Csa1G004360 (gene) Cucumber (Chinese Long) v2

Overview
NameCsa1G004360
Typegene
OrganismCucumis. sativus (Cucumber (Chinese Long) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationChr1 : 826445 .. 828712 (-)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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ATGGGCATGTTGATTGGCTCTTGCTCTCGCTCATTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCACTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCACGGTCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCTCAGGTCGATTTGA

mRNA sequence

ATGGGCATGTTGATTGGCTCTTGCTCTCGCTCATTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCACTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCACGGTCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCTCAGGTCGATTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGCATGTTGATTGGCTCTTGCTCTCGCTCATTCTTCTCTTCTCTTCTTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCACTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCTCGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCGTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGTTCTTCTCGTTCTTCTCTTATCGCCCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCACGGTCACGACCTTCTCTCGCTCGGGCGCTCAGGTCGATTTGA

Protein sequence

MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI*
Homology
[Close]
BLAST of Csa1G004360 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LRG2_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G004360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1392.5 bits (3603), Expect = 0.0e+00
Identity = 755/755 (100.00%), Postives = 755/755 (100.00%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60
           MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS
Sbjct: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60

Query: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120
           RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL
Sbjct: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120

Query: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180
           VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS
Sbjct: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180

Query: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240
           SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS
Sbjct: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240

Query: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300
           YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS
Sbjct: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300

Query: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360
           PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH
Sbjct: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360

Query: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420
           DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP
Sbjct: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420

Query: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480
           SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS
Sbjct: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480

Query: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540
           RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS
Sbjct: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540

Query: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600
           LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL
Sbjct: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600

Query: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660
           SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR
Sbjct: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660

Query: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720
           PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH
Sbjct: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720

Query: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 756
           DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI
Sbjct: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 755

[Close]
BLAST of Csa1G004360 vs. NCBI nr
Match: gi|700208473|gb|KGN63569.1| (hypothetical protein Csa_1G004360 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 1392.5 bits (3603), Expect = 0.0e+00
Identity = 755/755 (100.00%), Postives = 755/755 (100.00%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60
           MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS
Sbjct: 1   MGMLIGSCSRSFFSSLLLLSPSTFTRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFS 60

Query: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120
           RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL
Sbjct: 61  RSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSL 120

Query: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180
           VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS
Sbjct: 121 VRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARS 180

Query: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240
           SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS
Sbjct: 181 SLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS 240

Query: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300
           YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS
Sbjct: 241 YRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLS 300

Query: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360
           PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH
Sbjct: 301 PTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 360

Query: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420
           DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP
Sbjct: 361 DLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 420

Query: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480
           SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS
Sbjct: 421 SLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFS 480

Query: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540
           RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS
Sbjct: 481 RSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSS 540

Query: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600
           LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL
Sbjct: 541 LIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLL 600

Query: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660
           SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR
Sbjct: 601 SPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 660

Query: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720
           PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH
Sbjct: 661 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAH 720

Query: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 756
           DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI
Sbjct: 721 DLLSLVLLVLLLSPTTFSRSGARSRPSLARALRSI 755

[Close]
BLAST of Csa1G004360 vs. NCBI nr
Match: gi|929309121|ref|XP_014032191.1| (PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar])

HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 8.7e-22
Identity = 156/394 (39.59%), Postives = 182/394 (46.19%), Query Frame = 1 

Query: 50  LVRLLSPSTFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLA 109
           ++ LLSPS  S S +S  PR  SLA  SL A  L SL   LSPS  S S     PR S+ 
Sbjct: 136 VIELLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLASL---LSPSLLSPSPRCSVPRCSVP 195

Query: 110 RSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS---YRPRP---SLARSSLIALDLLSLVRLLSPS 169
           R S+  L   SL  LLSPS  S S +S     P P   SLA  SL A  L +        
Sbjct: 196 RCSVPRLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLAA-------- 255

Query: 170 TFSRSFVSYRPRPSLARSSLIALDLL--SLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAL 229
                        SLA  SL A  L   SL  LLSPS  S S  +     SLA  SL A 
Sbjct: 256 ------------QSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLAA----QSLAAQSLAAQ 315

