CSPI07G17570 (gene) Wild cucumber (PI 183967)

Overview
NameCSPI07G17570
Typegene
OrganismCucumis sativus (Wild cucumber (PI 183967))
DescriptionUnknown protein
LocationChr7 : 15904933 .. 15909969 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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ATTTCCTAATCATCGTCTTTGAAACCAGCTGCTTTTCTGACCTTCAACGCTTCAAGACACTCAATTACCAATGTCCATTGCAATAGGTTCCAAGCTTTTCCACACTGTTCTCTTAATGTTGGCTTGGCAATATTGGGCCAAGGTGGACGCCACATTCAAAGATGTCACTGGCTTTTTTGATTTCAACCTTGGTTCATTTGGATCAGGTGGCGCTGGAATTATGGGGGGGACGAAAAATGGTGGCTCACCGGCCAACGCTCCAGAAATGGCACCAGGTATTGCTCCTGTTGGATTTGATACTCCAACAAATAATGAAGACAGTGGAGCTTCGTCATTTGATTTCGATTTTTCTAAAAATATCAATGGTGGAGTCGATCTTTCTAATGGTGCTCACAAACTTAATCTGAAAGGGAGTGGCACACTTGATCTTTCTCATAAAGTCGATGTTTCTAATGATGGTCACAAAATTAAATTTAAAAAGAGTGGAACAATTGATGTTTCTAATGATGATCACAAATTTAATTTGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTGGTGAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTTCGAAGAAGAGTGGCACAGTTGATGTTTCTAACGAGGATCACAAAACTGATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACTTTTCTAATGATGATCACAACGCTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAACGTTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAACGTTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTTATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTCTAAGAAGGGTGCCTCAATTGATGTTTCTAACAAGGATCACAAAACTAATTCGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTGAAGAAGAGTGACTCAATTGATGTTTCTAACGAGGGTCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACTGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGACGTTTCTAATGATGACCACAAAATTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCTAACGAGGATCATAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCTCAATTAATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAACTGATGTTTCTCATAAAGTTGATGTTTCTGACGAGGATCACAAAACTGATTTGAAGAGTGGTGGTACAGTTGATGTTTCTCATGAAGTTGATGTTTCTAATGGTGATCATAAAATTAATTTGAAGAGTGGTGGCGATTCATTTGGTGTTTCTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGTGGCAGCGGCGGCGGCAGCGGCTCATTTGGTGTTTCTGGTGATGGAATTATGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTAGCGATTCATTCGGTGTTTCTGGTAATGGAATTATGAGTGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTAGCGGCTCATTCGGTGTTTCTGGTAATGGAATTATGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGAGGAGGTAGAGGAGGAGGAGGTGGTGGAGGTGGAGGTGGTAGCGGCTCATTCGGTGTTTCTGGTAATGGAATTATGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGCTCATTTGGTGTTTCTGGTGATGGAATTACGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGTGGCGGCTTATTTGGTGTTTTTGGTGATGGAATTATGAGTGGAAAGATTAGAGGTGGAGGTGGAGGCACCGTTGATGTTTCTAGTGAAGTTGATGTTTCTAAGGATGATCACAAAGTTAATTTGATGAAGGGTGGCACAATTGATGTTTCTAATGGTGATCACAAAATTAATTTGAAGGGTGGTGGCGGCTCATTTGGTGTTTCTCGTGATGGAATTATGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGAAGCTCAATTGGTGTTTCTGGCGATGGAATTATGAGTGGAAAGATCGGAGCTGGAGGTGGAGGTGATGGCACAATTGATGTTTCTAAGGATGATCACAAAGTTAACTCGAAGAGTGGTGACGGTTTATTTGGTATTTCTGGTGGTGGAAAGATGAGAAGTGGTGGCACACTTGACGTTTCTGGTAATGGAATGATGAGTGGAAAGTTGAGAGGTAGTGGCAGCATTGGACTAGGAAGCACAGGAAAAATTGGTTAATACCATATCAAAGTTAGCAATGACAATTAGCCAATGATGGGGAC

