CsGy1G019560 (gene) Cucumber (Gy14) v2

NameCsGy1G019560
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Gy14) v2)
DescriptionArmadillo repeat-containing protein 7
LocationChr1 : 18454108 .. 18473883 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexonthree_prime_UTR
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ATGGCAGCGGCTATGGTTCTGGTTGGTCCGTCGGAGGTCCTTGCCCGGAAACCAAAGCTAGCGGTTGGGATTGAGAGAACTTGGGCTGGAGCCATTAGAATTTGGAATTTGGAATTGAGAGAACGAATACCTATGTTTATATCTAGTTTATTACAAATTTCGATGCACCAAACATAATTATCTACTCTTTTTATTTTATAATAAGAAAAATTGTGATGGCTACCATTTTAAGTATATGTTATATAGTAAATAGAACACATTGTTTTATAATTTTACAAATTCCATAAAATTCTCATACATCTTAAACTTGTTATTATTCTCTCCAATCATTCTCTAATAATTTTTTTTTTTGAATAATAGTTAGTTATTTCTTCTATCGAATCATTCTTTAATAACTTATTCCTTTTACACGTTAGTTATTTCTTATCTCAAATCATTCTCTAATAACTTATTTCTTTTCCATTTTTCTAAGGTTATAATCATCGGTTATTTCTTCACTCACTTTTTAAGACCCTTATCATTCTTTCTCTTACGAGAAAATAATTTATTTGTTTAATAACGTTCATATTTTTTATCCCCTTTTTAAGACTCTAGTCATACTTTCTTATACGAGGAAAACAATATGTTCTTCCTATCTTAATCTTAATTTTAGGATATCAATAGTACATTATTTCCAATATAAAATATAATGGTTGTTGATTCGACTAATTTAACTTCGTTTATGACTTTTCTCTACTTTCTTTGATGTATATATTTTGAGTTAAATCTGATTTCAAATAATTTTGTTTTATTTTTTTACATTGGTTTTGTTTTACTTTACTTTGTATCAGTTTTGTATATTAATGTTGTGATGTACTACTTATATTATATATCTTAGTTGGTTAATATACTTACTACGTGTACTACGTGATTTTCAATTTTTCAAATTTTATGCAACATTTATAGTAGTTTATTGATTAAATAAGTATATGAACGATATAACTCAGTGTATAATTACAAAAGTATATCAACAAAATGAATCATTATCAATTATATCAATCAAGTTTGCAAGTGTATCAAGTATATAAGTAGGACTTCAAGCATATCAAGTGTATTTAATCAATCGAGTGTGTATCAATCAAGAATACTAAGTGTATATGCAGTACATCAGGTGTATCAAACATATAACTTACATATCAAGCCTATCAAATCTGTTGAGTGTACCAATGAAGCAAAACAAGTTTGTTAGCAAGATATCAAGTGTATTAAACTGATCAGTAAAACATTTAACTGTATCAAGAATATAAAAAAGAATCAAGAATAATAAGAAGTATTGTGTATCAAGGTGTTTCAAGTGTATCAAAGAGAATTCAATATATTAAAGAGTATTATGGTTTATGCATCGAGTGTATCAAAGAGTATCACGGTTCATTAAGTGTATCAAGGTCCAAAAGTTTTCAAGAAGTATCAAATATATATCAAGTGTATCAATTGTGTCAAAGGATATTAGGTGTATCTGGTATATCAAATATGTATTAGTAGCAAAGACATTAGTGACATTTTTACATTTTGTATATGTTGATTATATTTTGTTTTTGTCATTTTTGCAAACATTAAGTATGTCATATGAACTTAATTATTATAACTTGATTTGTTTTTTTATGAGTGTTCGTCCTAATAAGATAAGTTATTTAAAAATAATAATAGATGACATAAATTATAAAATAAATAATTATTAGTATAAAAAAAGATTGAAAGCAAGAGAGTGAATGGACCCAGAAGTCACAAAATTAAATGTTTAAGTAATTATGTATTTATTTTTTGTTTGTTATCGTTTTTTATGTTTGTTATCGTTTATTAGAGTAGTTGAAGGGACATCAAATTAAATGTTGTGATCTTTCATTCAATAGTTTAATTAGTATAAATGGAGTTGTAATTTTTAAATTTAAAAAAAAAAAATTTGGATGAATGAAATTTGAAAATTCTAAAATGTGGAATTTTGTTCTTGTGTGTATTTTTTATATAAAATGCATGAATATTTGCAGCCTTTAAGTGAGAATTGATCTGTCTTGTTTGTGGAGTGCTTTGAAGATCGATGATCGATGAGAGTTTCTAACTTTGTCTAATCCTTGGTTTGTTAGATCATCTAAGTAATTCAATCTAGTCTACCTTAAGGGTTGAAATCAAATTGATTTTAGGGCTATTGGAGTTGTGTTATTTGAGTGTTGTTGTCTAACATGATTCTTAGATCCAATGTCCAAGGGTTTCTTTGAAGGGATAAAAGCCCTCTTGGCAGCGGAAGATTCTACAGAACCATTACTTAATTTAATTTGAAAATCTCAAAATACCAGTACATTGACAAAGATTTAGAATCAAAATTCTAAATTAAAAACTAAGCATGCTTTTAATTTAAAAATTGTAGAGAACTTACATTCATTGACGTCTCTGAATCTACGAATTAATTCTCCAAATTTGGATACTACCGGTCGGAGAATTCTCTATCCTCTAAGATAAGATTGATTTGTGAGAATTAATTAGGATGGGAAAAAATTTAGAGGTATTTAAGAGAAACTCTTTTCTTTTTGCATAGAGCAAAAATATTGACTTTTTTTCTTGATTAATTCGTTAAAGAAAAACGGATTTCTTTTAGATATTTATAATTCTCTTTCCTTCTTGGAATAGGAAAAGGAATCGAAGAGAATCATGAGATTTTATTATCAAATCCACTAATTAATTAACCATTAATCAATTAGTTAATAACTAATTAAATCATATTTAATTAATATTTCATTCAAATCTTATTTGAATGAATATCTCTCCAATATCTTATACATCTATATTAATATAATTAATTAATATTTCATTCAAATTTTATTTGAATGAATATCTTTCTAATATCTTATAGATTTATATTAATATAATTAACTAAATCATATTTAATTAATATTTCATTCAAATCTTATTTGAATTACTATCTCTCCAATATCTTATTAAATAAAACAAAACTATTAATTAACTCTCCAATTAATTAATAGCTAAATTAAATATCTTATATGTAACTTAAATTAAATTTGAATCATATTCAAATATAATTTTTCTCTCATGGATAACTTTAATTTGAATCTAATTTACATTAAATTAATATTTAAACTCATTCAAATATTTTATCTCTCATAAATTAATTTTGAATCTTATCCAAAATTAAATTTATATAATAAAGTTTGATAAACTTTATATTATAATGTATTACTATACATTATACTAATTCTCAAAGTAAATTTGAACATTTCAAATTACAACCCATATAAATAAATATCATTATCCTTTATGAGCTAGAAATGAGACCTAATAGACTTACAGATCAGAAGCTACAACGATATGAGATTAATTGTTTAAACTCATTAACCACATTAATCAATATTCATTAACTGTGTGTACACTCCACTAAAGACTCACAGTTGAACTATTCTCACATTAGATATATTTTTGTGTCCACGAATATAGACTAATAATAGTAAGTTAGTCTTTCACGAGTGTTCGCAACACCAGCTGGATCAATTTATCATTTTACCCATGGGTTACCTCTAATCCTTAAATACCAGTGCTCCTCCAATGAACAACCTGTTTATGGTCCTACCAATAAATAAAAACCTCTCTCATGGCATAGAGAGGGTAGGGCCCTTTGTTCAAGACATGGACACACCATTTAAGGAAACACTCAGCTACTTACCCTGAAGTAGGGAAAGAGTGAATTTCATATTGTGTAATTCTGTTCCCAGCTCCCCAATCAGTCTTTTCCCCAAAATGATAAGCTTCTTGAGTTAACGATCTGACCACTCTTACCCGTACAAATCAAAGAACAATCCACCGTGAATAGGAGTTCATAATACACTCAGGATTAAGACTAAGTTACATAGGTCATTCTAGTGAAATAGAAACCTAACTAGTTAACAGAGTTACATCTAGTGGTTACGCATTCGCGGTCTGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAAGATACTCTCACTCGTATGTCAACTACATGAATGCGTTGGATCATTGTGTTTATATGAAATACAAAGTTAGCCGTATCCATAGTGTTACTAGGATAAGGTACCAAACCTTATCCCTATACTATAAACCATTTAAGCTGATCTCGAACATTGATCCCTGTATGTCTCTACATATTGTTCAAGACTCATTAAACAGGTTAGGATGTTAGTTTATTTGATTTGAGTTATTAAGAAAAAACTAATAATTTAATCAAGAATAATTATTACAACAATAACACTTTATTAATAACGGTTAATGGATTATATTTAAAATCTACGAGTTTTAGGACATAAATCCCAACAAACTCCCACTTGGACTATAACTTTAGGCTCTTTGGAATATACATAGTAAAATAATCCTCTGACATTGGAAATGGTAAAATGTACAAGTATATTACATAAAACATATATATATACATATATACAAATACAATACACTAGGACATCCTCATACCCATTGCACATCTCACACTTGCCCTAGATTACCTAATGTACATATTTCGTAGACCTAGACTTTCTAGATGATCCTCGAACACTTTAGCCGTGAGAGTCGTTGTAAATGGATCAGCAATGTTGTGCTCCAAAGCGATCTTTGTGACGATCACATCACCTCTTTGCACAATCTCCGGTATCAAATGATAATTCCTTTCTACCCGTTTTCCTCATTTGTGGTTGCGAGGTTCCTTTGAATTGACTGCTGCCCACTGTTATAACAATATAAAGTGATGGGCATGTTTATGATAGAACTAAGTCATGCACAGCGGAAAAAGAATCGAATTTCTACCCTAATTGCCACAATTAACATGTAACCATAAACTAATCAAATTAGGGTTTTAAGAAGTATTACCTTTGAAGCTTACAAAAGGTTTGATGTCTTCTTACCAATTCTACCCGAGACCACCACTAGTACTCAACTGCTATCCTCTAGACAAAGAACCGGGTTGTGGGACCCAATTTTGGTGTAGAAAATAATG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TGAGTACTTACCTCCGCATGTCCTTTAAGGTTGCCTTCTCCACGAATGATCTCACGGTTCTCCACCAACTGAGCTAATTGCATCATCTTGGCTAATCCAGTTGGTCGACAAAAATCCACCTCGACCTTGATCCACGACAAAAATCCATTCATGAATGTCTCTTCTATCACCCTTTAATGTAGATTCGATAATGGTGCCATCAGTCTATCGAACGAGTTTCAATTATTCCTCCACTGTCGTCTCTTGCCGAATTCTTAAAAATTGGCCACATATAGACTCTTCGCGAACTGTTCGGAACTGCACCAGGAACTGTTCCTTCAAGTTCGCCCAGTCCACAAATTCATCTCTCTCCTTCTATACTCTATACCAGTTCAGGGCTGGACCTTCAAAGCTGATAGTTGCCACCAATACCTTCTCGACATCAGTCAATCTATGGATCTGGATGTTGGATCGGTATGGCAACCCTAGAGGGGGGTGAATAGGGTTTAAATAAAATTTTTGACAAATAAAAAGTAAAATCAACTAATTAGATATTTTTTAAAATTTAAATAAAGAACTTTGTAAACTTTGTTAAATAACAAGATTGATAAAAAGATATGAATGGAAGTATGCAATCAAACTCAACCAATAAGAATATGTAACTAAAATTAAATTAAAAAGTAATTAGAAAAGAGTTAGAGAAGAAGGCACCGTAATTTTATAGTGGTTCGGTTAAACTCAACCTACATCCACTTTCCCAAGCACCTCTTGGGATTTTGATTGAAAATCTTCTTTGGACTCTTTCCACGAATTTGAGCCGAACCGATTCTTGCTCCTTTTTCGGGTTCAAGAGCAAACCCGATCATTTCCACGGGTTAGGATCCAACCGTTACAATATGTTGAAGTTTTTAAATCACGCAAAAGAAAAACTCTCTAAAAGAGTGAGTATACAATTTGAAGCTCACAAATTTAATCCTCACAATATAATAAGAAGCTCTCAAGAATAGGATGAAAAGAATAAAAATTGGAAGCTTTAAAGAGAATAACAATGTTGGCTTTTTGCTTGAGGATTGTAAAGATTTAAATGATCTTGTGTAAATGTGAAGTATTTAAAAAGAGAGGAAAAATAAATTCAAAATCATTTGGGTCATTAGATATAAGTAAAAGAAAAATGAATGGTTGAGATTTAAACTTAATTAGCCTTTAGACACAATACAAATAATAATATAATAATATGTCTTTTCAAAATACTTTGTTTAAAAAGAAATCAATAAAGCAACTTCACCATCTTTTAAAACAACTAGCCGTTAGACACAAGGAAAAAATAATAATATTAAAATCATTTTCTTTTTAAATTCATTTTCTTTATAAAACCCAATAAAACATAACAAAAACCCACATTTGTTACTCCTTCATTACTCCAAGTGGCTTTCTCTAATTGGTTCAAATTGAATGCTTGGTCGTCACGTCACCATCTCGGGTATTTTTCCGTTAACCTTGTTTTAGCAATATTTTCTTCATTTGAACTTCGATTTGGGTGATTCAAGAGGCGTTAGAATCATTTTTCCAAGCTCACGATATGGTCTATTCAAATTAATAAAATTGTCAATAAAAAAAATCAGATTTGTTATCATCAAAACATAAATTAATTGAATAGTTAAAATAAATTAATTTGAGATTAAGGGCCAAAAAGCCAACACTGGAGATATCTATCGGCTCAAAATAACCAAGAATCAGGATCTTCCCCATTGAATACTGGCATCTCTATTTTTTTAAACTTATTGCATTCTGTATTTCCCTCCTCGCTTTCAGTTCTGTCTTTTGACGTTTCGCCTCTGCTGCCTATGCCATACGTTCCTTCTCCTATCTTGGCCTACATCGTCATTGTTTCACGCAACCCTGGTTCAACCTTTCGATCGCCCATGGTCGTTCTCTCCTTCGTTACTGTCTCCATCAACATCAACATCATATGCTGATTTTTGTCTGTTTGTATACTCAAATTCTCCAGTGTCGTCGTGATTGCCGTCAGCTTCTCCTCAATTGTCGGTAATTTGCTAAGTTCTTTCTTCATGTCAATTAACTGGTTATCATATGCTTCCAACCTCTCTTCCATCCGAGTCTGAACAATCGCTTTGATACCAATATGATGGAACACTTAGATTGTGTTCTATCGTTGAATCTTTATTGGTACTCGAATGAATCGATTACAAGAATAAAATAAAAGCAATTCAATTACAATCTCTCTGTTATCTTCTCTCAAAGGTGCACAGATCCCAAATCTAACTCTCAAAATCTAATCCCCTCCAATACTTCAGAATTATTTATAAAAATATATCTCAACAAATTCCCCTAGCTATTTAAAATATATCCTAACAAATCCCCTAACTAACTTCACGTGCCTACACTATTGATGAATAATAGGAGGTCTATCATTCACCCCAAGATTGTCCCAAACAATTACATTATTCCACCCTGAGATTGTCCTGAGTTATTACATCATTCCACCCAAGATTGTCCGAAGTTATTGAGGGTGAGAGCACATTATGTGTTAGTAAGGGGAAGTTAGGGAGTGGGAAAGAGAAAGTATTAAATAGGAGGGGAGTGGGAAAGAGAAAGTATTAAATAGGAGGGGAGTGGGAAAGAGAAAGTAGTTCAGGTTTTTTTTGGGTAGTTTTGGTTTCTGCACTCTTTCGTGAGAGACAGGTTAGGCAGAGAAGGTTATGTTTTTCTTTTTACTTTTGGGTGTTCTTAGTTTTCTATTTGTTTGAATATAGAACTTTTTGTTCAACAATTCTTCTTTGTATTTTTGAAGAATTTTCAATCAAATTAGAACACAATTATTTGGTGTTCTATCAGACACACCTTACAGATCAGAGTTTCCTTTGAGCATCATCAAAACTTCTTTCATTTCTGATATTTCTGTGACACACTGTCCCATTGAGTAATAACATAATTTTAAGAAAATCTACCTACAGTCTCAGAGATGGGGGTAAATTTATTTAATTCTTTTCAGTCATGGATTTATGTCTAGTGAATTACCAAAGGTTATGTTTCTTTTGTTAGAAACTCAAAGCTGACAGTTTGCATTGTTTCTCTTGAACCCACAGAAACAAAAGAAAGACTTGTTGCCAATTTGGCAAAACTTTTCTTATGATCCTTACAATTATTCCTTCTTATGCCAGGTATTAAATCTCTATTTCTGATATTACTGTGATTTGTTTCAGAGCTCTCCATGGATGTTTGCCTACTTATCCCCTTCTCTAGAACAATTTTACTGAATTGTAATTTTGTGAGCAGCTAAATGTTCTGGAGCTGTTTTTGGACTGTTTCATAATTTTAAATTATTTGATTTAGATGTGAGTACTGTTTGTTCTACCGATTGGATGACTACCTGACCACAGATACATCTACTGTTACTTTTTTCATGCAGACCCTGCTAATGCTTCTCTTATAACTCAGTGTGGTGGAATTCCCCTCATCATTGAATGCTTGTCAAGTCCTGTAAACCTTGTGTGTGTTGCTTCTTGTCAGGTTTTCAGTCTTTGGTTCATAAAAGGCATTACCCAAAAGGTTTTTTGGGAAAAATAATTAGGGCCCTACTGTATGAAAATTAACTTTTGGTAACTTCTTTAACTAAAATTTTAAACATGATTCAGCATTCTATTTCTTTTCGTTCGGTAAGAGACAAGAGTACTAATAGGAATATCTTTAGAACAGTAATAAGGATCTTTGTAAGGGTATAGTGGTAGTTAGCTGAGAGTCTTGGTTACAAATATGTAAGGGAAAGCCATATTTTGATGGGTCAGTCCATAGTGGGCGGATTGTGGAAGGAGATAGCCCATTCAAAAGGCTGCTAGATATTGTAGGTTGCTTTTTATATTGCATTGTATTAGCATCTTTGTCTTTTCTGTGCTTGGATACCGAAAACATTCTTTTATCAAATATCGAATTTCAATGTATTTTTTCTCTTGGATATGCATGATATTTTTATCATTTGCTAATATATGGAAACCTTGACTATTGAAAATTGATTTGTTGATCTAGTCCAATGTATCTCCACCTCATTTTTTCTAAAGGATCTACTAATATCTCGACTAAATCATCTGATAAATGGATCACTTTTACTATTCTGTCAAATTGTATCACCTGTGGTTGAATCAGTGATTGATATTCCCTTTGGTTTTGATCAAAATAAAGTGTCAAACTTATTTCAATTTGAGGTGAATCATGCAGTTAGCTTCCTTTTTGTATTTTATGGAGGTACATTAGTGACATAGAATGTGTAGAATTTAGCCACATTTGAAAATCCATTCATTCGTGGCAAACTTAACAATTCTTATCAGGTGAATTATGCACTTGGCGCCATATATTACCTCTGCAATACATCAAACAAAGAGGAGATTATGAAACCAGAAGTTGTAGATGTCATCAACAAATACGCAGTGGCTGAGAGTGTGAGCTTTAGTAATCTATCTAAAGCAATTCTGGACAAGCACCTATCTAACAGAAACTGAAACTTGATATTCTTGATGGCGAATTGGCTGAAATCGCATTGCTACGTTGCTCGTTCTTCTTTTCTCTTTATTCTTTTATGATCTCATGAGTATGACTTTATCTCTTTTATTCACTTTGTTTTACAATGATTTTTATATTTCTTTTGGTAACATTTGAAATCATAGTTAAATTTTAAAAATAAAAACTATATTTTTCCACAAAATTTGACTTTGATTTTTAAACGCCCCTAAAGAGTAGATGTAAAAGAACATAGGCAAAACGGTTAGAAGCTTAATTTTCAAA

