CmaCh16G003660 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CmaCh16G003660
Type	gene
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
Description	Unknown protein
Location	Cma_Chr16 : 1740426 .. 1742556 (-)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

CCGCCTCCAGCTTCTTCAACCCTCTTCCTGTCTCCTCCATTCTTTTACCTTCTTTCTCGACATTCACAGAGTTGACATGGGTGGCTGCGCTAGCAAGCCCAAGACCTACGAGAAAGAAGACGCCCCCCTGCCCCTCCCTGTTGTCAAGGAGGCCGTAGTGGCGGAGCGGACTATTGAGGAGATTCGGGAGGTACCCATTTCCCTTGGGTCTTTGCTCCTTCAGGTAATTTAATTACTCTTTATGTTCTTTAATTCTAATTTTTTTAATTATATCTTTTTTTTTTTTTATTTATTATTTTCTTTGTAGAATGAAGCAAAGGAAGAGGCAGCTGAGGATCAAAAGGAAGTGGGACTTCCAATTAAGGCCCAAAATCAAGAGCCCAGTCAAGAAGCTAAGGTGGAGCCACTAAATGTGGTAGATGCTGCCCCTCCTATACCCACCGTTGAGGAAGTGGCAGTGTCCGAGAAAGCCACTCTAGAGTCAGCGCCGGAAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAATAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAATAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCACCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCACCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCAGCAGAACTCACGAAAGCCACCGAAGAGGAGAAGACCACCGAAGCGACACCGTCACCGGCGGTGGCAGTGGCGGCGGCGACAAAAGAAAAAACAATAGACAATATGGGAAAGTAA

mRNA sequence

CCGCCTCCAGCTTCTTCAACCCTCTTCCTGTCTCCTCCATTCTTTTACCTTCTTTCTCGACATTCACAGAGTTGACATGGGTGGCTGCGCTAGCAAGCCCAAGACCTACGAGAAAGAAGACGCCCCCCTGCCCCTCCCTGTTGTCAAGGAGGCCGTAGTGGCGGAGCGGACTATTGAGGAGATTCGGGAGGTACCCATTTCCCTTGGGTCTTTGCTCCTTCAGAATGAAGCAAAGGAAGAGGCAGCTGAGGATCAAAAGGAAGTGGGACTTCCAATTAAGGCCCAAAATCAAGAGCCCAGTCAAGAAGCTAAGGTGGAGCCACTAAATGTGGTAGATGCTGCCCCTCCTATACCCACCGTTGAGGAAGTGGCAGTGTCCGAGAAAGCCACTCTAGAGTCAGCGCCGGAAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAATAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAATAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCACCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCACCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCAGCAGAACTCACGAAAGCCACCGAAGAGGAGAAGACCACCGAAGCGACACCGTCACCGGCGGTGGCAGTGGCGGCGGCGACAAAAGAAAAAACAATAGACAATATGGGAAAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGTGGCTGCGCTAGCAAGCCCAAGACCTACGAGAAAGAAGACGCCCCCCTGCCCCTCCCTGTTGTCAAGGAGGCCGTAGTGGCGGAGCGGACTATTGAGGAGATTCGGGAGGTACCCATTTCCCTTGGGTCTTTGCTCCTTCAGAATGAAGCAAAGGAAGAGGCAGCTGAGGATCAAAAGGAAGTGGGACTTCCAATTAAGGCCCAAAATCAAGAGCCCAGTCAAGAAGCTAAGGTGGAGCCACTAAATGTGGTAGATGCTGCCCCTCCTATACCCACCGTTGAGGAAGTGGCAGTGTCCGAGAAAGCCACTCTAGAGTCAGCGCCGGAAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAATAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAATAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAATGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGCCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCACCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCACCGTCGAGGCAGCGGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCAGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCGGCCGTAGCGCCACAAAAGGCCGCCGTCGAGGCAGCAGCAGAACTCACGAAAGCCACCGAAGAGGAGAAGACCACCGAAGCGACACCGTCACCGGCGGTGGCAGTGGCGGCGGCGACAAAAGAAAAAACAATAGACAATATGGGAAAGTAA