mRNA sequence

ATGTCCATTGCAATAGGTTCCAAGCTTTTCCACACTGTTCTCTTAATGTTGGCTTGGCAATATTGGGCCAAGGTGGACGCCACATTCAAAGATGTCACTGGCTTTTTTGATTTCAACCTTGGTTCATTTGGATCAGGTGGCGCTGGAATTATGGGGGGGACGAAAAATGGTGGCTCACCGGCCAACGCTCCAGAAATGGCACCAGGTATTGCTCCTGTTGGATTTGATACTCCAACAAATAATGAAGACAGTGGAGCTTCGTCATTTGATTTCGATTTTTCTAAAAATATCAATGGTGGAGTCGATCTTTCTAATGGTGCTCACAAACTTAATCTGAAAGGGAGTGGCACACTTGATCTTTCTCATAAAGTCGATGTTTCTAATGATGGTCACAAAATTAAATTTAAAAAGAGTGGAACAATTGATGTTTCTAATGATGATCACAAATTTAATTTGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTGGTGAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTTCGAAGAAGAGTGGCACAGTTGATGTTTCTAACGAGGATCACAAAACTGATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACTTTTCTAATGATGATCACAACGCTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAACGTTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAACGTTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTTATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTCTAAGAAGGGTGCCTCAATTGATGTTTCTAACAAGGATCACAAAACTAATTCGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTGAAGAAGAGTGACTCAATTGATGTTTCTAACGAGGGTCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACTGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGACGTTTCTAATGATGACCACAAAATTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCTAACGAGGATCATAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCTCAATTAATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAACTGATGTTTCTCATAAAGTTGATGTTTCTGACGAGGATCACAAAACTGATTTGAAGAGTGGTGGTACAGTTGATGTTTCTCATGAAGTTGATGTTTCTAATGGTGATCATAAAATTAATTTGAAGAGTGGTGGCGATTCATTTGGTGTTTCTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGCTCATTTGGTGTTTCTGGTGATGGAATTACGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGTGGCGGCTTATTTGGTGTTTTTGGTGATGGAATTATGAGTGGAAAGATTAGAGGTGGAGGTGGAGGCACCGTTGATGTTTCTAGTGAAGTTGATGTTTCTAAGGATGATCACAAAGTTAATTTGATGAAGGGTGGCACAATTGATGTTTCTAATGGTGATCACAAAATTAATTTGAAGGGTGGTGGCGGCTCATTTGGTGTTTCTCGTGATGGAATTATGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGAAGCTCAATTGGTGTTTCTGGCGATGGAATTATGAGTGGAAAGATCGGAGCTGGAGGTGGAGGTGATGGCACAATTGATGTTTCTAAGGATGATCACAAAGTTAACTCGAAGAGTGGTGACGGTTTATTTGGTATTTCTGGTGGTGGAAAGATGAGAAGTGGTGGCACACTTGACGTTTCTGGTAATGGAATGATGAGTGGAAAGTTGAGAGGTAGTGGCAGCATTGGACTAGGAAGCACAGGAAAAATTGGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCCATTGCAATAGGTTCCAAGCTTTTCCACACTGTTCTCTTAATGTTGGCTTGGCAATATTGGGCCAAGGTGGACGCCACATTCAAAGATGTCACTGGCTTTTTTGATTTCAACCTTGGTTCATTTGGATCAGGTGGCGCTGGAATTATGGGGGGGACGAAAAATGGTGGCTCACCGGCCAACGCTCCAGAAATGGCACCAGGTATTGCTCCTGTTGGATTTGATACTCCAACAAATAATGAAGACAGTGGAGCTTCGTCATTTGATTTCGATTTTTCTAAAAATATCAATGGTGGAGTCGATCTTTCTAATGGTGCTCACAAACTTAATCTGAAAGGGAGTGGCACACTTGATCTTTCTCATAAAGTCGATGTTTCTAATGATGGTCACAAAATTAAATTTAAAAAGAGTGGAACAATTGATGTTTCTAATGATGATCACAAATTTAATTTGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTGGTGAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTTCGAAGAAGAGTGGCACAGTTGATGTTTCTAACGAGGATCACAAAACTGATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACTTTTCTAATGATGATCACAACGCTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAACGTTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTCATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAACGTTAATTTTAATAAGGGTGGCTCAGTTGATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAGTTGATGTTTCTTATAAAGTTGACGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGAACAGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGACCACAAAGTTAATTATAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCATATGAGGATCACAAAACTAATTCGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTCTAAGAAGGGTGCCTCAATTGATGTTTCTAACAAGGATCACAAAACTAATTCGAATAGTGGTGGCACAATTGATGTTTCTCACAAAGTTGATGTTTCTAATGATGATCACAAAGTTAATTTGAAGAAGAGTGACTCAATTGATGTTTCTAACGAGGGTCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACTGTTGATGTTTCTCACAAAGTTGACGTTTCTAATGATGACCACAAAATTAATTTTAAGAAGGGTGGCTCAATTGATGTTTCTAACGAGGATCATAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCTCAATTAATGTTTCTTATGAGGATCACAAAACTAATTCGAAGAGTGGTGGCACAACTGATGTTTCTCATAAAGTTGATGTTTCTGACGAGGATCACAAAACTGATTTGAAGAGTGGTGGTACAGTTGATGTTTCTCATGAAGTTGATGTTTCTAATGGTGATCATAAAATTAATTTGAAGAGTGGTGGCGATTCATTTGGTGTTTCTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGCTCATTTGGTGTTTCTGGTGATGGAATTACGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGTGGCGGCTTATTTGGTGTTTTTGGTGATGGAATTATGAGTGGAAAGATTAGAGGTGGAGGTGGAGGCACCGTTGATGTTTCTAGTGAAGTTGATGTTTCTAAGGATGATCACAAAGTTAATTTGATGAAGGGTGGCACAATTGATGTTTCTAATGGTGATCACAAAATTAATTTGAAGGGTGGTGGCGGCTCATTTGGTGTTTCTCGTGATGGAATTATGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGAAGCTCAATTGGTGTTTCTGGCGATGGAATTATGAGTGGAAAGATCGGAGCTGGAGGTGGAGGTGATGGCACAATTGATGTTTCTAAGGATGATCACAAAGTTAACTCGAAGAGTGGTGACGGTTTATTTGGTATTTCTGGTGGTGGAAAGATGAGAAGTGGTGGCACACTTGACGTTTCTGGTAATGGAATGATGAGTGGAAAGTTGAGAGGTAGTGGCAGCATTGGACTAGGAAGCACAGGAAAAATTGGTTAA
Homology
[Close]
BLAST of CSPI07G17570 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K5G8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G398120 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 1.6e-218
Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 418/459 (91.07%), Query Frame = 1 

