Bhi08G000091 (gene) Wax gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCTACTAAGAGATTAGCTCAACTTGATAAAGTGGCTGAACGTTTATCTCACCATGTAATGGAGCATCATGAAGTGATGGGTACGGCTTTCTTTTTCCTTTTGCTCCCTAGTTCCCTTCTCCAAGGGGCGTAGTTTTGGTCTTGTTCTTTTTATATGGGCTGGTTGGAGGGTTGATGGTTCTATTTTGTTATTGAAGCTGCTTCTCTCGCATCATTCTTTAATTTAGGCTTCTCTATATGAAGTAGAGTACAGTGAAAAAATTAATGTTTAAGCATATTCATTTGGTAGTTCAGCCTTTTCTTGGTTGGATTTGGGTGTATCTGTTTAGTTTGATTTAAAAGGGGAAAAAAGGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTAAATTAATATTTCCTATTCTCTCCTCTATTACAAAGTTAATTTTGCATCTGTGCTGTATTTTCCTTTATTTGTTAACTTTTGTTCTTGCATGTTTGTGAGGCACAGTTCTAGGGATCTTTTTATATTTCTTGATAAGAAACGTGAAATAGACTATGCACAGAAGGCCAAAAATTTAGCTTAAAAGGCTAGGGGTAAAGAACTAGTTCATTGATAGATTGTTCTATTCAAAATTTGTTTTTTTTGGATCGCTTTTATTTTCCCATTATTCTTTTTTTTTTTTCAAATTTCATTGATAGATGAAATAAAGGAGTGAAACTCCAAACGTTCGATAGGTAAATTACACAAATGGTCTCCAATTGGACATTAAAAAAGAAGAGCCATAAAGAGTAAAAGGATGCTTATTCTTGCACCAGAAAAAGCAGTAAAGTGTAGGAAACCTTCCTAAAGAGACTACCATTCCTAGCATACCAAAGAGTCTAGAAAAAAGCACGACTGAAATTGAAAGCAAACTAAAGGACCTCTTTTCTGCCACAAAAAGGATGACCCACCAAAACTGAAAGGAGTTGTTGGGAAAAGATAATGACCAATGAAAAGTCCCCAACATGGTAGCTGAAAAACGATAACTATAAGCAAACAAACAATGCATGAAAAGATCGCATGAAGCATGAAGTTGCCACATCAGATACACACATAATACACCAAGAATGCACCAAGGAGGTAAAGCCATATAAAACATTTGCCTTTGTAATCAATCAACTCTATTAATAGCCCCAAGGCTGAACTCCCAAAGAAGAAAGGATACTTATCCTTCCAAATGTATTATAAAGGTCCTTTGAAAGAGGATCAGTAGTACCCACCAAATCTTCCATGAGGGATTTAATGGTATAAGATCCTAAAGATGCAAGTGGCCAAGTCCAAATTTCAGGAAAATTTTGGAGCTGAACAATGGACAGAAGATGGGCAAGAGTTGCCCATTCAATCATCTCTCTATCATTAAGATTCGCGTGAATAGAAAACATTCTCAAGAATGCCACAACTTAACCAATAGTCCTTCCAGAACAAAGTAGAATGACTATTGCTAAGCCTACAATGGGTACGACTAGCAATCAAATCCACTTTGGGGGATTTATAGGAACCAGACATAATGAGGCAAGACCACCTAACCAGAGTATTTAGTGTCAATGAGTTTCCTCCATAATGTTTGAGGCTCCTGAAGATAGCGTCAAGTCCATTTGGTCACTAAAGCCAAGTTTTGATGCTGAAAATTATCAATACCAAGGCCACCCTTCAATTTCAAAGGTGAGTAGTTCCAATTAACATTATGCATACTTTCATCCCTATGAGATCTTTCCAACTATAATTTCTTTGTATTGCCAATATGTTATTTTTCATTTTTTCCCTGCGATGATTGTAGTTTTGAGCATTAGTCTCGTTTCATTAGTTTAAGTAAAAAAGAGTCTAGATAAGCAAAGTACTACCCAAGATTTTCTTTCTTGATCATTTTGTGCCTATTTTTTTTATTTTATGATCTTGAGCATTAGTCTTGTTTCATTAGTTCCACCCCTACGAGTCACCCCATGCTCCTTTGCTCTTCCATTCGAGTTTTCTTTGCCATCTTTTCTAACTTGCCTGCTTTTGGCTTTCTTTTCCTCCATCTCGTCTTGCTTCCCACCGTCTTTCATTGCTTCTCATCTCCTTTTGACCTTTCACCCACTCGTGATCTTTTAGAATTATGCTTTTTCCGTTAGCATGCCACATCCTCTCGACCCGTACCCTTTGTTTTTCTCGTTTGTGTTAAGTCACCTCAGCAGTTTGCTCTTCATCAGCCCTTACCTTCTTTTGTTTGCTATTTCGTCTGGTTGTCAACCATCAGCTCACTTCTCCATCTATTAGCAAGTTTACTGTCAGTCAGTACAAGGTTTTCACTGTCCGTTATCTTGTTTTGTTCTCATTTTTAATGGATCATAGTAGTGTTGTATCGGCGCGAGTTATTATTTAAAAAGATTAAAAGATTAATGCAAGTGTTGTACCAGCTCACTTCTCCATCTATTAGGAAGTGAAACATAATTACTTTTATTTTGTTGAAGATATAGATTTTAAGTCCCTCATCCCTCTTTCATTTTCTCATCTGTGATGGTTTGAGAAATTCTGGGTTGAAATGATGCTTTGCCCCATGTCTCAAATTTCTTCCAAGCAAGATGAGGATGAGTTTGGAACTACCAGAATTCAAAAACTTCGGTTTTCTTCAAGATTGATTACTGGTTGTATTTTGTGGCCAAACTCCAGTGTTTGGAAAATGATTACTATCCCTTGTGATGTTTTTGAAGTGTGGTTAACTCACTTCTTGGAATATGTTGAGAGATTTTATCTTGAAATTTGAGAAGCTAATGGCTTGAAAGATCAGTGTATGGCTCAACCTTTGAAGCGCAGTCCTAATCCTATTCGGATATTGTGAAATCTTTTATCCAACCTTCTCCTCCTCTACTAGATTGCTTTTCATCCTTTGCAAATTTGTTTTGTCCAAATGTCTCCATCGCCGAATCCTCTTACTGGGTAAAAGAAAAAATGGTCGTTTTGATTGGAATACTTTGTTTGTAGTTTCTCATTTGAATGCTCATGATGATTGGAAGGATATCTGGAGGGCCACTGAAACCCATATGGAAATCAATTTTTCGATTAATCCTTTTGTGGATTCTAAAGTTTTACTTCAAATGGAAGATTCTAATCTTTTAGATGGTTTTGGTCCAATAGATAAATGGTTAAATGTTGGTCCTTTCCATTTGAAGCATGAAAGTTGAGACTTTAGCAAGTACAATAATCTAGCATTCATCAAAGTTTATAGGGCTTGGATTACAACAATCTAGAAGCCATCCTTGAGTTCTGCCATCCCAAACCTTTACTGGACATCCAGGGATATAAATATAACCGTGGCCTCCGTTTGGGACAACACTTCAAGGTCTTGGTATCTTTCCTTTAGGAGGAATTTGAAAGAAGAGAAAATTGGAGAATAGGGCTGTTTTCTTGGGAACCAACTTAACTTATGACAGTGGCCTCTAAGACTTCATTTCTTGTAAGTCTCTCTGACATTTCTAGGCTACAAATAATCTCTTCGTCCATCATGATTATCAAAGCTGTCTGGAAAGATAAATACCTAAGAGAGTTAAGGGCCTGTTTAACAAGGGATTCAAAGAAAATAGAATTGTATTTCATGTTTTTAGATATGTGTTTGGTAGCAGATTCAGAAATTAAATTCCAATTTTAAATAAATTTTTCAACATGTGTTTGAAAATATATTTAGTTAGTCACTATATACTAGGTTGAATATAAACCATTACTAATTAATTTATGAACTTGTTTTATGTTAAAATATTTGTATAATTATTATTTTCTAATATCATATAATATATAATATGTAATATATTACATATTTTAATTTAACAAAAATAATTGAGTTTATAACATGAAATAATATATTTGTTATTGTTTTTTTTATTTATCATTTTTAATATAATTTTGCATTTTAAAATCTTGAATTCAAAATCTGTATACACTAAAAACATAAAAAAATTGTTTTCATAATTTGCACTGCTTGGATCATGGAATTCGGAAACAGTTTCCGAAAACAAAATTTTATCAACCAAACACATTTTCCCTGAACTTAGTGAATCTGAAAACATAAAACAAAATTTGAGTTGCCTACCAAACAAGCCCTAAAATATTTCGGTGGGAGGTGATCATGGGCAAGATAAACAACCACTACGAAACTATATGTAAAAAAGAAGCCTTTCTACTGCTCTTTCTCCTAATATGTGCAGCTTAGACTATCACTTTCCCTCTGTATTCTGGGATTGTACTACGTAGTTTTTTGATTGGAATTGCCTCCACTGTTGGTTGTTCACCCCTTTAATGGCAATCTAAATACTGTAGTTGAACTTGATCGAAAGTTTCCATTGGATAACTTGCTTTGAAAGGAACGACAGAAATTTCAATGGGAAGGAGAGGAGCTATACTTAACCTTTTTTCTTACCTAATTTTGTATATAGCACCCACGTGGTGCAAGCTAGAGAGTGTCTTTTTTGTAATTACTCCATCAGTAAGATCTTTGCTCATTGGAAGGGATTTGTGTAACCTCCATAAGCTTTTTGTATATTTCATCACATTAATCAAACAAGTTTCTCTTCAAAGAAAAATTGAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGTAATAAGATAACAAATAAAAAATCTCTTTGAAGTAAAATGGCAATGTGAATATTGTTCAGGATACCGTTGTGAATTTTCTAATAGCTTTCTACTGCACCTTGATGAACGTCCTTTAATTTTAGTATTGGTCTCCAATGGATGTTGTACACTTTTTGTTATTTGTGGTGGTGGTTCCAAATCGCTGTTTAATGCTGGAAGCCTGTTCTCTCGTTTTCTTGATTATCTTAAGGGCTATCTAGATTGCAAAAGGCTTAATTTTGGAATTGAATGCTAGTTAAATGAGATGTCGGTTTTTTACTTTTGATCAGTGAAGGGGATGCATTTGGTCAGGGAGTTGGAAAAAGACTTGAAAATTGCGAATGTCATCTGCAGGGTAAATCAAAGTCTTATTTATTAT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BLAST of Bhi08G000091 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Bhi08G000091 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8CI71|VPS50_MOUSE (Syndetin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vps50 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 248.1 bits (632), Expect = 4.0e-64 Identity = 241/954 (25.26%), Postives = 411/954 (43.08%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q5ZKV9|VPS50_CHICK (Syndetin OS=Gallus gallus OX=9031 GN=VPS50 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 246.1 bits (627), Expect = 1.5e-63 Identity = 243/959 (25.34%), Postives = 420/959 (43.80%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. Swiss-Prot
Match: sp|F1LSG8|VPS50_RAT (Syndetin OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Vps50 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 240.4 bits (612), Expect = 8.3e-62 Identity = 235/950 (24.74%), Postives = 404/950 (42.53%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. TAIR10