Protein sequence

MGGCASKPKTYEKEDAPLPLPVVKEAVVAERTIEEIREVPISLGSLLLQNEAKEEAAEDQKEVGLPIKAQNQEPSQEAKVEPLNVVDAAPPIPTVEEVAVSEKATLESAPEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKATVEAAAAVAPQKATVEAAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAELTKATEEEKTTEATPSPAVAVAAATKEKTIDNMGK

Homology

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TrEMBL
Match: H2KMI7_ARCGL (Antifreeze glycoprotein OS=Arctogadus glacialis GN=AFGP PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 1.9e-24
Identity = 257/572 (44.93%), Postives = 260/572 (45.45%), Query Frame = 1


Query: 99  AVSEKATLESAPEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAVAPQKAAV 158
           A +  AT  +    A    A   A A  P  AA  AA A      A  A PA A   AA 
Sbjct: 21  AAATPATAATPATAATPAKAATPATAATPATAATPAAAATP----ATAATPATAATPAAA 80

Query: 159 EAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAA 218
            A P  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A A AP  AA  A 
Sbjct: 81  -ATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPATAAAPAAAATPAT 140

Query: 219 AVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAA 278
           A  P  AA  AAA  P  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A 
Sbjct: 141 AATPATAAAPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPAT 200

Query: 279 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAA 338
           A AP  AA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  A 
Sbjct: 201 AAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAG 260

Query: 339 AVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEA 398
           A  P  AA  A A AP  AA  A A  P  AA  A AA  P  AA  A A AP  AA  A
Sbjct: 261 AATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAKAA-TPATAATPATAAAPAAAATPA 320

Query: 399 AAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEA 458
            A  P  AA  A A  P  AA  A A AP  AA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A
Sbjct: 321 TAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPAAAATPAAAATPATAATPA 380

Query: 459 AAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEA 518
            A AP KAA  A A AP  AA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A A AP KAA  A
Sbjct: 381 TAAAPAKAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPA 440

Query: 519 -----APAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKATVEAAA--- 578
                A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A  A AP KA   AAA   
Sbjct: 441 TAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPAT-AAAPAKAATPAAAATP 500

Query: 579 --AVAPQKATVEA-----AAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAA--- 638
             A AP KA   A     A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A A   
Sbjct: 501 ATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPATAAAP 560

Query: 639 --ELTKATEEEKTTEATPSPAVAVAAATKEKT 651
               T AT     T ATP+ A   A A    T
Sbjct: 561 AKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPAT 585

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TrEMBL
Match: U6G7H8_EIMAC (Uncharacterized protein OS=Eimeria acervulina GN=EAH_00016760 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 7.4e-08
Identity = 253/567 (44.62%), Postives = 289/567 (50.97%), Query Frame = 1


Query: 88   AAPPIPTVEEVA-VSEKATLESAPEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVE 147
            AA P+ +VEE    +  A   SAP +A   A  + A   AP   A E APA A   AA  
Sbjct: 2651 AAVPVSSVEEATGAAADAAATSAPAIATTAAEADVAADAAPH--AAEDAPAEAAANAAAP 2710

Query: 148  AAPAVAPQKAAVEAAPQKA---AVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAV 207
             A A AP  AA  AA   A   +V A  +    AA  AAA A   AA  AA  A   A+ 
Sbjct: 2711 LAAAAAPDTAADSAADAGADVDSVHAPLITSADAATGAAAEAASAAAGAAADAAADAASA 2770

Query: 208  EAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAV 267
             AAA A    A +AAA    +    AAAVAP  AA  A A A   AA E+AAVA   AA 
Sbjct: 2771 GAAAEAATEPAADAAAAGTDRCT--AAAVAPV-AADAATAAAAGDAAAESAAVAKAVAAA 2830

Query: 268  EAAAVAPQKA-----AVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAP 327
            EA A A   A     A  AA  A   AA +A    P  AA EAAA A   AA EA+A A 
Sbjct: 2831 EAVAAAESAAVAAAEADAAADTATDGAAADAVPPVPAVAAAEAAAEAAAEAAAEASAEAA 2890

