Cp4.1LG04g07980 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTCGCCTATAATGCGGAAGCTCGCAAGAGGGTTTTGAGCTACTATGCACTTAGTAAGAATAATATCCCTTGTGGCCGTCGTGGTACCTCGTACTATGATTGCAAGAAGCGTAGAAGGATCAATCCTTATCGTCGTGGTTGTGCCGCCATCACTGGATGTGCTCGATTCACCGATTAAACATTGTTGCCTCATTGAATTGGATTGTCTTTGCTTTTATCATCCAGTATTGATCTGATTGGTCTTCTTTCATTTTATTTTGGTGTCTTGCTTTTATCATAATGGATTGATCTAATGGATTGATCCAATGGGTCTTTTAAATTTGTTTCGGTGATTTTTTTTTTTGTTTTTTAAATCCTCATCGTGGTTTGTCACCATTACCAAATGAGCTCGACTTAATGATTAAGTTTGATTCTCCATGATTAAGCTTGATTCTCGACTTAATGGTTTTCTTAATTAATAAATTATTCATGTCACATATGGTTTAAAATAAATAACATAAATTACACACATGTAACGATCTTGAATTTTCTACAAGGTCGTTACTGTATATACATGTCTTGAATGCGGATGCGAAAATACATGTCTTGAATGCAAAAATACTTCACTTCATTTAAAACCTAAGTGTAAAACACCACACAACAAAAGACTGAATCAAATAAATAAATGTTTAAATTAAGAACATCTTATAATAAATACAACTACCCTATACATGTGTCACGGTCAAGTTTTGATGTAGTGTTAGCCATACGAGACCTAATCAACCAAGTTTTGATGTCGTGTTAGCCATACGAGACCTAATCAACGTAATTTGGGTCCTCTAGATACTAGAACATCTCAAGGGCATTTTTGAAACATGAATTAAAGTAGGAGGGGCTTTTGAAACGGGTAAAGTAGGAGTGGGTAAAACTATAAAACAGTACTCATTATGGAATTGAATTGATCAATAATATTGCCCTACTCATGAAGGAAATGATCTTTACTTGANTCTTTCATTTTATTTTGGTGTCTTGCTTTTATCATAATGGATTGATCTAATGGATTGATCCAATGGGTCTTTTAAATTTGTTTCGGTGATTTTTTTTTTTGTTTTTTAAATCCTCATCGTGGTTTGTCACCATTACCAAATGAGCTCGACTTAATGATTAAGTTTGATTCTCCATGATTAAGCTTGATTCTCGACTTAATGGTTTTCTTAATTAATAAATTATTCATGTCACATATGGTTTAAAATAAATAACATAAATTACACACATGTAACGATCTTGAATTTTCTACAAGGTCGTTACTGTATATACATGTCTTGAATGCGGATGCGAAAATACATGTCTTGAATGCAAAAATACTTCACTTCATTTAAAACCTAAGTGTAAAACACCACACAACAAAAGACTGAATCAAATAAATAAATGTTTAAATTAAGAACATCTTATAATAAATACAACTACCCTATACATGTGTCACGGTCAAGTTTTGATGTAGTGTTAGCCATACGAGACCTAATCAACGTAATTTGGGTCCTCTAGATACTAGAACATCTCAAGGGTATTTTTGAAACATGAATTAAAGTAGGAGGGGCTTTTGAAACGGGTAAAGTAGGAGTGGGTAAAACTGTAAAACAGTACTCATTATGGAATTGAATTGATCAATAATATTGCCCAACTCATGAAGGAAATGATCTTTACTTGGAAATAAAAGAATCCGGAGTAATTAATGAAGAAAATATTTCAGAATCAAAAGTGGCTCTAGTCTACTGTTAGATGAATAAACGGCCGTGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTAACGGCCCTAACTATGGCGGAATATTTTCGAGATGTTAATGAACAAGACATGCTTCTATTTATCGACAATATCTTTCGTTTGTTTTGTTCAAGCGGCGAGCATACTCTTGGCTCTTCATAGGCCAGACACCCATTAGAACTAGTAACCGTCGTCACGATAACATTAGGTTAAACATATTGATTGTTCTCGTGCTTGACCGTCGTCTCTTCATAGGCCAGACACCCATTAGAACTAGTAACCGTCGTCACGATAACATTAGGTTAAACATATTGATTGTTCTCGTGCTTGACCGTCGTCTCTTCATAGGCCAGACACCCATTAGAACTAGTAACCGTCGTCACGATAACATTAGGTTAAACATATTGATTGTTCTCGTGCTTGACCGTCGTCTCTTCATAGGCCAGACACCCATTAGAACTAGTAACCGTCGTCACGATAACATTAGGTTAAACATATTGATTGTTCTCGTGCTTGACCGTCGTCTCTTCATAGGCCAGACACCCATTAGAACTAGTAACCGACCGTCGTCACGATAACATTAGGTAAAACATATTGATTGTTCTCCTGCTTGACCTAAAGTCGTAGCTTAATAATTGTTCTCCTTCTCCTTGCAGCATTATGATAACCATAATGATCGTTTTCCTACCTCATAACATACGTTTGTACTACATGACCACACAATAATGCATGAGATCCCAACATTTTTTTCATTTTCATTATCATTTAATACAACCCTAGTAGCCTTTTGTACATAATTTTCATATCATTTCACATTTTGTTTATCATATCATTTATCTTATATTTCATGTATACGTCGGGGTTGTATTCATGCTAGTTCTTCGTTTTGCATGTCAATCACATCGTATCATTCAAATTACATAACTATGTCATATCATAACATTTCATGGTTCTAGACATAACAATTTTCATCATATACATGTCATACCATAACATATCGCATTATAATGTATCATATCATAAACATGTCACTTATCACATATCTCGTAGCGTAACATTGTTCATATCATTTTCATATCATATCACAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATATTATCCGTCATTCACATATTGTATCATAATCCNCATAGGCCAGACACCCATTAGAACTAGTAACCGACCGTCGTCACGATAACATTAGGTAAAACATATTGATTGTTCTCCTGCTTGACCTAAAGTCGTAGCTTAATAATTGTTCTCCTTCTCCTTGCAGCATTATGATAACCATAATGATCGTTTTCCTACCTCATAACATACGTTTGTACTACATGACCACACAATAATGCATGAGATCCCAACATTTTTTTCATTTTCATTATCATTTAATACAACCCTAGTAGCCTTTCGTACATAATTTTCATATCATTTCACATTTTGTTTATCATATCATTTATCTTATATTTCATGTATACGTCGGGGTTGTATTCATGCTAGTTCTTCGTTTTGCATGTCAATCACATCGTATCATTCAAATTACATAACTATGTCATATCATAACATTTCATGGTTCTAGACATAACAATTTTCATCATATACATGTCATACCATAACATATCGCATTATAATGTATCATATCATAAACATGTCACTTATCACATATCTCGTAGCGTAACATTGTTCATATCATTTTCATATCATATCACAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATATTATCCGTCATTCACATATTGTATCATAATCCTATCATGTCATAAACACTTCGGGGTCATATCGTGTAATAGCTCAAAAAAATAATAAAAAAATAAAAATAATTAAAAAAAATAGTTTAAAAAAAAAAAAATTAATTAAAAAAAAATAGTTTAAAAAAATAATAATAAACAAGAAACTTTTCCCCACTTCTTTCCACTAACCTCTCATCTCTTCCCACAATTATCCCTCCTCGACCCATCTTACACTAGAAAGTAACGGTTATTGCCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAACAATAATAGTCAGATATACTTAGAAAAAGAGAATGACCTTTACCCAATTGAGATTCACAAGAGATTTACATGGAGATAGATCTGATCATTAAATCTTCATTTTTTTTTAGAAATCACAACCAATTATAATTAGATCTTCATTGAATTATTACGATGATCTAGCTTTGAGTTAGAAACGTCAATCATTTATACGATTCTAGTAAATCACATCAGATTAGTAATATTAGATTAAATAAATCACGATTAGTAATATTAGATTAAATTTGTATCAGTAGCCAAAAGAATAGATTAAAAATAGAATGACAAGAAAACTTGAAACCCTCCAAGATAAGGAAAGATTTGGAAACAGGGATCCACTAGAAATTTGGAATACATGATATGAGAATTAAGAGACAACAGATAAAAAAAAATATTAGAGAATTAAAAACCCTCTGAGATAAGGAAAGATTTGGAAACAGGGATCCACTAGAAATTTGGAATACATGAGATCAGAATTAAGAGACAACAGATAAAAAAAAAGAAAACCACAAACTAAATATAGAGGGAAAGGTAAATACAGAGAGTAGTGAAGCCCAGAATAACTAAATATAGAGGGAGGGAAAGGTAAATACAAGGGAAAGGTAAATACAGAGAGTAGTAAAGCCCAAAATAACTAAATATAGAGGGAGGGAAAGGTAAATACAGAGAGTAGTAAAGTCCAGAATAACTGGAAATATTTGTATCTACTTTCTTATACAACAGTAACCATGAAAAATAAGATTTTTAATAAAAATATAATTATAGATATATAACATTTCAAGACTTTTAATAATGGACTAATGTAAATTAGAGAAATAATGTTGTAGAATTCAAACCTGAAACTAATATCATGGGCTCATATAGGTTGACTCGGATTTCAAAAGACGAAATCGAATTTTCATTAAGGATATATTCGTGACAACGACTTAAGCTAGCCAGGTAAGTGACCTTACTATCGGCATGGTTATATTTGATGTTGACACGTGCCCCATGGTTCTGCACGTGCCATATATATTGATATGTGTGAATTGTCTGTGGATCGATATGCTTCTTATATGTTATGTATATGTTATAATATGTGAATTGTATGATAATAATGACATGAAATATAACCCCGTTAGAATCATGTATGATTTGAGATGATTTGAGAACTGCAGAATGAGAAACGATATGATATGAATGATG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BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. Swiss-Prot
Match: RALF_TOBAC (Rapid alkalinization factor OS=Nicotiana tabacum GN=RALF PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 2.3e-09 Identity = 30/58 (51.72%), Postives = 40/58 (68.97%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. Swiss-Prot
Match: RLF23_ARATH (Rapid alkalinization factor 23 OS=Arabidopsis thaliana GN=RALF23 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 8.7e-09 Identity = 27/51 (52.94%), Postives = 37/51 (72.55%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. Swiss-Prot
Match: RLF22_ARATH (Protein RALF-like 22 OS=Arabidopsis thaliana GN=RALFL22 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 2.5e-08 Identity = 22/45 (48.89%), Postives = 36/45 (80.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KHU4_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G484570 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 5.6e-15 Identity = 58/111 (52.25%), Postives = 66/111 (59.46%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TrEMBL
Match: A0A103YNT3_CYNCS (Rapid ALkalinization Factor OS=Cynara cardunculus var. scolymus GN=Ccrd_009098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 79.0 bits (193), Expect = 9.9e-12 Identity = 72/235 (30.64%), Postives = 104/235 (44.26%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TrEMBL