Query: 230 DLLSLV--RLLSPS-TFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIAHDLL--SLVRLLSPTTFSRSFV 289
            L SL+   LLSPS   S S +S  PR  SLA  SL A  L   SL  LLSP+  S S  
Sbjct: 316 SLASLLSPSLLSPSLLLSPSLISPSPRCQSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSPR 375

Query: 290 SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSP-TTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLL--SLV 349
              PR S+ R S+      S+ R   P  +  RS V     P LA  SL A  L   SL 
Sbjct: 376 CSVPRCSVPRCSV---PRCSVPRCSVPRCSVPRSSVPRCSVPRLAAQSLAAQSLAAQSLA 435

Query: 350 RLLSPTTFSRSFV---SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLV--RLLSPTTFSRSFVSYRPRPS 409
            LLSP+  S S +   S    PSL +  L A  L SL+   LLSP+  S S +S    PS
Sbjct: 436 SLLSPSLLSPSLLLSPSLLLSPSLLQ-YLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSTSLLS----PS 493

Query: 410 LARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 421
               SL++   LS   LLSP+  S S ++  P P
Sbjct: 496 QLSPSLLSPSQLS-PSLLSPSLLSPSLLTVPPTP 493

[Close]
BLAST of Csa1G004360 vs. NCBI nr
Match: gi|929309121|ref|XP_014032191.1| (PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar])

HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 1.5e-21
Identity = 154/394 (39.09%), Postives = 182/394 (46.19%), Query Frame = 1 

Query: 120 LVRLLSPSTFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVSYRPRPSLA 179
           ++ LLSPS  S S +S  PR  SLA  SL A  L SL   LSPS  S S     PR S+ 
Sbjct: 136 VIELLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLASL---LSPSLLSPSPRCSVPRCSVP 195

Query: 180 RSSLIALDLLSLVRLLSPSTFSRSFVS---YRPRP---SLARSSLIALDLLSLVRLLSPS 239
           R S+  L   SL  LLSPS  S S +S     P P   SLA  SL A  L +        
Sbjct: 196 RCSVPRLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLAA-------- 255

Query: 240 TFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLL--SLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAH 299
                        SLA  SL A  L   SL  LLSP+  S S  +     SLA  SL A 
Sbjct: 256 ------------QSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLAA----QSLAAQSLAAQ 315

Query: 300 DLLSLV--RLLSPT-TFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIAHDLL--SLVRLLSPTTFSRSFV 359
            L SL+   LLSP+   S S +S  PR  SLA  SL A  L   SL  LLSP+  S S  
Sbjct: 316 SLASLLSPSLLSPSLLLSPSLISPSPRCQSLAAQSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSPR 375

Query: 360 SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLVRLLSP-TTFSRSFVSYRPRPSLARSSLIAHDLL--SLV 419
              PR S+ R S+      S+ R   P  +  RS V     P LA  SL A  L   SL 
Sbjct: 376 CSVPRCSVPRCSV---PRCSVPRCSVPRCSVPRSSVPRCSVPRLAAQSLAAQSLAAQSLA 435

Query: 420 RLLSPTTFSRSFV---SYRPRPSLARSSLIAHDLLSLV--RLLSPTTFSRSFVSYRPRPS 479
            LLSP+  S S +   S    PSL +  L A  L SL+   LLSP+  S S +S    PS
Sbjct: 436 SLLSPSLLSPSLLLSPSLLLSPSLLQ-YLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSTSLLS----PS 493

Query: 480 LARSSLIAHDLLSLVRLLSPTTFSRSFVSYRPRP 491
               SL++   LS   LLSP+  S S ++  P P
Sbjct: 496 QLSPSLLSPSQLS-PSLLSPSLLSPSLLTVPPTP 493


HSP 2 Score: 56.6 bits (135), Expect = 2.2e-04
Identity = 75/215 (34.88%), Postives = 104/215 (48.37%), Query Frame = 1 

Query: 470 LVRLLSPTTFSRSFVSYRPR-PSLARSSLIAHDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYR 529
           ++ LLSP+  S S +S  PR  SLA  SL A  L SL L   LLSP+             
Sbjct: 136 VIELLSPSLLSPSLLSPSPRCQSLAAQSLAAQSLASL-LSPSLLSPSPRCSVPRCSVPRC 195

Query: 530 PRPSLARSSRSSLIAHDLLSLVLL-VLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIA 589
             P LA  S +SL++  LLS  LL   LLSP+   +S  +  S   +   A+S  +  +A
Sbjct: 196 SVPRLAAQSLASLLSPSLLSPSLLSPSLLSPSPRCQS-LAAQSLAAQSLAAQSLAAQSLA 255

Query: 590 HDLLSLVLLVLLLSPTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLL--SLVLLVLLLS 649
              L+   L  LLSP+  S S  +        SLA  S +SL++  LL  SL+L   L+S
Sbjct: 256 AQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLAA--QSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLSPSLLLSPSLIS 315

Query: 650 PTTFSRSFFSFFSYRPRPSLARSSRSSLIAHDLLS 681
           P+   +S  +        SLA  S +SL++  LLS
Sbjct: 316 PSPRCQSLAA--QSLAAQSLAAQSLASLLSPSLLS 344

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csa1G004360 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LRG2_CUCSA0.0e+00100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G004360 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Csa1G004360 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700208473|gb|KGN63569.1|0.0e+00100.00hypothetical protein Csa_1G004360 [Cucumis sativus][more]
gi|929309121|ref|XP_014032191.1|8.7e-2239.59PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar][more]
gi|929309121|ref|XP_014032191.1|1.5e-2139.09PREDICTED: proline-rich protein 36-like [Salmo salar][more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csa1G004360.1Csa1G004360.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Csa1G004360Watermelon (97103) v2cuwmbB013
Csa1G004360Watermelon (97103) v2cuwmbB078
Csa1G004360Watermelon (97103) v2cuwmbB090
Csa1G004360Wax gourdcuwgoB007
Csa1G004360Wax gourdcuwgoB059
Csa1G004360Wax gourdcuwgoB070
Csa1G004360Wax gourdcuwgoB095
Csa1G004360Cucumber (Chinese Long) v2cucuB001
Csa1G004360Watermelon (97103) v1cuwmB094
Csa1G004360Cucumber (Gy14) v1cgycuB107
Csa1G004360Cucumber (Gy14) v1cgycuB299
Csa1G004360Cucumber (Gy14) v1cgycuB475
Csa1G004360Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB048
Csa1G004360Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB086
Csa1G004360Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB209
Csa1G004360Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB402
Csa1G004360Cucurbita moschata (Rifu)cmocuB076
Csa1G004360Cucurbita moschata (Rifu)cmocuB037
Csa1G004360Cucurbita moschata (Rifu)cmocuB194
Csa1G004360Cucurbita moschata (Rifu)cmocuB390
Csa1G004360Melon (DHL92) v3.5.1cumeB019
Csa1G004360Melon (DHL92) v3.5.1cumeB054
Csa1G004360Watermelon (Charleston Gray)cuwcgB002
Csa1G004360Watermelon (Charleston Gray)cuwcgB005
Csa1G004360Watermelon (Charleston Gray)cuwcgB026
Csa1G004360Watermelon (Charleston Gray)cuwcgB081
Csa1G004360Watermelon (97103) v1cuwmB005
Csa1G004360Watermelon (97103) v1cuwmB002
Csa1G004360Watermelon (97103) v1cuwmB037
Csa1G004360Cucurbita pepo (Zucchini)cpecuB025
Csa1G004360Cucurbita pepo (Zucchini)cpecuB361
Csa1G004360Cucurbita pepo (Zucchini)cpecuB520
Csa1G004360Cucurbita pepo (Zucchini)cpecuB653
Csa1G004360Bottle gourd (USVL1VR-Ls)culsiB070
Csa1G004360Bottle gourd (USVL1VR-Ls)culsiB035
Csa1G004360Bottle gourd (USVL1VR-Ls)culsiB045
Csa1G004360Cucumber (Gy14) v2cgybcuB001
Csa1G004360Cucumber (Gy14) v2cgybcuB011
Csa1G004360Cucumber (Gy14) v2cgybcuB098
Csa1G004360Melon (DHL92) v3.6.1cumedB014
Csa1G004360Melon (DHL92) v3.6.1cumedB046
Csa1G004360Silver-seed gourdcarcuB0391
Csa1G004360Silver-seed gourdcarcuB1018
Csa1G004360Silver-seed gourdcarcuB1062