Query: 1   MSIAIGSKLFHTVLLMLAWQYWAKVDATFKDVTGFFDFNLGSFGSGGAGIMGGTKNGGSP 60
           MSIAIGSKLFHTVLLMLAWQY AKVDATFKDVTGFFDFNLGSFGSGGAGIMGGTKNGGSP
Sbjct: 1   MSIAIGSKLFHTVLLMLAWQYCAKVDATFKDVTGFFDFNLGSFGSGGAGIMGGTKNGGSP 60

Query: 61  ANAPEMAPGIAPVGFDTPTNNEDSGASSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDL 120
           ANAPEMAPGIAPVGFDTPTNNEDSGASSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDL
Sbjct: 61  ANAPEMAPGIAPVGFDTPTNNEDSGASSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDL 120

Query: 121 SHKVDVSNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKV-SKKSGT 180
           SHKVDVSNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKV SKKS T
Sbjct: 121 SHKVDVSNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKVNSKKSDT 180

Query: 181 VDVSNEDHKTDSKSGGTVDVSHKVDFSNDDHNANFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDV 240
           VDVSNEDHKTDSKSGGT DVSH+VD SNDDHN NFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDV
Sbjct: 181 VDVSNEDHKTDSKSGGTTDVSHEVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDV 240

Query: 241 SHKVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHNVNFNKGGS 300
           SHKVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDH VN  KG S
Sbjct: 241 SHKVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNSKKGAS 300

Query: 301 VDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSYKVDVSNDDHKVNFKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDV 360
           +D+S +DHKTNS SGG +DVS+KVDVSNDDHKVN KK  SIDVS E HKTNSKSGGTVDV
Sbjct: 301 IDISNKDHKTNSNSGGIIDVSHKVDVSNDDHKVNLKKSDSIDVSNEGHKTNSKSGGTVDV 360

Query: 361 SHKVDVSNDDHKVNFKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGGS 420
           SHKVDVSNDDHK+NFKKGGSIDVS EDHKTNSKSGGT DVSHKVDVS+            
Sbjct: 361 SHKVDVSNDDHKINFKKGGSIDVSNEDHKTNSKSGGTTDVSHKVDVSD------------ 420

Query: 421 IDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGG 459
                EDHKT+ KSGGTVDVSH+VDVSN DHK+N K GG
Sbjct: 421 -----EDHKTDLKSGGTVDVSHEVDVSNGDHKINLKSGG 442

[Close]
BLAST of CSPI07G17570 vs. NCBI nr
Match: gi|778730408|ref|XP_011659777.1| (PREDICTED: keratin, type I cytoskeletal 9-like [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 854.7 bits (2207), Expect = 2.4e-244
Identity = 506/620 (81.61%), Postives = 530/620 (85.48%), Query Frame = 1 

Query: 906  DHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDV 965
            D  TN++  G          S+ D   +    G +D+S   HK N K  GT+D+SHKVDV
Sbjct: 76   DTPTNNEDSGA---------SSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDLSHKVDV 135

Query: 966  SNDDHKVNYKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGGSIDVSYE 1025
            SND HK+ +KK G+IDVS +DHK N  SGGT+DVS +VDVSNDDHKVN KK  ++DVS E
Sbjct: 136  SNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKVNSKKSDTVDVSNE 195

Query: 1026 DHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDV 1085
            DHKT+SKSGGT DVSH+VDVSNDDH VN+ KGGS+DVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDV
Sbjct: 196  DHKTDSKSGGTTDVSHEVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDV 255

Query: 1086 SNDDHKVNYKKGGSIDVSYEDHKTNSNSGGTIDVSHKVDVSNDDHKVNSKKGASIDVSNK 1145
            SNDDH VN+ KGGS+DVSYEDHKTNS SGGT+DVSHKVDVSNDDHKVNSKKGASID+SNK
Sbjct: 256  SNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNSKKGASIDISNK 315

Query: 1146 DHKTNSNSGGTIDVSHKVDVSNDDHKVNLKKSDSIDVSNEGHKTNSKSGGTVDVSHKVDV 1205
            DHKTNSNSGG IDVSHKVDVSNDDHKVNLKKSDSIDVSNEGHKTNSKSGGTVDVSHKVDV
Sbjct: 316  DHKTNSNSGGIIDVSHKVDVSNDDHKVNLKKSDSIDVSNEGHKTNSKSGGTVDVSHKVDV 375

Query: 1206 SNDDHKINFKKGGSIDVSNEDHKTNSKSGGSINVSYEDHKTNSKSGGTTDVSHKVDVSDE 1265
            SNDDHKINFKKGGSIDVSN                 EDHKTNSKSGGTTDVSHKVDVSDE
Sbjct: 376  SNDDHKINFKKGGSIDVSN-----------------EDHKTNSKSGGTTDVSHKVDVSDE 435

Query: 1266 DHKTDLKSGGTVDVSHEVDVSNGDHKINLKSGGDSFGVSGGGGGGGGGG-GGGGGSFGVS 1325
            DHKTDLKSGGTVDVSHEVDVSNGDHKINLKSGGDSFGVSGGGGGGGGGG GG  GSFGVS
Sbjct: 436  DHKTDLKSGGTVDVSHEVDVSNGDHKINLKSGGDSFGVSGGGGGGGGGGSGGSSGSFGVS 495

