPPP PYVYK   PPPY+Y   PPP+PYVYK   PP
Sbjct: 388 YNYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PP 443

Query: 520 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPY 539
           PYVY SP PPPY Y SP PP Y
Sbjct: 448 PYVYSSPSPPPY-YSSPSPPLY 443

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TAIR10
Match: AT1G23720.1 (AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 390.2 bits (1001), Expect = 7.2e-108
Identity = 645/1054 (61.20%), Postives = 658/1054 (62.43%), Query Frame = 1


Query: 753  PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP------PYVYKSPPPPPYVY 812
            PY Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP      P V    PPPPYVY
Sbjct: 8    PYTYSSPPPPLY---DSPTPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPLSYSPSPKVDYKSPPPPYVY 67

Query: 813  KSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPYVYKSPPPPP 872
             SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y        P P   YKSPPPP 
Sbjct: 68   SSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPYY-------SPSPKVDYKSPPPP- 127

Query: 873  YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPS 932
            Y+Y SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP 
Sbjct: 128  YVYSSPPPP---YYSPSPKP-TYKSPPPP-YVYNSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP- 187

Query: 933  PYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 992
             Y Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP
Sbjct: 188  -YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYNSPPPP---YYSPSPKP-TYKSPPPP 247

Query: 993  PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1052
             YIY SPPPP   Y SP P P VYKSPPPP Y+Y SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP
Sbjct: 248  -YIYSSPPPP---YYSPSPKP-VYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPKP-AYKSPPPP 307

Query: 1053 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 1112
             YVY SPPPP   Y SP P P +YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP
Sbjct: 308  -YVYSSPPPP---YYSPSPKP-IYKSPPPP-YVYNSPPPP---YYSPSPKP-AYKSPPPP 367

Query: 1113 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 1172
             YVY  PPPP Y     P P P VYKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPP
Sbjct: 368  -YVYSFPPPPYY----SPSPKP-VYKSPPPP-YVYNSPPPP---YYSPSPKP-AYKSPPP 427

Query: 1173 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1232
            P Y+Y SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P VYKSPPP
Sbjct: 428  P-YVYSSPPPP---YYSPSPKP-TYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPKP-VYKSPPP 487

Query: 1233 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1292
            P YIY SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKS PP
Sbjct: 488  P-YIYNSPPPP---YYSPSPKPS-YKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKLTYKSSPP 547

Query: 1293 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1352
            P YVY SPPPP Y     P P  VYKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPP
Sbjct: 548  P-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPKPS-YKSPPP 607

Query: 1353 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP------PPPPYI 1412
            P YVY SPPPP Y     P P  +YKSPP P +V   PPPPP    SP      PP PY+
Sbjct: 608  P-YVYNSPPPPYY----SPSPKVIYKSPPHP-HVCVCPPPPPCYSHSPKIEYKSPPTPYV 667

Query: 1413 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPP 1472
            Y SPPPPPY   SP P    YKS PPP YVY SPPPP  SP P  +YKSPPP       P
Sbjct: 668  YHSPPPPPYYSPSPKP---AYKSSPPP-YVYSSPPPPYYSPAPKPVYKSPPP-------P 727

Query: 1473 YIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPPPPPYIYKSPPPPPYVY 1532
            Y+Y        SPPPPYY  SP P   SPPPPY Y SPPPP        Y SP P P  Y
Sbjct: 728  YVYN-------SPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSPPPP--------YYSPTPKP-TY 787

Query: 1533 KSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI 1592
            KS PPPPY+Y SPPPP    Y SP P P  YKS PPPPY+Y SPPPP   Y SP P P  
Sbjct: 788  KS-PPPPYVYSSPPPP----YYSPSPKP-TYKS-PPPPYVYSSPPPP---YYSPAPKP-T 847

Query: 1593 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI 1652
            YKS PPPPYVY SPPPP   Y SP P P  YKS PPPPYVY SPPPPPY     P P   
Sbjct: 848  YKS-PPPPYVYSSPPPP---YYSPSPKP-TYKS-PPPPYVYSSPPPPPYY---SPSPKVE 892

Query: 1653 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1712
            YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY SPPPPPY     P P   
Sbjct: 908  YKS-PPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPPYY---SPSPKVE 892

Query: 1713 YKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1772
            YKS PPPPY+Y SPPPP Y     P P   YKS PPPPY+Y SPPPP Y     P P   
Sbjct: 968  YKS-PPPPYVYSSPPPPTYY---SPSPKVEYKS-PPPPYVYNSPPPPAYY---SPSPKIE 892

Query: 1773 YKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPS 1795
            YKS PPPPYVY SPPPPS SP P   YKSPPPPS
Sbjct: 1028 YKS-PPPPYVYSSPPPPSYSPSPKAEYKSPPPPS 892

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TAIR10
Match: AT3G28550.1 (AT3G28550.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 4.1e-103
Identity = 674/1144 (58.92%), Postives = 693/1144 (60.58%), Query Frame = 1


Query: 750  PPPPYIYKSPPPP------PYV-YKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYV- 809
            PP P +Y SPPPP      P V YKSPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP Y  
Sbjct: 46   PPLPDVYSSPPPPLEYSPAPKVDYKSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP-YVYNSPPPPYYSP 105

Query: 810  -----YKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPP 869
                 YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP 
Sbjct: 106  SPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPIY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPS 165

Query: 870  PX-----PPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 929
            P      PP PYVY SPPP  Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P
Sbjct: 166  PKVEYKSPPSPYVYNSPPPSYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSP 225

Query: 930  PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 989
              VYKSPPPP Y+Y SPPPP    Y SP P    YKSPPPP YVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 226  KVVYKSPPPP-YVYSSPPPP----YYSPSPK-VDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPS 285

Query: 990  PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP 1049
            P  VYKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 286  PKIVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPS 345

Query: 1050 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1109
            P  VYKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 346  PKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPTPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPS 405

Query: 1110 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPP 1169
            P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P P  +YKSPPPP  YVY SPPPP Y     P
Sbjct: 406  PKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKIVYKSPPPP--YVYSSPPPPYYT----P 465

Query: 1170 PPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPP 1229
             P  +YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P
Sbjct: 466  SPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SP 525

Query: 1230 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 1289
             P  VYKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P
Sbjct: 526  SPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SP 585

Query: 1290 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 1349
             P  +YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P  +YKSPPPP YVY SPPPP Y     P
Sbjct: 586  SPKVLYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SP 645

Query: 1350 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPP 1409
             P  VYKSPPPP YVY SPPPP Y     P P  VYKSPPPP Y+Y SPPPP   Y SP 
Sbjct: 646  SPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPS 705

Query: 1410 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPY 1469
            P  Y YKSPP P +     P P  +YKSPP P +V   PPPPP    SP     S PPPY
Sbjct: 706  PKVY-YKSPPSPYHA----PSPKVLYKSPPHP-HVCVCPPPPPCYSPSPKVVYKSSPPPY 765

Query: 1470 IYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPPP 1529
            +Y SPPPP  SP P   YKSPPPP       Y Y SPPPP  SP P  +YKSPPPP    
Sbjct: 766  VYSSPPPPYHSPSPKVHYKSPPPP-------YVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPP---- 825

Query: 1530 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPP 1589
              Y+Y SPPPP Y     P P  +YKSPPPP  YVY SPPPP Y     P P  +YKSPP
Sbjct: 826  --YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPPPP--YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPP 885

Query: 1590 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 1649
            PP YVY SPPPP Y     P P  VYKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P P  VYKSPP
Sbjct: 886  PP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPP 945

Query: 1650 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 1709
            PP YVY SPPPP Y     P P  VYKSPPPP YVY SPPPP Y     P P  VYKSPP
Sbjct: 946  PP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKSPP 1005

Query: 1710 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPP 1769
            PP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPP
Sbjct: 1006 PP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPP 1014

Query: 1770 PPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPP 1829
            PP YVY SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP  SP P   YKSPPP       
Sbjct: 1066 PP-YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPP------- 1014