Match: R0HVQ3_9BRAS (Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10024364mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 78.6 bits (192), Expect = 1.3e-11 Identity = 32/45 (71.11%), Postives = 39/45 (86.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TrEMBL
Match: V4NYG2_EUTSA (Uncharacterized protein OS=Eutrema salsugineum GN=EUTSA_v10017458mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 6.4e-11 Identity = 31/45 (68.89%), Postives = 38/45 (84.44%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TrEMBL
Match: A0A078E5A8_BRANA (BnaC07g10600D protein OS=Brassica napus GN=BnaC07g10600D PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 6.4e-11 Identity = 32/43 (74.42%), Postives = 37/43 (86.05%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TAIR10
Match: AT1G28270.1 (AT1G28270.1 ralf-like 4) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 3.3e-14 Identity = 32/43 (74.42%), Postives = 37/43 (86.05%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TAIR10
Match: AT2G33775.1 (AT2G33775.1 ralf-like 19) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 4.3e-14 Identity = 31/45 (68.89%), Postives = 38/45 (84.44%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TAIR10
Match: AT3G16570.1 (AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 23) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 4.9e-10 Identity = 27/51 (52.94%), Postives = 37/51 (72.55%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TAIR10
Match: AT3G05490.1 (AT3G05490.1 ralf-like 22) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 1.4e-09 Identity = 22/45 (48.89%), Postives = 36/45 (80.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. TAIR10
Match: AT4G15800.1 (AT4G15800.1 ralf-like 33) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 3.2e-09 Identity = 25/51 (49.02%), Postives = 36/51 (70.59%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. NCBI nr
Match: gi|449461879|ref|XP_004148669.1| (PREDICTED: protein RALF-like 19 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 8.1e-15 Identity = 58/111 (52.25%), Postives = 66/111 (59.46%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. NCBI nr
Match: gi|659080853|ref|XP_008441015.1| (PREDICTED: protein RALF-like 19 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 2.2e-12 Identity = 55/111 (49.55%), Postives = 64/111 (57.66%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. NCBI nr
Match: gi|976929662|gb|KVI12504.1| (Rapid ALkalinization Factor [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 79.0 bits (193), Expect = 1.4e-11 Identity = 72/235 (30.64%), Postives = 104/235 (44.26%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. NCBI nr
Match: gi|565475268|ref|XP_006295275.1| (hypothetical protein CARUB_v10024364mg [Capsella rubella]) HSP 1 Score: 78.6 bits (192), Expect = 1.9e-11 Identity = 32/45 (71.11%), Postives = 39/45 (86.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g07980 vs. NCBI nr
Match: gi|15217877|ref|NP_174148.1| (protein ralf-like 4 [Arabidopsis thaliana]) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 9.3e-11 Identity = 32/43 (74.42%), Postives = 37/43 (86.05%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |