Cla97C05G093880.1 (mRNA) Watermelon (97103) v2

NameCla97C05G093880.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr05 : 14104524 .. 14111223 (-)
Sequence length597
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGGTATAATACATATGCTATGATATATATCAAAAAACACATCACTTATTAAAGTAACATAAATCATATACTCAATGTTGTAGAAAGATCGATAAGCAAATAATGATGAGTAAAATGATATTGAGGTGGAAGGAGAACAAGTTGATGTGGTTTATATTCTTTAAAAAACACATCCATTTTAAGGTTGAAAAACTTCGTGCAAGCAAGAAGAAAATGTGCCTATTGAAGTCATCAAACAACATTTGGCACAATTGGGTAAGAAGCAAAGAAAATCAATGTGGAGAACAAAAAAGGTAAAGTAACCGTTTTATTTTATAAATAGATATTAATAAATTCAACATATATCCTATATATACTTATATTTATATAATAACACTGTAGAGTGCTGACTAAACATCGATGAAATCACCAGAAACAAGACAACATCAGCAAGCTCGTCATGTTGTGGAAAATAGGGTAAAATCCGAATATATAGTGAATATACATAAATGTTTGTTATACTATACTAAATGATATTTAATATGTGGTGCTTATTTTGAAATATAAAACAATACAACGAAAAACGTACAAAGACAGAAGAGCACACAAGTGTTGGGAAGGAAAAAACAAAGTTTAGTAGTGATGTTGGGAAAGAAAGATGTATTTCGAATATAATTAATGTTTAATTTTGTTTTTATGTAAACTTAAATGATTTCATTGTTACACAATTTTTAAATATATTGTAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGGTATGTATTATATATACACACTCATACAATTACCTTTGTACAAAATTGTGAAGAATGTTACTTTTTTACAGGATGCACCCTACCTAGACATAAGTGGTCTAGTGTACAAAAGTCAAATACTTATGCTAGGTTTGAAATCATTCGAAACATTAAGGACAACCTAAGTAGGAAACATCTTGGCTAGATTCCTACTTAGTCCTTTCGGTTATTTCCTAAACCTAAAACTTAGCACATTCTCTAGCTAACTATTGTATCACCAAATAAGGAGACAATTTAGTATCACAAAAGAGGATGAACTCACATTCAATTTTGAAGGAAAAATAGTAAAATTTGGGATAACTGACTTTGAAAAAATAACAGGACTTAATTGTGAGGAAATGCCAACCTTGGATATGCACAAATATAACGGCAAATTCGTAAACAAATACTTCAACCAAATGTCTCCAATTAGAAGATTAGTTTTAAGTGAAATGTTTATGAATAGGGAGTCTATAAAAAAGAAGGATAGAGTAAAGCTTGCAAAACTGTGTTTCCTATCAAATATCCATGAGAGCATATTGCATAAATGACCATAGTGGAGACAATAAAAAAATCTATCATGAATGCAGATTTTTTACAAGTGGGAAAGCTGGCTTCCCACATGCTTTGGTTGTTTGGGCATTCGAATGCATCCCTAATTTGTCAGGACCGTTAATGTTTTGTTGCCAACATATTTCCTCAAGAATTTCAAAGATGAACAACTGGTTGATTGACGTTCATTCGATTGGAATGAATTAGCAAGGAAGATCTTTGACAAAGACGATGTCATTGACCTCTTATTATTAGTAATATATATGCATGTTTATATTATAACTACTACTGTTTATGTCTAATTCACTAATATATTTAACTTAAATCTCCAATTTGAAATCTATGAGATGATGGGTGAGCGTGATTTTGGTGTGAGGATTATTTATCAAACTGAATCTAATAGGGGCAATGAACTAAATATGACTTAAAATCTACTAAAATATTTCGAAGAGTTTCGAGATCTAGTGATAAGTAAGTTTGAAGACTTGAAAAAGAAAATGGACTTATTGACTAGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGGTGAATATATGATACTTTAGATATGTACTGATATTTATATTATATGTAATTTTAGAAAGCATATTGAAGTAGTTATTTAGCACCATGTTTATATAATATGTACTACTGAAAATGCTATTAGAAATCCTAACTCCTGTTGTTTATTGAAATTTTATAACATGGAAGGTATATGTTTGAGCTCTAGCATCTTTAGCATAAACTTCTTACTTGAAGTAGATAAACTAGAAAATGAGGCGATGAAGGTATACAACTACCCTACATAGCTATATGAAATGTTTAGCCCTAATATGTTACATGCTATTTGTTTTTAATATTTGTATATATTGTAGGGAAAAAGAAAGATTACAAACACATTCAATAACTATGACATAAAGGTTGTCAACAAGCTGTAAGCTGTACTCAATTGAACTAATAAATTTGTTGACTTAAAAATATACATGTACAATGCTTTATGATTAACGTACTGTTGTGTATATTGTAGCAACTATAGGGTATGGGTTTATTTGTGAACAAATATGCTCAAGGACAAAGGGAACATAGACGATCGTACCTTCTAAAATGGTTAAATCTCCATGCACAACCAAATTTGGATCAACAAAGGAGAAGATAAAGGAGAGGATGAAAATTAAGACTCAGTATCTCAATGAAACATTATTCAACTTATTGTCCCAAATGTAACTCGATGTCAAGTGAACACCAACTTTAGACTTGTTCTGTTTTTTGAACTTTAAGAATTTAATGTGCTTTTTTAAATAGCTTCTAATTTATATGTTATGGGATTTGGTCATCTATTGTGATTTTAGCCAGCTCCCTAATTTATATGATAATGGATATAGTATTATGTGACGTTTTCATAAATTTACACGTTTACAGGGTTTATACGATATATGAATGAGTACACTACATAAACGTTTATCTATATACTCCCCACTTTATTACAAATGTACTTATACTTTGATCGTGTACGACTAAAACTAAATCTCTATTAAGGATTAGACAACTTTTAATTTGATCAATATATAAATACTAACAACTATAAGCTTATTTCAAACATAAAGATGGAAAACTGGACTTTTTTTTATTGTGTAATAGTATTAGGTAAATATAGGCTTATGCATATAACTTTCGTAACATGTTGAATGTACTCTTGGTTTATAGAACATTTGATATATAAATATAGTATGTTCGCACGTGACTATAAGTTAAAGTAAATTTTATTTATAAATACTAGTAACTCTTGGTTTATAACTAGCTTATTTCAAATGTAAAACATGCAAAATAATATTTCATTAATAATAAATAGTACTAATAATACTACTACGTGAATACAAGTTGAATGATTCCCCACAAGCTTTCTTCATTTCAAAAATGTAAAATTAATATCTCCTCATATTGAACATAATTAATGTTAATAAACCAACAAAACAAATAAGAAAATTGAACTTTGTAAGTAAGGCAACTATTGTGTAAATGTAAACCTGCAACTCTTAAGATTGTGCCTTCGTCTTCCACAACGACTACACTTCATGATCTTCTTAAACTTCATTTGTGAAGTAATTCTCAACTTCTTCGATCCGCCAACCGGACGCTTAACATTTGCTGAGAAATGGAAGGAACAACATCCCTACAAGTAAGGAAAATTAAAACGATTTGCACCCATTTTTAATGCAATAAACGGAAGATGATTGTTTCCAAAAATGAAGTCAAACTTGGCATTTTATTTAAGAAAAATCATTGGATTTTCGGTAATTTTAAAATAATGGATTACAAAGTCATATGGTCTGAATTATGGGTAGATTCCTTAAATGAATTAATTCAAATAAAAAGAAGATTTGTGAAATTGATAGGTTGAAGAGGATTTTTCCATGTAAATTTTCATTTCTTTAATAATAGACACATGTATATATGTGTTTCTAAATGTGTGGGTGAAGGGTGGTGCCGCAAATTAAAAAGGAAAAAGGAGACCGACAACAATATATTTTTTTTTGGGACTGCATAAGCTTTTTCGTGCGGTCCAATTGCGGCAGTGAGTTTATTGAAAAATACAGTGTATTTTTCTTGGATTTGGGTGTTTTTCTCCTACTATTAATTCCAAGATAGCGAGTTGTGGTATAGGGAATCAATTAATAGTTCGTGTTGGGTTATTTGGGTAGAGATTTGTAGCGCGAGTTTGAAATCTTTGGCAATCTTCATCATGGTAGAACCTGTTGTAGAGGATTGAACATAGTCCCAAGTTTGGGGCAAACCAGTATATTTTTCGGTGTCATTCTCTTTTCCCTTATCTTTATTATTTGATATTTTATAATCATTAGCCTTTTTTGGCGCTAACATGTGAACTGGGAGTTTCAGATATAATTTAGTTTATTCCACATTTAATTATATCACATAAAACTCCCAACAAAGATTTGATCTAAACCGTTCATGCAAAGACATGCGAGTGGGGTATCCTATACAAATGGTTTGTATAAAATTGGACCGTGAATTAGTTAATCTCTCCTTATTAACATAATTGACTAAAGCTATTAACATTTCATAGGATGACTACATGTAACTCGATCTTAATCCTTAGGGGGTTATGGACTCCTACTTCTGAGTGTTTATCCTTTGATTTGTATAGGTGAGAGTGGCCCGTGTTGCCGATTCAATAAGTCTACCATATTGGAGATAAGACCAAATGGGGAGCTAGGAACATAGCTACACAAGATGAAATTCACTCCTTCGATTTAGGATAAAGTAGAGAGGAGTTGTTCCTTTTAGGTGTTGAATCCAGGTCTTGAACAATGGGGTCCGTCCCTCTCATTGGCCCAAGAGGAATTTTGTTTATGGTAGGATATAAATAGGTTGTTCATTAGAGGATAAGTGAGACTTAAGGAGTAAGAGGTAATTACACGGACAAAAATGTAATTTGATATAGCTGTAATTACAAACAACTCTTGAAGGATCAACTTGTAATGGTTATATCCATGAACACAAAACATTCTACAATGCGAAAAATGCAACTGTGGGTCGTTGGTGGAGTGATACAAAGTTAATGAATGGTTATTAATTTAATTAATTAATTTTAAATTATTGGAGCTTCTAATTTGTAGGTTCTTTAGGTTCCCTCTTAGTACACTATAGTAAAACAATGATTAAGTAATTTTTGGAAAAATTTGAATTGTTCAAATTAAATAAGAGAATTTACATTTATTGTATAAGATATAATTAATATAATGTATATAGATATATTATAATATAAAATTAATTTTGATTGAGATTCAAAATTAAACTATAAAAATTGAGAAATCTAATTTATTTGAATAAGATTCAAATAATAAATAACATGAATGAGATTTATATTATAACTATAGGTTAAAAAAAATTAATTTTTGAATGAGATTCAAATATTAAATTAATATAAATGAGATTCATATTAAAATTTATAGGTTAGGAGAGAGATGTGTGCATTGATTCAAATGTATTAATTAAATATTGGATATTTTAAATTTATTATTTAAATTATATTAATTAATTTAATTAATCATAATTTATTTTAGTTAAATTATTATTTTATTTTAATTTAATTGAAATTTTAACTCTCCTTCATTGCCCGAGAGTGGTGTACGTGAGAGAGGGGGTTACTCTTCCTCTCACTTCCCTATTTTCTTAATTAATGCAGATTGTTTGCATACCAAATGGGGTTGCTGGAAAAACAAAATCATGTATTGTGATTTCCTTCTGTAAATCTCTCTTATCCTTCCAAAAGGAGGTTCCCACAAGCTCCATCTTTGTCGAAGAATAGCAAAGAAGACATTTTGGTGGTGTCCAAGCCATTGGTCAAATTCACTATTCGTTGAAAGAAGAGTAATGGCAGAGGAGGAAAAGGAGAAGAACGATCTTCAAAGGTAAAATATCTTTTCTTCTCCGTAGGTTAAATTAATTGCATGCTTAATTTTTGGTTTTTCCTTATCTATTTTTTAGTTTTATAATCAAAATTAATGACAAAAGGTGATCGTTTATTTTTGTGGAGATTCAATCCCATCGTATATATTATTACATTATTAAGCAATCTAAACAATAATTTCTTAATAAAATATCATTCACTTGGGGGCGTGAGATTATCATATCTTCTTGTTTGCAATTACTTAATTATAATAATATATATTATTAAATAAATAAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTATATTCCTCTCTTTTTCTTCTTTATAACTGTCGCGGCTCCCCACCCCCCAATCTCTCTCTATCCCTCTCAATTTTCCATCTCCTTCACTTAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

mRNA sequence

ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

Protein sequence

MDIDSYGYSFQNIRGKTKMNEDNYRRGNMRGRDQYKLYEKLKKFQDEKENEENNEEINTEEEDGDGGGDGDNRGRGNESKDGAGIEHIERANLEENDKNEEQDQVQAIYLYHTPSTAACPRPCRDCHQHLQVAVVEEDNAGKSHGSSSLSQSPSPSRSLSSYLFFAKPHPQTKSSITCSTATVYQLPPLLPSCGRRRN
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G093880Cla97C05G093880gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G093880.1Cla97C05G093880.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G093880.1.CDS.4Cla97C05G093880.1.CDS.4CDS
Cla97C05G093880.1.CDS.3Cla97C05G093880.1.CDS.3CDS
Cla97C05G093880.1.CDS.2Cla97C05G093880.1.CDS.2CDS
Cla97C05G093880.1.CDS.1Cla97C05G093880.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G093880.1.exon.4Cla97C05G093880.1.exon.4exon
Cla97C05G093880.1.exon.3Cla97C05G093880.1.exon.3exon
Cla97C05G093880.1.exon.2Cla97C05G093880.1.exon.2exon
Cla97C05G093880.1.exon.1Cla97C05G093880.1.exon.1exon


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 34..61
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 139..160
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 141..160