Cla97C09G174390.1 (mRNA) Watermelon (97103) v2

NameCla97C09G174390.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr09 : 11226018 .. 11238220 (-)
Sequence length538
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GACCCCAAACAAGTTGCAACAATCAAACTTGATTTTCCTAATAGTTCGTCTGTTCCTGCATGTATTAAATTTTTGTATCGATATGTTGAAAGCTTCTCAAGCATGATGCACAGAGGGTGCCCCTCAGTGATCGAGTCTTCCAAATGGGAAAACAATTTTCTTATGCCAGAGGATGTCTTGGAACTATGTGAATGGTGGAAATTTCCAATTTATGTTTATTAGTCTATGTTGGGTAAGTGACATATTTGATTATTTTATGTGTAACTATTAAAGAAATAAAAGTATTGAATTTGTTCAACGTGTGTATATAGGTTTCTTTAGAAATATTTTGAAGGGTTAGAAGTATTGAATACCTTCAAAGTAGTTGACTCAAATGACATCGCACCTTGTTTTGGGACACCGACCAATCGACAAAAGACTCTATCAATGGTCTTCTCATATTAGCCACGACAAATGATGCTCGTTCCATACAATTCGGGATAAGTGTTTACATTATTATATATTAGTTAGATTTTTATGTAACTTTTGATAAGAACGTAATCATACTTATTTTCATTCATTTTGACAGGAGACATTGGATATTGTATGTTGTTAACGTACATACAAATATAACATATATTTTAAACTCATTACACCCTACCAAGCTGGATGACCTGAAACATATTGTAAATATGTAAGTTCGTAAATATAGTTATATTTTCTATTCTTTAAGTTTGTTAAAAGTTTTGCATTTGTGTTTGGATGTTATTGTCTTTTTATTTAGGGTAATGAAAATGCATATGGCTCAAAGTATTCATTGAATACAAGAACATGCCAATATTACATGGCTTCCTATAAAGGTAAATAAAATTGAGTTATAATCAATTAACTATTAGTACGTGTTCAAAAAAAAGTCTTAATCATTGTTATTTATTTCTACGTTTCAGTGTGCTCTCGCCAAAAAAGTAGGGGAATGTGAGTATTATGTGATGAGTTCATGAGAGAGGTTTCTACATTTTAGTGCCCTTCCCAAAAACTTAGTAATAATGAATTTATTATAATATTTGTTATTTATTTACTTTGATGTAGTTTAATACTAAGAACCCTTTTAACTAAGAAGAACTCGATGAGGTCCAAGTTGAGTGGGTGGAGCATGTGTCAAACTACACTTGATTGGATTGCATGGTGCCACAATATAAGTTTGTTTGGCTTTCACTTTGAACTTTTGGTATCACTTACGCATTTTGTTTAACTTTGTTTGGTTGTAAAGTTGTCGAAGAGTGTTCTCTGGAATTTTGGTAGATCATAGGCATTGTGTTGTTTTAAAACATATTGTGTAACATTGTTTGGTTGTTTAGCTATTGGAGATGTTTTTTGCAATTTTGGTAAATCTTATACATTTTGTATGGGTTGAAACATTGATAAGCACTTGAAAAGTGCTTTTTATCCTCTCAAATTAAGGGAGTTTATATTAGATTTCACTTGTTTGCTAGTGGTTTTCAGGTTAAAATGAGGAAAATTAGAAGAAAAGACCAAAAGATCAAAACCAAGCAAGAATACGGCGAACAAGAGATGAAAAGCTCAAAATGGAAAAAATTGGGGCAACGCCGCGGCGCTAAAACCCGAGAGCAACGTTCTGAACGCATCATAGCATCGCGGCGCTAAAAACCAAGAGCAACATTCTAAACGCATCACAGCGTCGCGGCGCTGCCACGACGCTAAAACTTGAGAGCAACAATTTTGGACGCAACTCTAACGCCGCGGCGTTATGGACCAGCGCCGCGGCGCCAGTTTTCCATAAATGAAAATTTGTTATTTTTGGTAAGTTTTTGGGTGGCTAACTCTATAAATTTGGGGGTTTCTAGCAATCCTAAGCATCAATCAACCATCAATTTACAGACCTAAAGAGGCACAAGAAGAAGAGAATTGAGTGAGAGTTCATAAAAGAGTTCAAAGAGTGAGTTAGTTGCAAGGAAGAGGAAAAGAGTTTGAGATAGTCGTGGTGCCATTCAAATTCCGACGTGAGAGCCAAGGAGATCGTGACAATGCTACCTCAATCAAGAGCCTCTTTTCAGTAGAGTTTCCCTTTCTTTACACTCTTTCTTTGTTTATTTTGTTTAAACATGTTGCTTCAAGCTATGAGCGGCTAAACTCTTTAGTTTTAGGGTTTTGATGAATTATTTATGAATTTATGTTGATATTGTAGACTTTCATGGTTTTGTTTAAATGATTATGCTTTTCATTATTATTGTGTTTAATTCTTGTGGATTGGCCATCTTCACATGTTAGGTTAGATATATGATTGAGAGATTGCATGTTTAACTTGATCTATAACAATGAATTGTTGTTAATCTATCACGAGAGTAGTTAGGTTGACAATAAAAGTTGCTAAAGACTATTCTTAATGCCATGTAATTTGTATTGGTTTCAAGAAATTAGTAATCAATCGAGTTGCATGAGAAAGGGTTGTTTTTGAGAGAAAATAACTTGGAATTAAGTTTCTAAACTTAGGCATATTAATTACAATAAAATCCATGAAATCTATAATATTGCATGACGAAATAAACAAGGATTCATTACCCTAGAACTCTCTTTGACTCTTGTGTTTCTCACTTTATTACTTTCCTTATTTGGTTCATATTTTCCATAATTCACAAATTCCATTCCAATCCTTAAATAAAATTGATTCGATTCTAGAATAGCTAGGTAACATAAACCTTCACAATTGGATTTCTAGTGGAACGATATTCGGACTTCACCGTCTTATATTATAACTTGACCCGTACACTTGCGGTTAACACTAAAAGTGCGCATAAAAAATGTTGTGTAGCTCTATATTGAAATTCAATTGTGAATTGATCATCAATATTGAAATGATATGCCATTGTGTTCTTTGAAAGTTTGTCTTTGTTTTGGGATGGGTAGCGTTGATGATGCAACAAGGGTGGTGTGTATCTTTTTAGAGCCCAATCCTTCTTCTAATGAAGTTCTCGAGGATGATGCCATTAAGGAAAAGGGAGAGTTTGTGCTTTGATACCATATAACAGAAAAATGACAAGAATGACAATAATGATGCTCTCAAAATTGATACTAAGGCAATGGGTCCTATTAATCAGGAATTCAAGGAACAAGTGTCCACCATTTATTAGGTTCAAAATAACAACTTGATACATGTCCTGAAATGCATGTTTTTAACGCTCATTTTAGTATCTTTTCTTACCGAAGGTAATCTTTTGTATGTTAAAATACCCAAATTATGTTTCAAATGGATAAAATGAATGAATATGAGATCTTTAGTTGATGAAAATATAATTTTATCATTTTGGCCTGTTTTGGGAGCTTTTACATTGAGTTTTTCCTGTTTTGTAGAAACTATCTTTGATGCACTTGCATCGCCAAAATGTGATGCGCTCGCATCAAAACCCTAAATTCCAGAAATGTTAACCAGTCATCTACAAACGTGACTTACCTAGTCTCTAGCCATTTTTCAATGCCGAAATTGACTGGGTAGCTCTAGATTTGTGGATTTTGGCCCTCTCTACAAAATTTGAAGGCTATATAAAGGTGGGAAGTTTTCTCCTCAAGGACATGCTCTTCCCTCACAAATTACAGCCAGTCTTAGAAGGTTTCTATTACGCCCCCAAATTTCACACTAAACTAGAAAACATTACCAACATTTAACCTATAACTAACTTTACTATCTCTTAGAATTTATAAAAATTTCGGCAACATAACAACGCTACCCCAACAAAACCAAAATTTTACTTGAACCTGTTTCAAGGAAAAAAAAACACTCCCAATAACATTTAACTTCAAACTCTTCCCAACAGAACCATCAAAATTTCCAGAAATAATCTAAAACTCATAACTATCGACTTATTCAGATTCAACAAAACTTGCTAAGACTAACAAACTCAAACTAATGTGAAGTTCAACATACTAGATAACTAAAACTTATTACATAATTTCCAACTCAAAGGCAACCAAGACACTTTCAATTTAAAACAAAGTTCACATTCCAAATGTTTTGAAAAAATAAAATCCCAAAAAGGAAAAGAACAAAGACAATAATCTCAATGTTGATCTTAATCAAGCTCCCTTCTCTGCATCATCAAGGTTATAATGACCGTCATCACCTACAAAATTTGGTGGGGGGTCAGTACACAGTAGTACTAGTAAGTAGCTCACACTTGAAAGGCCACTAAATAGCACAAATTCATTGTAAAGGTGCACAACAACAGTAATATCAATCACATTAATACTAACTCACGAACTACATTATCATAAACAAGGCTAACATAATTTTTAATTCAACTTATCATGCTTATTTAGACATCTAAGCCTACTCCCCATAAAACTTCCTGAACGAATTACTCAAGAAATGTTGACCCCAACTGTTTGTGTCCAAGGCCATTGACATCTCTGTGCTGGCCCCAACTGACTTAATCCAAGGCCATCAATGCTCTTTGTCGACCCCATTGACTTCAACCAAGGCCACTGATGGTCTCTATAGGCCCTAACTGAGATATCTAAGGCCACCGACCTCTCTATTGGCCCCAACCAATACTATACAAGGCCACCAACCTCTCCATCGGCCCCAACTGACTCCACCAAGGGCCATCGATGTTCTCAAGAATTCTAATACTTTCCATTCTAAACTCAAGCACCGACACTAACTAGACCAAGACCATTGATGCTAATCAACAATATGTTTCATGCTTAAAACCACATAACAACATTATACTTTCAATGTTACACGTATACATCCTCAACACCTCAAACTACATTCTTATGTTCACAAGGCAACATAATAGTTTAACAACATATAATATTACATCTTATAAAAGTCAATACAAGAGCATTCCAACATACTTGGTCATATCATAATAAATCACAACATCAAGATAACATGAGTCATAAATTTACATAATGGTAATTAAATAGCGCATGATGCTAGCATACAAACAAACAAACCCAACAGGTAGAATTCTACATACCTTACCGTTCTAGAGTGTTTCTAA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mRNA sequence

GACCCCAAACAAGTTGCAACAATCAAACTTGATTTTCCTAATAGTTCGTCTGTTCCTGCATGTATTAAATTTTTGTATCGATATGTTGAAAGCTTCTCAAGCATGATGCACAGAGGGTGCCCCTCAGTGATCGAGTCTTCCAAATGGGAAAACAATTTTCTTATGCCAGAGGATGTCTTGGAACTATGTGAATGGTGGAAATTTCCAATTTATGAGACATTGGATATTGGTAATGAAAATGCATATGGCTCAAAGTATTCATTGAATACAAGAACATGCCAATATTACATGGCTTCCTATAAAGTGTGCTCTCGCCAAAAAAGTAGGGGAATGAATCATCCTCCCGACTTCTGTGCATTTCCGGTTAGGGAAGTTCGCTTTAACTCCTCATCCTTCCCGCCGGAAAACTCGACTTCCTCGCCGGAAAATGGCTCCAACCCCCGGAGGAGCTCTCATCTCTTCCAAATAACGAATGTGGTCATCCTCTTGCTCGTGGAAGGCTTGATCCTGACTGTTCCTGATCATAACTACGACCTTA

Coding sequence (CDS)

GACCCCAAACAAGTTGCAACAATCAAACTTGATTTTCCTAATAGTTCGTCTGTTCCTGCATGTATTAAATTTTTGTATCGATATGTTGAAAGCTTCTCAAGCATGATGCACAGAGGGTGCCCCTCAGTGATCGAGTCTTCCAAATGGGAAAACAATTTTCTTATGCCAGAGGATGTCTTGGAACTATGTGAATGGTGGAAATTTCCAATTTATGAGACATTGGATATTGGTAATGAAAATGCATATGGCTCAAAGTATTCATTGAATACAAGAACATGCCAATATTACATGGCTTCCTATAAAGTGTGCTCTCGCCAAAAAAGTAGGGGAATGAATCATCCTCCCGACTTCTGTGCATTTCCGGTTAGGGAAGTTCGCTTTAACTCCTCATCCTTCCCGCCGGAAAACTCGACTTCCTCGCCGGAAAATGGCTCCAACCCCCGGAGGAGCTCTCATCTCTTCCAAATAACGAATGTGGTCATCCTCTTGCTCGTGGAAGGCTTGATCCTGACTGTTCCTGATCATAACTACGACCTTA

Protein sequence

DPKQVATIKLDFPNSSSVPACIKFLYRYVESFSSMMHRGCPSVIESSKWENNFLMPEDVLELCEWWKFPIYETLDIGNENAYGSKYSLNTRTCQYYMASYKVCSRQKSRGMNHPPDFCAFPVREVRFNSSSFPPENSTSSPENGSNPRRSSHLFQITNVVILLLVEGLILTVPDHNYDL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G174390Cla97C09G174390gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G174390.1Cla97C09G174390.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G174390.1.CDS.6Cla97C09G174390.1.CDS.6CDS
Cla97C09G174390.1.CDS.5Cla97C09G174390.1.CDS.5CDS
Cla97C09G174390.1.CDS.4Cla97C09G174390.1.CDS.4CDS
Cla97C09G174390.1.CDS.3Cla97C09G174390.1.CDS.3CDS
Cla97C09G174390.1.CDS.2Cla97C09G174390.1.CDS.2CDS
Cla97C09G174390.1.CDS.1Cla97C09G174390.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G174390.1.exon.6Cla97C09G174390.1.exon.6exon
Cla97C09G174390.1.exon.5Cla97C09G174390.1.exon.5exon
Cla97C09G174390.1.exon.4Cla97C09G174390.1.exon.4exon
Cla97C09G174390.1.exon.3Cla97C09G174390.1.exon.3exon
Cla97C09G174390.1.exon.2Cla97C09G174390.1.exon.2exon
Cla97C09G174390.1.exon.1Cla97C09G174390.1.exon.1exon


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 130..149