CSPI01G12340 (gene) Wild cucumber (PI 183967) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CSPI01G12340
Type	gene
Organism	Cucumis sativus (Wild cucumber (PI 183967))
Description	Dynein heavy chain-like protein
Location	Chr1 : 7795581 .. 7796529 (+)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGTCGTACACATCTCGCACCTATCCCGTACCCATCTTGCACCTATCTCGTACGCATCTCGCACCTATCTTGTACACATCTCGCACCTATCTCGTACACATCTCGCACCTATCTCGTAGAAAACGCTAGATCCATAGTTGATTTAACTCCATAGTCTAGAGATTGTGAAGATGAAAAACAACATCAACTCCATAGCTGATTTAACTCCATACACCTCCTCGTCGGAACCCAATTTTTGCAGCAAGATCACGAGTCCCAAGTCATGTGCCACAATGAAATCACCGGAACTACCATTGTTTTTGTAGTTTTGTGAATGAAAAATGGAAAAGGAAGAAAAAGGAAATTTCGTGAAAATGAGGGAAAATGGAACACCAGAGGGAGGGATGAGAGAAAAATGAAACATTTTTAGAAAGTGAAAAAACGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGAGGATTCATAAATTGA

mRNA sequence

ATGTCGTACACATCTCGCACCTATCCCGTACCCATCTTGCACCTATCTCGTACGCATCTCGCACCTATCTTGTACACATCTCGCACCTATCTCCAAGATCACGAGTCCCAAGTCATGTGCCACAATGAAATCACCGGAACTACCATTGTTTTTAAAGTGAAAAAACGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGAGGATTCATAAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGTACACATCTCGCACCTATCCCGTACCCATCTTGCACCTATCTCGTACGCATCTCGCACCTATCTTGTACACATCTCGCACCTATCTCCAAGATCACGAGTCCCAAGTCATGTGCCACAATGAAATCACCGGAACTACCATTGTTTTTAAAGTGAAAAAACGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGAGGATTCATAAATTGA

Homology

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. TrEMBL
Match: U1HVS5_ENDPU (Uncharacterized protein OS=Endocarpon pusillum (strain Z07020 / HMAS-L-300199) GN=EPUS_04097 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 106.3 bits (264), Expect = 5.1e-20
Identity = 171/181 (94.48%), Postives = 176/181 (97.24%), Query Frame = 1


Query: 45  TGTTIVFKVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 104
           +G T+  + +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 169 SGETLRKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 228

Query: 105 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 164
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 229 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 288

Query: 165 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 224
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 289 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 348

Query: 225 K 226
           K
Sbjct: 349 K 349

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. TrEMBL
Match: R7VTF8_COLLI (Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_11950 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 6.6e-20
Identity = 170/174 (97.70%), Postives = 172/174 (98.85%), Query Frame = 1


Query: 54  KKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 113
           +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 68  EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 127

Query: 114 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 173
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 128 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 187

Query: 174 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKRG 228
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK G
Sbjct: 188 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEG 241

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. TrEMBL
Match: A0A067RQT4_ZOONE (S-antigen protein OS=Zootermopsis nevadensis GN=L798_02165 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 6.9e-17
Identity = 172/198 (86.87%), Postives = 174/198 (87.88%), Query Frame = 1


Query: 50  VF----------------------KVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 109
           VF                      K KK+ E+EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 94  VFNLNRGGKKKKEKKKEKEKEQEKKKKKKEEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 153

Query: 110 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 169
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 154 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 213

Query: 170 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 226
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 214 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 273

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. TrEMBL
Match: A0A0A2IT03_PENEN (Uncharacterized protein OS=Penicillium expansum GN=PEXP_015980 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 9.9e-16
Identity = 160/167 (95.81%), Postives = 165/167 (98.80%), Query Frame = 1


Query: 55  KRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 114
           ++R ++ EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 797 RKRMEDPEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 856

Query: 115 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 174
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 857 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 916

