Cla97C05G093880 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C05G093880
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr05 : 14104524 .. 14111223 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGGTATAATACATATGCTATGATATATATCAAAAAACACATCACTTATTAAAGTAACATAAATCATATACTCAATGTTGTAGAAAGATCGATAAGCAAATAATGATGAGTAAAATGATATTGAGGTGGAAGGAGAACAAGTTGATGTGGTTTATATTCTTTAAAAAACACATCCATTTTAAGGTTGAAAAACTTCGTGCAAGCAAGAAGAAAATGTGCCTATTGAAGTCATCAAACAACATTTGGCACAATTGGGTAAGAAGCAAAGAAAATCAATGTGGAGAACAAAAAAGGTAAAGTAACCGTTTTATTTTATAAATAGATATTAATAAATTCAACATATATCCTATATATACTTATATTTATATAATAACACTGTAGAGTGCTGACTAAACATCGATGAAATCACCAGAAACAAGACAACATCAGCAAGCTCGTCATGTTGTGGAAAATAGGGTAAAATCCGAATATATAGTGAATATACATAAATGTTTGTTATACTATACTAAATGATATTTAATATGTGGTGCTTATTTTGAAATATAAAACAATACAACGAAAAACGTACAAAGACAGAAGAGCACACAAGTGTTGGGAAGGAAAAAACAAAGTTTAGTAGTGATGTTGGGAAAGAAAGATGTATTTCGAATATAATTAATGTTTAATTTTGTTTTTATGTAAACTTAAATGATTTCATTGTTACACAATTTTTAAATATATTGTAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGGTATGTATTATATATACACACTCATACAATTACCTTTGTACAAAATTGTGAAGAATGTTACTTTTTTACAGGATGCACCCTACCTAGACATAAGTGGTCTAGTGTACAAAAGTCAAATACTTATGCTAGGTTTGAAATCATTCGAAACATTAAGGACAACCTAAGTAGGAAACATCTTGGCTAGATTCCTACTTAGTCCTTTCGGTTATTTCCTAAACCTAAAACTTAGCACATTCTCTAGCTAACTATTGTATCACCAAATAAGGAGACAATTTAGTATCACAAAAGAGGATGAACTCACATTCAATTTTGAAGGAAAAATAGTAAAATTTGGGATAACTGACTTTGAAAAAATAACAGGACTTAATTGTGAGGAAATGCCAACCTTGGATATGCACAAATATAACGGCAAATTCGTAAACAAATACTTCAACCAAATGTCTCCAATTAGAAGATTAGTTTTAAGTGAAATGTTTATGAATAGGGAGTCTATAAAAAAGAAGGATAGAGTAAAGCTTGCAAAACTGTGTTTCCTATCAAATATCCATGAGAGCATATTGCATAAATGACCATAGTGGAGACAATAAAAAAATCTATCATGAATGCAGATTTTTTACAAGTGGGAAAGCTGGCTTCCCACATGCTTTGGTTGTTTGGGCATTCGAATGCATCCCTAATTTGTCAGGACCGTTAATGTTTTGTTGCCAACATATTTCCTCAAGAATTTCAAAGATGAACAACTGGTTGATTGACGTTCATTCGATTGGAATGAATTAGCAAGGAAGATCTTTGACAAAGACGATGTCATTGACCTCTTATTATTAGTAATATATATGCATGTTTATATTATAACTACTACTGTTTATGTCTAATTCACTAATATATTTAACTTAAATCTCCAATTTGAAATCTATGAGATGATGGGTGAGCGTGATTTTGGTGTGAGGATTATTTATCAAACTGAATCTAATAGGGGCAATGAACTAAATATGACTTAAAATCTACTAAAATATTTCGAAGAGTTTCGAGATCTAGTGATAAGTAAGTTTGAAGACTTGAAAAAGAAAATGGACTTATTGACTAGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGGTGAATATATGATACTTTAGATATGTACTGATATTTATATTATATGTAATTTTAGAAAGCATATTGAAGTAGTTATTTAGCACCATGTTTATATAATATGTACTACTGAAAATGCTATTAGAAATCCTAACTCCTGTTGTTTATTGAAATTTTATAACATGGAAGGTATATGTTTGAGCTCTAGCATCTTTAGCATAAACTTCTTACTTGAAGTAGATAAACTAGAAAATGAGGCGATGAAGGTATACAACTACCCTACATAGCTATATGAAATGTTTAGCCCTAATATGTTACATGCTATTTGTTTTTAATATTTGTATATATTGTAGGGAAAAAGAAAGATTACAAACACATTCAATAACTATGACATAAAGGTTGTCAACAAGCTGTAAGCTGTACTCAATTGAACTAATAAATTTGTTGACTTAAAAATATACATGTACAATGCTTTATGATTAACGTACTGTTGTGTATATTGTAGCAACTATAGGGTATGGGTTTATTTGTGAACAAATATGCTCAAGGACAAAGGGAACATAGACGATCGTACCTTCTAAAATGGTTAAATCTCCATGCACAACCAAATTTGGATCAACAAAGGAGAAGATAAAGGAGAGGATGAAAATTAAGACTCAGTATCTCAATGAAACATTATTCAACTTATTGTCCCAAATGTAACTCGATGTCAAGTGAACACCAACTTTAGACTTGTTCTGTTTTTTGAACTTTAAGAATTTAATGTGCTTTTTTAAATAGCTTCTAATTTATATGTTATGGGATTTGGTCATCTATTGTGATTTTAGCCAGCTCCCTAATTTATATGATAATGGATATAGTATTATGTGACGTTTTCATAAATTTACACGTTTACAGGGTTTATACGATATATGAATGAGTACACTACATAAACGTTTATCTATATACTCCCCACTTTATTACAAATGTACTTATACTTTGATCGTGTACGACTAAAACTAAATCTCTATTAAGGATTAGACAACTTTTAATTTGATCAATATATAAATACTAACAACTATAAGCTTATTTCAAACATAAAGATGGAAAACTGGACTTTTTTTTATTGTGTAATAGTATTAGGTAAATATAGGCTTATGCATATAACTTTCGTAACATGTTGAATGTACTCTTGGTTTATAGAACATTTGATATATAAATATAGTATGTTCGCACGTGACTATAAGTTAAAGTAAATTTTATTTATAAATACTAGTAACTCTTGGTTTATAACTAGCTTATTTCAAATGTAAAACATGCAAAATAATATTTCATTAATAATAAATAGTACTAATAATACTACTACGTGAATACAAGTTGAATGATTCCCCACAAGCTTTCTTCATTTCAAAAATGTAAAATTAATATCTCCTCATATTGAACATAATTAATGTTAATAAACCAACAAAACAAATAAGAAAATTGAACTTTGTAAGTAAGGCAACTATTGTGTAAATGTAAACCTGCAACTCTTAAGATTGTGCCTTCGTCTTCCACAACGACTACACTTCATGATCTTCTTAAACTTCATTTGTGAAGTAATTCTCAACTTCTTCGATCCGCCAACCGGACGCTTAACATTTGCTGAGAAATGGAAGGAACAACATCCCTACAAGTAAGGAAAATTAAAACGATTTGCACCCATTTTTAATGCAATAAACGGAAGATGATTGTTTCCAAAAATGAAGTCAAACTTGGCATTTTATTTAAGAAAAATCATTGGATTTTCGGTAATTTTAAAATAATGGATTACAAAGTCATATGGTCTGAATTATGGGTAGATTCCTTAAATGAATTAATTCAAATAAAAAGAAGATTTGTGAAATTGATAGGTTGAAGAGGATTTTTCCATGTAAATTTTCATTTCTTTAATAATAGACACATGTATATATGTGTTTCTAAATGTGTGGGTGAAGGGTGGTGCCGCAAATTAAAAAGGAAAAAGGAGACCGACAACAATATATTTTTTTTTGGGACTGCATAAGCTTTTTCGTGCGGTCCAATTGCGGCAGTGAGTTTATTGAAAAATACAGTGTATTTTTCTTGGATTTGGGTGTTTTTCTCCTACTATTAATTCCAAGATAGCGAGTTGTGGTATAGGGAATCAATTAATAGTTCGTGTTGGGTTATTTGGGTAGAGATTTGTAGCGCGAGTTTGAAATCTTTGGCAATCTTCATCATGGTAGAACCTGTTGTAGAGGATTGAACATAGTCCCAAGTTTGGGGCAAACCAGTATATTTTTCGGTGTCATTCTCTTTTCCCTTATCTTTATTATTTGATATTTTATAATCATTAGCCTTTTTTGGCGCTAACATGTGAACTGGGAGTTTCAGATATAATTTAGTTTATTCCACATTTAATTATATCACATAAAACTCCCAACAAAGATTTGATCTAAACCGTTCATGCAAAGACATGCGAGTGGGGTATCCTATACAAATGGTTTGTATAAAATTGGACCGTGAATTAGTTAATCTCTCCTTATTAACATAATTGACTAAAGCTATTAACATTTCATAGGATGACTACATGTAACTCGATCTTAATCCTTAGGGGGTTATGGACTCCTACTTCTGAGTGTTTATCCTTTGATTTGTATAGGTGAGAGTGGCCCGTGTTGCCGATTCAATAAGTCTACCATATTGGAGATAAGACCAAATGGGGAGCTAGGAACATAGCTACACAAGATGAAATTCACTCCTTCGATTTAGGATAAAGTAGAGAGGAGTTGTTCCTTTTAGGTGTTGAATCCAGGTCTTGAACAATGGGGTCCGTCCCTCTCATTGGCCCAAGAGGAATTTTGTTTATGGTAGGATATAAATAGGTTGTTCATTAGAGGATAAGTGAGACTTAAGGA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mRNA sequence

ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

Protein sequence

MDIDSYGYSFQNIRGKTKMNEDNYRRGNMRGRDQYKLYEKLKKFQDEKENEENNEEINTEEEDGDGGGDGDNRGRGNESKDGAGIEHIERANLEENDKNEEQDQVQAIYLYHTPSTAACPRPCRDCHQHLQVAVVEEDNAGKSHGSSSLSQSPSPSRSLSSYLFFAKPHPQTKSSITCSTATVYQLPPLLPSCGRRRN
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G093880.1Cla97C05G093880.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 34..61
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 139..160
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 141..160

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None