Query: 1830 PYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSP 1864
            PY+Y SPPPP  SP P   YK       SPPPPYY  SP    KSPPPPY Y SPPPPS 
Sbjct: 1126 PYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK-------SPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPSY 1014

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TAIR10
Match: AT3G54580.1 (AT3G54580.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 8.3e-96
Identity = 619/1080 (57.31%), Postives = 636/1080 (58.89%), Query Frame = 1


Query: 813  PYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPX--PPPPYVYKSPPPPPYIYK 872
            PY   SPPP   +Y SP P    YK+PP P YI  SPPP   P P   YKSPPPP Y+Y 
Sbjct: 25   PYTDSSPPP---LYSSPLPK-IEYKTPPLP-YIDSSPPPTYSPAPEVEYKSPPPP-YVYS 84

Query: 873  SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAY 932
            SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP  Y Y
Sbjct: 85   SPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP--YVY 144

Query: 933  KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 992
             SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y+Y
Sbjct: 145  SSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVY 204

Query: 993  KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 1052
             SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY
Sbjct: 205  SSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVY 264

Query: 1053 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVY 1112
             SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY
Sbjct: 265  SSPPPPTY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVY 324

Query: 1113 KSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI 1172
             SPPPP Y       PSP V    PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y+
Sbjct: 325  SSPPPPTY------SPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YV 384

Query: 1173 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI 1232
            Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y+
Sbjct: 385  YSSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YV 444

Query: 1233 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1292
            Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YV
Sbjct: 445  YSSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YV 504

Query: 1293 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1352
            Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YV
Sbjct: 505  YSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY----SPSPKVDYKSPPPP-YV 564

Query: 1353 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 1412
            Y SPPPP   Y SP P  Y YKSPPPP YVY SPPPP Y      P P +Y   PPPPYV
Sbjct: 565  YSSPPPP---YYSPSPKVY-YKSPPPP-YVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYV 624

Query: 1413 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPS 1472
            Y SPPPP   Y SP P  Y YKSPPPP  SP P   YKSPPPP       Y+Y SPPPP 
Sbjct: 625  YSSPPPP---YYSPSPKVY-YKSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP-------YVYSSPPPPY 684

Query: 1473 PSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 1532
             SP P  YYKSPPPP       Y Y SPPPP   P P +    PPPPYVY SPPPP Y  
Sbjct: 685  YSPSPKVYYKSPPPP-------YVYSSPPPPYHSPSPKVQYKSPPPPYVYSSPPPPYY-- 744

Query: 1533 KSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYIYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYI 1592
                 PSP VY   PPPPYVY SPPPP     P +Y   PPPPYVY SPPPP     P +
Sbjct: 745  ----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKV 804

Query: 1593 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI 1652
            Y   PP P+V   PPPPP      P P  VYKS PPPPYVY SPPPP Y      P P +
Sbjct: 805  YYKSPPHPHVCVCPPPPPCY---SPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPHY-----SPSPKV 864

Query: 1653 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1712
            Y   PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y      P P V+   PPPPYV
Sbjct: 865  YYKSPPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVHYKSPPPPYYA-----PTPKVHYKSPPPPYV 924

Query: 1713 YKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1772
            Y SPPPP Y      P P V+   PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYV
Sbjct: 925  YSSPPPPYY-----SPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKS-PPPPYV 947

Query: 1773 YKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP--SPSPPPPYY 1832
            Y S PPPPY   SP     SPPPPY+Y SPPPP  SP P   YKSPPPP    SPPPPYY
Sbjct: 985  YSS-PPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYY 947

Query: 1833 YKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPYYYKSPPPPHKSKYP 1879
              SP     SPPPPY Y SPPPP  SP P   YKSP      PPPY YKSPPPP  S  P
Sbjct: 1045 SPSPVVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSP------PPPYVYKSPPPPSYSPSP 947

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. NCBI nr
Match: gi|302824135|ref|XP_002993713.1| (hypothetical protein SELMODRAFT_449207 [Selaginella moellendorffii])

HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 1.4e-249
Identity = 695/991 (70.13%), Postives = 746/991 (75.28%), Query Frame = 1


