Cla97C09G174390 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C09G174390
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr09 : 11226018 .. 11238220 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

GACCCCAAACAAGTTGCAACAATCAAACTTGATTTTCCTAATAGTTCGTCTGTTCCTGCATGTATTAAATTTTTGTATCGATATGTTGAAAGCTTCTCAAGCATGATGCACAGAGGGTGCCCCTCAGTGATCGAGTCTTCCAAATGGGAAAACAATTTTCTTATGCCAGAGGATGTCTTGGAACTATGTGAATGGTGGAAATTTCCAATTTATGAGACATTGGATATTGGTAATGAAAATGCATATGGCTCAAAGTATTCATTGAATACAAGAACATGCCAATATTACATGGCTTCCTATAAAGTGTGCTCTCGCCAAAAAAGTAGGGGAATGAATCATCCTCCCGACTTCTGTGCATTTCCGGTTAGGGAAGTTCGCTTTAACTCCTCATCCTTCCCGCCGGAAAACTCGACTTCCTCGCCGGAAAATGGCTCCAACCCCCGGAGGAGCTCTCATCTCTTCCAAATAACGAATGTGGTCATCCTCTTGCTCGTGGAAGGCTTGATCCTGACTGTTCCTGATCATAACTACGACCTTA

Coding sequence (CDS)

GACCCCAAACAAGTTGCAACAATCAAACTTGATTTTCCTAATAGTTCGTCTGTTCCTGCATGTATTAAATTTTTGTATCGATATGTTGAAAGCTTCTCAAGCATGATGCACAGAGGGTGCCCCTCAGTGATCGAGTCTTCCAAATGGGAAAACAATTTTCTTATGCCAGAGGATGTCTTGGAACTATGTGAATGGTGGAAATTTCCAATTTATGAGACATTGGATATTGGTAATGAAAATGCATATGGCTCAAAGTATTCATTGAATACAAGAACATGCCAATATTACATGGCTTCCTATAAAGTGTGCTCTCGCCAAAAAAGTAGGGGAATGAATCATCCTCCCGACTTCTGTGCATTTCCGGTTAGGGAAGTTCGCTTTAACTCCTCATCCTTCCCGCCGGAAAACTCGACTTCCTCGCCGGAAAATGGCTCCAACCCCCGGAGGAGCTCTCATCTCTTCCAAATAACGAATGTGGTCATCCTCTTGCTCGTGGAAGGCTTGATCCTGACTGTTCCTGATCATAACTACGACCTTA

Protein sequence

DPKQVATIKLDFPNSSSVPACIKFLYRYVESFSSMMHRGCPSVIESSKWENNFLMPEDVLELCEWWKFPIYETLDIGNENAYGSKYSLNTRTCQYYMASYKVCSRQKSRGMNHPPDFCAFPVREVRFNSSSFPPENSTSSPENGSNPRRSSHLFQITNVVILLLVEGLILTVPDHNYDL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G174390.1Cla97C09G174390.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 130..149

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cla97C09G174390Watermelon (97103) v2wmbwmbB058
Cla97C09G174390Silver-seed gourdcarwmbB0076
Cla97C09G174390Silver-seed gourdcarwmbB0823
Cla97C09G174390Silver-seed gourdcarwmbB1016
Cla97C09G174390Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB242
Cla97C09G174390Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB243
Cla97C09G174390Cucumber (Gy14) v1cgywmbB549
Cla97C09G174390Cucumber (Gy14) v1cgywmbB563
Cla97C09G174390Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB357
Cla97C09G174390Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB548
Cla97C09G174390Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB662
Cla97C09G174390Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB872
Cla97C09G174390Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB342
Cla97C09G174390Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB529
Cla97C09G174390Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB636
Cla97C09G174390Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB846
Cla97C09G174390Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB260
Cla97C09G174390Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB261
Cla97C09G174390Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB254
Cla97C09G174390Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB255
Cla97C09G174390Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB252
Cla97C09G174390Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB253
Cla97C09G174390Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB005
Cla97C09G174390Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB418
Cla97C09G174390Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB354
Cla97C09G174390Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB446
Cla97C09G174390Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB363
Cla97C09G174390Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB452
Cla97C09G174390Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB035
Cla97C09G174390Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB053
Cla97C09G174390Watermelon (97103) v1wmwmbB041
Cla97C09G174390Watermelon (97103) v1wmwmbB074
Cla97C09G174390Wax gourdwgowmbB048
Cla97C09G174390Wax gourdwgowmbB265