CsGy3G022120 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGTTCCAAACTAAGCTCACTAGTCCGCTCCGCCATCATATCTTCAAAATCTTCACAGAATGCCCAAGATGCCGCTCTTCAAAACTACGTTTCCACTATTGATCCTTTATCTCCCAGCACCTCTCTCTCTAACGCCATCAACTCCCCGACCTCCAAGAAGCTTCCTCAGAACCCCAATTCTGACGTTCAATTTCCTGCTCTCATTCTAGAAGAGTCTTCGGATTCTGGTACGTGTATTGCATTTTATTACTTTGGTTATGTTTACATCATGTTTTTGTTATTTTGGTTAATGTGTCTATAGTTAATCTTCAATCCAGCTTAATTTTGCCGTAGGCTTCGTGGTTTAGTGTTTTGTTGAAGCTGAAAAGAAGTTTTATTTTAATTATATTTCATTTGCATTGAAGGGCATGTGAATGACATTTGATTTGTCTTGTTTTACTTATCCCAAAAGTTCATGTTTTAATGCAGGGGATCCTACGAAGCATCTAGCCAAGGCCATATCTTCCGTTCTGTGCGGTACGTGTCATTGAATGTTTGTTGTAGGAATTCAATCTCAATTTGTTTTAGATTTATTATAACTCATTAGTTACAATTTCCTTCTTTAAGTTGTTAATAACCTAATAAGCATATGGTAAATATTGAAGGTCAACGGCTAAAATATCTAATGAGTTTCTTTGGCTACTAAACGTAGGGTCAGGCAATTGTCCAATCCTCGAAGGTTTGGTCCAGCTCACGTATTAAAAAAAACATGTAGTGCCTTAGAAATTTTAGAGTGTATTCCTCTTGATGTATCTTTCAGCATTAGTCTCTTTTCATTTTACTAGTTTTCTTTAAAAAAAATAGCCACCTTTTGGATCTTACGTTTCAGATTTTTATGTTGTCTATTTCATCATACTGAGAATGAAGGGATGTGAGTAATCGAATTAATTTCCTGTCCAGTTATACAAGCTGATTAAATAAATTCTTATGTAGTAATACGTTCTATAAATTATAATAATTTTGATGATCAAACTGTAAACTAAAAATTTGGTTTCTTACATGGGCAGGTTTCACCATCCTAAACAGGTTTTAAAGTTGCATTTACTATTTATAATTATTTGATTTGTAATTTTCATAGACATTATTTCATATGTTATCGTCTTGTTTTGCCTCCAATTATGAATCTATCTTAATGCAGTTCTCAGTTTTTCTGTTTTCTCCAAGTGAACTGCTTTAGTAACGTATTATTTCCTTTTGCAGAAGGCTCATCTGTTATGTCTCCTGAAGCACAAGGAAATTGTGTTGAAGAATCTTTGGAAAAATTATTAGATATACCATGGTTTTCCATCAAAACAAATCATAGCTTAACATTACATCGCAAAGAAATATCCCGGGAAAGAAAGCATAACTGGGTATTAAAAAATACCCAGAGCGATAGATTTAGACGATTAGTTAGAAGTTGCGCAAACAGGCTGGGGAGTGATGTTACTCTAGAAGTCTTTGGTAAATTGGGACGAGAAACTGGTGTGAAAGAATACAATGCACTAGTAGGCATATGTTTAGAGAAGGCTAAGGCAAGTAAGGACGTGGAGGTTGTATTGGAACAGATTGGGAAGGTTTATCAGCTATTTAAACTAATGAAAGAACAGGGTTTCTCATTAGAAGATGAAACTTATGGCCCAGTGCTTGCGTGTTTAATTGACATGGACATGATGGAAGAATTTAATTTTTTCTGTGAGGCTATAAAAGATGGAAATCCAGGCTCAATATCAAGGTTGGGTTACTATAAGATGTTGTTCTATATTAAAATCAATGATGAAGAAAAAGTTCAGGAGCTTTGTTACCGTGCTACAGTTGATGATGGAGTGGACAAGTTCAGTTTACAAGGTACGGCCAACTGTTTATGGATACACAAACCTCAGCTGCACCTTTTGTCTTCTTGCTCTGAAATAAACAATGGGGAAGTTTTGCTTATCGGGAAACTCTATTTTTGTTTAAGATAATTGTTAAATTGGCGCCAAACCTAGAAGTTTAAGCTGATGGGTTTGGGTAAAGTTAATTATAATTTATACAAATACTTTTAACCATAAGAAATAACCTGTTGATAAAAGCATGAATAACAAGGGATCTTTTTTTGGCTGAGAAATTAGTAGAAAGCTCTCAATCAGCTATAGTAAATAACAACAAGAAATAACTAAATGTCTTGGTTGCAGCCTAAAAGAAATGCATATAGTCAGGTGGCGAGTCTTTGATGTAACATGTACTATGTTTGAGACTTAAGGCTGACGAGTATTATGTATTTTAAGCTTCTCTGATTTGTAGGTCCCGTTTGGTAAGCATTTCATTTTTGTTTTTGGTTTTTGAAAGTTAAGCCTATTTCCTTTCATTTTATTACCATGACATTAATACGTAAGAGTTGCATTTATAGTTAGACTCTAAAAACAAAAATGAGGTTTTTAAAAACTGTTTTATTATTATTATTTTTAATTTTCAAACTTCGATTTTGTTTTTAAAAAAAGGGTAAAAAGTAGATATATCAAAACAACAAATTTAGAGGTGGAAGAGGTGTTTATAGGCTTAATTTGCAAAAATCAAAACAAAAAATGAAATGGTTACCAAAAGGGACCTTAGTATTTATTGTTTTTACGACAAGTTATTTTTTCAAGTTGTTTTTGCAGCAAGTTAAATTTTCAAGTTTGGTTTAGTTACTCCTTAGTTCATTATTTTAAGTTATTCTTTTAAATCTCTCAAAGGCTGGTTTGTAGCCTTGAAATAGGGATCCCCAGGCTGTAAGAGGCATTAGTTCTAAGCGAGTTCTTCAAGAATTCTCTAGATTTTGTTCAAGAAATTAGTTCTACACCAGACTCTCTCCCACCTCTTTCTATACCCTGGAATATTTTAGCTTTCCTTTTGAGAATAGGGTCAGCAATGATATAGGACAATTCTTGGAAATTATATTGAGGTTTAGAGTTCAATTTTGAAGTTGTGATAATTTTAAGGCTTTAGGGACAATCAAACTTGAAGTTGAATTCTTATTTAGCGTTTGCAATGAAAAATAACAAGCTATGTGAAAGAAATTTATAATAGAAGGAACCTATAATAAATAACACCTTTGGCATCCTCCTTGGGCAGCCCATAAAAATTCTTTGAAGTGATTAGAACAGTGTTTTCTCTGTTTAACTATTTCTGGAAAAAGGTTGTAGCTATTGTTTTAAAGATAATGCAGAGTTTAGCACATTTATCAACTGGGTACATACCAAAGGGAATATGACCGAGTTTCCCACTTTCCCACCCTTCGTTACCTGTACGGATAAAATGATAATCTCTCTAGATACTTTTACATATTATATAGTAGCACACACTACTTCTATCCACTCCTTCATCAGGTCAGTTAGTCTTACCAGTCATGATGGATATGATCTTCTACAGGAGTTCAGTAGGTTGTCATGGTTGTTTCATATGATTTCAGTACTTTCTTACACATTAAATAAGAACACACCCACACCCACACCTACACCCACACCCACACACAACTTCTATCTAATCCACTCATTCATCAGATCGGTTAGTCTTATTGGTCATGATGGATATGACCTTCTACATGAGTTCAGTAGGTTATGGATGTCCCATATGGCATAAGCAATTATAAAATTGAAATTTACATTCACAAACTTTTTTTATCAGCTATGTTCATGTTTTTGGTGAGGCATATATCTTACGATGAAATGGATACATTTCAGAGATAAACCTGTTTGGTTAAAAATTTGGAACCTTTGGTTACAGAAAATTATTTGTTGGCACTCTGTGGAAGTGAGCAGAAGAAGGAACTTTTACAGATGCTGGAAGTTATAGACATCACAAAACTTTCGACAACTGTAGTTGCACCTAACATCTTCAAATCCTTAGGGAGGCTATCACTTCACACTTTTGCAGAGAAGTCACTTTTGGCGTTTAAAACTTCTGGTACGTTGATGATTGCCTTAAAATTTTATTGACAATGAATTTGAAGCAGTCATTTCTTTGTTTTGGAGTGTATATTGAATAAAGTCAGATGCATTGATATAGAAATGTTTAGAATTAGTGGACTTGACCCTTAGGGTATTTATGGAAAGATTATGGAAATATTTACCCTAATTCCTAAATCTTTTCATTTTTTATTCCCTTATGTATTACATTTATTCTCCCTCATTATAACTATCGTATAATTCAATTTAGAAAATAATAAAAGAACAACAATATCGTGGTTTTTCTCCCGGTACTCGGGTTTCCACGTAAGTCTTGGTTTCATGTTTATTGCTTTCAATATGGTATTAGAGCAAAGCAACAACAAAACCTTAGAAAACATTTTAGGAGGAGCCTAGACCAAACCAGCCGCTGCCGCCGCCACCATGGACGCCGTCATGAAAAAATTAGTCCTACAACTTCAGGAATCGTCGATCTACACAGTGGGACCACCCTCGTCGCCGTCCGTGCAACCCTCCGGCCAGAATCTCTTTCACTCGCTGCCATCTGTTTGCCTCACCGCCAACCCAATCTCTTCTACTCACTATCGGTTGTCCAACAGTCATACCCTTCTGGACAGTCGCAGCCCCACACACTGCCCATGCTCTCCGATTATGGACAGCCACCACAAAAACTGTCAGATTTGTTCGTTTGCGCGCTGCTATCCGTCGACCCTTATTTATAGTAACGAGATTGATGGTAGATCAAGGGTTGAAGCGGGTGAGTCTTCGGCACATTCCAAACCAACCGAGTTGTCGATGTATTCCAAGAACCCAGTAATTTCGCTCCTCAATTTGCCTTTGAATTATATAACTGACTTTGCTGCTGCCTTTAGTGCTCGATCCTTGACCCATGATAATGAAAAGAATAGTGGAAAACCAATCCTTGTAGCTAGCACTGCAAGAAACAATGGCACACCAAGGATCAGTGTTGGAAACTCCACGATTGTTCCCCACGATGGAAGAAACGTTCCTACAATGACAAACTGAACTTAGAACGTGCCTATGTTAG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ATGCGTTCCAAACTAAGCTCACTAGTCCGCTCCGCCATCATATCTTCAAAATCTTCACAGAATGCCCAAGATGCCGCTCTTCAAAACTACGTTTCCACTATTGATCCTTTATCTCCCAGCACCTCTCTCTCTAACGCCATCAACTCCCCGACCTCCAAGAAGCTTCCTCAGAACCCCAATTCTGACGTTCAATTTCCTGCTCTCATTCTAGAAGAGTCTTCGGATTCTGGGGATCCTACGAAGCATCTAGCCAAGGCCATATCTTCCGTTCTGTGCGAGAACGGTTTTTTTCATAGAGAGGATGTGGAAGCTCAAAGGGATGCAGTCTCAGAAGCTCAGCTGAAATGGGAATGGAGCAGATGA ATGCGTTCCAAACTAAGCTCACTAGTCCGCTCCGCCATCATATCTTCAAAATCTTCACAGAATGCCCAAGATGCCGCTCTTCAAAACTACGTTTCCACTATTGATCCTTTATCTCCCAGCACCTCTCTCTCTAACGCCATCAACTCCCCGACCTCCAAGAAGCTTCCTCAGAACCCCAATTCTGACGTTCAATTTCCTGCTCTCATTCTAGAAGAGTCTTCGGATTCTGGGGATCCTACGAAGCATCTAGCCAAGGCCATATCTTCCGTTCTGTGCGAGAACGGTTTTTTTCATAGAGAGGATGTGGAAGCTCAAAGGGATGCAGTCTCAGAAGCTCAGCTGAAATGGGAATGGAGCAGATGA MRSKLSSLVRSAIISSKSSQNAQDAALQNYVSTIDPLSPSTSLSNAINSPTSKKLPQNPNSDVQFPALILEESSDSGDPTKHLAKAISSVLCENGFFHREDVEAQRDAVSEAQLKWEWSR
BLAST of CsGy3G022120 vs. NCBI nr
Match: KGN57963.1 (hypothetical protein Csa_3G415080 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 1.1e-39 Identity = 98/112 (87.50%), Postives = 100/112 (89.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. NCBI nr
Match: XP_011651464.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 1.1e-39 Identity = 98/112 (87.50%), Postives = 100/112 (89.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. NCBI nr
Match: XP_008454564.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 2.4e-26 Identity = 82/120 (68.33%), Postives = 90/120 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. NCBI nr
Match: XP_008454565.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 2.4e-26 Identity = 82/120 (68.33%), Postives = 90/120 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. NCBI nr
Match: XP_022981387.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 5.8e-25 Identity = 75/115 (65.22%), Postives = 80/115 (69.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0L854|A0A0A0L854_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G415080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 7.2e-40 Identity = 98/112 (87.50%), Postives = 100/112 (89.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BYG2|A0A1S3BYG2_CUCME (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494956 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 1.6e-26 Identity = 82/120 (68.33%), Postives = 90/120 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C047|A0A1S3C047_CUCME (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g04790, mitochondrial-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494956 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 1.6e-26 Identity = 82/120 (68.33%), Postives = 90/120 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G022120 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2R6PT78|A0A2R6PT78_ACTCH (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Actinidia chinensis var. chinensis OX=1590841 GN=CEY00_Acc26353 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 1.7e-04 Identity = 38/97 (39.18%), Postives = 57/97 (58.76%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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