Query: 328  QKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVA 387
             +AA EAAA A   AA EAAA A  +AA +AAA A   AA EAAA A  +AA EAAA   
Sbjct: 2891 AEAAAEAAAEASAEAAAEAAAEAAAEAAADAAAEASAEAAAEAAAEAAAEAAAEAAA--- 2950

Query: 388  PQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVA 447
               A+ EAAA    +AA EA+A A   AA EAAA    +AA E AA A   A+ EAAA  
Sbjct: 2951 --EASAEAAAEVAAEAAAEASAEASAEAAAEAAAEVAAEAAAEVAAEAAAEASAEAAAEV 3010

Query: 448  PQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVA 507
              +AA EAAA A   AA E AA A  +AA EA+A A   A+ EA+A A  +AA EAAA A
Sbjct: 3011 AAEAAAEAAAEAAAGAAAEVAAEASAEAAAEASAEASAEASAEASAEAAAEAAAEAAAEA 3070

Query: 508  PQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPA 567
               AA EAAA A   AA EAA ++A      E A      A V+AAA A   AA   A A
Sbjct: 3071 AAEAAAEAAAEAAAGAAAEAAGSMAAAPTTTETA------AGVDAAAGAAVDAAAAYAVA 3130

Query: 568  VAPQKATVEAAAAVAPQKATVEAAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEA 627
            +A   A  E  AA     A V+AAA  A   AA   AA A   AA EAAA A    AV  
Sbjct: 3131 LAAAGAAAETIAANIAADAAVDAAAEAAAADAAGPGAAEAAADAAAEAAADAAGSDAVAI 3190

Query: 628  AAELTKATEEEKTTEATPSPAVAVAAA 646
            AA     TE +   +A    AVA+AAA
Sbjct: 3191 AA---ADTEADTAADAAACDAVAIAAA 3198

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TrEMBL
Match: R1F1H5_EMIHU (Uncharacterized protein OS=Emiliania huxleyi GN=EMIHUDRAFT_114819 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.7e-07
Identity = 211/459 (45.97%), Postives = 254/459 (55.34%), Query Frame = 1


Query: 121 AAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEA-----APQKAAVEAAAVAPQ 180
           AA   A ++A   AA A+       E A AVA ++ A +A     A + AA EA A A +
Sbjct: 294 AAAVAAREEARAGAARALKASSLRREGAAAVAAREEARDALHEVEASRAAAKEARAAAEK 353

Query: 181 KAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQ 240
           KAA EA A A +KAA EA A A +KAA EA A A + A  EA A A +KA  EA A A +
Sbjct: 354 KAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAEQEARAAAEK 413

Query: 241 NAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQ 300
            AA EA A A +KAA EA A A + A  EA A A +KA  EA A A + A  EA A A +
Sbjct: 414 KAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAEQEARAAAEK 473

Query: 301 KAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQ 360
           KAA EA A A + AA EA A A +KAA EA A A + A VEA A A +KA  EA A A +
Sbjct: 474 KAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKAAEVEARAAAEKKAEEEARAAAEK 533

Query: 361 NAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAP 420
            AA EA A A +KAA EA AA A + A  EA A A +KA  EA A A + AA EA A A 
Sbjct: 534 KAAEEARAAAEKKAAEEARAA-AEKAAEEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAAEEARAAAE 593

Query: 421 QKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAA---VEAAA 480
           +KA  EA A A + AA EA A A +KA  EA A A + AA EA A A +KAA     A A
Sbjct: 594 KKAEEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAE-EARAAAEKKAAEEARAAAEKKAASGWYSAHA 653

Query: 481 VAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAA 540
           VA +    EA   A ++AA  A   A   AA EA   A +KAA E A  +A ++AA  AA
Sbjct: 654 VAARWG--EAPPSAEKEAAERAQIAAEVRAAEEARVAAEKKAAEEKASQMAAEQAASRAA 713