Query: 1326 GDGITSGGGGGGGGGGGGGSGSGSGSGGGLFGVFGDGIMSGKIR--GGGGGTVDVSSEVD 1385
                         GGGGGG GSGSGSGGGLFGVFGDGIMSGKIR  GGGGGTVDVSSEVD
Sbjct: 496  -------------GGGGGGGGSGSGSGGGLFGVFGDGIMSGKIRGGGGGGGTVDVSSEVD 555

Query: 1386 VSKDDHKVNLMKGGTIDVSNGDHKINLKGGGGSFGVSRDGIMSGGGGGGGGGGGGGSSIG 1445
            VSKDDHKVNLMKGGTIDVSNGDHKINLKGGGGSFGVSRDGIMS    GGGGGGGGGSSIG
Sbjct: 556  VSKDDHKVNLMKGGTIDVSNGDHKINLKGGGGSFGVSRDGIMS----GGGGGGGGGSSIG 615

Query: 1446 VSGDGIMSGKIGAGGGGDGTIDVSKDDHKVNSKSGDGLFGISGGGKMRSGGTLDVSGNGM 1505
            VSGDGIMSGKIGAGGGGD TIDVSKDDHKVNSKSGDGLFGISGGGKMRSGGTLDVSGNGM
Sbjct: 616  VSGDGIMSGKIGAGGGGDDTIDVSKDDHKVNSKSGDGLFGISGGGKMRSGGTLDVSGNGM 652

Query: 1506 MSGKLRGSGSIGLGSTGKIG 1523
            MSGKLRGSGSIGLGSTGKIG
Sbjct: 676  MSGKLRGSGSIGLGSTGKIG 652

[Close]
BLAST of CSPI07G17570 vs. NCBI nr
Match: gi|700189717|gb|KGN44950.1| (hypothetical protein Csa_7G398120 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 2.2e-218
Identity = 407/459 (88.67%), Postives = 418/459 (91.07%), Query Frame = 1 

Query: 1   MSIAIGSKLFHTVLLMLAWQYWAKVDATFKDVTGFFDFNLGSFGSGGAGIMGGTKNGGSP 60
           MSIAIGSKLFHTVLLMLAWQY AKVDATFKDVTGFFDFNLGSFGSGGAGIMGGTKNGGSP
Sbjct: 1   MSIAIGSKLFHTVLLMLAWQYCAKVDATFKDVTGFFDFNLGSFGSGGAGIMGGTKNGGSP 60

Query: 61  ANAPEMAPGIAPVGFDTPTNNEDSGASSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDL 120
           ANAPEMAPGIAPVGFDTPTNNEDSGASSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDL
Sbjct: 61  ANAPEMAPGIAPVGFDTPTNNEDSGASSFDFDFSKNINGGVDLSNGAHKLNLKGSGTLDL 120

Query: 121 SHKVDVSNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKV-SKKSGT 180
           SHKVDVSNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKV SKKS T
Sbjct: 121 SHKVDVSNDGHKIKFKKSGTIDVSNDDHKFNLNSGGTIDVSGEVDVSNDDHKVNSKKSDT 180

Query: 181 VDVSNEDHKTDSKSGGTVDVSHKVDFSNDDHNANFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDV 240
           VDVSNEDHKTDSKSGGT DVSH+VD SNDDHN NFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDV
Sbjct: 181 VDVSNEDHKTDSKSGGTTDVSHEVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDV 240

Query: 241 SHKVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHNVNFNKGGS 300
           SHKVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDH VN  KG S
Sbjct: 241 SHKVDVSNDDHNVNFNKGGSVDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNSKKGAS 300

Query: 301 VDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSYKVDVSNDDHKVNFKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDV 360
           +D+S +DHKTNS SGG +DVS+KVDVSNDDHKVN KK  SIDVS E HKTNSKSGGTVDV
Sbjct: 301 IDISNKDHKTNSNSGGIIDVSHKVDVSNDDHKVNLKKSDSIDVSNEGHKTNSKSGGTVDV 360

