Carg01958 (gene) Silver-seed gourd

NameCarg01958
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma (Silver-seed gourd)
DescriptionUnknown protein
LocationCucurbita_argyrosperma_scaffold_003 : 1370809 .. 1375888 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
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ATGAGAAGTGCGATGATTTTTCGTTCGAAGTTTTTGGTTGCTCGAGATGCTGTAAGTAAACGACGTTCCACTTCCAGTGATTTTCCTTTCACTAAACGATATTGTTTCTTGTTAGGTCTTGTAAATACGAAGTTCTTTACGATTTTGTTTAGTCGAAGAGGAATCCAAATCGTTTTATTATTGAACTAGTAACCGTGATTTCTCACTCTCGTAATCCTTGATATGAAAAGTTTTGTTCGTCGATCGGATTAGATTCGGTATTTTAATTGATCGATTTATCTCTTATGATGTGTACGGTCCGATGTCTCAATACTTAATATCTTAGATTTTGCCATTTCGAACTAGCTGCGGCAGTGCTGGTTATCGTGAGTTCAAATTAGACTCCCTGTGAACATATTGTTTCTTCAATCAATAGTCGTGATTGTAGTCTTATGAATCTTAATTGCTTTACGATTTTTATTAGTCGGAGAGGATACCGAATTGTTTATTTAACCAGCGATCGTTATTACTCAGTGTCGTAACTCTGATGATAAAAAGTTTTGTTGTTCGTCGATCAAATTAACTTAGGTGTGTTAGTTGATTGATCTGAATCATATATCGATTTGTCTCTTGTGCACGATTCCGATGATTCTCTCGATATAAGTTATCTTATGTTTTGAATAAATCGCTGTAGTCCTTGTTCTTCTGAGTTTAAATTAAAAATTATTCCTCGACGAGCGTTCAGATATTTATTTTTTATCTCAGAATTTTGAAGACGATTTGGCGTCGGGAGTGATTACGTGGATGCGTGTTTTGAATTGCTACCAGAAGGTCCGGAACATATTTATTGGTACGTATTTTGATGATTTTACACCGTGATACTCTTATAATCTTTTATAAAGTTCAAATCGTGAAGCAAGTACTTCGAAAACCTAGCAAACTTCTCTGAACTTTTTTCTTGCTAATTTATTTCTTTTTTGTGCATTAGAACTGTGATACTTTTCGATTTGTTGAATATTATGTCGTAGAAGCTTGCACTGATTCATTAGATTTCGTTCATTCGAGGCTTGAGTTGTGTTTCTTTTTAGAAAAGGAAAAGATAAGAGTTACTTCTGCCTATCAGCATTGTGATCTGAGTCTCGGTTTTATTCATTTAGGAGCTCTCTGGTTGTAATATTATCTCAAATATTTGGTATAAAACAACTTACCTAAAATAAGTTTTTTAAGCATGCTATTTCTCTTATTAACTTCTTAGTCATTATTTTTCAATAGTTCACGTCTAACCGTCTTCCAGTAGTCTTAATTTATTGTACATAATTATATTATCTGAAATATCTTATACAAAACAATTTTCCTGCTTCTCGTTAGTCCTAATTGCTTCTAGGCTTCAACTCCCAAAAAAAATTATTGTTGGTTTAAATATTCTCTTCCTTCGACGTTCGACATGTTATTGTTTCTTAATAGTCTTAATTTCCTTTAGGTTTATGTTGCTTTTTTGATGTTTTTCGTCATATATAGAATGGCTTTTTTTCGTTATTTATTATTAATGTACTCTGTTCAATCTATACACTATGATACTTATGGAACAATTTAAGTTGCTTAAAATACCATCCTGAGTAAATCATATGCCAGTTAAGGATACAAAATCAGAAAATTCCAGTTATCAATCAGCCTTCTTTTGATTATGACTTTATTGCTCCCCGTGCTTATCCTAAGTTCCTGACACTTCAATAAATAAATAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAACTGAATTGAAGTTGAGAAAAAAAAAAAAAAAATTCCAAGAGCTTTAGTGAAGGGAACAATGAAAGATCTTGGGAAGTCTCAAAACTGCGACATCCTAAAACTTCTCAATTTTCTGGATTTATCATTGAGTGTTCTTTGGTTTCTTTTCCATCAAAATTAGCACTTAACCGTACAAACTACAGTACCCTTATGCTTGAGAGGGTTGCCAACCAAAGGTAGCTCCAAACATTTTCGGATTAAGAGAGTGAGGCAAAATAGTGATGCGACCAAGGATTCTGGTTTGGAGTATTTAACTTTCTTGTTATTAGTAATCTCTTCTACCTTCTCTTGAATTAAGTTAGATTAGAGAGATTGTTACAGTGGCAGACAAGTTTATTCACTTTCCATCCTAGGTGGGTCGTCAAAATACTCATTTCAAGCAGATGTGCTAATTGAAAATAAAAAATGTTGTGTAAATTTTATCTTTTTTTTTTTTTTTGCACAATTAGATCGAGATAAGAAAGTCCTCCAAGAATTAGTGTTGGAATCCCCATAATCTTTAATCAAAACAATTGAAGAGTTGAAAATTTTGATGGAACAAACTTTTAAGGGATTTGAACTAAAAACTCACTTTTTCCTTATCCTTAGTTCTAAAGAAGAGATCCTCGTTTATTTTCATACAGATGAGAGAACTTGTAGATATCAAGTCTTCTGATCATTTTGGTTGATATATATTTTTCTGAGGAAATTATGATTGATATATTTTATATATTGTCTAGAGGGGAAATATGTATCTCGGTCTTGCGCTATATAATATATATTTTTTTTTATTGAGAATATCCCACTCACATCTTCTCACATGTACAACACTTAAGAAATAGGTTGCATGTACAGTGTCATCGAAACCAAATAATATTCATATAACGCAAGACAATTTAGGTAACTCTTAACTTAAGTTTTGTGCATTCTCTAATAAACATATTTGACCGTCTAAGTGATCCGAAGCACTTCCTAGTTCCTATTCAGATGTTTGTGTTTGGTTACTATTTTAAAACATTTTTCAATGAAGTAAGAACACTATTTTCAAAAAAAGAAATTAGTTCATGTCTTTTTTTCTTTTTTTTGTTCAACACTTTCTTTGTCAAACTTTCGTTCACTAATTCTTCTCTTTCTAATGTCTTTTTTGACAGTTTTTTCTCGTTAATTTCTCTTTTCGCACCATTTCTTTCTCCCGCTTCTCTCCCATTTTATCTCACTAATTTTCGTGACACTACCTTCCTTCTCGAATTTACTCTCTTCACACACACTTGTTTGTACTAGTCTCTCTACAGTAACGAGTCTCTTGTTAATATCTCTCTGCCAGTATTCTCATTTGTTTCATTTTTGTGATTTAGTTTTAATAATTTTAACATATTTGATTGTGGTGATATGTGAATTCTAGAAACTAGAAGCATCTATAGTCTGTATTTTACAAAGTACTTGTAGATGACTAAAAGTATGTTGCGAAGACTTAGTATTTGGTTAAAGTTTTTAGAGTGATTGTACCTATTAGGAGTGTCTTTTAACAACCTTGATTATCAAATGTGGTTTGAGAATTCTAAAATAGATAGAAATCTCTTTAGATGAATCATTTAACTAATCTTTAAAAAGTTAGTATGATGAATACTTGTTTTATACGCTTCTATACTTGCATTTTACATGTCCGAAGTACTCCATCAACTTATGGTCATCAAGGGTGTAACTGATTTGGTTCGGTTTGGGTGTCTAATTGAAGCCATAAATGTTATGGTCAAATATATATTTAGAAGTTGAAATTGCTGAACTGCTTTTGTGAGTTTAGAACATGCATCAAATGATTCAAATTCAATTTGGTTAAAAAAAATTCAAATTCAATTTTGACATGGATATGACAAAAATGATTTTAACCATTTTTAAATTTGCATGATGAATTTGATAAAATTCCTGGTTACTTTGACCATGAAAGATTGATCAAAAGGGCTGTGTACACATTTCTTGTTCCTAGTAATATAGGTTTGCGAGTCATGAGCGAAACTTAAACGTTGTTAATAAAACATTGAGACTAAAAGCTTCTGCATGTTGCTTTATTGTGTGCATACTTTTCGATAGTTTACATCTTGCACTATATTTTAGGAATGAGTTCGAACCAATATGCAACTGGACTTCGCGTTGATGTTGAATTTGAGGCATAAAGCTTTGAAGCGAAGTAATTGCAACTGCAACATGTCGCAGAGGTTTGTTCCTCTACCAACGCTTTTCTTTCTTTTTCTCTTTCTTGCACATCTACAAAGTCAGAAAATTCTCAAAATTATTCATATTAATAGAACAAGAATTCTAAACAAAAAGATCAATAATCTTAGCAACAATTTGGTGATAGCATTTCAGAAAGCTCGTAATGAGATAATTTCAAATTTCTTGCTCAAAACAATTAAGGTAAATATGATGTGTTCCCCTTATGTTTATACAACTATTTGGCAGAAATTTTTTCTTAATAAAAGGGCTACACGGTTCAGTTTAGTACTAGGCTTTATACAATCTTTTGTTCCGACCATTTAACACGATTATACGGCATAAGCGTTCATATGTAATCTTTAACTTTCAAGTGGGAGGGTGCTATATAGGATTTCTATTTTTTTTCTAAAAAAATAATTAAATAAAATAGAAAATTTTAATTTACAAATGTATTTCTTTCATTACAAAGTACTTGAAGTTTAGGAAATATTTTTAGAATTGGAGATAAACTTAAAAGAGAATGATGCAACAAAAATTGAAAGATGAGTTAAGAAGATTTCCTAGATTTAAATACTAGAACAATATTAAATAAGAATTTAGATTTAAAAGTTCAAGTAGAAATAAGTAATCAAGGGAGAGAGATTTTAATAGAAATAAGTAATCAAGGGAGAGAGATTTTAAACGTTTGAGAGAAAACTTATAAAGAGCAATATAAAAAACAAGTAGAAGTAATCCAGGAGAGAGAAGAATTAGATTGAAAGCAAACGTGACTTTTAGCCTAATTTTAGGATAGGACAAGATAGAGTGAAAGGGTTTCTTATGAATTATTCATTAACTCTGTAGTGAAACCTATTTCCTTCGACCTAACCATAAAACACGAGAATTAGACGTCCATTTTTTTTTATTTCCATTTATACTTCATATCAATTAATGTTATTGATGTCTTTATGTATATGGGTAGATGTCTAAGAACCGACGCTGACATAATCTCCTCTTGCAGTATGACCTAGTGTTATCAACTACGACGATTAGAAGTTCAAGTTTGAATTTCTGGGAATACTAGATCAGCGGAAAGGGAGAGCACGCAC