Query: 541 AVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKATVEAAAA 572
           A A    A  A A A + A   AA AVA + +    + A
Sbjct: 714 AEAAAAEAEAAEAAAAEAAEAAAAEAVAAKGSRARGSGA 748

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TrEMBL
Match: A0A076PW44_COMTE (Histone OS=Comamonas testosteroni TK102 GN=O987_24460 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 2.8e-07
Identity = 166/361 (45.98%), Postives = 194/361 (53.74%), Query Frame = 1


Query: 88  AAPPIPTVEEVAVSEKATLESA-PEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVE 147
           AAP    V++ A ++ A  ++A P  A  K A  AA A AP+KAA   A A AP KAA +
Sbjct: 23  AAPKAEAVKKTAATKTAAPKAAAPAKAAPKKAATAAKAAAPKKAAT-TAKAAAPAKAAPK 82

Query: 148 AAPAVAPQKAAVEAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAA 207
            A   A   A  +AAP+KAA  A A AP KAA       P+KAA  A A AP KAA + A
Sbjct: 83  KAATTAKAAAPAKAAPKKAATTAKAAAPAKAA-------PKKAATAAKAAAPAKAAPKKA 142

Query: 208 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAA 267
           A A + AA   A  AP+KAA  A A AP  AA       P+KAA  A A AP  AA    
Sbjct: 143 ATAAKAAA--PAKAAPKKAATAAKAAAPAKAA-------PKKAATAAKAAAPAKAA---- 202

Query: 268 AVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAA 327
              P+KAA  A A AP+ AA  A A AP KAA + AA A + AA   A  AP+KAA  A 
Sbjct: 203 ---PKKAATAAKAAAPKKAATTAKAAAPAKAAPKKAATAAKAAA--PAKAAPKKAATAAK 262

Query: 328 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEA 387
           A AP  AA + AA A  KAA  A A AP+ AA  A A AP KAA       AP+ A V A
Sbjct: 263 AAAPAKAASKKAATAA-KAAAPAKAAAPKKAAT-AKAAAPAKAA-------APKKA-VAA 322

Query: 388 AAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAA----VAPQKAAVEA-AAVAPQNAAVEAAAVAPQK 443
            A AP+KAA  + A AP  AA + AA     AP+KAA  A AAV    A V    +APQ 
Sbjct: 323 KAAAPKKAATASKAAAPAKAASKKAANGAKAAPKKAATPAPAAVTETTAPVAQTRLAPQA 347

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TrEMBL
Match: B7WU74_COMTE (Uncharacterized protein OS=Comamonas testosteroni KF-1 GN=CtesDRAFT_PD0504 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 3.7e-07
Identity = 166/360 (46.11%), Postives = 191/360 (53.06%), Query Frame = 1


Query: 88  AAPPIPTVEEVAVSEKATLESAPEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEA 147
           AAP    V++ A    AT  +AP  A  K A  AA A AP+KAA   A A AP KAA + 
Sbjct: 23  AAPKAEAVKKTA----ATKTAAPAKAAPKKAATAAKAAAPKKAAT-TAKAAAPAKAAPKK 82

Query: 148 APAVAPQKAAVEAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAA 207
           A   A   A  +AAP+KAA  A A AP KAA       P+KAA  A A AP KAA     
Sbjct: 83  AATTAKAAAPAKAAPKKAATTAKAAAPAKAA-------PKKAATAAKAAAPAKAA----- 142

Query: 208 VAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAA 267
             P+ AA  A A  P KAA       P+ AA  A A AP KAA + AA A + AA   A 
Sbjct: 143 --PKKAATAAKAATPAKAA-------PKKAATAAKAAAPAKAAAKKAATAAKAAA--PAK 202

Query: 268 VAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAA 327
            AP+KAA  A A AP+ AA  A A AP KAA + AA A + AA   A  AP+KAA  A A
Sbjct: 203 AAPKKAATAAKAAAPKKAATTAKAAAPAKAAPKKAATAAKAAA--PAKAAPKKAATAAKA 262

