Cp4.1LG04g06860 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGAGAATCCGAAGTCGATGCCGGGGATTGGAGGTCTCAATTGCAGCCGGATTCTCGGCATCAAATTGTCGACAGAATGTATGATTTCTTGCTTCTTTCATGCATATTTGAGAAATTTGTTTGAGCTTTTGTAACTTCTTTTGTGTTCATAGTTCGCTGCTTAGATTAGTTACTATGGGATGGTTTTCTGAATTAAGCTATGAACAGCAAAATTTTGGAAGTATAGAATCATCTTCGACCTTATTCTACCATTTCTTAGATTTGTGTATAACTGATCGATGCGAACTGATTCCAAAACCTAGTTCTATAATATTATCTCCTTCATTTTTCCATTTCTGGTTTGAAGATATGGTAGGTTAGGTTTTGTGGAGGCGGTTCCTATTTGTTACTTCAGGTATTAGCCCCTTCTTTGAACATAAGAAGTATAAGTTATTTGAAGTAGTATGGATCCTATTGAATTTTCCTCGACTGATCTAAAGTCCCTTTCTTCAAAATGCCTAATTGTGAGATCCCACATTGGTTGAAGAGGGTGGAACGAAACATTCCTCCTTAAGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGTAAACGTGTTTTAAAACTGCGAGACTGACGATGATACGTAATAGGCCAAAGCAGGCAATATCTGTTAGAGGTGGGCTTGGGATGTTACAAATGGTATCAGAATCAAACACCGGGAGGTATGCCAGCGAGGACGCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACAACATTCCTTATAAGGGTGTAGAAACGTCTCCCTAGAAGACACACTTTAAAACCGTGAGGCTGACGACAATACGTAACGGGCCTAAGCGGACAATATCTACTAGCGGTGGGCTTGAGCTGTTACAAATGGTATCAGAGTCAGACACTGGGCGGTGTGCCAGCGAAGACTCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCATGTTGGTTGGAGAGGGGAACGAAACATTCTTCCTAAGGGTGTGGAGACCTCTCCCTAGTAGACGTGTTTTAAAACCGTGAGGCTGATAGCGATAAGGGGCCAAAGCGAACAATATCTGTTAGTGGNATTTAGATTGTTTCGGAACTTCTGAATGGATTCAAATCATTTGGGGCCTGCTCAAGGTGGAGAATCCGAAGTCGATGCCGGGGATTGGAGGTCTCAATTGCAGCCGGATTCTCGGCATCAAATTGTCGACAGAATGTATGATTTCTTGCTTCTTTCATGCATATTTGAGAAATTTGTTTGAGCTTTTGTAACTTCTTTTGTGTTCATAGTTCGCTGCTTAGATTAGTTACTATGGGATGGTTTTCTGAATTAAGCTATGAACAGCAAAATTTTGGAAGTATAGAATCATCTTCGACCTTATTCTACCATTTCTTAGATTTGTGTATAACTGATCGATGCGAACTGATTCCAAAACCTAGTTCTATAATATTATCTCCTTCATTTTTCCATTTCTGGTTTGAAGATATGGTAGGTTAGGTTTTGTGGAGGCGGTTCCTATTTGTTACTTCAGGTATTAGCCCCTTCTTTGAACATAAGAAGTATAAGTTATTTGAAGTAGTATGGATCCTATTGAATTTTCCTCGACTGATCTAAAGTCCCTTTCTTCAAAATGCCTAATTGTGAGATCCCACATTGGTTGAAGAGGGTGGAACGAAACATTCCTCCTTAAGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGTAAACGTGTTTTAAAACTGCGAGACTGACGATGATACGTAATAGGCCAAAGCAGGCAATATCTGTTAGAGGTGGGCTTGGGATGTTACAAATGGTATCAGAATCAAACACCGGGAGGTATGCCAGCGAGGACGCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACAACATTCCTTATAAGGGTGTAGAAACGTCTCCCTAGAAGACACACTTTAAAACCGTGAGGCTGACGACAATACGTAACGGGCCTAAGCGGACAATATCTACTAGCGGTGGGCTTGAGCTGTTACAAATGGTATCAGAGTCAGACACTGGGCGGTGTGCCAGCGAAGACTCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCATGTTGGTTGGAGAGGGGAACGAAACATTCTTCCTAAGGGTGTGGAGACCTCTCCCTAGTAGACGTGTTTTAAAACCGTGAGGCTGATAGCGATAAGGGGCCAAAGCGAACAATATCTGTTAGTGGTGAGCTTGGATTGTTACAAATGGTATCAGAGTCAGACATCGGGCGGTGTGCCAGCGAGGACGTTAGGCCCTCAAGGGGGTGGAATGTTAGATCCCACATTAGCTTGAGAGGGGAACGAAACGTTCCTAATAAGGGTGTAGAAACCTCTCCCTAGTAGACGCGTTTTAAAAGNGCCAAAGCAGGCAATATCTGTTAGAGGTGGGCTTGGGATGTTACAAATGGTATCAGAATCAAACACCGGGAGGTATGCCAGCGAGGACGCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACAACATTCCTTATAAGGGTGTAGAAACGTCTCCCTAGAAGACACACTTTAAAACCGTGAGGCTGACGACAATACGTAACGGGCCTAAGCGGACAATATCTACTAGCGGTGGGCTTGAGCTGTTACAAATGGTATCAGAGTCAGACACTGGGCGGTGTGCCAGCGAAGACTCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCATGTTGGTTGGAGAGGGGAACGAAACATTCTTCCTAAGGGTGTGGAGACCTCTCCCTAGTAGACGTGTTTTAAAACCGTGAGGCTGATAGCGATAAGGGGCCAAAGCGAACAATATCTGTTAGTGGTGAGCTTGGATTGTTACAAATGGTATCAGAGTCAGACATCGGGCGGTGTGCCAGCGAGGACGTTAGGCCCTCAAGGGGGTGGAATGTTAGATCCCACATTAGCTTGAGAGGGGAACGAAACGTTCCTAATAAGGGTGTAGAAACCTCTCCCTAGTAGACGCGTTTTAAAAGAGCGAAACATAACGGACCAAAGCGGACAATATCTGCTAGTGGTGGGCTTAGACTGTTACACAAATATTTTGAATCATGAACGTGGATTACTGGGGTAGTTTTTCCTTCCTGAACAGCTTCCCATGCTTTTGTGTTTAATGAACTTGTCAGCCATCATCTTCTCCATTTTTATGTAGAATGGAGACATTGAAGAGGCTCCTTCCTGTTTCTGGTCCTGAGGGATTGAGTGAGATGAGGAAAATTGCTGTAAGGTTCGAGGAAAAGATTTATACTGCCGCTACTAGTGAGGTACTTCCTGCTCACTTGTTATAGTTCTCAAGGATTGTAAGAACAAACATTATCTTATTTATGTTTAGCCCATTTGCTATAACAATAAGATTCCAATTTGATTTGGTTCCTAAGATTTAGTTCTGTACTGAAAGATACTTTTGTATAAGAACTTGTTCATAAAGCCCTGATTTATTATGCTATGTAGTGTTGCACTAAATAAATACCAATTATATTTTGAACCTCTGATTTCAGTCAGAGTACCGAAGGAAAATANGTTGGAGAGGGGAACGAAACATTCCTTATAAGAGTGTAGAAACCTCTCCCTAGAAGACACGCTTTAAAAACGTGAGGCTTACGACAATACGTAACAGGCCAAAGCGGACAATATCTATTAGCGGTGAGCTTGGGCTGTTACAAATGGTATCAGAGTTCAGTCACTGGCCGGTGTGCCAGTGAGGACTCTAGGCCCTCAAGGGGGGGGGGGGANAACTGTGAAGATGCTTACTATGGAACCCAACTCTGAGACGACCACTGCATTACCACCAAAGTCTGCGCCCACGATCAACTGCCGAATTCGTTCGACCCGATTCACATCTCCGCCGCCGAATTCTGGCTTTCGTTCAGCCCTAAACAACGAGTAAACTCCATAACAGCCTTACTTTCCATCCTTGAAGGACTCTATTCAATCTCTCTTTTTGCTTTGTTATTGGGATTTTGACGCAGTTTTTTCTCGTGGGTTGTTTTGGAACTTTTGAATGGATTCGAATAATTGGAGGCCTGCTCAAGGTGGAGAACCCAGAGTCGATGCTGGGGATTGGAGGTCTCAATTGCAGCCGGATTCTCGGCATCAAATTGTCGACAGAATGTATGATTTCTTGCTTCTTTCATGCATATTTGAGAAATTTGTTTGAGCTTTTGTAACTTCTTTTGTGTTCATAGTTCGCTGCTTAGATTAGTTACTATGGGATGGTTTTCTGAATTAAGCTATGAACAGCAAAATTTTGGAAGTATAGAATCATCTTCGACCTTATTCTACCATTTCTTAGATTTGTGTATAACTGATCGATGCGAACTGATTCCAAAACCTAGTTCTATAATATTATCTCCTTCATTTTTCCATTTCTGGTTTGAAGATATGGTAGGTTAGGTTTTGTGGAGGCGGTTCCTATTTGTTACTTCAGGTATTAGCCCCTTCTTTGAACATAAGAAGTATAAGTTATTTGAAGTAGTATGGATCCTATTGAATTTTCCTCGACTGATCTAAAGTCCATTCCTTCAAAATGCCTAATTGTGAGATCCCACATTGGTGGAAGAGGGAACAAAACATTTCTCATTAAGATGTAGAAACCTCTCCCTAGTAGACGTGTTTTAAAACTGCGAGACTGACGACGATATGTAACGGGCTAAAGCGGACAATATCTGTTAGCGGTGGGCTTGAGATGTTACAAATGGTATCAGAATCAAACACTGGGAGGTATGCCAGCGAGGGTGCTAGGCCCTCAAGGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACATTGGTTGGAGAGAGGAACGAAACACTCCTATAAGGGTGTAGAAACCTCTCCCTAAAAGACACGGTTTAAAACCGTGAGGCTGACGACAATACGTAACGGGCCATAGCGGACAATATCCCAGTGGTGAGCTTGGGCTGTTACAAATGGTATCAGAGTTAGACACTTGGCGGTGTGCCAGCGAGGACTCTAGGCCCTCAA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GESEVDAGDWRSQLQPDSRHQIVDRIYGRLGFVEAVPICYFRMETLKRLLPVSGPEGLSEMRKIAVRFEEKIYTAATSEFFLVGCFGTFEWIRIIGGLLKVENPESMLGIGGLNCSRILGIKLSTECGESEVDAGDWRSQLQPESRHRIVDKIIETLKRHLPVSGPEGLSEVRKIAVRFEEKVHTVATSQSDYLRKISLRMLTMETKPGTTPALPSICPSQHLSTDAKMSRGPAQGGEPEVDAGVWRSQLPPDSRHRIVNSIIETLKRHIPVSGPEGLNELRKIAVRFEEKVYNAATSQSDYLRKISLRMLTMETKSGTFTALPSVSGPVSSNQP
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. Swiss-Prot
Match: MD15A_ARATH (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a OS=Arabidopsis thaliana GN=MED15A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 5.6e-29 Identity = 61/99 (61.62%), Postives = 80/99 (80.81%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TrEMBL
Match: A0A078H3Z0_BRANA (BnaC05g12030D protein OS=Brassica napus GN=BnaC05g12030D PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 9.5e-60 Identity = 138/329 (41.95%), Postives = 192/329 (58.36%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TrEMBL
