Cla97C05G083360 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C05G083360
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr05 : 2568082 .. 2573151 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGTGGAAGGAGATGGAGAGGTTGGAAAAAGAAGATGGGCATGAAACAGAAGAATTGGGTTTCCCAACGAAATGTGAAAATAGTGTGGGGGAGGGTCGAAAAGCAGAAGCTGATGACGACGACTCGGGAATTGATGTGCTTAACATTTTTCACTTTCCTCTTCAGGATTCGCTTCAATTTCCCTCCAGGTATGTATGAATCTTGCTCCTCTTGCTTTCTGTCGAAGTTGATTATTTATTTATTTATTTTTCGCACCCTCACAAAAATATATTAGGTAAAGGTAAAATTGTATGCAAAATAGTTGGAAATTACAACACTCTACTCTCAATTTTGTTCTTTGACGTTAAAATTTAAAATATTAATTAGCTTCTTTGTTTCATGAGTTTTTGTCATATACATTTAATAGGGAGGAATAATTACGTGTAGCCTATACAATTTTTAATTGAGTGCAGTAGAGGCTGCACCCAAGTTTTTTCCTTTAATATTTAATATCTTTTGTTTCATATAATTTCACTTTCTAGAACCTTGGATATAATTACTCAGGAACCTTCAAATCCATTTGACATGGATTTTTTATAGCCTAATTAATTAAATGAACTAATATCAACAATCATTACTATGAATTTTAAGGATGTTTTCAAAAATATAAAAAAGGTTGGAAATAATTATAAATATAGCAAAATTTTACTTTTTATATGTTATAGATTGCGATAGACTCGGATAAATATCTATCACTTCACCACATAAACACGGATAAATGTTTATTTGGGCCTATCGCGATATATCACAGAAAATGAAATTATGCTATATTTGTAAATAGTTTGATATTTTTATTATTTATATTAATTTTTCTTAATTTTAATCATTTATTAAATACAAATATATTATTTAGAATTAATAAATTTTAACTCGTACATTTAAGATTAATATTTTATATTATCATAACTATTTAATATAAAATTTTATTATTAATTATTAATAGTTTAATTAATTTATTTTTAAAGCAATTGTTTTAATGACAAAACTGTTGAAATTTTATTTTTAGACATGATATTTTGCTATATTTTGTAAATAATTTGGTTCATTTTGCTATATTCGAAAACACCCTTATTTTTGTTCAATTATTTTTAAAAATTAAATATATGTGCACAACATGTGACGTTCAAATGAATTTATAATTCTACCATCCTTGTTAAAGACTTGAGTTAAGAAAGCTATGTTTTGCTAACTATTTTATTTTTTTTGCTTTTGGTTTTTGAAAAATAAGTTTACTTCTTCTCAATTACTTATAGCGATTTGTATATTTCTTAAGTGCAAGAGTTAATTTCTTAGCCAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTTCAAAACTACTTTTTCGAGTTTTCAAAATTTGGCTTGATTTTTGAAAATATGAGTAAATCACAAAGCAAGAAGTTTAGAGGTAGTAAGAGTGTTTATAGGTTTAATTATTTAAAACTAAAAACCAACAACCTAATGATTACCAAATGGAGCTTAGAAATTTGGTCTTTTATTTTGTTTGTTTTTTATTTTATTTTTAAACTGTACTTTGTTTCATGACAACTTCATTTTTTTCCCTAGCTAAACATTTTTATTCTAAGCTTATTTTTTTTATTCTTTTTTTTACAAAAATTAGTTCATGTAATTAGTACGAAATCTTCACGATTCACACAAACTCAGCTTTTATATACCTTCCTTCAACGCTGAATCTTCTCACAGAAAACAACCATGACTATATGTTCCATAATTTGGAACATAACCAAAGTAGTTTTTACTCACTACAAACACCAAAAGTTGGTAATTTAAGAACATAAAAACTCCCTCATTTATCCCAATCCGCATACAAATACTATAGAAAACTACAAACTAAGGGCGCCATAGGCACCATAAGGGTGTCTAGAGGTTGAAACCCACATTCAAGTGTTGCCTTCCAAACTTGTTCGATATTACACATTGCAAAGCCACACTCGTGCTCAGTCCACCCTTCCATCGCATGCACCACACCAGCAATGCGCCATACGCTCATCACTCGCCTCGGCAACCAATTCTACAACAAATAATTAAAGCTCATTTACCCTATCTATATTGAATAGTATTATTCGTAGGCAGAGTGAAGTTAAGAATTTTACAATGAGTGACAACTATAAATATATATTGTGTTTCTATTTTAAAAGCATAGGGTATAACTTTAAAAGTTTTATATATAATTTTATCATTTTTAAGACAAACTAAGACAAGTGTCTCCTTCCTTGTTCGTGCTTTGCTCTGGTCTATACGTGTTGTGGGTAATTTTAGAAGAAATGGTTTAATTGACCTAAAAGAAATTGAAGGCATCAAATGGGGTTAATTAAGAGAAGTTTAGGCCGAAAACAACACCAAGGATGTAGGGAAAAGGGACAAGAATGCACTAAGGCCCAAATGTTTGGCCTCAGCTGCAACCAAAAGCCCCCTGTGAAATAGAAGATGTCCCAGATAGTCATCGAAACCTAGTCCAAAAGTGTTTAAATGAAGTCTCTAAAAGAGGTAAGTGAATTGATCACTTGGTTGAAGTCTTTAGGTTTTCTACATCATTAACTAAAGCATCGAGGGCAACACCAGTGTGTAGGATTTCATTCTTCTATGTATGTCTCGTTCTTTCCTAAAGAAATAAATTCAACATTGTTTCCATGAAGGTCAGGAAATTTACCCTAACTGTATGTATGTATATTTGTTTGGTAATTACCTCACAAGAGTGCATATTTTCAAGGGAAGAAGGAGCTTTCATAGCAGGGGTAAAGTGGTAAAAGCAGTCTTTGCGTACAATCTTTGGAGGGAATTGGTAGAAGGGAATGAAAGTGGTTCCTTTTGGAGCCTTCAGCTGTTCTTCATCTCTAACTCCTTCTCCCACCAACCATATCTGCACAAACATTCATATGATATGATGATCAACTTTTGTTTCATATGGAATCTAAATAAACATGATTAAGAAATAACCAATGGAATAATGGAATGATTTTGGAAGTCAAACATTATGAGAATGGCCTTTTGCAAGAACTAGAGTGCCTTCTTCAAAGTTGTTGGAATTAGCTTTGTTGAGCTTTCTGTAATGTTGTTCATTCAAAACAGCAATTTGAATGCCCTTCTTGGAAAGGGAATGATAAAGTGCAAAGGCCAATTTTGTAATTTTCCCCGTGAGGAGGACTTGAGTTGCAAATTTGGGGATATTATTGAGCACTACAGCCACAGCCAAACTACTCCCATCCACAATCCTCACTTTTGGTTTAGGGTTTCTTTGAATATAAATCTCTCCATATTTGTTCAGTTCCTCTCCCTGCAAATTAAATATATATAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTGAGTTTTTATGATGAAGGGATTTGTGAAGAAATTTGTTGCTTGCCTGATTCAAGAGCCCTAAGGTCAAGACTTTACAGCCTCTTTGATCCGCTTTGGTTATAGCTTCTTCAATCAAGCTGTTTATTGATTCGGTTTGCCATTGAAGTAAGTACTGCACAAATAAGTTCACGATCCCTTCGTTAGATACCAAACTAGGTGTATACCTAAAAGGGAAAAAAAAGGGAAAAAAAAATGTTGGTTGTTTGATAATTATCAAAAATGTTGGTTATGGATTTTGATTTTGTTTGTTAGGACGTATCTTCCTCATTTTGTTTGTTAGGACGTATCTTCCTCCATATGTCCTCACTAAACATTTCAACTCTTGGTTAAATCCTAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAATTAAAAAACTGTTTTTTTTTTTTTTTGCCCCATTTGATTCATTTTGACCTTGTTTGATAATATTTGATTTTTAGTTTTTAGTTTTTGAAAATTATGTTTGGTTTCTCACTATTTTTTAATCATAGTTTTCATTTTTCTTAAATAAAGATTTGAATTTTTAGTCAAATTTTTTAAAATTTTCAAAAACTTGGTTTGAATTTTAAAAAAAAGTACTAAACAGTAGACAACACAGCAAAAGAAAAAAAAAGTTAAAATAATATAATAAACTTAATTCTAAAAAACTAAAAAAAAAAAGTATCAAAAGAAACTTTATTTATTTGTATTATTATTATTTTGAGTTTAGCTTGTCAAACTAGTTTGTAGAAATGTATTTTTATTTTTAGAATTCAGTTATGAATTCAATATACTTCTTTAAAAGGACAATAACCATAAAAATAAATTGCACGAAACATTCCAATTTTAAAAAGTCAAAATCAAAGGGTGTTAATGCCAAGTTTTGTAACAATTTGATTTTTTTATTTTCTGATTTTGAAATTAAGCCCATAAATACTCTTCTCCCCTTTAAATTTTTTGATTAGATATCTACTTTTTACCAATGTTTTTACAAAATCAAGTCAAATATTGAAAATTAAAAGAAAAATATCTTGTTTTTGTTTTTGAAATTTGTTAAGAATTCAACTTCTTGTATTTATTTTAGAAAGATGCTAATCATGGTAAGAAATTGAAAAAAGTAGGCTTAGTTTTTAAAAATAAAAAATAAAAAACAAAAAATTAAATAGTTACCAAACAAGAATTGAATTTTGTCCTAAATATTTATGAAGTTTCAATTTTACTCCAATCTCTCAGGATATGTTTGAGTAATTTTAAATGATTTAAATTACTTTTGTCATTTCTAAAATCACTATAAAACATAATTTTAATTCTTTAAAACTAATTTTGATGATATGAAAATTGCATTTAAAAGTATAAAATTTAATATTAAATCAATTTTAAGCGATTAAAATTGTATTTTAAAGTATATTTAAAAATAATAAACCTGATTTTTAACTAAATTCAAAATCACTCCAATACATTTGCTAATTTTCCTGAAACGAAAACCAGAAATTGTGACCTGAACGTGAAACTTGGGGATGGCCCATGTTTGCAGCTTCAGCTTTTCAAATTGGTTGCTTTCAACAACAAATGTACGGCTGAATATCCACGTCAGCAGCATGGTGAATGCGGACAGCAAAGACAGATACCAAGTGGAAGTGTGGGGCCTGGATGCCAGCTCGGCAAATCCTAAGCGTAGATGA