Query: 328 VAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEAA 387
            AP  AA + AA A  KAA  A A AP+ AA  A A AP KAA       AP+ A V A 
Sbjct: 263 AAPAKAASKKAATAA-KAAAPAKAAAPKKAAT-AKAAAPAKAA-------APKKA-VAAK 322

Query: 388 AVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAA----VAPQKAAVEA-AAVAPQNAAVEAAAVAPQKA 443
           A AP+KAA  + A AP  AA + AA     AP+KAA  A AAV    A V    +APQ A
Sbjct: 323 AAAPKKAATASKAAAPAKAASKKAANGAKAAPKKAATPAPAAVTETTAPVAQTRLAPQAA 342

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. NCBI nr
Match: gi|33328237|gb|AAQ09569.1| (antifreeze glycoprotein precursor [Arctogadus glacialis])

HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 1.1e-23
Identity = 251/564 (44.50%), Postives = 254/564 (45.04%), Query Frame = 1


Query: 88  AAPPIPTVEEVAVSEKATLES-APEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVE 147
           AA P       A +  AT  + A   AP KAA  A  A     AA  AA   A       
Sbjct: 64  AATPATAATPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPAT 123

Query: 148 AAPAVAPQKAAVEAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAA 207
           AA   A    A  A P  AA  AAA  P  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  AA
Sbjct: 124 AAAPAAAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAA 183

Query: 208 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAA 267
           A  P  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A A AP  AA  A 
Sbjct: 184 AATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPAT 243

Query: 268 AVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAA 327
           A  P  AA  A A  P  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  A A  P  AA  A 
Sbjct: 244 AATPATAATPAGAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPAT 303

Query: 328 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEA 387
           A AP  AA  A A  P  AA  A A  P  AA  A A AP  AA  A AA  P  AA  A
Sbjct: 304 AAAPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAAAATPATAAT-PAAAATPA 363

Query: 388 AAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEA 447
           AA  P  AA  A A AP  AA  A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A
Sbjct: 364 AAATPATAATPATAAAPAKAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPA 423

Query: 448 AAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEA 507
            A AP  AA  A A  P      A A AP  AA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A
Sbjct: 424 TAAAPAKAATPATAATP------ATAAAPAKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPA 483

Query: 508 AAVAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKATV 567
            A AP KAA  AA A  P  AA  A A  P  AA  A A AP KAA    PA A   AT 
Sbjct: 484 TAAAPAKAATPAA-AATPATAAAPAKAATPATAATPATAAAPAKAA---TPATAATPATA 543

Query: 568 EAAAAVAPQKATVEAAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAELTKAT 627
            A AA A        A A AP KAA  A A  P  AA  AAA  P  AA  A A  T A 
Sbjct: 544 AAPAAAATPATAATPATAAAPAKAATPATAATPATAATPAAAATPATAATPATA-ATPAA 603

Query: 628 EEEKTTEATPSPAVAVAAATKEKT 651
                T ATP+ A   AAA    T
Sbjct: 604 AATPATAATPATAATPAAAATPAT 615

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. NCBI nr
Match: gi|930654330|gb|KPI96665.1| (Uncharacterized protein FLJ40925 [Papilio xuthus])

HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 7.4e-09
Identity = 171/361 (47.37%), Postives = 175/361 (48.48%), Query Frame = 1


Query: 138 IAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVA 197
           +A ++A       VA +    E      AVE A V    AAVE AA     AAVE AA  
Sbjct: 184 LATEEAEEAEEVEVAEEGMEAEETEMVEAVEMAEVVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAV 243

Query: 198 PQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVA 257
              AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA  
Sbjct: 244 EMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAV 303

Query: 258 PQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVA 317
              AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA  
Sbjct: 304 EMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAV 363

Query: 318 PQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAV 377
              AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE A   
Sbjct: 364 EMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMA--- 423

Query: 378 APQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAV 437
               AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA 
Sbjct: 424 ----AAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAA 483