mRNA sequence

ATGAGAAGTGCGATGATTTTTCGTTCGAAGTTTTTGGTTGCTCGAGATGCTAATTTTGAAGACGATTTGGCGTCGGGAGTGATTACGTGGATGCGTGTTTTGAATTGCTACCAGAAGGTCCGGAACATATTTATTGGAATGAGTTCGAACCAATATGCAACTGGACTTCGCGTTGATGTTGAATTTGAGGCATAAAGCTTTGAAGCGAAGTAATTGCAACTGCAACATGTCGCAGAGTATGACCTAGTGTTATCAACTACGACGATTAGAAGTTCAAGTTTGAATTTCTGGGAATACTAGATCAGCGGAAAGGGAGAGCACGCAC

Coding sequence (CDS)

ATGAGAAGTGCGATGATTTTTCGTTCGAAGTTTTTGGTTGCTCGAGATGCTAATTTTGAAGACGATTTGGCGTCGGGAGTGATTACGTGGATGCGTGTTTTGAATTGCTACCAGAAGGTCCGGAACATATTTATTGGAATGAGTTCGAACCAATATGCAACTGGACTTCGCGTTGATGTTGAATTTGAGGCATAA

Protein sequence

MRSAMIFRSKFLVARDANFEDDLASGVITWMRVLNCYQKVRNIFIGMSSNQYATGLRVDVEFEA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Carg01958-RACarg01958-RAmRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
Carg01958Cp4.1LG01g14860Cucurbita pepo (Zucchini)carcpeB1177
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None