Cp4.1LG05g05110.1 (mRNA) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGATGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGACCTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAGTACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCGCCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGNCTCCTTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAATCTCCGCCCCCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTATACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACNTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCNACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTNCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCATACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCCCCACCCCCTCCCTATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTATATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATACGTATACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCGTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACCTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCACCCTACGTCTACAAGTCCCCACCACCGCCTCCCTACATCTACAAGTCTCCTCCACCTCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCTTATTATTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAGAACACCGCCAACAAAAGTTCACTGAGTCATGGCATTTAAATTATATTAAGTTGTATGAATAATATTAGCCAACTTTCTACATAGAAGGTGAATNGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCCCCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATTTATAAATCTCCGCCACCACCATCTCCTTATGTATACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCCCCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCGCCTCCCTACGTCTACA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MGAMKPLRHWPQLLSVVAICLIATTVVTAQLDDDLMLPIKNPDLGGDLPKHHHHSTYPPVDHHHKPPQSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPXPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYXPTSTSLLHHLPTSTSLRHHLPTSTSLLHRHPTXKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPXPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPYYYKSPPPPHKSKYPH
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN2_ARATH (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 264.6 bits (675), Expect = 8.1e-69 Identity = 457/799 (57.20%), Postives = 472/799 (59.07%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 184.9 bits (468), Expect = 8.2e-45 Identity = 286/452 (63.27%), Postives = 296/452 (65.49%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. Swiss-Prot
Match: LRX3_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 1.2e-35 Identity = 231/414 (55.80%), Postives = 252/414 (60.87%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 149.1 bits (375), Expect = 5.0e-34 Identity = 255/424 (60.14%), Postives = 265/424 (62.50%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 6.8e-23 Identity = 175/303 (57.76%), Postives = 189/303 (62.38%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TrEMBL
Match: D8TDP8_SELML (Putative uncharacterized protein OS=Selaginella moellendorffii GN=SELMODRAFT_449207 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 9.5e-250 Identity = 695/991 (70.13%), Postives = 746/991 (75.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TrEMBL
Match: Q9C668_ARATH (Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.10 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 1.2e-180 Identity = 404/455 (88.79%), Postives = 416/455 (91.43%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L0P1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G291360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 9.1e-176 Identity = 574/825 (69.58%), Postives = 598/825 (72.48%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TrEMBL
Match: Q9C669_ARATH (Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.9 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 514.2 bits (1323), Expect = 6.6e-142 Identity = 360/442 (81.45%), Postives = 371/442 (83.94%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TrEMBL
Match: M4D3G5_BRARP (Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 496.5 bits (1277), Expect = 1.4e-136 Identity = 318/362 (87.85%), Postives = 326/362 (90.06%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TAIR10
Match: AT1G26240.1 (AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein) HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 6.2e-184 Identity = 404/455 (88.79%), Postives = 416/455 (91.43%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TAIR10
Match: AT1G26250.1 (AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein) HSP 1 Score: 514.2 bits (1323), Expect = 3.3e-145 Identity = 360/442 (81.45%), Postives = 371/442 (83.94%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TAIR10
Match: AT1G23720.1 (AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein) HSP 1 Score: 390.2 bits (1001), Expect = 7.2e-108 Identity = 645/1054 (61.20%), Postives = 658/1054 (62.43%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TAIR10
Match: AT3G28550.1 (AT3G28550.1 Proline-rich extensin-like family protein) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 4.1e-103 Identity = 674/1144 (58.92%), Postives = 693/1144 (60.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. TAIR10
Match: AT3G54580.1 (AT3G54580.1 Proline-rich extensin-like family protein) HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 8.3e-96 Identity = 619/1080 (57.31%), Postives = 636/1080 (58.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. NCBI nr
Match: gi|302824135|ref|XP_002993713.1| (hypothetical protein SELMODRAFT_449207 [Selaginella moellendorffii]) HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 1.4e-249 Identity = 695/991 (70.13%), Postives = 746/991 (75.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. NCBI nr
Match: gi|727421422|ref|XP_010436500.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Camelina sativa]) HSP 1 Score: 693.3 bits (1788), Expect = 1.1e-195 Identity = 446/513 (86.94%), Postives = 457/513 (89.08%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. NCBI nr
Match: gi|923686284|ref|XP_013655185.1| (PREDICTED: extensin-2-like isoform X1 [Brassica napus]) HSP 1 Score: 670.2 bits (1728), Expect = 1.0e-188 Identity = 421/471 (89.38%), Postives = 433/471 (91.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. NCBI nr
Match: gi|923686169|ref|XP_013655155.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Brassica napus]) HSP 1 Score: 666.0 bits (1717), Expect = 1.9e-187 Identity = 419/486 (86.21%), Postives = 434/486 (89.30%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG05g05110.1 vs. NCBI nr
Match: gi|923686288|ref|XP_013655186.1| (PREDICTED: extensin-2-like isoform X2 [Brassica napus]) HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 1.0e-183 Identity = 411/461 (89.15%), Postives = 424/461 (91.97%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
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