CmoCh03G000020 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGACCCTATGGAAGTGGGGACTCTTTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCTTTATTTGGGCACTCACCATTGCCCACACCTTTCTCCCTCGGGACCTGCGTTCCTTTCCACTCTCTCCTTCTTTCTCACCCAGTCCTTCCTCGCGTGCTTCCCCATCCCTGGAACTCCCACAAAAAAACACGAACAAAAACAGCCCCAAATCCTGTTCCAAACCCAAGAACACCAACAAAAATGTCCCACAATCTCTTCTACTTCCACCATTGTTGTTTAAACCCCTTTTCCTCATCTGGGTCTTCAAGAAATGCCGTTTTTACTCTCTATTTTCATCTCTATTTCATCAAATCCATGTGATTTTCAAGCTTTTTCCCTTGTTCTTCGTCTTCTTCCAACACTATGAAGCCAGGTTAGTTTGATTCCATTGTTTCTATACCTTGCTTCTATAGGGAAGACAAGAGACATGGAATCTCTTTTCTTTTCGGGTGGTTTTTTTTAATGTTTACTTTCTTTGTCGTGTTTTTAATTATTGTCTATTTGTTTTAGTTTCTTTTGAGTTGTTGTTCATCTCTGTTTTTGGGTGCTTCTGTTTGTCATTTTAAGGATGCAAAATGATCCACTCGTTTGATCTTCAAAATGTGTTGAGATTAAGTGTACTGATAACTATGAATGCTGACAATTAGGATTTCATTTGGCTATACTGATTTTGATTTTTATCTGTTCATTCATTCTTGCATTTCAATTGAATGTACTTGTTTTTCCCTGTTCTTTCCATGGATTGGATGGCTATGTTTGAAAAAGCCAAAGAGATGGAAAGGAAATGGGAACGTTCGAAAAATACTCGAAAGTAGAGACCTAAGCCAATGGATTCCAATGTGGTATTCCTCTAACGTTATTCATTCACAGATGATTTGTTAGGAATCACGAACCTTCATAATAGTATGATATTGTTCACTTTGAGTATAAGCTCTCGTGGCTTTGCTTTTGGTTTCCCCAAAAGGCCTCGTACCAATGGAGATGTATTACTTGCTTATAAACCCGTGATCAAACGCTTAATTAACCAATGTGGGACTCTTCTCCTAACAATCCTCCCCTCGAACAAAGTACACTGTAGAGCTTCCCCTGAGGCATATGGAGCCCTCGAACAGCCTCCCCTTTTATCAAGGCTAGACTCTTTCTCTGGAGGCCTCGAACAAAGTACACCTTTTGTTTGATACTTGAGTCACTTTTGACTACACTTTCGAGACTCACAACTTCTTTGTTCGATATTTGAGGATTCTATTGACATGGCTAAGTTAAGGGCATGACTCTAATACCATGTTAGGAATCACGGCTCTCGACAATGGTATGATATTGTTCACTCTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCCAAAAGGCCTCGTACCAATGGAGATGTATTCCTTGCTTATCAACCCATGATCAAACCCTTAATTAACCGATGTGGGACTCTTCTCCCAACAATCCTCCCCTCGAACAAAGTACGCCATAGAGCCTCTCCTGAGGCATATGAAGCCCTCGAACAGCCTCCCTTTAATAAAGGCTCGACCCTTTCTCTGGCTCGGATACTATTTATAACAGCCCAAGCCCACTACTAGTAAATATTGTTCTCTTTGGGCTTTCCCTTTTGGGCTTCCCCTGAAGGTTTTAAAACGCATCTGCTAGGGACAGGTTTTCACACTCTTATAAGGAATGTGATAAGATAAGGAATCAACTACAAGGGGAATAAGATTCGGATTACCTTGTTGATCGAATATCTCAAGTCAAGAACACTTTGTTTGAGATTCGAATCACTCCAGAAGCAAGATCGATCATCTCTAGCTTCAATGATTCTAGTTGATCAAATATCTCAAGACAAGAACACTTGATTGAGATTCGAATCACTCCACAAGCAAGATTGATCATGTCGAGCTTGAATGATTCTACATGCAACCTAAACTACATAGAGTTGCAAAGAAACTTAGCCATTGGCTAAAGAAAAGCACAAATGCTTCTTTTAATATATCTTCTAAGTCTTCCTTACAAATACAACATACATGGCTTTATATAGCCTCAAAATGAAAGCATTCCAAAAGTTGTAACATTCATACTTAATGACCATAATTAGCCATTATGTAAATGTAACCTAAAAAGTAAATAAAATGTCTTAAAATACAATAACTCTAAATTACTCTAAATTGTAACCCACCCAAACTTTATAACCATCAAACTTCATTCCTCTTCAATGTGACATGAATTGCAACCTCTTTTGATAATTTTGACAACATTTTCTTCACATCTTCATTGAAGTATATTGTATGAATGATGTCTCTTGGTTCATATCATTCTCCGCTTCTTCAAGAGGATTCGTCCTCGAATCTATTTGTGAAACTTTGCTGCAAAACATAAGATATGAAAATACAAAGGCCCTCACAACAATCTCTCATGTGTATACAACACTCAAGGATTTTTTTTTAGGCCACTCTGTTTACACAAATGAAGCTCTCATTCTCACCTCTCAAAATTGTAAATATAGCGAAGATTGAATTTTGAACTTTGGGTCGATTAAAAACTAAAAAGAAAAAAACAAATTGAAAAGAAACGCAAAGGAAACATATATCCGATCTTGAGCCTGAAGCTCTGATACCAAATGATAAGATAAGGAATCAACTACAAGGGGAGTAAGATTCGGATTACCTTGTGGATCGAATATCTCAAGCAAAGAACATTTTGTTTGAGATTCGAATCACTCCAGAAACAAGATCGATCATGTCTAGCTTCAATGATTCTTGTTGATCAAGTAATCTCAAACACTTGTTTGAGATTCGAATCACTCCACAAGCAAGATTGATCATATCGAGCTTGAATGATTCTACATGCAACCTAAACTACATAGAGTTGCAAAGAAACTTAGCCATTGGCTAAAGAAGAGCACAAATGATAAGATAAGGAATCAACTACAAGGGGAGTAAGATTCGGATTACCTTGTGGATCGAATATCTCAAGCAAAGAACATTTTGTTTGAGATTCGAATCACTCCAGAAACAAGATCGATCATGTCTAGCTTCAATGATTCTTGTTGATCAAGTAATCTCAAACACTTGTTTGAGATTCGAATCACTCCACAAGCAAGATTGATCATATCGAGCTTGAATGATTCTACATGCAACCTAAACTACATAGAGTTGCAAAGAAACTTAGCCATTGGCTAAAGAAGAGCACAAATGCTTCTTTTACTATATTTTCCAAGTCTTCCTTACAAATACAACATACATGGCTTTATATAGCCTCAAAATGAAAGCATTCCAAAAGTTGTAACATTCATACTTAATGACCATAATTAGCCATTATGTAAATGTAACCTAAAAAGTAAATAAAATGTCTTAAAATACAATAACTCTAAATTACTCTAAATTGTAACCCACCCAAACTTTATAACCATCAAACTTCATTCCTCTTCAATGTGACATGAATTGCAACCTCTTTTGATAATTTTGACAACATTTTCTTCACATCTTCATTGAAGTATATTGTATGAATGATGTCTCTTGGTTCATATCAGAATGTTTCGTTCTCCTCTCCAACCAATGTGAGATCTCACACTATCTAACTATAGTTTTTAACATCGAGAGGCACTGATACACAAGGCAGGATGAATGAAATGGTATTTGATCTGAACTGTGACAATGGAAGAGGATTAATGCTGCAAATATGATCCAAAGAAAGAGATCCATTCCCATTTGTGATCTTCACCCAACTGGTGTATTTTGCAAAAGAAACTCAGAATATCAAATCACTTGTTCTTGTTAGGAACCATGACTATCCACCATGGTTTGATATTATCCACTTTGAGTATAAGCTATCGTAACATTGCTTTTGGTTTCCCCAAAAGACCTTGTACCAATGGAGATGTATTCCTTGCTTACAAACCCATAATCAACCCGTTGAATAGCCTCCCCTTGATTGAGGCTTGACTCCTTTCTCTGGAGCACTCGAACAAAGTACACCCTTTATTTGACACTTGACTACACCTTCGAGGCTAGCAATTTCTTTGTTCGACACTTGATGATTCTATTGACATGACTAAGTTAAGGGCATGGCTCTGATACCATGTGTTAGAAAAGACGACTCTCCATAATGGTATGATAATGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCGTGGCTTTGCTTTTGGTTTCTCCAAAAGGCCTCATACCAACGGAGATGTATTCCCTACTTATAAACTCATGATCATCCCCTTAATTAGCCAATGTGGTACTCCCTCCCAACAATCCTCAACAGTCCTTCCGTTGCCCATGACTTGGAAGCTTTGATCTTTGTGTCTCTGAGAGTCCGGGTATATCACGAGTCTAAAAAAACCTTCAATTATTATTATTATTTCTAAAGAAGTTCACAAGTTCACTTGAAGTTTGCCACTTTTTCCTTTGCTTGTTTTGCCATCATACAACTTCTCTTGTAGCTGTTTTTTGTTCTTGATTTGATTGGAAGTTCTCTCTTTCACTTCCAGGTGTAGAGCAAGGTGATTTGGACTCATCTCCCGTGCAAAGTTTGGATGGAAGTTTTAGAAAGTTCATATCTGGTAACCATTGCTTTTTATTTATTTATTTATTTTGATATTCTCAATAAATATAGTCTCAAATAATGTTGAGGCACACTACAAGAAAGGGCTCGAGTCAAGAGTAATAAGACCTAGCGAATGGTTACAAGAAACCGAACATATCCGAAAAGACTCTCATCCTAAAGTCCCCACAAAATAGCACACGCCCCATCTTTGAAGGGTAGATGAAGGAAAAACTCCTTAAATGCCTCCTTACGACTCAAAAAAATTGTGCTAGGCTGCTCGAGCACAAGCACAACTCTAGGGACTATCTTGCTTATGCCTCGTCTTTTCCTCAATGTCCACTCTGTGTGGTGTGTTGGATGATGCACTGTTCTCCTTGGTTGCATCATGACACTCGTCTAGGCCCTA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BLAST of CmoCh03G000020 vs. Swiss-Prot
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BLAST of CmoCh03G000020 vs. Swiss-Prot
Match: CHFR_HUMAN (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Homo sapiens GN=CHFR PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 7.9e-12 Identity = 34/97 (35.05%), Postives = 53/97 (54.64%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. Swiss-Prot
Match: CHFR_PONAB (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Pongo abelii GN=CHFR PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 7.9e-12 Identity = 34/97 (35.05%), Postives = 53/97 (54.64%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. Swiss-Prot
Match: CHFR_XENTR (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Xenopus tropicalis GN=chfr PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.3e-11 Identity = 37/112 (33.04%), Postives = 55/112 (49.11%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. Swiss-Prot
Match: CHFR_XENLA (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Xenopus laevis GN=chfr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 2.3e-11 Identity = 37/112 (33.04%), Postives = 55/112 (49.11%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TrEMBL
