CsaV3_2G010100.1 (mRNA) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGCTTGAATTTCAATACTCAAATTTCGGATTCAGAATGCAACAATCAAACTGGATTTCAAAATCCTCATATTGTATGGAGATCAAGTTAATGTGAAGAGCCACCACTAAGCCATTTCATTTTTGTTATGGGGTTATTCATTAACTATTTCTAATTTATTATTATTATTATTTAAAAATTGAGCTTATTTTCTTTTATTTTAGAAGAGTTGCATTTTTAACCCATTCGAAAAACAAAAACAAAATTTTTAAGGTTACGTGTTTCGTGTTTTTTGAAATAGAAAAAAATAAATAAAAATATTTACAAATATAGTAAAATATCATAATTTATTTGTGATAGAGATTGTGATACATTACTATTTCTATCTATCACGACAAAGATATGCATAGATAATAGTCTATCGTGATCTATTGGTGATAAACGGAGATATTTTGCTATATCTATAAATATTTTTAGTAATTTTGTCATTCAAAATAACTTCCTTTTTTCCTTTCAAATTTTGACTTGATTTTTTAAAACACAGGTAAAAAAGTAAATCTCCAAATTAAAACACACGATAAGGGAATATGACAGTGAACACTTAACCAATTATCATGTGACGAGCTAGGAGAGGAGGAGTCTAGTTAATTAGCTAAACATAGATTAAGTTTGATTTAAGTTAAGCATAGTTTAAGAAGGATACTAAACTAACACAAGTAACACACTATGTAGGAGTTGTCGAGCTTAGGAGAAGTGTAATGCTGACTAACCTAATTTGGGGAGAGTATAAATAGGTCTGAAGATAGATTAATTCTAGTGTTTAGATTAGAGGAAGGTCTGTTAGAGGAGTAAAGATGAAGTTCATTGTAGGACTAGATGATAAGAAGGAATTAAAAGAGTTCGACGATAAGAAGGAGAGAAAGGAAAAAAGAAAAGCTTAGCTGAGTGAATGACCCCTTCAAAAGTTGAAATTTTTTTTATCACCAAAGTCATGTTGTTAAATATGCTCATGTTGTAATCTCATATAGACATATAAAAGAACATGACCGATTTGAAGTATGTTTTTGTTTGTGAAGTTGTATTGTTGTGATGCTTGTATGTATGCAAAACAATTAGCCTTTTTTCTGATCAAAGCGAGCTATTATATGTACATAAGAGTAAAGGATGCCATGCATTGAGTGGTCCGCTTGGTAGAAAGATGGTTGAATGCATTGAGTGGTTCATGTTCAAGTTAATTGCCAAGCAACTGGTATTGAATAAGGGTCTATAGGGATGTTGATGGTGAAGTTGTAATCATCATATTCACAACAGTCTTTGTGTTGAGGAAGTTCAATGTCCAGGCGTTAGAAATAAGTAGAGACTAATGTGATTATTGTGTTGTTTACCACATAGTGAGGCGTTAAGACATTTCTAAAAAAAAAGTTTATTGTAACAAAATCAAATTCAATAGTAATACTTTATATTCTTAACTAACGCTTCCAAATGTGGGGATTTAAATCTTTAATTCAAGGGACTGATTTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTGCATTCTATTGTTATGAATAAATATTATGTTAATTTTGATTTTAAAAAAAAAATAATGTAATTTTTGAACCACATGTCAAAAATAGTAGGGTGAATCCAAAACTATTGACAAAAATATGTGACTTCAGGTGAAGTTGTGTCCCACAACTTCTATTTTTTACCTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTACACGGATCTCCACACATTCTTATTTTTTTCATTATTTATATACATTATGCGTGGGTACTACACATTCTACTTGTTCTCATTATTTATATATACGTACACGCGCATATATATATTAAACATTCAAATTCTAAAAACATATTTATTAAATTAGTTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTATATATATTTAAATATCTCAATCTTCACTCTTCAATTTTTCTTATTAAATTCATTTTTTCTAATTTAATTTAATTATTTCTTAATCAAAATTATACATATTGTTTTTTTTCTTTCAAATTTTCAACTTTTTTTTTATCATATATTAACCAAAATATGTTAAACAAATGAAAACAATAATAATAATAACTTAGACAAGTTGAGGTTACTCCAACAAAAAATAATAATAATAACACTTAAATACACTAATTGAATAAATTTTTTTAATGTTTATGGCAAAAGAAAAAGAAAAAGAATTGGTTCGATTACAAATCAAATTTAAAAAACTTAACTAATAATTTTCGAATGCAAACTAAATTTAAAAAACTTAACCAATAATTTTTTATCGTAAAATTGTTATTATTATTATTTTTAGAGTAAATTTCGACTTCTTTTAATTATTATTATTATTTTATTTTAATTTGTTTAATATATTTTTTAATAACATATTTTATTGGTATATATACTTTTTAAATAGAAATTAGAAAAAGATACATATAATTTTAGTTAAAAAGTAATTGAATTAAATTAGAAAAGATCGATTTAAATAGAAAATTAGAAAAAGATACGTATAATTTTAGTTAAAAAATAATTAAATTAAATCAGAAAAGATGAATTTAATAAAAAAAAAAGTTGAAAATGGAAGATTGAGATATTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAATATTGATTTAGTTAAGTTTTTGAAATTTAATTTGTAATCCAACCAATTTTTATTTTTTTTTTCTTTTATCATAAACATTAATTTTTTTTATTTCAATGTGCATTGGTGGCTTCAAGTGTTATTATTATTATTATTGGAGAGTAACTTCAACTTCTCTCCATTATTATTATTATTATTTTCATTTGTTTAATAACATATTTTGTTAAAAAAACTTGAAAATTGAAAAAAAATATGTATAATTTTAATTAAGAAATAATTAAAATAAATTAAAAAATGAATTTAATAAGAAAAATTGAAGATGGAAGATTGAGATATTTATAAAGAAAAAAGAAAAATAAGAAATTAATTTAATAGAGATATTTTTAGAATTTGAATGTTTAATATACATCTCTTTGTGGACATGTATAAATAAATAATGAGAAAAAGTATAATGTGTGGAACTCACGCATAACGTATATAAATAATGAGAAAATAAAAATATGTGGAACCTAATGTAATATATATATAAAGAAAGATAAAGAAAAAAAATAAAAAATGTGGAGTCCACTGCATGGAAGTCATGGATAAGGTACACGACTTCACCTAAACTCACTTATTTTTGTCAATAACTTTTGCATTTACTGTTTCACGTATGTTTCAAAATTTACGTTACTCTCTAAAAAAAAGTTATAACTTGTGTAAAAGTACATATTATATAATTATTTTTGGAAGCTCTAGAAGTTGAGATGTAGGTGGTAAAGTTCACTTGGGCCTTATATCCTTAAGGTGGGTTAGGGTCTAATAGCTTTTGGGTCCAACGATTGAACTTTAGCTTTCAACCAATGTTTATTTTTTCTCACTCAAATTGGGTTCCACTTTGGACCCAATTTATTAAAGAGACAATCCCATTCTATTTACTTTTAATTAATATTTTCTCTCGTAAAATTTGTGGGTTTATTATATATTGTGTTCATAAATTTGACCAAGTTTAGGGTCAATTCTCTAAATTAATTAAGTTATCATGCATTCACTAAATTTCATCTCTTGTTTAGGGACATTTTCTAAAAATAGCAAAATAAATTAAAATATTAATAAGTTAGGATAAAATTTAAAATTTTATCCATCCCCCATGGGGTGGTGAAGGGAGGGCCCCAATTGGTAGAAAAAAACCCGCAACCTCTTGGGGTTATTCTGCACTTGGAAGAAGAAGTAGAAAAAGGAATAAATATAGTGATAATTCGACTATTCCTCAAGCCCGACAATTAGTTAATCATAGACATATTTTAGTTAATGGTTCTATAGTGGATATACCAAGTTATCGGTGCAAACCCCGAGATATTATTACAGCAAAAGATGAAAAAAAATCGAGAACACTGATTCAAAATTATCTTGATTCATCCCCCCCTCAGGAATTGCTAAAATGATAGCTACTGATAAATTTCTATCACTGTTTATCAATACCACTAATAGAAACATATTAGTGATTATTAATCTTCTTTTTCGCATGCATTTGTTCTTCTCACTCACACGTATCTTAGAAATTTTTTCAAGAAGTCACTCTACATAGCATTAGATAATAGTAATTTTCATTTATTTTAAGTCTTTATTAACCATACTTTTAACATACTTTCATATCCTGCTCAGGATCTTTCTTGATTCATTTATGTTTCACTGCTAAACCAAAGACGCTAAAATTTACAAAATACAGGAATAGATGTGTTCGTACAGTACTAAATTGAGTCGAGAGAATAAAGCGCCGGAAAATGTAGGAATATTAAAGTAAATAATAGAAATTGTAGGGCATTATTTATGGTATGGGGAAAGTAAAATAAATTTGTAGGGTCAATGGGGGTATGGATGCAATATGATTATTACTTGGTATTAAAAGTTGTGTTAGTTAGGTTTCATTCAAATCAAAACTGCCCTTACAGCTTCTTGTTTTTCTTACAAACAGAGTTGAATGATTGGGATGTAAAGTTGTTGATAAGTTATTACCCCACCACACAACATCACCTTTAATCATACAAATACTCCATCCCATTTCTTTCTTTCTTTTATTTTTCATCACTTACCTTTATATTCTTTTTTTATTATAAATGTCCATTAGCATGCTTAGTGGCTATAGTCACATGTCAACTCCTTAATCATTCAACATTTATGTCATGTGTCTATCAAATACTCACACTTAGTGGTTATTTAATTCACCTCATGCTTCTCAATTTGCCTATAAACATTGACATTCAGTGGGTTTTCTGGGTTTCAATATTCCATCTATGCCTCATTTTCACAATATTTTTCTTCTTCATTTTTTTTGTAATTTTTCATTGCTTGTGATT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ATGAAGCTTGAATTTCAATACTCAAATTTCGGATTCAGAATGCAACAATCAAACTGGATTTCAAAATCCTCATATTGTATGGAGATCAAGTTAATAATTTGA ATGAAGCTTGAATTTCAATACTCAAATTTCGGATTCAGAATGCAACAATCAAACTGGATTTCAAAATCCTCATATTGTATGGAGATCAAGTTAATAATTTGA MKLEFQYSNFGFRMQQSNWISKSSYCMEIKLII
BLAST of CsaV3_2G010100.1 vs. NCBI nr
Match: KGN61315.1 (30S ribosomal protein S4, chloroplastic [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.2e-05 Identity = 25/25 (100.00%), Postives = 25/25 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G010100.1 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LH94|A0A0A0LH94_CUCSA (30S ribosomal protein S4, chloroplastic OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G079910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 2.1e-05 Identity = 25/25 (100.00%), Postives = 25/25 (100.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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