Query: 438 APQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAV 497
               AAVE AA     AAVE AA     AAVE AA     AAVE  A     AAVE AA 
Sbjct: 484 VEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMAAAVEMVAAVEMAAAVEMAAA 537

Query: 498 A 499
           A
Sbjct: 544 A 537

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. NCBI nr
Match: gi|915017393|ref|XP_013253226.1| (hypothetical protein, conserved [Eimeria acervulina])

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 1.1e-07
Identity = 253/567 (44.62%), Postives = 289/567 (50.97%), Query Frame = 1


Query: 88   AAPPIPTVEEVA-VSEKATLESAPEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVE 147
            AA P+ +VEE    +  A   SAP +A   A  + A   AP   A E APA A   AA  
Sbjct: 2651 AAVPVSSVEEATGAAADAAATSAPAIATTAAEADVAADAAPH--AAEDAPAEAAANAAAP 2710

Query: 148  AAPAVAPQKAAVEAAPQKA---AVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAV 207
             A A AP  AA  AA   A   +V A  +    AA  AAA A   AA  AA  A   A+ 
Sbjct: 2711 LAAAAAPDTAADSAADAGADVDSVHAPLITSADAATGAAAEAASAAAGAAADAAADAASA 2770

Query: 208  EAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAV 267
             AAA A    A +AAA    +    AAAVAP  AA  A A A   AA E+AAVA   AA 
Sbjct: 2771 GAAAEAATEPAADAAAAGTDRCT--AAAVAPV-AADAATAAAAGDAAAESAAVAKAVAAA 2830

Query: 268  EAAAVAPQKA-----AVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAP 327
            EA A A   A     A  AA  A   AA +A    P  AA EAAA A   AA EA+A A 
Sbjct: 2831 EAVAAAESAAVAAAEADAAADTATDGAAADAVPPVPAVAAAEAAAEAAAEAAAEASAEAA 2890

Query: 328  QKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVA 387
             +AA EAAA A   AA EAAA A  +AA +AAA A   AA EAAA A  +AA EAAA   
Sbjct: 2891 AEAAAEAAAEASAEAAAEAAAEAAAEAAADAAAEASAEAAAEAAAEAAAEAAAEAAA--- 2950

Query: 388  PQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVA 447
               A+ EAAA    +AA EA+A A   AA EAAA    +AA E AA A   A+ EAAA  
Sbjct: 2951 --EASAEAAAEVAAEAAAEASAEASAEAAAEAAAEVAAEAAAEVAAEAAAEASAEAAAEV 3010

Query: 448  PQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVA 507
              +AA EAAA A   AA E AA A  +AA EA+A A   A+ EA+A A  +AA EAAA A
Sbjct: 3011 AAEAAAEAAAEAAAGAAAEVAAEASAEAAAEASAEASAEASAEASAEAAAEAAAEAAAEA 3070

Query: 508  PQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPA 567
               AA EAAA A   AA EAA ++A      E A      A V+AAA A   AA   A A
Sbjct: 3071 AAEAAAEAAAEAAAGAAAEAAGSMAAAPTTTETA------AGVDAAAGAAVDAAAAYAVA 3130

Query: 568  VAPQKATVEAAAAVAPQKATVEAAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEA 627
            +A   A  E  AA     A V+AAA  A   AA   AA A   AA EAAA A    AV  
Sbjct: 3131 LAAAGAAAETIAANIAADAAVDAAAEAAAADAAGPGAAEAAADAAAEAAADAAGSDAVAI 3190

Query: 628  AAELTKATEEEKTTEATPSPAVAVAAA 646
            AA     TE +   +A    AVA+AAA
Sbjct: 3191 AA---ADTEADTAADAAACDAVAIAAA 3198

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. NCBI nr
Match: gi|551589930|ref|XP_005779428.1| (hypothetical protein EMIHUDRAFT_114819 [Emiliania huxleyi CCMP1516])

HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 2.4e-07
Identity = 211/459 (45.97%), Postives = 254/459 (55.34%), Query Frame = 1