Match: F2DL41_HORVD (Predicted protein OS=Hordeum vulgare var. distichum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 219.5 bits (558), Expect = 6.0e-54 Identity = 118/213 (55.40%), Postives = 153/213 (71.83%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TrEMBL
Match: M4EBE6_BRARP (Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 216.9 bits (551), Expect = 3.9e-53 Identity = 125/291 (42.96%), Postives = 179/291 (61.51%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TrEMBL
Match: W5AVR2_WHEAT (Uncharacterized protein OS=Triticum aestivum PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 216.1 bits (549), Expect = 6.6e-53 Identity = 119/205 (58.05%), Postives = 151/205 (73.66%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3CAL8_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 216.1 bits (549), Expect = 6.6e-53 Identity = 127/325 (39.08%), Postives = 189/325 (58.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TAIR10
Match: AT1G15790.1 (AT1G15790.1 unknown protein) HSP 1 Score: 159.5 bits (402), Expect = 3.7e-39 Identity = 84/179 (46.93%), Postives = 118/179 (65.92%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. TAIR10
Match: AT1G15780.1 (AT1G15780.1 unknown protein) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 3.1e-30 Identity = 61/99 (61.62%), Postives = 80/99 (80.81%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. NCBI nr
Match: gi|828322731|ref|XP_012573082.1| (PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like [Cicer arietinum]) HSP 1 Score: 277.3 bits (708), Expect = 3.5e-71 Identity = 173/363 (47.66%), Postives = 218/363 (60.06%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. NCBI nr
Match: gi|698581864|ref|XP_009777664.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104227178 isoform X10 [Nicotiana sylvestris]) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 1.8e-67 Identity = 158/316 (50.00%), Postives = 197/316 (62.34%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. NCBI nr
Match: gi|698581860|ref|XP_009777663.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104227178 isoform X9 [Nicotiana sylvestris]) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 1.8e-67 Identity = 158/316 (50.00%), Postives = 197/316 (62.34%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. NCBI nr
Match: gi|698581831|ref|XP_009777654.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104227178 isoform X1 [Nicotiana sylvestris]) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 1.8e-67 Identity = 158/316 (50.00%), Postives = 197/316 (62.34%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG04g06860 vs. NCBI nr
Match: gi|694444421|ref|XP_009348733.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103940355 [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 264.6 bits (675), Expect = 2.3e-67 Identity = 152/324 (46.91%), Postives = 197/324 (60.80%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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