Query: 377  YVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK---SPPPPPYVYKSPPPPP-YVYK 436
            Y Y SPPPP   Y YKSPPPP Y YKSPPPPP VYK    PPPPPY YKSPPPPP Y Y+
Sbjct: 45   YTYSSPPPPSPVYEYKSPPPPVYEYKSPPPPPPVYKYKSPPPPPPYYYKSPPPPPPYKYE 104

Query: 437  SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 496
            SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+
Sbjct: 105  SPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYE 164

Query: 497  SPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP-YI 556
            SPPPPPY Y+SPPPP PY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPP Y 
Sbjct: 165  SPPPPPYKYESPPPP-PYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPPYY 224

Query: 557  YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPXPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 616
            YKSPPPP  VYK        YKSPPPPPY Y+SPPPPP  Y YKSPPPPPY YKSPPPPP
Sbjct: 225  YKSPPPPSPVYK--------YKSPPPPPYKYESPPPPP--YYYKSPPPPPYYYKSPPPPP 284

Query: 617  YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 676
             VYK        YKSPPPPPY YKSPP        PP P Y YKSPPPP Y YKSPPPP 
Sbjct: 285  PVYK--------YKSPPPPPYYYKSPP--------PPSPVYYYKSPPPPAYYYKSPPPPV 344

Query: 677  YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-------PYVYXPTSTSLLHH 736
            Y YKSPPPP Y Y+SPPPP    K      Y Y             P+     ++S    
Sbjct: 345  YYYKSPPPPAYHYQSPPPPSGKVKITCGESYYYGYTNKHGIFRIELPHQSWEEASSCKAK 404

Query: 737  LPTSTSLRHHL---------PTSTSLLHRHPTXKS--PPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 796
            +  S+ ++             T   L  +  T K       P+IY +P P    + +   
Sbjct: 405  IIKSSYIKSSCNVITDYRSGATGAKLKFKSKTEKELVLTAGPFIYATPEPSSVCFYT--S 464

Query: 797  PPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSP 856
            PPY YKSPPPP   Y Y SPPPP Y YKSPP        PP P Y YKSPP        P
Sbjct: 465  PPYEYKSPPPPTPVYHYASPPPPVYYYKSPP--------PPSPVYYYKSPP--------P 524

Query: 857  PPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPYVYKSPPPP-PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 916
            P P Y YKSPPPPPY YKSPPP PPP Y YKSPPPP PY YKSPPPPPY YKSPPPPPY 
Sbjct: 525  PSPVYYYKSPPPPPYYYKSPPP-PPPKYYYKSPPPPSPYYYKSPPPPPYYYKSPPPPPYK 584

Query: 917  YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 976
            Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP  Y Y+SPPPP Y YKS PPPPY
Sbjct: 585  YESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPP-VYKYESPPPPVYKYKS-PPPPY 644

Query: 977  VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1036
             Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPP Y YKSPPPPPY
Sbjct: 645  KYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPVYKYKSPPPPPY 704

Query: 1037 VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1096
             YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPP Y
Sbjct: 705  YYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPVY 764

Query: 1097 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSP 1156
             YKSPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP P
Sbjct: 765  KYKSPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPP-P 824

Query: 1157 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 1216
            Y Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP Y Y+SPPPP Y YKS PPPPY YKSPPPPP
Sbjct: 825  YKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPVYKYESPPPPVYKYKS-PPPPYYYKSPPPPP 884

Query: 1217 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 1276
            Y Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPP
Sbjct: 885  YKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPP 944

Query: 1277 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 1336
            Y Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPP
Sbjct: 945  YKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPP 980

Query: 1337 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1340
            Y YKSPPPP Y       PPYVYKSPPPP Y
Sbjct: 1005 YYYKSPPPPEY-----QSPPYVYKSPPPPSY 980

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. NCBI nr
Match: gi|727421422|ref|XP_010436500.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Camelina sativa])

HSP 1 Score: 693.3 bits (1788), Expect = 1.1e-195
Identity = 446/513 (86.94%), Postives = 457/513 (89.08%), Query Frame = 1


Query: 907  YVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 966
            Y Y  P PPPYIY SP PP PY Y SPP  PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPP
Sbjct: 28   YTYSPPSPPPYIYNSPSPPPPYVYNSPPYAPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 87

Query: 967  PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 1026
            PYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP
Sbjct: 88   PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPLPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 147

Query: 1027 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 1086
            PYVY SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPP PYVYKSPPPP
Sbjct: 148  PYVYSSPPPLPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPLPYVYKSPPPP 207

Query: 1087 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1146
            PYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPP PY+YKSPPPP PYVY SPPPPPYVYKSPPP
Sbjct: 208  PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPLPYVYKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPP 267

Query: 1147 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 1206
            PPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPP
Sbjct: 268  PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 327

Query: 1207 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1266
            PPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPP
Sbjct: 328  PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 387

Query: 1267 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 1326
            PPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPP
Sbjct: 388  PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 447

Query: 1327 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPP 1386
            PPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY S   PPYVYK PPPPPY+Y S   PPYVYK PPP
Sbjct: 448  PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSS---PPYVYKPPPPPPYVYSS---PPYVYK-PPP 507

Query: 1387 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 1420
            PPY Y S   PPY+Y SPPPP Y Y SPPPP Y
Sbjct: 508  PPYTYSS---PPYVYTSPPPPSYSYSSPPPPKY 529

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. NCBI nr
Match: gi|923686284|ref|XP_013655185.1| (PREDICTED: extensin-2-like isoform X1 [Brassica napus])

HSP 1 Score: 670.2 bits (1728), Expect = 1.0e-188
Identity = 421/471 (89.38%), Postives = 433/471 (91.93%), Query Frame = 1


Query: 921  SPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 980
            SPP P PYAY SP  PPYVYKSPP PPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 28   SPPSPPPYAYSSPWLPPYVYKSPPLPPYVYNSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 87

Query: 981  KSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 1040
            KSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 88   KSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 147

Query: 1041 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 1100
            KSPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY+Y
Sbjct: 148  KSPPPPPYVYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 207

Query: 1101 KSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 1160
             SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPP PYV+KSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYV
Sbjct: 208  SSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVHKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYV 267

Query: 1161 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1220
            Y SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYV
Sbjct: 268  YSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYV 327

Query: 1221 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1280
            Y SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYV
Sbjct: 328  YPSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYV 387

Query: 1281 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1340
            Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYV
Sbjct: 388  YSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYV 447

Query: 1341 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 1392
            Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP Y+Y SPPPP Y Y    PPP +Y
Sbjct: 448  YSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPSYIYSSPPPPSYSYSYSSPPPPIY 497

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. NCBI nr
Match: gi|923686169|ref|XP_013655155.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Brassica napus])

HSP 1 Score: 666.0 bits (1717), Expect = 1.9e-187
Identity = 419/486 (86.21%), Postives = 434/486 (89.30%), Query Frame = 1


Query: 228 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 287
           Y  P PPPY Y  P  PPYVYKSPP   Y Y SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 27  YSPPSPPPYAYSYPWLPPYVYKSPP---YAYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYV 86

Query: 288 YKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 347
           YKSPPPPPY+Y SPPPP PY YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY
Sbjct: 87  YKSPPPPPYVYSSPPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPPY 146

Query: 348 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPY 407
           +YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPY
Sbjct: 147 IYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPY 206

Query: 408 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 467
           VYKSPPPPPYVY  PPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY
Sbjct: 207 VYKSPPPPPYVYSQPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPPY 266

Query: 468 VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 527
           +YKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 267 IYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 326

Query: 528 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 587
           Y+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 327 YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 386

Query: 588 XPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 647
             YVYKSPPPPPY+Y SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPP
Sbjct: 387 --YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPP 446

Query: 648 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP-PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 707
           PPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPP PPYVY SPP P Y+Y SPPPP Y Y    
Sbjct: 447 PPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPAPPYVYNSPPSPSYIYSSPPPPSYSYSYSS 506

Query: 708 PPPYVY 713
           PPP +Y
Sbjct: 507 PPPPIY 506

[Close]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. NCBI nr
Match: gi|923686288|ref|XP_013655186.1| (PREDICTED: extensin-2-like isoform X2 [Brassica napus])

HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 1.0e-183
Identity = 411/461 (89.15%), Postives = 424/461 (91.97%), Query Frame = 1


Query: 921  SPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 980
            SPP P PYAY+   PPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 28   SPPSPPPYAYR---PPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 87

Query: 981  KSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 1040
            KSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 88   KSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 147

Query: 1041 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 1100
             SPPPP YVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+Y
Sbjct: 148  NSPPPP-YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 207

Query: 1101 KSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 1160
            KSPPPPPYVY SPPPPPY++KSPPPP PYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYV
Sbjct: 208  KSPPPPPYVYSSPPPPPYVHKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV 267

Query: 1161 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1220
            YKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 268  YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPPYV 327

Query: 1221 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1280
            YKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 328  YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV 387

Query: 1281 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 1340
            YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 388  YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV 447

Query: 1341 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVY 1382
            YKSPPPPPYVY SPPPP Y+Y SPPPP Y Y    PPP +Y
Sbjct: 448  YKSPPPPPYVYSSPPPPSYIYSSPPPPSYSYSYSSPPPPIY 483

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
EXTN2_ARATH	8.1e-69	57.20	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
EXTN3_ARATH	8.2e-45	63.27	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3	[more]
LRX3_ARATH	1.2e-35	55.80	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1...	[more]
EXTN1_ARATH	5.0e-34	60.14	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
EXTN_DAUCA	6.8e-23	57.76	Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
D8TDP8_SELML	9.5e-250	70.13	Putative uncharacterized protein OS=Selaginella moellendorffii GN=SELMODRAFT_449...	[more]
Q9C668_ARATH	1.2e-180	88.79	Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.10 P...	[more]
A0A0A0L0P1_CUCSA	9.1e-176	69.58	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G291360 PE=4 SV=1	[more]
Q9C669_ARATH	6.6e-142	81.45	Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.9 PE...	[more]
M4D3G5_BRARP	1.4e-136	87.85	Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G26240.1	6.2e-184	88.79	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	3.3e-145	81.45	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G23720.1	7.2e-108	61.20	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G28550.1	4.1e-103	58.92	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G54580.1	8.3e-96	57.31	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

BLAST of Cp4.1LG05g05110 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|302824135\|ref\|XP_002993713.1\|	1.4e-249	70.13	hypothetical protein SELMODRAFT_449207 [Selaginella moellendorffii]	[more]
gi\|727421422\|ref\|XP_010436500.1\|	1.1e-195	86.94	PREDICTED: extensin-2-like [Camelina sativa]	[more]
gi\|923686284\|ref\|XP_013655185.1\|	1.0e-188	89.38	PREDICTED: extensin-2-like isoform X1 [Brassica napus]	[more]
gi\|923686169\|ref\|XP_013655155.1\|	1.9e-187	86.21	PREDICTED: extensin-2-like [Brassica napus]	[more]
gi\|923686288\|ref\|XP_013655186.1\|	1.0e-183	89.15	PREDICTED: extensin-2-like isoform X2 [Brassica napus]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this gene:

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0009664	plant-type cell wall organization

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0005199	structural constituent of cell wall

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR006706	Extensin_dom

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0042546	cell wall biogenesis
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
cellular_component	GO:0005618	cell wall
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cp4.1LG05g05110.1	Cp4.1LG05g05110.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 1675..1717 score: 1.1E-4coord: 504..546 score: 6.0E-5coord: 974..1016 score: 9.7E-5coord: 1645..1687 score: 6.7E-5coord: 586..628 score: 9.3E-5coord: 393..435 score: 8.1E-5coord: 1245..1287 score: 6.5E-5coord: 1395..1437 score: 1.3E-4coord: 1135..1177 score: 1.6E-4coord: 1685..1727 score: 6.8E-5coord: 1054..1096 score: 6.3E-5coord: 544..586 score: 6.5E-5coord: 1355..1397 score: 1.2E-4coord: 893..936 score: 2.7E-5coord: 1034..1076 score: 6.6E-5coord: 1225..1267 score: 9.5E-5coord: 1335..1377 score: 1.2E-4coord: 104..154 score: 2.2E-4coord: 413..455 score: 6.6E-5coord: 272..315 score: 1.2E-4coord: 1295..1337 score: 8.5E-5coord: 473..516 score: 2.1E-5coord: 232..274 score: 7.1E-5coord: 1715..1757 score: 6.2E-5coord: 292..335 score: 2.4E-5coord: 626..668 score: 8.4E-5coord: 1545..1587 score: 1.8E-4coord: 1535..1577 score: 6.2E-5coord: 1575..1617 score: 7.7E-5coord: 810..851 score: 2.0E-4coord: 1074..1116 score: 6.4E-5coord: 574..618 score: 2.4E-4coord: 853..895 score: 4.8E-5coord: 770..812 score: 4.8E-5coord: 646..688 score: 5.5E-5coord: 1635..1677 score: 8.8E-5coord: 1235..1277 score: 7.2E-5coord: 1275..1317 score: 6.8E-5coord: 534..576 score: 2.1E-4coord: 212..254 score: 6.5E-5coord: 1655..1697 score: 6.4E-5coord: 1315..1357 score: 6.6E-5coord: 373..415 score: 7.1E-5coord: 514..556 score: 1.8E-4coord: 1265..1307 score: 1.2E-4coord: 744..792 score: 3.6E-5coord: 453..495 score: 6.8E-5coord: 1375..1417 score: 6.4E-5coord: 1185..1227 score: 9.1E-5coord: 493..536 score: 2.

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:


Gene	Orthologue	Organism	Block
Cp4.1LG05g05110	CmaCh20G000780	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpeB586
Cp4.1LG05g05110	CmaCh02G012440	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpeB646
Cp4.1LG05g05110	CmoCh02G012820	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpeB595
Cp4.1LG05g05110	Csa4G291360	Cucumber (Chinese Long) v2	cpecuB729
Cp4.1LG05g05110	MELO3C014602	Melon (DHL92) v3.5.1	cpemeB696
Cp4.1LG05g05110	ClCG02G023310	Watermelon (Charleston Gray)	cpewcgB644
Cp4.1LG05g05110	CSPI04G13840	Wild cucumber (PI 183967)	cpecpiB730
Cp4.1LG05g05110	MELO3C014602.2	Melon (DHL92) v3.6.1	cpemedB829
Cp4.1LG05g05110	CsaV3_4G024190	Cucumber (Chinese Long) v3	cpecucB0908
Cp4.1LG05g05110	Carg02716	Silver-seed gourd	carcpeB1283

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Chinese Long) v3	cpecucB0877
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Chinese Long) v3	cpecucB0948
Cp4.1LG05g05110	Wax gourd	cpewgoB0944
Cp4.1LG05g05110	Wax gourd	cpewgoB0970
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpeB190
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpeB310
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpeB341
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpeB369
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpeB493
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Gy14) v1	cgycpeB0102
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Gy14) v1	cgycpeB0386
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpeB098
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpeB158
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpeB074
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpeB134
Cp4.1LG05g05110	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpeB535
Cp4.1LG05g05110	Wild cucumber (PI 183967)	cpecpiB705
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Chinese Long) v2	cpecuB703
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Chinese Long) v2	cpecuB768
Cp4.1LG05g05110	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cpelsiB598
Cp4.1LG05g05110	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cpelsiB629
Cp4.1LG05g05110	Watermelon (Charleston Gray)	cpewcgB670
Cp4.1LG05g05110	Watermelon (97103) v1	cpewmB723
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Gy14) v2	cgybcpeB137
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Gy14) v2	cgybcpeB561
Cp4.1LG05g05110	Cucumber (Gy14) v2	cgybcpeB975
Cp4.1LG05g05110	Melon (DHL92) v3.6.1	cpemedB813
Cp4.1LG05g05110	Silver-seed gourd	carcpeB0249
Cp4.1LG05g05110	Silver-seed gourd	carcpeB0635
Cp4.1LG05g05110	Silver-seed gourd	carcpeB0658
Cp4.1LG05g05110	Silver-seed gourd	carcpeB0741