mRNA sequence

ATGGCGTGGAAGGAGATGGAGAGGTTGGAAAAAGAAGATGGGCATGAAACAGAAGAATTGGGTTTCCCAACGAAATGTGAAAATAGTGTGGGGGAGGGTCGAAAAGCAGAAGCTGATGACGACGACTCGGGAATTGATGTGCTTAACATTTTTCACTTTCCTCTTCAGGATTCGCTTCAATTTCCCTCCAGCTTCAGCTTTTCAAATTGGTTGCTTTCAACAACAAATGTACGGCTGAATATCCACGTCAGCAGCATGGTGAATGCGGACAGCAAAGACAGATACCAAGTGGAAGTGTGGGGCCTGGATGCCAGCTCGGCAAATCCTAAGCGTAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTGGAAGGAGATGGAGAGGTTGGAAAAAGAAGATGGGCATGAAACAGAAGAATTGGGTTTCCCAACGAAATGTGAAAATAGTGTGGGGGAGGGTCGAAAAGCAGAAGCTGATGACGACGACTCGGGAATTGATGTGCTTAACATTTTTCACTTTCCTCTTCAGGATTCGCTTCAATTTCCCTCCAGCTTCAGCTTTTCAAATTGGTTGCTTTCAACAACAAATGTACGGCTGAATATCCACGTCAGCAGCATGGTGAATGCGGACAGCAAAGACAGATACCAAGTGGAAGTGTGGGGCCTGGATGCCAGCTCGGCAAATCCTAAGCGTAGATGA

Protein sequence

MAWKEMERLEKEDGHETEELGFPTKCENSVGEGRKAEADDDDSGIDVLNIFHFPLQDSLQFPSSFSFSNWLLSTTNVRLNIHVSSMVNADSKDRYQVEVWGLDASSANPKRR
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G083360.1Cla97C05G083360.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..40

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cla97C05G083360Watermelon (97103) v2wmbwmbB054
Cla97C05G083360Watermelon (97103) v2wmbwmbB131
Cla97C05G083360Silver-seed gourdcarwmbB0229
Cla97C05G083360Silver-seed gourdcarwmbB1008
Cla97C05G083360Silver-seed gourdcarwmbB0647
Cla97C05G083360Silver-seed gourdcarwmbB0818
Cla97C05G083360Silver-seed gourdcarwmbB1130
Cla97C05G083360Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB196
Cla97C05G083360Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB204
Cla97C05G083360Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB437
Cla97C05G083360Cucumber (Gy14) v1cgywmbB452
Cla97C05G083360Cucumber (Gy14) v1cgywmbB542
Cla97C05G083360Cucumber (Gy14) v1cgywmbB622
Cla97C05G083360Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB005
Cla97C05G083360Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB263
Cla97C05G083360Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB366
Cla97C05G083360Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB856
Cla97C05G083360Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB858
Cla97C05G083360Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB916
Cla97C05G083360Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB243
Cla97C05G083360Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB350
Cla97C05G083360Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB626
Cla97C05G083360Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB833
Cla97C05G083360Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB890
Cla97C05G083360Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB209
Cla97C05G083360Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB215
Cla97C05G083360Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB485
Cla97C05G083360Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB206
Cla97C05G083360Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB214
Cla97C05G083360Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB478
Cla97C05G083360Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB204
Cla97C05G083360Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB212
Cla97C05G083360Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB460
Cla97C05G083360Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB020
Cla97C05G083360Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB333
Cla97C05G083360Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB337
Cla97C05G083360Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB116
Cla97C05G083360Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB327
Cla97C05G083360Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB423
Cla97C05G083360Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB125
Cla97C05G083360Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB340
Cla97C05G083360Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB434
Cla97C05G083360Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB020
Cla97C05G083360Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB229
Cla97C05G083360Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB264
Cla97C05G083360Watermelon (97103) v1wmwmbB206
Cla97C05G083360Watermelon (97103) v1wmwmbB398
Cla97C05G083360Wax gourdwgowmbB041
Cla97C05G083360Wax gourdwgowmbB080
Cla97C05G083360Wax gourdwgowmbB180