CsGy1G019560 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGCGGCTATGGTTCTGGTTGGTCCGTCGGAGGTCCTTGCCCGGAAACCAAAGCTAGCGGTTGGGATTGAGAGAACTTGGGCTGGAGCCATTAGAATTTGGAATTTGGAATTGAGAGAACGAATACCTATGTTTATATCTAGTTTATTACAAATTTCGATGCACCAAACATAATTATCTACTCTTTTTATTTTATAATAAGAAAAATTGTGATGGCTACCATTTTAAGTATATGTTATATAGTAAATAGAACACATTGTTTTATAATTTTACAAATTCCATAAAATTCTCATACATCTTAAACTTGTTATTATTCTCTCCAATCATTCTCTAATAATTTTTTTTTTTGAATAATAGTTAGTTATTTCTTCTATCGAATCATTCTTTAATAACTTATTCCTTTTACACGTTAGTTATTTCTTATCTCAAATCATTCTCTAATAACTTATTTCTTTTCCATTTTTCTAAGGTTATAATCATCGGTTATTTCTTCACTCACTTTTTAAGACCCTTATCATTCTTTCTCTTACGAGAAAATAATTTATTTGTTTAATAACGTTCATATTTTTTATCCCCTTTTTAAGACTCTAGTCATACTTTCTTATACGAGGAAAACAATATGTTCTTCCTATCTTAATCTTAATTTTAGGATATCAATAGTACATTATTTCCAATATAAAATATAATGGTTGTTGATTCGACTAATTTAACTTCGTTTATGACTTTTCTCTACTTTCTTTGATGTATATATTTTGAGTTAAATCTGATTTCAAATAATTTTGTTTTATTTTTTTACATTGGTTTTGTTTTACTTTACTTTGTATCAGTTTTGTATATTAATGTTGTGATGTACTACTTATATTATATATCTTAGTTGGTTAATATACTTACTACGTGTACTACGTGATTTTCAATTTTTCAAATTTTATGCAACATTTATAGTAGTTTATTGATTAAATAAGTATATGAACGATATAACTCAGTGTATAATTACAAAAGTATATCAACAAAATGAATCATTATCAATTATATCAATCAAGTTTGCAAGTGTATCAAGTATATAAGTAGGACTTCAAGCATATCAAGTGTATTTAATCAATCGAGTGTGTATCAATCAAGAATACTAAGTGTATATGCAGTACATCAGGTGTATCAAACATATAACTTACATATCAAGCCTATCAAATCTGTTGAGTGTACCAATGAAGCAAAACAAGTTTGTTAGCAAGATATCAAGTGTATTAAACTGATCAGTAAAACATTTAACTGTATCAAGAATATAAAAAAGAATCAAGAATAATAAGAAGTATTGTGTATCAAGGTGTTTCAAGTGTATCAAAGAGAATTCAATATATTAAAGAGTATTATGGTTTATGCATCGAGTGTATCAAAGAGTATCACGGTTCATTAAGTGTATCAAGGTCCAAAAGTTTTCAAGAAGTATCAAATATATATCAAGTGTATCAATTGTGTCAAAGGATATTAGGTGTATCTGGTATATCAAATATGTATTAGTAGCAAAGACATTAGTGACATTTTTACATTTTGTATATGTTGATTATATTTTGTTTTTGTCATTTTTGCAAACATTAAGTATGTCATATGAACTTAATTATTATAACTTGATTTGTTTTTTTATGAGTGTTCGTCCTAATAAGATAAGTTATTTAAAAATAATAATAGATGACATAAATTATAAAATAAATAATTATTAGTATAAAAAAAGATTGAAAGCAAGAGAGTGAATGGACCCAGAAGTCACAAAATTAAATGTTTAAGTAATTATGTATTTATTTTTTGTTTGTTATCGTTTTTTATGTTTGTTATCGTTTATTAGAGTAGTTGAAGGGACATCAAATTAAATGTTGTGATCTTTCATTCAATAGTTTAATTAGTATAAATGGAGTTGTAATTTTTAAATTTAAAAAAAAAAAATTTGGATGAATGAAATTTGAAAATTCTAAAATGTGGAATTTTGTTCTTGTGTGTATTTTTTATATAAAATGCATGAATATTTGCAGCCTTTAAGTGAGAATTGATCTGTCTTGTTTGTGGAGTGCTTTGAAGATCGATGATCGATGAGAGTTTCTAACTTTGTCTAATCCTTGGTTTGTTAGATCATCTAAGTAATTCAATCTAGTCTACCTTAAGGGTTGAAATCAAATTGATTTTAGGGCTATTGGAGTTGTGTTATTTGAGTGTTGTTGTCTAACATGATTCTTAGATCCAATGTCCAAGGGTTTCTTTGAAGGGATAAAAGCCCTCTTGGCAGCGGAAGATTCTACAGAACCATTACTTAATTTAATTTGAAAATCTCAAAATACCAGTACATTGACAAAGATTTAGAATCAAAATTCTAAATTAAAAACTAAGCATGCTTTTAATTTAAAAATTGTAGAGAACTTACATTCATTGACGTCTCTGAATCTACGAATTAATTCTCCAAATTTGGATACTACCGGTCGGAGAATTCTCTATCCTCTAAGATAAGATTGATTTGTGAGAATTAATTAGGATGGGAAAAAATTTAGAGGTATTTAAGAGAAACTCTTTTCTTTTTGCATAGAGCAAAAATATTGACTTTTTTTCTTGATTAATTCGTTAAAGAAAAACGGATTTCTTTTAGATATTTATAATTCTCTTTCCTTCTTGGAATAGGAAAAGGAATCGAAGAGAATCATGAGATTTTATTATCAAATCCACTAATTAATTAACCATTAATCAATTAGTTAATAACTAATTAAATCATATTTAATTAATATTTCATTCAAATCTTATTTGAATGAATATCTCTCCAATATCTTATACATCTATATTAATATAATTAATTAATATTTCATTCAAATTTTATTTGAATGAATATCTTTCTAATATCTTATAGATTTATATTAATATAATTAACTAAATCATATTTAATTAATATTTCATTCAAATCTTATTTGAATTACTATCTCTCCAATATCTTATTAAATAAAACAAAACTATTAATTAACTCTCCAATTAATTAATAGCTAAATTAAATATCTTATATGTAACTTAAATTAAATTTGAATCATATTCAAATATAATTTTTCTCTCATGGATAACTTTAATTTGAATCTAATTTACATTAAATTAATATTTAAACTCATTCAAATATTTTATCTCTCATAAATTAATTTTGAATCTTATCCAAAATTAAATTTATATAATAAAGTTTGATAAACTTTATATTATAATGTATTACTATACATTATACTAATTCTCAAAGTAAATTTGAACATTTCAAATTACAACCCATATAAATAAATATCATTATCCTTTATGAGCTAGAAATGAGACCTAATAGACTTACAGATCAGAAGCTACAACGATATGAGATTAATTGTTTAAACTCATTAACCACATTAATCAATATTCATTAACTGTGTGTACACTCCACTAAAGACTCACAGTTGAACTATTCTCACATTAGATATATTTTTGTGTCCACGAATATAGACTAATAATAGTAAGTTAGTCTTTCACGAGTGTTCGCAACACCAGCTGGATCAATTTATCATTTTACCCATGGGTTACCTCTAATCCTTAAATACCAGTGCTCCTCCAATGAACAACCTGTTTATGGTCCTACCAATAAATAAAAACCTCTCTCATGGCATAGAGAGGGTAGGGCCCTTTGTTCAAGACATGGACACACCATTTAAGGAAACACTCAGCTACTTACCCTGAAGTAGGGAAAGAGTGAATTTCATATTGTGTAATTCTGTTCCCAGCTCCCCAATCAGTCTTTTCCCCAAAATGATAAGCTTCTTGAGTTAACGATCTGACCACTCTTACCCGTACAAATCAAAGAACAATCCACCGTGAATAGGAGTTCATAATACACTCAGGATTAAGACTAAGTTACATAGGTCATTCTAGTGAAATAGAAACCTAACTAGTTAACAGAGTTACATCTAGTGGTTACGCATTCGCGGTCTGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAAGATACTCTCACTCGTATGTCAACTACATGAATGCGTTGGATCATTGTGTTTATATGAAATACAAAGTTAGCCGTATCCATAGTGTTACTAGGATAAGGTACCAAACCTTATCCCTATACTATAAACCATTTAAGCTGATCTCGAACATTGATCCCTGTATGTCTCTACATATTGTTCAAGACTCATTAAACAGGTTAGGATGTTAGTTTATTTGATTTGAGTTATTAAGAAAAAACTAATAATTTAATCAAGAATAATTATTACAACAATAACACTTTATTAATAACGGTTAATGGATTATATTTAAAATCTACGAGTTTTAGGACATAAATCCCAACAAACTCCCACTTGGACTATAACTTTAGGCTCTTTGGAATATACATAGTAAAATAATCCTCTGACATTGGAAATGGTAAAATGTACAAGTATATTACATAAAACATATATATATACATATATACAAATACAATACACTAGGACATCCTCATACCCATTGCACATCTCACACTTGCCCTAGATTACCTAATGTACATATTTCGTAGACCTAGACTTTCTAGATGATCCTCGAACACTTTAGCCGTGAGAGTCGTTGTAAATGGATCAGCAATGTTGTGCTCCAAAGCGATCTTTGTGACGATCACATCACCTCTTTGCACAATCTCCGGTATCAAATGATAATTCCTTTCTACCCGTTTTCCTCATTTGTGGTTGCGAGGTTCCTTTGAATTGACTGCTGCCCACTGTTATAACAATATAAAGTGATGGGCATGTTTATGATAGAACTAAGTCATGCACAGCGGAAAAAGAATCGAATTTCTACCCTAATTGCCACAATTAACATGTAACCATAAACTAATCAAATTAGGGTTTTAAGAAGTATTACCTTTGAAGCTTACAAAAGGTTTGATGTCTTCTTACCAATTCTACCCGAGACCACCACTAGTACTCAACTGCTATCCTCTAGACAAAGAACCGGGTTGTGGGACCCAATTTTGGTGTAGAAA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BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_022729317.1 (armadillo repeat-containing protein 7 isoform X1 [Durio zibethinus]) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 5.5e-27 Identity = 65/87 (74.71%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_022729318.1 (armadillo repeat-containing protein 7 isoform X2 [Durio zibethinus]) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 5.5e-27 Identity = 65/87 (74.71%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: XP_017627539.1 (PREDICTED: armadillo repeat-containing protein 7 isoform X3 [Gossypium arboreum]) HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 9.5e-27 Identity = 64/87 (73.56%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. NCBI nr
Match: PPD96897.1 (hypothetical protein GOBAR_DD06098 [Gossypium barbadense]) HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 9.5e-27 Identity = 64/87 (73.56%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. TAIR10
Match: AT5G37290.1 (ARM repeat superfamily protein) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 4.4e-10 Identity = 46/145 (31.72%), Postives = 69/145 (47.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5SCW5|A0A2P5SCW5_GOSBA (Uncharacterized protein OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=GOBAR_DD06098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 6.3e-27 Identity = 64/87 (73.56%), Postives = 78/87 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A061GXH2|A0A061GXH2_THECC (ARM repeat superfamily protein isoform 3 OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_041735 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 4.1e-26 Identity = 63/87 (72.41%), Postives = 77/87 (88.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A061F372|A0A061F372_THECC (ARM repeat superfamily protein OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_026566 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 5.3e-26 Identity = 61/85 (71.76%), Postives = 74/85 (87.06%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A251Q039|A0A251Q039_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_3G143200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 2.0e-25 Identity = 62/83 (74.70%), Postives = 73/83 (87.95%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G019560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P2JC85|A0A2P2JC85_RHIMU (Uncharacterized protein MANES_02G134600 OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 118.2 bits (295), Expect = 1.4e-23 Identity = 58/85 (68.24%), Postives = 72/85 (84.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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