ClCG06G004180.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTAAGCCCTTCAGTTAGCTTTGATACAACCAGAAACTTCAGGACCATTCACAGATATTAATGCAATAAATTTCCATCACCCTCTTCAGTTTACTCTCCCGGCGGAATGGCTAGCAGTGTGCAGAGGAGTCCTCGGTTGGATCAGATCCATGGCGAAATTCGCGACAGTTTTCGTGCCATTTCGTATGTTCTTTAACCACGCCCTCTCTATTTAGTGATTGTTTCTGCTTATATTGCCATGTTGTTGTATATATGCATTAAACGCTTCCAATGACAATGGTTGGTGTCTCGGGTAATGATCAATTTTTATGTTCGGGGACCCTTCAAGCCTTTTGATTCTGTTTCGTCTCTTACACCTTCGTTGAAGTGTGGTTTTGTGGATTAGTAGACATTTTTTTTCCCTGTTAAAATAATGTTTACGAAAAACTATTCCATTGACCCAATGGAAGGGAGAAGAAGACCCCATTCCAACAATGGAATTTAAGAAAGACGTCTGGTTAGCGCATTCGTTTGTTAGGCTAGGTCAGTGGACCTCATTTTAAACATCTGCATTGATAAATGGCGATGTAGTGTCTTTTAGGAATTTTTTTTTTCCCTTTCTGTTTGTATTCTTTGGGAGTTAGTTATTGACTTCTTATTTAAAGACTTCCTTAGTTATTTATTTTTACCTTTTGTTAACTTTTACCTTTTGGTAATGGTTTAATTTTAAGAGATGTAACTTTTCTTCAGCTTCTATTTTATTTCTTTACCTTCGGTTAATAAGGTCAAGTTAGTTTGTATTCTCAGTTTTCAGCCTATACATAAGGCTAATTACTTTCAGTTGAAGGTAATAAGAAGTTAATCATTTCTTTGAGAATTTTGTCCTCACCAAATGAAATGACCACCAAAGGTGCATTGTAAAAATGATCTTCAATCATGAAGAAAGACTATCTTTGAAAGGGTGTGCATAGTGCATAGGTTGACTGGGGGCATCATAAACTAATTAAATGTTTTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTAATTAAAGGCTGTTTGGAAGTGTACCCAAATCCTTTTTGAGTTTTTGAAAAAGACAGTGTATGAAGATACTCCAAGTTAATGGTGGGAGCAGATTGGTTGGGCACTTTAATAAGAGAGTTGAAGAATTTCCATCCCTTCTTTTCTTTTCCCACACGAATGATGACTTTGTTAAGGCCCCCACTGATGCAGAGCTTAATGACTTCAGCACAATGACCCTTTCAGCTGGTGGTCTTTTCAACCCAGAGATCATATTTGTCAAGATGACATTTTTGGAAGAATTGTTGGTTGAGGAGGGCGTCGATCAAAACATTGAAACAAGAAGAAATCCAAGATCAAGATTTTTTCTTCAAAGATGAATGGTTGATCTTTCCATGCCTCGGTGATGCGAAAGCCATGGTCAATCTCAATGGTGGAAGTCTTGTTGTTGAGGGTGAAGGAGGGAAGGGGGGAGGCAGAACGGCGGGACATGCCGTGGGAAGAATGGTTAGAGATGGAGAATGGTGGATGAGGGGGATGGAGAGGATTTCATTGGGGAGAGGGCGCCTTTCCTCTTTATGATTGTATATACATAATATTGAAAATTTGAGTTTTATTGTTTAATAACTTGGATATGTTCAAACTATAAAATTGAACACTTGGACTATGTATGTCGACGATTAGATAATTTGATAGGTTGGTTATTTTGTTAATGTTAGCAGCTTTAACAAATTTATCTTTAAATGAAAATTCTCCATGTGAAATTTACCATTTAAATGATTTTTTAGTGAAACACGCTGTGTATAATTAAAATAACTTAAAATAAAATTTGTTAAATAATAGAATTTGAATGAGAACTATGGATATCCTTGCTTGTGGATATCTAATTGTTCATTTATATTCATGGATTTATGGATGTAGCCTCTCTATCTCTGTAATTACACCTTTTTTTGTGTGATTAAACTTGGTTTGCAAGGTCTAACATGGTCAGTGATCAAAGCATTTGAGAATTGAATTGCTTGAAATGTGAGTTTCTCATGTTTTATAGCTGGAACACAGGTATACGAATACTCCTGCTAATAAGAGAGTAGAGCTGTTTGATGAGAGAGGCATTAATGAATCTACGACTGATGATAATGTTCAGATGACACCATGTAAGACTTTATATACTGTGAAATCCATAAGCTTGTAGCTAAATATGTCCCTTTTGGAGGAGTTTCTACCCTTGGAACCTTTAGGGCCTTCTATTTTTGAATTTGGAATTTTTGTTTTAGAACTCTTTGTCTCCTAGTATTACCAATCTCAAGTCGAAATACCATTGAAGGATCTCCAACTTCGTTTCCATCTATTACTCTTTTCTTATTGGCCTGAATGTTCTATTGCTTTGCTTTACACATTTTTTAACTTAAAATAATTAATTAGTTGTTTCCCGTTTCAACCTATTGATGTGATTTGTTCACAATAACTATGCATTTTTATTTACAATAATATTTCTTCAGTTTTGATATGTTCAGCGTGATATAAATCTCATGATATAATAAACTTGAGTTGAAGGAACCATAATTTTGTTCCCTATTTTATAATAAGTAGATTAAAGGATAGGTTTGCATTGCAATCCCGGGCTTGAGGATGTGACAATTGAAATATAAGTAAAAAGAAACAGTGGCTTTGGTTCCAAATTTCAATCTTCCAGATGTGTTCAAGTAATAAATATTAAATATGGTTTATTGTGGAGGGGTGAATTTCTATATTGTCTATAGGGCAGAAGGAAGAAATAGTATGATCATACTTGTAGGAACTATGCTTTCTTTGAGTTTTTTGATGTATATGTGAGTGTTGAAAAGTGAGAGACTTTTTAAGTATCCTCTTTTCTTCTATATATTTCACATTCTAGTGGCATGTCTTTGTGCTGTAGCAATAATAAGTCAAGAACTGACCAATGTTGGGAAGAAGACAATGGATGAAAATGATCCTGCGATTGACAGCTCTAAAATGGTGACCAGTTTTTTATAATGCACATGCTTTCTCATTTTGTTTAGGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTACTGTTATTCCTAATGCAAAATATGATCTTTAGGTAGTTGAACAGACAGTTGAAATGGGAAGGCAATCTGCTTTTACATTGGAAGGCCAAGTAAGTATATAAATTCACGATTCTCTTAAAAAGAAGTATTCAATTGGTTTAGCTCTATTCACTAGAATCTTTTTGGTGTTTTTGTTTTATGACTTGGCAATTGTTCTCACAATGCAATGCGTTACGTCTAGTGGACGTTATCAAGTTTAAGTTGGTAGATTACAATAAATTTAATTATATAAGTATACTTCAACACACCTCCTCACTTGTGGGCTTGAAGATGGTCTAGCAAGTGAAAATCAATAAGAAAAAGGACAACAAGTGCATTTGATGTAAAACTACAAATCACTAGTAAGGAAAAGAAGGATAACAAGCGCATTTGATGTAGTAAGATTAGAGTAAGGGTATCTTGGTCAAATCTTTAATTGATTAGGATAAGGATCGGTTCCTCGATTGATTAGGATTTGGATTAGTTTCTTTGGTTTATTAGGATTTGGATTACTTGGCTTTCCAGTTCTCTATAAATTGAAGAACTGTCTTCCTGTATTGATAACTTTGGATTCATAAGATTTCGATTTTTTCTGGGAGATTTCTCTCCTTTTATCTTTTAGGCTACATTGGTCGTTAGATAAATCGAGGAAAGAGTTTAGTCATTGGTTTTAATTGTGATCCATCTAAGGCTTCAAGATGGGCCATGATGGCTGCTCGTAATGTAGGAGAATTTCTCACGATTGAGTACTTTGGCCATATTGTATCAGACCAAGGAGTCTTAGCTCAGCCATTGAAAAATGAGGTAATGGTGCAATGGCGAAAGATGTAATTGTCTTTAGAGTAATATAGCGCAAGATGTCTTTGATAAACCTAAAAAAAGCAATGACTACTGTTCCAGTATTGGGCCTTCCAAATTTCTCTAAACAACCCATCAGGGAATCGAATGCTTTTGGAGTTGGTTTGTGTGTGTGTACTGTGCTAATTTAAGACCAACAACATCTAGTATTTTACTTATTATTTATTTTTTTGTTATGCTTTACCTTTTGTCCATTGACATGAGGCTATTCATTATGAGTGTGAGTTAATGGCGATTGTTATGGCAGTGCAAAAATAGAGACCACACCTCCAAAGTCAGAAGTTTGTAGGCCGTACGGATCAAAAGGCTTTGAAGTTTTTGCTTGGTGAAAGGGTAATAGCAGTTGAATACCAACATTGGATAACAAAGCTCCTAGGGCATGATTTTGACATTCAAAACAAAGTCAAATTAGACAATAAAGTCGTAGATGATCCAGGCTTCCCCCTAAGATTGCTTTAACAATTTGAGTATACTGGCAGGAACTAATGTGACCGTCATTGTCAATCAGATCAAACAAGATGAGGAACTCTCCAAAGTAGTGGAGGTATAGAAGAAGGGTGATAATCCACTAGAGGGATACAACCTCAGAGGGGACTTGTTATATTTTCGAGGATGTCTGGTATTACCCCAAATTCTCTGCCAATTCCTTTACTCTTGTAGGACTATTAAATGACTTGTTGGGTTGGTCAAGACTAAACAGAGGATTGCCAAAGAAATCCATTGGAGTCTTGTATCCTTGAGCAGTAGTTTTTTTCATTTCTTGAATGGAAAGTTTTGTATATTGTTAAAAAAAGGATGGCCAAAGAAATCTACTGGCGAGGAATGGAAAGGAGGATCCAGTCCTTTATTAACAATTGTGCAGTATGCCAACCATTAGCTTCAGTTGATTTTTTAAAATGTCATCCAATACTTGCTAGAATATGGGAAGGAAAGATTATAAAATGTACACAGAATATAGAAAGAGACAATCTTAACAATTCCTAAAGCATAGCTGAATCAATTAATCTTGATTTTCTA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BLAST of ClCG06G004180.1 vs. Swiss-Prot
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BLAST of ClCG06G004180.1 vs. Swiss-Prot
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BLAST of ClCG06G004180.1 vs. TrEMBL
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BLAST of ClCG06G004180.1 vs. TrEMBL
Match: A0A067G9P0_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g022587mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 42.4 bits (98), Expect = 4.1e-01 Identity = 18/26 (69.23%), Postives = 24/26 (92.31%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 88.6 bits (218), Expect = 5.0e-15 Identity = 45/79 (56.96%), Postives = 60/79 (75.95%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. TAIR10
Match: AT1G48240.1 (AT1G48240.1 novel plant snare 12) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 9.9e-15 Identity = 41/80 (51.25%), Postives = 54/80 (67.50%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 38.9 bits (89), Expect = 2.3e-03 Identity = 17/26 (65.38%), Postives = 19/26 (73.08%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. TAIR10
Match: AT3G17440.1 (AT3G17440.1 novel plant snare 13) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 1.7e-14 Identity = 41/80 (51.25%), Postives = 55/80 (68.75%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 39.7 bits (91), Expect = 1.3e-03 Identity = 17/26 (65.38%), Postives = 21/26 (80.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. TAIR10
Match: AT2G35190.1 (AT2G35190.1 novel plant snare 11) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 4.0e-08 Identity = 27/73 (36.99%), Postives = 43/73 (58.90%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449441646|ref|XP_004138593.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101203713 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 188.7 bits (478), Expect = 5.1e-45 Identity = 94/103 (91.26%), Postives = 99/103 (96.12%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659116834|ref|XP_008458283.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497748 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 187.2 bits (474), Expect = 1.5e-44 Identity = 94/103 (91.26%), Postives = 98/103 (95.15%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|778709007|ref|XP_011656330.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101203713 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 186.8 bits (473), Expect = 1.9e-44 Identity = 93/102 (91.18%), Postives = 98/102 (96.08%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659116836|ref|XP_008458284.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497748 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 185.3 bits (469), Expect = 5.6e-44 Identity = 93/102 (91.18%), Postives = 97/102 (95.10%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG06G004180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449441500|ref|XP_004138520.1| (PREDICTED: novel plant SNARE 13 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 2.2e-16 Identity = 48/86 (55.81%), Postives = 64/86 (74.42%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
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