Csa1G004360.1 (mRNA) Cucumber (Chinese Long) v2 | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	Csa1G004360.1
Type	mRNA
Organism	Cucumis. sativus (Cucumber (Chinese Long) v2)
Description	Unknown protein
Location	Chr1 : 826445 .. 828712 (-)
Sequence length	2268

Genome Viewer

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS

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ATGGGCATGTTGATTGGCTCTTGCTCTCGCTCATTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCACTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCACGGTCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCTCAGGTCGATTTGA

mRNA sequence

ATGGGCATGTTGATTGGCTCTTGCTCTCGCTCATTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCACTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCACGGTCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCTCAGGTCGATTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGCATGTTGATTGGCTCTTGCTCTCGCTCATTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCACTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCACGGTCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCTCAGGTCGATTTGA

Protein sequence

MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI*

Homology

[Close]

BLAST of Csa1G004360.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LRG2_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G004360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1392.5 bits (3603), Expect = 0.0e+00
Identity = 755/755 (100.00%), Postives = 755/755 (100.00%), Query Frame = 1


Query: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60
           MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS
Sbjct: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60

Query: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120
           RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL
Sbjct: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120

Query: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180
           VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS
Sbjct: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180

Query: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240
           SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS
Sbjct: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240

Query: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300
           YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS
Sbjct: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300

Query: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360
           PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH
Sbjct: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360

Query: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420
           DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP
Sbjct: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420

Query: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480
           SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS
Sbjct: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480

Query: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540
           RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS
Sbjct: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540

Query: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600
           LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL
Sbjct: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600

Query: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660
           SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR
Sbjct: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660

Query: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720
           PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH
Sbjct: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720

Query: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 756
           DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI
Sbjct: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 755

[Close]

BLAST of Csa1G004360.1 vs. NCBI nr
Match: gi|700208473|gb|KGN63569.1| (hypothetical protein Csa_1G004360 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 1392.5 bits (3603), Expect = 0.0e+00
Identity = 755/755 (100.00%), Postives = 755/755 (100.00%), Query Frame = 1


Query: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60
           MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS
Sbjct: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60

Query: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120
           RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL
Sbjct: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120

Query: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180
           VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS
Sbjct: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180

Query: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240
           SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS
Sbjct: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240

Query: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300
           YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS
Sbjct: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300

Query: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360
           PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH
Sbjct: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360

Query: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420
           DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP
Sbjct: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420

Query: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480
           SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS
Sbjct: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480

Query: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540
           RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS
Sbjct: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540

Query: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600
           LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL
Sbjct: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600

Query: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660
           SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR
Sbjct: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660

Query: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720
           PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH
Sbjct: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720

Query: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 756
           DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI
Sbjct: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 755

[Close]

BLAST of Csa1G004360.1 vs. NCBI nr
Match: gi|929309121|ref|XP_014032191.1| (PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar])

HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 8.7e-22
Identity = 156/394 (39.59%), Postives = 182/394 (46.19%), Query Frame = 1


Query: 50  LVRLLSPSTFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLA 109
           ++ LLSPS  S S +S  PR  SLA  SL A  L SL   LSPS  S S     PR S+ 
Sbjct: 136 VIELLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLASL---LSPSLLSPSPRCSVPRCSVP 195

Query: 110 RSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS---YRPRP---SLARSSLIALDLLSLVRLLSPS 169
           R S+  L   SL  LLSPS  S S +S     P P   SLA  SL A  L +        
Sbjct: 196 RCSVPRLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLAA-------- 255

Query: 170 TFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLL--SLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAL 229
                        SLA  SL A  L   SL  LLSPS  S S  +     SLA  SL A 
Sbjct: 256 ------------QSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLAA----QSLAAQSLAAQ 315

Query: 230 DLLSLV--RLLSPS-TFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIAHDLL--SLVRLLSPTTFSRSFV 289
            L SL+   LLSPS   S S +S  PR  SLA  SL A  L   SL  LLSP+  S S  
Sbjct: 316 SLASLLSPSLLSPSLLLSPSLISPSPRCQSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSPR 375

Query: 290 SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSP-TTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLL--SLV 349
              PR S+ R S+      S+ R   P  +  RS V     P LA  SL A  L   SL 
Sbjct: 376 CSVPRCSVPRCSV---PRCSVPRCSVPRCSVPRSSVPRCSVPRLAAQSLAAQSLAAQSLA 435

