Cla97C05G083360.1 (mRNA) Watermelon (97103) v2

NameCla97C05G083360.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr05 : 2568082 .. 2573151 (-)
Sequence length339
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGTGGAAGGAGATGGAGAGGTTGGAAAAAGAAGATGGGCATGAAACAGAAGAATTGGGTTTCCCAACGAAATGTGAAAATAGTGTGGGGGAGGGTCGAAAAGCAGAAGCTGATGACGACGACTCGGGAATTGATGTGCTTAACATTTTTCACTTTCCTCTTCAGGATTCGCTTCAATTTCCCTCCAGGTATGTATGAATCTTGCTCCTCTTGCTTTCTGTCGAAGTTGATTATTTATTTATTTATTTTTCGCACCCTCACAAAAATATATTAGGTAAAGGTAAAATTGTATGCAAAATAGTTGGAAATTACAACACTCTACTCTCAATTTTGTTCTTTGACGTTAAAATTTAAAATATTAATTAGCTTCTTTGTTTCATGAGTTTTTGTCATATACATTTAATAGGGAGGAATAATTACGTGTAGCCTATACAATTTTTAATTGAGTGCAGTAGAGGCTGCACCCAAGTTTTTTCCTTTAATATTTAATATCTTTTGTTTCATATAATTTCACTTTCTAGAACCTTGGATATAATTACTCAGGAACCTTCAAATCCATTTGACATGGATTTTTTATAGCCTAATTAATTAAATGAACTAATATCAACAATCATTACTATGAATTTTAAGGATGTTTTCAAAAATATAAAAAAGGTTGGAAATAATTATAAATATAGCAAAATTTTACTTTTTATATGTTATAGATTGCGATAGACTCGGATAAATATCTATCACTTCACCACATAAACACGGATAAATGTTTATTTGGGCCTATCGCGATATATCACAGAAAATGAAATTATGCTATATTTGTAAATAGTTTGATATTTTTATTATTTATATTAATTTTTCTTAATTTTAATCATTTATTAAATACAAATATATTATTTAGAATTAATAAATTTTAACTCGTACATTTAAGATTAATATTTTATATTATCATAACTATTTAATATAAAATTTTATTATTAATTATTAATAGTTTAATTAATTTATTTTTAAAGCAATTGTTTTAATGACAAAACTGTTGAAATTTTATTTTTAGACATGATATTTTGCTATATTTTGTAAATAATTTGGTTCATTTTGCTATATTCGAAAACACCCTTATTTTTGTTCAATTATTTTTAAAAATTAAATATATGTGCACAACATGTGACGTTCAAATGAATTTATAATTCTACCATCCTTGTTAAAGACTTGAGTTAAGAAAGCTATGTTTTGCTAACTATTTTATTTTTTTTGCTTTTGGTTTTTGAAAAATAAGTTTACTTCTTCTCAATTACTTATAGCGATTTGTATATTTCTTAAGTGCAAGAGTTAATTTCTTAGCCAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTTCAAAACTACTTTTTCGAGTTTTCAAAATTTGGCTTGATTTTTGAAAATATGAGTAAATCACAAAGCAAGAAGTTTAGAGGTAGTAAGAGTGTTTATAGGTTTAATTATTTAAAACTAAAAACCAACAACCTAATGATTACCAAATGGAGCTTAGAAATTTGGTCTTTTATTTTGTTTGTTTTTTATTTTATTTTTAAACTGTACTTTGTTTCATGACAACTTCATTTTTTTCCCTAGCTAAACATTTTTATTCTAAGCTTATTTTTTTTATTCTTTTTTTTACAAAAATTAGTTCATGTAATTAGTACGAAATCTTCACGATTCACACAAACTCAGCTTTTATATACCTTCCTTCAACGCTGAATCTTCTCACAGAAAACAACCATGACTATATGTTCCATAATTTGGAACATAACCAAAGTAGTTTTTACTCACTACAAACACCAAAAGTTGGTAATTTAAGAACATAAAAACTCCCTCATTTATCCCAATCCGCATACAAATACTATAGAAAACTACAAACTAAGGGCGCCATAGGCACCATAAGGGTGTCTAGAGGTTGAAACCCACATTCAAGTGTTGCCTTCCAAACTTGTTCGATATTACACATTGCAAAGCCACACTCGTGCTCAGTCCACCCTTCCATCGCATGCACCACACCAGCAATGCGCCATACGCTCATCACTCGCCTCGGCAACCAATTCTACAACAAATAATTAAAGCTCATTTACCCTATCTATATTGAATAGTATTATTCGTAGGCAGAGTGAAGTTAAGAATTTTACAATGAGTGACAACTATAAATATATATTGTGTTTCTATTTTAAAAGCATAGGGTATAACTTTAAAAGTTTTATATATAATTTTATCATTTTTAAGACAAACTAAGACAAGTGTCTCCTTCCTTGTTCGTGCTTTGCTCTGGTCTATACGTGTTGTGGGTAATTTTAGAAGAAATGGTTTAATTGACCTAAAAGAAATTGAAGGCATCAAATGGGGTTAATTAAGAGAAGTTTAGGCCGAAAACAACACCAAGGATGTAGGGAAAAGGGACAAGAATGCACTAAGGCCCAAATGTTTGGCCTCAGCTGCAACCAAAAGCCCCCTGTGAAATAGAAGATGTCCCAGATAGTCATCGAAACCTAGTCCAAAAGTGTTTAAATGAAGTCTCTAAAAGAGGTAAGTGAATTGATCACTTGGTTGAAGTCTTTAGGTTTTCTACATCATTAACTAAAGCATCGAGGGCAACACCAGTGTGTAGGATTTCATTCTTCTATGTATGTCTCGTTCTTTCCTAAAGAAATAAATTCAACATTGTTTCCATGAAGGTCAGGAAATTTACCCTAACTGTATGTATGTATATTTGTTTGGTAATTACCTCACAAGAGTGCATATTTTCAAGGGAAGAAGGAGCTTTCATAGCAGGGGTAAAGTGGTAAAAGCAGTCTTTGCGTACAATCTTTGGAGGGAATTGGTAGAAGGGAATGAAAGTGGTTCCTTTTGGAGCCTTCAGCTGTTCTTCATCTCTAACTCCTTCTCCCACCAACCATATCTGCACAAACATTCATATGATATGATGATCAACTTTTGTTTCATATGGAATCTAAATAAACATGATTAAGAAATAACCAATGGAATAATGGAATGATTTTGGAAGTCAAACATTATGAGAATGGCCTTTTGCAAGAACTAGAGTGCCTTCTTCAAAGTTGTTGGAATTAGCTTTGTTGAGCTTTCTGTAATGTTGTTCATTCAAAACAGCAATTTGAATGCCCTTCTTGGAAAGGGAATGATAAAGTGCAAAGGCCAATTTTGTAATTTTCCCCGTGAGGAGGACTTGAGTTGCAAATTTGGGGATATTATTGAGCACTACAGCCACAGCCAAACTACTCCCATCCACAATCCTCACTTTTGGTTTAGGGTTTCTTTGAATATAAATCTCTCCATATTTGTTCAGTTCCTCTCCCTGCAAATTAAATATATATAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTGAGTTTTTATGATGAAGGGATTTGTGAAGAAATTTGTTGCTTGCCTGATTCAAGAGCCCTAAGGTCAAGACTTTACAGCCTCTTTGATCCGCTTTGGTTATAGCTTCTTCAATCAAGCTGTTTATTGATTCGGTTTGCCATTGAAGTAAGTACTGCACAAATAAGTTCACGATCCCTTCGTTAGATACCAAACTAGGTGTATACCTAAAAGGGAAAAAAAAGGGAAAAAAAAATGTTGGTTGTTTGATAATTATCAAAAATGTTGGTTATGGATTTTGATTTTGTTTGTTAGGACGTATCTTCCTCATTTTGTTTGTTAGGACGTATCTTCCTCCATATGTCCTCACTAAACATTTCAACTCTTGGTTAAATCCTAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAATTAAAAAACTGTTTTTTTTTTTTTTTGCCCCATTTGATTCATTTTGACCTTGTTTGATAATATTTGATTTTTAGTTTTTAGTTTTTGAAAATTATGTTTGGTTTCTCACTATTTTTTAATCATAGTTTTCATTTTTCTTAAATAAAGATTTGAATTTTTAGTCAAATTTTTTAAAATTTTCAAAAACTTGGTTTGAATTTTAAAAAAAAGTACTAAACAGTAGACAACACAGCAAAAGAAAAAAAAAGTTAAAATAATATAATAAACTTAATTCTAAAAAACTAAAAAAAAAAAGTATCAAAAGAAACTTTATTTATTTGTATTATTATTATTTTGAGTTTAGCTTGTCAAACTAGTTTGTAGAAATGTATTTTTATTTTTAGAATTCAGTTATGAATTCAATATACTTCTTTAAAAGGACAATAACCATAAAAATAAATTGCACGAAACATTCCAATTTTAAAAAGTCAAAATCAAAGGGTGTTAATGCCAAGTTTTGTAACAATTTGATTTTTTTATTTTCTGATTTTGAAATTAAGCCCATAAATACTCTTCTCCCCTTTAAATTTTTTGATTAGATATCTACTTTTTACCAATGTTTTTACAAAATCAAGTCAAATATTGAAAATTAAAAGAAAAATATCTTGTTTTTGTTTTTGAAATTTGTTAAGAATTCAACTTCTTGTATTTATTTTAGAAAGATGCTAATCATGGTAAGAAATTGAAAAAAGTAGGCTTAGTTTTTAAAAATAAAAAATAAAAAACAAAAAATTAAATAGTTACCAAACAAGAATTGAATTTTGTCCTAAATATTTATGAAGTTTCAATTTTACTCCAATCTCTCAGGATATGTTTGAGTAATTTTAAATGATTTAAATTACTTTTGTCATTTCTAAAATCACTATAAAACATAATTTTAATTCTTTAAAACTAATTTTGATGATATGAAAATTGCATTTAAAAGTATAAAATTTAATATTAAATCAATTTTAAGCGATTAAAATTGTATTTTAAAGTATATTTAAAAATAATAAACCTGATTTTTAACTAAATTCAAAATCACTCCAATACATTTGCTAATTTTCCTGAAACGAAAACCAGAAATTGTGACCTGAACGTGAAACTTGGGGATGGCCCATGTTTGCAGCTTCAGCTTTTCAAATTGGTTGCTTTCAACAACAAATGTACGGCTGAATATCCACGTCAGCAGCATGGTGAATGCGGACAGCAAAGACAGATACCAAGTGGAAGTGTGGGGCCTGGATGCCAGCTCGGCAAATCCTAAGCGTAGATGA