Query: 121 AAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEA-----APQKAAVEAAAVAPQ 180
           AA   A ++A   AA A+       E A AVA ++ A +A     A + AA EA A A +
Sbjct: 294 AAAVAAREEARAGAARALKASSLRREGAAAVAAREEARDALHEVEASRAAAKEARAAAEK 353

Query: 181 KAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQ 240
           KAA EA A A +KAA EA A A +KAA EA A A + A  EA A A +KA  EA A A +
Sbjct: 354 KAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAEQEARAAAEK 413

Query: 241 NAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQ 300
            AA EA A A +KAA EA A A + A  EA A A +KA  EA A A + A  EA A A +
Sbjct: 414 KAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAEQEARAAAEK 473

Query: 301 KAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQ 360
           KAA EA A A + AA EA A A +KAA EA A A + A VEA A A +KA  EA A A +
Sbjct: 474 KAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAAEEARAAAEKAAEVEARAAAEKKAEEEARAAAEK 533

Query: 361 NAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAP 420
            AA EA A A +KAA EA AA A + A  EA A A +KA  EA A A + AA EA A A 
Sbjct: 534 KAAEEARAAAEKKAAEEARAA-AEKAAEEEARAAAEKKAEEEARAAAEKKAAEEARAAAE 593

Query: 421 QKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAA---VEAAA 480
           +KA  EA A A + AA EA A A +KA  EA A A + AA EA A A +KAA     A A
Sbjct: 594 KKAEEEARAAAEKKAAEEARAAAEKKAE-EARAAAEKKAAEEARAAAEKKAASGWYSAHA 653

Query: 481 VAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKAAVEAA 540
           VA +    EA   A ++AA  A   A   AA EA   A +KAA E A  +A ++AA  AA
Sbjct: 654 VAARWG--EAPPSAEKEAAERAQIAAEVRAAEEARVAAEKKAAEEKASQMAAEQAASRAA 713

Query: 541 AVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAPAVAPQKATVEAAAA 572
           A A    A  A A A + A   AA AVA + +    + A
Sbjct: 714 AEAAAAEAEAAEAAAAEAAEAAAAEAVAAKGSRARGSGA 748

[Close]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. NCBI nr
Match: gi|759659294|ref|WP_043376908.1| (hypothetical protein [Comamonas testosteroni])

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 4.0e-07
Identity = 166/361 (45.98%), Postives = 194/361 (53.74%), Query Frame = 1


Query: 88  AAPPIPTVEEVAVSEKATLESA-PEVAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVEAAPAIAPQKAAVE 147
           AAP    V++ A ++ A  ++A P  A  K A  AA A AP+KAA   A A AP KAA +
Sbjct: 23  AAPKAEAVKKTAATKTAAPKAAAPAKAAPKKAATAAKAAAPKKAAT-TAKAAAPAKAAPK 82

Query: 148 AAPAVAPQKAAVEAAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQKAAVEAA 207
            A   A   A  +AAP+KAA  A A AP KAA       P+KAA  A A AP KAA + A
Sbjct: 83  KAATTAKAAAPAKAAPKKAATTAKAAAPAKAA-------PKKAATAAKAAAPAKAAPKKA 142

Query: 208 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAA 267
           A A + AA   A  AP+KAA  A A AP  AA       P+KAA  A A AP  AA    
Sbjct: 143 ATAAKAAA--PAKAAPKKAATAAKAAAPAKAA-------PKKAATAAKAAAPAKAA---- 202

Query: 268 AVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAA 327
              P+KAA  A A AP+ AA  A A AP KAA + AA A + AA   A  AP+KAA  A 
Sbjct: 203 ---PKKAATAAKAAAPKKAATTAKAAAPAKAAPKKAATAAKAAA--PAKAAPKKAATAAK 262

Query: 328 AVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAAVAPQKAAVEAAAAVAPQNAAVEA 387
           A AP  AA + AA A  KAA  A A AP+ AA  A A AP KAA       AP+ A V A
Sbjct: 263 AAAPAKAASKKAATAA-KAAAPAKAAAPKKAAT-AKAAAPAKAA-------APKKA-VAA 322

Query: 388 AAVAPQKAAVEAAAVAPQNAAVEAAA----VAPQKAAVEA-AAVAPQNAAVEAAAVAPQK 443
            A AP+KAA  + A AP  AA + AA     AP+KAA  A AAV    A V    +APQ 
Sbjct: 323 KAAAPKKAATASKAAAPAKAASKKAANGAKAAPKKAATPAPAAVTETTAPVAQTRLAPQA 347

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh16G003660 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
H2KMI7_ARCGL	1.9e-24	44.93	Antifreeze glycoprotein OS=Arctogadus glacialis GN=AFGP PE=4 SV=1	[more]
U6G7H8_EIMAC	7.4e-08	44.62	Uncharacterized protein OS=Eimeria acervulina GN=EAH_00016760 PE=4 SV=1	[more]
R1F1H5_EMIHU	1.7e-07	45.97	Uncharacterized protein OS=Emiliania huxleyi GN=EMIHUDRAFT_114819 PE=4 SV=1	[more]
A0A076PW44_COMTE	2.8e-07	45.98	Histone OS=Comamonas testosteroni TK102 GN=O987_24460 PE=4 SV=1	[more]
B7WU74_COMTE	3.7e-07	46.11	Uncharacterized protein OS=Comamonas testosteroni KF-1 GN=CtesDRAFT_PD0504 PE=4 ...	[more]

BLAST of CmaCh16G003660 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh16G003660 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|33328237\|gb\|AAQ09569.1\|	1.1e-23	44.50	antifreeze glycoprotein precursor [Arctogadus glacialis]	[more]
gi\|930654330\|gb\|KPI96665.1\|	7.4e-09	47.37	Uncharacterized protein FLJ40925 [Papilio xuthus]	[more]
gi\|915017393\|ref\|XP_013253226.1\|	1.1e-07	44.62	hypothetical protein, conserved [Eimeria acervulina]	[more]
gi\|551589930\|ref\|XP_005779428.1\|	2.4e-07	45.97	hypothetical protein EMIHUDRAFT_114819 [Emiliania huxleyi CCMP1516]	[more]
gi\|759659294\|ref\|WP_043376908.1\|	4.0e-07	45.98	hypothetical protein [Comamonas testosteroni]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this gene:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh16G003660.1	CmaCh16G003660.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	GENE3D	G3DSA:2.160.10.10		coord: 308..408 score: 1.

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:


Gene	Orthologue	Organism	Block
CmaCh16G003660	CmoCh16G003910	Cucurbita moschata (Rifu)	cmacmoB322
CmaCh16G003660	CsaV3_3G018740	Cucumber (Chinese Long) v3	cmacucB0373
CmaCh16G003660	Carg11294	Silver-seed gourd	carcmaB0924

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
CmaCh16G003660	Silver-seed gourd	carcmaB0526
CmaCh16G003660	Cucumber (Chinese Long) v3	cmacucB0386
CmaCh16G003660	Watermelon (97103) v2	cmawmbB347
CmaCh16G003660	Wax gourd	cmawgoB0438
CmaCh16G003660	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmaB351
CmaCh16G003660	Cucurbita moschata (Rifu)	cmacmoB338
CmaCh16G003660	Wild cucumber (PI 183967)	cmacpiB326
CmaCh16G003660	Cucumber (Chinese Long) v2	cmacuB320
CmaCh16G003660	Cucumber (Chinese Long) v2	cmacuB331
CmaCh16G003660	Melon (DHL92) v3.5.1	cmameB298
CmaCh16G003660	Watermelon (Charleston Gray)	cmawcgB297
CmaCh16G003660	Watermelon (97103) v1	cmawmB317
CmaCh16G003660	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmacpeB344
CmaCh16G003660	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmacpeB351
CmaCh16G003660	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cmalsiB316
CmaCh16G003660	Cucumber (Gy14) v2	cgybcmaB332
CmaCh16G003660	Melon (DHL92) v3.6.1	cmamedB346