Query: 350 RLLSPTTFSRSFV---SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLV--RLLSPTTFSRSFVSYRPRPS 409
            LLSP+  S S +   S    PSL +  L A  L SL+   LLSP+  S S +S    PS
Sbjct: 436 SLLSPSLLSPSLLLSPSLLLSPSLLQ-YLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSTSLLS----PS 493

Query: 410 LARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 421
               SL++   LS   LLSP+  S S ++  P P
Sbjct: 496 QLSPSLLSPSQLS-PSLLSPSLLSPSLLTVPPTP 493

[Close]

BLAST of Csa1G004360.1 vs. NCBI nr
Match: gi|929309121|ref|XP_014032191.1| (PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar])

HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 1.5e-21
Identity = 154/394 (39.09%), Postives = 182/394 (46.19%), Query Frame = 1


Query: 120 LVRLLSPSTFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLA 179
           ++ LLSPS  S S +S  PR  SLA  SL A  L SL   LSPS  S S     PR S+ 
Sbjct: 136 VIELLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLASL---LSPSLLSPSPRCSVPRCSVP 195

Query: 180 RSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS---YRPRP---SLARSSLIALDLLSLVRLLSPS 239
           R S+  L   SL  LLSPS  S S +S     P P   SLA  SL A  L +        
Sbjct: 196 RCSVPRLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLAA-------- 255

Query: 240 TFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLL--SLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 299
                        SLA  SL A  L   SL  LLSP+  S S  +     SLA  SL A 
Sbjct: 256 ------------QSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLAA----QSLAAQSLAAQ 315

Query: 300 DLLSLV--RLLSPT-TFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIAHDLL--SLVRLLSPTTFSRSFV 359
            L SL+   LLSP+   S S +S  PR  SLA  SL A  L   SL  LLSP+  S S  
Sbjct: 316 SLASLLSPSLLSPSLLLSPSLISPSPRCQSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSPR 375

Query: 360 SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSP-TTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLL--SLV 419
              PR S+ R S+      S+ R   P  +  RS V     P LA  SL A  L   SL 
Sbjct: 376 CSVPRCSVPRCSV---PRCSVPRCSVPRCSVPRSSVPRCSVPRLAAQSLAAQSLAAQSLA 435

Query: 420 RLLSPTTFSRSFV---SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLV--RLLSPTTFSRSFVSYRPRPS 479
            LLSP+  S S +   S    PSL +  L A  L SL+   LLSP+  S S +S    PS
Sbjct: 436 SLLSPSLLSPSLLLSPSLLLSPSLLQ-YLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSTSLLS----PS 493

Query: 480 LARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 491
               SL++   LS   LLSP+  S S ++  P P
Sbjct: 496 QLSPSLLSPSQLS-PSLLSPSLLSPSLLTVPPTP 493

HSP 2 Score: 56.6 bits (135), Expect = 2.2e-04
Identity = 75/215 (34.88%), Postives = 104/215 (48.37%), Query Frame = 1


Query: 470 LVRLLSPTTFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 529
           ++ LLSP+  S S +S  PR  SLA  SL A  L SL L   LLSP+             
Sbjct: 136 VIELLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLASL-LSPSLLSPSPRCSVPRCSVPRC 195

Query: 530 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLL-VLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIA 589
             P LA  S +SL++  LLS  LL   LLSP+   +S  +  S   +   A+S  +  +A
Sbjct: 196 SVPRLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSPSLLSPSPRCQS-LAAQSLAAQSLAAQSLAAQSLA 255

Query: 590 HDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLL--SLVLLVLLLS 649
              L+   L  LLSP+  S S  +        SLA  S +SL++  LL  SL+L   L+S
Sbjct: 256 AQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLAA--QSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLLLSPSLIS 315

Query: 650 PTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLS 681
           P+   +S  +        SLA  S +SL++  LLS
Sbjct: 316 PSPRCQSLAA--QSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLS 344

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Csa1G004360.1 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0LRG2_CUCSA	0.0e+00	100.00	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G004360 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Csa1G004360.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|700208473\|gb\|KGN63569.1\|	0.0e+00	100.00	hypothetical protein Csa_1G004360 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|929309121\|ref\|XP_014032191.1\|	8.7e-22	39.59	PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar]	[more]
gi\|929309121\|ref\|XP_014032191.1\|	1.5e-21	39.09	PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar]	[more]

GO Annotation

GO Assignments

This mRNA is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
Csa1G004360	Csa1G004360	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Csa1G004360.1	Csa1G004360.1-protein	polypeptide

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Csa1G004360.1.cds1	Csa1G004360.1.cds1	CDS