mRNA sequence

ATGGCGTGGAAGGAGATGGAGAGGTTGGAAAAAGAAGATGGGCATGAAACAGAAGAATTGGGTTTCCCAACGAAATGTGAAAATAGTGTGGGGGAGGGTCGAAAAGCAGAAGCTGATGACGACGACTCGGGAATTGATGTGCTTAACATTTTTCACTTTCCTCTTCAGGATTCGCTTCAATTTCCCTCCAGCTTCAGCTTTTCAAATTGGTTGCTTTCAACAACAAATGTACGGCTGAATATCCACGTCAGCAGCATGGTGAATGCGGACAGCAAAGACAGATACCAAGTGGAAGTGTGGGGCCTGGATGCCAGCTCGGCAAATCCTAAGCGTAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTGGAAGGAGATGGAGAGGTTGGAAAAAGAAGATGGGCATGAAACAGAAGAATTGGGTTTCCCAACGAAATGTGAAAATAGTGTGGGGGAGGGTCGAAAAGCAGAAGCTGATGACGACGACTCGGGAATTGATGTGCTTAACATTTTTCACTTTCCTCTTCAGGATTCGCTTCAATTTCCCTCCAGCTTCAGCTTTTCAAATTGGTTGCTTTCAACAACAAATGTACGGCTGAATATCCACGTCAGCAGCATGGTGAATGCGGACAGCAAAGACAGATACCAAGTGGAAGTGTGGGGCCTGGATGCCAGCTCGGCAAATCCTAAGCGTAGATGA

Protein sequence

MAWKEMERLEKEDGHETEELGFPTKCENSVGEGRKAEADDDDSGIDVLNIFHFPLQDSLQFPSSFSFSNWLLSTTNVRLNIHVSSMVNADSKDRYQVEVWGLDASSANPKRR
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G083360Cla97C05G083360gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G083360.1.CDS.2Cla97C05G083360.1.CDS.2CDS
Cla97C05G083360.1.CDS.1Cla97C05G083360.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G083360.1.exon.2Cla97C05G083360.1.exon.2exon
Cla97C05G083360.1.exon.1Cla97C05G083360.1.exon.1exon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G083360.1Cla97C05G083360.1-proteinpolypeptide


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..40