Match: AT2G27900.1 (Protein of unknown function DUF2451, C-terminal (InterPro:IPR019514), Vacuolar protein sorting-associated protein 54 (InterPro:IPR019515)) HSP 1 Score: 1176.4 bits (3042), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/956 (65.17%), Postives = 750/956 (78.45%), Query Frame = 0
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BLAST of Bhi08G000091 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4FQ37|A0A2I4FQ37_9ROSI (syndetin isoform X2 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109001080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1322.0 bits (3420), Expect = 0.0e+00 Identity = 696/974 (71.46%), Postives = 804/974 (82.55%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4FQ35|A0A2I4FQ35_9ROSI (syndetin isoform X1 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109001080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1314.3 bits (3400), Expect = 0.0e+00 Identity = 696/983 (70.80%), Postives = 804/983 (81.79%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. TrEMBL
Match: tr|M5WA79|M5WA79_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G114700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1312.4 bits (3395), Expect = 0.0e+00 Identity = 688/969 (71.00%), Postives = 796/969 (82.15%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4GMC8|A0A2P4GMC8_QUESU (Isoform 3 of syndetin OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_25318 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1301.6 bits (3367), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/974 (69.92%), Postives = 792/974 (81.31%), Query Frame = 0
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Match: XP_008462106.1 (PREDICTED: syndetin [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1706.0 bits (4417), Expect = 0.0e+00 Identity = 884/937 (94.34%), Postives = 904/937 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. NCBI nr
Match: XP_011654226.1 (PREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 132 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1705.3 bits (4415), Expect = 0.0e+00 Identity = 880/937 (93.92%), Postives = 900/937 (96.05%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. NCBI nr
Match: XP_011654229.1 (PREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 132 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1705.3 bits (4415), Expect = 0.0e+00 Identity = 880/937 (93.92%), Postives = 900/937 (96.05%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. NCBI nr
Match: XP_022970284.1 (syndetin-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1634.8 bits (4232), Expect = 0.0e+00 Identity = 845/937 (90.18%), Postives = 880/937 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi08G000091 vs. NCBI nr
Match: XP_022152900.1 (syndetin isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1625.9 bits (4209), Expect = 0.0e+00 Identity = 842/937 (89.86%), Postives = 883/937 (94.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of wax gourd
Date Performed: 2019-11-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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