mRNA sequence

ATGGCAGCGGCTATGGTTCTGGTTGGTCCGTCGGAGGTCCTTGCCCGGAAACCAAAGCTAGCGGTTGGGATTGAGAGAACTTGGGCTGGAGCCATTAGAATTTGGAATTTGGAATTGAGAGAACGAATACCTATTGTCGTCGTGATTGCCGTCAGCTTCTCCTCAATTGTCGACCCTGCTAATGCTTCTCTTATAACTCAGTGTGGTGGAATTCCCCTCATCATTGAATGCTTGTCAAGTCCTGTAAACCTTGTGAATTATGCACTTGGCGCCATATATTACCTCTGCAATACATCAAACAAAGAGGAGATTATGAAACCAGAAGTTGTAGATGTCATCAACAAATACGCAGTGGCTGAGAGTGTGAGCTTTAGTAATCTATCTAAAGCAATTCTGGACAAGCACCTATCTAACAGAAACTGAAACTTGATATTCTTGATGGCGAATTGGCTGAAATCGCATTGCTACGTTGCTCGTTCTTCTTTTCTCTTTATTCTTTTATGATCTCATGAGTATGACTTTATCTCTTTTATTCACTTTGTTTTACAATGATTTTTATATTTCTTTTGGTAACATTTGAAATCATAGTTAAATTTTAAAAATAAAAACTATATTTTTCCACAAAATTTGACTTTGATTTTTAAACGCCCCTAAAGAGTAGATGTAAAAGAACATAGGCAAAACGGTTAGAAGCTTAATTTTCAAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAGCGGCTATGGTTCTGGTTGGTCCGTCGGAGGTCCTTGCCCGGAAACCAAAGCTAGCGGTTGGGATTGAGAGAACTTGGGCTGGAGCCATTAGAATTTGGAATTTGGAATTGAGAGAACGAATACCTATTGTCGTCGTGATTGCCGTCAGCTTCTCCTCAATTGTCGACCCTGCTAATGCTTCTCTTATAACTCAGTGTGGTGGAATTCCCCTCATCATTGAATGCTTGTCAAGTCCTGTAAACCTTGTGAATTATGCACTTGGCGCCATATATTACCTCTGCAATACATCAAACAAAGAGGAGATTATGAAACCAGAAGTTGTAGATGTCATCAACAAATACGCAGTGGCTGAGAGTGTGAGCTTTAGTAATCTATCTAAAGCAATTCTGGACAAGCACCTATCTAACAGAAACTGA

Protein sequence

MAAAMVLVGPSEVLARKPKLAVGIERTWAGAIRIWNLELRERIPIVVVIAVSFSSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPVNLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDVINKYAVAESVSFSNLSKAILDKHLSNRN
BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_011648493.1 (PREDICTED: armadillo repeat-containing protein 7-like [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 4.7e-34
Identity = 80/89 (89.89%), Postives = 82/89 (92.13%), Query Frame = 0

Query: 59  PANASLITQCGGIPLIIECLSSPVNL-------VNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVD 118
           PANAS+ITQCGGIPLIIECLSSPVNL       VNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVD
Sbjct: 38  PANASIITQCGGIPLIIECLSSPVNLVCVASCQVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVD 97

Query: 119 VINKYAVAESVSFSNLSKAILDKHLSNRN 141
           VINKYAVAESVSFSNL+KAILDKHLSNRN
Sbjct: 98  VINKYAVAESVSFSNLAKAILDKHLSNRN 126

BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_022729317.1 (armadillo repeat-containing protein 7 isoform X1 [Durio zibethinus])

HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 5.5e-27
Identity = 65/87 (74.71%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPANA++ITQCGGIPL+I+CLSSPV N VNYALGA+YYLCN SN+EEI+KPEVVDV
Sbjct: 89  NSCVDPANAAIITQCGGIPLVIQCLSSPVRNTVNYALGALYYLCNKSNREEILKPEVVDV 148

Query: 114 INKYAVAE--SVSFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A+  +VSFSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 149 IERYAAAQTINVSFSNLAKAFLDKHVS 175

BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_022729318.1 (armadillo repeat-containing protein 7 isoform X2 [Durio zibethinus])

HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 5.5e-27
Identity = 65/87 (74.71%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPANA++ITQCGGIPL+I+CLSSPV N VNYALGA+YYLCN SN+EEI+KPEVVDV
Sbjct: 56  NSCVDPANAAIITQCGGIPLVIQCLSSPVRNTVNYALGALYYLCNKSNREEILKPEVVDV 115

Query: 114 INKYAVAE--SVSFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A+  +VSFSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 116 IERYAAAQTINVSFSNLAKAFLDKHVS 142

BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_017627539.1 (PREDICTED: armadillo repeat-containing protein 7 isoform X3 [Gossypium arboreum])

HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 9.5e-27
Identity = 64/87 (73.56%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPANA++ITQCGGIPL+I+CLSSPV N VNYALGA+YYLCN SN+EEI+KPEV+DV
Sbjct: 56  NSCVDPANAAIITQCGGIPLVIKCLSSPVRNTVNYALGALYYLCNKSNREEILKPEVIDV 115

Query: 114 INKYAVAESV--SFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A++V  SFSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 116 IERYAAAQTVNASFSNLAKAFLDKHVS 142

BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: PPD96897.1 (hypothetical protein GOBAR_DD06098 [Gossypium barbadense])

HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 9.5e-27
Identity = 64/87 (73.56%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPANA++ITQCGGIPL+I+CLSSPV N VNYALGA+YYLCN SN+EEI+KPEV+DV
Sbjct: 31  NSCVDPANAAIITQCGGIPLVIKCLSSPVRNTVNYALGALYYLCNKSNREEILKPEVIDV 90

Query: 114 INKYAVAESV--SFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A++V  SFSNL+KA LDKHL+
Sbjct: 91  IERYAAAQTVNASFSNLAKAFLDKHLT 117

BLAST of CsGy1G019560 vs. TAIR10
Match: AT5G37290.1 (ARM repeat superfamily protein)

HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 4.4e-10
Identity = 46/145 (31.72%), Postives = 69/145 (47.59%), Query Frame = 0

Query: 38  ELRERIPIVVVIAVSFSSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSP-VNLVNYALG------ 97
           E +ERI     +A   +   DP N +++ Q   + L ++C++ P   LV + +G      
Sbjct: 37  ETKERI-----VANLANFAYDPYNYTILRQLNVLELFVDCITEPNEKLVEFGIGGICXXX 96

Query: 98  -----------------------------------AIYYLC--NTSNKEEIMKPEVVDVI 137
                                              A+YY+C  N + +EEI++PEVVD+I
Sbjct: 97  XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXALYYMCDYNRATREEILRPEVVDLI 156

BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5SCW5|A0A2P5SCW5_GOSBA (Uncharacterized protein OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=GOBAR_DD06098 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 6.3e-27
Identity = 64/87 (73.56%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPANA++ITQCGGIPL+I+CLSSPV N VNYALGA+YYLCN SN+EEI+KPEV+DV
Sbjct: 31  NSCVDPANAAIITQCGGIPLVIKCLSSPVRNTVNYALGALYYLCNKSNREEILKPEVIDV 90

Query: 114 INKYAVAESV--SFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A++V  SFSNL+KA LDKHL+
Sbjct: 91  IERYAAAQTVNASFSNLAKAFLDKHLT 117

BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A061GXH2|A0A061GXH2_THECC (ARM repeat superfamily protein isoform 3 OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_041735 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 4.1e-26
Identity = 63/87 (72.41%), Postives = 77/87 (88.51%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPANA+++TQC GIPL+I+CLSSPV N VNYALGA+YYLCN SN+EEI+KPEVVDV
Sbjct: 30  NSCVDPANAAILTQCDGIPLVIQCLSSPVRNTVNYALGALYYLCNKSNREEILKPEVVDV 89

Query: 114 INKYAVAE--SVSFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A+  +VSFSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 90  IERYAAAQTVNVSFSNLAKAFLDKHVS 116

BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A061F372|A0A061F372_THECC (ARM repeat superfamily protein OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_026566 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 5.3e-26
Identity = 61/85 (71.76%), Postives = 74/85 (87.06%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VDPAN ++ITQC GIPL I+CLSSPV N VNYALGA YYLCN +N+EEI+KPEVVDV
Sbjct: 22  NSCVDPANGAIITQCDGIPLAIQCLSSPVINTVNYALGAFYYLCNKANREEILKPEVVDV 81

Query: 114 INKYAVAESVSFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA +++VSFSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 82  IERYAASQNVSFSNLAKAFLDKHVS 106

BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A251Q039|A0A251Q039_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_3G143200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 2.0e-25
Identity = 62/83 (74.70%), Postives = 73/83 (87.95%), Query Frame = 0

Query: 58  DPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDVINKY 117
           DPANA +ITQCGGIPL+I+CLSSPV N VNYA+G++YYLCN SNK EIMKPEVVDV+ +Y
Sbjct: 66  DPANAVIITQCGGIPLVIQCLSSPVRNTVNYAIGSLYYLCNASNKGEIMKPEVVDVMKRY 125

Query: 118 AVAE--SVSFSNLSKAILDKHLS 138
           A AE  S+SFSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 126 AAAEEVSLSFSNLAKAFLDKHVS 148

BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P2JC85|A0A2P2JC85_RHIMU (Uncharacterized protein MANES_02G134600 OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 118.2 bits (295), Expect = 1.4e-23
Identity = 58/85 (68.24%), Postives = 72/85 (84.71%), Query Frame = 0

Query: 54  SSIVDPANASLITQCGGIPLIIECLSSPV-NLVNYALGAIYYLCNTSNKEEIMKPEVVDV 113
           +S VD ANA+++T+CGGI  II+CLSSP+ N V YALGA+YYLC  SNKEEI+KPEV+DV
Sbjct: 89  NSCVDSANAAVVTECGGILHIIQCLSSPIRNTVKYALGALYYLCYASNKEEILKPEVIDV 148

Query: 114 INKYAVAESVSFSNLSKAILDKHLS 138
           I +YA A+SV FSNL+KA LDKH+S
Sbjct: 149 IKRYAEADSVDFSNLAKAFLDKHVS 173

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_011648493.14.7e-3489.89PREDICTED: armadillo repeat-containing protein 7-like [Cucumis sativus][more]
XP_022729317.15.5e-2774.71armadillo repeat-containing protein 7 isoform X1 [Durio zibethinus][more]
XP_022729318.15.5e-2774.71armadillo repeat-containing protein 7 isoform X2 [Durio zibethinus][more]
XP_017627539.19.5e-2773.56PREDICTED: armadillo repeat-containing protein 7 isoform X3 [Gossypium arboreum][more]
PPD96897.19.5e-2773.56hypothetical protein GOBAR_DD06098 [Gossypium barbadense][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT5G37290.14.4e-1031.72ARM repeat superfamily protein[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
tr|A0A2P5SCW5|A0A2P5SCW5_GOSBA6.3e-2773.56Uncharacterized protein OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=GOBAR_DD06098 PE=4 SV... [more]
tr|A0A061GXH2|A0A061GXH2_THECC4.1e-2672.41ARM repeat superfamily protein isoform 3 OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_04173... [more]
tr|A0A061F372|A0A061F372_THECC5.3e-2671.76ARM repeat superfamily protein OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_026566 PE=4 SV=... [more]
tr|A0A251Q039|A0A251Q039_PRUPE2.0e-2574.70Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_3G143200 PE=4 SV=1[more]
tr|A0A2P2JC85|A0A2P2JC85_RHIMU1.4e-2368.24Uncharacterized protein MANES_02G134600 OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV... [more]
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0005488binding
GO:0005515protein binding
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR016024ARM-type_fold
IPR011989ARM-like
IPR000225Armadillo
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
molecular_function GO:0005488 binding
molecular_function GO:0005515 protein binding

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsGy1G019560.1CsGy1G019560.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR000225ArmadilloSMARTSM00185arm_5coord: 58..97
e-value: 0.0024
score: 27.1
IPR011989Armadillo-like helicalGENE3DG3DSA:1.25.10.10coord: 40..138
e-value: 9.5E-7
score: 30.7
IPR016024Armadillo-type foldSUPERFAMILYSSF48371ARM repeatcoord: 55..113

The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CsGy1G019560CsaV3_1G031100Cucumber (Chinese Long) v3cgybcucB001
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None