Match: V4SGG1_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10024761mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1455.3 bits (3766), Expect = 0.0e+00 Identity = 732/1157 (63.27%), Postives = 889/1157 (76.84%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L2I0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G507960 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1395.2 bits (3610), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/766 (88.90%), Postives = 720/766 (93.99%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TrEMBL
Match: F6HGI3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_07s0130g00060 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1076.6 bits (2783), Expect = 0.0e+00 Identity = 508/708 (71.75%), Postives = 607/708 (85.73%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TrEMBL
Match: M5WW24_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa014674mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1074.7 bits (2778), Expect = 1.3e-310 Identity = 528/766 (68.93%), Postives = 623/766 (81.33%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TrEMBL
Match: A0A061DN27_THECC (Kinase superfamily protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_003259 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1063.1 bits (2748), Expect = 2.5e-307 Identity = 522/752 (69.41%), Postives = 621/752 (82.58%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TAIR10
Match: AT1G47570.1 (AT1G47570.1 RING/U-box superfamily protein) HSP 1 Score: 583.2 bits (1502), Expect = 3.8e-166 Identity = 273/463 (58.96%), Postives = 340/463 (73.43%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. TAIR10
Match: AT2G40980.1 (AT2G40980.1 Protein kinase superfamily protein) HSP 1 Score: 520.0 bits (1338), Expect = 4.0e-147 Identity = 251/496 (50.60%), Postives = 361/496 (72.78%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. NCBI nr
Match: gi|296084808|emb|CBI27690.3| (unnamed protein product [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1550.8 bits (4014), Expect = 0.0e+00 Identity = 785/1245 (63.05%), Postives = 925/1245 (74.30%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. NCBI nr
Match: gi|567867589|ref|XP_006426417.1| (hypothetical protein CICLE_v10024761mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 1455.3 bits (3766), Expect = 0.0e+00 Identity = 732/1157 (63.27%), Postives = 889/1157 (76.84%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. NCBI nr
Match: gi|778694982|ref|XP_011653904.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101220220 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1395.2 bits (3610), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/766 (88.90%), Postives = 720/766 (93.99%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. NCBI nr
Match: gi|778694979|ref|XP_011653903.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101220220 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1389.4 bits (3595), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/762 (88.98%), Postives = 717/762 (94.09%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh03G000020 vs. NCBI nr
Match: gi|659082905|ref|XP_008442092.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103486054 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1389.4 bits (3595), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/766 (88.77%), Postives = 717/766 (93.60%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |