ClCG05G000120 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGGAAGTAGCAGTGGATACCTAACAAATTATTATTTTGTATATGTGTTTCAGGGCCACATGTATCTGTTCGTGCACTATATATGCTTTTACTCCAACATCTTTGGGTTTGAGACAAAGGTAACATGTGAATTCATCTTTTAGCTGCATGAGGTTATTCTTACCTACCAGCTTGATTAATAGAAGTTATGATTTAAACCAAAAGCACTTTCTCTCACTCAAACACATGGGCTTGCATGATGCAAGCACACACATTTGAAATTCCTCATGTTCGTTTTATTATTGAAGTCCACTATCCTTTTTCATCTGCTCAGGCAAGAACGTCTCCTCTTGGTTTCTTTCTTTTTCTGGTGTACAAAAAGTAGATGCATTATGGTAATGAAAGTAGATAGTTATTTATTGGTTTGTTGTTTCACTTGGTTTTGGTCTGGTTTGTTTTGGTTAAGTTTGTCTCTTGGATTCTTATGTATGGGGCTCTCTCTCTAAGTTTTTGTGCTTCTTTGTTGATGGATTTCCATCCTATTTGGCATGTAGTCTTCATCATCTTCAGTTGTTTTTGTCTCTTATATTTGTTTTCCATTTGAAGATCTTGTATTTTGGAGCATTAGTCTCTTTTAATTATATCATTGAAGTTTTGTTTCCTTTAAAAAGAATAATAGTAGCTTGAGGCATTTCAGACTAACTCAGTATTAAGTGAACAATGTGTCCTATTGTCGCAATCTAGAAGAATTTATTATAGACATGCAATCTTTAATGTTATGTTTATAAGTTATTATCATTATTCTGTTAGATTTTAGAGGTATGTTCAGTCTCCATTTGAATGTGAGAATTTCTGTACATCTTATATGGCTAGCATACTGTTACGCTATCAATCAAGGAAACAATCCCCACAATTGGGCTGATCCCCCCACCTCACTTATTATTTAATATTCTAAAAAATTAGGCTAATCCAGTAAGAAAATAATCAAAGCCCTCGATGCTAATCCAAGAAGAAGCATGTTTGAATCTTCGGGAGAGTTCAATAATCAAAGCCCTCGATGCCTTCAGAGTCTTGGCCTTAGGGGCTGACATGGACTTTTTTAAAAGTAAGATAACAGGGGAAAAAAGGATATACATGGATTAGCACTTGTTTAAACAACATTCTACTATAATTCTTTAGTGCTCCACTTAACATGAAATCCGGGATCTATCCTTATCCTTTTGCTTTTGGGATTCAAAATTTAAAAGGAGTGATTTTCCATGCTAATTATGTACGTTCCATTCACTGAAGAAATGTATATATGTTAAATCAACAATCAATCCAAAAGCTTAAGCTGGTGGGTTATGGTGAACTTAATGTGAAGGAAGTGGAAAGCTCTTTTCTGACTTTGATTTGAAGATCGAACAAAATAGACGAAAAAGAAAGATCAAGCCCGGTTACATTCATTTCATTTTTTTTTATCAGACGAAGCAAACCTGTTATTGAGTTCTGATGTTGCTCTTGCCAACTCATCAGCTTCTTGGTTGGCTTAACGATTAACTTGCATGATGGTCCACTCCCCCAAGGTTTTCCAGCTTGTTTAGGAGATGTTTAACCTTTAACATAAAATTAGAACAAGTGATTGCTGAGATTCGTGCGGGAACATACACTCTTAATTTAAAAGAGAGGGTTCGAAAACATATTTATTCTAATTCAGAGGGAGAAATGCATTGGAGTACCGATGTGTATCATGCACCCGAATTTACATATAGTAATGTCCATCTCTTACCAAAAACAGGTCATTTATGGATATTATCAGGAGGTTCATGCGGATGCAGTGTAGTCCTTTTTTCACGTTATATCAACACCCTAACACTCTCCCTCACTTGTGGGCTTGAAAATTTATTAAATGCCCAAAAAATGGAATTCAATATTATTAGCGAGGAAATGACTTTACAAGGGTTCGAACTCGAGATCTCCTGTTCTGATACCAACTTGAATTTGGGAAGAAAAATATTATTATATTTATTAGATGATATAATATTAAATTTTCCTTCACCCATACGCTTAAGCTTTTGGGTCAATTGGTGATTTAAGATGATGGTAACAAAGCAAGTGGTCCAAGGAGGTCTTGTGTTCAAACACCGGCATTGTTATTTTCTCTCCAACTAAAATATTGATTTCCACTTGTTGGGTCTTCTTCATATTTCAAGCCCATAAGTGAGGAGTGTTAGATGATCTAATATTAAATTTGCCTTCATCCATTAGCTTAAGCTTTTATATTAATTGGTGATTTAAGATTTGTAATCAATAAGATTTGGAACGACACAGATTTGGTGTTGAGCAATTTACAGAATACACAATAAATATTACAGAAGATTCGAGGAAATCTAACAGTTCTTTTTTTAAGCAAATGAGGGATATTTTTGGTACTACTCATTTGTTCAAGTTCAGATCTTCCCAGGTTGGAAATTTGTATGTAGGGTAACTAGGGTTTGGCCTCCCTCTAGTAGAAGAAAATCATTATAAGTTTCTGCTGGTTTTTGGAAGAAAGGGTGGGTGGTTTTCTGGGGAATGCTTAGTGCCTTTCTTCTAAATAATGGAAAACTTCATCAATCAGTTGTCAAGCTATTATCTCATAGACAAATTCTCGATGCTTAGTGCCGAATCAGTTGGCTTTTGTAGCCAATAGACAATTGTTCTTAAATTGGACCTTGAAAAGGTTTTTGATATGGTCGATTGGGAGTTTCTTGATTAAGTTCTTCGTATTAAAGGCTTTGGTTCTCTTTGGTGTACAACGTACTTGGATTAATGGTTGTCTCTCTAGTGCAAACTACTCCATTATTCGAAATGGCCGTCCCCGGGGCAAGATTATCCCAACGCGTGGTATTAGACAGGGAGATCCCCTCTCTCCCTTCTTATTTATCATTGTTGCTGATTGCCTAAGTTGCCTGCTTGCTCACAGTTCATCTTTGGGCCTCACTATTGCTCACCCCATTGGTCAGTCATCTTTTTCGATTAATCATTTGCAGTTTGCAGACGATACTTTGCTATTCTCTATTGCTGAAAGATCTGCTTTACAGAACTTATTTGATGTGATTCATATTTTTTAACGTGCTTCTAGCCTTAAAGTCAATCTTGCCAAGAGTGAGCTCCTGGGGATTCACATCCCTGATGCTGAGGTGGATGAGTGGTTGAACTCTTTTGGTTGTAAGAAAGGTTTTTGGCCTTCTTCTTATCTTGGTCTTCTGTTGGGTGGTAACTCTTCATCTATTGGATTTTGGCAGCCTGTGATGGAACGATTTCAGCATAAACTTCATAATTGGAAGTATGCTTATATATCAAAAGGGGGGAGACATACGCTTATTCAAGCTGCTCTTTCTAGCCTCCCTACTTATTACTTGTCGTTGTTTCAGGCTCCTTCATCTATTATTGGTTGCCTTGATAAGCTGACTCGTGATTTCTTTTGGGAGGGTACTAGAGGTGATGGTGGCATGCACAATGTTAACTGGGCCATCTCTTAGCGGCCTCAATTGTCGGGTGGCATGGGGATTGGTAACTTTAAATATCGTAATTCTGCTTTTCTTGCTAAATGGACGTGGCGTTTCATTATTGAGCTTGATGTCTTATGGAGAAAGCTTATTGTGGCGAAGTAGTATTCCCCTGATTGTATATGGCCCTCCCCTATCTCTCGCGGATCATCGAAGGCTCCCTGGAGATCCATTTGCCATTACATGGATTTGGTTGTGGATCGGGTCTCCCGTCGCATTGGTGATGGTGGTTCTACATCTTTTTGGCATGATCCATGGCTTAGTTGTGGTGTTTTTGCTTCTACTTATCCGCGACTTTTTCGGCTCACTCAACGTTCAGAGGCTATGGTAGCCAATGTCTGGGTTCCTTCTACGCCTGCTTGGAATCTTAATCTGCATTGCAATCTCACTGAATTGGAAATTGCTGAATGGGCCTCCCTTTCTGGCTACCTGGCCCAATCAGATTGCGCTCTTTCCTTGATTCTTGGTTATGGCCTCTTGATTCTTCTTTGACCTTTACTGTCAAATCTTTGATGGTCGATTTTGTGGATGATTTGGATACTGGTCTATCAGATCTTTATAGGGTTATATAGAAAAATAAATAACCTAAAAAGATTAAAATTTTTCTTGGCGCTGCATGCCCTCCCTATATGTCGCTTTCTCCATCTTTGTGTCATATGTGTCATATGAATGCGGAATCGCCGGCTCACTTGTTCCTGCACTGTCCTCGATATCAAAAGTTGCTTAGCCACAATACTCAATGAATTCACATGCTGACAATTGTTTGGTATGTAGGACTTTTAACCACTATTCATTGTTTAATTTGCATGTATGACTTCGACATCATGTTGTTATTCCCATCTAAACATGAACCACATGATTCGATTTCTCATATCAATATTTTTTAAAATTCGGTTATTGTCAGTTGGATCCTTACTACAGCTATATCTGCCTTGGTTCTTGTTTATGATTTTTATTATACTTCAGAAGATAATCCCATTACAAGAAATAACAGCTGTACGTAAAGCAAAGATGGCAGGGATCTTTCCTAATGCCATTGAAATATTTGTTGGAGAGAAAAAGGTAGTTTTAAGTTTTTAATGCTTTACATTTTCATTTTGCTTTAATTTTGAATTTCATCTACCAGAATTAATTATTAGGGGGATCTCTGATATCCTTTTTGTTTTTAGTCTTTTCTTTTTCTAAAACAATTAGCTTTACAATTTAATAGCACTTTTCTTTGTTTCGTAAATCTACTTTCAAAATAAATTTTGACAATAAAATAAAAATTATTATCAGCTTATTTTTTTTTAAAAAAAAACCTATAAATAGAATCATTCTCCATCTCAAGTAATTTGTTGGTTAGATTAAGTTTAGTCCCTGAATTTTGAGGCTTATGTTTATTTAGTTTCTGAACTTTTGAAATTGTTTAATAAGTCCCTAAATCATTTCAATTTTGTGTTAGATTGGTTCATGAACTTTCAGCCATCATTTACAATTTTACTTT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ATGTATCTGTTCGTGCACTATATATGCTTTTACTCCAACATCTTTGGGTTTGAGACAAAGAAGATAATCCCATTACAAGAAATAACAGCTGTACGTAAAGCAAAGATGGCAGGGATCTTTCCTAATGCCATTGAAATATTTGTTGGAGAGAAAAAGAAATCAATAAATGAATCTAGCGGACAAGAAATTGGTATCCCCAGTATCGAAAAGGCCAAGCAGCTGGATCCTTCAGATTCTTCGCATAGGAGTATGAATACTCCTATTCTTAATGTTTCCATGGATCAAGCCGATGTTGAAGAGGAAAATGCACCAAAGACGCTGCCGGCAGAACCTCTTGACGCCATTCAGGAAGCAGAGCCAATTCTTGATACTCATGCTTCAACTTCAAGAAAGACATTGACGTGGAAGCCAGAAGACACAGATGCTCCCAAGGTTCCAGATTATTATACCCAAGTTGCAGAATCAAAGTTTCCGATAAAAGTGGAAGATTTCTTTAGTTTCTATTTTTCCGACAATGCAGTAGATTTTGTTTCTTCATATCATGAAAAATGTGGAGACAAAGAGTTTAAATGTTCTCTTTGGCGTCACGATGACATGTTTGGGCATACACGTGCAAAGTTTGGTGGCTGCCTGGAGATTCAGAAATTTCGAGTTTATCGAGACAGTCATTTGGTCATCGAGGTAACACAAGAAGTCAGTGAGGTTCCATATTCAGATTATTTCCGTGTTGAGGCACACTGGGAGGTGAAGAAAGATGTTGATGAATCAAATAATTGCTGCGTCTTGAGGGTATATGTGAATGTGGCATTTTCAAAAAGAACAGTTTGGAAAGGGAAAATAGTGCAGTCTACCCTTGAAGAATGCCGAGAGGCCTATGGAATGTGGATTCAGATGGCAAAGGAATTGTTGAAGGAGAAACTTAAAGGTTCTGAAGAGGGAACAAGTGGTAGTACATCGCAGAGTGGTATAGATCATCATATTGAAGAAGAAATAAATAATAGCAAATCATTGGAGAAGTCAAATGAGAAGAATGACCAAAGAAGATTAACTGAATCACAATGTTCCACCGATGTTGATCAACAATCTGAAAACCTTACTCAAGGAGTCAATTCTACTTCGGCTGCTTCTTGGTTAAGAGAATACAGGAAGAAGCTTTGGTCTGTGTTACGAAGTCAAAACTATCTTCCTCTTGCCCTAGTCATCACTTTTGCTGTAATTTTTCTAATGCAGTTGAGCATAGTTATGCTATTATCCAGACCGCAACACATCCATGTGAGTTCTCCCGACCATGGAAGGGGTCTAAAATTCAGTGGTGGAAGATCTTCTGATGCTACGGCGTGGTTGGAAAAGCGAATTCACCACCTTAAGGATGAGATGTACATGGTTGAGGCTCGGCTAGAGATGATGCGACGCGAGCATGCCCAATTAAAAGCACAGCTAAGAGAGCTTGAGGAATTAAATTAA MYLFVHYICFYSNIFGFETKKIIPLQEITAVRKAKMAGIFPNAIEIFVGEKKKSINESSGQEIGIPSIEKAKQLDPSDSSHRSMNTPILNVSMDQADVEEENAPKTLPAEPLDAIQEAEPILDTHASTSRKTLTWKPEDTDAPKVPDYYTQVAESKFPIKVEDFFSFYFSDNAVDFVSSYHEKCGDKEFKCSLWRHDDMFGHTRAKFGGCLEIQKFRVYRDSHLVIEVTQEVSEVPYSDYFRVEAHWEVKKDVDESNNCCVLRVYVNVAFSKRTVWKGKIVQSTLEECREAYGMWIQMAKELLKEKLKGSEEGTSGSTSQSGIDHHIEEEINNSKSLEKSNEKNDQRRLTESQCSTDVDQQSENLTQGVNSTSAASWLREYRKKLWSVLRSQNYLPLALVITFAVIFLMQLSIVMLLSRPQHIHVSSPDHGRGLKFSGGRSSDATAWLEKRIHHLKDEMYMVEARLEMMRREHAQLKAQLRELEELN
BLAST of ClCG05G000120 vs. Swiss-Prot
Match: VAD1_ARATH (Protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=VAD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 2.1e-101 Identity = 225/524 (42.94%), Postives = 300/524 (57.25%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. Swiss-Prot
Match: BAGP1_ARATH (BAG-associated GRAM protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=BAGP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.5e-09 Identity = 75/345 (21.74%), Postives = 132/345 (38.26%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. Swiss-Prot
Match: GRM1A_RAT (GRAM domain-containing protein 1A OS=Rattus norvegicus GN=Gramd1a PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 9.6e-06 Identity = 25/52 (48.08%), Postives = 34/52 (65.38%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. Swiss-Prot
Match: GRM1A_MOUSE (GRAM domain-containing protein 1A OS=Mus musculus GN=Gramd1a PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 9.6e-06 Identity = 25/52 (48.08%), Postives = 34/52 (65.38%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. Swiss-Prot
Match: GRM1A_HUMAN (GRAM domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens GN=GRAMD1A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 9.6e-06 Identity = 25/52 (48.08%), Postives = 34/52 (65.38%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L3J6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G116750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 845.9 bits (2184), Expect = 2.5e-242 Identity = 435/535 (81.31%), Postives = 455/535 (85.05%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TrEMBL
Match: A0A061E2G1_THECC (GRAM domain family protein, putative isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_005713 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 480.3 bits (1235), Expect = 2.7e-132 Identity = 266/534 (49.81%), Postives = 336/534 (62.92%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TrEMBL
Match: D7SLY9_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_15s0021g01530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 478.8 bits (1231), Expect = 7.9e-132 Identity = 269/541 (49.72%), Postives = 353/541 (65.25%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TrEMBL
Match: A0A061DUJ5_THECC (GRAM domain family protein, putative isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_005713 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 1.5e-130 Identity = 266/538 (49.44%), Postives = 336/538 (62.45%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TrEMBL
Match: A0A059C4D9_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_E01549 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 9.1e-128 Identity = 267/546 (48.90%), Postives = 347/546 (63.55%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TAIR10
Match: AT1G02120.1 (AT1G02120.1 GRAM domain family protein) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 1.2e-102 Identity = 225/524 (42.94%), Postives = 300/524 (57.25%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. TAIR10
Match: AT3G59660.1 (AT3G59660.1 C2 domain-containing protein / GRAM domain-containing protein) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 1.4e-10 Identity = 75/345 (21.74%), Postives = 132/345 (38.26%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. NCBI nr
Match: gi|778676602|ref|XP_011650619.1| (PREDICTED: protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 845.9 bits (2184), Expect = 3.5e-242 Identity = 435/535 (81.31%), Postives = 455/535 (85.05%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. NCBI nr
Match: gi|778676604|ref|XP_011650620.1| (PREDICTED: protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X4 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 839.3 bits (2167), Expect = 3.3e-240 Identity = 434/538 (80.67%), Postives = 455/538 (84.57%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. NCBI nr
Match: gi|778676598|ref|XP_011650617.1| (PREDICTED: protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 839.3 bits (2167), Expect = 3.3e-240 Identity = 434/538 (80.67%), Postives = 455/538 (84.57%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. NCBI nr
Match: gi|778676600|ref|XP_011650618.1| (PREDICTED: protein VASCULAR ASSOCIATED DEATH 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 832.8 bits (2150), Expect = 3.1e-238 Identity = 433/538 (80.48%), Postives = 454/538 (84.39%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000120 vs. NCBI nr
Match: gi|659074733|ref|XP_008437767.1| (PREDICTED: GRAM domain-containing protein 1A isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 689.1 bits (1777), Expect = 5.5e-195 Identity = 358/456 (78.51%), Postives = 375/456 (82.24%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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