Query: 361 SHKVDVSNDDHKVNFKKGGSIDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGGS 420
           SHKVDVSNDDHK+NFKKGGSIDVS EDHKTNSKSGGT DVSHKVDVS+            
Sbjct: 361 SHKVDVSNDDHKINFKKGGSIDVSNEDHKTNSKSGGTTDVSHKVDVSD------------ 420

Query: 421 IDVSYEDHKTNSKSGGTVDVSHKVDVSNDDHKVNYKKGG 459
                EDHKT+ KSGGTVDVSH+VDVSN DHK+N K GG
Sbjct: 421 -----EDHKTDLKSGGTVDVSHEVDVSNGDHKINLKSGG 442

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CSPI07G17570 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CSPI07G17570 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K5G8_CUCSA1.6e-21888.67Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G398120 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CSPI07G17570 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CSPI07G17570 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|778730408|ref|XP_011659777.1|2.4e-24481.61PREDICTED: keratin, type I cytoskeletal 9-like [Cucumis sativus][more]
gi|700189717|gb|KGN44950.1|2.2e-21888.67hypothetical protein Csa_7G398120 [Cucumis sativus][more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005882 intermediate filament
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0005198 structural molecule activity
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CSPI07G17570.1CSPI07G17570.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CSPI07G17570Cla015089Watermelon (97103) v1cpiwmB578
CSPI07G17570Cla015076Watermelon (97103) v1cpiwmB587
CSPI07G17570Csa7G398120Cucumber (Chinese Long) v2cpicuB354
CSPI07G17570MELO3C015992Melon (DHL92) v3.5.1cpimeB540
CSPI07G17570ClCG09G005790Watermelon (Charleston Gray)cpiwcgB555
CSPI07G17570MELO3C015992.2Melon (DHL92) v3.6.1cpimedB525
CSPI07G17570CsaV3_7G029360Cucumber (Chinese Long) v3cpicucB414
CSPI07G17570Cla97C09G168160Watermelon (97103) v2cpiwmbB590
CSPI07G17570Cla97C09G168280Watermelon (97103) v2cpiwmbB598
CSPI07G17570Bhi09G000726Wax gourdcpiwgoB703
CSPI07G17570CsGy7G016010Cucumber (Gy14) v2cgybcpiB331
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CSPI07G17570Cucumber (Gy14) v1cgycpiB106
CSPI07G17570Cucumber (Gy14) v1cgycpiB325
CSPI07G17570Cucurbita maxima (Rimu)cmacpiB392
CSPI07G17570Cucurbita moschata (Rifu)cmocpiB381
CSPI07G17570Cucurbita moschata (Rifu)cmocpiB913
CSPI07G17570Cucumber (Chinese Long) v2cpicuB345
CSPI07G17570Melon (DHL92) v3.5.1cpimeB572
CSPI07G17570Watermelon (Charleston Gray)cpiwcgB547
CSPI07G17570Watermelon (Charleston Gray)cpiwcgB560
CSPI07G17570Watermelon (97103) v1cpiwmB593
CSPI07G17570Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpiB163
CSPI07G17570Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpiB344
CSPI07G17570Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpilsiB517
CSPI07G17570Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpilsiB530
CSPI07G17570Melon (DHL92) v3.6.1cpimedB557
CSPI07G17570Silver-seed gourdcarcpiB0124
CSPI07G17570Silver-seed gourdcarcpiB0599
CSPI07G17570Silver-seed gourdcarcpiB0855
CSPI07G17570Cucumber (Chinese Long) v3cpicucB402
CSPI07G17570Watermelon (97103) v2cpiwmbB541
CSPI07G17570Watermelon (97103) v2cpiwmbB564
CSPI07G17570Wax gourdcpiwgoB658
CSPI07G17570Wax gourdcpiwgoB666
CSPI07G17570Cucurbita maxima (Rimu)cmacpiB934
CSPI07G17570Wild cucumber (PI 183967)cpicpiB167