Query: 175 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 222
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE+
Sbjct: 917 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKER 963

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. TrEMBL
Match: R7VN40_COLLI (Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_15566 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 2.5e-11
Identity = 159/179 (88.83%), Postives = 166/179 (92.74%), Query Frame = 1


Query: 55  KRREKEKEKEKE------KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 114
           + R+KE+  + E      + K+ +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 180 RMRQKEEICDDEGGESLAQGKQGQKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 239

Query: 115 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 174
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 240 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 299

Query: 175 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKRG 228
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK G
Sbjct: 300 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEG 358

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. NCBI nr
Match: gi|629644562|ref|XP_007800902.1| (hypothetical protein EPUS_04097 [Endocarpon pusillum Z07020])

HSP 1 Score: 106.3 bits (264), Expect = 7.3e-20
Identity = 171/181 (94.48%), Postives = 176/181 (97.24%), Query Frame = 1


Query: 45  TGTTIVFKVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 104
           +G T+  + +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 169 SGETLRKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 228

Query: 105 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 164
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 229 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 288

Query: 165 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 224
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 289 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 348

Query: 225 K 226
           K
Sbjct: 349 K 349

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. NCBI nr
Match: gi|449269626|gb|EMC80383.1| (Dynein heavy chain-like protein [Columba livia])

HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 9.5e-20
Identity = 170/174 (97.70%), Postives = 172/174 (98.85%), Query Frame = 1


Query: 54  KKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 113
           +K +EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 68  EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 127

Query: 114 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 173
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 128 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 187

Query: 174 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKRG 228
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK G
Sbjct: 188 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEG 241

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. NCBI nr
Match: gi|646721780|gb|KDR23010.1| (S-antigen protein [Zootermopsis nevadensis])

HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 9.8e-17
Identity = 172/198 (86.87%), Postives = 174/198 (87.88%), Query Frame = 1


Query: 50  VF----------------------KVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 109
           VF                      K KK+ E+EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 94  VFNLNRGGKKKKEKKKEKEKEQEKKKKKKEEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 153

Query: 110 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 169
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 154 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 213

Query: 170 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 226
           EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK
Sbjct: 214 EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 273

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. NCBI nr
Match: gi|700456509|gb|KGO46169.1| (hypothetical protein PEXP_015980 [Penicillium expansum])

HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.4e-15
Identity = 160/167 (95.81%), Postives = 165/167 (98.80%), Query Frame = 1


Query: 55  KRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 114
           ++R ++ EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 797 RKRMEDPEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 856

Query: 115 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 174
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 857 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 916

Query: 175 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 222
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE+
Sbjct: 917 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKER 963

[Close]

BLAST of CSPI01G12340 vs. NCBI nr
Match: gi|449269555|gb|EMC80317.1| (DNA topoisomerase 1 [Columba livia])

HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 5.4e-15
Identity = 162/175 (92.57%), Postives = 170/175 (97.14%), Query Frame = 1


Query: 51  FKVKKRREKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 110
           F+ ++  EKE+EKE EKE++KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 7   FEKEEEDEKEQEKENEKEQKKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 66

Query: 111 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 170
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 67  KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 126

Query: 171 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 226
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK+K KE+
Sbjct: 127 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKKKGKEE 181

