CmaCh01G002610 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGCACGTATTCCATAGCGTCGAGGTACGTCTTGGCTTTCTTATGTAACGTTGAGATGCTCTTCTATAATGCCTCAATGCTACTCTCGTGGGTAGAATAGCTCGAGTGTTACAAAGTCAAACATCTAGTTGTTCTAGGAGCATTGAGAAGCTCTCCTATTTTTTGTCTCGAGCTCCACTAAAGACGTCACAACTTGTATGGTATCATCAAGCCATAAATTATAGCCTACTCATCATAAAGTTTGTAAGTAATAGACATGTGCAAGAAAAGCGTATCAACGAAGGCTCAAAGATAAAATTTATAATCTTTTTATACCTTTTCAAGGGTCGTTTTCAAAGCTATCGTGTAATTGGTTTCTTCACACGAAAAAATGACTTTAGGTACCTTTCACAAATAAGACGATATAATTGATTTAAGTAAAACATGCATAACCATGAATTTCCAATAATTGGTATATGCAGTAACTTTCATTTCTAAGTCTTTCTTAGTCATCATATCATCATATCACTCTTAGTTGAATGTGGTCCCAGTTCTCACCGAAAAATAAAGGTGCACCTTATTGATCTAGGTAGTAAATATTTTTTTATTAAATAAATAGCACTTTTTTTGTGATTTTTTAAATTAAATTACAATTTTAAATTTTTTTAGTGACTAGACTTATTCCTATCAATAAAACTTATATATTAAATATATATATATATATTAAAAAAATTTAAAGACTAATGTATCAAATTAAAAAAAAAAAAAATCAAACTCAAAATTTAGAAGAGAAAATATAATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTAAAAATATCGTTATTTAGTGTGAGCATTGCTTTAATGATATTGAAACAATATTGACAAATAAATATATAAAAAATCTATTAATTTTAAAATTTATGTGAAATAAAATTAATTAATTTTAGAAAATTATGAAAAAATTAGACACAAATATAAAAGTTAGGGACTAGATATGTAATTTCACTTTTTTTTTTAAACCTTTTTGTCCAATACGACAATATTTTACCTTAATTAATTAGAATAAAAATTTCTTAATTGCCATATATTTGTTAAACGACGTCGTTCTGTCTAACAAGTAGATTTATAGGTAGCAAACATAAAAATGACGTTCTATTTCTTTGAAGAATTTTCAAAGCAATATAATAATTCTTTTTTATTTTTACAAAACATATATAAATATTAAAATTTTCACTGTGTAAATTCTCCACAATTTTATTTTAAATCTTTAATTTAAGTACTTTTTCATCTATACTTAATTTTTATATCTTTAATAAATCTTAAAAATAAAAAATATATCTTTATTAGTGTTTACTATAATTTTTTTATTTAATTAATTTTCAAAATTATTAAAAATACGAGAACAAAATATAGACATTAAAAAGTACAAAGATTAAAATACAAAAAAAAAAAAAAACTAAGAGTCGATGATTTTTCTTTTCTATTTCAAACTTTTTTTAATTAAAAAAACGTTCGAGTAAGTAGCCATACAGTGTCACATGGCCACTAACTAGCCTGGTACTTGAGAAGATGGAAAAAAAAATATAAAAAATAAATAAAATTAATATTAATAAGCCATGAATTAAAGGAAATTTAATTTTGAAGTTATAATATGTTTTGATGGTACAGATTTAAAATTGATTATCCACATGGGAGATCAAGAGAACCATTTTAATAATTTTATATTTTAGTATATATTATATACTTTTAAAAATTAATTAATATTCGGTATATTTTGAAAATTTGAAGACCAAAAGTGAAAATATCAATTAACAATTGTCACTGTTTCAATTTGGATGACATCATTCTTAACTGTTGTTGTATAATAATGACACTCTAGACTGACTTTGTAATTAACGGTTGTCGTATATAGTCTAAGATGATGGTAAAAGAGTCCTGAAATACGTTTAAATTATGTGAGTTTGATCATATGTGAAGTACTGGAAAATAATGTTAATGTTCGTTTTTTGTGTAATGATTACGTTATTGAATAAGAAAGTCGTTCATTAATGAATTTATTAAATGAGAAAATAGTTTACCGACAGTAGAATTATTTAATCGTTGAGTAAATCAGTTAAAGGCACTCAAATTTATTTTTTATTATTTATTTTTATTATTATTATTATTATTGTCTTGGCTCAATCTTAAGTCACGTTCTTAAGTGAAAAATAAATAAAATTAATTTTAATTTCCATATTATTTTTTACCCGAAAAAAAAAAAAAAAACAATTTATTTATTCAATTATTGATTTTGGGTAAGTGGGGCAAGTGGGGCTGCCCGAATTAAATCGGCTGCCGCCCACCAACAGTAAATCCGACAGTAAAAACACTCCACATCAACCCAGCTAGGAATTCCGACATATTTTCCTTAATTTTTTTTTGTTTCCTTTTTTTTTTTAAATGATAATGGTTATTATTTATTATTATTAGTTCAATGACGGTGCATTCAACCTACATTATGCTCTATTTAACTCTACCTTTAACTTTAATTTCCTCCTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATAATAGCTTTGGCCCATTATGAATTCACCTCTAAAAAATGTTAGATTCTAATATTTTATTTTTTTAAAACATTTTTAACTTAATAAAAAAATTCAATTCAATTTGAATAGATCCACTTAGTAAAAGAAATATTAACATTAAAATATGGTTTTGATTTACTTATGTGAACATGTGGGCGCATGCCACTCGGAATACATAGATATTGTTGATGAGTTGTATTTTATATGTCAAGCCGTATTCAAGTGGCTCTATATATGATAATAATAATAATAATAATTAAATAATATACAATGTTTAAGTTAAACAATTTCAATTTTTTTTTATTTTTTTTGTGAAATGTTCTTATTAATAGACACGATAAATTTTTGCTTAATTTTATTAATTATTTAATTTTAAAATAACTAATATATCATTGTTTTCTTTAGAAAAAAATGGCACAAATCACTCTTAATTTAAATATAAAATCTAAATTGAATAAAATATTAGAAATTTGTAATGTTTCATGACTAAAAATAAAGTATATATTTAAAATATAATAAAAATGAAAATATTATATTGAATAAATTGCAAACAAATGTTTATGATAAAATACGATAATTTGATTGGTTGTTGAAGACGTTTAGAAAAGTAACGGTCCATTTATTTTATTATTTTTCTTCAAATAATTGAGTCATCATTAATCGAATAAAAATTCTTTACTAAGTCCAATGTTTTGAGTCGGTCCACTTTCATTGATATGAAACATTATTATTTATTTTTTATATTTTTTCTTTTTAAATTTTAATTTTGGTGAGAATTTACGGATCTAATTCAACGTAATTATAATTTTTTTTGGATGGTTTGGTTAAGTCATTTATTCATAATTTTATTTTCAATAAAAATAAAACGTTAATTCATAAAACATTTATTTATTTATTTTTAACGATGTATTTTAGGTTTATTTTTCTAGAAAAATCTTCTTAAAGGAGTAATTAAAAAATAACTAATAAAAAATTATTATAAAATTAAATAAAAATATGTATATATATTTGCGCAAATATGTAAAAATTAACCATAAATTTAGGTTAATTCGATTTAATTTAATTTAGTTTTAATAGAATCTACGAACTCAGCCCAATTCGTATGATCGAGTTGATTAATTTTTTCGCATGCTATTGCTTAAATTTTTCATTCAATATATTTTAAATAAAATAAATAAAAACAGCAATTTTAATATTTTATTTGATTGTAACGCGCATTTTATTTTCTAATTAAGTTTAAACAAAAAATAATTATATATTAATCTGAAAAATTAAAAAAAGGGAAGGAAATTAAACAGGGAAATATAGGTTTTAGAAAAAGAAGTAAATAAATAAAGAAAAGCGCGAAGCAGAGGATAACTACCCTCCCTCCGGTACAAGCAACGCAAAGGGCATCTTTTGAGGCATTGGGAGAGGGAGGGTCACGCGGTGTTGCTGTGCTGGGCCCCACCATTTTGCTTCTCTCTCTTCATTCCTTTTCTTTTATTAAAAATAAATAAATATCAATAATAATTCAATTAATTTGTTTTTTTCTTGTATAAAGATTTGAAATTTGACTTTGATTCTAAAATTTTTAAGATTATTATTATTATTATTATTTAAAAAAATTTGTAACAGACTCGAACTTAATTTTTTTTAAAAAAAATTAATTTTTAGTTTTACGGTGGATAGATTATGTGAGTGATGGAAAGAAGTAGCTCATAGTTTAATCTTTCATGTGATGAATTAGCTCTTACAATTACCAAATCTTTACCATCACTACTCCCACTTCCAACACCCAATACGAATCAAAGCCCACACGCTTTTCCATTCATTCATTTCGTCATCGCCTCTCATCTTCCCCTTTTCTCCTATATCTCCGACGGATTTCTGGCGGCCGATCTCTGTTGACTCCACTCGGTATTCACTTACTCTCTTTAATTTTGCTTTCTTTCTGATTTCTCGCTTTCTGGGTCTCCATATCTCAGTGTTCTTCACATGGGTTTCTGTTTTTTGGGCTATTCAATCACTTCACCCCATTGCTTTTTGA ATGATGCACGTATTCCATAGCGTCGAGCTCTTACAATTACCAAATCTTTACCATCACTACTCCCACTTCCAACACCCAATACGAATCAAAGCCCACACGCTTTTCCATTCATTCATTTCGTCATCGCCTCTCATCTTCCCCTTTTCTCCTATATCTCCGACGGATTTCTGGCGGCCGATCTCTGTTGACTCCACTCGGTATTCACTTACTCTCTTTAATTTTGCTTTCTTTCTGATTTCTCGCTTTCTGGGTCTCCATATCTCAGTGTTCTTCACATGGGTTTCTGTTTTTTGGGCTATTCAATCACTTCACCCCATTGCTTTTTGA ATGATGCACGTATTCCATAGCGTCGAGCTCTTACAATTACCAAATCTTTACCATCACTACTCCCACTTCCAACACCCAATACGAATCAAAGCCCACACGCTTTTCCATTCATTCATTTCGTCATCGCCTCTCATCTTCCCCTTTTCTCCTATATCTCCGACGGATTTCTGGCGGCCGATCTCTGTTGACTCCACTCGGTATTCACTTACTCTCTTTAATTTTGCTTTCTTTCTGATTTCTCGCTTTCTGGGTCTCCATATCTCAGTGTTCTTCACATGGGTTTCTGTTTTTTGGGCTATTCAATCACTTCACCCCATTGCTTTTTGA MMHVFHSVELLQLPNLYHHYSHFQHPIRIKAHTLFHSFISSSPLIFPFSPISPTDFWRPISVDSTRYSLTLFNFAFFLISRFLGLHISVFFTWVSVFWAIQSLHPIAF
BLAST of CmaCh01G002610 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L9D4_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G664540 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.8e-10 Identity = 40/54 (74.07%), Postives = 41/54 (75.93%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh01G002610 vs. NCBI nr
Match: gi|700203397|gb|KGN58530.1| (hypothetical protein Csa_3G664540 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 5.4e-10 Identity = 40/54 (74.07%), Postives = 41/54 (75.93%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |