CSPI01G12340.1 (mRNA) Wild cucumber (PI 183967) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CSPI01G12340.1
Type	mRNA
Organism	Cucumis sativus (Wild cucumber (PI 183967))
Description	Dynein heavy chain-like protein
Location	Chr1 : 7795581 .. 7796529 (+)
Sequence length	693

Genome Viewer

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGTCGTACACATCTCGCACCTATCCCGTACCCATCTTGCACCTATCTCGTACGCATCTCGCACCTATCTTGTACACATCTCGCACCTATCTCGTACACATCTCGCACCTATCTCGTAGAAAACGCTAGATCCATAGTTGATTTAACTCCATAGTCTAGAGATTGTGAAGATGAAAAACAACATCAACTCCATAGCTGATTTAACTCCATACACCTCCTCGTCGGAACCCAATTTTTGCAGCAAGATCACGAGTCCCAAGTCATGTGCCACAATGAAATCACCGGAACTACCATTGTTTTTGTAGTTTTGTGAATGAAAAATGGAAAAGGAAGAAAAAGGAAATTTCGTGAAAATGAGGGAAAATGGAACACCAGAGGGAGGGATGAGAGAAAAATGAAACATTTTTAGAAAGTGAAAAAACGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGAGGATTCATAAATTGA

mRNA sequence

ATGTCGTACACATCTCGCACCTATCCCGTACCCATCTTGCACCTATCTCGTACGCATCTCGCACCTATCTTGTACACATCTCGCACCTATCTCCAAGATCACGAGTCCCAAGTCATGTGCCACAATGAAATCACCGGAACTACCATTGTTTTTAAAGTGAAAAAACGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGAGGATTCATAAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGTACACATCTCGCACCTATCCCGTACCCATCTTGCACCTATCTCGTACGCATCTCGCACCTATCTTGTACACATCTCGCACCTATCTCCAAGATCACGAGTCCCAAGTCATGTGCCACAATGAAATCACCGGAACTACCATTGTTTTTAAAGTGAAAAAACGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGAGGATTCATAAATTGA

Homology

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TrEMBL
Match: U1HVS5_ENDPU (Uncharacterized protein OS=Endocarpon pusillum (strain Z07020 / HMAS-L-300199) GN=EPUS_04097 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 106.3 bits (264), Expect = 5.1e-20
Identity = 171/181 (94.48%), Postives = 176/181 (97.24%), Query Frame = 1


Query: 45  TGTTIVFKVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 104
           +G T+  + +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 169 SGETLRKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 228

Query: 105 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 164
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 229 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 288

Query: 165 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 224
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 289 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 348

Query: 225 K 226
           K
Sbjct: 349 K 349

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TrEMBL
Match: R7VTF8_COLLI (Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_11950 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 6.6e-20
Identity = 170/174 (97.70%), Postives = 172/174 (98.85%), Query Frame = 1


Query: 54  KKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 113
           +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 68  EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 127

Query: 114 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 173
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 128 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 187

Query: 174 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKRG 228
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK G
Sbjct: 188 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEG 241

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TrEMBL
Match: A0A067RQT4_ZOONE (S-antigen protein OS=Zootermopsis nevadensis GN=L798_02165 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 6.9e-17
Identity = 172/198 (86.87%), Postives = 174/198 (87.88%), Query Frame = 1


Query: 50  VF----------------------KVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 109
           VF                      K KK+ E+EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 94  VFNLNRGGKKKKEKKKEKEKEQEKKKKKKEEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 153

Query: 110 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 169
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 154 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 213

Query: 170 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 226
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 214 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 273

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A2IT03_PENEN (Uncharacterized protein OS=Penicillium expansum GN=PEXP_015980 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 9.9e-16
Identity = 160/167 (95.81%), Postives = 165/167 (98.80%), Query Frame = 1


Query: 55  KRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 114
           ++R ++ EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 797 RKRMEDPEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 856

Query: 115 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 174
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 857 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 916

Query: 175 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 222
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE+
Sbjct: 917 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKER 963

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TrEMBL
Match: R7VN40_COLLI (Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_15566 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 2.5e-11
Identity = 159/179 (88.83%), Postives = 166/179 (92.74%), Query Frame = 1


Query: 55  KRREKEKEKEKE------KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 114
           + R+KE+  + E      + K+ +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 180 RMRQKEEICDDEGGESLAQGKQGQKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 239

Query: 115 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 174
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 240 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 299

Query: 175 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKRG 228
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK G
Sbjct: 300 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEG 358

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. NCBI nr
Match: gi|629644562|ref|XP_007800902.1| (hypothetical protein EPUS_04097 [Endocarpon pusillum Z07020])

HSP 1 Score: 106.3 bits (264), Expect = 7.3e-20
Identity = 171/181 (94.48%), Postives = 176/181 (97.24%), Query Frame = 1


Query: 45  TGTTIVFKVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 104
           +G T+  + +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 169 SGETLRKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 228

Query: 105 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 164
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 229 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 288

Query: 165 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 224
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 289 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 348

Query: 225 K 226
           K
Sbjct: 349 K 349

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449269626|gb|EMC80383.1| (Dynein heavy chain-like protein [Columba livia])

HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 9.5e-20
Identity = 170/174 (97.70%), Postives = 172/174 (98.85%), Query Frame = 1


Query: 54  KKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 113
           +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 68  EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 127

Query: 114 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 173
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 128 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 187

Query: 174 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKRG 228
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK G
Sbjct: 188 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEG 241

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. NCBI nr
Match: gi|646721780|gb|KDR23010.1| (S-antigen protein [Zootermopsis nevadensis])

HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 9.8e-17
Identity = 172/198 (86.87%), Postives = 174/198 (87.88%), Query Frame = 1


Query: 50  VF----------------------KVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 109
           VF                      K KK+ E+EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 94  VFNLNRGGKKKKEKKKEKEKEQEKKKKKKEEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 153

Query: 110 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 169
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 154 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 213

Query: 170 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 226
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 214 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 273

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. NCBI nr
Match: gi|700456509|gb|KGO46169.1| (hypothetical protein PEXP_015980 [Penicillium expansum])

HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.4e-15
Identity = 160/167 (95.81%), Postives = 165/167 (98.80%), Query Frame = 1


Query: 55  KRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 114
           ++R ++ EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 797 RKRMEDPEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 856

Query: 115 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 174
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 857 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 916

Query: 175 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 222
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE+
Sbjct: 917 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKER 963

[Close]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449269555|gb|EMC80317.1| (DNA topoisomerase 1 [Columba livia])

HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 5.4e-15
Identity = 162/175 (92.57%), Postives = 170/175 (97.14%), Query Frame = 1


Query: 51  FKVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 110
           F+ ++  EKE+EKE EKE++KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 7   FEKEEEDEKEQEKENEKEQKKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 66

Query: 111 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 170
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 67  KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 126

Query: 171 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 226
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK+K KE+
Sbjct: 127 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKKKGKEE 181

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
U1HVS5_ENDPU	5.1e-20	94.48	Uncharacterized protein OS=Endocarpon pusillum (strain Z07020 / HMAS-L-300199) G...	[more]
R7VTF8_COLLI	6.6e-20	97.70	Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_11950 PE=4 SV=1	[more]
A0A067RQT4_ZOONE	6.9e-17	86.87	S-antigen protein OS=Zootermopsis nevadensis GN=L798_02165 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A2IT03_PENEN	9.9e-16	95.81	Uncharacterized protein OS=Penicillium expansum GN=PEXP_015980 PE=4 SV=1	[more]
R7VN40_COLLI	2.5e-11	88.83	Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_15566 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CSPI01G12340.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|629644562\|ref\|XP_007800902.1\|	7.3e-20	94.48	hypothetical protein EPUS_04097 [Endocarpon pusillum Z07020]	[more]
gi\|449269626\|gb\|EMC80383.1\|	9.5e-20	97.70	Dynein heavy chain-like protein [Columba livia]	[more]
gi\|646721780\|gb\|KDR23010.1\|	9.8e-17	86.87	S-antigen protein [Zootermopsis nevadensis]	[more]
gi\|700456509\|gb\|KGO46169.1\|	1.4e-15	95.81	hypothetical protein PEXP_015980 [Penicillium expansum]	[more]
gi\|449269555\|gb\|EMC80317.1\|	5.4e-15	92.57	DNA topoisomerase 1 [Columba livia]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this mRNA:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition

GO Annotation

GO Assignments

This mRNA is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
CSPI01G12340	CSPI01G12340	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CSPI01G12340.1	CSPI01G12340.1-protein	polypeptide

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CSPI01G12340.1.cds1	CSPI01G12340.1.cds1	CDS
CSPI01G12340.1.cds2	CSPI01G12340.1.cds2	CDS
CSPI01G12340.1.cds3	CSPI01G12340.1.cds3	CDS

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (PI183967)
Date Performed: 2017-01-17


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	unknown	Coil	Coil	coord: 51..227 scor