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CSPI01G12340 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CSPI01G12340 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
U1HVS5_ENDPU	5.1e-20	94.48	Uncharacterized protein OS=Endocarpon pusillum (strain Z07020 / HMAS-L-300199) G...	[more]
R7VTF8_COLLI	6.6e-20	97.70	Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_11950 PE=4 SV=1	[more]
A0A067RQT4_ZOONE	6.9e-17	86.87	S-antigen protein OS=Zootermopsis nevadensis GN=L798_02165 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A2IT03_PENEN	9.9e-16	95.81	Uncharacterized protein OS=Penicillium expansum GN=PEXP_015980 PE=4 SV=1	[more]
R7VN40_COLLI	2.5e-11	88.83	Dynein heavy chain-like protein OS=Columba livia GN=A306_15566 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CSPI01G12340 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CSPI01G12340 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|629644562\|ref\|XP_007800902.1\|	7.3e-20	94.48	hypothetical protein EPUS_04097 [Endocarpon pusillum Z07020]	[more]
gi\|449269626\|gb\|EMC80383.1\|	9.5e-20	97.70	Dynein heavy chain-like protein [Columba livia]	[more]
gi\|646721780\|gb\|KDR23010.1\|	9.8e-17	86.87	S-antigen protein [Zootermopsis nevadensis]	[more]
gi\|700456509\|gb\|KGO46169.1\|	1.4e-15	95.81	hypothetical protein PEXP_015980 [Penicillium expansum]	[more]
gi\|449269555\|gb\|EMC80317.1\|	5.4e-15	92.57	DNA topoisomerase 1 [Columba livia]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this gene:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CSPI01G12340.1	CSPI01G12340.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (PI183967)
Date Performed: 2017-01-17


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	unknown	Coil	Coil	coord: 51..227 scor

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
CSPI01G12340	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpiB654
CSPI01G12340	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpiB000
CSPI01G12340	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpiB205
CSPI01G12340	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpiB383
CSPI01G12340	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpiB647
CSPI01G12340	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocpiB846
CSPI01G12340	Cucumber (Chinese Long) v2	cpicuB000
CSPI01G12340	Cucumber (Chinese Long) v2	cpicuB044
CSPI01G12340	Melon (DHL92) v3.5.1	cpimeB024
CSPI01G12340	Melon (DHL92) v3.5.1	cpimeB086
CSPI01G12340	Watermelon (Charleston Gray)	cpiwcgB016
CSPI01G12340	Watermelon (Charleston Gray)	cpiwcgB051
CSPI01G12340	Watermelon (97103) v1	cpiwmB026
CSPI01G12340	Watermelon (97103) v1	cpiwmB043
CSPI01G12340	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpiB052
CSPI01G12340	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpiB475
CSPI01G12340	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpiB506
CSPI01G12340	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpiB771
CSPI01G12340	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cpilsiB018
CSPI01G12340	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cpilsiB021
CSPI01G12340	Melon (DHL92) v3.6.1	cpimedB023
CSPI01G12340	Melon (DHL92) v3.6.1	cpimedB076
CSPI01G12340	Cucumber (Gy14) v2	cgybcpiB001
CSPI01G12340	Cucumber (Gy14) v2	cgybcpiB161
CSPI01G12340	Cucumber (Gy14) v2	cgybcpiB248
CSPI01G12340	Silver-seed gourd	carcpiB0169
CSPI01G12340	Silver-seed gourd	carcpiB0581
CSPI01G12340	Silver-seed gourd	carcpiB0670
CSPI01G12340	Silver-seed gourd	carcpiB0986
CSPI01G12340	Cucumber (Chinese Long) v3	cpicucB001
CSPI01G12340	Cucumber (Chinese Long) v3	cpicucB039
CSPI01G12340	Cucumber (Chinese Long) v3	cpicucB051
CSPI01G12340	Watermelon (97103) v2	cpiwmbB001
CSPI01G12340	Watermelon (97103) v2	cpiwmbB023
CSPI01G12340	Watermelon (97103) v2	cpiwmbB046
CSPI01G12340	Wax gourd	cpiwgoB023
CSPI01G12340	Wax gourd	cpiwgoB052
CSPI01G12340	Wild cucumber (PI 183967)	cpicpiB026
CSPI01G12340	Wild cucumber (PI 183967)	cpicpiB038
CSPI01G12340	Cucurbita pepo (Zucchini)	cpecpiB025
CSPI01G12340	Cucumber (Gy14) v1	cgycpiB016
CSPI01G12340	Cucumber (Gy14) v1	cgycpiB162
CSPI01G12340	Cucumber (Gy14) v1	cgycpiB172
CSPI01G12340	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpiB219
CSPI01G12340	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacpiB395